Doublet Group distance statistics: 53514

back

Distances from reference structure (by RMSD)

4, 14, 10, 7, 3, 1, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.012, 0.020, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.012 std_dev=0.008
C2	A	0, -0.001, 0.008, 0.016, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.008 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.003, 0.015, 0.027, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.015 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.004, 0.018, 0.032, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.018 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.005, 0.019, 0.033, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.019 std_dev=0.014
C5	A	0, 0.005, 0.021, 0.037, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.021 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.005, 0.025, 0.045, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.025 std_dev=0.020
N9	A	0, 0.003, 0.030, 0.056, 0.109 max_d=0.109 avg_d=0.030 std_dev=0.026
N6	A	0, 0.007, 0.037, 0.067, 0.130 max_d=0.130 avg_d=0.037 std_dev=0.030
N7	A	0, 0.010, 0.047, 0.083, 0.139 max_d=0.139 avg_d=0.047 std_dev=0.037
C8	A	0, 0.009, 0.053, 0.096, 0.171 max_d=0.171 avg_d=0.053 std_dev=0.044
O2'	A	0, 0.027, 0.125, 0.223, 0.371 max_d=0.371 avg_d=0.125 std_dev=0.098
C2'	A	0, -0.021, 0.098, 0.216, 0.456 max_d=0.456 avg_d=0.098 std_dev=0.119
N1	B	0, 0.113, 0.239, 0.366, 0.524 max_d=0.524 avg_d=0.239 std_dev=0.127
O4'	A	0, -0.038, 0.095, 0.228, 0.538 max_d=0.538 avg_d=0.095 std_dev=0.133
C2	B	0, 0.122, 0.267, 0.412, 0.642 max_d=0.642 avg_d=0.267 std_dev=0.145
O2	B	0, 0.119, 0.273, 0.428, 0.659 max_d=0.659 avg_d=0.273 std_dev=0.155
C1'	B	0, 0.081, 0.237, 0.394, 0.765 max_d=0.765 avg_d=0.237 std_dev=0.157
C6	B	0, 0.103, 0.262, 0.420, 0.661 max_d=0.661 avg_d=0.262 std_dev=0.159
C5	B	0, 0.099, 0.292, 0.484, 0.851 max_d=0.851 avg_d=0.292 std_dev=0.193
N3	B	0, 0.111, 0.323, 0.535, 0.948 max_d=0.948 avg_d=0.323 std_dev=0.212
C4	B	0, 0.114, 0.336, 0.558, 0.976 max_d=0.976 avg_d=0.336 std_dev=0.222
C2'	B	0, 0.039, 0.270, 0.501, 1.187 max_d=1.187 avg_d=0.270 std_dev=0.231
C4'	A	0, -0.085, 0.167, 0.418, 1.079 max_d=1.079 avg_d=0.167 std_dev=0.251
C3'	A	0, -0.074, 0.190, 0.453, 1.093 max_d=1.093 avg_d=0.190 std_dev=0.263
O4	B	0, 0.128, 0.397, 0.666, 1.203 max_d=1.203 avg_d=0.397 std_dev=0.269
O4'	B	0, 0.008, 0.288, 0.569, 1.380 max_d=1.380 avg_d=0.288 std_dev=0.281
O2'	B	0, -0.009, 0.288, 0.585, 1.432 max_d=1.432 avg_d=0.288 std_dev=0.297
C3'	B	0, -0.009, 0.336, 0.680, 1.750 max_d=1.750 avg_d=0.336 std_dev=0.345
C5'	A	0, -0.112, 0.242, 0.595, 1.585 max_d=1.585 avg_d=0.242 std_dev=0.353
C4'	B	0, -0.041, 0.330, 0.702, 1.859 max_d=1.859 avg_d=0.330 std_dev=0.372
O3'	A	0, -0.120, 0.303, 0.725, 1.718 max_d=1.718 avg_d=0.303 std_dev=0.422
O3'	B	0, -0.076, 0.418, 0.913, 2.282 max_d=2.282 avg_d=0.418 std_dev=0.495
C5'	B	0, -0.119, 0.419, 0.956, 2.392 max_d=2.392 avg_d=0.419 std_dev=0.538
O5'	B	0, -0.096, 0.446, 0.987, 2.291 max_d=2.291 avg_d=0.446 std_dev=0.542
OP2	B	0, -0.071, 0.553, 1.177, 2.533 max_d=2.533 avg_d=0.553 std_dev=0.624
O5'	A	0, -0.367, 0.362, 1.092, 3.922 max_d=3.922 avg_d=0.362 std_dev=0.730
P	B	0, -0.174, 0.556, 1.287, 3.130 max_d=3.130 avg_d=0.556 std_dev=0.730
P	A	0, -0.530, 0.500, 1.530, 5.614 max_d=5.614 avg_d=0.500 std_dev=1.030
OP1	B	0, -0.317, 0.733, 1.783, 4.206 max_d=4.206 avg_d=0.733 std_dev=1.050
OP1	A	0, -0.572, 0.708, 1.989, 6.435 max_d=6.435 avg_d=0.708 std_dev=1.280
OP2	A	0, -0.748, 0.851, 2.450, 8.269 max_d=8.269 avg_d=0.851 std_dev=1.599

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.04	0.02	0.01	0.20	0.24	0.23	0.16
C2	0.02	0.00	0.10	0.13	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.15	0.05	0.34	0.37	0.64	0.34
C2'	0.00	0.10	0.00	0.01	0.07	0.01	0.06	0.01	0.08	0.04	0.10	0.09	0.07	0.04	0.03	0.00	0.02	0.01	0.12	0.10	0.19	0.12
C3'	0.01	0.13	0.01	0.00	0.11	0.01	0.14	0.01	0.15	0.11	0.15	0.11	0.16	0.13	0.08	0.02	0.01	0.01	0.09	0.14	0.23	0.10
C4	0.01	0.01	0.07	0.11	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.12	0.03	0.38	0.37	0.65	0.38
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.04	0.00	0.06	0.00	0.06	0.08	0.04	0.03	0.07	0.08	0.04	0.07	0.02	0.00	0.02	0.15	0.20	0.05
C5	0.01	0.01	0.06	0.14	0.01	0.06	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.15	0.03	0.48	0.48	0.90	0.52
C5'	0.02	0.03	0.01	0.01	0.04	0.00	0.08	0.00	0.08	0.10	0.05	0.02	0.10	0.11	0.05	0.07	0.02	0.01	0.01	0.15	0.29	0.01
C6	0.01	0.01	0.08	0.15	0.01	0.06	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.18	0.04	0.49	0.50	0.95	0.54
C8	0.02	0.01	0.04	0.11	0.01	0.08	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.12	0.05	0.51	0.48	0.84	0.54
N1	0.02	0.00	0.10	0.15	0.01	0.04	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.07	0.18	0.05	0.42	0.44	0.82	0.45
N3	0.02	0.01	0.09	0.11	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.12	0.04	0.30	0.33	0.52	0.28
N6	0.02	0.01	0.07	0.16	0.01	0.07	0.01	0.10	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.04	0.20	0.05	0.54	0.58	1.11	0.63
N7	0.02	0.01	0.04	0.13	0.01	0.08	0.00	0.11	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.16	0.04	0.55	0.56	1.04	0.63
N9	0.01	0.01	0.03	0.08	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.07	0.03	0.37	0.34	0.56	0.36
O2'	0.04	0.08	0.00	0.02	0.04	0.07	0.04	0.07	0.05	0.04	0.07	0.07	0.04	0.03	0.03	0.00	0.06	0.08	0.03	0.18	0.18	0.06
O3'	0.02	0.15	0.02	0.01	0.12	0.02	0.15	0.02	0.18	0.12	0.18	0.12	0.20	0.16	0.07	0.06	0.00	0.02	0.14	0.32	0.35	0.11
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.05	0.05	0.04	0.05	0.04	0.03	0.08	0.02	0.00	0.17	0.27	0.13	0.11
O5'	0.20	0.34	0.12	0.09	0.38	0.02	0.48	0.01	0.49	0.51	0.42	0.30	0.54	0.55	0.37	0.03	0.14	0.17	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.24	0.37	0.10	0.14	0.37	0.15	0.48	0.15	0.50	0.48	0.44	0.33	0.58	0.56	0.34	0.18	0.32	0.27	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.23	0.64	0.19	0.23	0.65	0.20	0.90	0.29	0.95	0.84	0.82	0.52	1.11	1.04	0.56	0.18	0.35	0.13	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.16	0.34	0.12	0.10	0.38	0.05	0.52	0.01	0.54	0.54	0.45	0.28	0.63	0.63	0.36	0.06	0.11	0.11	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.12	0.10	0.11	0.11	0.13	0.11	0.15	0.11	0.11	0.13	0.15	0.11	0.15	0.12	0.17	0.12	0.19	0.15	0.13
C2	0.15	0.12	0.16	0.16	0.13	0.15	0.12	0.15	0.12	0.12	0.14	0.14	0.15	0.21	0.14	0.18	0.17	0.19	0.15	0.13
C2'	0.12	0.10	0.15	0.15	0.11	0.16	0.13	0.18	0.13	0.11	0.10	0.11	0.22	0.21	0.11	0.17	0.15	0.19	0.16	0.15
C3'	0.14	0.10	0.14	0.14	0.12	0.18	0.15	0.22	0.16	0.13	0.10	0.10	0.20	0.19	0.12	0.20	0.18	0.22	0.18	0.19
C4	0.11	0.13	0.11	0.11	0.13	0.13	0.11	0.14	0.11	0.10	0.14	0.15	0.10	0.16	0.14	0.15	0.11	0.15	0.14	0.11
C4'	0.12	0.11	0.10	0.12	0.11	0.16	0.12	0.20	0.13	0.11	0.11	0.13	0.12	0.15	0.11	0.18	0.16	0.23	0.16	0.17
C5	0.12	0.14	0.12	0.12	0.14	0.14	0.12	0.16	0.12	0.11	0.16	0.16	0.11	0.17	0.16	0.16	0.12	0.14	0.15	0.13
C5'	0.12	0.11	0.09	0.12	0.10	0.16	0.12	0.21	0.13	0.10	0.11	0.14	0.11	0.16	0.11	0.18	0.17	0.25	0.17	0.19
C6	0.14	0.15	0.14	0.13	0.16	0.15	0.14	0.17	0.13	0.13	0.17	0.16	0.12	0.19	0.17	0.19	0.15	0.15	0.16	0.14
C8	0.10	0.14	0.11	0.11	0.14	0.12	0.12	0.14	0.11	0.11	0.15	0.16	0.12	0.15	0.15	0.14	0.12	0.14	0.16	0.13
N1	0.15	0.14	0.16	0.15	0.15	0.16	0.14	0.17	0.14	0.13	0.16	0.15	0.14	0.20	0.17	0.20	0.17	0.17	0.16	0.14
N3	0.12	0.12	0.13	0.13	0.12	0.14	0.11	0.14	0.11	0.10	0.13	0.14	0.11	0.19	0.13	0.16	0.14	0.19	0.14	0.12
N6	0.14	0.15	0.15	0.13	0.17	0.17	0.15	0.19	0.14	0.14	0.18	0.16	0.13	0.18	0.19	0.20	0.16	0.16	0.17	0.17
N7	0.11	0.14	0.12	0.11	0.15	0.13	0.13	0.16	0.12	0.11	0.16	0.16	0.11	0.16	0.16	0.15	0.12	0.14	0.16	0.14
N9	0.11	0.13	0.10	0.11	0.13	0.12	0.11	0.13	0.11	0.11	0.14	0.16	0.11	0.15	0.14	0.14	0.11	0.15	0.15	0.12
O2'	0.18	0.17	0.13	0.13	0.17	0.18	0.18	0.19	0.19	0.17	0.16	0.17	0.19	0.21	0.17	0.25	0.16	0.20	0.17	0.17
O3'	0.17	0.14	0.15	0.16	0.17	0.21	0.20	0.26	0.20	0.17	0.14	0.12	0.20	0.20	0.16	0.23	0.22	0.27	0.22	0.24
O4'	0.13	0.14	0.11	0.12	0.13	0.15	0.12	0.17	0.12	0.12	0.15	0.17	0.10	0.15	0.14	0.17	0.14	0.22	0.15	0.15
O5'	0.17	0.21	0.14	0.12	0.19	0.17	0.17	0.23	0.17	0.17	0.22	0.25	0.17	0.18	0.20	0.20	0.18	0.32	0.20	0.23
OP1	0.28	0.31	0.32	0.37	0.30	0.36	0.29	0.43	0.29	0.28	0.32	0.35	0.30	0.45	0.31	0.31	0.39	0.58	0.41	0.45
OP2	0.28	0.34	0.22	0.28	0.32	0.30	0.30	0.38	0.30	0.29	0.35	0.39	0.24	0.38	0.33	0.31	0.39	0.53	0.43	0.46
P	0.19	0.22	0.15	0.21	0.21	0.22	0.21	0.27	0.21	0.19	0.23	0.25	0.15	0.30	0.22	0.23	0.27	0.40	0.30	0.31

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.05	0.04	0.01	0.00	0.08	0.07	0.13	0.05
C2	0.01	0.00	0.09	0.10	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.13	0.01	0.02	0.18	0.16	0.13	0.10
C2'	0.00	0.09	0.00	0.01	0.05	0.02	0.05	0.01	0.05	0.04	0.08	0.14	0.00	0.04	0.06	0.01	0.10	0.17	0.08	0.06
C3'	0.02	0.10	0.01	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.09	0.05	0.09	0.13	0.02	0.01	0.07	0.01	0.14	0.23	0.06	0.10
C4	0.01	0.01	0.05	0.07	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.09	0.00	0.02	0.27	0.22	0.19	0.17
C4'	0.00	0.03	0.02	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.05	0.02	0.03	0.04	0.08	0.01	0.04	0.00	0.01	0.09	0.14	0.04
C5	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.10	0.01	0.03	0.28	0.20	0.17	0.17
C5'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.07	0.00	0.08	0.00	0.07	0.04	0.06	0.05	0.07	0.03	0.08	0.01	0.01	0.11	0.15	0.02
C6	0.01	0.01	0.05	0.09	0.01	0.05	0.00	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.10	0.01	0.03	0.24	0.15	0.12	0.12
N1	0.00	0.01	0.04	0.05	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.01	0.17	0.13	0.11	0.08
N3	0.01	0.01	0.08	0.09	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.12	0.01	0.02	0.23	0.20	0.16	0.14
O2	0.02	0.00	0.14	0.13	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.13	0.18	0.02	0.03	0.15	0.16	0.14	0.09
O2'	0.05	0.07	0.00	0.02	0.04	0.08	0.03	0.07	0.04	0.02	0.07	0.13	0.00	0.09	0.06	0.08	0.04	0.12	0.09	0.03
O3'	0.04	0.13	0.04	0.01	0.09	0.01	0.10	0.03	0.10	0.06	0.12	0.18	0.09	0.00	0.09	0.02	0.13	0.28	0.08	0.12
O4	0.01	0.01	0.06	0.07	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.09	0.00	0.02	0.28	0.24	0.22	0.20
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.08	0.02	0.02	0.00	0.05	0.05	0.19	0.10
O5'	0.08	0.18	0.10	0.14	0.27	0.01	0.28	0.01	0.24	0.17	0.23	0.15	0.04	0.13	0.28	0.05	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.07	0.16	0.17	0.23	0.22	0.09	0.20	0.11	0.15	0.13	0.20	0.16	0.12	0.28	0.24	0.05	0.02	0.00	0.02	0.00
OP2	0.13	0.13	0.08	0.06	0.19	0.14	0.17	0.15	0.12	0.11	0.16	0.14	0.09	0.08	0.22	0.19	0.02	0.02	0.00	0.00
P	0.05	0.10	0.06	0.10	0.17	0.04	0.17	0.02	0.12	0.08	0.14	0.09	0.03	0.12	0.20	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00