Doublet Group distance statistics: 53493

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 4, 6, 4, 2, 4, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.008, 0.016, 0.025, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.016 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.012, 0.022, 0.031, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.022 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.019, 0.031, 0.044, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.031 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.010, 0.023, 0.036, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.023 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.015, 0.031, 0.048, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.031 std_dev=0.016
C5	A	0, 0.019, 0.039, 0.059, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.039 std_dev=0.020
C4	A	0, 0.017, 0.042, 0.066, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.042 std_dev=0.025
N9	A	0, 0.022, 0.053, 0.085, 0.123 max_d=0.123 avg_d=0.053 std_dev=0.031
N6	A	0, 0.045, 0.084, 0.123, 0.177 max_d=0.177 avg_d=0.084 std_dev=0.039
N7	A	0, 0.041, 0.089, 0.138, 0.206 max_d=0.206 avg_d=0.089 std_dev=0.048
C8	A	0, 0.045, 0.102, 0.159, 0.234 max_d=0.234 avg_d=0.102 std_dev=0.057
C2'	A	0, 0.075, 0.154, 0.233, 0.410 max_d=0.410 avg_d=0.154 std_dev=0.079
O4'	A	0, -0.012, 0.072, 0.157, 0.367 max_d=0.367 avg_d=0.072 std_dev=0.084
O2'	A	0, 0.113, 0.223, 0.332, 0.463 max_d=0.463 avg_d=0.223 std_dev=0.110
C2'	B	0, 0.174, 0.320, 0.465, 0.661 max_d=0.661 avg_d=0.320 std_dev=0.146
C3'	A	0, 0.098, 0.255, 0.412, 0.692 max_d=0.692 avg_d=0.255 std_dev=0.157
C1'	B	0, 0.192, 0.365, 0.538, 0.699 max_d=0.699 avg_d=0.365 std_dev=0.173
O2'	B	0, 0.141, 0.323, 0.504, 0.822 max_d=0.822 avg_d=0.323 std_dev=0.181
C4'	A	0, 0.076, 0.258, 0.440, 0.789 max_d=0.789 avg_d=0.258 std_dev=0.182
O2	B	0, 0.119, 0.306, 0.494, 0.733 max_d=0.733 avg_d=0.306 std_dev=0.188
O3'	A	0, 0.182, 0.382, 0.583, 0.939 max_d=0.939 avg_d=0.382 std_dev=0.200
C3'	B	0, 0.155, 0.371, 0.587, 0.952 max_d=0.952 avg_d=0.371 std_dev=0.216
N1	B	0, 0.176, 0.395, 0.613, 1.025 max_d=1.025 avg_d=0.395 std_dev=0.219
C2	B	0, 0.135, 0.359, 0.582, 1.022 max_d=1.022 avg_d=0.359 std_dev=0.224
O4'	B	0, 0.166, 0.422, 0.677, 1.003 max_d=1.003 avg_d=0.422 std_dev=0.256
C4'	B	0, 0.135, 0.396, 0.657, 1.144 max_d=1.144 avg_d=0.396 std_dev=0.261
C5'	A	0, 0.121, 0.395, 0.669, 1.299 max_d=1.299 avg_d=0.395 std_dev=0.274
C6	B	0, 0.204, 0.503, 0.802, 1.514 max_d=1.514 avg_d=0.503 std_dev=0.299
O3'	B	0, 0.087, 0.391, 0.696, 1.275 max_d=1.275 avg_d=0.391 std_dev=0.304
N3	B	0, 0.118, 0.441, 0.764, 1.573 max_d=1.573 avg_d=0.441 std_dev=0.323
O5'	B	0, 0.196, 0.529, 0.862, 1.541 max_d=1.541 avg_d=0.529 std_dev=0.333
C5'	B	0, 0.127, 0.481, 0.835, 1.505 max_d=1.505 avg_d=0.481 std_dev=0.354
P	B	0, 0.191, 0.601, 1.012, 2.113 max_d=2.113 avg_d=0.601 std_dev=0.410
C5	B	0, 0.177, 0.591, 1.005, 2.046 max_d=2.046 avg_d=0.591 std_dev=0.414
C4	B	0, 0.130, 0.560, 0.990, 2.086 max_d=2.086 avg_d=0.560 std_dev=0.430
OP2	B	0, 0.228, 0.677, 1.126, 2.136 max_d=2.136 avg_d=0.677 std_dev=0.449
OP1	A	0, 0.150, 0.652, 1.153, 2.382 max_d=2.382 avg_d=0.652 std_dev=0.502
OP1	B	0, 0.159, 0.687, 1.214, 2.696 max_d=2.696 avg_d=0.687 std_dev=0.528
N4	B	0, 0.123, 0.685, 1.247, 2.672 max_d=2.672 avg_d=0.685 std_dev=0.562
O5'	A	0, 0.049, 0.652, 1.255, 2.300 max_d=2.300 avg_d=0.652 std_dev=0.603
P	A	0, -0.020, 0.723, 1.467, 2.866 max_d=2.866 avg_d=0.723 std_dev=0.743
OP2	A	0, -0.233, 1.101, 2.435, 5.080 max_d=5.080 avg_d=1.101 std_dev=1.334

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.33	0.23	0.42	0.26
C2	0.02	0.00	0.08	0.10	0.01	0.06	0.01	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.12	0.03	0.40	0.17	0.70	0.32
C2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.05	0.02	0.04	0.02	0.06	0.03	0.08	0.08	0.06	0.03	0.02	0.00	0.06	0.03	0.14	0.27	0.19	0.09
C3'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.07	0.01	0.08	0.01	0.10	0.07	0.11	0.09	0.12	0.08	0.05	0.04	0.01	0.02	0.13	0.25	0.13	0.10
C4	0.01	0.01	0.05	0.07	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.07	0.08	0.04	0.47	0.19	0.75	0.37
C4'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.06	0.00	0.08	0.01	0.09	0.09	0.07	0.05	0.10	0.09	0.05	0.06	0.03	0.01	0.01	0.23	0.07	0.06
C5	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.08	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.08	0.05	0.56	0.20	0.96	0.46
C5'	0.03	0.11	0.02	0.01	0.11	0.01	0.15	0.00	0.16	0.15	0.14	0.09	0.19	0.17	0.09	0.06	0.04	0.02	0.01	0.14	0.15	0.06
C6	0.02	0.00	0.06	0.10	0.01	0.09	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.11	0.05	0.54	0.20	0.98	0.45
C8	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01	0.09	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.08	0.06	0.63	0.22	0.96	0.51
N1	0.02	0.01	0.08	0.11	0.01	0.07	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.12	0.04	0.47	0.18	0.85	0.38
N3	0.02	0.01	0.08	0.09	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.10	0.03	0.38	0.19	0.62	0.30
N6	0.02	0.01	0.06	0.12	0.01	0.10	0.01	0.19	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.07	0.12	0.06	0.58	0.23	1.10	0.49
N7	0.01	0.01	0.03	0.08	0.01	0.09	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.08	0.05	0.64	0.23	1.11	0.54
N9	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.06	0.04	0.48	0.20	0.71	0.38
O2'	0.01	0.12	0.00	0.04	0.07	0.06	0.05	0.06	0.08	0.02	0.11	0.11	0.07	0.03	0.02	0.00	0.13	0.05	0.04	0.35	0.09	0.09
O3'	0.05	0.12	0.06	0.01	0.08	0.03	0.08	0.04	0.11	0.08	0.12	0.10	0.12	0.08	0.06	0.13	0.00	0.05	0.33	0.27	0.44	0.30
O4'	0.01	0.03	0.03	0.02	0.04	0.01	0.05	0.02	0.05	0.06	0.04	0.03	0.06	0.05	0.04	0.05	0.05	0.00	0.33	0.23	0.37	0.29
O5'	0.33	0.40	0.14	0.13	0.47	0.01	0.56	0.01	0.54	0.63	0.47	0.38	0.58	0.64	0.48	0.04	0.33	0.33	0.00	0.03	0.02	0.01
OP1	0.23	0.17	0.27	0.25	0.19	0.23	0.20	0.14	0.20	0.22	0.18	0.19	0.23	0.23	0.20	0.35	0.27	0.23	0.03	0.00	0.04	0.01
OP2	0.42	0.70	0.19	0.13	0.75	0.07	0.96	0.15	0.98	0.96	0.85	0.62	1.10	1.11	0.71	0.09	0.44	0.37	0.02	0.04	0.00	0.01
P	0.26	0.32	0.09	0.10	0.37	0.06	0.46	0.06	0.45	0.51	0.38	0.30	0.49	0.54	0.38	0.09	0.30	0.29	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.10	0.13	0.19	0.10	0.15	0.10	0.17	0.11	0.11	0.10	0.10	0.13	0.12	0.29	0.17	0.15	0.20	0.27	0.17
C2	0.13	0.14	0.14	0.17	0.19	0.14	0.18	0.15	0.16	0.13	0.18	0.21	0.13	0.14	0.23	0.14	0.14	0.19	0.33	0.17
C2'	0.13	0.12	0.13	0.19	0.11	0.17	0.13	0.20	0.13	0.12	0.12	0.11	0.14	0.16	0.31	0.19	0.18	0.23	0.27	0.19
C3'	0.12	0.12	0.13	0.20	0.14	0.17	0.15	0.21	0.14	0.13	0.13	0.15	0.12	0.16	0.33	0.19	0.19	0.25	0.28	0.21
C4	0.11	0.12	0.13	0.17	0.15	0.13	0.13	0.14	0.12	0.10	0.14	0.17	0.12	0.12	0.25	0.13	0.11	0.15	0.30	0.14
C4'	0.12	0.10	0.15	0.23	0.09	0.17	0.11	0.21	0.12	0.11	0.09	0.09	0.11	0.15	0.36	0.17	0.20	0.26	0.30	0.22
C5	0.12	0.15	0.13	0.17	0.19	0.13	0.17	0.14	0.14	0.13	0.18	0.22	0.14	0.12	0.24	0.14	0.12	0.16	0.31	0.15
C5'	0.12	0.10	0.13	0.22	0.10	0.17	0.11	0.21	0.12	0.11	0.10	0.11	0.11	0.13	0.35	0.18	0.20	0.27	0.29	0.22
C6	0.14	0.18	0.14	0.17	0.23	0.14	0.21	0.15	0.18	0.16	0.22	0.27	0.15	0.13	0.23	0.15	0.13	0.18	0.34	0.17
C8	0.11	0.12	0.13	0.17	0.14	0.14	0.13	0.15	0.11	0.11	0.15	0.17	0.13	0.12	0.26	0.15	0.12	0.17	0.28	0.15
N1	0.15	0.18	0.15	0.17	0.24	0.15	0.22	0.16	0.19	0.17	0.22	0.27	0.14	0.15	0.22	0.16	0.15	0.20	0.35	0.19
N3	0.10	0.11	0.13	0.17	0.14	0.13	0.13	0.14	0.11	0.09	0.14	0.16	0.13	0.12	0.25	0.12	0.11	0.16	0.30	0.14
N6	0.16	0.20	0.15	0.17	0.27	0.15	0.24	0.16	0.21	0.18	0.25	0.31	0.17	0.14	0.23	0.16	0.15	0.19	0.36	0.18
N7	0.12	0.14	0.13	0.17	0.18	0.13	0.16	0.15	0.14	0.12	0.18	0.21	0.14	0.12	0.24	0.14	0.12	0.15	0.30	0.14
N9	0.11	0.11	0.13	0.18	0.12	0.14	0.11	0.15	0.11	0.10	0.12	0.14	0.12	0.12	0.27	0.14	0.13	0.17	0.28	0.15
O2'	0.17	0.19	0.18	0.23	0.18	0.18	0.19	0.20	0.18	0.18	0.19	0.18	0.21	0.19	0.35	0.21	0.21	0.25	0.29	0.21
O3'	0.12	0.15	0.17	0.23	0.19	0.20	0.18	0.24	0.16	0.14	0.18	0.22	0.13	0.23	0.38	0.18	0.23	0.31	0.30	0.24
O4'	0.13	0.10	0.14	0.20	0.09	0.16	0.10	0.19	0.11	0.11	0.10	0.10	0.12	0.13	0.31	0.18	0.16	0.22	0.27	0.18
O5'	0.16	0.23	0.31	0.32	0.20	0.18	0.16	0.19	0.15	0.17	0.24	0.21	0.27	0.32	0.46	0.17	0.19	0.23	0.30	0.19
OP1	0.22	0.20	0.34	0.40	0.20	0.35	0.19	0.39	0.21	0.21	0.20	0.19	0.21	0.35	0.53	0.23	0.39	0.44	0.49	0.41
OP2	0.25	0.41	0.42	0.37	0.37	0.19	0.29	0.19	0.25	0.30	0.44	0.39	0.49	0.44	0.50	0.22	0.21	0.20	0.32	0.19
P	0.13	0.19	0.27	0.30	0.16	0.17	0.14	0.19	0.12	0.14	0.19	0.17	0.23	0.29	0.47	0.16	0.19	0.23	0.29	0.19

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.01	0.00	0.13	0.09	0.28	0.09
C2	0.01	0.00	0.05	0.04	0.02	0.03	0.01	0.07	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.06	0.07	0.03	0.22	0.17	0.30	0.14
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.06	0.02	0.05	0.01	0.06	0.03	0.05	0.06	0.08	0.00	0.03	0.03	0.13	0.14	0.19	0.05
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.08	0.01	0.09	0.03	0.09	0.04	0.05	0.09	0.06	0.03	0.01	0.02	0.15	0.19	0.12	0.08
C4	0.02	0.02	0.06	0.08	0.00	0.04	0.00	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.04	0.11	0.03	0.28	0.23	0.31	0.21
C4'	0.02	0.03	0.02	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.03	0.03	0.05	0.05	0.09	0.02	0.00	0.05	0.07	0.20	0.04
C5	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.06	0.00	0.13	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.11	0.03	0.29	0.23	0.31	0.21
C5'	0.03	0.07	0.01	0.03	0.11	0.01	0.13	0.00	0.12	0.08	0.09	0.13	0.07	0.08	0.07	0.01	0.02	0.04	0.14	0.01
C6	0.01	0.00	0.06	0.09	0.01	0.06	0.01	0.12	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.10	0.03	0.27	0.19	0.30	0.17
N1	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.03	0.01	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.05	0.02	0.21	0.15	0.29	0.13
N3	0.01	0.01	0.05	0.05	0.00	0.03	0.02	0.09	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.05	0.09	0.03	0.26	0.21	0.31	0.18
N4	0.02	0.03	0.06	0.09	0.00	0.05	0.01	0.13	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.05	0.13	0.03	0.30	0.26	0.32	0.23
O2	0.04	0.00	0.08	0.06	0.03	0.05	0.01	0.07	0.01	0.02	0.03	0.05	0.00	0.12	0.09	0.05	0.20	0.16	0.30	0.13
O2'	0.02	0.06	0.00	0.03	0.04	0.09	0.04	0.08	0.04	0.02	0.05	0.05	0.12	0.00	0.08	0.06	0.07	0.10	0.19	0.06
O3'	0.01	0.07	0.03	0.01	0.11	0.02	0.11	0.07	0.10	0.05	0.09	0.13	0.09	0.08	0.00	0.01	0.14	0.29	0.12	0.14
O4'	0.00	0.03	0.03	0.02	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.03	0.05	0.06	0.01	0.00	0.11	0.08	0.31	0.13
O5'	0.13	0.22	0.13	0.15	0.28	0.05	0.29	0.02	0.27	0.21	0.26	0.30	0.20	0.07	0.14	0.11	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.09	0.17	0.14	0.19	0.23	0.07	0.23	0.04	0.19	0.15	0.21	0.26	0.16	0.10	0.29	0.08	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.28	0.30	0.19	0.12	0.31	0.20	0.31	0.14	0.30	0.29	0.31	0.32	0.30	0.19	0.12	0.31	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.09	0.14	0.05	0.08	0.21	0.04	0.21	0.01	0.17	0.13	0.18	0.23	0.13	0.06	0.14	0.13	0.00	0.01	0.01	0.00