Doublet Group distance statistics: 53512

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 1, 4, 4, 9, 8, 4, 9, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.006, 0.012, 0.019, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.012 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.004, 0.011, 0.017, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.011 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.009, 0.018, 0.027, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.018 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.010, 0.020, 0.031, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.020 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.008, 0.020, 0.031, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.020 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.011, 0.024, 0.037, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.024 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.011, 0.028, 0.044, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.028 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.012, 0.032, 0.051, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.032 std_dev=0.019
N6	A	0, 0.025, 0.050, 0.076, 0.121 max_d=0.121 avg_d=0.050 std_dev=0.025
N7	A	0, 0.020, 0.050, 0.079, 0.144 max_d=0.144 avg_d=0.050 std_dev=0.029
C8	A	0, 0.023, 0.058, 0.093, 0.160 max_d=0.160 avg_d=0.058 std_dev=0.035
N1	B	0, 0.259, 0.417, 0.576, 0.767 max_d=0.767 avg_d=0.417 std_dev=0.159
C6	B	0, 0.297, 0.480, 0.664, 0.935 max_d=0.935 avg_d=0.480 std_dev=0.184
C1'	B	0, 0.198, 0.386, 0.573, 1.039 max_d=1.039 avg_d=0.386 std_dev=0.187
C2	B	0, 0.275, 0.463, 0.652, 0.800 max_d=0.800 avg_d=0.463 std_dev=0.188
O2	B	0, 0.206, 0.395, 0.585, 0.983 max_d=0.983 avg_d=0.395 std_dev=0.189
C2'	B	0, 0.144, 0.348, 0.551, 1.186 max_d=1.186 avg_d=0.348 std_dev=0.204
O2'	B	0, 0.074, 0.330, 0.586, 1.577 max_d=1.577 avg_d=0.330 std_dev=0.256
C5	B	0, 0.352, 0.619, 0.885, 1.104 max_d=1.104 avg_d=0.619 std_dev=0.266
O4'	B	0, 0.250, 0.528, 0.805, 1.255 max_d=1.255 avg_d=0.528 std_dev=0.277
C3'	B	0, 0.187, 0.472, 0.757, 1.234 max_d=1.234 avg_d=0.472 std_dev=0.285
N3	B	0, 0.340, 0.641, 0.942, 1.140 max_d=1.140 avg_d=0.641 std_dev=0.301
C4	B	0, 0.388, 0.743, 1.098, 1.400 max_d=1.400 avg_d=0.743 std_dev=0.355
C4'	B	0, 0.167, 0.532, 0.897, 1.410 max_d=1.410 avg_d=0.532 std_dev=0.365
O3'	B	0, 0.119, 0.572, 1.025, 1.618 max_d=1.618 avg_d=0.572 std_dev=0.453
O5'	B	0, 0.228, 0.691, 1.153, 1.832 max_d=1.832 avg_d=0.691 std_dev=0.462
C5'	B	0, 0.194, 0.682, 1.169, 1.870 max_d=1.870 avg_d=0.682 std_dev=0.487
O4	B	0, 0.390, 0.928, 1.467, 2.030 max_d=2.030 avg_d=0.928 std_dev=0.539
OP2	B	0, 0.346, 0.898, 1.449, 2.326 max_d=2.326 avg_d=0.898 std_dev=0.551
P	B	0, 0.243, 0.889, 1.535, 2.453 max_d=2.453 avg_d=0.889 std_dev=0.646
O4'	A	0, -0.146, 0.550, 1.246, 1.704 max_d=1.704 avg_d=0.550 std_dev=0.696
C2'	A	0, -0.165, 0.552, 1.270, 1.737 max_d=1.737 avg_d=0.552 std_dev=0.718
OP1	B	0, 0.161, 1.012, 1.862, 2.988 max_d=2.988 avg_d=1.012 std_dev=0.851
C3'	A	0, -0.193, 0.771, 1.734, 2.295 max_d=2.295 avg_d=0.771 std_dev=0.963
C4'	A	0, -0.177, 0.888, 1.953, 2.546 max_d=2.546 avg_d=0.888 std_dev=1.065
O3'	A	0, -0.203, 0.918, 2.038, 3.077 max_d=3.077 avg_d=0.918 std_dev=1.121
O2'	A	0, -0.214, 0.908, 2.029, 2.769 max_d=2.769 avg_d=0.908 std_dev=1.121
O5'	A	0, -0.254, 1.229, 2.713, 3.961 max_d=3.961 avg_d=1.229 std_dev=1.484
C5'	A	0, -0.269, 1.331, 2.932, 3.883 max_d=3.883 avg_d=1.331 std_dev=1.601
P	A	0, -0.292, 1.462, 3.216, 4.692 max_d=4.692 avg_d=1.462 std_dev=1.754
OP2	A	0, -0.311, 1.506, 3.324, 4.819 max_d=4.819 avg_d=1.506 std_dev=1.817
OP1	A	0, -0.327, 1.714, 3.756, 5.173 max_d=5.173 avg_d=1.714 std_dev=2.042

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.35	0.00	0.15	0.37	0.21	0.18
C2	0.02	0.00	0.37	0.17	0.01	0.25	0.01	0.30	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.24	0.33	0.39	0.19	0.25	0.36	0.23
C2'	0.00	0.37	0.00	0.00	0.20	0.01	0.10	0.18	0.18	0.18	0.29	0.36	0.13	0.09	0.02	0.00	0.03	0.02	0.49	0.88	0.78	0.68
C3'	0.01	0.17	0.00	0.00	0.24	0.01	0.35	0.01	0.34	0.39	0.26	0.13	0.40	0.43	0.25	0.02	0.01	0.02	0.19	0.66	0.29	0.36
C4	0.01	0.01	0.20	0.24	0.00	0.06	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.06	0.18	0.20	0.19	0.20	0.36	0.28
C4'	0.01	0.25	0.01	0.01	0.06	0.00	0.08	0.01	0.03	0.34	0.15	0.25	0.08	0.28	0.11	0.33	0.02	0.00	0.01	0.27	0.11	0.08
C5	0.01	0.01	0.10	0.35	0.00	0.08	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.25	0.04	0.08	0.31	0.34	0.60	0.49
C5'	0.05	0.30	0.18	0.01	0.09	0.01	0.12	0.00	0.07	0.41	0.18	0.29	0.13	0.36	0.10	0.14	0.23	0.02	0.01	0.07	0.16	0.01
C6	0.01	0.01	0.18	0.34	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.16	0.06	0.17	0.28	0.34	0.67	0.49
C8	0.01	0.01	0.18	0.39	0.00	0.34	0.01	0.41	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.54	0.16	0.24	0.46	0.41	0.53	0.56
N1	0.02	0.00	0.29	0.26	0.01	0.15	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.19	0.31	0.20	0.23	0.53	0.35
N3	0.02	0.00	0.36	0.13	0.00	0.25	0.01	0.29	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.27	0.37	0.39	0.20	0.30	0.26	0.20
N6	0.01	0.01	0.13	0.40	0.01	0.08	0.01	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.27	0.07	0.11	0.36	0.49	0.84	0.63
N7	0.01	0.01	0.09	0.43	0.00	0.28	0.00	0.36	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.50	0.17	0.13	0.49	0.54	0.75	0.68
N9	0.00	0.01	0.02	0.25	0.01	0.11	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.23	0.11	0.01	0.20	0.19	0.26	0.26
O2'	0.02	0.24	0.00	0.02	0.06	0.33	0.25	0.14	0.16	0.54	0.08	0.27	0.27	0.50	0.23	0.00	0.05	0.23	0.32	0.82	0.90	0.62
O3'	0.35	0.33	0.03	0.01	0.18	0.02	0.04	0.23	0.06	0.16	0.19	0.37	0.07	0.17	0.11	0.05	0.00	0.22	0.26	0.41	0.20	0.22
O4'	0.00	0.39	0.02	0.02	0.20	0.00	0.08	0.02	0.17	0.24	0.31	0.39	0.11	0.13	0.01	0.23	0.22	0.00	0.08	0.11	0.18	0.16
O5'	0.15	0.19	0.49	0.19	0.19	0.01	0.31	0.01	0.28	0.46	0.20	0.20	0.36	0.49	0.20	0.32	0.26	0.08	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.37	0.25	0.88	0.66	0.20	0.27	0.34	0.07	0.34	0.41	0.23	0.30	0.49	0.54	0.19	0.82	0.41	0.11	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.21	0.36	0.78	0.29	0.36	0.11	0.60	0.16	0.67	0.53	0.53	0.26	0.84	0.75	0.26	0.90	0.20	0.18	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.18	0.23	0.68	0.36	0.28	0.08	0.49	0.01	0.49	0.56	0.35	0.20	0.63	0.68	0.26	0.62	0.22	0.16	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.11	0.08	0.10	0.08	0.23	0.09	0.28	0.11	0.12	0.09	0.13	0.09	0.13	0.08	0.23	0.23	0.33	0.21	0.26
C2	0.07	0.09	0.07	0.07	0.10	0.07	0.08	0.07	0.08	0.07	0.10	0.09	0.08	0.12	0.10	0.09	0.06	0.08	0.11	0.08
C2'	0.54	0.53	0.57	0.52	0.57	0.44	0.57	0.34	0.56	0.55	0.54	0.49	0.57	0.50	0.57	0.49	0.38	0.23	0.37	0.32
C3'	0.22	0.15	0.25	0.41	0.18	0.41	0.22	0.51	0.24	0.20	0.15	0.12	0.19	0.51	0.17	0.28	0.52	0.70	0.56	0.57
C4	0.08	0.09	0.07	0.07	0.09	0.10	0.08	0.12	0.08	0.08	0.09	0.10	0.07	0.12	0.09	0.10	0.09	0.17	0.08	0.09
C4'	0.58	0.57	0.64	0.73	0.58	0.67	0.59	0.70	0.59	0.58	0.57	0.55	0.57	0.81	0.57	0.58	0.74	0.85	0.80	0.78
C5	0.07	0.09	0.07	0.07	0.09	0.08	0.08	0.10	0.07	0.07	0.10	0.09	0.07	0.12	0.10	0.08	0.07	0.14	0.07	0.06
C5'	0.61	0.65	0.73	0.84	0.68	0.70	0.68	0.74	0.66	0.65	0.67	0.63	0.64	0.96	0.68	0.59	0.82	0.97	0.92	0.87
C6	0.07	0.09	0.07	0.07	0.10	0.07	0.09	0.08	0.07	0.07	0.10	0.09	0.07	0.12	0.11	0.10	0.06	0.09	0.10	0.07
C8	0.09	0.09	0.07	0.08	0.09	0.13	0.08	0.17	0.08	0.09	0.09	0.10	0.07	0.13	0.09	0.12	0.13	0.24	0.12	0.15
N1	0.08	0.09	0.08	0.07	0.10	0.07	0.09	0.08	0.08	0.07	0.10	0.09	0.08	0.12	0.12	0.11	0.07	0.07	0.12	0.10
N3	0.08	0.09	0.06	0.07	0.09	0.09	0.08	0.10	0.08	0.08	0.09	0.10	0.07	0.12	0.09	0.10	0.07	0.14	0.08	0.08
N6	0.08	0.09	0.07	0.07	0.11	0.07	0.09	0.09	0.08	0.07	0.11	0.09	0.07	0.12	0.13	0.11	0.07	0.08	0.11	0.09
N7	0.07	0.09	0.07	0.08	0.09	0.10	0.08	0.13	0.08	0.08	0.10	0.10	0.07	0.13	0.10	0.09	0.09	0.18	0.08	0.09
N9	0.11	0.09	0.07	0.08	0.08	0.15	0.08	0.18	0.09	0.09	0.09	0.11	0.07	0.12	0.09	0.14	0.14	0.24	0.13	0.16
O2'	0.79	0.75	1.05	1.15	0.85	0.87	0.90	0.76	0.88	0.82	0.78	0.64	0.97	1.32	0.86	0.72	0.84	0.72	0.85	0.76
O3'	0.78	0.74	0.79	0.92	0.77	0.94	0.80	1.00	0.81	0.78	0.74	0.68	0.68	0.93	0.76	0.83	1.00	1.03	1.01	1.00
O4'	0.60	0.59	0.60	0.62	0.56	0.63	0.56	0.63	0.57	0.59	0.57	0.60	0.60	0.61	0.54	0.60	0.64	0.70	0.65	0.65
O5'	0.42	0.40	0.52	0.64	0.41	0.57	0.43	0.64	0.44	0.42	0.40	0.40	0.46	0.78	0.40	0.45	0.67	0.88	0.75	0.74
OP1	0.80	0.71	0.87	1.12	0.79	1.09	0.88	1.28	0.89	0.80	0.72	0.63	0.74	1.25	0.78	0.90	1.32	1.67	1.46	1.47
OP2	0.29	0.23	0.38	0.59	0.24	0.57	0.29	0.72	0.31	0.27	0.22	0.24	0.33	0.76	0.22	0.37	0.72	1.06	0.81	0.84
P	0.46	0.39	0.55	0.75	0.42	0.71	0.49	0.86	0.50	0.45	0.38	0.35	0.46	0.91	0.41	0.54	0.89	1.21	0.99	1.00

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.08	0.10	0.10
C2	0.01	0.00	0.06	0.07	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.08	0.01	0.02	0.10	0.13	0.19	0.18
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.06	0.01	0.07	0.01	0.07	0.02	0.05	0.11	0.00	0.02	0.07	0.01	0.03	0.08	0.08	0.06
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.10	0.00	0.12	0.02	0.11	0.05	0.08	0.11	0.02	0.01	0.12	0.01	0.05	0.12	0.08	0.06
C4	0.01	0.01	0.06	0.10	0.00	0.07	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.12	0.00	0.02	0.17	0.23	0.29	0.26
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.07	0.00	0.08	0.00	0.08	0.04	0.05	0.05	0.04	0.02	0.08	0.00	0.01	0.06	0.03	0.03
C5	0.01	0.01	0.07	0.12	0.00	0.08	0.00	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.15	0.01	0.03	0.18	0.24	0.28	0.26
C5'	0.01	0.06	0.01	0.02	0.12	0.00	0.13	0.00	0.11	0.06	0.09	0.05	0.04	0.03	0.13	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.07	0.11	0.01	0.08	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.13	0.01	0.03	0.15	0.18	0.20	0.21
N1	0.00	0.01	0.02	0.05	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.01	0.09	0.12	0.16	0.16
N3	0.01	0.00	0.05	0.08	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.09	0.01	0.02	0.14	0.18	0.25	0.22
O2	0.02	0.01	0.11	0.11	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.11	0.13	0.01	0.03	0.09	0.11	0.18	0.15
O2'	0.01	0.05	0.00	0.02	0.04	0.04	0.05	0.04	0.04	0.02	0.05	0.11	0.00	0.04	0.06	0.03	0.03	0.11	0.05	0.05
O3'	0.01	0.08	0.02	0.01	0.12	0.02	0.15	0.03	0.13	0.05	0.09	0.13	0.04	0.00	0.15	0.01	0.07	0.19	0.11	0.09
O4	0.02	0.01	0.07	0.12	0.00	0.08	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.15	0.00	0.03	0.18	0.26	0.32	0.28
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.03	0.00	0.05	0.10	0.09	0.10
O5'	0.04	0.10	0.03	0.05	0.17	0.01	0.18	0.01	0.15	0.09	0.14	0.09	0.03	0.07	0.18	0.05	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.08	0.13	0.08	0.12	0.23	0.06	0.24	0.05	0.18	0.12	0.18	0.11	0.11	0.19	0.26	0.10	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.10	0.19	0.08	0.08	0.29	0.03	0.28	0.02	0.20	0.16	0.25	0.18	0.05	0.11	0.32	0.09	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.18	0.06	0.06	0.26	0.03	0.26	0.01	0.21	0.16	0.22	0.15	0.05	0.09	0.28	0.10	0.00	0.01	0.01	0.00