Doublet Group distance statistics: 53494

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 7, 3, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.008, 0.013, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.008 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.002, 0.009, 0.016, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.009 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.000, 0.008, 0.015, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.008 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.002, 0.011, 0.020, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.011 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.002, 0.012, 0.022, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.012 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.010 std_dev=0.010
N6	A	0, 0.006, 0.018, 0.030, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.018 std_dev=0.012
C1'	A	0, -0.003, 0.009, 0.022, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.009 std_dev=0.013
N9	A	0, 0.001, 0.015, 0.028, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.015 std_dev=0.013
C8	A	0, 0.004, 0.021, 0.039, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.021 std_dev=0.018
N7	A	0, 0.002, 0.019, 0.037, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.019 std_dev=0.018
C2'	A	0, 0.007, 0.072, 0.137, 0.224 max_d=0.224 avg_d=0.072 std_dev=0.065
O4'	A	0, -0.011, 0.079, 0.169, 0.364 max_d=0.364 avg_d=0.079 std_dev=0.090
O2'	A	0, 0.033, 0.127, 0.221, 0.386 max_d=0.386 avg_d=0.127 std_dev=0.094
C3'	A	0, 0.005, 0.121, 0.237, 0.439 max_d=0.439 avg_d=0.121 std_dev=0.116
C4'	A	0, -0.014, 0.117, 0.248, 0.513 max_d=0.513 avg_d=0.117 std_dev=0.131
O2'	B	0, 0.063, 0.230, 0.398, 0.621 max_d=0.621 avg_d=0.230 std_dev=0.168
C2'	B	0, 0.086, 0.255, 0.425, 0.703 max_d=0.703 avg_d=0.255 std_dev=0.170
O3'	A	0, 0.000, 0.182, 0.364, 0.675 max_d=0.675 avg_d=0.182 std_dev=0.182
C2	B	0, 0.039, 0.292, 0.544, 1.141 max_d=1.141 avg_d=0.292 std_dev=0.253
O2	B	0, 0.048, 0.304, 0.559, 1.134 max_d=1.134 avg_d=0.304 std_dev=0.256
C1'	B	0, 0.024, 0.287, 0.550, 1.153 max_d=1.153 avg_d=0.287 std_dev=0.263
N3	B	0, 0.073, 0.346, 0.620, 1.220 max_d=1.220 avg_d=0.346 std_dev=0.273
N1	B	0, 0.030, 0.306, 0.582, 1.252 max_d=1.252 avg_d=0.306 std_dev=0.276
C5'	A	0, -0.075, 0.214, 0.502, 1.164 max_d=1.164 avg_d=0.214 std_dev=0.289
C3'	B	0, 0.059, 0.351, 0.642, 1.048 max_d=1.048 avg_d=0.351 std_dev=0.291
C4	B	0, 0.061, 0.391, 0.722, 1.425 max_d=1.425 avg_d=0.391 std_dev=0.330
O3'	B	0, 0.050, 0.387, 0.723, 1.163 max_d=1.163 avg_d=0.387 std_dev=0.337
O4'	B	0, 0.013, 0.364, 0.715, 1.348 max_d=1.348 avg_d=0.364 std_dev=0.351
O5'	A	0, -0.067, 0.293, 0.653, 1.484 max_d=1.484 avg_d=0.293 std_dev=0.360
C6	B	0, 0.020, 0.389, 0.758, 1.563 max_d=1.563 avg_d=0.389 std_dev=0.369
C4'	B	0, 0.016, 0.385, 0.755, 1.232 max_d=1.232 avg_d=0.385 std_dev=0.369
N4	B	0, 0.072, 0.449, 0.826, 1.551 max_d=1.551 avg_d=0.449 std_dev=0.377
C5	B	0, 0.030, 0.426, 0.823, 1.657 max_d=1.657 avg_d=0.426 std_dev=0.397
C5'	B	0, 0.000, 0.460, 0.920, 1.362 max_d=1.362 avg_d=0.460 std_dev=0.460
O5'	B	0, -0.001, 0.468, 0.937, 1.451 max_d=1.451 avg_d=0.468 std_dev=0.469
P	A	0, -0.152, 0.347, 0.846, 2.078 max_d=2.078 avg_d=0.347 std_dev=0.499
P	B	0, -0.031, 0.486, 1.004, 1.617 max_d=1.617 avg_d=0.486 std_dev=0.518
OP2	B	0, -0.030, 0.512, 1.055, 1.777 max_d=1.777 avg_d=0.512 std_dev=0.543
OP1	B	0, -0.030, 0.545, 1.119, 1.937 max_d=1.937 avg_d=0.545 std_dev=0.574
OP2	A	0, -0.216, 0.463, 1.143, 2.744 max_d=2.744 avg_d=0.463 std_dev=0.679
OP1	A	0, -0.546, 0.776, 2.097, 4.954 max_d=4.954 avg_d=0.776 std_dev=1.322

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.05	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.15	0.28	0.15	0.11
C2	0.02	0.00	0.06	0.08	0.01	0.03	0.02	0.08	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.08	0.10	0.01	0.25	0.74	0.38	0.30
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.02	0.02	0.01	0.03	0.02	0.05	0.05	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.12	0.20	0.16	0.13
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.06	0.07	0.07	0.07	0.06	0.07	0.04	0.02	0.01	0.01	0.10	0.15	0.15	0.14
C4	0.02	0.01	0.03	0.05	0.00	0.03	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.05	0.02	0.27	0.72	0.33	0.29
C4'	0.00	0.03	0.02	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.04	0.08	0.03	0.03	0.05	0.08	0.04	0.04	0.02	0.00	0.05	0.11	0.19	0.03
C5	0.02	0.02	0.02	0.05	0.00	0.05	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.06	0.02	0.32	0.94	0.40	0.38
C5'	0.05	0.08	0.01	0.01	0.12	0.01	0.17	0.00	0.16	0.21	0.12	0.07	0.18	0.22	0.13	0.04	0.05	0.04	0.01	0.25	0.30	0.02
C6	0.02	0.01	0.03	0.06	0.00	0.04	0.01	0.16	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.07	0.02	0.32	1.00	0.45	0.40
C8	0.01	0.02	0.02	0.07	0.01	0.08	0.00	0.21	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.03	0.35	0.83	0.30	0.34
N1	0.02	0.01	0.05	0.07	0.00	0.03	0.01	0.12	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.07	0.09	0.01	0.28	0.90	0.44	0.36
N3	0.02	0.00	0.05	0.07	0.00	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.07	0.08	0.02	0.23	0.62	0.32	0.26
N6	0.01	0.02	0.03	0.06	0.00	0.05	0.01	0.18	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.07	0.02	0.34	1.13	0.49	0.44
N7	0.01	0.02	0.02	0.07	0.00	0.08	0.00	0.22	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.07	0.03	0.36	1.04	0.39	0.41
N9	0.00	0.00	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.26	0.61	0.25	0.25
O2'	0.01	0.08	0.00	0.02	0.05	0.04	0.04	0.04	0.06	0.01	0.07	0.07	0.05	0.02	0.02	0.00	0.05	0.03	0.09	0.09	0.15	0.08
O3'	0.02	0.10	0.02	0.01	0.05	0.02	0.06	0.05	0.07	0.07	0.09	0.08	0.07	0.07	0.03	0.05	0.00	0.02	0.08	0.23	0.14	0.12
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.04	0.02	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.03	0.02	0.00	0.08	0.12	0.13	0.04
O5'	0.15	0.25	0.12	0.10	0.27	0.05	0.32	0.01	0.32	0.35	0.28	0.23	0.34	0.36	0.26	0.09	0.08	0.08	0.00	0.03	0.02	0.01
OP1	0.28	0.74	0.20	0.15	0.72	0.11	0.94	0.25	1.00	0.83	0.90	0.62	1.13	1.04	0.61	0.09	0.23	0.12	0.03	0.00	0.01	0.00
OP2	0.15	0.38	0.16	0.15	0.33	0.19	0.40	0.30	0.45	0.30	0.44	0.32	0.49	0.39	0.25	0.15	0.14	0.13	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.30	0.13	0.14	0.29	0.03	0.38	0.02	0.40	0.34	0.36	0.26	0.44	0.41	0.25	0.08	0.12	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.21	0.15	0.21	0.18	0.20	0.14	0.20	0.14	0.16	0.21	0.18	0.25	0.17	0.25	0.18	0.19	0.21	0.17	0.17
C2	0.09	0.12	0.12	0.14	0.12	0.13	0.09	0.12	0.08	0.06	0.15	0.14	0.19	0.12	0.16	0.11	0.13	0.15	0.14	0.13
C2'	0.17	0.16	0.17	0.23	0.14	0.25	0.14	0.27	0.15	0.15	0.16	0.13	0.18	0.17	0.27	0.22	0.24	0.33	0.23	0.26
C3'	0.18	0.14	0.17	0.22	0.13	0.26	0.15	0.29	0.16	0.15	0.13	0.12	0.14	0.17	0.26	0.23	0.26	0.36	0.25	0.28
C4	0.08	0.14	0.12	0.15	0.12	0.13	0.08	0.14	0.06	0.07	0.16	0.14	0.20	0.15	0.19	0.10	0.13	0.14	0.12	0.11
C4'	0.14	0.15	0.12	0.18	0.13	0.20	0.12	0.22	0.12	0.13	0.15	0.13	0.17	0.11	0.22	0.17	0.19	0.29	0.19	0.21
C5	0.08	0.11	0.11	0.15	0.12	0.12	0.10	0.13	0.08	0.06	0.13	0.14	0.16	0.14	0.19	0.10	0.13	0.13	0.13	0.11
C5'	0.15	0.18	0.13	0.17	0.16	0.19	0.13	0.21	0.14	0.15	0.18	0.16	0.20	0.13	0.21	0.18	0.18	0.29	0.18	0.21
C6	0.10	0.09	0.12	0.15	0.13	0.12	0.13	0.12	0.11	0.08	0.13	0.16	0.13	0.13	0.18	0.11	0.13	0.14	0.16	0.13
C8	0.09	0.14	0.12	0.17	0.12	0.15	0.08	0.16	0.06	0.08	0.15	0.13	0.19	0.15	0.22	0.12	0.14	0.15	0.12	0.12
N1	0.12	0.09	0.12	0.14	0.13	0.13	0.13	0.12	0.12	0.08	0.13	0.16	0.14	0.12	0.17	0.12	0.14	0.16	0.18	0.15
N3	0.08	0.16	0.12	0.14	0.13	0.13	0.08	0.13	0.06	0.08	0.17	0.14	0.22	0.14	0.17	0.10	0.12	0.15	0.12	0.11
N6	0.12	0.08	0.12	0.15	0.15	0.13	0.17	0.12	0.15	0.10	0.12	0.19	0.11	0.12	0.19	0.12	0.14	0.16	0.19	0.15
N7	0.07	0.11	0.11	0.16	0.11	0.13	0.09	0.14	0.07	0.06	0.13	0.14	0.16	0.14	0.21	0.10	0.13	0.13	0.12	0.11
N9	0.11	0.17	0.13	0.17	0.14	0.16	0.09	0.16	0.08	0.10	0.17	0.14	0.22	0.15	0.21	0.13	0.15	0.16	0.12	0.13
O2'	0.14	0.15	0.13	0.22	0.13	0.24	0.13	0.27	0.14	0.13	0.15	0.13	0.19	0.11	0.29	0.19	0.25	0.36	0.25	0.27
O3'	0.19	0.11	0.18	0.25	0.13	0.31	0.17	0.36	0.19	0.16	0.11	0.12	0.09	0.17	0.29	0.26	0.33	0.44	0.33	0.36
O4'	0.16	0.20	0.15	0.22	0.18	0.20	0.15	0.20	0.15	0.16	0.21	0.18	0.23	0.16	0.27	0.18	0.20	0.20	0.18	0.17
O5'	0.28	0.33	0.26	0.29	0.31	0.27	0.27	0.26	0.27	0.29	0.34	0.31	0.36	0.26	0.31	0.28	0.24	0.27	0.23	0.23
OP1	0.44	0.64	0.41	0.34	0.62	0.29	0.50	0.28	0.45	0.51	0.69	0.66	0.71	0.39	0.33	0.35	0.26	0.33	0.25	0.25
OP2	0.35	0.42	0.30	0.33	0.40	0.32	0.36	0.31	0.34	0.37	0.44	0.41	0.46	0.32	0.37	0.35	0.30	0.30	0.29	0.29
P	0.30	0.38	0.26	0.27	0.34	0.26	0.29	0.25	0.28	0.31	0.39	0.35	0.42	0.26	0.28	0.29	0.23	0.28	0.21	0.22

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.05	0.07	0.08	0.06
C2	0.01	0.00	0.10	0.08	0.01	0.03	0.02	0.06	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.11	0.08	0.04	0.12	0.13	0.16	0.15
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.07	0.03	0.05	0.02	0.04	0.04	0.10	0.07	0.14	0.01	0.02	0.02	0.02	0.11	0.07	0.04
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.07	0.01	0.07	0.01	0.07	0.04	0.09	0.08	0.11	0.01	0.01	0.02	0.02	0.14	0.11	0.07
C4	0.01	0.01	0.07	0.07	0.00	0.06	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.08	0.08	0.02	0.18	0.20	0.24	0.23
C4'	0.01	0.03	0.03	0.01	0.06	0.00	0.07	0.00	0.06	0.04	0.04	0.06	0.03	0.08	0.01	0.00	0.02	0.06	0.06	0.03
C5	0.01	0.02	0.05	0.07	0.01	0.07	0.00	0.14	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.05	0.10	0.05	0.19	0.20	0.23	0.24
C5'	0.03	0.06	0.02	0.01	0.11	0.00	0.14	0.00	0.12	0.07	0.08	0.13	0.04	0.08	0.03	0.02	0.01	0.05	0.02	0.02
C6	0.01	0.02	0.04	0.07	0.01	0.06	0.00	0.12	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.10	0.07	0.16	0.15	0.16	0.18
N1	0.01	0.01	0.04	0.04	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.04	0.02	0.11	0.11	0.13	0.13
N3	0.01	0.00	0.10	0.09	0.01	0.04	0.02	0.08	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.11	0.09	0.03	0.15	0.17	0.21	0.19
N4	0.01	0.02	0.07	0.08	0.00	0.06	0.00	0.13	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.08	0.09	0.02	0.19	0.23	0.29	0.26
O2	0.02	0.01	0.14	0.11	0.01	0.03	0.02	0.04	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.15	0.13	0.07	0.10	0.11	0.14	0.12
O2'	0.02	0.11	0.01	0.01	0.08	0.08	0.05	0.08	0.03	0.05	0.11	0.08	0.15	0.00	0.02	0.05	0.05	0.15	0.09	0.08
O3'	0.01	0.08	0.02	0.01	0.08	0.01	0.10	0.03	0.10	0.04	0.09	0.09	0.13	0.02	0.00	0.01	0.05	0.21	0.16	0.13
O4'	0.00	0.04	0.02	0.02	0.02	0.00	0.05	0.02	0.07	0.02	0.03	0.02	0.07	0.05	0.01	0.00	0.06	0.07	0.08	0.06
O5'	0.05	0.12	0.02	0.02	0.18	0.02	0.19	0.01	0.16	0.11	0.15	0.19	0.10	0.05	0.05	0.06	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.07	0.13	0.11	0.14	0.20	0.06	0.20	0.05	0.15	0.11	0.17	0.23	0.11	0.15	0.21	0.07	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.08	0.16	0.07	0.11	0.24	0.06	0.23	0.02	0.16	0.13	0.21	0.29	0.14	0.09	0.16	0.08	0.01	0.02	0.00	0.00
P	0.06	0.15	0.04	0.07	0.23	0.03	0.24	0.02	0.18	0.13	0.19	0.26	0.12	0.08	0.13	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00