Doublet Group distance statistics: 53509

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
O2'	A	0, 0.000, 1.090, 2.179, 2.179 max_d=2.179 avg_d=1.090 std_dev=1.090
O2'	B	0, 0.000, 1.689, 3.377, 3.377 max_d=3.377 avg_d=1.689 std_dev=1.689
N3	A	0, 0.000, 1.871, 3.743, 3.743 max_d=3.743 avg_d=1.871 std_dev=1.871
C2'	A	0, 0.000, 1.898, 3.797, 3.797 max_d=3.797 avg_d=1.898 std_dev=1.898
C2	A	0, 0.000, 1.932, 3.864, 3.864 max_d=3.864 avg_d=1.932 std_dev=1.932
N3	B	0, 0.000, 2.058, 4.116, 4.116 max_d=4.116 avg_d=2.058 std_dev=2.058
C2	B	0, 0.000, 2.267, 4.535, 4.535 max_d=4.535 avg_d=2.267 std_dev=2.267
O3'	A	0, 0.000, 2.299, 4.598, 4.598 max_d=4.598 avg_d=2.299 std_dev=2.299
C2'	B	0, 0.000, 2.542, 5.084, 5.084 max_d=5.084 avg_d=2.542 std_dev=2.542
C1'	A	0, 0.000, 2.637, 5.274, 5.274 max_d=5.274 avg_d=2.637 std_dev=2.637
C3'	A	0, 0.000, 2.644, 5.287, 5.287 max_d=5.287 avg_d=2.644 std_dev=2.644
C1'	B	0, 0.000, 2.775, 5.550, 5.550 max_d=5.550 avg_d=2.775 std_dev=2.775
N1	A	0, 0.000, 2.891, 5.783, 5.783 max_d=5.783 avg_d=2.891 std_dev=2.891
C4	A	0, 0.000, 2.975, 5.951, 5.951 max_d=5.951 avg_d=2.975 std_dev=2.975
C4'	A	0, 0.000, 3.045, 6.091, 6.091 max_d=6.091 avg_d=3.045 std_dev=3.045
C4	B	0, 0.000, 3.058, 6.115, 6.115 max_d=6.115 avg_d=3.058 std_dev=3.058
N1	B	0, 0.000, 3.123, 6.247, 6.247 max_d=6.247 avg_d=3.123 std_dev=3.123
O3'	B	0, 0.000, 3.261, 6.523, 6.523 max_d=6.523 avg_d=3.261 std_dev=3.261
N9	A	0, 0.000, 3.354, 6.707, 6.707 max_d=6.707 avg_d=3.354 std_dev=3.354
C3'	B	0, 0.000, 3.430, 6.860, 6.860 max_d=6.860 avg_d=3.430 std_dev=3.430
N9	B	0, 0.000, 3.447, 6.894, 6.894 max_d=6.894 avg_d=3.447 std_dev=3.447
O4'	A	0, 0.000, 3.500, 7.000, 7.000 max_d=7.000 avg_d=3.500 std_dev=3.500
O4'	B	0, 0.000, 3.658, 7.317, 7.317 max_d=7.317 avg_d=3.658 std_dev=3.658
C4'	B	0, 0.000, 3.687, 7.373, 7.373 max_d=7.373 avg_d=3.687 std_dev=3.687
C6	A	0, 0.000, 4.005, 8.010, 8.010 max_d=8.010 avg_d=4.005 std_dev=4.005
C5	A	0, 0.000, 4.071, 8.143, 8.143 max_d=8.143 avg_d=4.071 std_dev=4.071
C6	B	0, 0.000, 4.085, 8.170, 8.170 max_d=8.170 avg_d=4.085 std_dev=4.085
C5	B	0, 0.000, 4.130, 8.259, 8.259 max_d=8.259 avg_d=4.130 std_dev=4.130
C5'	A	0, 0.000, 4.150, 8.300, 8.300 max_d=8.300 avg_d=4.150 std_dev=4.150
C8	A	0, 0.000, 4.625, 9.249, 9.249 max_d=9.249 avg_d=4.625 std_dev=4.625
C8	B	0, 0.000, 4.748, 9.497, 9.497 max_d=9.497 avg_d=4.748 std_dev=4.748
O5'	A	0, 0.000, 4.837, 9.675, 9.675 max_d=9.675 avg_d=4.837 std_dev=4.837
C5'	B	0, 0.000, 4.997, 9.995, 9.995 max_d=9.995 avg_d=4.997 std_dev=4.997
N6	A	0, 0.000, 5.031, 10.062, 10.062 max_d=10.062 avg_d=5.031 std_dev=5.031
N6	B	0, 0.000, 5.068, 10.136, 10.136 max_d=10.136 avg_d=5.068 std_dev=5.068
N7	A	0, 0.000, 5.110, 10.219, 10.219 max_d=10.219 avg_d=5.110 std_dev=5.110
N7	B	0, 0.000, 5.182, 10.365, 10.365 max_d=10.365 avg_d=5.182 std_dev=5.182
OP1	A	0, 0.000, 5.480, 10.961, 10.961 max_d=10.961 avg_d=5.480 std_dev=5.480
O5'	B	0, 0.000, 5.838, 11.676, 11.676 max_d=11.676 avg_d=5.838 std_dev=5.838
P	A	0, 0.000, 5.903, 11.806, 11.806 max_d=11.806 avg_d=5.903 std_dev=5.903
OP2	A	0, 0.000, 6.823, 13.646, 13.646 max_d=13.646 avg_d=6.823 std_dev=6.823
P	B	0, 0.000, 7.324, 14.649, 14.649 max_d=14.649 avg_d=7.324 std_dev=7.324
OP1	B	0, 0.000, 7.445, 14.890, 14.890 max_d=14.890 avg_d=7.445 std_dev=7.445
OP2	B	0, 0.000, 8.130, 16.261, 16.261 max_d=16.261 avg_d=8.130 std_dev=8.130

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.02	0.18	0.12
C2	0.01	0.00	0.08	0.10	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.13	0.01	0.17	0.12	0.47	0.30
C2'	0.00	0.08	0.00	0.01	0.05	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.07	0.08	0.07	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.18	0.00	0.24	0.16
C3'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.07	0.00	0.06	0.00	0.09	0.00	0.10	0.09	0.09	0.03	0.03	0.02	0.00	0.00	0.28	0.09	0.23	0.22
C4	0.00	0.01	0.05	0.07	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.01	0.19	0.18	0.46	0.33
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.04	0.04	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.09	0.05	0.02
C5	0.00	0.01	0.04	0.06	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.09	0.01	0.26	0.31	0.60	0.45
C5'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.04	0.05	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.04	0.18	0.00
C6	0.00	0.01	0.06	0.09	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.12	0.01	0.26	0.32	0.64	0.47
C8	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.26	0.34	0.53	0.45
N1	0.00	0.00	0.07	0.10	0.00	0.04	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.14	0.01	0.22	0.23	0.57	0.40
N3	0.01	0.00	0.08	0.09	0.00	0.04	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.11	0.00	0.14	0.07	0.39	0.25
N6	0.01	0.01	0.07	0.09	0.01	0.04	0.01	0.05	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.13	0.00	0.28	0.40	0.71	0.53
N7	0.00	0.02	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.05	0.01	0.30	0.42	0.66	0.53
N9	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.00	0.18	0.17	0.39	0.30
O2'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.22	0.06	0.03
O3'	0.00	0.13	0.01	0.00	0.08	0.01	0.09	0.01	0.12	0.01	0.14	0.11	0.13	0.05	0.04	0.02	0.00	0.01	0.27	0.03	0.16	0.16
O4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.06	0.06	0.02	0.02
O5'	0.06	0.17	0.18	0.28	0.19	0.00	0.26	0.00	0.26	0.26	0.22	0.14	0.28	0.30	0.18	0.02	0.27	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.02	0.12	0.00	0.09	0.18	0.09	0.31	0.04	0.32	0.34	0.23	0.07	0.40	0.42	0.17	0.22	0.03	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.18	0.47	0.24	0.23	0.46	0.05	0.60	0.18	0.64	0.53	0.57	0.39	0.71	0.66	0.39	0.06	0.16	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.12	0.30	0.16	0.22	0.33	0.02	0.45	0.00	0.47	0.45	0.40	0.25	0.53	0.53	0.30	0.03	0.16	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.07	1.08	0.17	0.43	0.70	0.52	0.79	0.54	0.98	0.41	1.11	0.86	1.02	0.62	0.41	0.51	0.75	0.18	0.28	0.31	0.33	0.26
C2	1.10	0.24	1.21	1.22	0.40	1.32	0.15	1.24	0.22	0.61	0.44	0.29	0.37	0.33	0.72	1.47	1.33	1.18	1.01	0.58	1.12	0.88
C2'	0.42	1.40	0.15	0.21	1.04	0.34	1.07	0.42	1.24	0.67	1.37	1.25	1.24	0.86	0.73	0.15	0.60	0.09	0.14	0.22	0.17	0.15
C3'	0.75	1.38	0.55	0.17	1.15	0.06	1.15	0.08	1.27	0.87	1.36	1.29	1.27	1.00	0.94	0.42	0.20	0.45	0.13	0.09	0.13	0.08
C4	0.59	0.59	0.78	0.87	0.08	0.96	0.25	0.91	0.53	0.16	0.70	0.21	0.62	0.09	0.22	1.11	1.07	0.72	0.67	0.46	0.75	0.59
C4'	0.72	1.22	0.58	0.24	1.06	0.13	1.09	0.00	1.18	0.86	1.23	1.15	1.19	0.97	0.90	0.48	0.11	0.46	0.20	0.10	0.17	0.13
C5	0.65	0.31	0.79	0.86	0.10	0.96	0.07	0.92	0.31	0.27	0.45	0.02	0.42	0.06	0.34	1.06	1.03	0.76	0.69	0.46	0.79	0.62
C5'	0.80	1.14	0.71	0.42	1.04	0.32	1.06	0.18	1.12	0.90	1.15	1.08	1.13	0.98	0.93	0.67	0.15	0.59	0.34	0.03	0.34	0.26
C6	0.89	0.01	1.00	1.03	0.38	1.13	0.20	1.07	0.06	0.53	0.19	0.33	0.19	0.32	0.61	1.24	1.16	0.98	0.86	0.52	0.99	0.77
C8	0.20	0.62	0.36	0.51	0.30	0.61	0.42	0.61	0.61	0.11	0.71	0.38	0.68	0.29	0.08	0.61	0.73	0.37	0.39	0.35	0.45	0.35
N1	1.10	0.06	1.18	1.19	0.54	1.29	0.33	1.22	0.01	0.70	0.15	0.48	0.14	0.46	0.79	1.41	1.29	1.17	1.01	0.58	1.15	0.89
N3	0.83	0.65	1.02	1.08	0.02	1.17	0.19	1.09	0.54	0.30	0.77	0.15	0.64	0.01	0.40	1.37	1.24	0.95	0.83	0.51	0.92	0.72
N6	0.92	0.19	0.99	1.02	0.49	1.12	0.34	1.07	0.12	0.61	0.02	0.46	0.01	0.43	0.68	1.20	1.13	0.99	0.88	0.52	1.02	0.79
N7	0.42	0.38	0.56	0.66	0.06	0.76	0.19	0.74	0.40	0.10	0.50	0.13	0.48	0.08	0.15	0.80	0.84	0.55	0.53	0.40	0.60	0.48
N9	0.24	0.78	0.45	0.61	0.37	0.70	0.50	0.69	0.72	0.13	0.86	0.50	0.78	0.34	0.09	0.76	0.86	0.42	0.45	0.38	0.51	0.40
O2'	0.63	1.55	0.31	0.18	1.28	0.31	1.27	0.41	1.41	0.86	1.51	1.48	1.39	1.05	0.96	0.04	0.67	0.21	0.10	0.22	0.14	0.12
O3'	1.10	1.53	0.89	0.47	1.38	0.39	1.35	0.16	1.43	1.11	1.51	1.49	1.42	1.21	1.21	0.89	0.07	0.81	0.35	0.02	0.37	0.24
O4'	0.32	1.00	0.14	0.13	0.77	0.22	0.84	0.28	0.98	0.57	1.04	0.86	1.01	0.72	0.57	0.08	0.45	0.09	0.06	0.23	0.11	0.07
O5'	0.68	1.03	0.68	0.49	0.96	0.30	1.04	0.21	1.11	0.89	1.10	0.95	1.15	1.00	0.86	0.54	0.30	0.48	0.42	0.07	0.47	0.37
OP1	1.26	1.22	1.31	1.23	1.34	1.06	1.42	0.99	1.39	1.44	1.29	1.23	1.44	1.47	1.36	1.22	1.15	1.15	1.16	0.67	1.29	1.09
OP2	0.60	0.69	0.66	0.59	0.73	0.41	0.81	0.35	0.82	0.78	0.76	0.67	0.87	0.83	0.72	0.56	0.53	0.48	0.53	0.18	0.64	0.48
P	0.81	0.91	0.85	0.75	0.96	0.57	1.04	0.51	1.06	1.01	0.99	0.89	1.11	1.07	0.94	0.73	0.65	0.67	0.70	0.30	0.79	0.65

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.27	0.14	0.04
C2	0.04	0.00	0.12	0.10	0.00	0.05	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.15	0.14	0.00	0.05	0.56	0.36	0.14
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.06	0.01	0.02	0.00	0.05	0.07	0.10	0.13	0.02	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.05	0.08	0.03
C3'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.02	0.09	0.07	0.10	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.12	0.01	0.00
C4	0.02	0.00	0.06	0.04	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.05	0.00	0.06	0.54	0.33	0.13
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.02	0.07	0.02	0.05	0.04	0.07	0.01	0.03	0.00	0.00	0.00	0.04	0.12	0.00
C5	0.01	0.02	0.02	0.00	0.00	0.03	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.01	0.01	0.12	0.68	0.39	0.20
C5'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.09	0.12	0.05	0.00	0.13	0.13	0.05	0.03	0.01	0.00	0.00	0.13	0.26	0.01
C6	0.02	0.01	0.05	0.02	0.00	0.02	0.00	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.03	0.01	0.12	0.73	0.41	0.22
C8	0.01	0.01	0.07	0.09	0.01	0.07	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.11	0.00	0.14	0.61	0.31	0.18
N1	0.03	0.00	0.10	0.07	0.00	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.12	0.10	0.00	0.09	0.67	0.40	0.19
N3	0.04	0.00	0.13	0.10	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.14	0.13	0.00	0.03	0.48	0.32	0.10
N6	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.01	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.02	0.16	0.83	0.43	0.28
N7	0.00	0.02	0.04	0.07	0.01	0.07	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.09	0.01	0.16	0.74	0.38	0.24
N9	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.06	0.46	0.27	0.10
O2'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.07	0.03	0.04	0.03	0.07	0.04	0.12	0.14	0.05	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.00
O3'	0.01	0.14	0.00	0.01	0.05	0.00	0.01	0.01	0.03	0.11	0.10	0.13	0.01	0.09	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.34	0.14	0.01
O4'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.24	0.06	0.00
O5'	0.01	0.05	0.02	0.02	0.06	0.00	0.12	0.00	0.12	0.14	0.09	0.03	0.16	0.16	0.06	0.00	0.02	0.03	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.27	0.56	0.05	0.12	0.54	0.04	0.68	0.13	0.73	0.61	0.67	0.48	0.83	0.74	0.46	0.03	0.34	0.24	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.14	0.36	0.08	0.01	0.33	0.12	0.39	0.26	0.41	0.31	0.40	0.32	0.43	0.38	0.27	0.00	0.14	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.04	0.14	0.03	0.00	0.13	0.00	0.20	0.01	0.22	0.18	0.19	0.10	0.28	0.24	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00