Doublet Group distance statistics: 53454

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 3, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.008, 0.012, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.008 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.003, 0.009, 0.015, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.009 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.005, 0.012, 0.019, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.012 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.005, 0.014, 0.023, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.014 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.010 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.004, 0.014, 0.025, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.014 std_dev=0.010
N6	A	0, 0.009, 0.019, 0.030, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.019 std_dev=0.011
N7	A	0, 0.006, 0.017, 0.028, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.017 std_dev=0.011
C8	A	0, 0.007, 0.020, 0.033, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.020 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.001, 0.014, 0.028, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.014 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.004, 0.018, 0.032, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.018 std_dev=0.014
C4	B	0, 0.104, 0.243, 0.381, 0.450 max_d=0.450 avg_d=0.243 std_dev=0.138
C5	B	0, 0.150, 0.302, 0.454, 0.545 max_d=0.545 avg_d=0.302 std_dev=0.152
N3	B	0, 0.057, 0.249, 0.442, 0.701 max_d=0.701 avg_d=0.249 std_dev=0.192
N7	B	0, 0.138, 0.361, 0.583, 0.798 max_d=0.798 avg_d=0.361 std_dev=0.222
C6	B	0, 0.165, 0.396, 0.627, 0.849 max_d=0.849 avg_d=0.396 std_dev=0.231
N9	B	0, 0.049, 0.289, 0.528, 0.888 max_d=0.888 avg_d=0.289 std_dev=0.239
C2'	B	0, 0.017, 0.258, 0.499, 0.891 max_d=0.891 avg_d=0.258 std_dev=0.241
O6	B	0, 0.220, 0.484, 0.747, 0.970 max_d=0.970 avg_d=0.484 std_dev=0.264
O4'	A	0, -0.091, 0.222, 0.534, 0.958 max_d=0.958 avg_d=0.222 std_dev=0.313
C2'	A	0, -0.070, 0.243, 0.556, 1.002 max_d=1.002 avg_d=0.243 std_dev=0.313
C1'	B	0, -0.007, 0.326, 0.660, 1.230 max_d=1.230 avg_d=0.326 std_dev=0.334
C8	B	0, 0.031, 0.367, 0.702, 1.224 max_d=1.224 avg_d=0.367 std_dev=0.336
C2	B	0, -0.005, 0.353, 0.710, 1.288 max_d=1.288 avg_d=0.353 std_dev=0.358
O2'	A	0, -0.046, 0.324, 0.694, 1.228 max_d=1.228 avg_d=0.324 std_dev=0.370
N1	B	0, 0.054, 0.425, 0.797, 1.371 max_d=1.371 avg_d=0.425 std_dev=0.372
C4'	A	0, -0.111, 0.329, 0.769, 1.400 max_d=1.400 avg_d=0.329 std_dev=0.440
C3'	A	0, -0.110, 0.383, 0.875, 1.583 max_d=1.583 avg_d=0.383 std_dev=0.493
N2	B	0, -0.119, 0.421, 0.962, 1.890 max_d=1.890 avg_d=0.421 std_dev=0.540
C3'	B	0, -0.159, 0.422, 1.003, 2.003 max_d=2.003 avg_d=0.422 std_dev=0.581
O5'	A	0, -0.049, 0.543, 1.136, 1.853 max_d=1.853 avg_d=0.543 std_dev=0.592
O4'	B	0, -0.149, 0.499, 1.148, 2.276 max_d=2.276 avg_d=0.499 std_dev=0.649
O3'	A	0, -0.151, 0.499, 1.150, 2.087 max_d=2.087 avg_d=0.499 std_dev=0.651
O3'	B	0, -0.173, 0.508, 1.190, 2.314 max_d=2.314 avg_d=0.508 std_dev=0.682
O2'	B	0, -0.225, 0.504, 1.233, 2.542 max_d=2.542 avg_d=0.504 std_dev=0.729
C5'	A	0, -0.207, 0.577, 1.361, 2.472 max_d=2.472 avg_d=0.577 std_dev=0.784
C4'	B	0, -0.239, 0.557, 1.354, 2.739 max_d=2.739 avg_d=0.557 std_dev=0.796
OP2	A	0, -0.129, 0.711, 1.550, 2.434 max_d=2.434 avg_d=0.711 std_dev=0.839
P	A	0, -0.159, 0.767, 1.692, 2.485 max_d=2.485 avg_d=0.767 std_dev=0.926
OP1	A	0, -0.203, 0.989, 2.181, 3.270 max_d=3.270 avg_d=0.989 std_dev=1.192
C5'	B	0, -0.447, 0.760, 1.966, 4.083 max_d=4.083 avg_d=0.760 std_dev=1.207
O5'	B	0, -0.519, 0.765, 2.049, 4.354 max_d=4.354 avg_d=0.765 std_dev=1.284
P	B	0, -0.826, 0.962, 2.751, 5.953 max_d=5.953 avg_d=0.962 std_dev=1.788
OP2	B	0, -0.917, 0.990, 2.898, 6.337 max_d=6.337 avg_d=0.990 std_dev=1.908
OP1	B	0, -0.885, 1.143, 3.172, 6.756 max_d=6.756 avg_d=1.143 std_dev=2.028

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.13	0.13	0.06	0.10
C2	0.03	0.00	0.20	0.17	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.20	0.23	0.10	0.28	0.25	0.19	0.29
C2'	0.00	0.20	0.00	0.00	0.10	0.00	0.05	0.01	0.09	0.09	0.16	0.20	0.07	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.21	0.22	0.10	0.17
C3'	0.01	0.17	0.00	0.00	0.07	0.00	0.04	0.01	0.07	0.14	0.13	0.16	0.06	0.09	0.03	0.01	0.01	0.01	0.26	0.27	0.12	0.22
C4	0.02	0.01	0.10	0.07	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.10	0.09	0.06	0.29	0.25	0.17	0.27
C4'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.03	0.05	0.04	0.04	0.04	0.04	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.08	0.14	0.02
C5	0.01	0.01	0.05	0.04	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.04	0.03	0.36	0.31	0.25	0.34
C5'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.05	0.00	0.05	0.00	0.06	0.06	0.06	0.06	0.06	0.06	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.09	0.21	0.01
C6	0.02	0.01	0.09	0.07	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.09	0.05	0.37	0.32	0.29	0.37
C8	0.01	0.01	0.09	0.14	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.15	0.07	0.36	0.29	0.18	0.30
N1	0.03	0.00	0.16	0.13	0.01	0.04	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.17	0.08	0.33	0.29	0.25	0.34
N3	0.03	0.00	0.20	0.16	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.19	0.20	0.10	0.25	0.21	0.14	0.24
N6	0.02	0.01	0.07	0.06	0.01	0.04	0.01	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.06	0.04	0.40	0.36	0.34	0.41
N7	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.11	0.04	0.39	0.34	0.28	0.37
N9	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.27	0.22	0.11	0.22
O2'	0.01	0.20	0.00	0.01	0.10	0.03	0.06	0.03	0.10	0.06	0.16	0.19	0.08	0.03	0.02	0.00	0.04	0.03	0.10	0.17	0.04	0.09
O3'	0.01	0.23	0.01	0.01	0.09	0.02	0.04	0.02	0.09	0.15	0.17	0.20	0.06	0.11	0.02	0.04	0.00	0.02	0.19	0.29	0.15	0.20
O4'	0.00	0.10	0.01	0.01	0.06	0.00	0.03	0.01	0.05	0.07	0.08	0.10	0.04	0.04	0.01	0.03	0.02	0.00	0.05	0.04	0.19	0.06
O5'	0.13	0.28	0.21	0.26	0.29	0.01	0.36	0.01	0.37	0.36	0.33	0.25	0.40	0.39	0.27	0.10	0.19	0.05	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.13	0.25	0.22	0.27	0.25	0.08	0.31	0.09	0.32	0.29	0.29	0.21	0.36	0.34	0.22	0.17	0.29	0.04	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.06	0.19	0.10	0.12	0.17	0.14	0.25	0.21	0.29	0.18	0.25	0.14	0.34	0.28	0.11	0.04	0.15	0.19	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.29	0.17	0.22	0.27	0.02	0.34	0.01	0.37	0.30	0.34	0.24	0.41	0.37	0.22	0.09	0.20	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.29	0.14	0.24	0.24	0.16	0.63	0.16	0.70	0.13	0.26	0.14	0.22	0.11	0.22	0.24	0.53	0.46	0.68	0.48	0.14	0.57	0.33	0.52
C2	0.19	0.19	0.32	0.06	0.17	0.50	0.19	0.60	0.19	0.21	0.20	0.28	0.15	0.20	0.18	0.46	0.28	0.59	0.25	0.20	0.33	0.12	0.27
C2'	0.32	0.31	0.22	0.36	0.33	0.77	0.33	0.90	0.32	0.33	0.32	0.29	0.32	0.33	0.33	0.67	0.52	0.77	0.71	0.32	0.82	0.63	0.79
C3'	0.38	0.28	0.20	0.46	0.33	0.84	0.32	0.99	0.29	0.35	0.28	0.26	0.31	0.33	0.36	0.68	0.60	0.78	0.86	0.28	1.02	0.79	0.96
C4	0.25	0.17	0.29	0.16	0.17	0.59	0.18	0.69	0.17	0.24	0.17	0.26	0.13	0.21	0.21	0.50	0.39	0.66	0.40	0.17	0.50	0.23	0.44
C4'	0.33	0.11	0.19	0.37	0.14	0.69	0.14	0.75	0.12	0.26	0.12	0.16	0.09	0.20	0.24	0.56	0.56	0.66	0.65	0.13	0.79	0.53	0.72
C5	0.25	0.17	0.28	0.18	0.17	0.62	0.18	0.73	0.17	0.24	0.19	0.26	0.13	0.21	0.21	0.50	0.42	0.67	0.43	0.19	0.56	0.25	0.48
C5'	0.34	0.14	0.16	0.40	0.13	0.68	0.14	0.76	0.16	0.25	0.18	0.20	0.08	0.19	0.23	0.49	0.58	0.64	0.70	0.20	0.89	0.58	0.79
C6	0.23	0.19	0.29	0.14	0.17	0.59	0.19	0.70	0.19	0.23	0.20	0.27	0.14	0.21	0.20	0.48	0.39	0.65	0.37	0.21	0.50	0.20	0.42
C8	0.29	0.15	0.24	0.27	0.16	0.67	0.17	0.76	0.15	0.26	0.16	0.24	0.12	0.22	0.23	0.51	0.50	0.69	0.54	0.16	0.69	0.38	0.60
N1	0.20	0.19	0.31	0.09	0.17	0.53	0.19	0.65	0.20	0.21	0.21	0.27	0.14	0.21	0.19	0.46	0.32	0.61	0.29	0.21	0.38	0.14	0.32
N3	0.21	0.18	0.31	0.08	0.17	0.52	0.18	0.62	0.17	0.22	0.18	0.28	0.14	0.20	0.19	0.48	0.31	0.61	0.29	0.18	0.37	0.15	0.32
N6	0.23	0.19	0.29	0.15	0.17	0.61	0.19	0.73	0.20	0.23	0.21	0.26	0.14	0.22	0.21	0.48	0.41	0.66	0.40	0.22	0.53	0.21	0.45
N7	0.28	0.16	0.25	0.24	0.16	0.66	0.17	0.77	0.16	0.26	0.18	0.25	0.13	0.22	0.23	0.50	0.48	0.69	0.51	0.18	0.67	0.34	0.58
N9	0.28	0.15	0.26	0.22	0.17	0.64	0.17	0.73	0.15	0.26	0.15	0.23	0.12	0.22	0.23	0.52	0.46	0.69	0.48	0.15	0.60	0.32	0.53
O2'	0.33	0.42	0.23	0.36	0.42	0.73	0.42	0.84	0.43	0.38	0.43	0.39	0.42	0.40	0.38	0.68	0.47	0.78	0.66	0.43	0.71	0.61	0.71
O3'	0.47	0.47	0.25	0.55	0.50	0.91	0.50	1.12	0.49	0.49	0.48	0.44	0.49	0.50	0.50	0.75	0.61	0.81	1.05	0.49	1.23	1.03	1.18
O4'	0.30	0.27	0.24	0.23	0.17	0.59	0.21	0.61	0.25	0.26	0.29	0.35	0.17	0.23	0.22	0.48	0.46	0.61	0.45	0.27	0.55	0.28	0.49
O5'	0.37	0.19	0.30	0.45	0.13	0.75	0.12	0.84	0.16	0.27	0.21	0.29	0.10	0.18	0.25	0.60	0.63	0.70	0.73	0.19	0.93	0.59	0.82
OP1	0.42	0.17	0.17	0.50	0.17	0.83	0.15	0.97	0.17	0.29	0.21	0.24	0.14	0.20	0.29	0.50	0.60	0.77	0.93	0.21	1.22	0.83	1.08
OP2	0.39	0.15	0.30	0.48	0.16	0.83	0.13	0.98	0.14	0.28	0.18	0.23	0.12	0.19	0.27	0.62	0.64	0.78	0.84	0.18	1.11	0.72	0.98
P	0.37	0.22	0.26	0.45	0.11	0.78	0.12	0.90	0.20	0.24	0.26	0.31	0.11	0.15	0.23	0.57	0.61	0.72	0.79	0.25	1.05	0.65	0.91

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.18	0.00	0.08	0.02	0.08	0.11	0.09
C2	0.02	0.00	0.32	0.18	0.00	0.28	0.01	0.42	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.34	0.10	0.43	0.12	0.01	0.14	0.24	0.15
C2'	0.00	0.32	0.00	0.00	0.17	0.02	0.09	0.09	0.16	0.17	0.25	0.38	0.31	0.08	0.01	0.00	0.02	0.01	0.19	0.13	0.19	0.24	0.21
C3'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.20	0.00	0.27	0.01	0.29	0.25	0.24	0.15	0.14	0.29	0.17	0.02	0.00	0.02	0.09	0.33	0.10	0.06	0.09
C4	0.01	0.00	0.17	0.20	0.00	0.08	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.06	0.21	0.21	0.01	0.23	0.35	0.24
C4'	0.01	0.28	0.02	0.00	0.08	0.00	0.07	0.00	0.06	0.29	0.18	0.39	0.27	0.24	0.08	0.21	0.02	0.00	0.01	0.08	0.06	0.03	0.01
C5	0.00	0.01	0.09	0.27	0.00	0.07	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.12	0.13	0.08	0.42	0.01	0.47	0.61	0.49
C5'	0.02	0.42	0.09	0.01	0.13	0.00	0.10	0.00	0.11	0.40	0.28	0.58	0.39	0.34	0.09	0.11	0.13	0.01	0.01	0.12	0.15	0.04	0.01
C6	0.01	0.01	0.16	0.29	0.00	0.06	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.16	0.17	0.37	0.01	0.44	0.61	0.45
C8	0.01	0.01	0.17	0.25	0.00	0.29	0.00	0.40	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.45	0.10	0.24	0.65	0.02	0.67	0.73	0.72
N1	0.01	0.00	0.25	0.24	0.01	0.18	0.01	0.28	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.18	0.13	0.32	0.19	0.01	0.23	0.40	0.23
N2	0.02	0.01	0.38	0.15	0.01	0.39	0.02	0.58	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.49	0.12	0.51	0.21	0.02	0.26	0.22	0.26
N3	0.02	0.00	0.31	0.14	0.00	0.27	0.01	0.39	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.33	0.09	0.42	0.10	0.01	0.11	0.18	0.12
N7	0.01	0.01	0.08	0.29	0.00	0.24	0.00	0.34	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.38	0.16	0.14	0.65	0.02	0.73	0.86	0.78
N9	0.00	0.00	0.01	0.17	0.00	0.08	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.15	0.02	0.01	0.30	0.02	0.31	0.36	0.33
O2'	0.01	0.34	0.00	0.02	0.06	0.21	0.12	0.11	0.03	0.45	0.18	0.49	0.33	0.38	0.15	0.00	0.07	0.15	0.13	0.10	0.15	0.27	0.17
O3'	0.18	0.10	0.02	0.00	0.06	0.02	0.13	0.13	0.16	0.10	0.13	0.12	0.09	0.16	0.02	0.07	0.00	0.10	0.06	0.21	0.09	0.14	0.07
O4'	0.00	0.43	0.01	0.02	0.21	0.00	0.08	0.01	0.17	0.24	0.32	0.51	0.42	0.14	0.01	0.15	0.10	0.00	0.14	0.10	0.18	0.13	0.15
O5'	0.08	0.12	0.19	0.09	0.21	0.01	0.42	0.01	0.37	0.65	0.19	0.21	0.10	0.65	0.30	0.13	0.06	0.14	0.00	0.48	0.02	0.02	0.00
O6	0.02	0.01	0.13	0.33	0.01	0.08	0.01	0.12	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.10	0.21	0.10	0.48	0.00	0.59	0.77	0.60
OP1	0.08	0.14	0.19	0.10	0.23	0.06	0.47	0.15	0.44	0.67	0.23	0.26	0.11	0.73	0.31	0.15	0.09	0.18	0.02	0.59	0.00	0.01	0.01
OP2	0.11	0.24	0.24	0.06	0.35	0.03	0.61	0.04	0.61	0.73	0.40	0.22	0.18	0.86	0.36	0.27	0.14	0.13	0.02	0.77	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.15	0.21	0.09	0.24	0.01	0.49	0.01	0.45	0.72	0.23	0.26	0.12	0.78	0.33	0.17	0.07	0.15	0.00	0.60	0.01	0.01	0.00