Doublet Group distance statistics: 53462

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.008, 0.018, 0.027, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.018 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.004, 0.016, 0.029, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.016 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.008, 0.021, 0.035, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.021 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.017, 0.033, 0.048, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.033 std_dev=0.015
N3	A	0, 0.011, 0.027, 0.044, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.027 std_dev=0.017
C5	A	0, 0.018, 0.035, 0.052, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.035 std_dev=0.017
C4	A	0, 0.016, 0.038, 0.059, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.038 std_dev=0.021
N9	A	0, 0.015, 0.041, 0.067, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.041 std_dev=0.026
N7	A	0, 0.024, 0.055, 0.086, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.055 std_dev=0.031
C8	A	0, 0.024, 0.066, 0.107, 0.123 max_d=0.123 avg_d=0.066 std_dev=0.042
N6	A	0, 0.036, 0.087, 0.138, 0.162 max_d=0.162 avg_d=0.087 std_dev=0.051
N3	B	0, 0.186, 0.350, 0.514, 0.507 max_d=0.507 avg_d=0.350 std_dev=0.164
C4	B	0, 0.148, 0.314, 0.481, 0.527 max_d=0.527 avg_d=0.314 std_dev=0.166
C5	B	0, 0.163, 0.344, 0.524, 0.525 max_d=0.525 avg_d=0.344 std_dev=0.181
N7	B	0, 0.185, 0.391, 0.596, 0.689 max_d=0.689 avg_d=0.391 std_dev=0.206
C6	B	0, 0.236, 0.487, 0.738, 0.772 max_d=0.772 avg_d=0.487 std_dev=0.251
N9	B	0, 0.140, 0.401, 0.663, 0.772 max_d=0.772 avg_d=0.401 std_dev=0.262
C8	B	0, 0.224, 0.486, 0.748, 0.773 max_d=0.773 avg_d=0.486 std_dev=0.262
C2	B	0, 0.216, 0.489, 0.763, 0.804 max_d=0.804 avg_d=0.489 std_dev=0.274
O6	B	0, 0.307, 0.603, 0.899, 0.899 max_d=0.899 avg_d=0.603 std_dev=0.296
N1	B	0, 0.249, 0.574, 0.899, 0.924 max_d=0.924 avg_d=0.574 std_dev=0.325
C2'	B	0, 0.227, 0.553, 0.879, 1.012 max_d=1.012 avg_d=0.553 std_dev=0.326
C1'	B	0, 0.173, 0.517, 0.862, 1.080 max_d=1.080 avg_d=0.517 std_dev=0.344
O2'	B	0, 0.221, 0.579, 0.937, 1.021 max_d=1.021 avg_d=0.579 std_dev=0.358
N2	B	0, 0.269, 0.637, 1.006, 1.039 max_d=1.039 avg_d=0.637 std_dev=0.369
C3'	B	0, 0.257, 0.712, 1.166, 1.532 max_d=1.532 avg_d=0.712 std_dev=0.454
O4'	B	0, 0.215, 0.696, 1.177, 1.618 max_d=1.618 avg_d=0.696 std_dev=0.481
O3'	B	0, 0.313, 0.813, 1.312, 1.664 max_d=1.664 avg_d=0.813 std_dev=0.499
C4'	B	0, 0.277, 0.802, 1.327, 1.791 max_d=1.791 avg_d=0.802 std_dev=0.525
OP2	B	0, 0.451, 1.028, 1.604, 1.842 max_d=1.842 avg_d=1.028 std_dev=0.577
O2'	A	0, 0.067, 0.668, 1.268, 1.512 max_d=1.512 avg_d=0.668 std_dev=0.600
C2'	A	0, -0.058, 0.577, 1.212, 1.473 max_d=1.473 avg_d=0.577 std_dev=0.635
O4'	A	0, -0.050, 0.586, 1.221, 1.480 max_d=1.480 avg_d=0.586 std_dev=0.635
C5'	B	0, 0.319, 1.007, 1.695, 2.347 max_d=2.347 avg_d=1.007 std_dev=0.688
O5'	B	0, 0.378, 1.132, 1.887, 2.566 max_d=2.566 avg_d=1.132 std_dev=0.755
P	B	0, 0.360, 1.135, 1.909, 2.558 max_d=2.558 avg_d=1.135 std_dev=0.775
C4'	A	0, 0.254, 1.097, 1.941, 2.235 max_d=2.235 avg_d=1.097 std_dev=0.843
OP1	B	0, 0.581, 1.557, 2.533, 3.230 max_d=3.230 avg_d=1.557 std_dev=0.976
C3'	A	0, 0.022, 1.006, 1.991, 2.387 max_d=2.387 avg_d=1.006 std_dev=0.985
C5'	A	0, 0.588, 1.945, 3.301, 3.720 max_d=3.720 avg_d=1.945 std_dev=1.357
O3'	A	0, -0.072, 1.373, 2.819, 3.398 max_d=3.398 avg_d=1.373 std_dev=1.446
O5'	A	0, 0.263, 1.814, 3.365, 3.936 max_d=3.936 avg_d=1.814 std_dev=1.551
OP1	A	0, 1.480, 3.081, 4.681, 4.752 max_d=4.752 avg_d=3.081 std_dev=1.600
P	A	0, 0.255, 2.476, 4.696, 5.494 max_d=5.494 avg_d=2.476 std_dev=2.221
OP2	A	0, 0.895, 3.473, 6.051, 6.813 max_d=6.813 avg_d=3.473 std_dev=2.578

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.14	0.02	0.01	0.03	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.38	0.14	0.56	0.25
C2	0.04	0.00	0.39	0.28	0.01	0.14	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.33	0.37	0.37	0.75	0.65	1.17	0.63
C2'	0.01	0.39	0.00	0.00	0.21	0.02	0.13	0.07	0.22	0.16	0.33	0.37	0.18	0.05	0.02	0.00	0.02	0.02	0.25	0.32	0.44	0.31
C3'	0.01	0.28	0.00	0.00	0.18	0.01	0.16	0.02	0.22	0.06	0.27	0.25	0.21	0.07	0.06	0.01	0.01	0.01	0.15	0.45	0.33	0.33
C4	0.02	0.01	0.21	0.18	0.00	0.05	0.00	0.25	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.16	0.20	0.20	0.63	0.60	1.07	0.54
C4'	0.01	0.14	0.02	0.01	0.05	0.00	0.10	0.00	0.06	0.25	0.08	0.14	0.10	0.21	0.10	0.11	0.04	0.00	0.01	0.14	0.12	0.07
C5	0.01	0.00	0.13	0.16	0.00	0.10	0.00	0.37	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.09	0.17	0.12	0.63	0.84	1.26	0.63
C5'	0.14	0.21	0.07	0.02	0.25	0.00	0.37	0.00	0.31	0.61	0.23	0.19	0.38	0.56	0.33	0.07	0.16	0.04	0.01	0.05	0.09	0.02
C6	0.02	0.00	0.22	0.22	0.00	0.06	0.01	0.31	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.17	0.26	0.20	0.69	0.92	1.38	0.70
C8	0.01	0.00	0.16	0.06	0.00	0.25	0.01	0.61	0.02	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.00	0.13	0.08	0.18	0.42	0.68	1.02	0.47
N1	0.03	0.00	0.33	0.27	0.00	0.08	0.00	0.23	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.27	0.35	0.31	0.75	0.82	1.32	0.69
N3	0.04	0.00	0.37	0.25	0.00	0.14	0.00	0.19	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.31	0.32	0.35	0.69	0.51	1.02	0.55
N6	0.01	0.01	0.18	0.21	0.01	0.10	0.02	0.38	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.04	0.02	0.14	0.25	0.15	0.67	1.08	1.49	0.74
N7	0.01	0.00	0.05	0.07	0.01	0.21	0.00	0.56	0.02	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.01	0.06	0.06	0.07	0.50	0.92	1.26	0.59
N9	0.01	0.01	0.02	0.06	0.00	0.10	0.01	0.33	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.02	0.50	0.46	0.88	0.43
O2'	0.02	0.33	0.00	0.01	0.16	0.11	0.09	0.07	0.17	0.13	0.27	0.31	0.14	0.06	0.01	0.00	0.06	0.08	0.15	0.22	0.27	0.09
O3'	0.03	0.37	0.02	0.01	0.20	0.04	0.17	0.16	0.26	0.08	0.35	0.32	0.25	0.06	0.05	0.06	0.00	0.05	0.15	0.59	0.29	0.19
O4'	0.00	0.37	0.02	0.01	0.20	0.00	0.12	0.04	0.20	0.18	0.31	0.35	0.15	0.07	0.02	0.08	0.05	0.00	0.33	0.25	0.40	0.16
O5'	0.38	0.75	0.25	0.15	0.63	0.01	0.63	0.01	0.69	0.42	0.75	0.69	0.67	0.50	0.50	0.15	0.15	0.33	0.00	0.02	0.03	0.00
OP1	0.14	0.65	0.32	0.45	0.60	0.14	0.84	0.05	0.92	0.68	0.82	0.51	1.08	0.92	0.46	0.22	0.59	0.25	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.56	1.17	0.44	0.33	1.07	0.12	1.26	0.09	1.38	1.02	1.32	1.02	1.49	1.26	0.88	0.27	0.29	0.40	0.03	0.00	0.00	0.00
P	0.25	0.63	0.31	0.33	0.54	0.07	0.63	0.02	0.70	0.47	0.69	0.55	0.74	0.59	0.43	0.09	0.19	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.12	0.06	0.08	0.11	0.10	0.10	0.08	0.10	0.14	0.11	0.15	0.11	0.11	0.14	0.12	0.20	0.18	0.03	0.10	0.09	0.12	0.04
C2	0.18	0.14	0.08	0.08	0.15	0.13	0.13	0.14	0.12	0.15	0.13	0.17	0.16	0.13	0.17	0.10	0.11	0.20	0.14	0.11	0.15	0.23	0.16
C2'	0.15	0.55	0.14	0.13	0.39	0.10	0.41	0.11	0.49	0.26	0.55	0.60	0.46	0.34	0.26	0.08	0.14	0.12	0.13	0.51	0.16	0.25	0.14
C3'	0.20	0.33	0.11	0.09	0.27	0.12	0.26	0.13	0.29	0.21	0.32	0.36	0.31	0.23	0.22	0.06	0.12	0.20	0.11	0.29	0.20	0.14	0.11
C4	0.14	0.08	0.04	0.06	0.10	0.08	0.08	0.08	0.08	0.11	0.09	0.09	0.09	0.09	0.12	0.10	0.16	0.17	0.07	0.09	0.09	0.16	0.08
C4'	0.24	0.24	0.26	0.20	0.30	0.17	0.34	0.17	0.34	0.34	0.29	0.17	0.24	0.36	0.30	0.12	0.13	0.20	0.18	0.35	0.24	0.22	0.19
C5	0.13	0.09	0.04	0.07	0.10	0.07	0.09	0.07	0.09	0.11	0.09	0.09	0.09	0.09	0.12	0.11	0.19	0.16	0.05	0.09	0.09	0.16	0.07
C5'	0.31	0.35	0.40	0.38	0.41	0.27	0.49	0.29	0.50	0.48	0.43	0.27	0.33	0.52	0.41	0.20	0.37	0.25	0.34	0.54	0.43	0.43	0.37
C6	0.14	0.11	0.04	0.05	0.11	0.08	0.10	0.08	0.10	0.12	0.11	0.12	0.12	0.10	0.13	0.11	0.16	0.16	0.08	0.10	0.09	0.18	0.10
C8	0.16	0.09	0.07	0.10	0.10	0.11	0.09	0.10	0.09	0.12	0.10	0.12	0.09	0.10	0.13	0.12	0.24	0.18	0.03	0.10	0.10	0.12	0.04
N1	0.17	0.14	0.07	0.06	0.15	0.12	0.13	0.12	0.12	0.14	0.13	0.16	0.16	0.13	0.16	0.10	0.12	0.19	0.13	0.12	0.13	0.22	0.15
N3	0.17	0.10	0.07	0.07	0.12	0.12	0.10	0.12	0.09	0.13	0.10	0.11	0.13	0.11	0.15	0.09	0.12	0.19	0.12	0.09	0.13	0.20	0.13
N6	0.13	0.11	0.04	0.06	0.11	0.06	0.11	0.07	0.11	0.11	0.11	0.13	0.12	0.10	0.12	0.12	0.18	0.15	0.07	0.11	0.08	0.18	0.09
N7	0.14	0.08	0.05	0.09	0.09	0.09	0.08	0.08	0.08	0.11	0.09	0.09	0.08	0.09	0.12	0.11	0.23	0.17	0.03	0.09	0.09	0.13	0.04
N9	0.15	0.09	0.05	0.08	0.09	0.09	0.08	0.08	0.09	0.11	0.10	0.12	0.09	0.09	0.12	0.11	0.20	0.17	0.03	0.10	0.08	0.13	0.04
O2'	0.17	0.66	0.26	0.24	0.49	0.17	0.52	0.17	0.60	0.32	0.65	0.67	0.59	0.42	0.33	0.22	0.28	0.13	0.19	0.61	0.22	0.30	0.19
O3'	0.37	0.51	0.11	0.10	0.46	0.16	0.46	0.17	0.48	0.39	0.50	0.51	0.49	0.42	0.41	0.07	0.23	0.36	0.18	0.48	0.24	0.19	0.17
O4'	0.25	0.33	0.16	0.14	0.33	0.18	0.36	0.16	0.37	0.32	0.35	0.30	0.32	0.35	0.31	0.25	0.24	0.22	0.09	0.38	0.15	0.05	0.09
O5'	0.06	0.48	0.11	0.17	0.31	0.29	0.39	0.32	0.51	0.20	0.55	0.54	0.34	0.32	0.17	0.22	0.29	0.22	0.23	0.56	0.22	0.19	0.22
OP1	0.27	0.14	0.56	0.74	0.18	0.56	0.22	0.65	0.18	0.33	0.15	0.23	0.11	0.30	0.27	0.47	0.97	0.32	0.72	0.21	0.90	0.78	0.76
OP2	0.46	0.45	0.49	0.73	0.25	0.86	0.29	0.96	0.40	0.34	0.50	0.60	0.28	0.28	0.31	0.60	0.92	0.71	0.87	0.45	0.96	0.79	0.90
P	0.18	0.29	0.17	0.32	0.15	0.36	0.20	0.41	0.29	0.08	0.33	0.35	0.20	0.15	0.09	0.25	0.50	0.34	0.37	0.33	0.41	0.35	0.38

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.05	0.10	0.04
C2	0.02	0.00	0.15	0.12	0.00	0.06	0.01	0.08	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.22	0.17	0.01	0.12	0.01	0.16	0.26	0.17
C2'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.07	0.02	0.04	0.01	0.07	0.07	0.12	0.18	0.15	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.06	0.07	0.10	0.05
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.08	0.18	0.09	0.16	0.11	0.15	0.07	0.01	0.00	0.01	0.06	0.10	0.08	0.09	0.04
C4	0.01	0.00	0.07	0.05	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.11	0.05	0.01	0.07	0.00	0.10	0.21	0.13
C4'	0.00	0.06	0.02	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.04	0.08	0.05	0.08	0.05	0.07	0.03	0.09	0.01	0.00	0.01	0.05	0.10	0.03	0.01
C5	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.10	0.01	0.09	0.00	0.14	0.24	0.16
C5'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.05	0.01	0.07	0.00	0.08	0.09	0.08	0.09	0.06	0.09	0.04	0.10	0.03	0.01	0.00	0.10	0.10	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.07	0.08	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.12	0.10	0.01	0.11	0.00	0.19	0.28	0.19
C8	0.01	0.00	0.07	0.18	0.00	0.08	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.20	0.01	0.11	0.01	0.11	0.15	0.11
N1	0.01	0.00	0.12	0.09	0.01	0.05	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.18	0.12	0.01	0.12	0.01	0.19	0.28	0.19
N2	0.02	0.01	0.18	0.16	0.01	0.08	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.26	0.24	0.01	0.13	0.01	0.18	0.27	0.18
N3	0.02	0.00	0.15	0.11	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.20	0.15	0.01	0.10	0.01	0.12	0.22	0.14
N7	0.01	0.01	0.04	0.15	0.00	0.07	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.19	0.01	0.12	0.01	0.15	0.22	0.15
N9	0.00	0.01	0.01	0.07	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.07	0.00	0.04	0.01	0.06	0.15	0.08
O2'	0.02	0.22	0.01	0.01	0.11	0.09	0.07	0.10	0.12	0.05	0.18	0.26	0.20	0.01	0.02	0.00	0.04	0.07	0.05	0.10	0.14	0.08	0.06
O3'	0.01	0.17	0.01	0.00	0.05	0.01	0.10	0.03	0.10	0.20	0.12	0.24	0.15	0.19	0.07	0.04	0.00	0.01	0.09	0.13	0.13	0.14	0.08
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.01	0.00	0.04	0.01	0.07	0.06	0.02
O5'	0.02	0.12	0.05	0.06	0.07	0.01	0.09	0.00	0.11	0.11	0.12	0.13	0.10	0.12	0.04	0.05	0.09	0.04	0.00	0.13	0.01	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.06	0.10	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.13	0.01	0.13	0.00	0.23	0.30	0.21
OP1	0.05	0.16	0.07	0.08	0.10	0.10	0.14	0.10	0.19	0.11	0.19	0.18	0.12	0.15	0.06	0.14	0.13	0.07	0.01	0.23	0.00	0.01	0.00
OP2	0.10	0.26	0.10	0.09	0.21	0.03	0.24	0.02	0.28	0.15	0.28	0.27	0.22	0.22	0.15	0.08	0.14	0.06	0.02	0.30	0.01	0.00	0.00
P	0.04	0.17	0.05	0.04	0.13	0.01	0.16	0.01	0.19	0.11	0.19	0.18	0.14	0.15	0.08	0.06	0.08	0.02	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00