Doublet Group distance statistics: 53452

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 3, 4, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.009, 0.013, 0.017, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.013 std_dev=0.004
N1	A	0, 0.016, 0.023, 0.031, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.023 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.012, 0.020, 0.028, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.020 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.005, 0.014, 0.023, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.014 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.016, 0.025, 0.034, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.025 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.019, 0.029, 0.040, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.029 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.011, 0.022, 0.033, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.022 std_dev=0.011
N9	A	0, 0.020, 0.032, 0.044, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.032 std_dev=0.012
N7	A	0, 0.023, 0.038, 0.053, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.038 std_dev=0.015
C8	A	0, 0.030, 0.049, 0.068, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.049 std_dev=0.019
N6	A	0, 0.019, 0.039, 0.059, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.039 std_dev=0.020
C5	B	0, 0.201, 0.336, 0.472, 0.520 max_d=0.520 avg_d=0.336 std_dev=0.136
N7	B	0, 0.205, 0.344, 0.484, 0.484 max_d=0.484 avg_d=0.344 std_dev=0.140
C2'	A	0, 0.064, 0.231, 0.398, 0.698 max_d=0.698 avg_d=0.231 std_dev=0.167
C4	B	0, 0.178, 0.344, 0.511, 0.652 max_d=0.652 avg_d=0.344 std_dev=0.167
O4'	A	0, 0.085, 0.253, 0.421, 0.734 max_d=0.734 avg_d=0.253 std_dev=0.168
C8	B	0, 0.185, 0.379, 0.574, 0.780 max_d=0.780 avg_d=0.379 std_dev=0.195
C6	B	0, 0.187, 0.392, 0.597, 0.823 max_d=0.823 avg_d=0.392 std_dev=0.205
N3	B	0, 0.154, 0.364, 0.574, 0.802 max_d=0.802 avg_d=0.364 std_dev=0.210
C2	B	0, 0.157, 0.383, 0.609, 0.911 max_d=0.911 avg_d=0.383 std_dev=0.226
N9	B	0, 0.146, 0.383, 0.620, 0.937 max_d=0.937 avg_d=0.383 std_dev=0.237
N1	B	0, 0.161, 0.408, 0.656, 0.971 max_d=0.971 avg_d=0.408 std_dev=0.248
O6	B	0, 0.173, 0.458, 0.743, 1.077 max_d=1.077 avg_d=0.458 std_dev=0.285
N2	B	0, 0.132, 0.434, 0.736, 1.179 max_d=1.179 avg_d=0.434 std_dev=0.302
C2'	B	0, 0.035, 0.405, 0.775, 1.311 max_d=1.311 avg_d=0.405 std_dev=0.370
C1'	B	0, 0.062, 0.445, 0.828, 1.366 max_d=1.366 avg_d=0.445 std_dev=0.383
O2'	B	0, -0.015, 0.395, 0.806, 1.428 max_d=1.428 avg_d=0.395 std_dev=0.411
O5'	A	0, 0.056, 0.527, 0.998, 1.512 max_d=1.512 avg_d=0.527 std_dev=0.471
C4'	A	0, -0.003, 0.474, 0.952, 1.814 max_d=1.814 avg_d=0.474 std_dev=0.477
O2'	A	0, 0.040, 0.555, 1.070, 1.712 max_d=1.712 avg_d=0.555 std_dev=0.515
C3'	B	0, -0.033, 0.532, 1.097, 1.926 max_d=1.926 avg_d=0.532 std_dev=0.565
C5'	A	0, 0.100, 0.679, 1.259, 2.383 max_d=2.383 avg_d=0.679 std_dev=0.579
O4'	B	0, -0.018, 0.568, 1.155, 1.983 max_d=1.983 avg_d=0.568 std_dev=0.587
P	A	0, -0.087, 0.534, 1.155, 2.056 max_d=2.056 avg_d=0.534 std_dev=0.621
C3'	A	0, -0.043, 0.581, 1.204, 1.966 max_d=1.966 avg_d=0.581 std_dev=0.624
O3'	B	0, -0.086, 0.564, 1.214, 2.213 max_d=2.213 avg_d=0.564 std_dev=0.650
C4'	B	0, -0.078, 0.613, 1.304, 2.307 max_d=2.307 avg_d=0.613 std_dev=0.691
O5'	B	0, -0.021, 0.722, 1.464, 2.525 max_d=2.525 avg_d=0.722 std_dev=0.743
OP2	B	0, 0.111, 0.861, 1.611, 2.520 max_d=2.520 avg_d=0.861 std_dev=0.750
OP1	A	0, -0.004, 0.746, 1.496, 2.699 max_d=2.699 avg_d=0.746 std_dev=0.750
OP2	A	0, -0.235, 0.575, 1.385, 2.962 max_d=2.962 avg_d=0.575 std_dev=0.810
C5'	B	0, -0.086, 0.756, 1.597, 2.810 max_d=2.810 avg_d=0.756 std_dev=0.842
P	B	0, -0.010, 0.918, 1.846, 2.966 max_d=2.966 avg_d=0.918 std_dev=0.928
O3'	A	0, -0.323, 0.841, 2.005, 3.349 max_d=3.349 avg_d=0.841 std_dev=1.164
OP1	B	0, -0.138, 1.101, 2.341, 3.889 max_d=3.889 avg_d=1.101 std_dev=1.239

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.27	0.00	0.30	0.45	0.31	0.38
C2	0.02	0.00	0.18	0.21	0.00	0.05	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.23	0.31	0.09	0.25	0.64	0.37	0.43
C2'	0.00	0.18	0.00	0.01	0.11	0.03	0.07	0.14	0.11	0.06	0.15	0.18	0.09	0.03	0.03	0.00	0.03	0.00	0.46	0.59	0.42	0.54
C3'	0.01	0.21	0.01	0.00	0.25	0.01	0.35	0.02	0.35	0.38	0.28	0.17	0.41	0.42	0.24	0.01	0.01	0.02	0.10	0.13	0.09	0.10
C4	0.01	0.00	0.11	0.25	0.00	0.09	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.23	0.15	0.04	0.26	0.64	0.39	0.44
C4'	0.01	0.05	0.03	0.01	0.09	0.00	0.16	0.01	0.14	0.23	0.09	0.04	0.18	0.22	0.12	0.28	0.02	0.01	0.02	0.07	0.04	0.02
C5	0.01	0.00	0.07	0.35	0.00	0.16	0.00	0.23	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.28	0.11	0.01	0.26	0.71	0.44	0.47
C5'	0.05	0.13	0.14	0.02	0.15	0.01	0.23	0.00	0.24	0.27	0.18	0.10	0.29	0.30	0.15	0.12	0.20	0.02	0.01	0.12	0.19	0.02
C6	0.01	0.00	0.11	0.35	0.01	0.14	0.01	0.24	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.29	0.12	0.03	0.25	0.72	0.44	0.47
C8	0.01	0.01	0.06	0.38	0.00	0.23	0.01	0.27	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.22	0.21	0.09	0.29	0.70	0.46	0.48
N1	0.02	0.00	0.15	0.28	0.01	0.09	0.00	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.27	0.19	0.07	0.24	0.69	0.41	0.45
N3	0.02	0.00	0.18	0.17	0.00	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.19	0.34	0.09	0.26	0.60	0.35	0.41
N6	0.02	0.01	0.09	0.41	0.01	0.18	0.01	0.29	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.32	0.17	0.02	0.26	0.74	0.48	0.48
N7	0.01	0.01	0.03	0.42	0.00	0.22	0.00	0.30	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.27	0.24	0.05	0.28	0.74	0.49	0.49
N9	0.00	0.01	0.03	0.24	0.00	0.12	0.01	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.17	0.07	0.01	0.28	0.61	0.39	0.44
O2'	0.01	0.23	0.00	0.01	0.23	0.28	0.28	0.12	0.29	0.22	0.27	0.19	0.32	0.27	0.17	0.00	0.04	0.20	0.23	0.36	0.14	0.32
O3'	0.27	0.31	0.03	0.01	0.15	0.02	0.11	0.20	0.12	0.21	0.19	0.34	0.17	0.24	0.07	0.04	0.00	0.18	0.31	0.17	0.44	0.31
O4'	0.00	0.09	0.00	0.02	0.04	0.01	0.01	0.02	0.03	0.09	0.07	0.09	0.02	0.05	0.01	0.20	0.18	0.00	0.17	0.23	0.20	0.20
O5'	0.30	0.25	0.46	0.10	0.26	0.02	0.26	0.01	0.25	0.29	0.24	0.26	0.26	0.28	0.28	0.23	0.31	0.17	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.45	0.64	0.59	0.13	0.64	0.07	0.71	0.12	0.72	0.70	0.69	0.60	0.74	0.74	0.61	0.36	0.17	0.23	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.31	0.37	0.42	0.09	0.39	0.04	0.44	0.19	0.44	0.46	0.41	0.35	0.48	0.49	0.39	0.14	0.44	0.20	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.38	0.43	0.54	0.10	0.44	0.02	0.47	0.02	0.47	0.48	0.45	0.41	0.48	0.49	0.44	0.32	0.31	0.20	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.21	0.10	0.08	0.14	0.15	0.10	0.14	0.12	0.10	0.17	0.27	0.21	0.08	0.13	0.13	0.09	0.19	0.11	0.10	0.07	0.05	0.09
C2	0.06	0.25	0.07	0.07	0.14	0.08	0.15	0.07	0.19	0.08	0.23	0.29	0.20	0.11	0.08	0.13	0.08	0.08	0.06	0.18	0.08	0.10	0.07
C2'	0.28	0.41	0.18	0.10	0.33	0.13	0.30	0.09	0.32	0.23	0.37	0.46	0.40	0.24	0.28	0.19	0.11	0.25	0.11	0.30	0.08	0.11	0.09
C3'	0.09	0.32	0.22	0.42	0.13	0.36	0.11	0.45	0.16	0.19	0.26	0.46	0.26	0.16	0.10	0.16	0.57	0.17	0.44	0.15	0.57	0.48	0.48
C4	0.12	0.24	0.10	0.09	0.16	0.11	0.14	0.10	0.17	0.09	0.21	0.30	0.22	0.10	0.12	0.09	0.10	0.12	0.09	0.16	0.10	0.10	0.09
C4'	0.11	0.15	0.18	0.31	0.05	0.25	0.11	0.31	0.10	0.21	0.10	0.27	0.12	0.21	0.11	0.12	0.41	0.18	0.32	0.14	0.35	0.36	0.33
C5	0.10	0.25	0.12	0.12	0.15	0.11	0.15	0.11	0.19	0.09	0.24	0.31	0.21	0.11	0.11	0.10	0.15	0.10	0.12	0.19	0.15	0.15	0.12
C5'	0.11	0.24	0.14	0.25	0.07	0.24	0.07	0.31	0.10	0.16	0.18	0.37	0.20	0.14	0.08	0.12	0.34	0.18	0.29	0.11	0.32	0.30	0.30
C6	0.07	0.25	0.09	0.11	0.14	0.08	0.16	0.08	0.21	0.09	0.25	0.31	0.18	0.12	0.09	0.09	0.14	0.08	0.10	0.22	0.15	0.16	0.11
C8	0.15	0.25	0.15	0.15	0.16	0.16	0.14	0.17	0.17	0.11	0.22	0.31	0.22	0.10	0.14	0.15	0.18	0.16	0.15	0.15	0.18	0.14	0.15
N1	0.07	0.25	0.07	0.07	0.14	0.08	0.16	0.06	0.22	0.08	0.26	0.32	0.18	0.13	0.08	0.11	0.09	0.09	0.08	0.22	0.11	0.14	0.09
N3	0.09	0.23	0.07	0.07	0.15	0.08	0.13	0.07	0.16	0.08	0.20	0.28	0.21	0.09	0.11	0.09	0.08	0.09	0.05	0.14	0.05	0.07	0.05
N6	0.07	0.23	0.10	0.12	0.13	0.08	0.16	0.08	0.22	0.09	0.25	0.29	0.15	0.13	0.08	0.09	0.17	0.08	0.11	0.24	0.18	0.19	0.13
N7	0.12	0.25	0.14	0.16	0.16	0.14	0.15	0.14	0.19	0.10	0.23	0.31	0.21	0.11	0.12	0.12	0.19	0.13	0.15	0.18	0.19	0.17	0.15
N9	0.15	0.24	0.13	0.11	0.16	0.15	0.13	0.14	0.15	0.11	0.20	0.30	0.23	0.10	0.14	0.13	0.12	0.17	0.12	0.14	0.12	0.10	0.12
O2'	0.12	0.14	0.11	0.13	0.12	0.12	0.11	0.13	0.11	0.11	0.13	0.15	0.13	0.10	0.12	0.12	0.14	0.15	0.13	0.10	0.15	0.13	0.14
O3'	0.68	0.35	0.86	1.13	0.56	1.03	0.64	1.13	0.56	0.83	0.43	0.26	0.39	0.79	0.69	0.76	1.31	0.78	1.15	0.61	1.30	1.21	1.20
O4'	0.15	0.11	0.15	0.18	0.09	0.21	0.12	0.23	0.11	0.17	0.09	0.17	0.11	0.17	0.13	0.16	0.21	0.21	0.19	0.15	0.14	0.16	0.17
O5'	0.24	0.18	0.30	0.34	0.21	0.31	0.25	0.34	0.23	0.31	0.19	0.21	0.18	0.30	0.25	0.26	0.39	0.26	0.34	0.25	0.31	0.34	0.33
OP1	0.45	0.48	0.47	0.47	0.49	0.44	0.53	0.46	0.54	0.51	0.52	0.46	0.46	0.54	0.48	0.43	0.48	0.43	0.47	0.57	0.45	0.43	0.45
OP2	0.23	0.26	0.29	0.30	0.27	0.24	0.31	0.26	0.33	0.31	0.30	0.25	0.24	0.34	0.26	0.24	0.33	0.21	0.29	0.37	0.23	0.29	0.26
P	0.33	0.30	0.37	0.38	0.34	0.34	0.37	0.36	0.36	0.39	0.33	0.28	0.30	0.40	0.35	0.33	0.40	0.32	0.37	0.39	0.31	0.35	0.35

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.05	0.02	0.07	0.06	0.05
C2	0.02	0.00	0.06	0.06	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.09	0.03	0.05	0.01	0.09	0.09	0.07
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.07	0.03	0.08	0.07	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.04	0.09	0.07	0.05
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.04	0.11	0.04	0.09	0.06	0.10	0.04	0.01	0.00	0.01	0.03	0.06	0.10	0.06	0.05
C4	0.01	0.00	0.02	0.03	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.03	0.02	0.06	0.01	0.07	0.08	0.07
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.03	0.06	0.02	0.03	0.02	0.06	0.02	0.04	0.02	0.00	0.02	0.04	0.06	0.02	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.06	0.01	0.07	0.01	0.08	0.09	0.09
C5'	0.02	0.03	0.02	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.04	0.07	0.03	0.03	0.03	0.07	0.03	0.04	0.02	0.02	0.01	0.05	0.04	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.04	0.02	0.07	0.01	0.08	0.10	0.09
C8	0.01	0.01	0.07	0.11	0.01	0.06	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.13	0.02	0.11	0.01	0.11	0.10	0.11
N1	0.02	0.00	0.03	0.04	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.05	0.03	0.06	0.01	0.08	0.09	0.08
N2	0.02	0.00	0.08	0.09	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.13	0.03	0.05	0.02	0.10	0.10	0.06
N3	0.01	0.00	0.07	0.06	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.09	0.03	0.05	0.01	0.09	0.09	0.06
N7	0.01	0.01	0.06	0.10	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.12	0.02	0.11	0.01	0.11	0.12	0.13
N9	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.04	0.01	0.06	0.01	0.07	0.07	0.07
O2'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.04	0.04	0.03	0.04	0.04	0.04	0.06	0.09	0.07	0.04	0.02	0.00	0.04	0.03	0.04	0.05	0.09	0.05	0.04
O3'	0.02	0.09	0.02	0.00	0.03	0.02	0.06	0.02	0.04	0.13	0.05	0.13	0.09	0.12	0.04	0.04	0.00	0.02	0.03	0.07	0.12	0.07	0.05
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.03	0.02	0.01	0.03	0.02	0.00	0.05	0.02	0.06	0.05	0.05
O5'	0.05	0.05	0.04	0.03	0.06	0.02	0.07	0.01	0.07	0.11	0.06	0.05	0.05	0.11	0.06	0.04	0.03	0.05	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00
O6	0.02	0.01	0.04	0.06	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.07	0.02	0.08	0.00	0.09	0.11	0.10
OP1	0.07	0.09	0.09	0.10	0.07	0.06	0.08	0.04	0.08	0.11	0.08	0.10	0.09	0.11	0.07	0.09	0.12	0.06	0.01	0.09	0.00	0.01	0.01
OP2	0.06	0.09	0.07	0.06	0.08	0.02	0.09	0.01	0.10	0.10	0.09	0.10	0.09	0.12	0.07	0.05	0.07	0.05	0.01	0.11	0.01	0.00	0.00
P	0.05	0.07	0.05	0.05	0.07	0.02	0.09	0.01	0.09	0.11	0.08	0.06	0.06	0.13	0.07	0.04	0.05	0.05	0.00	0.10	0.01	0.00	0.00