sequences=6 maxmove=0.1 pval=0.1 usescval=false complexatt=true cooling=1.0 currcool=1.0 attfactor=10.0 attvalpow=1 repfactor=10.0 repvalpow=1 dampening=1.0 minattract=1.0 cluster2d=false blastpath=/home/sdh/apps/blast-2.2.17/bin/blastall -p blastp -M PAM70 -F F -e 10000 -b 500 -v 500 formatdbpath=/home/sdh/apps/blast-2.2.17/bin/formatdb showinfo=true zoom=1.0 dotsize=0 ovalsize=10 groupsize=4 usefoldchange=false avgfoldchange=false colorcutoffs=0.0;0.1;0.2;0.3;0.4;0.5;0.6;0.7;0.8;0.9; colorarr=(230;230;230):(207;207;207):(184;184;184):(161;161;161):(138;138;138):(115;115;115):(92;92;92):(69;69;69):(46;46;46):(23;23;23): 1.0;0.0;0.0; 0.0;1.0;0.0; 0.0;0.0;1.0; >3IVN-A19-A23 X >1Y27-X19-X23 X >3GER-A18-A22 X >2EEV-A18-A22 X >2EEU-A18-A22 X >3GOG-A17-A21 X 0 1:0.637683510052 0 2:0.843357137437 0 3:0.912164132132 0 4:0.969875966962 0 5:0.999999588243 1 2:0.512549317461 1 3:0.608992446057 1 4:0.720771605402 1 5:0.67456842915 2 3:0.15153890435 2 4:0.264396088847 2 5:0.235168406961 3 4:0.155674207926 3 5:0.164349605475 4 5:0.131728898762