Doublet Group distance statistics: 53525

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 0, 2, 2, 0, 1, 1, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.001, 0.011, 0.020, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.011 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.001, 0.014, 0.028, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.014 std_dev=0.013
C5	A	0, -0.002, 0.014, 0.029, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.014 std_dev=0.015
C4	A	0, -0.002, 0.015, 0.033, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.015 std_dev=0.017
C8	A	0, 0.005, 0.023, 0.042, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.023 std_dev=0.018
N7	A	0, 0.002, 0.020, 0.039, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.020 std_dev=0.018
N9	A	0, -0.001, 0.021, 0.043, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.021 std_dev=0.022
C2	A	0, -0.007, 0.016, 0.040, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.016 std_dev=0.024
C1'	A	0, -0.007, 0.019, 0.044, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.019 std_dev=0.026
N3	A	0, -0.006, 0.020, 0.046, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.020 std_dev=0.026
N6	A	0, 0.002, 0.035, 0.067, 0.101 max_d=0.101 avg_d=0.035 std_dev=0.032
C2'	B	0, 0.174, 0.337, 0.499, 0.608 max_d=0.608 avg_d=0.337 std_dev=0.162
C3'	B	0, 0.155, 0.333, 0.510, 0.658 max_d=0.658 avg_d=0.333 std_dev=0.177
C1'	B	0, 0.124, 0.318, 0.511, 0.647 max_d=0.647 avg_d=0.318 std_dev=0.193
C2'	A	0, 0.030, 0.235, 0.440, 0.583 max_d=0.583 avg_d=0.235 std_dev=0.205
C4'	B	0, 0.152, 0.359, 0.567, 0.746 max_d=0.746 avg_d=0.359 std_dev=0.208
O4'	B	0, 0.214, 0.428, 0.642, 0.793 max_d=0.793 avg_d=0.428 std_dev=0.214
O4'	A	0, 0.032, 0.259, 0.485, 0.605 max_d=0.605 avg_d=0.259 std_dev=0.227
N1	B	0, 0.219, 0.446, 0.673, 0.726 max_d=0.726 avg_d=0.446 std_dev=0.227
O2'	A	0, 0.013, 0.241, 0.470, 0.635 max_d=0.635 avg_d=0.241 std_dev=0.229
C5'	B	0, 0.215, 0.460, 0.704, 0.900 max_d=0.900 avg_d=0.460 std_dev=0.244
O2	B	0, 0.254, 0.504, 0.754, 0.821 max_d=0.821 avg_d=0.504 std_dev=0.250
C2	B	0, 0.249, 0.500, 0.751, 0.802 max_d=0.802 avg_d=0.500 std_dev=0.251
O5'	B	0, 0.227, 0.489, 0.751, 0.900 max_d=0.900 avg_d=0.489 std_dev=0.262
O3'	B	0, 0.163, 0.449, 0.734, 0.851 max_d=0.851 avg_d=0.449 std_dev=0.286
O2'	B	0, 0.080, 0.382, 0.685, 0.879 max_d=0.879 avg_d=0.382 std_dev=0.303
C6	B	0, 0.264, 0.606, 0.949, 1.025 max_d=1.025 avg_d=0.606 std_dev=0.342
C3'	A	0, 0.060, 0.413, 0.765, 0.980 max_d=0.980 avg_d=0.413 std_dev=0.352
C4'	A	0, 0.055, 0.407, 0.759, 0.955 max_d=0.955 avg_d=0.407 std_dev=0.352
P	B	0, 0.318, 0.696, 1.074, 1.117 max_d=1.117 avg_d=0.696 std_dev=0.378
N3	B	0, 0.225, 0.629, 1.033, 1.267 max_d=1.267 avg_d=0.629 std_dev=0.404
OP1	B	0, 0.246, 0.694, 1.143, 1.365 max_d=1.365 avg_d=0.694 std_dev=0.449
O3'	A	0, 0.145, 0.614, 1.083, 1.351 max_d=1.351 avg_d=0.614 std_dev=0.469
C5	B	0, 0.275, 0.762, 1.249, 1.478 max_d=1.478 avg_d=0.762 std_dev=0.487
C4	B	0, 0.232, 0.756, 1.280, 1.595 max_d=1.595 avg_d=0.756 std_dev=0.524
OP2	B	0, 0.353, 0.921, 1.489, 1.811 max_d=1.811 avg_d=0.921 std_dev=0.568
C5'	A	0, 0.053, 0.688, 1.324, 1.721 max_d=1.721 avg_d=0.688 std_dev=0.636
O4	B	0, 0.224, 0.868, 1.511, 1.956 max_d=1.956 avg_d=0.868 std_dev=0.643
O5'	A	0, 0.132, 0.788, 1.443, 1.856 max_d=1.856 avg_d=0.788 std_dev=0.656
P	A	0, 0.190, 1.104, 2.018, 2.628 max_d=2.628 avg_d=1.104 std_dev=0.914
OP2	A	0, 0.374, 1.312, 2.250, 2.759 max_d=2.759 avg_d=1.312 std_dev=0.938
OP1	A	0, 0.136, 1.275, 2.414, 3.221 max_d=3.221 avg_d=1.275 std_dev=1.139

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.02	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.04	0.06	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.19	0.19	0.22	0.26
C2	0.05	0.00	0.12	0.14	0.01	0.06	0.02	0.12	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.12	0.17	0.06	0.47	0.51	0.68	0.58
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.07	0.02	0.04	0.01	0.06	0.06	0.10	0.12	0.05	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.24	0.22	0.19	0.22
C3'	0.02	0.14	0.00	0.00	0.09	0.00	0.09	0.01	0.11	0.11	0.13	0.13	0.11	0.10	0.06	0.02	0.01	0.02	0.27	0.27	0.12	0.22
C4	0.03	0.01	0.07	0.09	0.00	0.05	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.05	0.09	0.03	0.44	0.47	0.59	0.55
C4'	0.01	0.06	0.02	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.07	0.05	0.06	0.06	0.09	0.07	0.03	0.07	0.01	0.00	0.02	0.07	0.13	0.04
C5	0.01	0.02	0.04	0.09	0.01	0.06	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.10	0.02	0.50	0.59	0.72	0.65
C5'	0.02	0.12	0.01	0.01	0.12	0.01	0.16	0.00	0.17	0.13	0.15	0.11	0.21	0.16	0.09	0.07	0.06	0.01	0.01	0.14	0.27	0.01
C6	0.02	0.02	0.06	0.11	0.01	0.07	0.01	0.17	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.06	0.12	0.03	0.52	0.63	0.79	0.68
C8	0.02	0.02	0.06	0.11	0.01	0.05	0.01	0.13	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.00	0.01	0.04	0.13	0.05	0.45	0.53	0.57	0.58
N1	0.04	0.01	0.10	0.13	0.01	0.06	0.01	0.15	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.09	0.15	0.04	0.51	0.60	0.77	0.65
N3	0.06	0.01	0.12	0.13	0.00	0.06	0.01	0.11	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.11	0.16	0.07	0.43	0.44	0.58	0.52
N6	0.02	0.02	0.05	0.11	0.02	0.09	0.02	0.21	0.01	0.04	0.02	0.03	0.00	0.05	0.03	0.04	0.13	0.05	0.53	0.69	0.85	0.73
N7	0.01	0.02	0.04	0.10	0.01	0.07	0.01	0.16	0.02	0.00	0.02	0.01	0.05	0.00	0.01	0.03	0.13	0.04	0.51	0.63	0.73	0.68
N9	0.00	0.01	0.01	0.06	0.01	0.03	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.05	0.00	0.38	0.40	0.46	0.47
O2'	0.01	0.12	0.00	0.02	0.05	0.07	0.04	0.07	0.06	0.04	0.09	0.11	0.04	0.03	0.01	0.00	0.07	0.03	0.07	0.12	0.05	0.06
O3'	0.02	0.17	0.02	0.01	0.09	0.01	0.10	0.06	0.12	0.13	0.15	0.16	0.13	0.13	0.05	0.07	0.00	0.03	0.19	0.30	0.17	0.18
O4'	0.01	0.06	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.05	0.04	0.07	0.05	0.04	0.00	0.03	0.03	0.00	0.11	0.16	0.18	0.20
O5'	0.19	0.47	0.24	0.27	0.44	0.02	0.50	0.01	0.52	0.45	0.51	0.43	0.53	0.51	0.38	0.07	0.19	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.19	0.51	0.22	0.27	0.47	0.07	0.59	0.14	0.63	0.53	0.60	0.44	0.69	0.63	0.40	0.12	0.30	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.22	0.68	0.19	0.12	0.59	0.13	0.72	0.27	0.79	0.57	0.77	0.58	0.85	0.73	0.46	0.05	0.17	0.18	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.26	0.58	0.22	0.22	0.55	0.04	0.65	0.01	0.68	0.58	0.65	0.52	0.73	0.68	0.47	0.06	0.18	0.20	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.07	0.19	0.16	0.15	0.23	0.11	0.16	0.13	0.10	0.10	0.23	0.24	0.09	0.22	0.26	0.15	0.06	0.30	0.08	0.07
C2	0.10	0.19	0.17	0.14	0.18	0.08	0.14	0.09	0.11	0.12	0.21	0.25	0.15	0.17	0.20	0.14	0.07	0.13	0.20	0.11
C2'	0.20	0.07	0.12	0.12	0.11	0.26	0.16	0.29	0.18	0.14	0.08	0.07	0.11	0.19	0.11	0.33	0.21	0.22	0.19	0.19
C3'	0.22	0.05	0.09	0.09	0.09	0.32	0.17	0.38	0.21	0.15	0.06	0.09	0.10	0.17	0.10	0.40	0.28	0.21	0.22	0.25
C4	0.09	0.19	0.17	0.15	0.19	0.10	0.12	0.12	0.08	0.10	0.22	0.25	0.14	0.20	0.22	0.16	0.08	0.22	0.12	0.09
C4'	0.09	0.20	0.17	0.15	0.23	0.16	0.16	0.20	0.10	0.10	0.25	0.26	0.11	0.26	0.28	0.22	0.09	0.31	0.10	0.08
C5	0.10	0.19	0.17	0.15	0.21	0.10	0.14	0.12	0.09	0.11	0.24	0.25	0.13	0.20	0.24	0.15	0.09	0.21	0.13	0.10
C5'	0.10	0.20	0.17	0.16	0.24	0.18	0.15	0.22	0.08	0.09	0.26	0.26	0.10	0.29	0.30	0.26	0.09	0.32	0.11	0.08
C6	0.10	0.19	0.17	0.15	0.21	0.10	0.15	0.11	0.12	0.12	0.23	0.24	0.14	0.19	0.23	0.15	0.09	0.17	0.19	0.12
C8	0.09	0.19	0.16	0.14	0.22	0.12	0.14	0.14	0.08	0.10	0.24	0.25	0.11	0.21	0.26	0.17	0.08	0.28	0.08	0.08
N1	0.10	0.19	0.17	0.14	0.20	0.09	0.16	0.11	0.13	0.12	0.22	0.24	0.15	0.17	0.22	0.14	0.08	0.13	0.22	0.13
N3	0.09	0.18	0.18	0.15	0.18	0.08	0.12	0.09	0.09	0.11	0.21	0.25	0.16	0.19	0.20	0.14	0.07	0.18	0.14	0.09
N6	0.11	0.20	0.17	0.15	0.22	0.11	0.17	0.12	0.13	0.13	0.24	0.23	0.14	0.19	0.26	0.15	0.10	0.17	0.20	0.13
N7	0.10	0.20	0.16	0.15	0.22	0.11	0.14	0.13	0.09	0.11	0.25	0.25	0.12	0.20	0.26	0.16	0.09	0.25	0.10	0.09
N9	0.09	0.19	0.16	0.15	0.20	0.12	0.13	0.14	0.07	0.09	0.23	0.24	0.11	0.21	0.24	0.17	0.08	0.27	0.08	0.08
O2'	0.21	0.09	0.11	0.11	0.13	0.26	0.17	0.27	0.19	0.16	0.09	0.09	0.08	0.18	0.13	0.31	0.19	0.23	0.14	0.14
O3'	0.33	0.17	0.14	0.19	0.23	0.46	0.32	0.53	0.36	0.28	0.16	0.09	0.11	0.14	0.21	0.52	0.44	0.27	0.36	0.41
O4'	0.11	0.29	0.20	0.17	0.34	0.10	0.26	0.13	0.18	0.19	0.35	0.34	0.12	0.24	0.40	0.14	0.07	0.35	0.16	0.10
O5'	0.28	0.27	0.19	0.13	0.28	0.27	0.24	0.31	0.25	0.25	0.30	0.31	0.18	0.21	0.31	0.40	0.20	0.19	0.12	0.16
OP1	0.27	0.25	0.16	0.08	0.27	0.33	0.21	0.42	0.23	0.22	0.30	0.30	0.15	0.21	0.32	0.46	0.25	0.34	0.16	0.27
OP2	0.40	0.44	0.32	0.24	0.47	0.34	0.44	0.39	0.43	0.42	0.48	0.45	0.27	0.27	0.51	0.51	0.30	0.13	0.30	0.30
P	0.30	0.36	0.28	0.21	0.41	0.27	0.34	0.32	0.32	0.32	0.42	0.39	0.24	0.29	0.46	0.41	0.21	0.19	0.15	0.17

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.05	0.03	0.01	0.02	0.01	0.05	0.07	0.23	0.13
C2	0.03	0.00	0.06	0.09	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.11	0.02	0.04	0.08	0.10	0.36	0.22
C2'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.04	0.02	0.05	0.09	0.00	0.02	0.05	0.01	0.05	0.17	0.12	0.05
C3'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.10	0.01	0.10	0.01	0.08	0.06	0.11	0.09	0.02	0.01	0.11	0.02	0.09	0.23	0.03	0.07
C4	0.03	0.02	0.04	0.10	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.14	0.00	0.02	0.15	0.29	0.51	0.36
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.05	0.02	0.04	0.06	0.06	0.02	0.05	0.01	0.01	0.15	0.07	0.02
C5	0.02	0.02	0.04	0.10	0.01	0.06	0.00	0.10	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.12	0.01	0.02	0.16	0.32	0.52	0.37
C5'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.08	0.01	0.10	0.00	0.08	0.03	0.05	0.04	0.07	0.02	0.09	0.01	0.01	0.14	0.04	0.02
C6	0.01	0.01	0.04	0.08	0.01	0.05	0.01	0.08	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.10	0.01	0.02	0.13	0.21	0.40	0.29
N1	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.07	0.01	0.02	0.08	0.10	0.32	0.21
N3	0.03	0.00	0.05	0.11	0.01	0.04	0.01	0.05	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.14	0.01	0.03	0.13	0.20	0.45	0.30
O2	0.05	0.01	0.09	0.09	0.02	0.06	0.02	0.04	0.02	0.02	0.01	0.00	0.10	0.12	0.02	0.07	0.04	0.05	0.31	0.17
O2'	0.03	0.06	0.00	0.02	0.04	0.06	0.03	0.07	0.03	0.03	0.06	0.10	0.00	0.02	0.04	0.04	0.03	0.24	0.07	0.03
O3'	0.01	0.11	0.02	0.01	0.14	0.02	0.12	0.02	0.10	0.07	0.14	0.12	0.02	0.00	0.16	0.01	0.12	0.38	0.12	0.18
O4	0.02	0.02	0.05	0.11	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.16	0.00	0.02	0.17	0.34	0.55	0.39
O4'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.07	0.04	0.01	0.02	0.00	0.10	0.11	0.20	0.14
O5'	0.05	0.08	0.05	0.09	0.15	0.01	0.16	0.01	0.13	0.08	0.13	0.04	0.03	0.12	0.17	0.10	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.07	0.10	0.17	0.23	0.29	0.15	0.32	0.14	0.21	0.10	0.20	0.05	0.24	0.38	0.34	0.11	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.23	0.36	0.12	0.03	0.51	0.07	0.52	0.04	0.40	0.32	0.45	0.31	0.07	0.12	0.55	0.20	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.13	0.22	0.05	0.07	0.36	0.02	0.37	0.02	0.29	0.21	0.30	0.17	0.03	0.18	0.39	0.14	0.01	0.00	0.01	0.00