Doublet Group distance statistics: 53460

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.012, 0.022, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.012 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.003, 0.015, 0.026, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.015 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.016, 0.028, 0.039, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.028 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.019, 0.033, 0.047, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.033 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.016, 0.031, 0.046, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.031 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.020, 0.036, 0.053, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.036 std_dev=0.017
N1	A	0, 0.029, 0.052, 0.074, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.052 std_dev=0.022
C8	A	0, 0.029, 0.052, 0.075, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.052 std_dev=0.023
N9	A	0, 0.026, 0.050, 0.074, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.050 std_dev=0.024
N7	A	0, 0.031, 0.059, 0.086, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.059 std_dev=0.027
N6	A	0, 0.036, 0.070, 0.105, 0.121 max_d=0.121 avg_d=0.070 std_dev=0.035
O2'	A	0, 0.081, 0.158, 0.235, 0.275 max_d=0.275 avg_d=0.158 std_dev=0.077
O4'	A	0, 0.072, 0.170, 0.269, 0.304 max_d=0.304 avg_d=0.170 std_dev=0.099
C2'	A	0, 0.018, 0.163, 0.307, 0.367 max_d=0.367 avg_d=0.163 std_dev=0.144
C2	B	0, 0.215, 0.402, 0.589, 0.647 max_d=0.647 avg_d=0.402 std_dev=0.187
N1	B	0, 0.221, 0.434, 0.647, 0.731 max_d=0.731 avg_d=0.434 std_dev=0.213
N3	B	0, 0.295, 0.510, 0.725, 0.698 max_d=0.698 avg_d=0.510 std_dev=0.215
C5	B	0, 0.151, 0.367, 0.583, 0.648 max_d=0.648 avg_d=0.367 std_dev=0.216
C4	B	0, 0.242, 0.467, 0.693, 0.737 max_d=0.737 avg_d=0.467 std_dev=0.225
C6	B	0, 0.225, 0.462, 0.699, 0.851 max_d=0.851 avg_d=0.462 std_dev=0.237
N2	B	0, 0.238, 0.485, 0.733, 0.883 max_d=0.883 avg_d=0.485 std_dev=0.248
C3'	A	0, 0.081, 0.359, 0.636, 0.770 max_d=0.770 avg_d=0.359 std_dev=0.278
C4'	A	0, 0.043, 0.322, 0.601, 0.746 max_d=0.746 avg_d=0.322 std_dev=0.279
N7	B	0, 0.121, 0.415, 0.708, 0.834 max_d=0.834 avg_d=0.415 std_dev=0.294
N9	B	0, 0.328, 0.654, 0.979, 1.053 max_d=1.053 avg_d=0.654 std_dev=0.325
C8	B	0, 0.187, 0.547, 0.907, 1.086 max_d=1.086 avg_d=0.547 std_dev=0.360
O6	B	0, 0.335, 0.696, 1.058, 1.331 max_d=1.331 avg_d=0.696 std_dev=0.361
C5'	A	0, 0.139, 0.526, 0.912, 1.102 max_d=1.102 avg_d=0.526 std_dev=0.386
C1'	B	0, 0.505, 0.904, 1.303, 1.289 max_d=1.289 avg_d=0.904 std_dev=0.399
C2'	B	0, 0.542, 0.945, 1.347, 1.256 max_d=1.256 avg_d=0.945 std_dev=0.402
O4'	B	0, 0.562, 0.970, 1.378, 1.304 max_d=1.304 avg_d=0.970 std_dev=0.408
O3'	A	0, 0.088, 0.502, 0.917, 1.112 max_d=1.112 avg_d=0.502 std_dev=0.414
C3'	B	0, 0.492, 0.914, 1.336, 1.501 max_d=1.501 avg_d=0.914 std_dev=0.422
P	A	0, 0.549, 0.983, 1.416, 1.392 max_d=1.392 avg_d=0.983 std_dev=0.433
C4'	B	0, 0.534, 0.998, 1.461, 1.657 max_d=1.657 avg_d=0.998 std_dev=0.464
O5'	A	0, 0.234, 0.717, 1.201, 1.302 max_d=1.302 avg_d=0.717 std_dev=0.483
O3'	B	0, 0.486, 0.981, 1.475, 1.770 max_d=1.770 avg_d=0.981 std_dev=0.495
O5'	B	0, 0.397, 0.905, 1.414, 1.773 max_d=1.773 avg_d=0.905 std_dev=0.508
O2'	B	0, 0.626, 1.148, 1.670, 1.661 max_d=1.661 avg_d=1.148 std_dev=0.522
C5'	B	0, 0.450, 1.005, 1.561, 1.950 max_d=1.950 avg_d=1.005 std_dev=0.556
OP2	B	0, 0.800, 1.540, 2.280, 2.631 max_d=2.631 avg_d=1.540 std_dev=0.740
P	B	0, 0.609, 1.423, 2.237, 2.694 max_d=2.694 avg_d=1.423 std_dev=0.814
OP1	B	0, 0.921, 1.962, 3.002, 3.479 max_d=3.479 avg_d=1.962 std_dev=1.041
OP2	A	0, 1.553, 2.722, 3.892, 3.582 max_d=3.582 avg_d=2.722 std_dev=1.170
OP1	A	0, 0.710, 2.090, 3.471, 3.721 max_d=3.721 avg_d=2.090 std_dev=1.380

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.11	0.21	0.30	0.10
C2	0.01	0.00	0.14	0.16	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.21	0.04	0.18	0.70	0.35	0.25
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.09	0.01	0.08	0.01	0.11	0.03	0.13	0.12	0.10	0.04	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.13	0.14	0.03
C3'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.12	0.00	0.13	0.01	0.16	0.09	0.17	0.13	0.17	0.11	0.07	0.02	0.01	0.01	0.06	0.05	0.12	0.06
C4	0.01	0.01	0.09	0.12	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.06	0.13	0.02	0.19	0.62	0.34	0.24
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.09	0.08	0.07	0.04	0.11	0.09	0.05	0.03	0.02	0.00	0.01	0.17	0.30	0.01
C5	0.01	0.01	0.08	0.13	0.00	0.08	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.15	0.02	0.25	0.82	0.40	0.31
C5'	0.02	0.07	0.01	0.01	0.08	0.01	0.12	0.00	0.13	0.12	0.11	0.05	0.16	0.14	0.07	0.03	0.02	0.01	0.01	0.34	0.31	0.01
C6	0.02	0.01	0.11	0.16	0.01	0.09	0.01	0.13	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.08	0.20	0.03	0.26	0.92	0.42	0.34
C8	0.01	0.01	0.03	0.09	0.00	0.08	0.01	0.12	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.02	0.09	0.03	0.26	0.65	0.37	0.28
N1	0.02	0.00	0.13	0.17	0.01	0.07	0.01	0.11	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.10	0.22	0.03	0.23	0.85	0.39	0.31
N3	0.01	0.00	0.12	0.13	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.17	0.04	0.15	0.56	0.32	0.21
N6	0.02	0.01	0.10	0.17	0.02	0.11	0.02	0.16	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.07	0.22	0.04	0.30	1.06	0.47	0.39
N7	0.01	0.01	0.04	0.11	0.01	0.09	0.00	0.14	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.03	0.12	0.02	0.29	0.87	0.43	0.35
N9	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.05	0.01	0.07	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.06	0.01	0.18	0.48	0.32	0.20
O2'	0.01	0.11	0.00	0.02	0.06	0.03	0.05	0.03	0.08	0.02	0.10	0.10	0.07	0.03	0.02	0.00	0.04	0.03	0.02	0.03	0.20	0.01
O3'	0.01	0.21	0.01	0.01	0.13	0.02	0.15	0.02	0.20	0.09	0.22	0.17	0.22	0.12	0.06	0.04	0.00	0.01	0.13	0.14	0.19	0.12
O4'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.03	0.04	0.04	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.12	0.16	0.41	0.10
O5'	0.11	0.18	0.01	0.06	0.19	0.01	0.25	0.01	0.26	0.26	0.23	0.15	0.30	0.29	0.18	0.02	0.13	0.12	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.21	0.70	0.13	0.05	0.62	0.17	0.82	0.34	0.92	0.65	0.85	0.56	1.06	0.87	0.48	0.03	0.14	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.30	0.35	0.14	0.12	0.34	0.30	0.40	0.31	0.42	0.37	0.39	0.32	0.47	0.43	0.32	0.20	0.19	0.41	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.25	0.03	0.06	0.24	0.01	0.31	0.01	0.34	0.28	0.31	0.21	0.39	0.35	0.20	0.01	0.12	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.16	0.12	0.15	0.06	0.21	0.05	0.23	0.03	0.18	0.11	0.28	0.12	0.13	0.13	0.13	0.19	0.22	0.19	0.02	0.25	0.17	0.20
C2	0.21	0.12	0.05	0.04	0.08	0.22	0.07	0.24	0.08	0.14	0.12	0.21	0.06	0.10	0.15	0.07	0.09	0.32	0.15	0.08	0.18	0.05	0.16
C2'	0.20	0.13	0.12	0.18	0.12	0.26	0.14	0.31	0.11	0.22	0.11	0.20	0.12	0.19	0.18	0.09	0.21	0.27	0.26	0.12	0.36	0.25	0.29
C3'	0.21	0.13	0.11	0.16	0.15	0.25	0.16	0.31	0.13	0.23	0.12	0.17	0.13	0.21	0.19	0.07	0.18	0.29	0.27	0.14	0.40	0.27	0.31
C4	0.20	0.13	0.09	0.11	0.06	0.24	0.06	0.26	0.05	0.15	0.11	0.23	0.06	0.11	0.14	0.10	0.14	0.29	0.17	0.06	0.22	0.11	0.19
C4'	0.15	0.16	0.08	0.11	0.05	0.18	0.05	0.22	0.04	0.16	0.11	0.26	0.12	0.13	0.11	0.07	0.17	0.21	0.19	0.03	0.29	0.19	0.22
C5	0.20	0.11	0.08	0.10	0.08	0.25	0.06	0.28	0.08	0.14	0.11	0.19	0.05	0.10	0.14	0.10	0.13	0.31	0.19	0.09	0.25	0.11	0.21
C5'	0.15	0.14	0.09	0.11	0.05	0.18	0.05	0.22	0.03	0.17	0.10	0.24	0.10	0.13	0.12	0.08	0.17	0.22	0.19	0.02	0.29	0.20	0.22
C6	0.20	0.10	0.06	0.07	0.09	0.25	0.08	0.29	0.10	0.13	0.12	0.15	0.07	0.09	0.14	0.09	0.11	0.33	0.18	0.12	0.24	0.08	0.21
C8	0.18	0.12	0.11	0.14	0.06	0.25	0.05	0.28	0.05	0.15	0.10	0.22	0.06	0.11	0.13	0.12	0.17	0.27	0.21	0.05	0.28	0.16	0.23
N1	0.20	0.09	0.05	0.04	0.10	0.24	0.08	0.27	0.10	0.13	0.12	0.15	0.08	0.09	0.15	0.07	0.09	0.34	0.16	0.12	0.21	0.06	0.19
N3	0.21	0.14	0.08	0.08	0.06	0.22	0.06	0.23	0.05	0.16	0.11	0.24	0.08	0.11	0.15	0.09	0.11	0.30	0.15	0.05	0.18	0.07	0.15
N6	0.19	0.10	0.06	0.07	0.10	0.26	0.09	0.31	0.12	0.12	0.14	0.12	0.09	0.09	0.14	0.09	0.10	0.34	0.19	0.15	0.26	0.08	0.22
N7	0.18	0.11	0.09	0.12	0.07	0.26	0.06	0.29	0.07	0.14	0.11	0.19	0.05	0.10	0.13	0.11	0.15	0.30	0.20	0.08	0.28	0.13	0.22
N9	0.18	0.13	0.11	0.13	0.05	0.23	0.05	0.26	0.04	0.16	0.10	0.24	0.08	0.12	0.13	0.12	0.17	0.26	0.19	0.04	0.25	0.15	0.20
O2'	0.15	0.19	0.08	0.14	0.11	0.18	0.11	0.22	0.11	0.18	0.15	0.27	0.17	0.16	0.13	0.06	0.21	0.18	0.20	0.11	0.30	0.21	0.22
O3'	0.23	0.19	0.11	0.16	0.20	0.25	0.21	0.32	0.20	0.26	0.18	0.20	0.19	0.24	0.23	0.07	0.18	0.30	0.30	0.21	0.46	0.32	0.35
O4'	0.15	0.21	0.13	0.16	0.07	0.20	0.06	0.22	0.07	0.17	0.15	0.33	0.15	0.13	0.12	0.13	0.21	0.20	0.20	0.06	0.26	0.18	0.20
O5'	0.19	0.11	0.15	0.15	0.11	0.23	0.11	0.28	0.08	0.19	0.09	0.18	0.10	0.16	0.17	0.14	0.20	0.29	0.24	0.08	0.35	0.23	0.27
OP1	0.49	0.51	0.28	0.21	0.51	0.36	0.50	0.36	0.51	0.48	0.51	0.50	0.51	0.49	0.50	0.27	0.23	0.55	0.33	0.51	0.36	0.32	0.35
OP2	0.36	0.30	0.33	0.33	0.31	0.35	0.30	0.37	0.28	0.36	0.29	0.33	0.30	0.34	0.34	0.34	0.34	0.38	0.35	0.28	0.44	0.34	0.36
P	0.25	0.16	0.19	0.18	0.18	0.25	0.18	0.29	0.15	0.24	0.15	0.19	0.16	0.22	0.23	0.18	0.23	0.32	0.25	0.15	0.34	0.24	0.28

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.02	0.05	0.14	0.07
C2	0.03	0.00	0.26	0.24	0.01	0.07	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.23	0.33	0.08	0.15	0.01	0.20	0.25	0.16
C2'	0.00	0.26	0.00	0.01	0.12	0.01	0.06	0.01	0.10	0.13	0.18	0.32	0.26	0.09	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.08	0.08	0.05	0.04
C3'	0.01	0.24	0.01	0.00	0.11	0.00	0.06	0.01	0.10	0.15	0.18	0.31	0.23	0.11	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.09	0.09	0.04	0.03
C4	0.01	0.01	0.12	0.11	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.14	0.04	0.11	0.02	0.14	0.21	0.12
C4'	0.00	0.07	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.06	0.06	0.06	0.09	0.06	0.06	0.02	0.06	0.01	0.00	0.01	0.07	0.05	0.04	0.02
C5	0.01	0.01	0.06	0.06	0.01	0.05	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.08	0.02	0.11	0.01	0.15	0.21	0.14
C5'	0.02	0.09	0.01	0.01	0.07	0.00	0.08	0.00	0.10	0.06	0.10	0.09	0.08	0.08	0.04	0.06	0.01	0.01	0.01	0.11	0.06	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.10	0.10	0.01	0.06	0.01	0.10	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.09	0.14	0.04	0.14	0.00	0.19	0.24	0.17
C8	0.01	0.01	0.13	0.15	0.01	0.06	0.01	0.06	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.09	0.16	0.05	0.06	0.03	0.07	0.16	0.09
N1	0.02	0.00	0.18	0.18	0.01	0.06	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.17	0.25	0.06	0.15	0.01	0.21	0.26	0.17
N2	0.03	0.00	0.32	0.31	0.01	0.09	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.31	0.43	0.09	0.16	0.02	0.22	0.26	0.16
N3	0.03	0.00	0.26	0.23	0.00	0.06	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.22	0.29	0.07	0.14	0.01	0.17	0.23	0.14
N7	0.01	0.01	0.09	0.11	0.01	0.06	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.12	0.03	0.08	0.03	0.11	0.18	0.11
N9	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.08	0.02	0.09	0.17	0.09
O2'	0.01	0.23	0.00	0.02	0.09	0.06	0.05	0.06	0.09	0.09	0.17	0.31	0.22	0.07	0.01	0.00	0.02	0.03	0.03	0.07	0.06	0.06	0.04
O3'	0.01	0.33	0.01	0.01	0.14	0.01	0.08	0.01	0.14	0.16	0.25	0.43	0.29	0.12	0.02	0.02	0.00	0.01	0.06	0.12	0.11	0.10	0.06
O4'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.04	0.00	0.02	0.01	0.04	0.05	0.06	0.09	0.07	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.09	0.03	0.03	0.17	0.09
O5'	0.07	0.15	0.03	0.03	0.11	0.01	0.11	0.01	0.14	0.06	0.15	0.16	0.14	0.08	0.08	0.03	0.06	0.09	0.00	0.15	0.01	0.02	0.00
O6	0.02	0.01	0.08	0.09	0.02	0.07	0.01	0.11	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.07	0.12	0.03	0.15	0.00	0.20	0.25	0.18
OP1	0.05	0.20	0.08	0.09	0.14	0.05	0.15	0.06	0.19	0.07	0.21	0.22	0.17	0.11	0.09	0.06	0.11	0.03	0.01	0.20	0.00	0.01	0.01
OP2	0.14	0.25	0.05	0.04	0.21	0.04	0.21	0.02	0.24	0.16	0.26	0.26	0.23	0.18	0.17	0.06	0.10	0.17	0.02	0.25	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.16	0.04	0.03	0.12	0.02	0.14	0.01	0.17	0.09	0.17	0.16	0.14	0.11	0.09	0.04	0.06	0.09	0.00	0.18	0.01	0.01	0.00