Doublet Group distance statistics: 53453

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 1, 1, 0, 1, 1, 1, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.011, 0.022, 0.034, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.022 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.004, 0.019, 0.034, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.019 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.012, 0.030, 0.049, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.030 std_dev=0.018
N3	A	0, 0.019, 0.039, 0.058, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.039 std_dev=0.019
N1	A	0, 0.022, 0.045, 0.067, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.045 std_dev=0.022
C5	A	0, 0.022, 0.044, 0.067, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.044 std_dev=0.023
C4	A	0, 0.025, 0.054, 0.082, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.054 std_dev=0.028
N9	A	0, 0.021, 0.055, 0.090, 0.114 max_d=0.114 avg_d=0.055 std_dev=0.035
N6	A	0, 0.032, 0.071, 0.110, 0.114 max_d=0.114 avg_d=0.071 std_dev=0.039
N7	A	0, 0.044, 0.091, 0.139, 0.142 max_d=0.142 avg_d=0.091 std_dev=0.048
C8	A	0, 0.048, 0.106, 0.164, 0.166 max_d=0.166 avg_d=0.106 std_dev=0.058
N2	B	0, 0.258, 0.542, 0.826, 0.858 max_d=0.858 avg_d=0.542 std_dev=0.284
C2	B	0, 0.248, 0.552, 0.856, 0.929 max_d=0.929 avg_d=0.552 std_dev=0.304
N3	B	0, 0.240, 0.556, 0.872, 0.966 max_d=0.966 avg_d=0.556 std_dev=0.316
N1	B	0, 0.251, 0.572, 0.892, 0.957 max_d=0.957 avg_d=0.572 std_dev=0.321
C2'	B	0, 0.255, 0.585, 0.915, 0.939 max_d=0.939 avg_d=0.585 std_dev=0.330
C6	B	0, 0.255, 0.600, 0.945, 1.016 max_d=1.016 avg_d=0.600 std_dev=0.345
C4	B	0, 0.225, 0.571, 0.917, 1.016 max_d=1.016 avg_d=0.571 std_dev=0.346
O2'	B	0, 0.286, 0.641, 0.996, 1.106 max_d=1.106 avg_d=0.641 std_dev=0.355
C5	B	0, 0.234, 0.593, 0.953, 1.040 max_d=1.040 avg_d=0.593 std_dev=0.359
O6	B	0, 0.281, 0.643, 1.006, 1.042 max_d=1.042 avg_d=0.643 std_dev=0.362
N9	B	0, 0.221, 0.595, 0.969, 1.056 max_d=1.056 avg_d=0.595 std_dev=0.374
C1'	B	0, 0.254, 0.635, 1.017, 1.084 max_d=1.084 avg_d=0.635 std_dev=0.381
N7	B	0, 0.230, 0.623, 1.016, 1.148 max_d=1.148 avg_d=0.623 std_dev=0.393
C8	B	0, 0.212, 0.613, 1.014, 1.129 max_d=1.129 avg_d=0.613 std_dev=0.401
C3'	B	0, 0.241, 0.646, 1.052, 1.171 max_d=1.171 avg_d=0.646 std_dev=0.405
O3'	B	0, 0.225, 0.662, 1.099, 1.306 max_d=1.306 avg_d=0.662 std_dev=0.437
O4'	B	0, 0.243, 0.696, 1.149, 1.279 max_d=1.279 avg_d=0.696 std_dev=0.453
C4'	B	0, 0.226, 0.700, 1.175, 1.407 max_d=1.407 avg_d=0.700 std_dev=0.474
C2'	A	0, 0.193, 0.729, 1.264, 1.277 max_d=1.277 avg_d=0.729 std_dev=0.535
O4'	A	0, 0.182, 0.729, 1.276, 1.262 max_d=1.262 avg_d=0.729 std_dev=0.547
C5'	B	0, 0.189, 0.747, 1.306, 1.713 max_d=1.713 avg_d=0.747 std_dev=0.559
O2'	A	0, 0.281, 0.840, 1.399, 1.528 max_d=1.528 avg_d=0.840 std_dev=0.559
O5'	B	0, 0.152, 0.924, 1.696, 2.140 max_d=2.140 avg_d=0.924 std_dev=0.772
C4'	A	0, 0.252, 1.043, 1.833, 1.827 max_d=1.827 avg_d=1.043 std_dev=0.790
C3'	A	0, 0.252, 1.139, 2.025, 2.029 max_d=2.029 avg_d=1.139 std_dev=0.886
O5'	A	0, 0.356, 1.533, 2.710, 2.659 max_d=2.659 avg_d=1.533 std_dev=1.177
O3'	A	0, 0.391, 1.620, 2.849, 2.800 max_d=2.800 avg_d=1.620 std_dev=1.229
C5'	A	0, 0.391, 1.727, 3.063, 3.076 max_d=3.076 avg_d=1.727 std_dev=1.336
P	B	0, 0.140, 1.519, 2.899, 3.832 max_d=3.832 avg_d=1.519 std_dev=1.380
OP1	B	0, 0.101, 1.748, 3.395, 4.669 max_d=4.669 avg_d=1.748 std_dev=1.647
OP2	B	0, 0.121, 1.939, 3.756, 5.218 max_d=5.218 avg_d=1.939 std_dev=1.818
OP2	A	0, 0.666, 2.577, 4.487, 4.959 max_d=4.959 avg_d=2.577 std_dev=1.911
P	A	0, 0.669, 2.739, 4.808, 4.811 max_d=4.811 avg_d=2.739 std_dev=2.069
OP1	A	0, 0.898, 3.710, 6.521, 6.341 max_d=6.341 avg_d=3.710 std_dev=2.812

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.04	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.22	0.15	0.17	0.16
C2	0.04	0.00	0.34	0.29	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.33	0.39	0.17	0.55	0.60	0.65	0.68
C2'	0.01	0.34	0.00	0.01	0.17	0.01	0.09	0.03	0.16	0.17	0.26	0.34	0.12	0.11	0.03	0.01	0.01	0.01	0.31	0.33	0.30	0.13
C3'	0.01	0.29	0.01	0.00	0.14	0.01	0.10	0.03	0.14	0.23	0.23	0.27	0.12	0.17	0.06	0.02	0.01	0.01	0.37	0.31	0.45	0.15
C4	0.02	0.01	0.17	0.14	0.00	0.03	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.16	0.17	0.09	0.54	0.57	0.64	0.66
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.04	0.09	0.03	0.05	0.06	0.09	0.03	0.04	0.03	0.01	0.02	0.38	0.10	0.23
C5	0.01	0.01	0.09	0.10	0.01	0.05	0.00	0.14	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.09	0.13	0.05	0.66	0.85	0.89	0.93
C5'	0.03	0.11	0.03	0.03	0.10	0.01	0.14	0.00	0.15	0.14	0.13	0.09	0.17	0.17	0.09	0.04	0.04	0.02	0.01	0.09	0.22	0.02
C6	0.02	0.01	0.16	0.14	0.01	0.04	0.00	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.16	0.20	0.09	0.69	0.95	0.97	1.01
C8	0.02	0.02	0.17	0.23	0.01	0.09	0.01	0.14	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.10	0.25	0.11	0.61	0.69	0.80	0.81
N1	0.03	0.00	0.26	0.23	0.01	0.03	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.26	0.32	0.14	0.64	0.83	0.84	0.89
N3	0.04	0.01	0.34	0.27	0.01	0.05	0.02	0.09	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.32	0.35	0.16	0.47	0.43	0.51	0.53
N6	0.02	0.01	0.12	0.12	0.01	0.06	0.01	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.18	0.07	0.75	1.14	1.13	1.18
N7	0.01	0.02	0.11	0.17	0.02	0.09	0.01	0.17	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.05	0.20	0.06	0.70	0.93	1.01	1.04
N9	0.00	0.02	0.03	0.06	0.01	0.03	0.01	0.09	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.01	0.47	0.42	0.53	0.53
O2'	0.02	0.33	0.01	0.02	0.16	0.04	0.09	0.04	0.16	0.10	0.26	0.32	0.12	0.05	0.02	0.00	0.04	0.04	0.08	0.72	0.11	0.35
O3'	0.02	0.39	0.01	0.01	0.17	0.03	0.13	0.04	0.20	0.25	0.32	0.35	0.18	0.20	0.06	0.04	0.00	0.02	0.26	0.64	0.42	0.12
O4'	0.01	0.17	0.01	0.01	0.09	0.01	0.05	0.02	0.09	0.11	0.14	0.16	0.07	0.06	0.01	0.04	0.02	0.00	0.03	0.14	0.13	0.17
O5'	0.22	0.55	0.31	0.37	0.54	0.02	0.66	0.01	0.69	0.61	0.64	0.47	0.75	0.70	0.47	0.08	0.26	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.15	0.60	0.33	0.31	0.57	0.38	0.85	0.09	0.95	0.69	0.83	0.43	1.14	0.93	0.42	0.72	0.64	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.17	0.65	0.30	0.45	0.64	0.10	0.89	0.22	0.97	0.80	0.84	0.51	1.13	1.01	0.53	0.11	0.42	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.16	0.68	0.13	0.15	0.66	0.23	0.93	0.02	1.01	0.81	0.89	0.53	1.18	1.04	0.53	0.35	0.12	0.17	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.26	0.18	0.19	0.24	0.15	0.25	0.16	0.25	0.21	0.26	0.25	0.25	0.23	0.21	0.17	0.19	0.15	0.22	0.26	0.41	0.35	0.11
C2	0.10	0.13	0.18	0.21	0.12	0.15	0.14	0.15	0.16	0.11	0.16	0.13	0.11	0.13	0.11	0.14	0.26	0.11	0.50	0.18	0.35	0.89	0.45
C2'	0.15	0.33	0.17	0.15	0.27	0.10	0.29	0.10	0.32	0.23	0.34	0.36	0.30	0.27	0.22	0.10	0.14	0.12	0.14	0.33	0.45	0.23	0.17
C3'	0.30	0.42	0.18	0.14	0.40	0.19	0.44	0.21	0.46	0.40	0.45	0.40	0.39	0.43	0.37	0.11	0.11	0.29	0.21	0.48	0.74	0.26	0.49
C4	0.11	0.21	0.17	0.19	0.17	0.13	0.19	0.14	0.21	0.15	0.22	0.22	0.18	0.17	0.14	0.16	0.23	0.10	0.34	0.22	0.32	0.59	0.21
C4'	0.10	0.12	0.10	0.12	0.11	0.07	0.12	0.08	0.12	0.12	0.12	0.14	0.12	0.13	0.11	0.13	0.22	0.13	0.15	0.13	0.77	0.21	0.48
C5	0.11	0.20	0.17	0.19	0.17	0.13	0.18	0.14	0.20	0.15	0.21	0.21	0.17	0.17	0.14	0.16	0.23	0.10	0.31	0.21	0.35	0.55	0.18
C5'	0.15	0.13	0.11	0.15	0.13	0.10	0.15	0.13	0.13	0.18	0.13	0.16	0.12	0.17	0.15	0.14	0.31	0.22	0.33	0.14	1.01	0.50	0.74
C6	0.09	0.16	0.17	0.20	0.13	0.13	0.15	0.14	0.17	0.12	0.18	0.17	0.14	0.14	0.11	0.15	0.25	0.09	0.38	0.19	0.32	0.69	0.27
C8	0.17	0.25	0.18	0.19	0.23	0.16	0.23	0.16	0.24	0.20	0.25	0.25	0.24	0.22	0.20	0.19	0.21	0.15	0.18	0.25	0.51	0.29	0.15
N1	0.09	0.13	0.17	0.21	0.11	0.14	0.13	0.14	0.16	0.11	0.16	0.14	0.11	0.13	0.10	0.14	0.26	0.10	0.47	0.18	0.33	0.85	0.41
N3	0.09	0.17	0.17	0.20	0.14	0.14	0.16	0.15	0.19	0.13	0.19	0.18	0.13	0.15	0.11	0.14	0.25	0.09	0.44	0.20	0.31	0.78	0.37
N6	0.09	0.16	0.17	0.20	0.13	0.13	0.15	0.13	0.17	0.12	0.18	0.17	0.14	0.14	0.11	0.15	0.25	0.09	0.37	0.19	0.32	0.67	0.25
N7	0.15	0.23	0.18	0.20	0.20	0.15	0.21	0.15	0.22	0.18	0.23	0.24	0.21	0.20	0.18	0.18	0.22	0.14	0.22	0.23	0.46	0.38	0.12
N9	0.14	0.24	0.18	0.19	0.21	0.14	0.22	0.15	0.24	0.19	0.24	0.25	0.22	0.21	0.18	0.17	0.21	0.13	0.24	0.24	0.40	0.41	0.11
O2'	0.14	0.30	0.24	0.21	0.23	0.12	0.24	0.12	0.26	0.18	0.29	0.33	0.28	0.21	0.19	0.16	0.25	0.13	0.24	0.26	0.33	0.38	0.16
O3'	0.54	0.65	0.39	0.35	0.67	0.37	0.72	0.39	0.74	0.66	0.70	0.59	0.62	0.71	0.63	0.28	0.29	0.50	0.39	0.76	0.87	0.51	0.68
O4'	0.19	0.32	0.27	0.28	0.28	0.19	0.29	0.19	0.31	0.23	0.32	0.32	0.30	0.26	0.24	0.25	0.30	0.15	0.11	0.32	0.57	0.15	0.22
O5'	0.27	0.24	0.22	0.30	0.11	0.45	0.11	0.51	0.15	0.22	0.23	0.35	0.15	0.16	0.18	0.25	0.28	0.41	0.67	0.16	1.40	0.79	1.07
OP1	1.35	0.45	1.13	1.28	0.91	1.66	0.90	1.77	0.68	1.28	0.48	0.24	0.68	1.12	1.18	1.16	1.15	1.64	2.01	0.66	2.67	2.18	2.44
OP2	0.65	0.16	0.59	0.76	0.36	0.95	0.36	1.07	0.23	0.62	0.17	0.26	0.22	0.52	0.54	0.61	0.77	0.87	1.40	0.22	2.26	1.64	1.87
P	0.87	0.16	0.79	0.95	0.50	1.18	0.49	1.28	0.31	0.80	0.17	0.19	0.33	0.66	0.72	0.83	0.94	1.10	1.55	0.29	2.30	1.71	1.98

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.02	0.03	0.01	0.03	0.02	0.04	0.02	0.05	0.08	0.05	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.43	0.04	0.31	0.51	0.33
C2	0.05	0.00	0.06	0.08	0.01	0.05	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.10	0.07	0.67	0.02	0.59	1.13	0.72
C2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.05	0.05	0.05	0.07	0.06	0.05	0.02	0.01	0.02	0.01	0.23	0.05	0.25	0.35	0.17
C3'	0.02	0.08	0.01	0.00	0.06	0.01	0.06	0.03	0.07	0.07	0.08	0.09	0.08	0.07	0.04	0.02	0.01	0.01	0.15	0.07	0.27	0.20	0.15
C4	0.03	0.01	0.03	0.06	0.00	0.03	0.01	0.04	0.02	0.00	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.04	0.06	0.04	0.74	0.02	0.68	1.12	0.79
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.05	0.05	0.05	0.07	0.05	0.05	0.03	0.05	0.03	0.01	0.01	0.06	0.17	0.15	0.09
C5	0.03	0.01	0.04	0.06	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.06	0.04	0.91	0.02	0.95	1.44	1.06
C5'	0.02	0.04	0.02	0.03	0.04	0.01	0.06	0.00	0.06	0.07	0.05	0.06	0.04	0.07	0.04	0.05	0.06	0.01	0.01	0.08	0.34	0.31	0.03
C6	0.04	0.01	0.05	0.07	0.02	0.05	0.01	0.06	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.06	0.08	0.05	0.91	0.00	0.99	1.54	1.10
C8	0.02	0.01	0.05	0.07	0.00	0.05	0.01	0.07	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.08	0.03	0.94	0.04	0.96	1.30	1.05
N1	0.05	0.01	0.05	0.08	0.02	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.06	0.10	0.06	0.80	0.02	0.81	1.37	0.93
N2	0.08	0.01	0.07	0.09	0.02	0.07	0.01	0.06	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.08	0.12	0.09	0.58	0.04	0.48	1.02	0.60
N3	0.05	0.01	0.06	0.08	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.05	0.09	0.06	0.60	0.02	0.49	0.96	0.61
N7	0.02	0.01	0.05	0.07	0.01	0.05	0.00	0.07	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.08	0.03	1.01	0.04	1.13	1.58	1.22
N9	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.03	0.02	0.04	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.02	0.00	0.02	0.04	0.02	0.73	0.03	0.65	0.98	0.73
O2'	0.02	0.07	0.01	0.02	0.04	0.05	0.04	0.05	0.06	0.04	0.06	0.08	0.05	0.04	0.02	0.00	0.05	0.04	0.08	0.06	0.45	0.05	0.24
O3'	0.02	0.10	0.02	0.01	0.06	0.03	0.06	0.06	0.08	0.08	0.10	0.12	0.09	0.08	0.04	0.05	0.00	0.02	0.23	0.09	0.32	0.16	0.24
O4'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.05	0.03	0.06	0.09	0.06	0.03	0.02	0.04	0.02	0.00	0.37	0.05	0.26	0.32	0.23
O5'	0.43	0.67	0.23	0.15	0.74	0.01	0.91	0.01	0.91	0.94	0.80	0.58	0.60	1.01	0.73	0.08	0.23	0.37	0.00	0.98	0.03	0.03	0.01
O6	0.04	0.02	0.05	0.07	0.02	0.06	0.02	0.08	0.00	0.04	0.02	0.04	0.02	0.04	0.03	0.06	0.09	0.05	0.98	0.00	1.15	1.72	1.24
OP1	0.31	0.59	0.25	0.27	0.68	0.17	0.95	0.34	0.99	0.96	0.81	0.48	0.49	1.13	0.65	0.45	0.32	0.26	0.03	1.15	0.00	0.02	0.01
OP2	0.51	1.13	0.35	0.20	1.12	0.15	1.44	0.31	1.54	1.30	1.37	1.02	0.96	1.58	0.98	0.05	0.16	0.32	0.03	1.72	0.02	0.00	0.01
P	0.33	0.72	0.17	0.15	0.79	0.09	1.06	0.03	1.10	1.05	0.93	0.60	0.61	1.22	0.73	0.24	0.24	0.23	0.01	1.24	0.01	0.01	0.00