Doublet Group distance statistics: 53492

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 2, 5, 5, 20, 12, 5, 2, 1, 5, 7, 5, 3, 1, 0, 1, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.020, 0.028, 0.037, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.028 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.031, 0.040, 0.048, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.040 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.007, 0.017, 0.026, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.017 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.015, 0.024, 0.034, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.024 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.017, 0.028, 0.039, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.028 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.009, 0.020, 0.031, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.020 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.023, 0.038, 0.053, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.038 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.031, 0.051, 0.070, 0.107 max_d=0.107 avg_d=0.051 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.012, 0.033, 0.055, 0.132 max_d=0.132 avg_d=0.033 std_dev=0.021
C8	A	0, 0.013, 0.036, 0.058, 0.146 max_d=0.146 avg_d=0.036 std_dev=0.023
N6	A	0, 0.079, 0.109, 0.140, 0.253 max_d=0.253 avg_d=0.109 std_dev=0.030
C2'	A	0, 0.083, 0.219, 0.355, 0.592 max_d=0.592 avg_d=0.219 std_dev=0.136
O4'	A	0, 0.066, 0.203, 0.340, 0.532 max_d=0.532 avg_d=0.203 std_dev=0.137
O2'	A	0, 0.067, 0.231, 0.395, 0.797 max_d=0.797 avg_d=0.231 std_dev=0.164
C2'	B	0, 0.333, 0.506, 0.680, 1.054 max_d=1.054 avg_d=0.506 std_dev=0.174
O2'	B	0, 0.406, 0.609, 0.811, 1.073 max_d=1.073 avg_d=0.609 std_dev=0.202
C4'	A	0, 0.141, 0.345, 0.550, 0.833 max_d=0.833 avg_d=0.345 std_dev=0.204
C3'	A	0, 0.179, 0.384, 0.589, 0.911 max_d=0.911 avg_d=0.384 std_dev=0.205
C1'	B	0, 0.237, 0.476, 0.716, 1.302 max_d=1.302 avg_d=0.476 std_dev=0.239
C3'	B	0, 0.407, 0.661, 0.916, 1.271 max_d=1.271 avg_d=0.661 std_dev=0.254
N1	B	0, 0.279, 0.539, 0.798, 1.402 max_d=1.402 avg_d=0.539 std_dev=0.260
O3'	B	0, 0.543, 0.833, 1.122, 1.526 max_d=1.526 avg_d=0.833 std_dev=0.290
O3'	A	0, 0.211, 0.507, 0.803, 1.326 max_d=1.326 avg_d=0.507 std_dev=0.296
C6	B	0, 0.385, 0.702, 1.019, 1.571 max_d=1.571 avg_d=0.702 std_dev=0.317
O4'	B	0, 0.319, 0.665, 1.011, 1.717 max_d=1.717 avg_d=0.665 std_dev=0.346
C5'	A	0, 0.197, 0.567, 0.937, 1.364 max_d=1.364 avg_d=0.567 std_dev=0.370
O5'	A	0, 0.322, 0.723, 1.123, 1.738 max_d=1.738 avg_d=0.723 std_dev=0.400
C2	B	0, 0.286, 0.691, 1.096, 1.693 max_d=1.693 avg_d=0.691 std_dev=0.405
C5	B	0, 0.421, 0.826, 1.231, 2.022 max_d=2.022 avg_d=0.826 std_dev=0.405
C4'	B	0, 0.323, 0.730, 1.136, 1.920 max_d=1.920 avg_d=0.730 std_dev=0.407
C4	B	0, 0.401, 0.917, 1.433, 2.220 max_d=2.220 avg_d=0.917 std_dev=0.516
O2	B	0, 0.234, 0.756, 1.277, 2.405 max_d=2.405 avg_d=0.756 std_dev=0.522
C5'	B	0, 0.576, 1.141, 1.706, 3.218 max_d=3.218 avg_d=1.141 std_dev=0.565
N3	B	0, 0.296, 0.872, 1.448, 2.351 max_d=2.351 avg_d=0.872 std_dev=0.576
N4	B	0, 0.488, 1.184, 1.880, 3.020 max_d=3.020 avg_d=1.184 std_dev=0.696
O5'	B	0, 0.409, 1.133, 1.857, 3.755 max_d=3.755 avg_d=1.133 std_dev=0.724
P	A	0, 0.629, 1.531, 2.433, 3.462 max_d=3.462 avg_d=1.531 std_dev=0.902
P	B	0, 0.637, 1.608, 2.578, 4.712 max_d=4.712 avg_d=1.608 std_dev=0.970
OP2	B	0, 0.754, 1.767, 2.781, 4.959 max_d=4.959 avg_d=1.767 std_dev=1.013
OP1	A	0, 0.962, 2.034, 3.106, 4.134 max_d=4.134 avg_d=2.034 std_dev=1.072
OP1	B	0, 0.730, 1.838, 2.946, 5.503 max_d=5.503 avg_d=1.838 std_dev=1.108
OP2	A	0, 0.716, 1.974, 3.232, 5.634 max_d=5.634 avg_d=1.974 std_dev=1.258

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.03	0.03	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.14	0.22	0.40	0.23
C2	0.03	0.00	0.15	0.16	0.01	0.07	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.20	0.05	0.32	0.31	0.82	0.42
C2'	0.00	0.15	0.00	0.01	0.08	0.01	0.05	0.02	0.08	0.07	0.13	0.15	0.07	0.05	0.02	0.01	0.02	0.01	0.22	0.28	0.34	0.11
C3'	0.01	0.16	0.01	0.00	0.08	0.01	0.06	0.02	0.09	0.10	0.14	0.15	0.09	0.07	0.03	0.02	0.01	0.01	0.29	0.38	0.36	0.20
C4	0.02	0.01	0.08	0.08	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.08	0.09	0.02	0.32	0.32	0.79	0.44
C4'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.05	0.06	0.06	0.06	0.06	0.06	0.03	0.05	0.02	0.01	0.02	0.30	0.19	0.14
C5	0.01	0.01	0.05	0.06	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.06	0.07	0.02	0.39	0.49	0.98	0.59
C5'	0.03	0.10	0.02	0.02	0.08	0.01	0.10	0.00	0.12	0.10	0.11	0.09	0.13	0.12	0.07	0.05	0.04	0.02	0.01	0.15	0.25	0.02
C6	0.02	0.01	0.08	0.09	0.01	0.05	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.09	0.11	0.03	0.40	0.52	1.05	0.61
C8	0.02	0.01	0.07	0.10	0.01	0.06	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.04	0.11	0.04	0.37	0.49	0.88	0.57
N1	0.03	0.00	0.13	0.14	0.01	0.06	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.13	0.17	0.04	0.37	0.42	0.96	0.53
N3	0.03	0.00	0.15	0.15	0.00	0.06	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.18	0.04	0.28	0.26	0.70	0.35
N6	0.03	0.01	0.07	0.09	0.02	0.06	0.02	0.13	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.03	0.08	0.11	0.04	0.43	0.65	1.16	0.71
N7	0.01	0.01	0.05	0.07	0.01	0.06	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03	0.09	0.04	0.42	0.61	1.06	0.68
N9	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.01	0.07	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.28	0.28	0.68	0.40
O2'	0.02	0.15	0.01	0.02	0.08	0.05	0.06	0.05	0.09	0.04	0.13	0.15	0.08	0.03	0.02	0.00	0.04	0.04	0.10	0.44	0.18	0.15
O3'	0.02	0.20	0.02	0.01	0.09	0.02	0.07	0.04	0.11	0.11	0.17	0.18	0.11	0.09	0.03	0.04	0.00	0.02	0.25	0.61	0.40	0.26
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.04	0.04	0.04	0.04	0.04	0.01	0.04	0.02	0.00	0.10	0.30	0.37	0.30
O5'	0.14	0.32	0.22	0.29	0.32	0.02	0.39	0.01	0.40	0.37	0.37	0.28	0.43	0.42	0.28	0.10	0.25	0.10	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.22	0.31	0.28	0.38	0.32	0.30	0.49	0.15	0.52	0.49	0.42	0.26	0.65	0.61	0.28	0.44	0.61	0.30	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.40	0.82	0.34	0.36	0.79	0.19	0.98	0.25	1.05	0.88	0.96	0.70	1.16	1.06	0.68	0.18	0.40	0.37	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.23	0.42	0.11	0.20	0.44	0.14	0.59	0.02	0.61	0.57	0.53	0.35	0.71	0.68	0.40	0.15	0.26	0.30	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.25	0.19	0.20	0.20	0.19	0.27	0.20	0.26	0.22	0.21	0.20	0.20	0.20	0.22	0.23	0.32	0.20	0.24	0.19	0.19
C2	0.26	0.14	0.14	0.16	0.19	0.24	0.15	0.25	0.15	0.15	0.20	0.23	0.16	0.15	0.23	0.37	0.18	0.18	0.19	0.20
C2'	0.16	0.16	0.09	0.16	0.13	0.27	0.14	0.32	0.16	0.13	0.17	0.13	0.24	0.10	0.21	0.30	0.25	0.31	0.22	0.27
C3'	0.17	0.21	0.09	0.17	0.16	0.29	0.16	0.37	0.18	0.15	0.21	0.17	0.30	0.10	0.24	0.31	0.30	0.39	0.28	0.35
C4	0.25	0.15	0.12	0.13	0.17	0.26	0.14	0.26	0.16	0.16	0.18	0.20	0.17	0.14	0.19	0.37	0.18	0.18	0.16	0.18
C4'	0.18	0.16	0.18	0.23	0.16	0.27	0.18	0.30	0.20	0.16	0.17	0.17	0.20	0.16	0.30	0.28	0.24	0.31	0.23	0.26
C5	0.25	0.15	0.11	0.13	0.18	0.28	0.14	0.29	0.15	0.15	0.20	0.24	0.17	0.14	0.20	0.39	0.20	0.19	0.16	0.20
C5'	0.17	0.16	0.18	0.23	0.16	0.27	0.17	0.32	0.18	0.15	0.18	0.18	0.22	0.16	0.32	0.28	0.25	0.34	0.24	0.28
C6	0.26	0.15	0.12	0.14	0.22	0.27	0.16	0.29	0.15	0.15	0.23	0.29	0.16	0.13	0.21	0.39	0.20	0.19	0.19	0.21
C8	0.25	0.16	0.15	0.17	0.17	0.29	0.15	0.30	0.18	0.17	0.19	0.20	0.18	0.17	0.22	0.37	0.21	0.23	0.17	0.21
N1	0.26	0.16	0.14	0.16	0.23	0.26	0.18	0.27	0.16	0.16	0.24	0.30	0.17	0.15	0.23	0.38	0.20	0.19	0.21	0.22
N3	0.26	0.16	0.11	0.13	0.16	0.24	0.14	0.24	0.16	0.17	0.18	0.19	0.18	0.14	0.20	0.35	0.17	0.17	0.16	0.17
N6	0.26	0.17	0.12	0.15	0.26	0.28	0.19	0.30	0.16	0.15	0.27	0.34	0.17	0.14	0.21	0.40	0.21	0.20	0.20	0.23
N7	0.25	0.15	0.12	0.15	0.18	0.29	0.14	0.31	0.16	0.16	0.20	0.23	0.17	0.15	0.21	0.39	0.21	0.21	0.16	0.21
N9	0.25	0.17	0.15	0.16	0.17	0.27	0.16	0.27	0.19	0.18	0.18	0.19	0.18	0.18	0.21	0.35	0.20	0.21	0.16	0.19
O2'	0.18	0.14	0.11	0.18	0.13	0.27	0.18	0.29	0.20	0.16	0.13	0.13	0.19	0.10	0.24	0.29	0.24	0.30	0.23	0.26
O3'	0.24	0.30	0.13	0.20	0.24	0.33	0.25	0.44	0.26	0.24	0.30	0.25	0.40	0.16	0.28	0.34	0.39	0.52	0.40	0.46
O4'	0.26	0.24	0.25	0.25	0.26	0.27	0.26	0.26	0.26	0.25	0.26	0.27	0.25	0.26	0.28	0.31	0.21	0.26	0.22	0.20
O5'	0.27	0.33	0.22	0.21	0.29	0.28	0.24	0.32	0.25	0.27	0.35	0.31	0.40	0.23	0.26	0.33	0.26	0.34	0.24	0.29
OP1	0.30	0.28	0.31	0.45	0.28	0.54	0.31	0.68	0.34	0.27	0.31	0.30	0.36	0.29	0.55	0.47	0.62	0.83	0.64	0.72
OP2	0.52	0.71	0.44	0.34	0.65	0.36	0.52	0.38	0.48	0.56	0.75	0.69	0.80	0.46	0.40	0.48	0.33	0.40	0.31	0.36
P	0.25	0.35	0.27	0.30	0.30	0.30	0.22	0.38	0.22	0.25	0.38	0.33	0.44	0.28	0.42	0.30	0.32	0.43	0.30	0.36

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.05	0.02	0.02	0.00	0.07	0.09	0.13	0.10
C2	0.02	0.00	0.08	0.10	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.12	0.03	0.14	0.15	0.24	0.19
C2'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.05	0.01	0.06	0.02	0.06	0.03	0.07	0.06	0.14	0.00	0.02	0.01	0.06	0.16	0.14	0.08
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.11	0.00	0.12	0.02	0.11	0.07	0.11	0.12	0.13	0.02	0.01	0.01	0.07	0.20	0.15	0.11
C4	0.02	0.01	0.05	0.11	0.00	0.08	0.00	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.05	0.13	0.03	0.22	0.28	0.37	0.30
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.08	0.00	0.10	0.01	0.09	0.04	0.05	0.08	0.06	0.05	0.02	0.00	0.01	0.09	0.05	0.03
C5	0.02	0.01	0.06	0.12	0.00	0.10	0.00	0.17	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.13	0.03	0.24	0.30	0.37	0.31
C5'	0.02	0.07	0.02	0.02	0.14	0.01	0.17	0.00	0.14	0.08	0.10	0.16	0.06	0.05	0.03	0.01	0.01	0.06	0.02	0.02
C6	0.01	0.01	0.06	0.11	0.01	0.09	0.00	0.14	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.12	0.04	0.20	0.23	0.28	0.24
N1	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.07	0.01	0.14	0.15	0.21	0.17
N3	0.02	0.01	0.07	0.11	0.00	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.08	0.13	0.03	0.18	0.21	0.31	0.24
N4	0.02	0.01	0.06	0.12	0.01	0.08	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.15	0.03	0.24	0.33	0.42	0.33
O2	0.05	0.01	0.14	0.13	0.02	0.06	0.01	0.06	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.14	0.16	0.06	0.11	0.12	0.20	0.15
O2'	0.02	0.08	0.00	0.02	0.05	0.05	0.04	0.05	0.04	0.03	0.08	0.06	0.14	0.00	0.05	0.04	0.04	0.15	0.11	0.06
O3'	0.02	0.12	0.02	0.01	0.13	0.02	0.13	0.03	0.12	0.07	0.13	0.15	0.16	0.05	0.00	0.02	0.11	0.29	0.22	0.19
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.03	0.03	0.06	0.04	0.02	0.00	0.08	0.09	0.13	0.12
O5'	0.07	0.14	0.06	0.07	0.22	0.01	0.24	0.01	0.20	0.14	0.18	0.24	0.11	0.04	0.11	0.08	0.00	0.03	0.02	0.01
OP1	0.09	0.15	0.16	0.20	0.28	0.09	0.30	0.06	0.23	0.15	0.21	0.33	0.12	0.15	0.29	0.09	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.13	0.24	0.14	0.15	0.37	0.05	0.37	0.02	0.28	0.21	0.31	0.42	0.20	0.11	0.22	0.13	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.19	0.08	0.11	0.30	0.03	0.31	0.02	0.24	0.17	0.24	0.33	0.15	0.06	0.19	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00