Doublet Group distance statistics: 53441

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 4, 5, 4, 2, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.009, 0.016, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.002, 0.012, 0.022, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.012 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.004, 0.016, 0.028, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.016 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.005, 0.018, 0.030, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.018 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.007, 0.019, 0.032, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.019 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.005, 0.018, 0.031, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.018 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.003, 0.016, 0.029, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.016 std_dev=0.013
N9	A	0, 0.009, 0.023, 0.036, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.023 std_dev=0.014
N6	A	0, 0.010, 0.031, 0.052, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.031 std_dev=0.021
N7	A	0, 0.009, 0.036, 0.063, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.036 std_dev=0.027
C8	A	0, 0.014, 0.042, 0.070, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.042 std_dev=0.028
O4'	A	0, 0.025, 0.071, 0.116, 0.151 max_d=0.151 avg_d=0.071 std_dev=0.046
C2'	A	0, 0.050, 0.113, 0.176, 0.253 max_d=0.253 avg_d=0.113 std_dev=0.063
C4'	A	0, 0.048, 0.143, 0.239, 0.342 max_d=0.342 avg_d=0.143 std_dev=0.095
C3'	A	0, 0.064, 0.170, 0.276, 0.398 max_d=0.398 avg_d=0.170 std_dev=0.106
O2'	A	0, 0.060, 0.171, 0.282, 0.458 max_d=0.458 avg_d=0.171 std_dev=0.111
O3'	A	0, 0.128, 0.279, 0.431, 0.579 max_d=0.579 avg_d=0.279 std_dev=0.151
C1'	B	0, 0.149, 0.317, 0.486, 0.673 max_d=0.673 avg_d=0.317 std_dev=0.168
C5'	A	0, 0.081, 0.255, 0.430, 0.628 max_d=0.628 avg_d=0.255 std_dev=0.174
N9	B	0, 0.131, 0.318, 0.505, 0.719 max_d=0.719 avg_d=0.318 std_dev=0.187
N3	B	0, 0.082, 0.271, 0.460, 0.715 max_d=0.715 avg_d=0.271 std_dev=0.189
C4	B	0, 0.092, 0.295, 0.498, 0.703 max_d=0.703 avg_d=0.295 std_dev=0.203
C8	B	0, 0.173, 0.400, 0.627, 0.879 max_d=0.879 avg_d=0.400 std_dev=0.227
C2'	B	0, 0.114, 0.341, 0.569, 0.943 max_d=0.943 avg_d=0.341 std_dev=0.228
C2	B	0, 0.098, 0.339, 0.580, 0.919 max_d=0.919 avg_d=0.339 std_dev=0.241
C5	B	0, 0.122, 0.364, 0.606, 0.832 max_d=0.832 avg_d=0.364 std_dev=0.242
O4'	B	0, 0.255, 0.501, 0.747, 0.853 max_d=0.853 avg_d=0.501 std_dev=0.246
N7	B	0, 0.174, 0.420, 0.667, 0.934 max_d=0.934 avg_d=0.420 std_dev=0.247
O2'	B	0, 0.103, 0.377, 0.650, 1.343 max_d=1.343 avg_d=0.377 std_dev=0.274
N2	B	0, 0.092, 0.373, 0.653, 1.024 max_d=1.024 avg_d=0.373 std_dev=0.281
N1	B	0, 0.124, 0.409, 0.694, 1.077 max_d=1.077 avg_d=0.409 std_dev=0.285
C6	B	0, 0.115, 0.406, 0.696, 1.054 max_d=1.054 avg_d=0.406 std_dev=0.290
O6	B	0, 0.133, 0.469, 0.804, 1.212 max_d=1.212 avg_d=0.469 std_dev=0.335
OP1	A	0, 0.289, 0.725, 1.162, 1.545 max_d=1.545 avg_d=0.725 std_dev=0.436
C3'	B	0, 0.146, 0.595, 1.045, 1.529 max_d=1.529 avg_d=0.595 std_dev=0.450
C4'	B	0, 0.221, 0.703, 1.185, 1.554 max_d=1.554 avg_d=0.703 std_dev=0.482
O5'	A	0, 0.034, 0.600, 1.166, 1.769 max_d=1.769 avg_d=0.600 std_dev=0.566
P	A	0, 0.059, 0.625, 1.192, 1.640 max_d=1.640 avg_d=0.625 std_dev=0.566
O3'	B	0, 0.053, 0.714, 1.374, 2.026 max_d=2.026 avg_d=0.714 std_dev=0.661
OP2	A	0, 0.187, 0.961, 1.735, 2.469 max_d=2.469 avg_d=0.961 std_dev=0.774
C5'	B	0, 0.177, 1.038, 1.899, 2.884 max_d=2.884 avg_d=1.038 std_dev=0.861
O5'	B	0, 0.167, 1.133, 2.099, 3.423 max_d=3.423 avg_d=1.133 std_dev=0.966
P	B	0, 0.028, 1.519, 3.010, 4.047 max_d=4.047 avg_d=1.519 std_dev=1.491
OP2	B	0, -0.001, 1.624, 3.250, 4.486 max_d=4.486 avg_d=1.624 std_dev=1.625
OP1	B	0, 0.021, 1.775, 3.529, 4.681 max_d=4.681 avg_d=1.775 std_dev=1.754

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.22	0.24	0.20	0.10
C2	0.03	0.00	0.08	0.07	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.10	0.09	0.03	0.23	0.24	0.19	0.05
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.06	0.04	0.07	0.07	0.07	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.22	0.13	0.18
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.06	0.01	0.08	0.04	0.09	0.10	0.08	0.07	0.11	0.10	0.05	0.02	0.01	0.01	0.15	0.24	0.07	0.15
C4	0.02	0.01	0.04	0.06	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.05	0.06	0.01	0.28	0.27	0.19	0.06
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.04	0.00	0.07	0.00	0.07	0.09	0.06	0.04	0.08	0.09	0.05	0.02	0.03	0.00	0.01	0.25	0.16	0.18
C5	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.07	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.09	0.01	0.33	0.32	0.24	0.14
C5'	0.02	0.07	0.02	0.04	0.08	0.00	0.13	0.00	0.13	0.15	0.10	0.06	0.15	0.16	0.08	0.02	0.08	0.01	0.01	0.34	0.06	0.01
C6	0.02	0.01	0.06	0.09	0.01	0.07	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.10	0.02	0.32	0.31	0.25	0.14
C8	0.01	0.01	0.04	0.10	0.01	0.09	0.01	0.15	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.10	0.02	0.38	0.34	0.23	0.17
N1	0.03	0.00	0.07	0.08	0.01	0.06	0.01	0.10	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.10	0.02	0.28	0.27	0.22	0.08
N3	0.03	0.01	0.07	0.07	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.08	0.03	0.22	0.23	0.19	0.06
N6	0.02	0.01	0.07	0.11	0.02	0.08	0.01	0.15	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.06	0.13	0.02	0.35	0.34	0.29	0.20
N7	0.02	0.01	0.04	0.10	0.01	0.09	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.11	0.02	0.39	0.36	0.28	0.22
N9	0.01	0.02	0.02	0.05	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.30	0.28	0.18	0.05
O2'	0.02	0.10	0.00	0.02	0.05	0.02	0.04	0.02	0.06	0.03	0.08	0.09	0.06	0.02	0.02	0.00	0.03	0.04	0.09	0.23	0.25	0.33
O3'	0.02	0.09	0.02	0.01	0.06	0.03	0.09	0.08	0.10	0.10	0.10	0.08	0.13	0.11	0.05	0.03	0.00	0.03	0.36	0.23	0.05	0.24
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.04	0.03	0.00	0.32	0.26	0.24	0.09
O5'	0.22	0.23	0.02	0.15	0.28	0.01	0.33	0.01	0.32	0.38	0.28	0.22	0.35	0.39	0.30	0.09	0.36	0.32	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.24	0.24	0.22	0.24	0.27	0.25	0.32	0.34	0.31	0.34	0.27	0.23	0.34	0.36	0.28	0.23	0.23	0.26	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.20	0.19	0.13	0.07	0.19	0.16	0.24	0.06	0.25	0.23	0.22	0.19	0.29	0.28	0.18	0.25	0.05	0.24	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.05	0.18	0.15	0.06	0.18	0.14	0.01	0.14	0.17	0.08	0.06	0.20	0.22	0.05	0.33	0.24	0.09	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.09	0.11	0.23	0.11	0.08	0.23	0.09	0.25	0.09	0.07	0.11	0.13	0.10	0.08	0.07	0.21	0.15	0.18	0.08	0.09	0.14	0.31	0.17
C2	0.12	0.13	0.22	0.09	0.11	0.33	0.13	0.38	0.14	0.11	0.15	0.17	0.10	0.13	0.10	0.23	0.15	0.26	0.11	0.16	0.22	0.42	0.36
C2'	0.09	0.07	0.24	0.09	0.07	0.29	0.07	0.34	0.07	0.07	0.07	0.07	0.07	0.07	0.07	0.26	0.19	0.19	0.11	0.07	0.10	0.39	0.29
C3'	0.11	0.07	0.26	0.09	0.08	0.29	0.07	0.38	0.07	0.10	0.07	0.07	0.07	0.08	0.10	0.30	0.21	0.18	0.18	0.07	0.16	0.38	0.32
C4	0.10	0.11	0.23	0.09	0.09	0.31	0.10	0.35	0.11	0.08	0.11	0.12	0.09	0.10	0.08	0.22	0.16	0.23	0.08	0.12	0.11	0.36	0.29
C4'	0.11	0.09	0.24	0.09	0.07	0.20	0.07	0.25	0.07	0.09	0.09	0.13	0.08	0.07	0.08	0.21	0.14	0.15	0.09	0.07	0.23	0.28	0.15
C5	0.10	0.10	0.22	0.09	0.09	0.34	0.10	0.41	0.11	0.08	0.11	0.11	0.09	0.10	0.08	0.22	0.19	0.24	0.11	0.12	0.15	0.39	0.34
C5'	0.14	0.10	0.26	0.12	0.08	0.21	0.07	0.27	0.08	0.11	0.10	0.15	0.08	0.08	0.10	0.24	0.15	0.18	0.14	0.08	0.29	0.27	0.17
C6	0.11	0.11	0.22	0.10	0.10	0.37	0.11	0.45	0.13	0.10	0.13	0.13	0.09	0.11	0.09	0.23	0.20	0.27	0.14	0.14	0.23	0.43	0.40
C8	0.09	0.11	0.22	0.11	0.09	0.29	0.09	0.35	0.10	0.08	0.11	0.12	0.09	0.09	0.08	0.20	0.20	0.20	0.10	0.10	0.09	0.34	0.25
N1	0.12	0.13	0.22	0.09	0.10	0.37	0.12	0.43	0.14	0.11	0.14	0.15	0.10	0.13	0.10	0.23	0.18	0.28	0.13	0.16	0.26	0.45	0.41
N3	0.11	0.12	0.23	0.10	0.10	0.30	0.11	0.33	0.13	0.10	0.13	0.15	0.09	0.11	0.09	0.23	0.14	0.23	0.09	0.13	0.14	0.38	0.30
N6	0.12	0.11	0.22	0.11	0.10	0.40	0.11	0.49	0.13	0.10	0.13	0.12	0.09	0.12	0.09	0.24	0.22	0.28	0.17	0.14	0.27	0.46	0.44
N7	0.10	0.10	0.22	0.10	0.08	0.32	0.09	0.40	0.10	0.08	0.10	0.10	0.08	0.09	0.07	0.21	0.21	0.22	0.12	0.10	0.11	0.37	0.31
N9	0.09	0.10	0.23	0.10	0.08	0.28	0.09	0.32	0.10	0.08	0.11	0.12	0.09	0.09	0.08	0.21	0.17	0.20	0.07	0.10	0.08	0.33	0.23
O2'	0.08	0.08	0.24	0.11	0.07	0.25	0.07	0.25	0.08	0.07	0.08	0.09	0.08	0.07	0.07	0.26	0.19	0.17	0.07	0.08	0.10	0.35	0.21
O3'	0.15	0.09	0.26	0.13	0.13	0.32	0.13	0.45	0.11	0.15	0.10	0.08	0.11	0.14	0.15	0.38	0.28	0.20	0.29	0.12	0.25	0.46	0.41
O4'	0.10	0.15	0.21	0.12	0.10	0.19	0.10	0.21	0.12	0.09	0.14	0.19	0.13	0.09	0.08	0.17	0.16	0.16	0.09	0.12	0.25	0.30	0.13
O5'	0.28	0.11	0.21	0.34	0.10	0.54	0.08	0.63	0.09	0.18	0.12	0.16	0.08	0.12	0.18	0.35	0.48	0.40	0.42	0.11	0.26	0.40	0.43
OP1	0.23	0.21	0.24	0.33	0.23	0.30	0.24	0.38	0.23	0.27	0.21	0.20	0.21	0.27	0.24	0.22	0.43	0.21	0.35	0.24	0.23	0.38	0.29
OP2	0.34	0.43	0.29	0.37	0.41	0.39	0.45	0.45	0.48	0.41	0.46	0.42	0.40	0.45	0.39	0.33	0.46	0.32	0.38	0.50	0.13	0.43	0.35
P	0.47	0.37	0.40	0.49	0.43	0.56	0.43	0.62	0.41	0.46	0.38	0.34	0.40	0.46	0.45	0.48	0.58	0.47	0.51	0.40	0.18	0.50	0.46

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.12	0.02	0.11	0.40	0.15
C2	0.03	0.00	0.14	0.19	0.01	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.18	0.16	0.09	0.38	0.01	0.30	0.26	0.18
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.07	0.01	0.05	0.01	0.07	0.09	0.11	0.16	0.13	0.06	0.02	0.00	0.02	0.02	0.06	0.06	0.23	0.39	0.15
C3'	0.02	0.19	0.00	0.00	0.19	0.01	0.25	0.01	0.27	0.23	0.24	0.17	0.16	0.27	0.16	0.01	0.01	0.02	0.06	0.29	0.31	0.26	0.12
C4	0.01	0.01	0.07	0.19	0.00	0.05	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.15	0.15	0.04	0.43	0.01	0.32	0.25	0.21
C4'	0.03	0.05	0.01	0.01	0.05	0.00	0.14	0.01	0.12	0.23	0.05	0.10	0.06	0.23	0.10	0.08	0.01	0.01	0.02	0.16	0.18	0.29	0.10
C5	0.01	0.00	0.05	0.25	0.00	0.14	0.00	0.33	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.18	0.23	0.03	0.60	0.01	0.46	0.35	0.39
C5'	0.02	0.10	0.01	0.01	0.19	0.01	0.33	0.00	0.32	0.44	0.21	0.06	0.06	0.47	0.22	0.07	0.04	0.01	0.01	0.39	0.21	0.12	0.03
C6	0.02	0.01	0.07	0.27	0.01	0.12	0.01	0.32	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.19	0.25	0.03	0.62	0.01	0.50	0.42	0.43
C8	0.02	0.01	0.09	0.23	0.01	0.23	0.01	0.44	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.15	0.22	0.10	0.63	0.02	0.42	0.27	0.38
N1	0.02	0.00	0.11	0.24	0.01	0.05	0.01	0.21	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.19	0.22	0.06	0.52	0.01	0.42	0.34	0.32
N2	0.03	0.00	0.16	0.17	0.01	0.10	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.19	0.15	0.12	0.31	0.01	0.25	0.25	0.13
N3	0.03	0.01	0.13	0.16	0.00	0.06	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.17	0.12	0.09	0.31	0.01	0.24	0.25	0.12
N7	0.01	0.01	0.06	0.27	0.01	0.23	0.00	0.47	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.18	0.27	0.07	0.72	0.02	0.53	0.42	0.52
N9	0.01	0.01	0.02	0.16	0.00	0.10	0.01	0.22	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.11	0.12	0.02	0.39	0.02	0.27	0.26	0.16
O2'	0.02	0.18	0.00	0.01	0.15	0.08	0.18	0.07	0.19	0.15	0.19	0.19	0.17	0.18	0.11	0.00	0.07	0.09	0.06	0.21	0.26	0.35	0.10
O3'	0.05	0.16	0.02	0.01	0.15	0.01	0.23	0.04	0.25	0.22	0.22	0.15	0.12	0.27	0.12	0.07	0.00	0.02	0.06	0.29	0.49	0.25	0.18
O4'	0.01	0.09	0.02	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.03	0.10	0.06	0.12	0.09	0.07	0.02	0.09	0.02	0.00	0.07	0.03	0.08	0.54	0.28
O5'	0.12	0.38	0.06	0.06	0.43	0.02	0.60	0.01	0.62	0.63	0.52	0.31	0.31	0.72	0.39	0.06	0.06	0.07	0.00	0.70	0.01	0.01	0.01
O6	0.02	0.01	0.06	0.29	0.01	0.16	0.01	0.39	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.21	0.29	0.03	0.70	0.00	0.58	0.52	0.54
OP1	0.11	0.30	0.23	0.31	0.32	0.18	0.46	0.21	0.50	0.42	0.42	0.25	0.24	0.53	0.27	0.26	0.49	0.08	0.01	0.58	0.00	0.01	0.00
OP2	0.40	0.26	0.39	0.26	0.25	0.29	0.35	0.12	0.42	0.27	0.34	0.25	0.25	0.42	0.26	0.35	0.25	0.54	0.01	0.52	0.01	0.00	0.00
P	0.15	0.18	0.15	0.12	0.21	0.10	0.39	0.03	0.43	0.38	0.32	0.13	0.12	0.52	0.16	0.10	0.18	0.28	0.01	0.54	0.00	0.00	0.00