Doublet Group distance statistics: 53511

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 7, 18, 16, 5, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.009, 0.014, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.009 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.006, 0.015, 0.023, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.015 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.011, 0.022, 0.034, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.022 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.010, 0.023, 0.037, 0.103 max_d=0.103 avg_d=0.023 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.011, 0.026, 0.041, 0.120 max_d=0.120 avg_d=0.026 std_dev=0.015
N7	A	0, 0.015, 0.031, 0.047, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.031 std_dev=0.016
N6	A	0, 0.010, 0.026, 0.043, 0.103 max_d=0.103 avg_d=0.026 std_dev=0.016
C2	A	0, 0.011, 0.028, 0.045, 0.130 max_d=0.130 avg_d=0.028 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.010, 0.028, 0.045, 0.131 max_d=0.131 avg_d=0.028 std_dev=0.017
C8	A	0, 0.020, 0.039, 0.059, 0.119 max_d=0.119 avg_d=0.039 std_dev=0.019
C1'	A	0, 0.017, 0.037, 0.058, 0.157 max_d=0.157 avg_d=0.037 std_dev=0.021
C5	B	0, 0.207, 0.325, 0.442, 0.568 max_d=0.568 avg_d=0.325 std_dev=0.117
C2	B	0, 0.152, 0.276, 0.400, 0.646 max_d=0.646 avg_d=0.276 std_dev=0.124
N3	B	0, 0.192, 0.326, 0.459, 0.652 max_d=0.652 avg_d=0.326 std_dev=0.134
C4	B	0, 0.221, 0.355, 0.489, 0.706 max_d=0.706 avg_d=0.355 std_dev=0.134
C6	B	0, 0.153, 0.288, 0.423, 0.722 max_d=0.722 avg_d=0.288 std_dev=0.135
N1	B	0, 0.128, 0.263, 0.398, 0.670 max_d=0.670 avg_d=0.263 std_dev=0.135
O2	B	0, 0.136, 0.285, 0.433, 0.742 max_d=0.742 avg_d=0.285 std_dev=0.148
C1'	B	0, 0.116, 0.287, 0.458, 1.016 max_d=1.016 avg_d=0.287 std_dev=0.171
C2'	B	0, 0.142, 0.327, 0.511, 1.113 max_d=1.113 avg_d=0.327 std_dev=0.185
O4	B	0, 0.250, 0.445, 0.640, 0.928 max_d=0.928 avg_d=0.445 std_dev=0.195
O4'	A	0, -0.059, 0.139, 0.338, 1.469 max_d=1.469 avg_d=0.139 std_dev=0.199
O4'	B	0, 0.115, 0.330, 0.545, 1.515 max_d=1.515 avg_d=0.330 std_dev=0.215
C2'	A	0, -0.030, 0.187, 0.404, 1.634 max_d=1.634 avg_d=0.187 std_dev=0.217
C3'	B	0, 0.125, 0.347, 0.568, 1.519 max_d=1.519 avg_d=0.347 std_dev=0.221
C4'	B	0, 0.121, 0.366, 0.612, 1.771 max_d=1.771 avg_d=0.366 std_dev=0.245
O3'	B	0, 0.203, 0.461, 0.719, 1.867 max_d=1.867 avg_d=0.461 std_dev=0.258
O2'	B	0, 0.203, 0.473, 0.744, 1.442 max_d=1.442 avg_d=0.473 std_dev=0.271
C5'	B	0, 0.113, 0.412, 0.712, 2.232 max_d=2.232 avg_d=0.412 std_dev=0.300
C3'	A	0, -0.070, 0.233, 0.535, 2.241 max_d=2.241 avg_d=0.233 std_dev=0.302
O2'	A	0, 0.040, 0.346, 0.652, 2.364 max_d=2.364 avg_d=0.346 std_dev=0.306
C4'	A	0, -0.127, 0.185, 0.496, 2.313 max_d=2.313 avg_d=0.185 std_dev=0.312
O5'	B	0, 0.159, 0.480, 0.800, 2.372 max_d=2.372 avg_d=0.480 std_dev=0.320
O3'	A	0, -0.022, 0.360, 0.741, 2.775 max_d=2.775 avg_d=0.360 std_dev=0.382
OP2	B	0, 0.227, 0.620, 1.013, 2.851 max_d=2.851 avg_d=0.620 std_dev=0.393
P	B	0, 0.206, 0.630, 1.054, 3.110 max_d=3.110 avg_d=0.630 std_dev=0.424
C5'	A	0, -0.134, 0.329, 0.792, 3.408 max_d=3.408 avg_d=0.329 std_dev=0.463
OP1	B	0, 0.194, 0.685, 1.175, 3.612 max_d=3.612 avg_d=0.685 std_dev=0.491
O5'	A	0, -0.081, 0.439, 0.959, 3.445 max_d=3.445 avg_d=0.439 std_dev=0.520
P	A	0, -0.198, 0.595, 1.387, 4.049 max_d=4.049 avg_d=0.595 std_dev=0.793
OP1	A	0, -0.230, 0.743, 1.716, 4.608 max_d=4.608 avg_d=0.743 std_dev=0.973
OP2	A	0, -0.214, 0.760, 1.733, 4.581 max_d=4.581 avg_d=0.760 std_dev=0.973

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01	0.04	0.04	0.02	0.01	0.00	0.01	0.11	0.00	0.11	0.14	0.20	0.16
C2	0.04	0.00	0.13	0.09	0.01	0.07	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.11	0.13	0.19	0.18	0.37	0.28
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.07	0.01	0.04	0.06	0.07	0.08	0.10	0.13	0.05	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.15	0.29	0.26	0.20
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.08	0.00	0.11	0.02	0.11	0.12	0.10	0.08	0.13	0.13	0.08	0.02	0.01	0.01	0.13	0.29	0.16	0.14
C4	0.02	0.01	0.07	0.08	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.07	0.07	0.19	0.18	0.36	0.27
C4'	0.00	0.07	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.10	0.05	0.07	0.05	0.08	0.03	0.10	0.02	0.00	0.01	0.12	0.19	0.06
C5	0.01	0.00	0.04	0.11	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.08	0.06	0.04	0.21	0.25	0.47	0.34
C5'	0.03	0.11	0.06	0.02	0.07	0.01	0.09	0.00	0.09	0.13	0.10	0.10	0.11	0.13	0.06	0.06	0.07	0.02	0.01	0.12	0.14	0.01
C6	0.02	0.00	0.07	0.11	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.07	0.06	0.21	0.26	0.50	0.35
C8	0.01	0.01	0.08	0.12	0.00	0.10	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.16	0.08	0.07	0.23	0.25	0.42	0.33
N1	0.04	0.00	0.10	0.10	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.08	0.10	0.20	0.22	0.45	0.32
N3	0.04	0.00	0.13	0.08	0.00	0.07	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.12	0.12	0.18	0.17	0.32	0.25
N6	0.02	0.01	0.05	0.13	0.01	0.05	0.01	0.11	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.09	0.08	0.05	0.22	0.31	0.57	0.38
N7	0.01	0.01	0.05	0.13	0.00	0.08	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.15	0.09	0.04	0.24	0.30	0.53	0.38
N9	0.00	0.01	0.02	0.08	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.05	0.01	0.18	0.16	0.30	0.24
O2'	0.01	0.12	0.00	0.02	0.05	0.10	0.08	0.06	0.07	0.16	0.08	0.12	0.09	0.15	0.07	0.00	0.05	0.07	0.09	0.28	0.36	0.20
O3'	0.11	0.11	0.02	0.01	0.07	0.02	0.06	0.07	0.07	0.08	0.08	0.12	0.08	0.09	0.05	0.05	0.00	0.08	0.17	0.37	0.32	0.21
O4'	0.00	0.13	0.01	0.01	0.07	0.00	0.04	0.02	0.06	0.07	0.10	0.12	0.05	0.04	0.01	0.07	0.08	0.00	0.10	0.10	0.20	0.16
O5'	0.11	0.19	0.15	0.13	0.19	0.01	0.21	0.01	0.21	0.23	0.20	0.18	0.22	0.24	0.18	0.09	0.17	0.10	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.14	0.18	0.29	0.29	0.18	0.12	0.25	0.12	0.26	0.25	0.22	0.17	0.31	0.30	0.16	0.28	0.37	0.10	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.20	0.37	0.26	0.16	0.36	0.19	0.47	0.14	0.50	0.42	0.45	0.32	0.57	0.53	0.30	0.36	0.32	0.20	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.16	0.28	0.20	0.14	0.27	0.06	0.34	0.01	0.35	0.33	0.32	0.25	0.38	0.38	0.24	0.20	0.21	0.16	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.09	0.09	0.13	0.08	0.22	0.10	0.25	0.12	0.11	0.08	0.10	0.10	0.16	0.07	0.21	0.20	0.28	0.18	0.23
C2	0.13	0.13	0.10	0.10	0.13	0.14	0.13	0.14	0.13	0.13	0.13	0.14	0.10	0.12	0.13	0.15	0.11	0.14	0.09	0.11
C2'	0.22	0.19	0.19	0.19	0.20	0.25	0.21	0.28	0.22	0.21	0.19	0.18	0.21	0.21	0.20	0.26	0.25	0.31	0.23	0.27
C3'	0.17	0.11	0.08	0.16	0.12	0.26	0.15	0.34	0.17	0.15	0.11	0.10	0.07	0.21	0.11	0.25	0.31	0.43	0.32	0.37
C4	0.14	0.11	0.09	0.11	0.11	0.17	0.12	0.19	0.13	0.12	0.11	0.11	0.09	0.13	0.10	0.18	0.15	0.20	0.12	0.16
C4'	0.22	0.18	0.20	0.25	0.18	0.30	0.20	0.36	0.21	0.20	0.18	0.18	0.17	0.29	0.18	0.28	0.33	0.43	0.35	0.38
C5	0.14	0.12	0.09	0.10	0.12	0.16	0.12	0.18	0.13	0.13	0.12	0.13	0.09	0.13	0.12	0.17	0.14	0.19	0.11	0.15
C5'	0.25	0.22	0.24	0.29	0.23	0.31	0.23	0.37	0.24	0.23	0.22	0.22	0.21	0.34	0.23	0.29	0.36	0.48	0.39	0.41
C6	0.13	0.14	0.09	0.10	0.14	0.14	0.14	0.15	0.13	0.13	0.15	0.15	0.09	0.12	0.14	0.15	0.12	0.15	0.10	0.12
C8	0.14	0.11	0.09	0.12	0.10	0.19	0.11	0.23	0.13	0.12	0.10	0.11	0.09	0.15	0.10	0.19	0.18	0.25	0.16	0.21
N1	0.13	0.15	0.10	0.10	0.15	0.13	0.14	0.14	0.13	0.13	0.15	0.16	0.10	0.12	0.15	0.14	0.11	0.13	0.09	0.10
N3	0.14	0.11	0.09	0.10	0.11	0.17	0.12	0.17	0.13	0.12	0.11	0.11	0.10	0.12	0.11	0.17	0.13	0.17	0.11	0.14
N6	0.13	0.15	0.09	0.10	0.16	0.13	0.14	0.14	0.13	0.14	0.16	0.17	0.09	0.12	0.16	0.14	0.11	0.15	0.09	0.11
N7	0.14	0.12	0.09	0.11	0.11	0.17	0.12	0.20	0.13	0.13	0.12	0.12	0.09	0.14	0.11	0.18	0.16	0.22	0.14	0.18
N9	0.15	0.10	0.09	0.12	0.09	0.20	0.11	0.23	0.13	0.12	0.09	0.10	0.10	0.14	0.09	0.20	0.18	0.25	0.16	0.20
O2'	0.26	0.24	0.34	0.36	0.27	0.32	0.28	0.31	0.29	0.26	0.25	0.21	0.34	0.42	0.27	0.28	0.31	0.34	0.31	0.32
O3'	0.28	0.24	0.21	0.28	0.26	0.36	0.29	0.45	0.29	0.27	0.24	0.22	0.17	0.30	0.26	0.35	0.43	0.54	0.47	0.49
O4'	0.25	0.22	0.23	0.26	0.21	0.30	0.21	0.33	0.22	0.23	0.21	0.22	0.23	0.27	0.20	0.29	0.30	0.36	0.30	0.32
O5'	0.24	0.20	0.21	0.25	0.19	0.30	0.21	0.36	0.22	0.22	0.19	0.20	0.19	0.31	0.18	0.30	0.34	0.46	0.36	0.39
OP1	0.26	0.24	0.29	0.36	0.27	0.35	0.29	0.43	0.29	0.26	0.25	0.23	0.25	0.43	0.28	0.31	0.44	0.59	0.50	0.51
OP2	0.26	0.27	0.27	0.35	0.26	0.34	0.27	0.43	0.27	0.26	0.27	0.30	0.25	0.45	0.26	0.29	0.42	0.59	0.45	0.49
P	0.25	0.24	0.24	0.30	0.23	0.30	0.24	0.37	0.24	0.24	0.23	0.26	0.22	0.38	0.22	0.28	0.37	0.51	0.40	0.43

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.04	0.09	0.06
C2	0.02	0.00	0.04	0.06	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.07	0.01	0.02	0.10	0.12	0.19	0.14
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.06	0.01	0.06	0.01	0.05	0.03	0.05	0.05	0.00	0.01	0.08	0.01	0.03	0.04	0.05	0.03
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.11	0.00	0.10	0.01	0.08	0.05	0.09	0.05	0.02	0.01	0.13	0.01	0.03	0.06	0.06	0.04
C4	0.02	0.01	0.06	0.11	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.14	0.00	0.03	0.16	0.21	0.28	0.21
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.06	0.00	0.06	0.00	0.06	0.03	0.04	0.03	0.04	0.02	0.06	0.00	0.01	0.04	0.02	0.01
C5	0.02	0.01	0.06	0.10	0.00	0.06	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.13	0.01	0.04	0.16	0.21	0.27	0.22
C5'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.10	0.00	0.11	0.00	0.09	0.05	0.08	0.04	0.04	0.03	0.11	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.08	0.01	0.06	0.00	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.10	0.01	0.03	0.13	0.16	0.19	0.17
N1	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.02	0.09	0.10	0.16	0.12
N3	0.02	0.00	0.05	0.09	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.11	0.01	0.02	0.13	0.17	0.24	0.18
O2	0.03	0.01	0.05	0.05	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.06	0.01	0.03	0.09	0.09	0.17	0.12
O2'	0.01	0.05	0.00	0.02	0.05	0.04	0.05	0.04	0.03	0.03	0.05	0.07	0.00	0.04	0.07	0.03	0.03	0.07	0.05	0.04
O3'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.14	0.02	0.13	0.03	0.10	0.06	0.11	0.06	0.04	0.00	0.18	0.02	0.05	0.10	0.10	0.08
O4	0.02	0.01	0.08	0.13	0.00	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.18	0.00	0.04	0.17	0.24	0.30	0.23
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.04	0.00	0.04	0.04	0.07	0.05
O5'	0.04	0.10	0.03	0.03	0.16	0.01	0.16	0.01	0.13	0.09	0.13	0.09	0.03	0.05	0.17	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.04	0.12	0.04	0.06	0.21	0.04	0.21	0.04	0.16	0.10	0.17	0.09	0.07	0.10	0.24	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.09	0.19	0.05	0.06	0.28	0.02	0.27	0.01	0.19	0.16	0.24	0.17	0.05	0.10	0.30	0.07	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.06	0.14	0.03	0.04	0.21	0.01	0.22	0.01	0.17	0.12	0.18	0.12	0.04	0.08	0.23	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00