Doublet Group distance statistics: 53443

back

Distances from reference structure (by RMSD)

3, 1, 4, 2, 5, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.004, 0.008, 0.012, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.008 std_dev=0.004
C6	A	0, 0.000, 0.008, 0.016, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.008 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.003, 0.012, 0.021, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.012 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.001, 0.014, 0.026, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.014 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.001, 0.013, 0.025, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.013 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.000, 0.013, 0.027, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C4	A	0, -0.003, 0.016, 0.035, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.016 std_dev=0.019
N9	A	0, -0.004, 0.018, 0.041, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.018 std_dev=0.022
N6	A	0, 0.002, 0.026, 0.051, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.026 std_dev=0.024
N7	A	0, -0.003, 0.026, 0.054, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.026 std_dev=0.028
C8	A	0, -0.006, 0.031, 0.068, 0.119 max_d=0.119 avg_d=0.031 std_dev=0.037
N2	B	0, 0.147, 0.271, 0.394, 0.482 max_d=0.482 avg_d=0.271 std_dev=0.124
N3	B	0, 0.101, 0.245, 0.388, 0.546 max_d=0.546 avg_d=0.245 std_dev=0.144
C2	B	0, 0.142, 0.287, 0.432, 0.565 max_d=0.565 avg_d=0.287 std_dev=0.145
C4	B	0, 0.119, 0.285, 0.451, 0.607 max_d=0.607 avg_d=0.285 std_dev=0.166
C1'	B	0, 0.099, 0.268, 0.436, 0.607 max_d=0.607 avg_d=0.268 std_dev=0.168
C4'	B	0, 0.109, 0.282, 0.455, 0.668 max_d=0.668 avg_d=0.282 std_dev=0.173
N9	B	0, 0.103, 0.277, 0.450, 0.619 max_d=0.619 avg_d=0.277 std_dev=0.174
C2'	B	0, 0.145, 0.322, 0.499, 0.580 max_d=0.580 avg_d=0.322 std_dev=0.177
O4'	B	0, 0.101, 0.280, 0.459, 0.661 max_d=0.661 avg_d=0.280 std_dev=0.179
O2'	B	0, 0.152, 0.339, 0.525, 0.669 max_d=0.669 avg_d=0.339 std_dev=0.187
O3'	B	0, 0.110, 0.297, 0.484, 0.623 max_d=0.623 avg_d=0.297 std_dev=0.187
C3'	B	0, 0.126, 0.323, 0.520, 0.641 max_d=0.641 avg_d=0.323 std_dev=0.197
C8	B	0, 0.124, 0.336, 0.548, 0.687 max_d=0.687 avg_d=0.336 std_dev=0.212
N1	B	0, 0.161, 0.376, 0.591, 0.807 max_d=0.807 avg_d=0.376 std_dev=0.215
C5	B	0, 0.137, 0.369, 0.602, 0.780 max_d=0.780 avg_d=0.369 std_dev=0.232
N7	B	0, 0.129, 0.395, 0.661, 0.901 max_d=0.901 avg_d=0.395 std_dev=0.266
C6	B	0, 0.147, 0.429, 0.711, 1.004 max_d=1.004 avg_d=0.429 std_dev=0.282
OP2	A	0, 0.186, 0.538, 0.891, 1.414 max_d=1.414 avg_d=0.538 std_dev=0.352
O5'	B	0, 0.086, 0.460, 0.834, 1.442 max_d=1.442 avg_d=0.460 std_dev=0.374
C5'	B	0, 0.045, 0.424, 0.803, 1.183 max_d=1.183 avg_d=0.424 std_dev=0.379
O6	B	0, 0.143, 0.530, 0.917, 1.361 max_d=1.361 avg_d=0.530 std_dev=0.387
P	B	0, 0.068, 0.475, 0.882, 1.761 max_d=1.761 avg_d=0.475 std_dev=0.407
O4'	A	0, -0.144, 0.264, 0.672, 1.242 max_d=1.242 avg_d=0.264 std_dev=0.408
C2'	A	0, -0.133, 0.277, 0.686, 1.220 max_d=1.220 avg_d=0.277 std_dev=0.410
OP1	B	0, 0.002, 0.477, 0.952, 2.078 max_d=2.078 avg_d=0.477 std_dev=0.475
OP2	B	0, 0.187, 0.669, 1.152, 1.822 max_d=1.822 avg_d=0.669 std_dev=0.483
O2'	A	0, -0.216, 0.389, 0.995, 1.787 max_d=1.787 avg_d=0.389 std_dev=0.606
O5'	A	0, -0.085, 0.664, 1.412, 2.580 max_d=2.580 avg_d=0.664 std_dev=0.749
C4'	A	0, -0.287, 0.476, 1.239, 2.267 max_d=2.267 avg_d=0.476 std_dev=0.763
C3'	A	0, -0.276, 0.498, 1.273, 2.264 max_d=2.264 avg_d=0.498 std_dev=0.774
P	A	0, -0.135, 0.791, 1.718, 3.159 max_d=3.159 avg_d=0.791 std_dev=0.927
C5'	A	0, -0.320, 0.655, 1.629, 3.027 max_d=3.027 avg_d=0.655 std_dev=0.975
O3'	A	0, -0.391, 0.750, 1.890, 3.310 max_d=3.310 avg_d=0.750 std_dev=1.140
OP1	A	0, -0.454, 1.114, 2.681, 4.752 max_d=4.752 avg_d=1.114 std_dev=1.568

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.30	0.01	0.07	0.15	0.26	0.06
C2	0.02	0.00	0.30	0.19	0.00	0.10	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.09	0.26	0.21	0.12	0.56	0.17	0.30
C2'	0.00	0.30	0.00	0.00	0.17	0.01	0.11	0.15	0.18	0.10	0.25	0.29	0.15	0.03	0.03	0.00	0.02	0.02	0.35	0.68	0.69	0.54
C3'	0.01	0.19	0.00	0.00	0.23	0.00	0.33	0.01	0.33	0.33	0.27	0.14	0.38	0.38	0.22	0.01	0.01	0.01	0.04	0.63	0.20	0.28
C4	0.01	0.00	0.17	0.23	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.10	0.14	0.11	0.17	0.59	0.16	0.32
C4'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.02	0.00	0.09	0.00	0.05	0.23	0.04	0.10	0.09	0.20	0.09	0.26	0.02	0.00	0.01	0.16	0.10	0.06
C5	0.01	0.00	0.11	0.33	0.00	0.09	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.20	0.05	0.07	0.29	0.86	0.12	0.52
C5'	0.04	0.09	0.15	0.01	0.04	0.00	0.13	0.00	0.09	0.27	0.04	0.09	0.15	0.26	0.09	0.10	0.17	0.01	0.01	0.08	0.29	0.01
C6	0.01	0.01	0.18	0.33	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.16	0.05	0.12	0.29	0.90	0.12	0.55
C8	0.01	0.01	0.10	0.33	0.00	0.23	0.00	0.27	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.34	0.14	0.11	0.35	0.82	0.13	0.52
N1	0.01	0.00	0.25	0.27	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.14	0.18	0.21	0.76	0.13	0.44
N3	0.02	0.00	0.29	0.14	0.00	0.10	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.10	0.31	0.20	0.08	0.44	0.19	0.21
N6	0.01	0.01	0.15	0.38	0.01	0.09	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.21	0.10	0.09	0.36	1.06	0.13	0.67
N7	0.01	0.01	0.03	0.38	0.00	0.20	0.00	0.26	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.33	0.17	0.05	0.40	1.01	0.12	0.65
N9	0.00	0.00	0.03	0.22	0.00	0.09	0.00	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.18	0.09	0.01	0.15	0.51	0.18	0.27
O2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.10	0.26	0.20	0.10	0.16	0.34	0.06	0.10	0.21	0.33	0.18	0.00	0.03	0.17	0.24	0.71	0.65	0.51
O3'	0.30	0.26	0.02	0.01	0.14	0.02	0.05	0.17	0.05	0.14	0.14	0.31	0.10	0.17	0.09	0.03	0.00	0.19	0.17	0.59	0.14	0.12
O4'	0.01	0.21	0.02	0.01	0.11	0.00	0.07	0.01	0.12	0.11	0.18	0.20	0.09	0.05	0.01	0.17	0.19	0.00	0.04	0.38	0.09	0.17
O5'	0.07	0.12	0.35	0.04	0.17	0.01	0.29	0.01	0.29	0.35	0.21	0.08	0.36	0.40	0.15	0.24	0.17	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.15	0.56	0.68	0.63	0.59	0.16	0.86	0.08	0.90	0.82	0.76	0.44	1.06	1.01	0.51	0.71	0.59	0.38	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.26	0.17	0.69	0.20	0.16	0.10	0.12	0.29	0.12	0.13	0.13	0.19	0.13	0.12	0.18	0.65	0.14	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.06	0.30	0.54	0.28	0.32	0.06	0.52	0.01	0.55	0.52	0.44	0.21	0.67	0.65	0.27	0.51	0.12	0.17	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.09	0.05	0.18	0.19	0.07	0.06	0.09	0.05	0.08	0.12	0.06	0.07	0.05	0.12	0.09	0.11	0.18	0.09	0.13	0.10	0.09	0.31	0.10
C2	0.06	0.05	0.19	0.21	0.05	0.06	0.05	0.10	0.05	0.06	0.05	0.06	0.05	0.05	0.06	0.07	0.18	0.04	0.09	0.05	0.08	0.31	0.11
C2'	0.25	0.28	0.09	0.07	0.25	0.18	0.22	0.23	0.22	0.20	0.25	0.31	0.28	0.19	0.23	0.13	0.13	0.24	0.06	0.20	0.19	0.13	0.10
C3'	0.31	0.05	0.47	0.62	0.19	0.50	0.24	0.49	0.17	0.39	0.07	0.17	0.06	0.35	0.30	0.41	0.71	0.42	0.72	0.20	0.67	0.86	0.68
C4	0.06	0.05	0.17	0.19	0.05	0.05	0.05	0.07	0.05	0.07	0.04	0.08	0.05	0.06	0.06	0.04	0.18	0.06	0.10	0.05	0.08	0.31	0.10
C4'	0.50	0.32	0.65	0.80	0.48	0.65	0.56	0.65	0.52	0.65	0.41	0.19	0.35	0.65	0.55	0.51	0.88	0.58	0.81	0.56	0.70	1.02	0.77
C5	0.05	0.06	0.15	0.20	0.05	0.06	0.05	0.10	0.06	0.06	0.06	0.09	0.05	0.06	0.06	0.06	0.18	0.06	0.11	0.06	0.10	0.33	0.12
C5'	0.53	0.34	0.67	0.87	0.53	0.72	0.62	0.77	0.58	0.72	0.45	0.19	0.37	0.73	0.60	0.49	0.97	0.62	0.90	0.64	0.84	1.16	0.90
C6	0.05	0.07	0.15	0.20	0.05	0.06	0.05	0.13	0.06	0.06	0.07	0.10	0.05	0.06	0.05	0.06	0.18	0.05	0.12	0.07	0.10	0.34	0.14
C8	0.07	0.06	0.14	0.18	0.05	0.06	0.06	0.07	0.06	0.08	0.06	0.10	0.06	0.08	0.06	0.07	0.16	0.08	0.12	0.08	0.10	0.32	0.11
N1	0.05	0.06	0.16	0.21	0.05	0.07	0.05	0.13	0.06	0.06	0.06	0.08	0.05	0.05	0.05	0.06	0.18	0.04	0.10	0.06	0.09	0.33	0.13
N3	0.06	0.04	0.20	0.20	0.05	0.05	0.05	0.06	0.04	0.07	0.04	0.06	0.04	0.06	0.07	0.07	0.18	0.06	0.08	0.04	0.07	0.30	0.09
N6	0.05	0.08	0.13	0.20	0.06	0.07	0.07	0.15	0.08	0.06	0.09	0.11	0.06	0.07	0.05	0.07	0.18	0.05	0.13	0.09	0.11	0.36	0.15
N7	0.06	0.07	0.13	0.19	0.05	0.06	0.06	0.09	0.07	0.07	0.07	0.10	0.06	0.07	0.06	0.07	0.17	0.07	0.13	0.08	0.11	0.33	0.13
N9	0.07	0.05	0.16	0.18	0.05	0.05	0.06	0.05	0.06	0.09	0.05	0.08	0.05	0.08	0.07	0.06	0.17	0.08	0.11	0.07	0.09	0.31	0.10
O2'	0.43	0.22	0.27	0.36	0.33	0.59	0.33	0.73	0.28	0.42	0.23	0.16	0.27	0.38	0.40	0.27	0.34	0.53	0.46	0.28	0.67	0.36	0.56
O3'	0.89	0.50	1.03	1.15	0.74	1.07	0.79	1.00	0.71	0.97	0.57	0.33	0.58	0.92	0.87	0.99	1.19	1.01	1.31	0.73	1.20	1.39	1.23
O4'	0.39	0.34	0.52	0.58	0.43	0.42	0.48	0.40	0.47	0.51	0.41	0.25	0.34	0.53	0.45	0.37	0.59	0.41	0.49	0.50	0.33	0.72	0.46
O5'	0.31	0.09	0.44	0.63	0.25	0.51	0.33	0.57	0.28	0.45	0.16	0.13	0.12	0.44	0.34	0.30	0.72	0.41	0.67	0.32	0.65	0.92	0.68
OP1	0.16	0.69	0.17	0.10	0.41	0.17	0.40	0.25	0.53	0.17	0.66	0.84	0.56	0.26	0.24	0.15	0.12	0.13	0.37	0.53	0.40	0.49	0.39
OP2	0.29	0.16	0.37	0.45	0.27	0.37	0.31	0.38	0.28	0.38	0.21	0.11	0.18	0.38	0.31	0.28	0.47	0.35	0.48	0.31	0.39	0.69	0.46
P	0.13	0.26	0.21	0.39	0.05	0.38	0.06	0.45	0.08	0.22	0.20	0.42	0.18	0.17	0.12	0.13	0.46	0.29	0.56	0.07	0.57	0.76	0.58

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.02	0.09	0.21	0.07
C2	0.02	0.00	0.05	0.14	0.00	0.07	0.00	0.23	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.13	0.12	0.02	0.16	0.01	0.15	0.36	0.19
C2'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.03	0.01	0.03	0.05	0.04	0.02	0.04	0.05	0.05	0.02	0.02	0.00	0.03	0.01	0.14	0.04	0.17	0.17	0.09
C3'	0.01	0.14	0.01	0.00	0.13	0.01	0.15	0.07	0.16	0.10	0.16	0.14	0.12	0.14	0.10	0.02	0.01	0.01	0.21	0.17	0.24	0.16	0.13
C4	0.01	0.00	0.03	0.13	0.00	0.09	0.00	0.25	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.08	0.11	0.01	0.16	0.01	0.14	0.34	0.18
C4'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.09	0.00	0.13	0.01	0.14	0.15	0.11	0.05	0.05	0.16	0.09	0.03	0.03	0.00	0.02	0.15	0.09	0.26	0.03
C5	0.01	0.00	0.03	0.15	0.00	0.13	0.00	0.34	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.15	0.02	0.18	0.01	0.20	0.39	0.23
C5'	0.06	0.23	0.05	0.07	0.25	0.01	0.34	0.00	0.36	0.34	0.31	0.20	0.19	0.39	0.23	0.03	0.08	0.01	0.01	0.40	0.16	0.37	0.02
C6	0.02	0.00	0.04	0.16	0.01	0.14	0.00	0.36	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.17	0.02	0.19	0.00	0.23	0.42	0.26
C8	0.01	0.01	0.02	0.10	0.00	0.15	0.00	0.34	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.12	0.03	0.16	0.01	0.16	0.33	0.20
N1	0.02	0.00	0.04	0.16	0.01	0.11	0.00	0.31	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.11	0.15	0.01	0.18	0.00	0.20	0.40	0.23
N2	0.02	0.00	0.05	0.14	0.01	0.05	0.01	0.20	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.14	0.11	0.02	0.15	0.01	0.14	0.35	0.17
N3	0.02	0.00	0.05	0.12	0.00	0.05	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.12	0.09	0.02	0.14	0.01	0.12	0.32	0.15
N7	0.01	0.00	0.02	0.14	0.00	0.16	0.00	0.39	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.16	0.03	0.19	0.01	0.23	0.40	0.26
N9	0.01	0.01	0.02	0.10	0.00	0.09	0.01	0.23	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.08	0.01	0.13	0.01	0.11	0.29	0.14
O2'	0.01	0.13	0.00	0.02	0.08	0.03	0.07	0.03	0.09	0.02	0.11	0.14	0.12	0.03	0.03	0.00	0.05	0.06	0.05	0.09	0.09	0.22	0.06
O3'	0.01	0.12	0.03	0.01	0.11	0.03	0.15	0.08	0.17	0.12	0.15	0.11	0.09	0.16	0.08	0.05	0.00	0.02	0.14	0.19	0.20	0.22	0.09
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.06	0.02	0.00	0.06	0.02	0.08	0.20	0.06
O5'	0.08	0.16	0.14	0.21	0.16	0.02	0.18	0.01	0.19	0.16	0.18	0.15	0.14	0.19	0.13	0.05	0.14	0.06	0.00	0.21	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.04	0.17	0.01	0.15	0.01	0.40	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.19	0.02	0.21	0.00	0.28	0.45	0.29
OP1	0.09	0.15	0.17	0.24	0.14	0.09	0.20	0.16	0.23	0.16	0.20	0.14	0.12	0.23	0.11	0.09	0.20	0.08	0.02	0.28	0.00	0.00	0.00
OP2	0.21	0.36	0.17	0.16	0.34	0.26	0.39	0.37	0.42	0.33	0.40	0.35	0.32	0.40	0.29	0.22	0.22	0.20	0.02	0.45	0.00	0.00	0.00
P	0.07	0.19	0.09	0.13	0.18	0.03	0.23	0.02	0.26	0.20	0.23	0.17	0.15	0.26	0.14	0.06	0.09	0.06	0.01	0.29	0.00	0.00	0.00