Doublet Group distance statistics: 53465

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 2, 1, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.016, 0.027, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.016 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.008, 0.022, 0.036, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.022 std_dev=0.014
C2	A	0, 0.006, 0.024, 0.042, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.024 std_dev=0.018
N3	A	0, 0.011, 0.030, 0.049, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.030 std_dev=0.019
N1	A	0, 0.010, 0.030, 0.050, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.030 std_dev=0.020
C4	A	0, 0.005, 0.029, 0.052, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.029 std_dev=0.024
C1'	A	0, 0.013, 0.037, 0.061, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.037 std_dev=0.024
N6	A	0, 0.017, 0.044, 0.072, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.044 std_dev=0.027
N7	A	0, 0.017, 0.046, 0.075, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.046 std_dev=0.029
N9	A	0, 0.021, 0.052, 0.083, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.052 std_dev=0.031
C8	A	0, 0.018, 0.055, 0.092, 0.124 max_d=0.124 avg_d=0.055 std_dev=0.037
N3	B	0, 0.274, 0.542, 0.809, 0.813 max_d=0.813 avg_d=0.542 std_dev=0.268
C4	B	0, 0.234, 0.521, 0.809, 0.837 max_d=0.837 avg_d=0.521 std_dev=0.287
C2	B	0, 0.225, 0.518, 0.810, 0.843 max_d=0.843 avg_d=0.518 std_dev=0.293
N2	B	0, 0.299, 0.602, 0.906, 0.897 max_d=0.897 avg_d=0.602 std_dev=0.304
N9	B	0, 0.333, 0.646, 0.959, 0.940 max_d=0.940 avg_d=0.646 std_dev=0.313
C5'	B	0, 0.359, 0.674, 0.988, 0.897 max_d=0.897 avg_d=0.674 std_dev=0.315
C4'	B	0, 0.347, 0.668, 0.988, 0.951 max_d=0.951 avg_d=0.668 std_dev=0.321
C3'	B	0, 0.346, 0.673, 1.000, 0.955 max_d=0.955 avg_d=0.673 std_dev=0.327
C8	B	0, 0.334, 0.664, 0.994, 0.987 max_d=0.987 avg_d=0.664 std_dev=0.330
O4'	B	0, 0.374, 0.708, 1.042, 1.041 max_d=1.041 avg_d=0.708 std_dev=0.334
C1'	B	0, 0.376, 0.723, 1.070, 1.100 max_d=1.100 avg_d=0.723 std_dev=0.347
N7	B	0, 0.244, 0.593, 0.941, 1.014 max_d=1.014 avg_d=0.593 std_dev=0.348
C5	B	0, 0.122, 0.476, 0.831, 0.958 max_d=0.958 avg_d=0.476 std_dev=0.355
O3'	B	0, 0.375, 0.732, 1.089, 1.040 max_d=1.040 avg_d=0.732 std_dev=0.357
C2'	B	0, 0.376, 0.736, 1.095, 1.119 max_d=1.119 avg_d=0.736 std_dev=0.359
N1	B	0, 0.131, 0.497, 0.863, 0.966 max_d=0.966 avg_d=0.497 std_dev=0.366
O5'	B	0, 0.371, 0.741, 1.110, 1.110 max_d=1.110 avg_d=0.741 std_dev=0.369
OP1	B	0, 0.314, 0.732, 1.149, 1.278 max_d=1.278 avg_d=0.732 std_dev=0.417
P	B	0, 0.362, 0.779, 1.197, 1.269 max_d=1.269 avg_d=0.779 std_dev=0.417
O2'	B	0, 0.424, 0.844, 1.264, 1.286 max_d=1.286 avg_d=0.844 std_dev=0.420
C6	B	0, 0.032, 0.457, 0.882, 1.081 max_d=1.081 avg_d=0.457 std_dev=0.425
OP2	B	0, 0.331, 0.761, 1.190, 1.285 max_d=1.285 avg_d=0.761 std_dev=0.429
P	A	0, 0.361, 0.819, 1.277, 1.536 max_d=1.536 avg_d=0.819 std_dev=0.458
O6	B	0, 0.152, 0.613, 1.074, 1.305 max_d=1.305 avg_d=0.613 std_dev=0.461
C4'	A	0, 0.217, 0.725, 1.234, 1.424 max_d=1.424 avg_d=0.725 std_dev=0.509
O4'	A	0, 0.170, 0.710, 1.250, 1.439 max_d=1.439 avg_d=0.710 std_dev=0.540
C2'	A	0, 0.123, 0.668, 1.212, 1.371 max_d=1.371 avg_d=0.668 std_dev=0.545
C3'	A	0, 0.580, 1.225, 1.871, 1.873 max_d=1.873 avg_d=1.225 std_dev=0.646
O2'	A	0, 0.504, 1.245, 1.987, 2.157 max_d=2.157 avg_d=1.245 std_dev=0.741
O5'	A	0, 0.639, 1.474, 2.310, 2.631 max_d=2.631 avg_d=1.474 std_dev=0.835
OP2	A	0, 0.821, 1.757, 2.693, 2.932 max_d=2.932 avg_d=1.757 std_dev=0.936
O3'	A	0, 1.141, 2.085, 3.028, 2.724 max_d=2.724 avg_d=2.085 std_dev=0.944
C5'	A	0, 0.796, 1.815, 2.833, 3.048 max_d=3.048 avg_d=1.815 std_dev=1.018
OP1	A	0, 1.087, 2.204, 3.322, 3.115 max_d=3.115 avg_d=2.204 std_dev=1.118

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.09	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.02	0.01	0.03	0.23	0.01	0.27	0.90	0.21	0.22
C2	0.03	0.00	0.28	0.20	0.01	0.06	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.31	0.22	0.08	0.40	0.99	0.27	0.22
C2'	0.01	0.28	0.00	0.01	0.14	0.03	0.07	0.21	0.11	0.16	0.19	0.30	0.08	0.13	0.03	0.01	0.03	0.02	0.63	0.34	0.90	0.38
C3'	0.03	0.20	0.01	0.00	0.11	0.00	0.07	0.02	0.10	0.11	0.16	0.20	0.08	0.09	0.04	0.01	0.01	0.02	0.37	0.13	0.95	0.35
C4	0.02	0.01	0.14	0.11	0.00	0.02	0.01	0.12	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.20	0.19	0.04	0.43	1.01	0.20	0.27
C4'	0.02	0.06	0.03	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.07	0.04	0.06	0.04	0.06	0.02	0.14	0.03	0.01	0.02	0.49	0.29	0.18
C5	0.01	0.00	0.07	0.07	0.01	0.03	0.00	0.20	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.23	0.17	0.04	0.51	1.04	0.25	0.33
C5'	0.09	0.06	0.21	0.02	0.12	0.01	0.20	0.00	0.18	0.29	0.12	0.04	0.22	0.28	0.17	0.09	0.20	0.01	0.02	0.11	0.20	0.04
C6	0.02	0.01	0.11	0.10	0.01	0.03	0.01	0.18	0.00	0.03	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.26	0.18	0.05	0.52	1.03	0.26	0.32
C8	0.02	0.01	0.16	0.11	0.01	0.07	0.02	0.29	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.00	0.01	0.20	0.19	0.05	0.53	1.06	0.29	0.39
N1	0.03	0.00	0.19	0.16	0.02	0.04	0.01	0.12	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.28	0.20	0.08	0.47	1.01	0.25	0.26
N3	0.03	0.00	0.30	0.20	0.00	0.06	0.02	0.04	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.31	0.22	0.07	0.36	0.97	0.26	0.21
N6	0.02	0.02	0.08	0.08	0.01	0.04	0.01	0.22	0.00	0.03	0.02	0.02	0.00	0.03	0.02	0.27	0.17	0.05	0.56	1.03	0.32	0.35
N7	0.02	0.01	0.13	0.09	0.01	0.06	0.01	0.28	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.24	0.18	0.04	0.56	1.06	0.35	0.40
N9	0.01	0.02	0.03	0.04	0.01	0.02	0.01	0.17	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.10	0.19	0.01	0.43	1.01	0.17	0.29
O2'	0.03	0.31	0.01	0.01	0.20	0.14	0.23	0.09	0.26	0.20	0.28	0.31	0.27	0.24	0.10	0.00	0.07	0.07	0.58	0.38	1.06	0.42
O3'	0.23	0.22	0.03	0.01	0.19	0.03	0.17	0.20	0.18	0.19	0.20	0.22	0.17	0.18	0.19	0.07	0.00	0.16	0.26	0.31	0.96	0.37
O4'	0.01	0.08	0.02	0.02	0.04	0.01	0.04	0.01	0.05	0.05	0.08	0.07	0.05	0.04	0.01	0.07	0.16	0.00	0.11	1.04	0.21	0.55
O5'	0.27	0.40	0.63	0.37	0.43	0.02	0.51	0.02	0.52	0.53	0.47	0.36	0.56	0.56	0.43	0.58	0.26	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.90	0.99	0.34	0.13	1.01	0.49	1.04	0.11	1.03	1.06	1.01	0.97	1.03	1.06	1.01	0.38	0.31	1.04	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.21	0.27	0.90	0.95	0.20	0.29	0.25	0.20	0.26	0.29	0.25	0.26	0.32	0.35	0.17	1.06	0.96	0.21	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.22	0.22	0.38	0.35	0.27	0.18	0.33	0.04	0.32	0.39	0.26	0.21	0.35	0.40	0.29	0.42	0.37	0.55	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.11	0.24	0.21	0.12	0.17	0.13	0.15	0.11	0.19	0.10	0.15	0.10	0.16	0.16	0.29	0.19	0.19	0.16	0.12	0.11	0.19	0.18
C2	0.09	0.21	0.13	0.12	0.12	0.07	0.14	0.06	0.18	0.10	0.21	0.23	0.15	0.12	0.10	0.11	0.14	0.09	0.08	0.19	0.08	0.09	0.09
C2'	0.43	0.38	0.47	0.50	0.40	0.49	0.38	0.47	0.37	0.38	0.37	0.35	0.41	0.37	0.41	0.45	0.55	0.42	0.49	0.36	0.53	0.42	0.44
C3'	0.33	0.33	0.27	0.27	0.34	0.31	0.36	0.32	0.35	0.36	0.34	0.30	0.33	0.36	0.35	0.25	0.25	0.34	0.37	0.36	0.38	0.35	0.35
C4	0.11	0.19	0.19	0.17	0.10	0.11	0.11	0.09	0.15	0.10	0.19	0.23	0.14	0.10	0.09	0.22	0.19	0.11	0.11	0.16	0.10	0.12	0.12
C4'	0.13	0.18	0.15	0.12	0.15	0.10	0.16	0.11	0.17	0.16	0.18	0.20	0.17	0.16	0.14	0.22	0.15	0.13	0.15	0.18	0.17	0.16	0.16
C5	0.10	0.22	0.19	0.18	0.12	0.11	0.14	0.10	0.19	0.10	0.23	0.26	0.15	0.11	0.09	0.20	0.19	0.10	0.11	0.21	0.09	0.12	0.12
C5'	0.17	0.20	0.14	0.12	0.21	0.15	0.25	0.21	0.25	0.25	0.22	0.18	0.19	0.27	0.21	0.24	0.18	0.20	0.26	0.28	0.32	0.28	0.28
C6	0.09	0.25	0.16	0.15	0.13	0.09	0.16	0.08	0.23	0.11	0.27	0.29	0.16	0.14	0.10	0.14	0.17	0.10	0.10	0.26	0.09	0.10	0.10
C8	0.12	0.20	0.22	0.21	0.10	0.14	0.11	0.13	0.16	0.11	0.20	0.24	0.14	0.10	0.10	0.26	0.22	0.13	0.13	0.17	0.11	0.14	0.14
N1	0.08	0.25	0.12	0.12	0.14	0.07	0.17	0.07	0.23	0.11	0.26	0.29	0.17	0.14	0.10	0.09	0.14	0.09	0.08	0.25	0.08	0.09	0.08
N3	0.10	0.17	0.17	0.14	0.10	0.08	0.11	0.07	0.14	0.11	0.16	0.20	0.13	0.10	0.10	0.18	0.16	0.10	0.09	0.14	0.09	0.11	0.10
N6	0.09	0.25	0.15	0.16	0.14	0.09	0.18	0.08	0.25	0.11	0.29	0.30	0.16	0.15	0.10	0.13	0.18	0.09	0.10	0.29	0.08	0.10	0.10
N7	0.11	0.22	0.21	0.20	0.11	0.13	0.13	0.12	0.19	0.10	0.23	0.26	0.15	0.11	0.09	0.24	0.22	0.11	0.13	0.21	0.10	0.13	0.13
N9	0.13	0.18	0.22	0.20	0.10	0.14	0.10	0.12	0.13	0.12	0.17	0.22	0.13	0.10	0.10	0.27	0.21	0.13	0.13	0.14	0.11	0.14	0.14
O2'	0.51	0.32	0.73	0.86	0.37	0.80	0.35	0.73	0.33	0.36	0.31	0.28	0.36	0.34	0.41	0.78	1.05	0.50	0.67	0.33	0.79	0.53	0.59
O3'	0.36	0.24	0.32	0.31	0.32	0.35	0.36	0.37	0.34	0.40	0.28	0.18	0.25	0.40	0.36	0.33	0.26	0.39	0.40	0.37	0.42	0.40	0.40
O4'	0.20	0.17	0.34	0.35	0.12	0.27	0.11	0.24	0.12	0.17	0.15	0.21	0.14	0.14	0.15	0.42	0.39	0.21	0.23	0.11	0.18	0.24	0.24
O5'	0.21	0.34	0.24	0.15	0.26	0.11	0.25	0.17	0.29	0.20	0.33	0.40	0.31	0.23	0.22	0.34	0.17	0.17	0.19	0.29	0.32	0.19	0.22
OP1	0.77	0.84	0.91	0.85	0.79	0.74	0.74	0.66	0.75	0.67	0.80	0.87	0.85	0.67	0.75	0.99	0.93	0.66	0.69	0.72	0.70	0.62	0.62
OP2	0.56	0.53	0.41	0.41	0.61	0.52	0.69	0.59	0.69	0.73	0.61	0.47	0.52	0.76	0.63	0.37	0.28	0.66	0.60	0.74	0.57	0.72	0.67
P	0.12	0.11	0.25	0.23	0.09	0.17	0.10	0.18	0.11	0.11	0.11	0.12	0.11	0.12	0.09	0.36	0.33	0.11	0.19	0.13	0.29	0.16	0.18

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.04	0.01	0.03	0.02	0.04	0.02	0.06	0.06	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.06	0.04	0.04
C2	0.06	0.00	0.09	0.06	0.01	0.04	0.02	0.03	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.18	0.08	0.05	0.06	0.02	0.06	0.15	0.11
C2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.05	0.00	0.05	0.02	0.07	0.04	0.09	0.09	0.09	0.04	0.02	0.00	0.02	0.00	0.04	0.06	0.10	0.07	0.04
C3'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.03	0.01	0.04	0.02	0.04	0.07	0.04	0.07	0.06	0.07	0.03	0.01	0.01	0.00	0.06	0.05	0.12	0.09	0.07
C4	0.04	0.01	0.05	0.03	0.00	0.02	0.01	0.05	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.03	0.03	0.06	0.01	0.07	0.13	0.10
C4'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.08	0.03	0.05	0.05	0.07	0.03	0.03	0.02	0.00	0.01	0.06	0.08	0.02	0.00
C5	0.03	0.02	0.05	0.04	0.01	0.03	0.00	0.09	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.08	0.04	0.02	0.11	0.01	0.15	0.21	0.17
C5'	0.02	0.03	0.02	0.02	0.05	0.01	0.09	0.00	0.09	0.12	0.06	0.03	0.03	0.13	0.06	0.03	0.02	0.00	0.01	0.14	0.09	0.01	0.01
C6	0.04	0.01	0.07	0.04	0.01	0.03	0.01	0.09	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.12	0.05	0.02	0.13	0.01	0.18	0.26	0.20
C8	0.02	0.02	0.04	0.07	0.02	0.08	0.02	0.12	0.03	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.08	0.03	0.12	0.05	0.14	0.18	0.16
N1	0.06	0.00	0.09	0.04	0.02	0.03	0.01	0.06	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.17	0.06	0.04	0.09	0.02	0.13	0.21	0.16
N2	0.06	0.00	0.09	0.07	0.01	0.05	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.19	0.10	0.06	0.05	0.02	0.05	0.14	0.10
N3	0.07	0.01	0.09	0.06	0.01	0.05	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.16	0.08	0.06	0.03	0.02	0.03	0.10	0.07
N7	0.01	0.02	0.04	0.07	0.01	0.07	0.01	0.13	0.03	0.01	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.04	0.08	0.03	0.15	0.05	0.20	0.26	0.21
N9	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.06	0.02	0.06	0.10	0.08
O2'	0.01	0.18	0.00	0.01	0.09	0.03	0.08	0.03	0.12	0.02	0.17	0.19	0.16	0.04	0.02	0.00	0.05	0.05	0.02	0.11	0.09	0.04	0.02
O3'	0.02	0.08	0.02	0.01	0.03	0.02	0.04	0.02	0.05	0.08	0.06	0.10	0.08	0.08	0.03	0.05	0.00	0.02	0.09	0.06	0.14	0.12	0.10
O4'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.03	0.00	0.02	0.00	0.02	0.03	0.04	0.06	0.06	0.03	0.02	0.05	0.02	0.00	0.08	0.03	0.10	0.07	0.07
O5'	0.03	0.06	0.04	0.06	0.06	0.01	0.11	0.01	0.13	0.12	0.09	0.05	0.03	0.15	0.06	0.02	0.09	0.08	0.00	0.18	0.02	0.01	0.01
O6	0.03	0.02	0.06	0.05	0.01	0.06	0.01	0.14	0.01	0.05	0.02	0.02	0.02	0.05	0.02	0.11	0.06	0.03	0.18	0.00	0.27	0.33	0.27
OP1	0.06	0.06	0.10	0.12	0.07	0.08	0.15	0.09	0.18	0.14	0.13	0.05	0.03	0.20	0.06	0.09	0.14	0.10	0.02	0.27	0.00	0.02	0.01
OP2	0.04	0.15	0.07	0.09	0.13	0.02	0.21	0.01	0.26	0.18	0.21	0.14	0.10	0.26	0.10	0.04	0.12	0.07	0.01	0.33	0.02	0.00	0.01
P	0.04	0.11	0.04	0.07	0.10	0.00	0.17	0.01	0.20	0.16	0.16	0.10	0.07	0.21	0.08	0.02	0.10	0.07	0.01	0.27	0.01	0.01	0.00