Doublet Group distance statistics: 53475

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.001, 0.011, 0.022, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.011 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.001, 0.012, 0.023, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.012 std_dev=0.011
C1'	A	0, -0.001, 0.013, 0.028, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.013 std_dev=0.015
C2	A	0, -0.003, 0.013, 0.028, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.013 std_dev=0.015
N3	A	0, 0.000, 0.016, 0.032, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.016 std_dev=0.016
C4	A	0, -0.003, 0.014, 0.031, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.014 std_dev=0.017
C5	A	0, -0.002, 0.015, 0.032, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.015 std_dev=0.017
N9	A	0, -0.005, 0.015, 0.034, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.015 std_dev=0.019
N7	A	0, -0.005, 0.022, 0.048, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.022 std_dev=0.026
C8	A	0, -0.006, 0.026, 0.058, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.026 std_dev=0.032
N6	A	0, -0.008, 0.038, 0.083, 0.101 max_d=0.101 avg_d=0.038 std_dev=0.045
C2'	B	0, 0.007, 0.089, 0.172, 0.198 max_d=0.198 avg_d=0.089 std_dev=0.082
N7	B	0, 0.003, 0.150, 0.297, 0.349 max_d=0.349 avg_d=0.150 std_dev=0.147
O2'	B	0, -0.025, 0.124, 0.272, 0.333 max_d=0.333 avg_d=0.124 std_dev=0.149
C5	B	0, -0.001, 0.167, 0.335, 0.397 max_d=0.397 avg_d=0.167 std_dev=0.168
N9	B	0, -0.007, 0.169, 0.344, 0.411 max_d=0.411 avg_d=0.169 std_dev=0.176
C1'	B	0, -0.024, 0.194, 0.412, 0.498 max_d=0.498 avg_d=0.194 std_dev=0.218
C8	B	0, -0.020, 0.201, 0.422, 0.508 max_d=0.508 avg_d=0.201 std_dev=0.221
C4	B	0, -0.017, 0.212, 0.441, 0.530 max_d=0.530 avg_d=0.212 std_dev=0.229
O6	B	0, -0.035, 0.239, 0.514, 0.623 max_d=0.623 avg_d=0.239 std_dev=0.274
C3'	B	0, -0.040, 0.242, 0.525, 0.639 max_d=0.639 avg_d=0.242 std_dev=0.283
C6	B	0, -0.038, 0.251, 0.541, 0.657 max_d=0.657 avg_d=0.251 std_dev=0.290
O4'	A	0, -0.087, 0.237, 0.561, 0.695 max_d=0.695 avg_d=0.237 std_dev=0.324
O4'	B	0, -0.056, 0.304, 0.664, 0.810 max_d=0.810 avg_d=0.304 std_dev=0.360
N3	B	0, -0.064, 0.331, 0.727, 0.888 max_d=0.888 avg_d=0.331 std_dev=0.396
C2'	A	0, -0.114, 0.296, 0.705, 0.875 max_d=0.875 avg_d=0.296 std_dev=0.410
O3'	B	0, -0.075, 0.335, 0.746, 0.913 max_d=0.913 avg_d=0.335 std_dev=0.410
C4'	B	0, -0.082, 0.349, 0.780, 0.957 max_d=0.957 avg_d=0.349 std_dev=0.431
O5'	A	0, -0.097, 0.366, 0.830, 1.020 max_d=1.020 avg_d=0.366 std_dev=0.463
N1	B	0, -0.095, 0.385, 0.866, 1.062 max_d=1.062 avg_d=0.385 std_dev=0.480
C2	B	0, -0.110, 0.420, 0.950, 1.168 max_d=1.168 avg_d=0.420 std_dev=0.530
OP2	B	0, -0.107, 0.460, 1.027, 1.259 max_d=1.259 avg_d=0.460 std_dev=0.567
C4'	A	0, -0.158, 0.423, 1.003, 1.244 max_d=1.244 avg_d=0.423 std_dev=0.581
C5'	A	0, -0.143, 0.441, 1.025, 1.266 max_d=1.266 avg_d=0.441 std_dev=0.584
C5'	B	0, -0.124, 0.462, 1.049, 1.291 max_d=1.291 avg_d=0.462 std_dev=0.587
P	A	0, -0.149, 0.479, 1.108, 1.367 max_d=1.367 avg_d=0.479 std_dev=0.628
P	B	0, -0.131, 0.503, 1.137, 1.397 max_d=1.397 avg_d=0.503 std_dev=0.634
O5'	B	0, -0.148, 0.511, 1.170, 1.442 max_d=1.442 avg_d=0.511 std_dev=0.659
C3'	A	0, -0.196, 0.507, 1.210, 1.501 max_d=1.501 avg_d=0.507 std_dev=0.703
N2	B	0, -0.181, 0.558, 1.298, 1.603 max_d=1.603 avg_d=0.558 std_dev=0.739
O2'	A	0, -0.200, 0.544, 1.288, 1.596 max_d=1.596 avg_d=0.544 std_dev=0.744
OP1	B	0, -0.174, 0.598, 1.369, 1.687 max_d=1.687 avg_d=0.598 std_dev=0.772
O3'	A	0, -0.339, 0.885, 2.109, 2.616 max_d=2.616 avg_d=0.885 std_dev=1.224
OP2	A	0, -0.450, 1.131, 2.712, 3.367 max_d=3.367 avg_d=1.131 std_dev=1.581
OP1	A	0, -0.468, 1.301, 3.069, 3.801 max_d=3.801 avg_d=1.301 std_dev=1.769

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.00	0.03	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.31	0.00	0.17	0.33	0.03	0.19
C2	0.03	0.00	0.24	0.26	0.00	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.10	0.11	0.07	0.06	0.63	0.55	0.11
C2'	0.01	0.24	0.00	0.00	0.11	0.00	0.03	0.21	0.09	0.14	0.18	0.25	0.04	0.09	0.01	0.00	0.03	0.02	0.37	0.26	0.21	0.38
C3'	0.01	0.26	0.00	0.00	0.24	0.00	0.27	0.01	0.30	0.21	0.30	0.22	0.31	0.26	0.19	0.01	0.01	0.00	0.06	0.45	0.04	0.11
C4	0.01	0.00	0.11	0.24	0.00	0.06	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.19	0.09	0.05	0.08	0.65	0.47	0.14
C4'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.06	0.00	0.06	0.00	0.06	0.06	0.06	0.05	0.05	0.06	0.06	0.25	0.03	0.00	0.00	0.24	0.23	0.01
C5	0.01	0.00	0.03	0.27	0.00	0.06	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.28	0.01	0.05	0.07	0.86	0.62	0.15
C5'	0.07	0.01	0.21	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.17	0.00	0.01	0.32	0.43	0.00
C6	0.00	0.01	0.09	0.30	0.00	0.06	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.26	0.03	0.06	0.05	0.90	0.70	0.14
C8	0.03	0.00	0.14	0.21	0.00	0.06	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.28	0.03	0.01	0.09	0.81	0.45	0.18
N1	0.02	0.01	0.18	0.30	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.18	0.03	0.07	0.05	0.79	0.66	0.12
N3	0.02	0.00	0.25	0.22	0.00	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.17	0.06	0.07	0.54	0.43	0.12
N6	0.01	0.02	0.04	0.31	0.00	0.05	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.31	0.08	0.07	0.06	1.05	0.78	0.16
N7	0.02	0.00	0.09	0.26	0.00	0.06	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.32	0.08	0.02	0.06	0.98	0.64	0.17
N9	0.00	0.00	0.01	0.19	0.01	0.06	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.19	0.09	0.01	0.10	0.57	0.33	0.16
O2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.19	0.25	0.28	0.03	0.26	0.28	0.18	0.06	0.31	0.32	0.19	0.00	0.02	0.18	0.27	0.15	0.20	0.32
O3'	0.31	0.11	0.03	0.01	0.09	0.03	0.01	0.17	0.03	0.03	0.03	0.17	0.08	0.08	0.09	0.02	0.00	0.24	0.23	0.90	0.22	0.39
O4'	0.00	0.07	0.02	0.00	0.05	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.07	0.06	0.07	0.02	0.01	0.18	0.24	0.00	0.05	0.19	0.07	0.07
O5'	0.17	0.06	0.37	0.06	0.08	0.00	0.07	0.01	0.05	0.09	0.05	0.07	0.06	0.06	0.10	0.27	0.23	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.33	0.63	0.26	0.45	0.65	0.24	0.86	0.32	0.90	0.81	0.79	0.54	1.05	0.98	0.57	0.15	0.90	0.19	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.03	0.55	0.21	0.04	0.47	0.23	0.62	0.43	0.70	0.45	0.66	0.43	0.78	0.64	0.33	0.20	0.22	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.19	0.11	0.38	0.11	0.14	0.01	0.15	0.00	0.14	0.18	0.12	0.12	0.16	0.17	0.16	0.32	0.39	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.02	0.05	0.02	0.02	0.04	0.02	0.03	0.04	0.03	0.01	0.04	0.06	0.06	0.01	0.02	0.03	0.04	0.01	0.01	0.03	0.28	0.02	0.07
C2	0.17	0.04	0.07	0.07	0.07	0.18	0.04	0.17	0.01	0.11	0.05	0.11	0.04	0.07	0.12	0.15	0.05	0.20	0.13	0.03	0.26	0.00	0.09
C2'	0.34	0.25	0.33	0.36	0.31	0.39	0.31	0.41	0.29	0.34	0.26	0.21	0.29	0.33	0.34	0.33	0.37	0.34	0.36	0.30	0.62	0.38	0.43
C3'	0.07	0.06	0.11	0.19	0.02	0.16	0.05	0.17	0.02	0.12	0.02	0.11	0.04	0.11	0.07	0.07	0.22	0.13	0.24	0.04	0.01	0.20	0.17
C4	0.08	0.03	0.02	0.01	0.05	0.08	0.02	0.09	0.01	0.04	0.01	0.03	0.06	0.02	0.06	0.09	0.01	0.08	0.03	0.01	0.23	0.03	0.04
C4'	0.11	0.05	0.15	0.20	0.11	0.16	0.14	0.16	0.13	0.18	0.09	0.00	0.05	0.19	0.14	0.09	0.23	0.14	0.27	0.14	0.03	0.21	0.16
C5	0.10	0.08	0.02	0.01	0.08	0.09	0.05	0.08	0.03	0.05	0.04	0.09	0.11	0.04	0.08	0.10	0.04	0.11	0.02	0.01	0.21	0.06	0.02
C5'	0.12	0.06	0.16	0.20	0.12	0.16	0.15	0.16	0.14	0.19	0.10	0.01	0.06	0.20	0.14	0.10	0.22	0.15	0.27	0.16	0.04	0.21	0.16
C6	0.16	0.08	0.05	0.02	0.11	0.14	0.07	0.13	0.04	0.10	0.04	0.08	0.13	0.08	0.13	0.13	0.02	0.17	0.07	0.02	0.21	0.05	0.05
C8	0.04	0.08	0.01	0.04	0.05	0.02	0.02	0.02	0.02	0.00	0.05	0.11	0.09	0.00	0.03	0.04	0.06	0.02	0.05	0.01	0.20	0.07	0.00
N1	0.18	0.03	0.07	0.06	0.11	0.18	0.07	0.17	0.02	0.13	0.01	0.03	0.11	0.09	0.14	0.15	0.02	0.21	0.12	0.01	0.24	0.02	0.08
N3	0.10	0.03	0.04	0.05	0.03	0.14	0.01	0.13	0.02	0.06	0.04	0.06	0.02	0.03	0.07	0.13	0.05	0.12	0.09	0.02	0.26	0.00	0.08
N6	0.18	0.14	0.06	0.02	0.15	0.15	0.11	0.13	0.08	0.13	0.09	0.15	0.18	0.11	0.15	0.14	0.03	0.19	0.07	0.05	0.20	0.05	0.05
N7	0.08	0.10	0.00	0.03	0.07	0.05	0.04	0.04	0.04	0.03	0.06	0.13	0.11	0.02	0.06	0.07	0.06	0.07	0.03	0.02	0.19	0.08	0.00
N9	0.03	0.04	0.00	0.01	0.03	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.06	0.06	0.00	0.02	0.05	0.01	0.02	0.02	0.00	0.23	0.03	0.03
O2'	0.34	0.08	0.46	0.70	0.26	0.65	0.31	0.74	0.25	0.44	0.15	0.05	0.13	0.41	0.35	0.35	0.87	0.42	0.71	0.28	1.07	0.73	0.80
O3'	0.62	0.49	0.69	0.77	0.59	0.71	0.64	0.70	0.60	0.71	0.54	0.41	0.50	0.70	0.64	0.61	0.79	0.66	0.80	0.62	0.52	0.76	0.70
O4'	0.15	0.09	0.18	0.20	0.14	0.17	0.17	0.16	0.15	0.20	0.12	0.04	0.09	0.20	0.17	0.12	0.20	0.17	0.25	0.17	0.07	0.20	0.15
O5'	0.14	0.08	0.19	0.23	0.13	0.17	0.17	0.17	0.15	0.20	0.12	0.03	0.08	0.20	0.16	0.14	0.24	0.16	0.27	0.17	0.03	0.24	0.17
OP1	0.30	0.68	0.39	0.29	0.53	0.10	0.59	0.02	0.68	0.42	0.73	0.73	0.57	0.52	0.42	0.28	0.25	0.17	0.23	0.72	0.18	0.28	0.10
OP2	0.13	0.43	0.00	0.20	0.24	0.12	0.17	0.20	0.24	0.02	0.36	0.57	0.38	0.05	0.13	0.10	0.34	0.03	0.31	0.21	0.19	0.31	0.28
P	0.15	0.12	0.21	0.24	0.16	0.16	0.20	0.15	0.20	0.21	0.16	0.08	0.11	0.23	0.17	0.14	0.26	0.15	0.27	0.22	0.02	0.25	0.18

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.02	0.10	0.07	0.03
C2	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.17	0.11
C2'	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.18	0.03	0.01
C3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.00	0.04	0.02	0.03	0.05	0.03	0.02	0.02	0.05	0.03	0.00	0.01	0.00	0.03	0.03	0.21	0.01	0.03
C4	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.17	0.11
C4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.01	0.01
C5	0.01	0.00	0.01	0.04	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.02	0.06	0.20	0.15
C5'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.05	0.01	0.06	0.00	0.05	0.07	0.04	0.04	0.04	0.07	0.04	0.00	0.03	0.01	0.00	0.04	0.10	0.01	0.01
C6	0.02	0.00	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.03	0.00	0.00	0.06	0.20	0.14
C8	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.03	0.00	0.07	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.03	0.00	0.02	0.06	0.18	0.14
N1	0.00	0.00	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.00	0.01	0.02	0.19	0.13
N2	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.03	0.00	0.01	0.04	0.16	0.10
N3	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.02	0.02	0.00	0.01	0.04	0.15	0.10
N7	0.02	0.00	0.01	0.05	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.03	0.01	0.02	0.11	0.23	0.17
N9	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.14	0.10
O2'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.00	0.00	0.02	0.04	0.01	0.03	0.19	0.03	0.01
O3'	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.05	0.03	0.05	0.06	0.04	0.01	0.02	0.07	0.04	0.02	0.00	0.01	0.07	0.05	0.26	0.01	0.06
O4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.04	0.01	0.00	0.09	0.04	0.10	0.02	0.01
O5'	0.04	0.00	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01
O6	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.05	0.04	0.01	0.00	0.09	0.21	0.15
OP1	0.10	0.02	0.18	0.21	0.00	0.14	0.06	0.10	0.06	0.06	0.02	0.04	0.04	0.11	0.02	0.19	0.26	0.10	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00
OP2	0.07	0.17	0.03	0.01	0.17	0.01	0.20	0.01	0.20	0.18	0.19	0.16	0.15	0.23	0.14	0.03	0.01	0.02	0.01	0.21	0.01	0.00	0.00
P	0.03	0.11	0.01	0.03	0.11	0.01	0.15	0.01	0.14	0.14	0.13	0.10	0.10	0.17	0.10	0.01	0.06	0.01	0.01	0.15	0.00	0.00	0.00