Doublet Group distance statistics: 53515

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 8, 10, 7, 5, 6, 1, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.010, 0.017, 0.023, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.017 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.008, 0.014, 0.020, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.014, 0.022, 0.030, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.022 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.014, 0.025, 0.036, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.025 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.022, 0.033, 0.045, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.033 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.019, 0.031, 0.043, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.031 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.020, 0.034, 0.049, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.034 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.028, 0.043, 0.058, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.043 std_dev=0.015
N6	A	0, 0.035, 0.057, 0.079, 0.120 max_d=0.120 avg_d=0.057 std_dev=0.022
N7	A	0, 0.059, 0.084, 0.110, 0.130 max_d=0.130 avg_d=0.084 std_dev=0.026
C8	A	0, 0.058, 0.089, 0.120, 0.149 max_d=0.149 avg_d=0.089 std_dev=0.031
O4'	A	0, 0.029, 0.076, 0.123, 0.228 max_d=0.228 avg_d=0.076 std_dev=0.047
C2'	A	0, 0.018, 0.081, 0.145, 0.302 max_d=0.302 avg_d=0.081 std_dev=0.064
C4'	A	0, 0.075, 0.157, 0.239, 0.440 max_d=0.440 avg_d=0.157 std_dev=0.082
C3'	A	0, 0.062, 0.153, 0.243, 0.448 max_d=0.448 avg_d=0.153 std_dev=0.091
O2'	A	0, 0.069, 0.166, 0.262, 0.395 max_d=0.395 avg_d=0.166 std_dev=0.096
O3'	A	0, 0.077, 0.196, 0.314, 0.684 max_d=0.684 avg_d=0.196 std_dev=0.119
O2'	B	0, 0.063, 0.245, 0.428, 0.880 max_d=0.880 avg_d=0.245 std_dev=0.182
N1	B	0, 0.116, 0.307, 0.499, 0.740 max_d=0.740 avg_d=0.307 std_dev=0.192
C2'	B	0, 0.069, 0.262, 0.455, 0.759 max_d=0.759 avg_d=0.262 std_dev=0.193
C1'	B	0, 0.089, 0.289, 0.488, 0.774 max_d=0.774 avg_d=0.289 std_dev=0.199
C4	B	0, 0.196, 0.405, 0.613, 0.836 max_d=0.836 avg_d=0.405 std_dev=0.209
C5'	A	0, 0.089, 0.298, 0.508, 1.110 max_d=1.110 avg_d=0.298 std_dev=0.209
C6	B	0, 0.193, 0.406, 0.618, 0.908 max_d=0.908 avg_d=0.406 std_dev=0.213
N3	B	0, 0.129, 0.347, 0.565, 0.945 max_d=0.945 avg_d=0.347 std_dev=0.218
C2	B	0, 0.075, 0.294, 0.514, 0.928 max_d=0.928 avg_d=0.294 std_dev=0.220
C5	B	0, 0.215, 0.445, 0.674, 1.047 max_d=1.047 avg_d=0.445 std_dev=0.229
O4	B	0, 0.241, 0.490, 0.739, 0.947 max_d=0.947 avg_d=0.490 std_dev=0.249
O2	B	0, 0.052, 0.334, 0.616, 1.172 max_d=1.172 avg_d=0.334 std_dev=0.282
O4'	B	0, -0.001, 0.385, 0.771, 1.603 max_d=1.603 avg_d=0.385 std_dev=0.386
C3'	B	0, -0.076, 0.360, 0.795, 1.787 max_d=1.787 avg_d=0.360 std_dev=0.435
C4'	B	0, -0.115, 0.408, 0.931, 2.144 max_d=2.144 avg_d=0.408 std_dev=0.523
O3'	B	0, -0.175, 0.400, 0.975, 2.296 max_d=2.296 avg_d=0.400 std_dev=0.575
O5'	A	0, -0.145, 0.520, 1.185, 3.025 max_d=3.025 avg_d=0.520 std_dev=0.665
OP1	A	0, 0.067, 0.808, 1.549, 3.174 max_d=3.174 avg_d=0.808 std_dev=0.741
C5'	B	0, -0.268, 0.542, 1.352, 3.268 max_d=3.268 avg_d=0.542 std_dev=0.810
P	A	0, -0.165, 0.696, 1.557, 4.136 max_d=4.136 avg_d=0.696 std_dev=0.861
O5'	B	0, -0.587, 0.771, 2.130, 5.625 max_d=5.625 avg_d=0.771 std_dev=1.359
OP2	A	0, -0.389, 1.128, 2.644, 6.536 max_d=6.536 avg_d=1.128 std_dev=1.517
P	B	0, -0.820, 0.949, 2.718, 7.319 max_d=7.319 avg_d=0.949 std_dev=1.769
OP2	B	0, -0.783, 1.125, 3.034, 7.720 max_d=7.720 avg_d=1.125 std_dev=1.908
OP1	B	0, -0.838, 1.162, 3.163, 8.091 max_d=8.091 avg_d=1.162 std_dev=2.000

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.13	0.33	0.21	0.16
C2	0.02	0.00	0.05	0.06	0.01	0.03	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.06	0.06	0.02	0.20	0.46	0.36	0.26
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.04	0.04	0.05	0.04	0.04	0.02	0.00	0.02	0.00	0.17	0.20	0.24	0.17
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.04	0.00	0.05	0.03	0.06	0.05	0.06	0.06	0.07	0.05	0.03	0.01	0.00	0.01	0.28	0.16	0.38	0.25
C4	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.03	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.03	0.01	0.21	0.47	0.38	0.26
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.04	0.05	0.04	0.03	0.06	0.05	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.12	0.05	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.04	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.05	0.01	0.27	0.54	0.50	0.32
C5'	0.03	0.09	0.02	0.03	0.09	0.00	0.12	0.00	0.13	0.13	0.11	0.07	0.15	0.14	0.08	0.03	0.04	0.01	0.01	0.08	0.11	0.01
C6	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.04	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.06	0.02	0.27	0.55	0.53	0.34
C8	0.01	0.01	0.04	0.05	0.01	0.05	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.03	0.06	0.03	0.28	0.53	0.49	0.32
N1	0.02	0.00	0.04	0.06	0.01	0.04	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.06	0.02	0.24	0.51	0.46	0.31
N3	0.02	0.00	0.05	0.06	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.06	0.02	0.17	0.43	0.31	0.22
N6	0.02	0.01	0.04	0.07	0.02	0.06	0.02	0.15	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.05	0.08	0.03	0.30	0.58	0.61	0.37
N7	0.01	0.01	0.04	0.05	0.01	0.05	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03	0.06	0.02	0.31	0.58	0.58	0.36
N9	0.00	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.21	0.45	0.35	0.25
O2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.04	0.03	0.04	0.03	0.05	0.03	0.06	0.06	0.05	0.03	0.02	0.00	0.04	0.02	0.07	0.16	0.11	0.08
O3'	0.01	0.06	0.02	0.00	0.03	0.02	0.05	0.04	0.06	0.06	0.06	0.06	0.08	0.06	0.03	0.04	0.00	0.01	0.35	0.24	0.53	0.34
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.19	0.32	0.27	0.19
O5'	0.13	0.20	0.17	0.28	0.21	0.01	0.27	0.01	0.27	0.28	0.24	0.17	0.30	0.31	0.21	0.07	0.35	0.19	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.33	0.46	0.20	0.16	0.47	0.12	0.54	0.08	0.55	0.53	0.51	0.43	0.58	0.58	0.45	0.16	0.24	0.32	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.21	0.36	0.24	0.38	0.38	0.05	0.50	0.11	0.53	0.49	0.46	0.31	0.61	0.58	0.35	0.11	0.53	0.27	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.16	0.26	0.17	0.25	0.26	0.02	0.32	0.01	0.34	0.32	0.31	0.22	0.37	0.36	0.25	0.08	0.34	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.11	0.08	0.11	0.15	0.16	0.19	0.18	0.20	0.15	0.12	0.11	0.09	0.16	0.16	0.17	0.26	0.38	0.38	0.40
C2	0.16	0.15	0.14	0.17	0.17	0.07	0.19	0.08	0.19	0.16	0.15	0.20	0.09	0.22	0.19	0.17	0.12	0.26	0.16	0.12
C2'	0.13	0.11	0.07	0.16	0.12	0.23	0.14	0.27	0.14	0.12	0.12	0.13	0.09	0.24	0.13	0.18	0.45	0.59	0.58	0.61
C3'	0.13	0.12	0.09	0.21	0.13	0.28	0.14	0.35	0.14	0.12	0.13	0.15	0.09	0.31	0.14	0.20	0.58	0.80	0.78	0.80
C4	0.16	0.13	0.07	0.08	0.16	0.10	0.19	0.10	0.19	0.16	0.14	0.15	0.07	0.15	0.18	0.18	0.12	0.08	0.19	0.20
C4'	0.15	0.12	0.13	0.24	0.15	0.26	0.18	0.32	0.19	0.15	0.12	0.12	0.10	0.35	0.16	0.18	0.50	0.76	0.72	0.73
C5	0.17	0.14	0.08	0.09	0.17	0.11	0.19	0.11	0.19	0.16	0.15	0.16	0.07	0.15	0.18	0.20	0.14	0.08	0.24	0.22
C5'	0.15	0.11	0.13	0.26	0.14	0.28	0.18	0.36	0.19	0.14	0.12	0.14	0.09	0.37	0.15	0.19	0.55	0.86	0.81	0.82
C6	0.16	0.15	0.11	0.13	0.17	0.10	0.19	0.09	0.18	0.16	0.16	0.18	0.08	0.19	0.19	0.20	0.10	0.15	0.18	0.14
C8	0.17	0.13	0.05	0.07	0.16	0.16	0.19	0.17	0.19	0.16	0.14	0.14	0.07	0.13	0.17	0.20	0.25	0.29	0.41	0.40
N1	0.16	0.16	0.14	0.17	0.18	0.08	0.19	0.08	0.18	0.17	0.17	0.20	0.09	0.22	0.20	0.18	0.12	0.27	0.17	0.12
N3	0.16	0.13	0.09	0.11	0.16	0.07	0.19	0.06	0.19	0.16	0.13	0.16	0.08	0.17	0.18	0.16	0.07	0.10	0.09	0.08
N6	0.16	0.16	0.12	0.14	0.18	0.10	0.18	0.10	0.18	0.16	0.17	0.17	0.08	0.20	0.20	0.21	0.12	0.18	0.21	0.16
N7	0.17	0.14	0.06	0.07	0.16	0.14	0.19	0.15	0.19	0.16	0.15	0.15	0.07	0.14	0.18	0.21	0.22	0.19	0.36	0.34
N9	0.16	0.12	0.05	0.07	0.16	0.14	0.19	0.15	0.19	0.15	0.13	0.13	0.08	0.13	0.17	0.18	0.21	0.25	0.33	0.33
O2'	0.14	0.12	0.12	0.24	0.14	0.26	0.15	0.30	0.16	0.13	0.13	0.13	0.10	0.33	0.14	0.18	0.48	0.67	0.58	0.63
O3'	0.14	0.14	0.13	0.30	0.14	0.36	0.15	0.47	0.15	0.13	0.14	0.17	0.13	0.42	0.15	0.23	0.78	1.06	1.02	1.04
O4'	0.16	0.11	0.11	0.16	0.16	0.18	0.21	0.21	0.21	0.16	0.13	0.11	0.11	0.22	0.18	0.16	0.30	0.49	0.47	0.48
O5'	0.22	0.25	0.14	0.20	0.26	0.21	0.24	0.25	0.23	0.23	0.26	0.27	0.13	0.31	0.28	0.22	0.44	0.66	0.74	0.68
OP1	0.27	0.31	0.30	0.34	0.31	0.34	0.29	0.42	0.29	0.28	0.33	0.34	0.29	0.44	0.33	0.29	0.62	0.91	0.98	0.93
OP2	0.27	0.37	0.17	0.24	0.37	0.16	0.31	0.20	0.28	0.30	0.39	0.40	0.16	0.42	0.40	0.25	0.36	0.52	0.70	0.57
P	0.25	0.30	0.16	0.21	0.31	0.20	0.28	0.24	0.27	0.27	0.32	0.33	0.15	0.34	0.34	0.24	0.45	0.70	0.77	0.71

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.05	0.02	0.02	0.02	0.01	0.11	0.22	0.34	0.17
C2	0.03	0.00	0.12	0.12	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.12	0.02	0.08	0.18	0.51	0.40	0.29
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.04	0.01	0.09	0.01	0.11	0.02	0.09	0.21	0.01	0.01	0.05	0.01	0.19	0.15	0.29	0.16
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.09	0.01	0.06	0.01	0.06	0.06	0.12	0.16	0.01	0.01	0.09	0.01	0.24	0.14	0.29	0.17
C4	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.08	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.09	0.00	0.03	0.46	0.95	0.87	0.69
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.08	0.00	0.11	0.00	0.10	0.04	0.04	0.07	0.05	0.02	0.09	0.00	0.01	0.18	0.25	0.03
C5	0.02	0.01	0.09	0.06	0.00	0.11	0.00	0.21	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.07	0.01	0.09	0.59	1.04	1.05	0.84
C5'	0.02	0.07	0.01	0.01	0.16	0.00	0.21	0.00	0.19	0.08	0.10	0.09	0.05	0.04	0.18	0.01	0.01	0.30	0.30	0.01
C6	0.02	0.01	0.11	0.06	0.01	0.10	0.00	0.19	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.07	0.01	0.11	0.54	0.82	0.90	0.71
N1	0.00	0.01	0.02	0.06	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.04	0.02	0.01	0.28	0.52	0.54	0.39
N3	0.02	0.00	0.09	0.12	0.01	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.13	0.01	0.06	0.30	0.72	0.59	0.46
O2	0.05	0.00	0.21	0.16	0.01	0.07	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.17	0.18	0.02	0.15	0.08	0.34	0.18	0.11
O2'	0.02	0.08	0.01	0.01	0.07	0.05	0.11	0.05	0.11	0.03	0.06	0.17	0.00	0.04	0.08	0.05	0.09	0.10	0.20	0.04
O3'	0.02	0.12	0.01	0.01	0.09	0.02	0.07	0.04	0.07	0.04	0.13	0.18	0.04	0.00	0.10	0.02	0.18	0.28	0.18	0.09
O4	0.02	0.02	0.05	0.09	0.00	0.09	0.01	0.18	0.01	0.02	0.01	0.02	0.08	0.10	0.00	0.03	0.50	1.06	0.96	0.76
O4'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.03	0.00	0.09	0.01	0.11	0.01	0.06	0.15	0.05	0.02	0.03	0.00	0.05	0.14	0.38	0.12
O5'	0.11	0.18	0.19	0.24	0.46	0.01	0.59	0.01	0.54	0.28	0.30	0.08	0.09	0.18	0.50	0.05	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.22	0.51	0.15	0.14	0.95	0.18	1.04	0.30	0.82	0.52	0.72	0.34	0.10	0.28	1.06	0.14	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.34	0.40	0.29	0.29	0.87	0.25	1.05	0.30	0.90	0.54	0.59	0.18	0.20	0.18	0.96	0.38	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.17	0.29	0.16	0.17	0.69	0.03	0.84	0.01	0.71	0.39	0.46	0.11	0.04	0.09	0.76	0.12	0.00	0.01	0.01	0.00