Doublet Group distance statistics: 53526

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 2, 1, 1, 0, 1, 0, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.006, 0.015, 0.024, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.015 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.012, 0.028, 0.045, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.028 std_dev=0.016
N1	A	0, 0.014, 0.033, 0.051, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.033 std_dev=0.018
N7	A	0, 0.021, 0.041, 0.060, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.041 std_dev=0.020
C4	A	0, 0.016, 0.037, 0.058, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.037 std_dev=0.021
C2	A	0, 0.012, 0.035, 0.057, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.035 std_dev=0.022
N3	A	0, 0.018, 0.042, 0.067, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.042 std_dev=0.024
C8	A	0, 0.023, 0.048, 0.073, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.048 std_dev=0.025
C1'	A	0, 0.017, 0.050, 0.083, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.050 std_dev=0.033
N9	A	0, 0.017, 0.052, 0.086, 0.106 max_d=0.106 avg_d=0.052 std_dev=0.034
N6	A	0, 0.014, 0.060, 0.105, 0.130 max_d=0.130 avg_d=0.060 std_dev=0.045
C2'	A	0, 0.014, 0.183, 0.352, 0.646 max_d=0.646 avg_d=0.183 std_dev=0.169
O4'	A	0, -0.023, 0.159, 0.341, 0.672 max_d=0.672 avg_d=0.159 std_dev=0.182
O2'	A	0, 0.076, 0.276, 0.475, 0.738 max_d=0.738 avg_d=0.276 std_dev=0.199
N1	B	0, 0.138, 0.358, 0.578, 0.661 max_d=0.661 avg_d=0.358 std_dev=0.220
C2	B	0, 0.124, 0.361, 0.598, 0.901 max_d=0.901 avg_d=0.361 std_dev=0.237
C5	B	0, 0.162, 0.448, 0.734, 1.038 max_d=1.038 avg_d=0.448 std_dev=0.286
C3'	A	0, -0.036, 0.256, 0.549, 1.089 max_d=1.089 avg_d=0.256 std_dev=0.293
C4'	A	0, -0.101, 0.199, 0.499, 1.077 max_d=1.077 avg_d=0.199 std_dev=0.300
C6	B	0, 0.172, 0.484, 0.795, 0.938 max_d=0.938 avg_d=0.484 std_dev=0.312
O2	B	0, 0.039, 0.400, 0.762, 1.351 max_d=1.351 avg_d=0.400 std_dev=0.362
C4	B	0, 0.163, 0.550, 0.938, 1.199 max_d=1.199 avg_d=0.550 std_dev=0.387
O3'	A	0, -0.028, 0.366, 0.761, 1.453 max_d=1.453 avg_d=0.366 std_dev=0.394
C1'	B	0, 0.106, 0.533, 0.960, 1.296 max_d=1.296 avg_d=0.533 std_dev=0.427
N3	B	0, 0.089, 0.535, 0.981, 1.570 max_d=1.570 avg_d=0.535 std_dev=0.446
C5'	A	0, -0.180, 0.318, 0.816, 1.793 max_d=1.793 avg_d=0.318 std_dev=0.498
OP1	A	0, -0.046, 0.483, 1.013, 1.976 max_d=1.976 avg_d=0.483 std_dev=0.530
O4	B	0, 0.156, 0.728, 1.301, 1.849 max_d=1.849 avg_d=0.728 std_dev=0.573
C2'	B	0, 0.066, 0.674, 1.282, 1.972 max_d=1.972 avg_d=0.674 std_dev=0.608
O2'	B	0, 0.082, 0.719, 1.356, 2.027 max_d=2.027 avg_d=0.719 std_dev=0.637
O5'	A	0, -0.283, 0.478, 1.239, 2.701 max_d=2.701 avg_d=0.478 std_dev=0.761
O4'	B	0, 0.040, 0.861, 1.681, 2.556 max_d=2.556 avg_d=0.861 std_dev=0.821
C3'	B	0, 0.009, 1.007, 2.006, 3.245 max_d=3.245 avg_d=1.007 std_dev=0.998
P	A	0, -0.484, 0.583, 1.650, 3.768 max_d=3.768 avg_d=0.583 std_dev=1.067
C4'	B	0, -0.010, 1.090, 2.190, 3.515 max_d=3.515 avg_d=1.090 std_dev=1.100
O3'	B	0, -0.063, 1.261, 2.585, 4.288 max_d=4.288 avg_d=1.261 std_dev=1.324
C5'	B	0, -0.066, 1.395, 2.855, 4.611 max_d=4.611 avg_d=1.395 std_dev=1.461
OP2	A	0, -0.819, 0.816, 2.452, 5.700 max_d=5.700 avg_d=0.816 std_dev=1.635
O5'	B	0, -0.037, 1.613, 3.262, 5.063 max_d=5.063 avg_d=1.613 std_dev=1.650
P	B	0, -0.206, 2.170, 4.545, 7.403 max_d=7.403 avg_d=2.170 std_dev=2.375
OP2	B	0, -0.118, 2.507, 5.131, 7.433 max_d=7.433 avg_d=2.507 std_dev=2.625
OP1	B	0, -0.473, 2.416, 5.305, 9.370 max_d=9.370 avg_d=2.416 std_dev=2.889

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.08	0.01	0.01	0.05	0.01	0.03	0.04	0.05	0.02	0.07	0.09	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.26	0.08	0.42	0.26
C2	0.08	0.00	0.16	0.21	0.01	0.12	0.02	0.20	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.13	0.24	0.07	0.21	0.14	0.66	0.27
C2'	0.01	0.16	0.00	0.01	0.09	0.01	0.08	0.02	0.11	0.08	0.14	0.16	0.09	0.07	0.03	0.01	0.02	0.01	0.14	0.10	0.23	0.14
C3'	0.01	0.21	0.01	0.00	0.14	0.01	0.12	0.03	0.15	0.10	0.20	0.20	0.12	0.10	0.06	0.02	0.01	0.02	0.10	0.12	0.12	0.08
C4	0.05	0.01	0.09	0.14	0.00	0.09	0.01	0.17	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.14	0.03	0.29	0.12	0.73	0.34
C4'	0.01	0.12	0.01	0.01	0.09	0.00	0.08	0.01	0.09	0.04	0.11	0.11	0.07	0.06	0.05	0.04	0.02	0.00	0.02	0.11	0.06	0.02
C5	0.03	0.02	0.08	0.12	0.01	0.08	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.07	0.14	0.02	0.35	0.12	0.93	0.40
C5'	0.04	0.20	0.02	0.03	0.17	0.01	0.19	0.00	0.21	0.14	0.21	0.18	0.20	0.18	0.13	0.04	0.08	0.02	0.01	0.11	0.06	0.01
C6	0.05	0.01	0.11	0.15	0.02	0.09	0.01	0.21	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.03	0.10	0.17	0.03	0.32	0.12	0.94	0.38
C8	0.02	0.02	0.08	0.10	0.01	0.04	0.01	0.14	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.00	0.01	0.05	0.12	0.05	0.47	0.11	0.95	0.50
N1	0.07	0.01	0.14	0.20	0.02	0.11	0.01	0.21	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.13	0.22	0.05	0.25	0.14	0.81	0.31
N3	0.09	0.01	0.16	0.20	0.01	0.11	0.02	0.18	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.12	0.21	0.08	0.22	0.14	0.59	0.27
N6	0.04	0.01	0.09	0.12	0.02	0.07	0.02	0.20	0.00	0.04	0.02	0.01	0.00	0.05	0.03	0.09	0.15	0.05	0.35	0.10	1.07	0.42
N7	0.01	0.03	0.07	0.10	0.01	0.06	0.01	0.18	0.03	0.00	0.02	0.02	0.05	0.00	0.01	0.05	0.12	0.05	0.44	0.12	1.08	0.50
N9	0.01	0.02	0.03	0.06	0.01	0.05	0.02	0.13	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.00	0.02	0.06	0.01	0.34	0.11	0.69	0.36
O2'	0.01	0.13	0.01	0.02	0.06	0.04	0.07	0.04	0.10	0.05	0.13	0.12	0.09	0.05	0.02	0.00	0.02	0.03	0.06	0.10	0.09	0.06
O3'	0.02	0.24	0.02	0.01	0.14	0.02	0.14	0.08	0.17	0.12	0.22	0.21	0.15	0.12	0.06	0.02	0.00	0.01	0.20	0.15	0.30	0.16
O4'	0.01	0.07	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.02	0.03	0.05	0.05	0.08	0.05	0.05	0.01	0.03	0.01	0.00	0.27	0.09	0.33	0.26
O5'	0.26	0.21	0.14	0.10	0.29	0.02	0.35	0.01	0.32	0.47	0.25	0.22	0.35	0.44	0.34	0.06	0.20	0.27	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.08	0.14	0.10	0.12	0.12	0.11	0.12	0.11	0.12	0.11	0.14	0.14	0.10	0.12	0.11	0.10	0.15	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.42	0.66	0.23	0.12	0.73	0.06	0.93	0.06	0.94	0.95	0.81	0.59	1.07	1.08	0.69	0.09	0.30	0.33	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.26	0.27	0.14	0.08	0.34	0.02	0.40	0.01	0.38	0.50	0.31	0.27	0.42	0.50	0.36	0.06	0.16	0.26	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.23	0.13	0.18	0.24	0.16	0.30	0.21	0.34	0.24	0.19	0.13	0.10	0.20	0.32	0.16	0.34	0.35	0.22	0.35	0.24
C2	0.13	0.18	0.11	0.09	0.20	0.12	0.17	0.14	0.16	0.15	0.20	0.22	0.10	0.12	0.22	0.19	0.17	0.35	0.36	0.40
C2'	0.22	0.24	0.26	0.32	0.28	0.22	0.30	0.25	0.29	0.25	0.26	0.23	0.37	0.54	0.29	0.29	0.30	0.26	0.31	0.26
C3'	0.24	0.30	0.25	0.36	0.35	0.26	0.35	0.31	0.33	0.29	0.33	0.28	0.34	0.61	0.37	0.30	0.39	0.37	0.41	0.34
C4	0.14	0.15	0.10	0.10	0.18	0.14	0.18	0.16	0.18	0.16	0.17	0.16	0.09	0.12	0.19	0.19	0.10	0.23	0.19	0.27
C4'	0.25	0.15	0.26	0.38	0.20	0.38	0.25	0.45	0.27	0.22	0.15	0.12	0.29	0.58	0.19	0.39	0.52	0.39	0.59	0.42
C5	0.12	0.17	0.12	0.10	0.19	0.12	0.17	0.14	0.16	0.15	0.19	0.19	0.10	0.15	0.21	0.18	0.09	0.32	0.27	0.36
C5'	0.26	0.20	0.21	0.36	0.24	0.37	0.28	0.45	0.29	0.24	0.21	0.17	0.23	0.55	0.24	0.37	0.53	0.40	0.60	0.43
C6	0.12	0.20	0.14	0.12	0.21	0.12	0.17	0.15	0.15	0.14	0.23	0.24	0.12	0.18	0.24	0.21	0.16	0.42	0.41	0.47
C8	0.15	0.15	0.13	0.15	0.18	0.17	0.19	0.20	0.19	0.16	0.16	0.15	0.13	0.19	0.18	0.20	0.17	0.19	0.18	0.22
N1	0.13	0.21	0.15	0.13	0.21	0.13	0.17	0.16	0.14	0.14	0.24	0.26	0.13	0.19	0.24	0.22	0.21	0.44	0.46	0.49
N3	0.14	0.15	0.08	0.07	0.18	0.13	0.18	0.15	0.18	0.16	0.16	0.15	0.08	0.08	0.18	0.19	0.10	0.23	0.21	0.28
N6	0.13	0.22	0.17	0.14	0.23	0.13	0.17	0.16	0.15	0.15	0.26	0.27	0.14	0.22	0.27	0.23	0.20	0.49	0.49	0.53
N7	0.13	0.17	0.12	0.12	0.19	0.13	0.18	0.15	0.17	0.15	0.19	0.18	0.11	0.17	0.21	0.17	0.09	0.28	0.22	0.31
N9	0.17	0.14	0.13	0.16	0.17	0.19	0.19	0.21	0.20	0.17	0.15	0.12	0.14	0.20	0.17	0.22	0.19	0.15	0.19	0.20
O2'	0.27	0.20	0.35	0.42	0.24	0.33	0.29	0.37	0.30	0.25	0.21	0.18	0.46	0.72	0.24	0.42	0.45	0.35	0.50	0.37
O3'	0.29	0.37	0.33	0.46	0.45	0.31	0.44	0.37	0.41	0.36	0.41	0.35	0.43	0.79	0.47	0.34	0.49	0.53	0.52	0.44
O4'	0.28	0.14	0.24	0.33	0.17	0.41	0.23	0.47	0.27	0.22	0.13	0.11	0.25	0.42	0.15	0.42	0.50	0.37	0.54	0.38
O5'	0.22	0.16	0.36	0.44	0.19	0.35	0.23	0.38	0.24	0.20	0.16	0.15	0.43	0.63	0.19	0.30	0.43	0.33	0.47	0.35
OP1	0.24	0.20	0.21	0.34	0.25	0.32	0.28	0.38	0.28	0.24	0.22	0.17	0.23	0.49	0.26	0.32	0.50	0.33	0.57	0.37
OP2	0.34	0.38	0.52	0.52	0.32	0.37	0.29	0.35	0.30	0.32	0.37	0.46	0.60	0.65	0.32	0.31	0.42	0.28	0.43	0.33
P	0.25	0.18	0.39	0.47	0.19	0.38	0.23	0.41	0.25	0.21	0.16	0.18	0.44	0.64	0.18	0.32	0.47	0.34	0.50	0.37

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.04	0.01	0.02	0.03	0.01	0.11	0.19	0.19	0.23
C2	0.03	0.00	0.06	0.04	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.08	0.05	0.03	0.02	0.22	0.20	0.31	0.26
C2'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.05	0.09	0.01	0.01	0.04	0.01	0.17	0.28	0.19	0.14
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.06	0.01	0.10	0.03	0.11	0.04	0.05	0.08	0.03	0.01	0.06	0.02	0.28	0.41	0.36	0.25
C4	0.02	0.02	0.03	0.06	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.04	0.05	0.07	0.00	0.03	0.33	0.26	0.50	0.32
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.04	0.05	0.06	0.02	0.04	0.01	0.02	0.20	0.17	0.06
C5	0.02	0.02	0.03	0.10	0.01	0.05	0.00	0.06	0.00	0.01	0.02	0.03	0.01	0.11	0.01	0.04	0.36	0.27	0.52	0.33
C5'	0.01	0.03	0.01	0.03	0.04	0.01	0.06	0.00	0.06	0.02	0.04	0.05	0.05	0.04	0.06	0.01	0.01	0.23	0.31	0.02
C6	0.02	0.02	0.04	0.11	0.01	0.05	0.00	0.06	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.12	0.01	0.04	0.33	0.25	0.43	0.31
N1	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.05	0.02	0.01	0.23	0.21	0.30	0.27
N3	0.03	0.01	0.05	0.05	0.01	0.04	0.02	0.04	0.02	0.02	0.00	0.03	0.07	0.05	0.03	0.03	0.28	0.23	0.40	0.29
O2	0.04	0.01	0.09	0.08	0.04	0.05	0.03	0.05	0.02	0.02	0.03	0.00	0.11	0.09	0.05	0.04	0.19	0.21	0.25	0.24
O2'	0.01	0.08	0.01	0.03	0.05	0.06	0.01	0.05	0.02	0.02	0.07	0.11	0.00	0.02	0.06	0.05	0.09	0.26	0.11	0.12
O3'	0.02	0.05	0.01	0.01	0.07	0.02	0.11	0.04	0.12	0.05	0.05	0.09	0.02	0.00	0.07	0.02	0.34	0.56	0.56	0.37
O4	0.03	0.03	0.04	0.06	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.02	0.03	0.05	0.06	0.07	0.00	0.03	0.35	0.28	0.55	0.34
O4'	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.03	0.04	0.05	0.02	0.03	0.00	0.18	0.27	0.30	0.32
O5'	0.11	0.22	0.17	0.28	0.33	0.02	0.36	0.01	0.33	0.23	0.28	0.19	0.09	0.34	0.35	0.18	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.19	0.20	0.28	0.41	0.26	0.20	0.27	0.23	0.25	0.21	0.23	0.21	0.26	0.56	0.28	0.27	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.19	0.31	0.19	0.36	0.50	0.17	0.52	0.31	0.43	0.30	0.40	0.25	0.11	0.56	0.55	0.30	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.23	0.26	0.14	0.25	0.32	0.06	0.33	0.02	0.31	0.27	0.29	0.24	0.12	0.37	0.34	0.32	0.01	0.01	0.01	0.00