Doublet Group distance statistics: 53459

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 2, 1, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.010, 0.015, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.010 std_dev=0.005
C4	A	0, 0.005, 0.011, 0.018, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.011 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.005, 0.011, 0.018, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.011 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.007, 0.017, 0.027, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.017 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.005, 0.016, 0.027, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.016 std_dev=0.011
C8	A	0, 0.012, 0.023, 0.034, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.023 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.007, 0.019, 0.030, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.019 std_dev=0.012
N7	A	0, 0.010, 0.022, 0.034, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.022 std_dev=0.012
N9	A	0, 0.012, 0.024, 0.036, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.024 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.005, 0.018, 0.031, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.018 std_dev=0.013
N6	A	0, 0.005, 0.021, 0.038, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.021 std_dev=0.016
O2'	B	0, 0.140, 0.316, 0.491, 0.554 max_d=0.554 avg_d=0.316 std_dev=0.176
C2'	B	0, 0.219, 0.450, 0.682, 0.777 max_d=0.777 avg_d=0.450 std_dev=0.232
N3	B	0, 0.232, 0.484, 0.736, 0.767 max_d=0.767 avg_d=0.484 std_dev=0.252
O3'	B	0, 0.340, 0.606, 0.872, 0.876 max_d=0.876 avg_d=0.606 std_dev=0.266
C2	B	0, 0.257, 0.551, 0.844, 0.958 max_d=0.958 avg_d=0.551 std_dev=0.293
C3'	B	0, 0.345, 0.639, 0.933, 0.945 max_d=0.945 avg_d=0.639 std_dev=0.294
N2	B	0, 0.287, 0.592, 0.898, 1.064 max_d=1.064 avg_d=0.592 std_dev=0.305
C4	B	0, 0.190, 0.537, 0.884, 1.087 max_d=1.087 avg_d=0.537 std_dev=0.347
C1'	B	0, 0.103, 0.464, 0.824, 1.056 max_d=1.056 avg_d=0.464 std_dev=0.361
N1	B	0, 0.259, 0.640, 1.020, 1.112 max_d=1.112 avg_d=0.640 std_dev=0.381
C4'	B	0, 0.409, 0.809, 1.209, 1.298 max_d=1.298 avg_d=0.809 std_dev=0.400
N9	B	0, 0.140, 0.548, 0.955, 1.236 max_d=1.236 avg_d=0.548 std_dev=0.407
O4'	B	0, 0.196, 0.626, 1.056, 1.300 max_d=1.300 avg_d=0.626 std_dev=0.430
C5	B	0, 0.173, 0.638, 1.102, 1.415 max_d=1.415 avg_d=0.638 std_dev=0.465
C6	B	0, 0.227, 0.696, 1.165, 1.422 max_d=1.422 avg_d=0.696 std_dev=0.469
O4'	A	0, 0.155, 0.696, 1.238, 1.476 max_d=1.476 avg_d=0.696 std_dev=0.541
O6	B	0, 0.259, 0.812, 1.365, 1.685 max_d=1.685 avg_d=0.812 std_dev=0.553
C2'	A	0, 0.211, 0.765, 1.319, 1.581 max_d=1.581 avg_d=0.765 std_dev=0.554
C8	B	0, 0.106, 0.664, 1.223, 1.643 max_d=1.643 avg_d=0.664 std_dev=0.558
N7	B	0, 0.103, 0.707, 1.310, 1.770 max_d=1.770 avg_d=0.707 std_dev=0.603
C5'	B	0, 0.797, 1.405, 2.014, 1.900 max_d=1.900 avg_d=1.405 std_dev=0.609
C3'	A	0, 0.103, 0.892, 1.681, 2.249 max_d=2.249 avg_d=0.892 std_dev=0.789
O2'	A	0, 0.429, 1.224, 2.018, 2.295 max_d=2.295 avg_d=1.224 std_dev=0.795
C4'	A	0, 0.110, 0.968, 1.826, 2.345 max_d=2.345 avg_d=0.968 std_dev=0.858
O5'	B	0, 0.213, 1.089, 1.964, 2.280 max_d=2.280 avg_d=1.089 std_dev=0.875
O3'	A	0, -0.180, 0.929, 2.037, 2.818 max_d=2.818 avg_d=0.929 std_dev=1.109
O5'	A	0, 0.656, 1.788, 2.920, 3.179 max_d=3.179 avg_d=1.788 std_dev=1.132
OP1	B	0, 0.409, 1.635, 2.860, 3.189 max_d=3.189 avg_d=1.635 std_dev=1.225
P	B	0, 0.208, 1.445, 2.682, 3.133 max_d=3.133 avg_d=1.445 std_dev=1.237
C5'	A	0, 0.284, 1.567, 2.849, 3.477 max_d=3.477 avg_d=1.567 std_dev=1.283
OP2	B	0, 0.502, 1.798, 3.094, 3.573 max_d=3.573 avg_d=1.798 std_dev=1.296
OP1	A	0, 0.672, 2.169, 3.667, 3.964 max_d=3.964 avg_d=2.169 std_dev=1.498
P	A	0, -0.064, 1.604, 3.272, 3.921 max_d=3.921 avg_d=1.604 std_dev=1.668
OP2	A	0, 0.466, 2.344, 4.222, 4.821 max_d=4.821 avg_d=2.344 std_dev=1.878

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.02	0.01	0.03	0.03	0.03	0.01	0.01	0.01	0.29	0.00	0.21	0.28	0.35	0.20
C2	0.03	0.00	0.55	0.51	0.01	0.21	0.01	0.25	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.36	0.25	0.33	0.14	0.32	0.22	0.20
C2'	0.01	0.55	0.00	0.00	0.28	0.01	0.13	0.19	0.25	0.26	0.43	0.54	0.17	0.13	0.01	0.01	0.03	0.03	0.38	0.42	0.81	0.54
C3'	0.01	0.51	0.00	0.00	0.38	0.00	0.39	0.01	0.47	0.18	0.52	0.45	0.47	0.29	0.22	0.02	0.00	0.02	0.15	0.48	0.51	0.19
C4	0.01	0.01	0.28	0.38	0.00	0.10	0.00	0.07	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.13	0.12	0.17	0.16	0.42	0.11	0.28
C4'	0.00	0.21	0.01	0.00	0.10	0.00	0.11	0.00	0.12	0.21	0.16	0.20	0.13	0.19	0.08	0.30	0.03	0.00	0.02	0.38	0.39	0.04
C5	0.01	0.01	0.13	0.39	0.00	0.11	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.24	0.16	0.06	0.26	0.63	0.25	0.45
C5'	0.07	0.25	0.19	0.01	0.07	0.00	0.09	0.00	0.08	0.29	0.16	0.24	0.11	0.26	0.08	0.11	0.19	0.01	0.00	0.31	0.38	0.01
C6	0.02	0.01	0.25	0.47	0.01	0.12	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.18	0.25	0.14	0.23	0.62	0.35	0.44
C8	0.01	0.01	0.26	0.18	0.01	0.21	0.01	0.29	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.52	0.04	0.21	0.40	0.72	0.12	0.58
N1	0.03	0.00	0.43	0.52	0.02	0.16	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.21	0.28	0.25	0.16	0.46	0.31	0.31
N3	0.03	0.00	0.54	0.45	0.01	0.20	0.01	0.24	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.37	0.18	0.33	0.14	0.29	0.15	0.16
N6	0.03	0.01	0.17	0.47	0.02	0.13	0.02	0.11	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.03	0.25	0.28	0.09	0.28	0.76	0.47	0.53
N7	0.01	0.02	0.13	0.29	0.01	0.19	0.01	0.26	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.00	0.01	0.47	0.11	0.12	0.39	0.83	0.27	0.63
N9	0.01	0.01	0.01	0.22	0.00	0.08	0.01	0.08	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.21	0.07	0.01	0.22	0.43	0.10	0.32
O2'	0.01	0.36	0.01	0.02	0.13	0.30	0.24	0.11	0.18	0.52	0.21	0.37	0.25	0.47	0.21	0.00	0.03	0.20	0.24	0.40	0.81	0.48
O3'	0.29	0.25	0.03	0.00	0.12	0.03	0.16	0.19	0.25	0.04	0.28	0.18	0.28	0.11	0.07	0.03	0.00	0.21	0.33	0.64	0.35	0.19
O4'	0.00	0.33	0.03	0.02	0.17	0.00	0.06	0.01	0.14	0.21	0.25	0.33	0.09	0.12	0.01	0.20	0.21	0.00	0.15	0.50	0.21	0.21
O5'	0.21	0.14	0.38	0.15	0.16	0.02	0.26	0.00	0.23	0.40	0.16	0.14	0.28	0.39	0.22	0.24	0.33	0.15	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.28	0.32	0.42	0.48	0.42	0.38	0.63	0.31	0.62	0.72	0.46	0.29	0.76	0.83	0.43	0.40	0.64	0.50	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.35	0.22	0.81	0.51	0.11	0.39	0.25	0.38	0.35	0.12	0.31	0.15	0.47	0.27	0.10	0.81	0.35	0.21	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.20	0.20	0.54	0.19	0.28	0.04	0.45	0.01	0.44	0.58	0.31	0.16	0.53	0.63	0.32	0.48	0.19	0.21	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.11	0.19	0.22	0.12	0.19	0.12	0.19	0.11	0.16	0.11	0.11	0.11	0.14	0.16	0.19	0.24	0.24	0.22	0.12	0.16	0.31	0.21
C2	0.11	0.09	0.11	0.13	0.09	0.04	0.08	0.08	0.07	0.11	0.08	0.10	0.08	0.10	0.11	0.09	0.16	0.12	0.17	0.07	0.21	0.14	0.13
C2'	0.54	0.55	0.44	0.39	0.55	0.48	0.54	0.48	0.55	0.51	0.54	0.54	0.56	0.52	0.52	0.50	0.27	0.54	0.37	0.55	0.35	0.34	0.37
C3'	0.14	0.39	0.15	0.32	0.20	0.27	0.18	0.36	0.26	0.13	0.35	0.50	0.32	0.11	0.13	0.13	0.51	0.19	0.50	0.25	0.59	0.56	0.51
C4	0.16	0.11	0.16	0.19	0.11	0.11	0.10	0.13	0.10	0.12	0.11	0.12	0.11	0.11	0.13	0.14	0.22	0.17	0.03	0.11	0.11	0.16	0.03
C4'	0.57	0.24	0.66	0.84	0.45	0.79	0.47	0.86	0.39	0.64	0.28	0.12	0.31	0.59	0.57	0.57	1.00	0.66	0.94	0.40	1.01	1.02	0.96
C5	0.14	0.13	0.13	0.17	0.11	0.10	0.12	0.12	0.14	0.12	0.15	0.14	0.12	0.11	0.12	0.12	0.21	0.15	0.12	0.16	0.17	0.12	0.10
C5'	0.79	0.39	0.91	1.16	0.66	1.07	0.72	1.21	0.61	0.91	0.46	0.21	0.48	0.87	0.81	0.75	1.36	0.89	1.27	0.63	1.43	1.38	1.32
C6	0.12	0.14	0.10	0.13	0.12	0.06	0.13	0.10	0.16	0.12	0.16	0.14	0.12	0.12	0.12	0.09	0.18	0.12	0.24	0.16	0.25	0.16	0.19
C8	0.17	0.13	0.17	0.21	0.12	0.16	0.13	0.18	0.15	0.13	0.15	0.14	0.13	0.12	0.14	0.17	0.25	0.20	0.05	0.17	0.09	0.17	0.06
N1	0.11	0.10	0.08	0.11	0.09	0.05	0.09	0.09	0.09	0.10	0.10	0.11	0.09	0.09	0.10	0.09	0.15	0.12	0.26	0.09	0.27	0.16	0.21
N3	0.16	0.10	0.17	0.17	0.12	0.09	0.11	0.11	0.10	0.15	0.10	0.11	0.11	0.13	0.15	0.12	0.19	0.16	0.04	0.09	0.12	0.19	0.04
N6	0.13	0.18	0.09	0.13	0.15	0.06	0.18	0.11	0.22	0.14	0.22	0.18	0.14	0.17	0.13	0.09	0.18	0.13	0.30	0.23	0.30	0.22	0.26
N7	0.15	0.15	0.15	0.19	0.13	0.13	0.14	0.15	0.17	0.13	0.17	0.15	0.13	0.13	0.13	0.15	0.24	0.17	0.09	0.19	0.13	0.12	0.07
N9	0.18	0.12	0.18	0.22	0.12	0.17	0.11	0.17	0.12	0.14	0.12	0.12	0.12	0.12	0.15	0.18	0.25	0.21	0.09	0.13	0.10	0.22	0.10
O2'	0.81	0.51	0.76	0.87	0.67	0.98	0.69	1.05	0.62	0.80	0.53	0.40	0.58	0.75	0.75	0.79	0.83	0.92	0.90	0.63	0.96	0.86	0.93
O3'	0.49	0.20	0.56	0.74	0.31	0.70	0.34	0.74	0.26	0.53	0.20	0.27	0.21	0.47	0.45	0.51	0.89	0.62	1.06	0.26	1.10	1.10	1.05
O4'	0.68	0.41	0.73	0.81	0.57	0.76	0.57	0.78	0.50	0.69	0.43	0.31	0.48	0.65	0.66	0.66	0.88	0.72	0.81	0.49	0.79	0.90	0.81
O5'	0.61	0.24	0.77	1.02	0.48	0.89	0.53	1.03	0.43	0.72	0.30	0.16	0.32	0.67	0.62	0.61	1.24	0.70	1.08	0.45	1.26	1.21	1.14
OP1	0.48	0.38	0.54	0.78	0.36	0.79	0.38	0.97	0.35	0.55	0.38	0.51	0.32	0.49	0.47	0.44	0.94	0.61	0.97	0.36	1.27	1.04	1.07
OP2	0.60	0.26	0.77	1.07	0.45	0.97	0.51	1.14	0.42	0.72	0.32	0.30	0.28	0.67	0.61	0.62	1.31	0.75	1.22	0.46	1.48	1.35	1.30
P	0.49	0.10	0.62	0.91	0.31	0.85	0.36	1.03	0.23	0.60	0.10	0.26	0.14	0.53	0.49	0.47	1.12	0.63	1.06	0.26	1.34	1.18	1.15

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.03	0.01	0.03	0.06	0.04	0.02	0.04	0.04	0.05	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.26	0.06	0.28	0.19	0.21
C2	0.04	0.00	0.10	0.13	0.01	0.06	0.01	0.19	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.13	0.16	0.03	0.41	0.02	0.36	0.26	0.34
C2'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.06	0.03	0.06	0.02	0.08	0.04	0.09	0.12	0.10	0.04	0.01	0.01	0.03	0.01	0.29	0.08	0.31	0.10	0.22
C3'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.07	0.01	0.06	0.01	0.08	0.05	0.12	0.15	0.11	0.04	0.03	0.01	0.01	0.02	0.36	0.07	0.37	0.06	0.26
C4	0.03	0.01	0.06	0.07	0.00	0.05	0.00	0.20	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.07	0.08	0.01	0.43	0.03	0.37	0.26	0.34
C4'	0.01	0.06	0.03	0.01	0.05	0.00	0.08	0.01	0.08	0.11	0.07	0.06	0.05	0.12	0.06	0.06	0.03	0.00	0.01	0.08	0.15	0.26	0.01
C5	0.03	0.01	0.06	0.06	0.00	0.08	0.00	0.26	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.07	0.02	0.50	0.03	0.41	0.32	0.40
C5'	0.06	0.19	0.02	0.01	0.20	0.01	0.26	0.00	0.27	0.27	0.24	0.17	0.15	0.31	0.18	0.06	0.06	0.01	0.00	0.27	0.26	0.42	0.01
C6	0.04	0.01	0.08	0.08	0.01	0.08	0.01	0.27	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.09	0.10	0.03	0.51	0.01	0.42	0.35	0.42
C8	0.02	0.02	0.04	0.05	0.01	0.11	0.01	0.27	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.06	0.05	0.49	0.05	0.41	0.28	0.39
N1	0.04	0.01	0.09	0.12	0.01	0.07	0.01	0.24	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.11	0.14	0.02	0.46	0.02	0.39	0.31	0.38
N2	0.04	0.00	0.12	0.15	0.01	0.06	0.01	0.17	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.15	0.19	0.04	0.38	0.03	0.34	0.25	0.32
N3	0.05	0.00	0.10	0.11	0.00	0.05	0.01	0.15	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.11	0.13	0.04	0.38	0.01	0.35	0.24	0.31
N7	0.02	0.02	0.04	0.04	0.02	0.12	0.01	0.31	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.03	0.05	0.05	0.52	0.06	0.42	0.34	0.43
N9	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.06	0.02	0.18	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.41	0.05	0.36	0.23	0.32
O2'	0.01	0.13	0.01	0.01	0.07	0.06	0.07	0.06	0.09	0.02	0.11	0.15	0.11	0.03	0.01	0.00	0.05	0.04	0.09	0.10	0.19	0.12	0.08
O3'	0.02	0.16	0.03	0.01	0.08	0.03	0.07	0.06	0.10	0.06	0.14	0.19	0.13	0.05	0.02	0.05	0.00	0.03	0.33	0.10	0.35	0.10	0.26
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.05	0.02	0.04	0.04	0.05	0.01	0.04	0.03	0.00	0.22	0.04	0.25	0.26	0.18
O5'	0.26	0.41	0.29	0.36	0.43	0.01	0.50	0.00	0.51	0.49	0.46	0.38	0.38	0.52	0.41	0.09	0.33	0.22	0.00	0.57	0.01	0.02	0.01
O6	0.06	0.02	0.08	0.07	0.03	0.08	0.03	0.27	0.01	0.05	0.02	0.03	0.01	0.06	0.05	0.10	0.10	0.04	0.57	0.00	0.48	0.42	0.49
OP1	0.28	0.36	0.31	0.37	0.37	0.15	0.41	0.26	0.42	0.41	0.39	0.34	0.35	0.42	0.36	0.19	0.35	0.25	0.01	0.48	0.00	0.01	0.00
OP2	0.19	0.26	0.10	0.06	0.26	0.26	0.32	0.42	0.35	0.28	0.31	0.25	0.24	0.34	0.23	0.12	0.10	0.26	0.02	0.42	0.01	0.00	0.01
P	0.21	0.34	0.22	0.26	0.34	0.01	0.40	0.01	0.42	0.39	0.38	0.32	0.31	0.43	0.32	0.08	0.26	0.18	0.01	0.49	0.00	0.01	0.00