Doublet Group distance statistics: 53516

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 3, 8, 7, 6, 4, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.001, 0.008, 0.015, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.008 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.006, 0.014, 0.023, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.014 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.004, 0.013, 0.023, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.013 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.007, 0.016, 0.026, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.016 std_dev=0.009
N9	A	0, 0.008, 0.018, 0.029, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.018 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.002, 0.015, 0.027, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.015 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.005, 0.018, 0.031, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.018 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.005, 0.020, 0.035, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.020 std_dev=0.015
N7	A	0, 0.010, 0.025, 0.040, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.025 std_dev=0.015
C8	A	0, 0.011, 0.027, 0.043, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.027 std_dev=0.016
N6	A	0, 0.006, 0.033, 0.059, 0.137 max_d=0.137 avg_d=0.033 std_dev=0.026
O4'	A	0, 0.023, 0.072, 0.121, 0.237 max_d=0.237 avg_d=0.072 std_dev=0.049
C2'	A	0, 0.029, 0.078, 0.128, 0.257 max_d=0.257 avg_d=0.078 std_dev=0.049
O2'	A	0, 0.050, 0.114, 0.178, 0.310 max_d=0.310 avg_d=0.114 std_dev=0.064
C4'	A	0, 0.036, 0.109, 0.182, 0.389 max_d=0.389 avg_d=0.109 std_dev=0.073
C3'	A	0, 0.028, 0.115, 0.201, 0.411 max_d=0.411 avg_d=0.115 std_dev=0.086
C5'	A	0, 0.062, 0.182, 0.302, 0.599 max_d=0.599 avg_d=0.182 std_dev=0.120
C1'	B	0, 0.121, 0.243, 0.364, 0.458 max_d=0.458 avg_d=0.243 std_dev=0.121
C2'	B	0, 0.116, 0.244, 0.371, 0.536 max_d=0.536 avg_d=0.244 std_dev=0.127
O3'	A	0, 0.040, 0.175, 0.311, 0.618 max_d=0.618 avg_d=0.175 std_dev=0.135
C3'	B	0, 0.135, 0.277, 0.418, 0.583 max_d=0.583 avg_d=0.277 std_dev=0.141
N1	B	0, 0.133, 0.276, 0.420, 0.539 max_d=0.539 avg_d=0.276 std_dev=0.143
C4'	B	0, 0.129, 0.273, 0.417, 0.573 max_d=0.573 avg_d=0.273 std_dev=0.144
O4'	B	0, 0.119, 0.280, 0.441, 0.634 max_d=0.634 avg_d=0.280 std_dev=0.161
C2	B	0, 0.108, 0.275, 0.443, 0.943 max_d=0.943 avg_d=0.275 std_dev=0.168
O2'	B	0, 0.083, 0.252, 0.420, 0.916 max_d=0.916 avg_d=0.252 std_dev=0.168
O3'	B	0, 0.125, 0.300, 0.474, 0.839 max_d=0.839 avg_d=0.300 std_dev=0.174
N3	B	0, 0.178, 0.355, 0.533, 0.945 max_d=0.945 avg_d=0.355 std_dev=0.178
C6	B	0, 0.225, 0.414, 0.603, 0.782 max_d=0.782 avg_d=0.414 std_dev=0.189
C4	B	0, 0.274, 0.468, 0.662, 0.764 max_d=0.764 avg_d=0.468 std_dev=0.194
C5	B	0, 0.298, 0.512, 0.725, 0.893 max_d=0.893 avg_d=0.512 std_dev=0.214
O4	B	0, 0.345, 0.582, 0.819, 0.938 max_d=0.938 avg_d=0.582 std_dev=0.237
C5'	B	0, 0.124, 0.374, 0.625, 1.233 max_d=1.233 avg_d=0.374 std_dev=0.250
O2	B	0, 0.027, 0.290, 0.553, 1.549 max_d=1.549 avg_d=0.290 std_dev=0.263
O5'	A	0, -0.078, 0.227, 0.532, 1.834 max_d=1.834 avg_d=0.227 std_dev=0.305
OP1	A	0, -0.017, 0.368, 0.752, 2.110 max_d=2.110 avg_d=0.368 std_dev=0.384
P	A	0, -0.087, 0.300, 0.687, 2.229 max_d=2.229 avg_d=0.300 std_dev=0.387
OP2	A	0, -0.125, 0.323, 0.772, 2.567 max_d=2.567 avg_d=0.323 std_dev=0.448
O5'	B	0, -0.012, 0.443, 0.898, 2.361 max_d=2.361 avg_d=0.443 std_dev=0.455
P	B	0, -0.277, 0.575, 1.426, 4.176 max_d=4.176 avg_d=0.575 std_dev=0.852
OP2	B	0, -0.198, 0.660, 1.519, 3.961 max_d=3.961 avg_d=0.660 std_dev=0.859
OP1	B	0, -0.420, 0.718, 1.857, 5.775 max_d=5.775 avg_d=0.718 std_dev=1.138

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.06	0.11	0.11
C2	0.03	0.00	0.07	0.07	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.09	0.03	0.17	0.15	0.27	0.23
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.02	0.04	0.03	0.06	0.07	0.04	0.03	0.02	0.00	0.01	0.00	0.11	0.07	0.12	0.11
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.05	0.00	0.05	0.02	0.06	0.07	0.06	0.07	0.06	0.06	0.04	0.02	0.01	0.01	0.15	0.08	0.10	0.11
C4	0.02	0.00	0.04	0.05	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.05	0.01	0.17	0.15	0.25	0.22
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.05	0.03	0.04	0.05	0.05	0.02	0.03	0.02	0.00	0.02	0.07	0.04	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.06	0.01	0.21	0.21	0.32	0.28
C5'	0.02	0.04	0.02	0.02	0.04	0.01	0.06	0.00	0.06	0.07	0.05	0.04	0.08	0.08	0.04	0.03	0.03	0.01	0.01	0.06	0.10	0.02
C6	0.02	0.01	0.04	0.06	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.07	0.02	0.21	0.22	0.35	0.30
C8	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.07	0.02	0.21	0.19	0.27	0.27
N1	0.03	0.00	0.06	0.06	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.08	0.02	0.19	0.19	0.32	0.27
N3	0.03	0.00	0.07	0.07	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.08	0.03	0.15	0.12	0.23	0.20
N6	0.02	0.01	0.04	0.06	0.01	0.05	0.02	0.08	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.05	0.07	0.03	0.23	0.26	0.39	0.33
N7	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.05	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.07	0.02	0.23	0.24	0.34	0.31
N9	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.16	0.13	0.21	0.20
O2'	0.01	0.08	0.00	0.02	0.04	0.03	0.04	0.03	0.05	0.02	0.07	0.07	0.05	0.02	0.02	0.00	0.04	0.02	0.04	0.09	0.05	0.04
O3'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.05	0.02	0.06	0.03	0.07	0.07	0.08	0.08	0.07	0.07	0.04	0.04	0.00	0.02	0.12	0.11	0.08	0.08
O4'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.06	0.08	0.07	0.08
O5'	0.08	0.17	0.11	0.15	0.17	0.02	0.21	0.01	0.21	0.21	0.19	0.15	0.23	0.23	0.16	0.04	0.12	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.06	0.15	0.07	0.08	0.15	0.07	0.21	0.06	0.22	0.19	0.19	0.12	0.26	0.24	0.13	0.09	0.11	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.11	0.27	0.12	0.10	0.25	0.04	0.32	0.10	0.35	0.27	0.32	0.23	0.39	0.34	0.21	0.05	0.08	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.23	0.11	0.11	0.22	0.02	0.28	0.02	0.30	0.27	0.27	0.20	0.33	0.31	0.20	0.04	0.08	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.08	0.13	0.16	0.11	0.13	0.12	0.14	0.13	0.11	0.09	0.09	0.11	0.22	0.11	0.14	0.15	0.19	0.11	0.10
C2	0.11	0.08	0.12	0.10	0.06	0.12	0.07	0.13	0.09	0.08	0.09	0.13	0.11	0.13	0.07	0.17	0.15	0.27	0.22	0.28
C2'	0.12	0.09	0.15	0.17	0.11	0.14	0.13	0.17	0.14	0.11	0.10	0.08	0.14	0.22	0.12	0.15	0.15	0.21	0.08	0.11
C3'	0.12	0.09	0.15	0.18	0.11	0.16	0.14	0.19	0.14	0.12	0.10	0.08	0.14	0.24	0.12	0.15	0.17	0.23	0.10	0.12
C4	0.10	0.08	0.13	0.13	0.08	0.10	0.08	0.12	0.09	0.09	0.09	0.10	0.11	0.18	0.09	0.15	0.11	0.21	0.14	0.19
C4'	0.12	0.09	0.14	0.18	0.12	0.16	0.14	0.19	0.14	0.11	0.10	0.09	0.12	0.24	0.13	0.15	0.20	0.25	0.15	0.14
C5	0.10	0.08	0.13	0.13	0.07	0.11	0.07	0.12	0.09	0.08	0.09	0.11	0.11	0.18	0.08	0.16	0.12	0.25	0.18	0.24
C5'	0.12	0.09	0.14	0.19	0.12	0.16	0.14	0.20	0.14	0.11	0.10	0.09	0.12	0.24	0.13	0.15	0.21	0.26	0.15	0.14
C6	0.11	0.08	0.12	0.11	0.07	0.11	0.07	0.13	0.09	0.08	0.09	0.13	0.12	0.16	0.08	0.17	0.15	0.30	0.24	0.30
C8	0.10	0.09	0.14	0.15	0.09	0.11	0.09	0.13	0.10	0.09	0.10	0.10	0.11	0.22	0.10	0.14	0.12	0.20	0.11	0.15
N1	0.11	0.09	0.12	0.10	0.07	0.12	0.07	0.14	0.10	0.09	0.09	0.15	0.12	0.14	0.07	0.18	0.17	0.31	0.26	0.32
N3	0.11	0.08	0.12	0.12	0.08	0.11	0.08	0.12	0.09	0.08	0.09	0.11	0.11	0.15	0.09	0.15	0.12	0.21	0.15	0.20
N6	0.11	0.09	0.13	0.12	0.07	0.12	0.08	0.14	0.10	0.09	0.10	0.14	0.12	0.16	0.09	0.17	0.17	0.34	0.27	0.34
N7	0.10	0.08	0.13	0.14	0.08	0.11	0.07	0.13	0.09	0.08	0.10	0.10	0.11	0.20	0.09	0.16	0.12	0.23	0.15	0.21
N9	0.11	0.08	0.14	0.15	0.10	0.11	0.10	0.12	0.10	0.09	0.10	0.09	0.11	0.21	0.10	0.14	0.12	0.18	0.10	0.13
O2'	0.12	0.10	0.14	0.18	0.14	0.15	0.16	0.18	0.16	0.12	0.11	0.09	0.12	0.22	0.14	0.14	0.19	0.23	0.15	0.13
O3'	0.14	0.12	0.17	0.20	0.15	0.18	0.17	0.22	0.17	0.14	0.12	0.11	0.16	0.25	0.15	0.17	0.20	0.26	0.13	0.14
O4'	0.12	0.10	0.13	0.17	0.12	0.14	0.14	0.16	0.14	0.11	0.11	0.11	0.12	0.23	0.14	0.14	0.18	0.23	0.14	0.12
O5'	0.13	0.12	0.14	0.19	0.12	0.14	0.13	0.17	0.13	0.12	0.12	0.15	0.12	0.28	0.13	0.16	0.17	0.23	0.09	0.11
OP1	0.14	0.11	0.18	0.26	0.12	0.20	0.16	0.24	0.17	0.13	0.11	0.12	0.15	0.35	0.13	0.17	0.26	0.34	0.20	0.20
OP2	0.17	0.19	0.11	0.14	0.16	0.13	0.14	0.16	0.14	0.16	0.18	0.22	0.11	0.23	0.16	0.20	0.12	0.23	0.11	0.16
P	0.14	0.14	0.12	0.17	0.11	0.14	0.11	0.17	0.12	0.13	0.14	0.18	0.11	0.27	0.11	0.17	0.17	0.25	0.09	0.11

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.14	0.16	0.15
C2	0.01	0.00	0.05	0.06	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.07	0.01	0.02	0.09	0.10	0.20	0.14
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.02	0.04	0.02	0.04	0.10	0.00	0.02	0.04	0.01	0.07	0.10	0.14	0.05
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.08	0.00	0.09	0.02	0.08	0.04	0.06	0.09	0.02	0.01	0.09	0.02	0.12	0.14	0.16	0.09
C4	0.01	0.01	0.03	0.08	0.00	0.07	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.08	0.00	0.03	0.16	0.17	0.30	0.19
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.07	0.00	0.09	0.00	0.08	0.04	0.04	0.04	0.05	0.01	0.08	0.00	0.01	0.14	0.06	0.07
C5	0.01	0.01	0.04	0.09	0.01	0.09	0.00	0.17	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.09	0.01	0.03	0.17	0.19	0.31	0.21
C5'	0.02	0.07	0.02	0.02	0.14	0.00	0.17	0.00	0.14	0.08	0.10	0.04	0.05	0.03	0.16	0.01	0.01	0.10	0.03	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.08	0.01	0.08	0.00	0.14	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.08	0.01	0.03	0.14	0.15	0.25	0.18
N1	0.00	0.01	0.02	0.04	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.01	0.09	0.11	0.20	0.15
N3	0.01	0.00	0.04	0.06	0.00	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.08	0.01	0.02	0.13	0.12	0.25	0.16
O2	0.03	0.00	0.10	0.09	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.11	0.12	0.02	0.03	0.07	0.11	0.17	0.14
O2'	0.01	0.06	0.00	0.02	0.03	0.05	0.03	0.05	0.03	0.02	0.05	0.11	0.00	0.05	0.04	0.03	0.05	0.14	0.10	0.08
O3'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.08	0.01	0.09	0.03	0.08	0.04	0.08	0.12	0.05	0.00	0.10	0.01	0.14	0.25	0.18	0.15
O4	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.08	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.10	0.00	0.03	0.17	0.20	0.33	0.21
O4'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.03	0.00	0.07	0.22	0.16	0.20
O5'	0.05	0.09	0.07	0.12	0.16	0.01	0.17	0.01	0.14	0.09	0.13	0.07	0.05	0.14	0.17	0.07	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.14	0.10	0.10	0.14	0.17	0.14	0.19	0.10	0.15	0.11	0.12	0.11	0.14	0.25	0.20	0.22	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.16	0.20	0.14	0.16	0.30	0.06	0.31	0.03	0.25	0.20	0.25	0.17	0.10	0.18	0.33	0.16	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.15	0.14	0.05	0.09	0.19	0.07	0.21	0.01	0.18	0.15	0.16	0.14	0.08	0.15	0.21	0.20	0.00	0.01	0.00	0.00