Doublet Group distance statistics: 53491

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 2, 7, 9, 12, 9, 11, 6, 11, 9, 2, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.015, 0.022, 0.029, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.022 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.013, 0.022, 0.030, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.022 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.029, 0.040, 0.051, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.040 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.019, 0.033, 0.046, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.033 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.022, 0.036, 0.050, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.036 std_dev=0.014
C5	A	0, 0.013, 0.028, 0.043, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.028 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.023, 0.040, 0.057, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.040 std_dev=0.017
C4	A	0, 0.020, 0.040, 0.059, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.040 std_dev=0.020
N6	A	0, 0.027, 0.051, 0.075, 0.127 max_d=0.127 avg_d=0.051 std_dev=0.024
N7	A	0, 0.028, 0.056, 0.085, 0.133 max_d=0.133 avg_d=0.056 std_dev=0.028
C8	A	0, 0.033, 0.065, 0.097, 0.152 max_d=0.152 avg_d=0.065 std_dev=0.032
C2'	A	0, 0.149, 0.280, 0.410, 0.607 max_d=0.607 avg_d=0.280 std_dev=0.130
O2'	A	0, 0.188, 0.330, 0.471, 0.755 max_d=0.755 avg_d=0.330 std_dev=0.141
O4'	A	0, 0.049, 0.191, 0.333, 0.649 max_d=0.649 avg_d=0.191 std_dev=0.142
C4'	A	0, 0.168, 0.386, 0.605, 1.247 max_d=1.247 avg_d=0.386 std_dev=0.219
O2'	B	0, 0.179, 0.400, 0.621, 0.958 max_d=0.958 avg_d=0.400 std_dev=0.221
C3'	A	0, 0.237, 0.458, 0.680, 1.133 max_d=1.133 avg_d=0.458 std_dev=0.222
C2	B	0, 0.307, 0.545, 0.783, 1.093 max_d=1.093 avg_d=0.545 std_dev=0.238
C2'	B	0, 0.192, 0.434, 0.677, 1.270 max_d=1.270 avg_d=0.434 std_dev=0.242
O2	B	0, 0.325, 0.582, 0.838, 1.201 max_d=1.201 avg_d=0.582 std_dev=0.257
C1'	B	0, 0.196, 0.454, 0.711, 1.362 max_d=1.362 avg_d=0.454 std_dev=0.257
N1	B	0, 0.230, 0.493, 0.756, 1.166 max_d=1.166 avg_d=0.493 std_dev=0.263
N3	B	0, 0.348, 0.657, 0.966, 1.484 max_d=1.484 avg_d=0.657 std_dev=0.309
O3'	A	0, 0.380, 0.706, 1.033, 1.361 max_d=1.361 avg_d=0.706 std_dev=0.327
C6	B	0, 0.297, 0.630, 0.962, 1.734 max_d=1.734 avg_d=0.630 std_dev=0.332
C4	B	0, 0.362, 0.696, 1.030, 1.381 max_d=1.381 avg_d=0.696 std_dev=0.334
C5	B	0, 0.361, 0.708, 1.055, 1.648 max_d=1.648 avg_d=0.708 std_dev=0.347
C3'	B	0, 0.200, 0.579, 0.958, 2.438 max_d=2.438 avg_d=0.579 std_dev=0.379
O4'	B	0, 0.219, 0.601, 0.983, 2.396 max_d=2.396 avg_d=0.601 std_dev=0.382
C5'	A	0, 0.211, 0.597, 0.983, 2.423 max_d=2.423 avg_d=0.597 std_dev=0.386
N4	B	0, 0.442, 0.844, 1.247, 1.790 max_d=1.790 avg_d=0.844 std_dev=0.402
C4'	B	0, 0.214, 0.644, 1.074, 2.854 max_d=2.854 avg_d=0.644 std_dev=0.430
O3'	B	0, 0.182, 0.643, 1.103, 2.917 max_d=2.917 avg_d=0.643 std_dev=0.460
C5'	B	0, 0.258, 0.855, 1.452, 4.005 max_d=4.005 avg_d=0.855 std_dev=0.597
O5'	B	0, 0.305, 1.037, 1.769, 4.378 max_d=4.378 avg_d=1.037 std_dev=0.732
P	B	0, 0.168, 1.156, 2.143, 6.275 max_d=6.275 avg_d=1.156 std_dev=0.988
OP1	B	0, 0.348, 1.386, 2.425, 5.630 max_d=5.630 avg_d=1.386 std_dev=1.038
O5'	A	0, 0.012, 1.075, 2.138, 3.177 max_d=3.177 avg_d=1.075 std_dev=1.063
OP2	B	0, 0.274, 1.524, 2.774, 7.372 max_d=7.372 avg_d=1.524 std_dev=1.250
P	A	0, 0.368, 1.666, 2.964, 4.072 max_d=4.072 avg_d=1.666 std_dev=1.298
OP1	A	0, 1.282, 2.824, 4.367, 5.762 max_d=5.762 avg_d=2.824 std_dev=1.542
OP2	A	0, -0.001, 2.272, 4.545, 6.875 max_d=6.875 avg_d=2.272 std_dev=2.273

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.37	0.33	0.57	0.40
C2	0.02	0.00	0.12	0.14	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.14	0.17	0.04	0.63	0.68	1.19	0.77
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.07	0.01	0.07	0.02	0.08	0.08	0.10	0.12	0.09	0.08	0.04	0.00	0.02	0.01	0.20	0.31	0.27	0.20
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.10	0.00	0.14	0.02	0.15	0.16	0.14	0.12	0.17	0.17	0.09	0.02	0.01	0.01	0.17	0.37	0.22	0.14
C4	0.01	0.01	0.07	0.10	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.08	0.11	0.02	0.71	0.69	1.23	0.81
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.08	0.11	0.06	0.04	0.10	0.11	0.05	0.04	0.02	0.00	0.01	0.13	0.19	0.04
C5	0.01	0.01	0.07	0.14	0.00	0.08	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.06	0.16	0.02	0.90	0.89	1.62	1.06
C5'	0.03	0.11	0.02	0.02	0.12	0.01	0.18	0.00	0.18	0.20	0.15	0.09	0.21	0.22	0.12	0.04	0.04	0.02	0.01	0.17	0.27	0.01
C6	0.02	0.01	0.08	0.15	0.01	0.08	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.18	0.03	0.90	0.95	1.70	1.10
C8	0.01	0.01	0.08	0.16	0.00	0.11	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.05	0.18	0.04	0.96	0.85	1.54	1.05
N1	0.02	0.00	0.10	0.14	0.01	0.06	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.17	0.03	0.78	0.84	1.48	0.96
N3	0.02	0.00	0.12	0.12	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.14	0.14	0.04	0.55	0.58	1.00	0.66
N6	0.02	0.01	0.09	0.17	0.02	0.10	0.01	0.21	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.08	0.21	0.04	1.00	1.08	1.95	1.24
N7	0.01	0.01	0.08	0.17	0.00	0.11	0.00	0.22	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.20	0.03	1.03	1.00	1.84	1.21
N9	0.00	0.01	0.04	0.09	0.00	0.05	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.03	0.09	0.01	0.69	0.62	1.11	0.75
O2'	0.01	0.14	0.00	0.02	0.08	0.04	0.06	0.04	0.09	0.05	0.12	0.14	0.08	0.04	0.03	0.00	0.04	0.04	0.07	0.21	0.21	0.07
O3'	0.01	0.17	0.02	0.01	0.11	0.02	0.16	0.04	0.18	0.18	0.17	0.14	0.21	0.20	0.09	0.04	0.00	0.02	0.35	0.47	0.58	0.32
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.04	0.03	0.04	0.04	0.03	0.01	0.04	0.02	0.00	0.33	0.29	0.47	0.34
O5'	0.37	0.63	0.20	0.17	0.71	0.01	0.90	0.01	0.90	0.96	0.78	0.55	1.00	1.03	0.69	0.07	0.35	0.33	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.33	0.68	0.31	0.37	0.69	0.13	0.89	0.17	0.95	0.85	0.84	0.58	1.08	1.00	0.62	0.21	0.47	0.29	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.57	1.19	0.27	0.22	1.23	0.19	1.62	0.27	1.70	1.54	1.48	1.00	1.95	1.84	1.11	0.21	0.58	0.47	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.40	0.77	0.20	0.14	0.81	0.04	1.06	0.01	1.10	1.05	0.96	0.66	1.24	1.21	0.75	0.07	0.32	0.34	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.16	0.12	0.12	0.14	0.17	0.13	0.18	0.13	0.12	0.16	0.15	0.20	0.11	0.17	0.19	0.15	0.48	0.30	0.22
C2	0.20	0.17	0.16	0.15	0.17	0.20	0.17	0.21	0.18	0.18	0.17	0.18	0.17	0.15	0.18	0.25	0.22	0.38	0.22	0.16
C2'	0.19	0.12	0.12	0.15	0.13	0.26	0.17	0.30	0.19	0.16	0.11	0.13	0.12	0.13	0.19	0.28	0.24	0.58	0.33	0.33
C3'	0.21	0.13	0.11	0.16	0.14	0.31	0.20	0.38	0.22	0.18	0.12	0.14	0.13	0.11	0.20	0.32	0.31	0.67	0.40	0.42
C4	0.15	0.16	0.12	0.12	0.15	0.16	0.13	0.17	0.13	0.13	0.17	0.17	0.18	0.11	0.17	0.21	0.12	0.45	0.20	0.18
C4'	0.16	0.13	0.12	0.14	0.13	0.25	0.14	0.30	0.16	0.12	0.14	0.14	0.18	0.11	0.19	0.25	0.26	0.57	0.37	0.30
C5	0.17	0.17	0.13	0.12	0.17	0.17	0.15	0.19	0.15	0.15	0.19	0.19	0.19	0.11	0.18	0.23	0.13	0.46	0.20	0.19
C5'	0.17	0.16	0.13	0.15	0.15	0.26	0.15	0.33	0.16	0.14	0.18	0.17	0.21	0.12	0.21	0.26	0.28	0.61	0.40	0.33
C6	0.19	0.18	0.15	0.14	0.20	0.19	0.18	0.20	0.18	0.18	0.21	0.22	0.19	0.13	0.19	0.25	0.18	0.43	0.20	0.18
C8	0.15	0.16	0.11	0.12	0.15	0.17	0.13	0.19	0.12	0.13	0.18	0.17	0.20	0.10	0.18	0.21	0.13	0.51	0.28	0.24
N1	0.21	0.19	0.16	0.15	0.20	0.20	0.20	0.22	0.20	0.19	0.20	0.22	0.18	0.14	0.18	0.27	0.23	0.39	0.23	0.17
N3	0.16	0.15	0.13	0.13	0.15	0.17	0.14	0.18	0.14	0.14	0.16	0.16	0.17	0.13	0.17	0.21	0.16	0.40	0.18	0.16
N6	0.20	0.20	0.15	0.15	0.23	0.20	0.21	0.22	0.19	0.19	0.23	0.25	0.20	0.13	0.20	0.27	0.19	0.44	0.21	0.19
N7	0.16	0.17	0.12	0.12	0.17	0.17	0.14	0.19	0.13	0.14	0.19	0.19	0.19	0.10	0.19	0.22	0.11	0.50	0.24	0.23
N9	0.14	0.16	0.11	0.11	0.15	0.16	0.12	0.18	0.12	0.12	0.17	0.16	0.20	0.10	0.17	0.20	0.12	0.48	0.26	0.21
O2'	0.20	0.14	0.13	0.18	0.17	0.26	0.20	0.29	0.22	0.18	0.14	0.17	0.14	0.12	0.25	0.28	0.25	0.54	0.34	0.30
O3'	0.26	0.18	0.15	0.24	0.23	0.39	0.29	0.50	0.31	0.25	0.18	0.22	0.16	0.11	0.28	0.40	0.43	0.78	0.53	0.54
O4'	0.15	0.21	0.15	0.15	0.20	0.18	0.17	0.21	0.15	0.15	0.23	0.22	0.26	0.14	0.19	0.19	0.20	0.50	0.37	0.23
O5'	0.21	0.34	0.16	0.16	0.25	0.30	0.16	0.46	0.16	0.21	0.35	0.27	0.47	0.22	0.26	0.26	0.37	0.84	0.47	0.51
OP1	0.37	0.40	0.24	0.27	0.34	0.46	0.31	0.60	0.33	0.33	0.41	0.36	0.51	0.29	0.34	0.49	0.44	0.82	0.49	0.54
OP2	0.33	0.63	0.30	0.27	0.51	0.38	0.33	0.66	0.28	0.39	0.67	0.56	0.81	0.37	0.41	0.29	0.56	1.20	0.70	0.79
P	0.22	0.44	0.20	0.16	0.34	0.29	0.19	0.48	0.16	0.26	0.47	0.38	0.58	0.25	0.29	0.25	0.39	0.90	0.50	0.55

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.21	0.16	0.20	0.09
C2	0.02	0.00	0.07	0.08	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.09	0.03	0.45	0.25	0.56	0.32
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.06	0.02	0.06	0.06	0.12	0.00	0.02	0.01	0.27	0.32	0.25	0.15
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.08	0.00	0.10	0.02	0.10	0.05	0.08	0.09	0.12	0.01	0.01	0.01	0.35	0.48	0.27	0.26
C4	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.10	0.02	0.66	0.51	0.90	0.59
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.06	0.03	0.04	0.05	0.04	0.04	0.02	0.00	0.01	0.25	0.23	0.09
C5	0.01	0.01	0.06	0.10	0.00	0.06	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.12	0.03	0.70	0.57	0.91	0.63
C5'	0.02	0.06	0.01	0.02	0.10	0.01	0.11	0.00	0.10	0.06	0.08	0.11	0.05	0.04	0.04	0.01	0.01	0.31	0.37	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.10	0.01	0.06	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.11	0.04	0.61	0.42	0.68	0.49
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.44	0.24	0.49	0.30
N3	0.02	0.00	0.06	0.08	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.10	0.02	0.56	0.37	0.75	0.46
N4	0.01	0.01	0.06	0.09	0.00	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.12	0.03	0.71	0.60	1.03	0.68
O2	0.03	0.00	0.12	0.12	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.11	0.15	0.05	0.34	0.19	0.44	0.21
O2'	0.02	0.06	0.00	0.01	0.05	0.04	0.05	0.04	0.04	0.02	0.06	0.06	0.11	0.00	0.04	0.04	0.06	0.34	0.17	0.11
O3'	0.01	0.09	0.02	0.01	0.10	0.02	0.12	0.04	0.11	0.05	0.10	0.12	0.15	0.04	0.00	0.01	0.25	0.59	0.32	0.25
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.02	0.03	0.05	0.04	0.01	0.00	0.09	0.19	0.17	0.16
O5'	0.21	0.45	0.27	0.35	0.66	0.01	0.70	0.01	0.61	0.44	0.56	0.71	0.34	0.06	0.25	0.09	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.16	0.25	0.32	0.48	0.51	0.25	0.57	0.31	0.42	0.24	0.37	0.60	0.19	0.34	0.59	0.19	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.20	0.56	0.25	0.27	0.90	0.23	0.91	0.37	0.68	0.49	0.75	1.03	0.44	0.17	0.32	0.17	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.32	0.15	0.26	0.59	0.09	0.63	0.01	0.49	0.30	0.46	0.68	0.21	0.11	0.25	0.16	0.00	0.01	0.01	0.00