Doublet Group distance statistics: 53513

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 6, 11, 14, 4, 4, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.010, 0.017, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.007, 0.016, 0.024, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.016 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.005, 0.015, 0.025, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.015 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.006, 0.017, 0.028, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.017 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.001, 0.012, 0.023, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.012 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.003, 0.014, 0.026, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.014 std_dev=0.011
N9	A	0, 0.008, 0.021, 0.034, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.021 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.004, 0.017, 0.031, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.017 std_dev=0.013
N7	A	0, 0.014, 0.032, 0.050, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.032 std_dev=0.018
N6	A	0, 0.016, 0.035, 0.055, 0.109 max_d=0.109 avg_d=0.035 std_dev=0.020
C8	A	0, 0.016, 0.038, 0.059, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.038 std_dev=0.022
C2'	A	0, 0.038, 0.154, 0.270, 0.500 max_d=0.500 avg_d=0.154 std_dev=0.116
O2'	A	0, 0.046, 0.166, 0.286, 0.596 max_d=0.596 avg_d=0.166 std_dev=0.120
O4'	A	0, 0.040, 0.178, 0.316, 0.631 max_d=0.631 avg_d=0.178 std_dev=0.138
N1	B	0, 0.114, 0.269, 0.424, 0.749 max_d=0.749 avg_d=0.269 std_dev=0.155
C2	B	0, 0.133, 0.288, 0.443, 0.758 max_d=0.758 avg_d=0.288 std_dev=0.155
C6	B	0, 0.135, 0.312, 0.489, 0.795 max_d=0.795 avg_d=0.312 std_dev=0.177
N3	B	0, 0.155, 0.347, 0.538, 0.942 max_d=0.942 avg_d=0.347 std_dev=0.192
C1'	B	0, 0.099, 0.296, 0.493, 0.790 max_d=0.790 avg_d=0.296 std_dev=0.197
C2'	B	0, 0.090, 0.293, 0.495, 0.816 max_d=0.816 avg_d=0.293 std_dev=0.202
C3'	A	0, 0.063, 0.270, 0.477, 0.834 max_d=0.834 avg_d=0.270 std_dev=0.207
C4'	A	0, 0.057, 0.265, 0.473, 0.909 max_d=0.909 avg_d=0.265 std_dev=0.208
O2	B	0, 0.140, 0.350, 0.560, 1.067 max_d=1.067 avg_d=0.350 std_dev=0.210
O2'	B	0, 0.093, 0.322, 0.552, 0.989 max_d=0.989 avg_d=0.322 std_dev=0.229
C5	B	0, 0.145, 0.375, 0.605, 0.940 max_d=0.940 avg_d=0.375 std_dev=0.230
C3'	B	0, 0.099, 0.329, 0.559, 1.047 max_d=1.047 avg_d=0.329 std_dev=0.230
O4'	B	0, 0.097, 0.329, 0.561, 1.010 max_d=1.010 avg_d=0.329 std_dev=0.232
C4	B	0, 0.183, 0.417, 0.650, 1.056 max_d=1.056 avg_d=0.417 std_dev=0.234
C4'	B	0, 0.091, 0.332, 0.574, 1.172 max_d=1.172 avg_d=0.332 std_dev=0.241
O3'	B	0, 0.105, 0.360, 0.616, 1.193 max_d=1.193 avg_d=0.360 std_dev=0.255
O5'	B	0, 0.139, 0.411, 0.684, 1.136 max_d=1.136 avg_d=0.411 std_dev=0.273
OP2	B	0, 0.241, 0.526, 0.812, 1.671 max_d=1.671 avg_d=0.526 std_dev=0.286
C5'	B	0, 0.108, 0.395, 0.682, 1.467 max_d=1.467 avg_d=0.395 std_dev=0.287
P	B	0, 0.162, 0.473, 0.783, 1.611 max_d=1.611 avg_d=0.473 std_dev=0.310
O3'	A	0, 0.094, 0.415, 0.736, 1.307 max_d=1.307 avg_d=0.415 std_dev=0.321
O4	B	0, 0.274, 0.618, 0.961, 1.454 max_d=1.454 avg_d=0.618 std_dev=0.343
C5'	A	0, 0.102, 0.448, 0.794, 1.427 max_d=1.427 avg_d=0.448 std_dev=0.346
OP1	B	0, 0.216, 0.596, 0.977, 1.911 max_d=1.911 avg_d=0.596 std_dev=0.381
O5'	A	0, 0.129, 0.779, 1.428, 3.271 max_d=3.271 avg_d=0.779 std_dev=0.650
P	A	0, 0.055, 1.215, 2.374, 4.312 max_d=4.312 avg_d=1.215 std_dev=1.159
OP1	A	0, 0.084, 1.281, 2.477, 4.055 max_d=4.055 avg_d=1.281 std_dev=1.196
OP2	A	0, -0.198, 1.604, 3.406, 6.956 max_d=6.956 avg_d=1.604 std_dev=1.802

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.23	0.16	0.35	0.25
C2	0.03	0.00	0.09	0.10	0.01	0.03	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.13	0.04	0.39	0.29	0.74	0.50
C2'	0.00	0.09	0.00	0.01	0.05	0.01	0.05	0.02	0.06	0.04	0.08	0.08	0.06	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.17	0.23	0.20	0.10
C3'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.09	0.08	0.10	0.09	0.10	0.09	0.05	0.02	0.01	0.01	0.21	0.36	0.26	0.17
C4	0.01	0.01	0.05	0.07	0.00	0.03	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.05	0.09	0.02	0.41	0.30	0.74	0.51
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.05	0.07	0.04	0.03	0.06	0.07	0.04	0.04	0.02	0.00	0.01	0.16	0.34	0.10
C5	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.05	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.10	0.02	0.50	0.45	1.00	0.66
C5'	0.04	0.09	0.02	0.01	0.10	0.00	0.14	0.00	0.14	0.16	0.12	0.08	0.16	0.17	0.10	0.05	0.04	0.02	0.01	0.22	0.26	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.09	0.01	0.05	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.06	0.12	0.03	0.51	0.47	1.07	0.69
C8	0.01	0.01	0.04	0.08	0.01	0.07	0.01	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.02	0.09	0.03	0.53	0.44	0.93	0.64
N1	0.02	0.00	0.08	0.10	0.01	0.04	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.14	0.04	0.46	0.39	0.93	0.61
N3	0.03	0.00	0.08	0.09	0.00	0.03	0.01	0.08	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.08	0.11	0.04	0.35	0.23	0.62	0.42
N6	0.02	0.01	0.06	0.10	0.02	0.06	0.01	0.16	0.00	0.03	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.06	0.14	0.03	0.54	0.56	1.23	0.78
N7	0.01	0.01	0.04	0.09	0.01	0.07	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.10	0.03	0.56	0.54	1.15	0.75
N9	0.00	0.01	0.02	0.05	0.00	0.04	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.40	0.28	0.64	0.46
O2'	0.01	0.09	0.00	0.02	0.05	0.04	0.04	0.05	0.06	0.02	0.08	0.08	0.06	0.02	0.02	0.00	0.04	0.04	0.06	0.29	0.39	0.12
O3'	0.02	0.13	0.02	0.01	0.09	0.02	0.10	0.04	0.12	0.09	0.14	0.11	0.14	0.10	0.05	0.04	0.00	0.02	0.26	0.52	0.58	0.34
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.03	0.04	0.04	0.03	0.03	0.01	0.04	0.02	0.00	0.21	0.20	0.35	0.26
O5'	0.23	0.39	0.17	0.21	0.41	0.01	0.50	0.01	0.51	0.53	0.46	0.35	0.54	0.56	0.40	0.06	0.26	0.21	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.16	0.29	0.23	0.36	0.30	0.16	0.45	0.22	0.47	0.44	0.39	0.23	0.56	0.54	0.28	0.29	0.52	0.20	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.35	0.74	0.20	0.26	0.74	0.34	1.00	0.26	1.07	0.93	0.93	0.62	1.23	1.15	0.64	0.39	0.58	0.35	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.25	0.50	0.10	0.17	0.51	0.10	0.66	0.02	0.69	0.64	0.61	0.42	0.78	0.75	0.46	0.12	0.34	0.26	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.15	0.14	0.15	0.13	0.18	0.12	0.19	0.13	0.14	0.15	0.18	0.14	0.21	0.13	0.19	0.17	0.22	0.15	0.18
C2	0.12	0.13	0.12	0.11	0.14	0.13	0.14	0.14	0.14	0.13	0.14	0.14	0.12	0.13	0.15	0.15	0.13	0.14	0.15	0.14
C2'	0.13	0.10	0.09	0.12	0.11	0.18	0.12	0.21	0.13	0.11	0.10	0.11	0.11	0.18	0.11	0.18	0.19	0.25	0.18	0.21
C3'	0.14	0.11	0.08	0.12	0.11	0.19	0.13	0.24	0.15	0.12	0.11	0.12	0.10	0.20	0.12	0.20	0.21	0.30	0.22	0.25
C4	0.12	0.13	0.10	0.11	0.13	0.14	0.12	0.15	0.13	0.12	0.14	0.15	0.11	0.15	0.14	0.16	0.13	0.16	0.13	0.14
C4'	0.13	0.12	0.13	0.16	0.10	0.18	0.11	0.22	0.12	0.11	0.12	0.16	0.12	0.24	0.12	0.18	0.19	0.30	0.19	0.23
C5	0.12	0.13	0.10	0.10	0.14	0.13	0.13	0.15	0.13	0.12	0.14	0.14	0.11	0.15	0.14	0.15	0.13	0.16	0.14	0.14
C5'	0.14	0.14	0.13	0.16	0.11	0.18	0.11	0.22	0.12	0.12	0.14	0.19	0.13	0.24	0.12	0.18	0.19	0.32	0.20	0.24
C6	0.12	0.13	0.11	0.11	0.15	0.13	0.14	0.14	0.14	0.12	0.14	0.13	0.12	0.14	0.16	0.15	0.13	0.15	0.15	0.14
C8	0.13	0.14	0.11	0.13	0.13	0.15	0.12	0.17	0.13	0.12	0.14	0.16	0.11	0.19	0.13	0.16	0.15	0.20	0.14	0.16
N1	0.12	0.13	0.12	0.11	0.15	0.13	0.15	0.14	0.14	0.13	0.15	0.13	0.12	0.13	0.16	0.15	0.14	0.15	0.16	0.15
N3	0.12	0.14	0.10	0.10	0.13	0.13	0.13	0.14	0.13	0.12	0.14	0.15	0.11	0.13	0.14	0.16	0.13	0.15	0.13	0.13
N6	0.12	0.13	0.11	0.11	0.15	0.13	0.15	0.15	0.14	0.13	0.15	0.13	0.12	0.14	0.17	0.15	0.14	0.16	0.16	0.15
N7	0.12	0.13	0.10	0.11	0.13	0.14	0.13	0.15	0.13	0.12	0.14	0.15	0.11	0.17	0.14	0.15	0.14	0.17	0.13	0.14
N9	0.13	0.14	0.11	0.13	0.12	0.16	0.12	0.17	0.13	0.13	0.14	0.16	0.12	0.18	0.13	0.17	0.15	0.19	0.14	0.16
O2'	0.11	0.07	0.08	0.13	0.09	0.18	0.10	0.21	0.11	0.09	0.08	0.10	0.09	0.19	0.09	0.16	0.19	0.25	0.18	0.21
O3'	0.15	0.12	0.09	0.14	0.14	0.21	0.17	0.28	0.18	0.15	0.12	0.12	0.11	0.23	0.14	0.22	0.26	0.36	0.28	0.31
O4'	0.18	0.19	0.18	0.20	0.15	0.19	0.14	0.21	0.15	0.16	0.18	0.23	0.18	0.25	0.16	0.19	0.19	0.26	0.18	0.20
O5'	0.24	0.27	0.20	0.17	0.21	0.19	0.19	0.22	0.20	0.23	0.25	0.33	0.22	0.24	0.20	0.24	0.20	0.32	0.20	0.24
OP1	0.25	0.20	0.25	0.30	0.25	0.31	0.31	0.38	0.31	0.24	0.20	0.22	0.22	0.37	0.25	0.31	0.37	0.55	0.42	0.43
OP2	0.36	0.46	0.39	0.47	0.40	0.42	0.37	0.54	0.36	0.38	0.46	0.55	0.37	0.61	0.41	0.35	0.57	0.80	0.62	0.65
P	0.24	0.31	0.24	0.25	0.23	0.20	0.20	0.26	0.21	0.24	0.30	0.40	0.25	0.36	0.23	0.22	0.27	0.44	0.30	0.33

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.00	0.05	0.05	0.09	0.05
C2	0.02	0.00	0.07	0.09	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.11	0.01	0.03	0.08	0.09	0.14	0.10
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.09	0.02	0.09	0.02	0.08	0.04	0.08	0.09	0.00	0.02	0.11	0.01	0.05	0.07	0.07	0.05
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.16	0.00	0.16	0.02	0.14	0.08	0.13	0.09	0.02	0.01	0.18	0.01	0.06	0.09	0.07	0.06
C4	0.01	0.01	0.09	0.16	0.00	0.06	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.21	0.00	0.03	0.13	0.15	0.20	0.16
C4'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.06	0.04	0.05	0.04	0.05	0.03	0.07	0.00	0.02	0.07	0.03	0.02
C5	0.01	0.01	0.09	0.16	0.01	0.07	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.21	0.01	0.04	0.14	0.16	0.19	0.17
C5'	0.02	0.05	0.02	0.02	0.09	0.01	0.10	0.00	0.09	0.05	0.07	0.04	0.06	0.04	0.10	0.01	0.01	0.07	0.02	0.02
C6	0.01	0.01	0.08	0.14	0.01	0.06	0.00	0.09	0.00	0.01	0.02	0.01	0.05	0.17	0.01	0.04	0.12	0.12	0.14	0.13
N1	0.01	0.01	0.04	0.08	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.09	0.01	0.02	0.08	0.08	0.12	0.09
N3	0.01	0.00	0.08	0.13	0.00	0.05	0.01	0.07	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.17	0.01	0.03	0.11	0.12	0.18	0.14
O2	0.04	0.00	0.09	0.09	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.11	0.01	0.06	0.07	0.08	0.12	0.08
O2'	0.01	0.05	0.00	0.02	0.05	0.05	0.06	0.06	0.05	0.02	0.05	0.09	0.00	0.04	0.07	0.03	0.05	0.10	0.06	0.05
O3'	0.02	0.11	0.02	0.01	0.21	0.03	0.21	0.04	0.17	0.09	0.17	0.11	0.04	0.00	0.25	0.02	0.09	0.15	0.13	0.11
O4	0.01	0.01	0.11	0.18	0.00	0.07	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.25	0.00	0.04	0.14	0.18	0.23	0.18
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.03	0.06	0.03	0.02	0.04	0.00	0.05	0.06	0.08	0.05
O5'	0.05	0.08	0.05	0.06	0.13	0.02	0.14	0.01	0.12	0.08	0.11	0.07	0.05	0.09	0.14	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.05	0.09	0.07	0.09	0.15	0.07	0.16	0.07	0.12	0.08	0.12	0.08	0.10	0.15	0.18	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.09	0.14	0.07	0.07	0.20	0.03	0.19	0.02	0.14	0.12	0.18	0.12	0.06	0.13	0.23	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.10	0.05	0.06	0.16	0.02	0.17	0.02	0.13	0.09	0.14	0.08	0.05	0.11	0.18	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00