Doublet Group distance statistics: 53450

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 2, 2, 0, 0, 2, 1, 0, 0, 1, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.015, 0.024, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.015 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.009, 0.023, 0.036, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.023 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.005, 0.021, 0.037, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.021 std_dev=0.016
C5	A	0, 0.003, 0.019, 0.035, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.019 std_dev=0.016
N3	A	0, 0.007, 0.026, 0.045, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.026 std_dev=0.019
C4	A	0, 0.006, 0.025, 0.044, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.025 std_dev=0.019
N9	A	0, 0.004, 0.029, 0.053, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.029 std_dev=0.025
C1'	A	0, 0.005, 0.032, 0.058, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.032 std_dev=0.026
N6	A	0, 0.009, 0.037, 0.065, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.037 std_dev=0.028
N7	A	0, 0.004, 0.034, 0.063, 0.116 max_d=0.116 avg_d=0.034 std_dev=0.030
C8	A	0, 0.004, 0.037, 0.071, 0.137 max_d=0.137 avg_d=0.037 std_dev=0.033
N3	B	0, 0.110, 0.254, 0.399, 0.482 max_d=0.482 avg_d=0.254 std_dev=0.145
C2	B	0, 0.050, 0.328, 0.606, 0.857 max_d=0.857 avg_d=0.328 std_dev=0.278
N1	B	0, 0.118, 0.401, 0.684, 0.869 max_d=0.869 avg_d=0.401 std_dev=0.283
O4'	A	0, -0.069, 0.216, 0.501, 0.965 max_d=0.965 avg_d=0.216 std_dev=0.285
C4	B	0, 0.117, 0.405, 0.694, 0.874 max_d=0.874 avg_d=0.405 std_dev=0.288
C2'	A	0, -0.059, 0.250, 0.559, 0.949 max_d=0.949 avg_d=0.250 std_dev=0.309
O2'	A	0, -0.038, 0.332, 0.702, 0.941 max_d=0.941 avg_d=0.332 std_dev=0.370
C6	B	0, 0.108, 0.498, 0.888, 1.176 max_d=1.176 avg_d=0.498 std_dev=0.390
C4'	A	0, -0.093, 0.347, 0.787, 1.494 max_d=1.494 avg_d=0.347 std_dev=0.440
C5	B	0, 0.046, 0.527, 1.008, 1.386 max_d=1.386 avg_d=0.527 std_dev=0.481
C3'	A	0, -0.105, 0.383, 0.870, 1.566 max_d=1.566 avg_d=0.383 std_dev=0.488
N9	B	0, 0.123, 0.643, 1.162, 1.400 max_d=1.400 avg_d=0.643 std_dev=0.520
O6	B	0, 0.128, 0.663, 1.197, 1.589 max_d=1.589 avg_d=0.663 std_dev=0.535
N2	B	0, -0.020, 0.549, 1.117, 1.597 max_d=1.597 avg_d=0.549 std_dev=0.569
C1'	B	0, 0.115, 0.684, 1.253, 1.836 max_d=1.836 avg_d=0.684 std_dev=0.569
O5'	A	0, 0.042, 0.616, 1.191, 1.642 max_d=1.642 avg_d=0.616 std_dev=0.574
OP2	A	0, 0.055, 0.667, 1.279, 1.807 max_d=1.807 avg_d=0.667 std_dev=0.612
P	A	0, 0.015, 0.719, 1.423, 1.950 max_d=1.950 avg_d=0.719 std_dev=0.704
O2'	B	0, 0.043, 0.749, 1.455, 2.711 max_d=2.711 avg_d=0.749 std_dev=0.706
C5'	A	0, -0.127, 0.586, 1.299, 2.415 max_d=2.415 avg_d=0.586 std_dev=0.713
O3'	A	0, -0.163, 0.553, 1.268, 2.251 max_d=2.251 avg_d=0.553 std_dev=0.715
C2'	B	0, 0.077, 0.845, 1.613, 2.569 max_d=2.569 avg_d=0.845 std_dev=0.768
N7	B	0, 0.003, 0.790, 1.576, 2.201 max_d=2.201 avg_d=0.790 std_dev=0.786
C8	B	0, 0.066, 0.853, 1.641, 2.177 max_d=2.177 avg_d=0.853 std_dev=0.787
OP1	A	0, 0.035, 0.915, 1.795, 2.473 max_d=2.473 avg_d=0.915 std_dev=0.880
O4'	B	0, 0.057, 1.011, 1.965, 2.908 max_d=2.908 avg_d=1.011 std_dev=0.954
C3'	B	0, 0.015, 1.195, 2.375, 3.677 max_d=3.677 avg_d=1.195 std_dev=1.180
C4'	B	0, -0.004, 1.237, 2.478, 3.871 max_d=3.871 avg_d=1.237 std_dev=1.241
O3'	B	0, -0.045, 1.420, 2.885, 4.760 max_d=4.760 avg_d=1.420 std_dev=1.465
O5'	B	0, 0.073, 1.570, 3.068, 4.164 max_d=4.164 avg_d=1.570 std_dev=1.497
C5'	B	0, -0.068, 1.548, 3.163, 4.712 max_d=4.712 avg_d=1.548 std_dev=1.616
OP2	B	0, 0.153, 1.806, 3.459, 4.638 max_d=4.638 avg_d=1.806 std_dev=1.653
P	B	0, 0.061, 1.840, 3.619, 5.492 max_d=5.492 avg_d=1.840 std_dev=1.779
OP1	B	0, 0.001, 2.130, 4.259, 7.164 max_d=7.164 avg_d=2.130 std_dev=2.129

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.04	0.01	0.05	0.06	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.19	0.06	0.12
C2	0.06	0.00	0.27	0.25	0.01	0.10	0.02	0.05	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01	0.30	0.34	0.04	0.08	0.14	0.12	0.09
C2'	0.00	0.27	0.00	0.00	0.15	0.01	0.10	0.01	0.15	0.08	0.22	0.26	0.13	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.08	0.07	0.17	0.04
C3'	0.01	0.25	0.00	0.00	0.13	0.00	0.09	0.02	0.14	0.14	0.22	0.23	0.12	0.10	0.05	0.01	0.01	0.01	0.14	0.13	0.21	0.13
C4	0.03	0.01	0.15	0.13	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.15	0.16	0.03	0.07	0.13	0.11	0.09
C4'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.05	0.09	0.08	0.10	0.05	0.08	0.03	0.04	0.02	0.00	0.01	0.14	0.02	0.05
C5	0.03	0.02	0.10	0.09	0.01	0.04	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.12	0.02	0.11	0.12	0.18	0.13
C5'	0.02	0.05	0.01	0.02	0.04	0.01	0.09	0.00	0.09	0.14	0.06	0.04	0.12	0.15	0.06	0.03	0.02	0.01	0.01	0.12	0.03	0.01
C6	0.04	0.02	0.15	0.14	0.01	0.05	0.01	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.18	0.19	0.03	0.11	0.12	0.20	0.14
C8	0.01	0.01	0.08	0.14	0.01	0.09	0.01	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.15	0.02	0.13	0.15	0.16	0.13
N1	0.05	0.00	0.22	0.22	0.01	0.08	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.26	0.30	0.04	0.09	0.12	0.17	0.11
N3	0.06	0.00	0.26	0.23	0.01	0.10	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.28	0.30	0.04	0.08	0.16	0.10	0.09
N6	0.03	0.02	0.13	0.12	0.02	0.05	0.01	0.12	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.16	0.17	0.03	0.13	0.15	0.26	0.19
N7	0.01	0.02	0.02	0.10	0.01	0.08	0.01	0.15	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.10	0.02	0.15	0.16	0.23	0.18
N9	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.03	0.01	0.06	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.07	0.15	0.09	0.10
O2'	0.01	0.30	0.00	0.01	0.15	0.04	0.11	0.03	0.18	0.05	0.26	0.28	0.16	0.02	0.03	0.00	0.02	0.04	0.05	0.12	0.10	0.04
O3'	0.01	0.34	0.02	0.01	0.16	0.02	0.12	0.02	0.19	0.15	0.30	0.30	0.17	0.10	0.05	0.02	0.00	0.01	0.19	0.24	0.28	0.21
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.04	0.04	0.03	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.13	0.29	0.14	0.21
O5'	0.05	0.08	0.08	0.14	0.07	0.01	0.11	0.01	0.11	0.13	0.09	0.08	0.13	0.15	0.07	0.05	0.19	0.13	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.19	0.14	0.07	0.13	0.13	0.14	0.12	0.12	0.12	0.15	0.12	0.16	0.15	0.16	0.15	0.12	0.24	0.29	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.06	0.12	0.17	0.21	0.11	0.02	0.18	0.03	0.20	0.16	0.17	0.10	0.26	0.23	0.09	0.10	0.28	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.09	0.04	0.13	0.09	0.05	0.13	0.01	0.14	0.13	0.11	0.09	0.19	0.18	0.10	0.04	0.21	0.21	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.08	0.18	0.21	0.13	0.24	0.14	0.25	0.12	0.19	0.10	0.07	0.09	0.17	0.17	0.23	0.28	0.34	0.25	0.13	0.27	0.21	0.23
C2	0.18	0.06	0.31	0.31	0.18	0.19	0.22	0.19	0.18	0.26	0.10	0.17	0.09	0.26	0.22	0.25	0.34	0.18	0.20	0.20	0.26	0.21	0.22
C2'	0.25	0.31	0.11	0.16	0.30	0.22	0.32	0.24	0.33	0.30	0.33	0.30	0.30	0.32	0.28	0.23	0.34	0.35	0.23	0.35	0.24	0.20	0.21
C3'	0.30	0.40	0.12	0.15	0.40	0.19	0.44	0.22	0.47	0.41	0.44	0.38	0.38	0.45	0.37	0.24	0.38	0.36	0.24	0.50	0.22	0.24	0.22
C4	0.16	0.09	0.11	0.09	0.12	0.16	0.13	0.19	0.13	0.14	0.11	0.07	0.09	0.14	0.13	0.08	0.10	0.28	0.17	0.14	0.17	0.12	0.12
C4'	0.26	0.22	0.17	0.21	0.27	0.22	0.30	0.25	0.30	0.33	0.26	0.18	0.22	0.34	0.28	0.27	0.38	0.38	0.26	0.33	0.27	0.26	0.28
C5	0.13	0.15	0.11	0.06	0.11	0.19	0.14	0.24	0.17	0.10	0.18	0.14	0.11	0.12	0.09	0.07	0.08	0.30	0.18	0.19	0.17	0.11	0.13
C5'	0.26	0.23	0.17	0.21	0.28	0.21	0.33	0.24	0.34	0.36	0.29	0.18	0.22	0.37	0.30	0.27	0.39	0.37	0.26	0.38	0.26	0.27	0.28
C6	0.08	0.19	0.19	0.13	0.15	0.11	0.20	0.16	0.24	0.14	0.23	0.16	0.14	0.18	0.11	0.13	0.17	0.23	0.11	0.26	0.10	0.07	0.08
C8	0.20	0.13	0.11	0.18	0.09	0.32	0.10	0.36	0.13	0.13	0.14	0.15	0.10	0.11	0.12	0.15	0.21	0.39	0.30	0.14	0.31	0.23	0.26
N1	0.10	0.13	0.28	0.26	0.19	0.09	0.25	0.09	0.25	0.22	0.20	0.07	0.12	0.26	0.18	0.22	0.30	0.13	0.11	0.27	0.16	0.15	0.13
N3	0.21	0.07	0.21	0.21	0.14	0.18	0.16	0.20	0.13	0.21	0.07	0.13	0.10	0.20	0.19	0.16	0.22	0.25	0.19	0.14	0.24	0.17	0.20
N6	0.07	0.25	0.19	0.12	0.17	0.15	0.22	0.21	0.28	0.12	0.30	0.27	0.17	0.19	0.10	0.14	0.17	0.26	0.14	0.31	0.12	0.10	0.13
N7	0.17	0.17	0.07	0.12	0.09	0.30	0.11	0.36	0.16	0.09	0.18	0.20	0.11	0.09	0.08	0.09	0.13	0.39	0.28	0.18	0.29	0.20	0.24
N9	0.20	0.09	0.12	0.16	0.11	0.25	0.12	0.27	0.12	0.15	0.11	0.09	0.09	0.14	0.15	0.15	0.18	0.35	0.24	0.13	0.25	0.19	0.20
O2'	0.32	0.28	0.22	0.23	0.31	0.29	0.32	0.30	0.31	0.33	0.29	0.25	0.29	0.33	0.32	0.33	0.40	0.43	0.30	0.32	0.31	0.29	0.32
O3'	0.41	0.54	0.15	0.13	0.54	0.18	0.60	0.22	0.63	0.56	0.60	0.51	0.51	0.61	0.51	0.27	0.43	0.44	0.28	0.67	0.22	0.33	0.29
O4'	0.22	0.08	0.20	0.23	0.14	0.25	0.15	0.26	0.13	0.22	0.10	0.07	0.09	0.19	0.19	0.26	0.34	0.35	0.26	0.14	0.29	0.24	0.25
O5'	0.18	0.22	0.16	0.23	0.21	0.25	0.25	0.27	0.27	0.26	0.25	0.21	0.19	0.27	0.21	0.25	0.39	0.31	0.25	0.30	0.29	0.21	0.23
OP1	0.20	0.29	0.11	0.10	0.27	0.12	0.30	0.15	0.32	0.28	0.31	0.28	0.27	0.31	0.25	0.17	0.26	0.25	0.16	0.34	0.15	0.16	0.16
OP2	0.19	0.25	0.24	0.32	0.19	0.34	0.18	0.38	0.20	0.18	0.23	0.30	0.23	0.18	0.17	0.31	0.44	0.33	0.32	0.21	0.37	0.25	0.30
P	0.19	0.21	0.12	0.17	0.21	0.21	0.25	0.24	0.26	0.25	0.24	0.21	0.20	0.27	0.21	0.17	0.29	0.30	0.23	0.29	0.24	0.18	0.19

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.03	0.04	0.06	0.04	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.05	0.08	0.09
C2	0.05	0.00	0.14	0.13	0.01	0.06	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.19	0.09	0.12	0.02	0.09	0.07	0.09
C2'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.08	0.01	0.06	0.02	0.08	0.07	0.11	0.17	0.14	0.06	0.03	0.01	0.02	0.01	0.07	0.07	0.17	0.09	0.06
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.08	0.00	0.07	0.01	0.08	0.08	0.11	0.16	0.12	0.08	0.03	0.01	0.01	0.01	0.08	0.09	0.23	0.11	0.10
C4	0.02	0.01	0.08	0.08	0.00	0.04	0.00	0.12	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.10	0.05	0.11	0.01	0.07	0.08	0.08
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.07	0.05	0.08	0.05	0.08	0.04	0.03	0.02	0.00	0.01	0.08	0.06	0.04	0.05
C5	0.01	0.01	0.06	0.07	0.00	0.06	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.09	0.03	0.13	0.01	0.10	0.11	0.12
C5'	0.03	0.13	0.02	0.01	0.12	0.01	0.15	0.00	0.16	0.14	0.15	0.13	0.11	0.16	0.10	0.03	0.03	0.01	0.02	0.18	0.03	0.02	0.02
C6	0.02	0.01	0.08	0.08	0.01	0.06	0.01	0.16	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.12	0.04	0.14	0.01	0.11	0.13	0.14
C8	0.03	0.01	0.07	0.08	0.01	0.07	0.01	0.14	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.09	0.05	0.13	0.02	0.10	0.10	0.10
N1	0.04	0.01	0.11	0.11	0.02	0.05	0.01	0.15	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.11	0.16	0.07	0.13	0.02	0.10	0.10	0.11
N2	0.06	0.01	0.17	0.16	0.01	0.08	0.01	0.13	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.18	0.23	0.11	0.12	0.04	0.10	0.07	0.08
N3	0.04	0.01	0.14	0.12	0.00	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.13	0.17	0.08	0.11	0.02	0.08	0.06	0.07
N7	0.02	0.01	0.06	0.08	0.01	0.08	0.01	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.10	0.04	0.14	0.03	0.13	0.14	0.14
N9	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.10	0.01	0.05	0.07	0.07
O2'	0.01	0.14	0.01	0.01	0.07	0.03	0.05	0.03	0.07	0.06	0.11	0.18	0.13	0.05	0.02	0.00	0.03	0.02	0.04	0.06	0.14	0.06	0.05
O3'	0.02	0.19	0.02	0.01	0.10	0.02	0.09	0.03	0.12	0.09	0.16	0.23	0.17	0.10	0.04	0.03	0.00	0.02	0.08	0.13	0.33	0.15	0.16
O4'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.05	0.00	0.03	0.01	0.04	0.05	0.07	0.11	0.08	0.04	0.01	0.02	0.02	0.00	0.08	0.04	0.15	0.18	0.20
O5'	0.04	0.12	0.07	0.08	0.11	0.01	0.13	0.02	0.14	0.13	0.13	0.12	0.11	0.14	0.10	0.04	0.08	0.08	0.00	0.16	0.02	0.02	0.01
O6	0.01	0.02	0.07	0.09	0.01	0.08	0.01	0.18	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.03	0.01	0.06	0.13	0.04	0.16	0.00	0.16	0.18	0.18
OP1	0.05	0.09	0.17	0.23	0.07	0.06	0.10	0.03	0.11	0.10	0.10	0.10	0.08	0.13	0.05	0.14	0.33	0.15	0.02	0.16	0.00	0.01	0.00
OP2	0.08	0.07	0.09	0.11	0.08	0.04	0.11	0.02	0.13	0.10	0.10	0.07	0.06	0.14	0.07	0.06	0.15	0.18	0.02	0.18	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.09	0.06	0.10	0.08	0.05	0.12	0.02	0.14	0.10	0.11	0.08	0.07	0.14	0.07	0.05	0.16	0.20	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00