Doublet Group distance statistics: 53472

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.007, 0.016, 0.025, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.016 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.006, 0.021, 0.036, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.021 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.013, 0.030, 0.047, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.030 std_dev=0.017
N1	A	0, 0.006, 0.024, 0.042, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.024 std_dev=0.018
N3	A	0, 0.006, 0.025, 0.043, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.025 std_dev=0.019
C4	A	0, -0.001, 0.019, 0.039, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.019 std_dev=0.020
N9	A	0, 0.012, 0.033, 0.054, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.033 std_dev=0.021
C2	A	0, 0.003, 0.026, 0.049, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.026 std_dev=0.023
N7	A	0, 0.007, 0.037, 0.067, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.037 std_dev=0.030
N6	A	0, 0.018, 0.051, 0.083, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.051 std_dev=0.032
C8	A	0, 0.001, 0.039, 0.076, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.039 std_dev=0.038
O4'	A	0, 0.030, 0.147, 0.263, 0.280 max_d=0.280 avg_d=0.147 std_dev=0.116
C2'	A	0, 0.062, 0.179, 0.296, 0.301 max_d=0.301 avg_d=0.179 std_dev=0.117
O2'	A	0, 0.051, 0.191, 0.331, 0.393 max_d=0.393 avg_d=0.191 std_dev=0.140
C4'	B	0, 0.124, 0.295, 0.466, 0.414 max_d=0.414 avg_d=0.295 std_dev=0.171
P	A	0, 0.074, 0.262, 0.449, 0.467 max_d=0.467 avg_d=0.262 std_dev=0.188
C3'	A	0, 0.081, 0.273, 0.465, 0.459 max_d=0.459 avg_d=0.273 std_dev=0.192
O4'	B	0, 0.133, 0.331, 0.530, 0.511 max_d=0.511 avg_d=0.331 std_dev=0.199
C1'	B	0, 0.090, 0.297, 0.504, 0.576 max_d=0.576 avg_d=0.297 std_dev=0.207
C4'	A	0, 0.050, 0.265, 0.479, 0.493 max_d=0.493 avg_d=0.265 std_dev=0.215
O2'	B	0, 0.094, 0.309, 0.524, 0.550 max_d=0.550 avg_d=0.309 std_dev=0.215
N2	B	0, 0.126, 0.358, 0.589, 0.643 max_d=0.643 avg_d=0.358 std_dev=0.231
N3	B	0, 0.102, 0.335, 0.567, 0.657 max_d=0.657 avg_d=0.335 std_dev=0.232
C2'	B	0, 0.061, 0.306, 0.550, 0.646 max_d=0.646 avg_d=0.306 std_dev=0.244
C2	B	0, 0.125, 0.373, 0.622, 0.695 max_d=0.695 avg_d=0.373 std_dev=0.248
C3'	B	0, 0.084, 0.339, 0.595, 0.668 max_d=0.668 avg_d=0.339 std_dev=0.256
N9	B	0, 0.140, 0.405, 0.669, 0.723 max_d=0.723 avg_d=0.405 std_dev=0.264
C4	B	0, 0.145, 0.414, 0.683, 0.748 max_d=0.748 avg_d=0.414 std_dev=0.269
O3'	B	0, 0.152, 0.423, 0.693, 0.750 max_d=0.750 avg_d=0.423 std_dev=0.270
O3'	A	0, 0.087, 0.359, 0.631, 0.699 max_d=0.699 avg_d=0.359 std_dev=0.272
N1	B	0, 0.189, 0.489, 0.790, 0.818 max_d=0.818 avg_d=0.489 std_dev=0.300
C5'	B	0, 0.207, 0.533, 0.858, 0.871 max_d=0.871 avg_d=0.533 std_dev=0.325
OP1	A	0, 0.184, 0.514, 0.844, 0.811 max_d=0.811 avg_d=0.514 std_dev=0.330
C5	B	0, 0.211, 0.550, 0.889, 0.894 max_d=0.894 avg_d=0.550 std_dev=0.339
C8	B	0, 0.193, 0.533, 0.873, 0.875 max_d=0.875 avg_d=0.533 std_dev=0.340
OP2	A	0, 0.089, 0.433, 0.777, 0.937 max_d=0.937 avg_d=0.433 std_dev=0.344
C6	B	0, 0.241, 0.603, 0.964, 0.946 max_d=0.946 avg_d=0.603 std_dev=0.362
C5'	A	0, 0.071, 0.458, 0.846, 1.015 max_d=1.015 avg_d=0.458 std_dev=0.388
N7	B	0, 0.238, 0.634, 1.029, 0.989 max_d=0.989 avg_d=0.634 std_dev=0.396
O6	B	0, 0.299, 0.739, 1.179, 1.103 max_d=1.103 avg_d=0.739 std_dev=0.440
OP2	B	0, 0.318, 0.758, 1.199, 1.091 max_d=1.091 avg_d=0.758 std_dev=0.440
P	B	0, 0.214, 0.659, 1.103, 1.074 max_d=1.074 avg_d=0.659 std_dev=0.445
OP1	B	0, 0.113, 0.644, 1.175, 1.308 max_d=1.308 avg_d=0.644 std_dev=0.531
O5'	A	0, 0.055, 0.762, 1.469, 1.747 max_d=1.747 avg_d=0.762 std_dev=0.707
O5'	B	0, 0.448, 1.162, 1.875, 1.820 max_d=1.820 avg_d=1.162 std_dev=0.714

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.05	0.05	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.17	0.39	0.11
C2	0.05	0.00	0.07	0.08	0.02	0.04	0.01	0.07	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.11	0.12	0.05	0.29	0.12	0.41	0.08
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.06	0.01	0.07	0.01	0.09	0.04	0.08	0.06	0.10	0.06	0.02	0.00	0.02	0.00	0.16	0.22	0.36	0.06
C3'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.06	0.00	0.07	0.02	0.09	0.03	0.09	0.06	0.11	0.05	0.02	0.01	0.00	0.01	0.20	0.31	0.32	0.04
C4	0.03	0.02	0.06	0.06	0.00	0.02	0.00	0.08	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.07	0.08	0.02	0.29	0.10	0.40	0.09
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.04	0.04	0.03	0.03	0.05	0.04	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.23	0.35	0.07
C5	0.02	0.01	0.07	0.07	0.00	0.03	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.08	0.09	0.02	0.35	0.05	0.39	0.08
C5'	0.03	0.07	0.01	0.02	0.08	0.00	0.12	0.00	0.12	0.12	0.10	0.05	0.14	0.14	0.08	0.03	0.02	0.01	0.00	0.33	0.33	0.00
C6	0.03	0.00	0.09	0.09	0.01	0.04	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.11	0.13	0.02	0.36	0.05	0.38	0.08
C8	0.01	0.02	0.04	0.03	0.01	0.04	0.00	0.12	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.03	0.03	0.03	0.34	0.05	0.40	0.09
N1	0.05	0.00	0.08	0.09	0.02	0.03	0.01	0.10	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.12	0.13	0.04	0.33	0.08	0.40	0.08
N3	0.05	0.01	0.06	0.06	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.09	0.09	0.05	0.26	0.14	0.41	0.08
N6	0.03	0.01	0.10	0.11	0.02	0.05	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.12	0.15	0.01	0.40	0.05	0.35	0.08
N7	0.01	0.02	0.06	0.05	0.00	0.04	0.00	0.14	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.06	0.03	0.37	0.05	0.38	0.08
N9	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.08	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.03	0.01	0.27	0.11	0.40	0.10
O2'	0.01	0.11	0.00	0.01	0.07	0.03	0.08	0.03	0.11	0.03	0.12	0.09	0.12	0.05	0.03	0.00	0.02	0.01	0.02	0.21	0.36	0.09
O3'	0.01	0.12	0.02	0.00	0.08	0.01	0.09	0.02	0.13	0.03	0.13	0.09	0.15	0.06	0.03	0.02	0.00	0.01	0.12	0.36	0.30	0.03
O4'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.04	0.05	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.10	0.19	0.38	0.12
O5'	0.14	0.29	0.16	0.20	0.29	0.01	0.35	0.00	0.36	0.34	0.33	0.26	0.40	0.37	0.27	0.02	0.12	0.10	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.17	0.12	0.22	0.31	0.10	0.23	0.05	0.33	0.05	0.05	0.08	0.14	0.05	0.05	0.11	0.21	0.36	0.19	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.39	0.41	0.36	0.32	0.40	0.35	0.39	0.33	0.38	0.40	0.40	0.41	0.35	0.38	0.40	0.36	0.30	0.38	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.11	0.08	0.06	0.04	0.09	0.07	0.08	0.00	0.08	0.09	0.08	0.08	0.08	0.08	0.10	0.09	0.03	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.12	0.11	0.08	0.14	0.10	0.16	0.13	0.16	0.16	0.14	0.09	0.11	0.17	0.14	0.13	0.10	0.13	0.15	0.17	0.22	0.21	0.12
C2	0.15	0.14	0.14	0.13	0.17	0.09	0.16	0.10	0.16	0.17	0.14	0.11	0.16	0.17	0.17	0.07	0.14	0.14	0.14	0.15	0.11	0.21	0.11
C2'	0.10	0.13	0.08	0.11	0.14	0.14	0.17	0.18	0.17	0.15	0.15	0.10	0.11	0.17	0.13	0.12	0.14	0.14	0.18	0.19	0.26	0.17	0.13
C3'	0.09	0.11	0.09	0.14	0.11	0.20	0.13	0.25	0.14	0.11	0.13	0.11	0.10	0.14	0.10	0.13	0.16	0.18	0.25	0.16	0.31	0.16	0.18
C4	0.10	0.10	0.11	0.09	0.12	0.08	0.13	0.09	0.13	0.12	0.12	0.08	0.10	0.13	0.12	0.10	0.10	0.12	0.09	0.14	0.15	0.20	0.09
C4'	0.10	0.09	0.09	0.08	0.11	0.14	0.14	0.20	0.14	0.15	0.11	0.07	0.08	0.16	0.13	0.12	0.10	0.16	0.23	0.15	0.29	0.19	0.17
C5	0.10	0.11	0.12	0.10	0.12	0.07	0.14	0.08	0.14	0.13	0.13	0.09	0.11	0.14	0.12	0.09	0.12	0.12	0.08	0.15	0.13	0.20	0.08
C5'	0.08	0.12	0.07	0.09	0.09	0.15	0.09	0.22	0.10	0.10	0.11	0.14	0.11	0.11	0.09	0.11	0.10	0.17	0.25	0.10	0.30	0.17	0.19
C6	0.12	0.14	0.13	0.12	0.15	0.08	0.16	0.09	0.17	0.15	0.16	0.12	0.14	0.16	0.14	0.08	0.14	0.13	0.11	0.17	0.10	0.20	0.10
C8	0.07	0.08	0.10	0.07	0.10	0.08	0.12	0.10	0.13	0.11	0.11	0.06	0.07	0.13	0.09	0.10	0.09	0.10	0.10	0.14	0.18	0.20	0.09
N1	0.14	0.17	0.14	0.14	0.17	0.09	0.18	0.10	0.18	0.16	0.17	0.14	0.17	0.17	0.16	0.07	0.16	0.13	0.15	0.18	0.09	0.21	0.11
N3	0.13	0.10	0.12	0.10	0.13	0.09	0.14	0.09	0.13	0.14	0.11	0.08	0.11	0.14	0.14	0.09	0.11	0.14	0.10	0.13	0.14	0.21	0.10
N6	0.13	0.16	0.13	0.13	0.16	0.08	0.17	0.10	0.18	0.15	0.18	0.14	0.15	0.17	0.15	0.08	0.15	0.14	0.12	0.19	0.10	0.20	0.10
N7	0.08	0.09	0.11	0.09	0.11	0.07	0.13	0.09	0.14	0.11	0.12	0.07	0.09	0.13	0.10	0.10	0.11	0.11	0.08	0.15	0.15	0.20	0.08
N9	0.08	0.09	0.10	0.07	0.10	0.08	0.12	0.10	0.13	0.11	0.11	0.07	0.08	0.13	0.10	0.10	0.09	0.11	0.10	0.14	0.18	0.20	0.09
O2'	0.20	0.21	0.11	0.10	0.24	0.15	0.26	0.18	0.26	0.26	0.24	0.18	0.20	0.28	0.24	0.10	0.12	0.22	0.23	0.28	0.27	0.25	0.18
O3'	0.11	0.16	0.09	0.18	0.16	0.24	0.19	0.31	0.20	0.16	0.19	0.16	0.15	0.19	0.15	0.12	0.20	0.21	0.31	0.22	0.36	0.16	0.23
O4'	0.11	0.08	0.11	0.09	0.12	0.12	0.14	0.16	0.13	0.15	0.11	0.06	0.09	0.15	0.13	0.13	0.11	0.15	0.18	0.14	0.26	0.20	0.15
O5'	0.26	0.40	0.21	0.12	0.37	0.15	0.40	0.20	0.44	0.33	0.44	0.40	0.36	0.38	0.32	0.21	0.10	0.24	0.25	0.46	0.30	0.21	0.20
OP1	0.29	0.20	0.28	0.28	0.28	0.31	0.32	0.35	0.31	0.36	0.25	0.14	0.21	0.37	0.31	0.27	0.33	0.31	0.35	0.33	0.41	0.36	0.33
OP2	0.33	0.33	0.37	0.35	0.32	0.34	0.30	0.35	0.30	0.30	0.31	0.33	0.34	0.29	0.31	0.39	0.33	0.32	0.39	0.29	0.40	0.41	0.36
P	0.13	0.12	0.12	0.15	0.13	0.20	0.14	0.26	0.14	0.14	0.13	0.12	0.12	0.15	0.13	0.13	0.18	0.20	0.26	0.15	0.35	0.18	0.21

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.23	0.08
C2	0.00	0.00	0.12	0.16	0.01	0.07	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.19	0.02	0.12	0.01	0.09	0.21	0.09
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.06	0.01	0.03	0.00	0.06	0.05	0.10	0.15	0.12	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.05	0.15	0.23	0.08
C3'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.08	0.00	0.05	0.01	0.09	0.07	0.13	0.19	0.14	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.07	0.16	0.24	0.08
C4	0.00	0.01	0.06	0.08	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.09	0.01	0.09	0.01	0.05	0.21	0.07
C4'	0.00	0.07	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.04	0.05	0.06	0.08	0.06	0.04	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.12	0.16	0.04
C5	0.00	0.01	0.03	0.05	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.06	0.01	0.11	0.01	0.05	0.17	0.05
C5'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.05	0.00	0.07	0.00	0.08	0.09	0.08	0.09	0.06	0.09	0.04	0.03	0.02	0.00	0.00	0.09	0.09	0.07	0.00
C6	0.01	0.01	0.06	0.09	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.10	0.01	0.13	0.00	0.09	0.16	0.07
C8	0.01	0.01	0.05	0.07	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.08	0.02	0.11	0.02	0.07	0.17	0.04
N1	0.00	0.00	0.10	0.13	0.01	0.06	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.16	0.02	0.13	0.00	0.10	0.19	0.09
N2	0.00	0.01	0.15	0.19	0.01	0.08	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.25	0.02	0.13	0.01	0.11	0.22	0.11
N3	0.00	0.00	0.12	0.14	0.00	0.06	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.17	0.02	0.10	0.01	0.07	0.22	0.09
N7	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.05	0.01	0.12	0.02	0.04	0.14	0.02
N9	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.01	0.06	0.21	0.06
O2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.04	0.02	0.02	0.03	0.04	0.03	0.06	0.10	0.07	0.02	0.01	0.00	0.03	0.02	0.02	0.04	0.15	0.22	0.06
O3'	0.01	0.19	0.01	0.00	0.09	0.01	0.06	0.02	0.10	0.08	0.16	0.25	0.17	0.05	0.01	0.03	0.00	0.01	0.08	0.09	0.20	0.23	0.09
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.06	0.02	0.10	0.23	0.10
O5'	0.01	0.12	0.05	0.08	0.09	0.01	0.11	0.00	0.13	0.11	0.13	0.13	0.10	0.12	0.06	0.02	0.08	0.06	0.00	0.14	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.05	0.07	0.01	0.05	0.01	0.09	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.09	0.02	0.14	0.00	0.11	0.13	0.07
OP1	0.10	0.09	0.15	0.16	0.05	0.12	0.05	0.09	0.09	0.07	0.10	0.11	0.07	0.04	0.06	0.15	0.20	0.10	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00
OP2	0.23	0.21	0.23	0.24	0.21	0.16	0.17	0.07	0.16	0.17	0.19	0.22	0.22	0.14	0.21	0.22	0.23	0.23	0.01	0.13	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.09	0.08	0.08	0.07	0.04	0.05	0.00	0.07	0.04	0.09	0.11	0.09	0.02	0.06	0.06	0.09	0.10	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00