Doublet Group distance statistics: 53455

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.008, 0.012, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.008 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.012, 0.021, 0.030, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.021 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.015, 0.027, 0.039, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.027 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.017, 0.029, 0.041, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.029 std_dev=0.012
N9	A	0, 0.016, 0.029, 0.043, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.029 std_dev=0.014
N7	A	0, 0.016, 0.032, 0.048, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.032 std_dev=0.016
C8	A	0, 0.017, 0.034, 0.050, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.034 std_dev=0.017
C2	A	0, 0.022, 0.042, 0.062, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.042 std_dev=0.020
N3	A	0, 0.021, 0.042, 0.063, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.042 std_dev=0.021
C1'	A	0, 0.018, 0.039, 0.060, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.039 std_dev=0.021
N6	A	0, 0.021, 0.048, 0.074, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.048 std_dev=0.026
O2'	A	0, 0.123, 0.280, 0.437, 0.546 max_d=0.546 avg_d=0.280 std_dev=0.157
C2'	A	0, 0.097, 0.272, 0.446, 0.635 max_d=0.635 avg_d=0.272 std_dev=0.175
O4'	A	0, 0.018, 0.195, 0.372, 0.537 max_d=0.537 avg_d=0.195 std_dev=0.177
C4	B	0, 0.282, 0.535, 0.788, 0.862 max_d=0.862 avg_d=0.535 std_dev=0.253
N1	B	0, 0.227, 0.481, 0.735, 0.724 max_d=0.724 avg_d=0.481 std_dev=0.254
N3	B	0, 0.168, 0.437, 0.706, 0.784 max_d=0.784 avg_d=0.437 std_dev=0.269
C4'	A	0, 0.076, 0.364, 0.652, 0.895 max_d=0.895 avg_d=0.364 std_dev=0.288
C3'	A	0, 0.129, 0.421, 0.714, 0.996 max_d=0.996 avg_d=0.421 std_dev=0.292
C2'	B	0, 0.343, 0.650, 0.958, 1.049 max_d=1.049 avg_d=0.650 std_dev=0.307
C1'	B	0, 0.310, 0.628, 0.945, 1.084 max_d=1.084 avg_d=0.628 std_dev=0.317
C6	B	0, 0.345, 0.674, 1.003, 1.104 max_d=1.104 avg_d=0.674 std_dev=0.329
O2'	B	0, 0.214, 0.556, 0.898, 1.130 max_d=1.130 avg_d=0.556 std_dev=0.342
C2	B	0, 0.152, 0.524, 0.895, 1.076 max_d=1.076 avg_d=0.524 std_dev=0.372
N9	B	0, 0.338, 0.729, 1.120, 1.295 max_d=1.295 avg_d=0.729 std_dev=0.391
C5	B	0, 0.381, 0.782, 1.184, 1.308 max_d=1.308 avg_d=0.782 std_dev=0.401
O3'	A	0, 0.221, 0.632, 1.043, 1.457 max_d=1.457 avg_d=0.632 std_dev=0.411
O6	B	0, 0.440, 0.868, 1.297, 1.397 max_d=1.397 avg_d=0.868 std_dev=0.429
C5'	A	0, 0.156, 0.650, 1.145, 1.499 max_d=1.499 avg_d=0.650 std_dev=0.495
O4'	B	0, 0.464, 1.032, 1.601, 1.973 max_d=1.973 avg_d=1.032 std_dev=0.568
C3'	B	0, 0.385, 0.962, 1.540, 1.910 max_d=1.910 avg_d=0.962 std_dev=0.577
C4'	B	0, 0.420, 1.058, 1.696, 2.114 max_d=2.114 avg_d=1.058 std_dev=0.638
O5'	A	0, 0.213, 0.865, 1.517, 1.708 max_d=1.708 avg_d=0.865 std_dev=0.652
C8	B	0, 0.431, 1.107, 1.782, 2.169 max_d=2.169 avg_d=1.107 std_dev=0.675
O3'	B	0, 0.428, 1.115, 1.801, 2.206 max_d=2.206 avg_d=1.115 std_dev=0.686
N7	B	0, 0.464, 1.156, 1.848, 2.229 max_d=2.229 avg_d=1.156 std_dev=0.692
N2	B	0, 0.115, 0.816, 1.518, 1.975 max_d=1.975 avg_d=0.816 std_dev=0.702
P	A	0, 0.611, 1.508, 2.405, 3.093 max_d=3.093 avg_d=1.508 std_dev=0.897
C5'	B	0, 0.441, 1.468, 2.495, 3.157 max_d=3.157 avg_d=1.468 std_dev=1.027
OP2	A	0, 0.464, 1.579, 2.694, 4.189 max_d=4.189 avg_d=1.579 std_dev=1.115
O5'	B	0, 0.426, 1.562, 2.698, 3.541 max_d=3.541 avg_d=1.562 std_dev=1.136
OP1	A	0, 0.897, 2.111, 3.325, 3.742 max_d=3.742 avg_d=2.111 std_dev=1.214
P	B	0, 0.769, 2.195, 3.622, 4.570 max_d=4.570 avg_d=2.195 std_dev=1.427
OP1	B	0, 2.428, 4.241, 6.054, 6.109 max_d=6.109 avg_d=4.241 std_dev=1.813
OP2	B	0, 0.986, 3.046, 5.105, 6.598 max_d=6.598 avg_d=3.046 std_dev=2.060

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.19	0.23	0.44	0.18
C2	0.03	0.00	0.11	0.16	0.01	0.06	0.01	0.11	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.21	0.03	0.40	0.63	0.84	0.54
C2'	0.00	0.11	0.00	0.01	0.06	0.01	0.04	0.02	0.06	0.04	0.09	0.11	0.05	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.25	0.22	0.31	0.14
C3'	0.01	0.16	0.01	0.00	0.11	0.01	0.11	0.01	0.13	0.07	0.16	0.15	0.13	0.08	0.06	0.01	0.01	0.01	0.28	0.19	0.21	0.13
C4	0.02	0.01	0.06	0.11	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.13	0.01	0.38	0.56	0.78	0.51
C4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.05	0.00	0.07	0.00	0.07	0.08	0.06	0.05	0.09	0.09	0.04	0.06	0.03	0.00	0.01	0.36	0.24	0.12
C5	0.01	0.01	0.04	0.11	0.00	0.07	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.14	0.01	0.45	0.77	0.95	0.67
C5'	0.03	0.11	0.02	0.01	0.11	0.00	0.16	0.00	0.17	0.16	0.15	0.09	0.21	0.19	0.10	0.06	0.03	0.01	0.01	0.26	0.24	0.02
C6	0.01	0.01	0.06	0.13	0.01	0.07	0.01	0.17	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.05	0.18	0.01	0.47	0.86	1.04	0.73
C8	0.01	0.02	0.04	0.07	0.01	0.08	0.01	0.16	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.02	0.08	0.04	0.40	0.61	0.82	0.60
N1	0.03	0.00	0.09	0.16	0.01	0.06	0.01	0.15	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.08	0.21	0.02	0.45	0.78	0.97	0.66
N3	0.03	0.00	0.11	0.15	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.18	0.04	0.35	0.50	0.72	0.44
N6	0.01	0.00	0.05	0.13	0.01	0.09	0.01	0.21	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.04	0.18	0.03	0.50	1.00	1.15	0.82
N7	0.01	0.01	0.02	0.08	0.01	0.09	0.01	0.19	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.11	0.03	0.45	0.84	0.99	0.73
N9	0.00	0.01	0.02	0.06	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.01	0.33	0.42	0.67	0.43
O2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.04	0.06	0.03	0.06	0.05	0.02	0.08	0.08	0.04	0.02	0.02	0.00	0.06	0.03	0.12	0.41	0.22	0.09
O3'	0.02	0.21	0.02	0.01	0.13	0.03	0.14	0.03	0.18	0.08	0.21	0.18	0.18	0.11	0.06	0.06	0.00	0.03	0.22	0.39	0.12	0.11
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.04	0.03	0.03	0.01	0.03	0.03	0.00	0.08	0.24	0.43	0.13
O5'	0.19	0.40	0.25	0.28	0.38	0.01	0.45	0.01	0.47	0.40	0.45	0.35	0.50	0.45	0.33	0.12	0.22	0.08	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.23	0.63	0.22	0.19	0.56	0.36	0.77	0.26	0.86	0.61	0.78	0.50	1.00	0.84	0.42	0.41	0.39	0.24	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.44	0.84	0.31	0.21	0.78	0.24	0.95	0.24	1.04	0.82	0.97	0.72	1.15	0.99	0.67	0.22	0.12	0.43	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.18	0.54	0.14	0.13	0.51	0.12	0.67	0.02	0.73	0.60	0.66	0.44	0.82	0.73	0.43	0.09	0.11	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.23	0.32	0.18	0.26	0.22	0.24	0.21	0.25	0.24	0.20	0.29	0.40	0.28	0.20	0.20	0.13	0.38	0.28	0.26	0.24	0.49	0.25	0.26
C2	0.16	0.20	0.28	0.23	0.17	0.21	0.20	0.25	0.21	0.19	0.21	0.24	0.15	0.21	0.17	0.30	0.31	0.31	0.22	0.22	0.35	0.34	0.35
C2'	0.28	0.32	0.20	0.17	0.27	0.28	0.26	0.32	0.28	0.25	0.31	0.36	0.30	0.25	0.26	0.25	0.18	0.34	0.35	0.27	0.55	0.35	0.36
C3'	0.30	0.33	0.20	0.19	0.28	0.32	0.27	0.38	0.28	0.27	0.31	0.37	0.31	0.27	0.28	0.24	0.21	0.38	0.44	0.28	0.69	0.46	0.48
C4	0.19	0.28	0.24	0.24	0.21	0.21	0.21	0.24	0.24	0.18	0.27	0.33	0.24	0.19	0.18	0.20	0.36	0.31	0.19	0.24	0.34	0.20	0.23
C4'	0.26	0.32	0.18	0.27	0.23	0.30	0.22	0.33	0.24	0.25	0.29	0.41	0.29	0.23	0.23	0.19	0.36	0.32	0.36	0.23	0.65	0.40	0.39
C5	0.18	0.23	0.25	0.24	0.18	0.21	0.19	0.27	0.22	0.18	0.24	0.28	0.19	0.19	0.17	0.21	0.37	0.32	0.19	0.22	0.35	0.24	0.28
C5'	0.24	0.34	0.17	0.27	0.22	0.29	0.20	0.34	0.23	0.22	0.30	0.44	0.29	0.20	0.21	0.17	0.39	0.31	0.36	0.23	0.66	0.39	0.39
C6	0.16	0.18	0.28	0.24	0.15	0.22	0.18	0.28	0.19	0.19	0.19	0.23	0.14	0.20	0.16	0.26	0.35	0.33	0.21	0.20	0.37	0.34	0.36
C8	0.21	0.30	0.21	0.25	0.21	0.22	0.21	0.26	0.24	0.18	0.29	0.37	0.26	0.19	0.19	0.15	0.38	0.31	0.22	0.25	0.41	0.18	0.24
N1	0.16	0.17	0.28	0.23	0.14	0.22	0.18	0.28	0.18	0.21	0.18	0.25	0.13	0.21	0.16	0.29	0.33	0.32	0.23	0.20	0.39	0.40	0.40
N3	0.18	0.27	0.25	0.22	0.21	0.20	0.21	0.23	0.24	0.18	0.27	0.31	0.24	0.20	0.18	0.26	0.32	0.30	0.19	0.24	0.31	0.22	0.25
N6	0.16	0.17	0.28	0.24	0.14	0.23	0.17	0.30	0.17	0.20	0.17	0.24	0.13	0.20	0.16	0.26	0.36	0.34	0.22	0.19	0.40	0.39	0.41
N7	0.19	0.25	0.24	0.25	0.19	0.22	0.19	0.27	0.22	0.17	0.25	0.30	0.21	0.18	0.17	0.18	0.39	0.32	0.20	0.23	0.38	0.20	0.26
N9	0.21	0.31	0.21	0.25	0.22	0.22	0.22	0.25	0.25	0.19	0.30	0.38	0.27	0.19	0.19	0.15	0.37	0.30	0.22	0.25	0.40	0.18	0.21
O2'	0.28	0.32	0.20	0.19	0.27	0.29	0.26	0.31	0.27	0.26	0.30	0.37	0.30	0.26	0.26	0.24	0.16	0.32	0.35	0.26	0.59	0.40	0.38
O3'	0.36	0.35	0.25	0.27	0.33	0.43	0.33	0.52	0.33	0.35	0.34	0.37	0.34	0.34	0.35	0.28	0.22	0.45	0.63	0.32	0.93	0.71	0.72
O4'	0.23	0.34	0.19	0.31	0.22	0.26	0.21	0.28	0.24	0.22	0.30	0.45	0.29	0.21	0.20	0.15	0.43	0.27	0.32	0.24	0.61	0.35	0.35
O5'	0.43	0.39	0.31	0.30	0.37	0.41	0.36	0.44	0.35	0.39	0.37	0.43	0.39	0.37	0.39	0.33	0.34	0.51	0.49	0.35	0.70	0.49	0.49
OP1	0.38	0.50	0.26	0.28	0.40	0.34	0.37	0.43	0.40	0.31	0.47	0.58	0.47	0.32	0.36	0.29	0.45	0.44	0.43	0.39	0.77	0.49	0.58
OP2	0.67	0.74	0.52	0.40	0.69	0.52	0.69	0.51	0.71	0.66	0.74	0.78	0.72	0.67	0.67	0.55	0.34	0.70	0.59	0.71	0.71	0.56	0.57
P	0.40	0.43	0.23	0.16	0.38	0.30	0.36	0.32	0.37	0.34	0.41	0.49	0.42	0.34	0.36	0.28	0.27	0.45	0.38	0.36	0.63	0.39	0.43

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.03	0.05	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.14	0.03	0.22	0.25	0.24
C2	0.04	0.00	0.18	0.25	0.01	0.08	0.02	0.13	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.16	0.29	0.07	0.32	0.02	0.41	0.53	0.40
C2'	0.01	0.18	0.00	0.01	0.10	0.02	0.07	0.03	0.10	0.09	0.14	0.22	0.18	0.07	0.03	0.01	0.01	0.01	0.21	0.09	0.24	0.21	0.19
C3'	0.02	0.25	0.01	0.00	0.16	0.01	0.14	0.03	0.18	0.11	0.23	0.28	0.22	0.10	0.08	0.02	0.01	0.01	0.28	0.18	0.33	0.24	0.24
C4	0.01	0.01	0.10	0.16	0.00	0.07	0.01	0.14	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.09	0.17	0.04	0.35	0.02	0.42	0.51	0.41
C4'	0.01	0.08	0.02	0.01	0.07	0.00	0.10	0.01	0.10	0.12	0.08	0.09	0.06	0.13	0.06	0.07	0.02	0.00	0.01	0.12	0.18	0.18	0.10
C5	0.02	0.02	0.07	0.14	0.01	0.10	0.00	0.21	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.10	0.15	0.05	0.46	0.02	0.58	0.67	0.55
C5'	0.03	0.13	0.03	0.03	0.14	0.01	0.21	0.00	0.22	0.23	0.17	0.12	0.10	0.25	0.13	0.07	0.05	0.02	0.01	0.26	0.18	0.31	0.02
C6	0.02	0.01	0.10	0.18	0.01	0.10	0.01	0.22	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.12	0.21	0.05	0.47	0.00	0.62	0.74	0.58
C8	0.02	0.02	0.09	0.11	0.02	0.12	0.01	0.23	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.07	0.12	0.09	0.46	0.02	0.53	0.57	0.51
N1	0.03	0.01	0.14	0.23	0.01	0.08	0.01	0.17	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.15	0.27	0.06	0.41	0.01	0.53	0.65	0.50
N2	0.05	0.01	0.22	0.28	0.02	0.09	0.02	0.12	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.03	0.03	0.18	0.35	0.09	0.27	0.03	0.36	0.48	0.35
N3	0.03	0.01	0.18	0.22	0.01	0.06	0.01	0.10	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.13	0.25	0.07	0.28	0.02	0.34	0.44	0.34
N7	0.02	0.02	0.07	0.10	0.01	0.13	0.01	0.25	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.08	0.11	0.08	0.52	0.02	0.65	0.73	0.62
N9	0.01	0.02	0.03	0.08	0.01	0.06	0.02	0.13	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.05	0.07	0.02	0.32	0.03	0.37	0.42	0.37
O2'	0.02	0.16	0.01	0.02	0.09	0.07	0.10	0.07	0.12	0.07	0.15	0.18	0.13	0.08	0.05	0.00	0.03	0.07	0.07	0.12	0.28	0.09	0.16
O3'	0.01	0.29	0.01	0.01	0.17	0.02	0.15	0.05	0.21	0.12	0.27	0.35	0.25	0.11	0.07	0.03	0.00	0.02	0.21	0.20	0.38	0.27	0.20
O4'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.02	0.05	0.09	0.06	0.09	0.07	0.08	0.02	0.07	0.02	0.00	0.09	0.06	0.24	0.28	0.27
O5'	0.14	0.32	0.21	0.28	0.35	0.01	0.46	0.01	0.47	0.46	0.41	0.27	0.28	0.52	0.32	0.07	0.21	0.09	0.00	0.53	0.01	0.02	0.01
O6	0.03	0.02	0.09	0.18	0.02	0.12	0.02	0.26	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.12	0.20	0.06	0.53	0.00	0.72	0.84	0.67
OP1	0.22	0.41	0.24	0.33	0.42	0.18	0.58	0.18	0.62	0.53	0.53	0.36	0.34	0.65	0.37	0.28	0.38	0.24	0.01	0.72	0.00	0.02	0.01
OP2	0.25	0.53	0.21	0.24	0.51	0.18	0.67	0.31	0.74	0.57	0.65	0.48	0.44	0.73	0.42	0.09	0.27	0.28	0.02	0.84	0.02	0.00	0.01
P	0.24	0.40	0.19	0.24	0.41	0.10	0.55	0.02	0.58	0.51	0.50	0.35	0.34	0.62	0.37	0.16	0.20	0.27	0.01	0.67	0.01	0.01	0.00