Doublet Group distance statistics: 53496

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 2, 4, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.003, 0.008, 0.013, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.008 std_dev=0.005
C1'	A	0, 0.007, 0.015, 0.024, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.015 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.004, 0.012, 0.021, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.012 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.007, 0.021, 0.035, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.021 std_dev=0.014
C5	A	0, 0.007, 0.021, 0.036, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.021 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.008, 0.023, 0.038, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.023 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.007, 0.025, 0.043, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.025 std_dev=0.018
N9	A	0, 0.007, 0.025, 0.044, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.025 std_dev=0.019
N6	A	0, 0.012, 0.037, 0.061, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.037 std_dev=0.024
O4'	A	0, 0.028, 0.061, 0.093, 0.111 max_d=0.111 avg_d=0.061 std_dev=0.033
N7	A	0, 0.015, 0.050, 0.084, 0.125 max_d=0.125 avg_d=0.050 std_dev=0.035
C8	A	0, 0.014, 0.049, 0.085, 0.119 max_d=0.119 avg_d=0.049 std_dev=0.036
C2'	A	0, 0.029, 0.101, 0.174, 0.259 max_d=0.259 avg_d=0.101 std_dev=0.073
C4'	A	0, -0.007, 0.147, 0.301, 0.596 max_d=0.596 avg_d=0.147 std_dev=0.154
C5'	A	0, 0.083, 0.243, 0.403, 0.637 max_d=0.637 avg_d=0.243 std_dev=0.160
O2	B	0, 0.127, 0.444, 0.762, 1.193 max_d=1.193 avg_d=0.444 std_dev=0.318
C2	B	0, 0.167, 0.492, 0.817, 1.340 max_d=1.340 avg_d=0.492 std_dev=0.325
C3'	A	0, -0.090, 0.245, 0.580, 1.287 max_d=1.287 avg_d=0.245 std_dev=0.335
N3	B	0, 0.248, 0.598, 0.948, 1.472 max_d=1.472 avg_d=0.598 std_dev=0.350
C4	B	0, 0.316, 0.699, 1.083, 1.714 max_d=1.714 avg_d=0.699 std_dev=0.383
N1	B	0, 0.167, 0.560, 0.954, 1.467 max_d=1.467 avg_d=0.560 std_dev=0.393
N4	B	0, 0.405, 0.818, 1.232, 1.845 max_d=1.845 avg_d=0.818 std_dev=0.413
O2'	B	0, 0.037, 0.459, 0.881, 1.587 max_d=1.587 avg_d=0.459 std_dev=0.422
O2'	A	0, -0.164, 0.272, 0.708, 1.622 max_d=1.622 avg_d=0.272 std_dev=0.436
C5	B	0, 0.329, 0.769, 1.210, 1.887 max_d=1.887 avg_d=0.769 std_dev=0.440
O5'	A	0, -0.084, 0.360, 0.803, 1.679 max_d=1.679 avg_d=0.360 std_dev=0.443
C1'	B	0, 0.067, 0.525, 0.982, 1.585 max_d=1.585 avg_d=0.525 std_dev=0.458
C6	B	0, 0.234, 0.713, 1.191, 1.766 max_d=1.766 avg_d=0.713 std_dev=0.478
C2'	B	0, 0.019, 0.510, 1.001, 1.750 max_d=1.750 avg_d=0.510 std_dev=0.491
OP2	A	0, 0.022, 0.633, 1.244, 2.201 max_d=2.201 avg_d=0.633 std_dev=0.611
O4'	B	0, -0.066, 0.610, 1.285, 2.511 max_d=2.511 avg_d=0.610 std_dev=0.676
O3'	A	0, -0.252, 0.453, 1.157, 2.650 max_d=2.650 avg_d=0.453 std_dev=0.705
C3'	B	0, -0.100, 0.639, 1.379, 2.764 max_d=2.764 avg_d=0.639 std_dev=0.740
P	A	0, -0.198, 0.577, 1.353, 2.904 max_d=2.904 avg_d=0.577 std_dev=0.776
C4'	B	0, -0.156, 0.658, 1.472, 3.106 max_d=3.106 avg_d=0.658 std_dev=0.814
OP1	B	0, 0.099, 0.926, 1.752, 2.804 max_d=2.804 avg_d=0.926 std_dev=0.826
P	B	0, 0.053, 0.913, 1.774, 3.006 max_d=3.006 avg_d=0.913 std_dev=0.861
OP2	B	0, 0.099, 0.963, 1.827, 2.863 max_d=2.863 avg_d=0.963 std_dev=0.864
O3'	B	0, -0.160, 0.722, 1.604, 3.310 max_d=3.310 avg_d=0.722 std_dev=0.882
O5'	B	0, -0.034, 0.919, 1.872, 3.377 max_d=3.377 avg_d=0.919 std_dev=0.953
C5'	B	0, -0.219, 0.829, 1.876, 3.983 max_d=3.983 avg_d=0.829 std_dev=1.047
OP1	A	0, -0.387, 0.739, 1.866, 4.098 max_d=4.098 avg_d=0.739 std_dev=1.127

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.21	0.00	0.09	0.19	0.16	0.09
C2	0.02	0.00	0.03	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.23	0.32	0.02	0.11	0.26	0.38	0.20
C2'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.13	0.03	0.04	0.02	0.04	0.05	0.04	0.02	0.01	0.03	0.02	0.30	0.49	0.26	0.34
C3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.08	0.00	0.16	0.01	0.13	0.24	0.07	0.02	0.16	0.25	0.12	0.01	0.01	0.01	0.07	0.13	0.09	0.10
C4	0.01	0.00	0.02	0.08	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.21	0.18	0.01	0.12	0.24	0.35	0.20
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.05	0.11	0.03	0.02	0.06	0.11	0.05	0.19	0.02	0.00	0.01	0.10	0.08	0.01
C5	0.01	0.01	0.03	0.16	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.25	0.09	0.02	0.17	0.27	0.45	0.28
C5'	0.05	0.04	0.13	0.01	0.06	0.00	0.09	0.00	0.09	0.12	0.07	0.04	0.10	0.14	0.06	0.07	0.14	0.01	0.01	0.22	0.16	0.01
C6	0.01	0.01	0.03	0.13	0.01	0.05	0.01	0.09	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.29	0.13	0.02	0.17	0.28	0.48	0.29
C8	0.01	0.02	0.04	0.24	0.02	0.11	0.01	0.12	0.02	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.00	0.18	0.13	0.02	0.20	0.24	0.37	0.27
N1	0.02	0.00	0.02	0.07	0.01	0.03	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.27	0.22	0.02	0.14	0.27	0.45	0.26
N3	0.02	0.00	0.04	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.19	0.33	0.02	0.09	0.24	0.31	0.16
N6	0.02	0.01	0.05	0.16	0.02	0.06	0.02	0.10	0.01	0.03	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.31	0.10	0.03	0.19	0.31	0.53	0.33
N7	0.01	0.02	0.04	0.25	0.01	0.11	0.01	0.14	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.23	0.13	0.03	0.23	0.28	0.49	0.34
N9	0.00	0.01	0.02	0.12	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.15	0.09	0.01	0.11	0.21	0.28	0.17
O2'	0.02	0.23	0.01	0.01	0.21	0.19	0.25	0.07	0.29	0.18	0.27	0.19	0.31	0.23	0.15	0.00	0.04	0.12	0.23	0.49	0.24	0.29
O3'	0.21	0.32	0.03	0.01	0.18	0.02	0.09	0.14	0.13	0.13	0.22	0.33	0.10	0.13	0.09	0.04	0.00	0.13	0.10	0.16	0.15	0.08
O4'	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.01	0.12	0.13	0.00	0.05	0.08	0.07	0.09
O5'	0.09	0.11	0.30	0.07	0.12	0.01	0.17	0.01	0.17	0.20	0.14	0.09	0.19	0.23	0.11	0.23	0.10	0.05	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.19	0.26	0.49	0.13	0.24	0.10	0.27	0.22	0.28	0.24	0.27	0.24	0.31	0.28	0.21	0.49	0.16	0.08	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.16	0.38	0.26	0.09	0.35	0.08	0.45	0.16	0.48	0.37	0.45	0.31	0.53	0.49	0.28	0.24	0.15	0.07	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.09	0.20	0.34	0.10	0.20	0.01	0.28	0.01	0.29	0.27	0.26	0.16	0.33	0.34	0.17	0.29	0.08	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.24	0.09	0.13	0.24	0.08	0.22	0.14	0.21	0.22	0.25	0.25	0.26	0.13	0.29	0.18	0.20	0.19	0.27	0.22
C2	0.15	0.24	0.26	0.22	0.26	0.12	0.23	0.14	0.20	0.20	0.27	0.28	0.25	0.15	0.22	0.11	0.12	0.23	0.26	0.15
C2'	0.14	0.22	0.22	0.36	0.21	0.35	0.16	0.43	0.13	0.16	0.24	0.23	0.25	0.30	0.54	0.10	0.11	0.33	0.12	0.13
C3'	0.35	0.39	0.15	0.10	0.44	0.06	0.43	0.10	0.41	0.38	0.42	0.46	0.38	0.18	0.29	0.34	0.42	0.32	0.50	0.46
C4	0.16	0.25	0.18	0.09	0.25	0.08	0.22	0.10	0.20	0.21	0.27	0.27	0.27	0.12	0.07	0.11	0.09	0.21	0.24	0.15
C4'	0.30	0.29	0.13	0.14	0.31	0.09	0.32	0.10	0.31	0.30	0.30	0.32	0.29	0.17	0.32	0.32	0.41	0.23	0.42	0.39
C5	0.16	0.25	0.20	0.12	0.26	0.09	0.22	0.12	0.19	0.20	0.28	0.28	0.27	0.14	0.10	0.10	0.09	0.23	0.22	0.14
C5'	0.30	0.31	0.13	0.14	0.33	0.09	0.33	0.09	0.32	0.31	0.31	0.33	0.31	0.16	0.33	0.33	0.43	0.25	0.42	0.40
C6	0.16	0.25	0.25	0.19	0.27	0.11	0.23	0.13	0.20	0.20	0.29	0.30	0.27	0.15	0.19	0.11	0.11	0.23	0.24	0.14
C8	0.16	0.25	0.14	0.05	0.25	0.09	0.21	0.16	0.19	0.20	0.27	0.27	0.28	0.13	0.14	0.10	0.12	0.24	0.23	0.18
N1	0.15	0.24	0.27	0.23	0.27	0.13	0.23	0.14	0.20	0.20	0.28	0.30	0.25	0.15	0.24	0.11	0.13	0.24	0.25	0.14
N3	0.17	0.24	0.20	0.14	0.25	0.09	0.22	0.10	0.20	0.21	0.26	0.26	0.26	0.12	0.12	0.13	0.09	0.20	0.25	0.15
N6	0.16	0.25	0.26	0.21	0.28	0.12	0.23	0.14	0.20	0.20	0.29	0.31	0.26	0.16	0.22	0.13	0.12	0.24	0.23	0.14
N7	0.16	0.25	0.17	0.07	0.26	0.09	0.21	0.15	0.19	0.20	0.28	0.28	0.28	0.13	0.09	0.10	0.09	0.24	0.21	0.15
N9	0.17	0.25	0.13	0.05	0.25	0.07	0.22	0.13	0.20	0.21	0.26	0.26	0.27	0.12	0.14	0.12	0.13	0.21	0.24	0.18
O2'	0.18	0.32	0.31	0.58	0.30	0.59	0.20	0.67	0.15	0.21	0.35	0.32	0.38	0.41	0.84	0.18	0.34	0.56	0.16	0.27
O3'	0.71	0.74	0.48	0.34	0.80	0.39	0.79	0.26	0.77	0.75	0.77	0.82	0.71	0.44	0.23	0.71	0.74	0.52	0.80	0.73
O4'	0.27	0.25	0.13	0.15	0.25	0.11	0.26	0.12	0.26	0.26	0.25	0.25	0.26	0.15	0.28	0.28	0.35	0.18	0.37	0.33
O5'	0.34	0.37	0.15	0.14	0.40	0.11	0.40	0.11	0.38	0.36	0.39	0.42	0.36	0.15	0.31	0.35	0.45	0.29	0.49	0.46
OP1	0.49	0.60	0.22	0.10	0.65	0.12	0.61	0.04	0.57	0.56	0.64	0.68	0.59	0.20	0.32	0.47	0.46	0.29	0.52	0.49
OP2	0.28	0.34	0.19	0.23	0.36	0.18	0.34	0.18	0.31	0.31	0.36	0.37	0.37	0.18	0.33	0.28	0.45	0.31	0.48	0.46
P	0.33	0.36	0.14	0.17	0.41	0.12	0.41	0.11	0.38	0.36	0.39	0.42	0.36	0.14	0.35	0.35	0.47	0.32	0.50	0.49

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.14	0.16	0.18	0.06
C2	0.01	0.00	0.06	0.14	0.02	0.06	0.02	0.15	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.06	0.15	0.02	0.30	0.26	0.19	0.14
C2'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.03	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.05	0.04	0.09	0.00	0.02	0.01	0.19	0.30	0.13	0.11
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.15	0.01	0.12	0.02	0.08	0.09	0.16	0.17	0.13	0.02	0.01	0.01	0.24	0.41	0.09	0.18
C4	0.02	0.02	0.03	0.15	0.00	0.12	0.01	0.24	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.18	0.04	0.38	0.29	0.26	0.23
C4'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.12	0.00	0.13	0.01	0.11	0.06	0.09	0.14	0.04	0.07	0.02	0.01	0.01	0.19	0.22	0.05
C5	0.02	0.02	0.03	0.12	0.01	0.13	0.00	0.25	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.04	0.14	0.05	0.38	0.26	0.23	0.21
C5'	0.04	0.15	0.02	0.02	0.24	0.01	0.25	0.00	0.20	0.13	0.19	0.28	0.11	0.07	0.03	0.01	0.01	0.23	0.30	0.02
C6	0.02	0.02	0.03	0.08	0.02	0.11	0.01	0.20	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.03	0.09	0.04	0.34	0.22	0.17	0.14
N1	0.00	0.01	0.02	0.09	0.01	0.06	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.10	0.01	0.28	0.22	0.16	0.10
N3	0.01	0.01	0.05	0.16	0.01	0.09	0.01	0.19	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.19	0.02	0.35	0.29	0.23	0.19
N4	0.02	0.02	0.04	0.17	0.01	0.14	0.02	0.28	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.05	0.21	0.05	0.39	0.31	0.30	0.26
O2	0.02	0.01	0.09	0.13	0.02	0.04	0.03	0.11	0.03	0.02	0.01	0.02	0.00	0.08	0.15	0.04	0.25	0.25	0.18	0.11
O2'	0.01	0.06	0.00	0.02	0.05	0.07	0.04	0.07	0.03	0.03	0.06	0.05	0.08	0.00	0.03	0.06	0.07	0.27	0.13	0.04
O3'	0.01	0.15	0.02	0.01	0.18	0.02	0.14	0.03	0.09	0.10	0.19	0.21	0.15	0.03	0.00	0.02	0.22	0.48	0.08	0.21
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.04	0.01	0.02	0.05	0.04	0.06	0.02	0.00	0.09	0.11	0.24	0.12
O5'	0.14	0.30	0.19	0.24	0.38	0.01	0.38	0.01	0.34	0.28	0.35	0.39	0.25	0.07	0.22	0.09	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.16	0.26	0.30	0.41	0.29	0.19	0.26	0.23	0.22	0.22	0.29	0.31	0.25	0.27	0.48	0.11	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.18	0.19	0.13	0.09	0.26	0.22	0.23	0.30	0.17	0.16	0.23	0.30	0.18	0.13	0.08	0.24	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.14	0.11	0.18	0.23	0.05	0.21	0.02	0.14	0.10	0.19	0.26	0.11	0.04	0.21	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00