Doublet Group distance statistics: 53527

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C1'	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.000, 0.007, 0.014, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.007 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.000, 0.008, 0.017, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.008 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.002, 0.010, 0.019, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.010 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.001, 0.013, 0.024, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.013 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.001, 0.013, 0.025, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.013 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.002, 0.014, 0.027, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.014 std_dev=0.013
N9	A	0, 0.000, 0.015, 0.030, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.015 std_dev=0.015
N7	A	0, 0.003, 0.024, 0.045, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.024 std_dev=0.021
N6	A	0, 0.001, 0.027, 0.053, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.027 std_dev=0.026
C8	A	0, 0.003, 0.030, 0.057, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.030 std_dev=0.027
O4'	A	0, 0.010, 0.127, 0.245, 0.344 max_d=0.344 avg_d=0.127 std_dev=0.118
C2'	A	0, 0.016, 0.148, 0.281, 0.378 max_d=0.378 avg_d=0.148 std_dev=0.132
C4'	A	0, -0.019, 0.175, 0.370, 0.553 max_d=0.553 avg_d=0.175 std_dev=0.195
C3'	A	0, 0.016, 0.243, 0.470, 0.654 max_d=0.654 avg_d=0.243 std_dev=0.227
O2'	A	0, 0.006, 0.248, 0.490, 0.689 max_d=0.689 avg_d=0.248 std_dev=0.242
C4	B	0, 0.147, 0.414, 0.680, 0.720 max_d=0.720 avg_d=0.414 std_dev=0.267
N3	B	0, 0.149, 0.418, 0.688, 0.774 max_d=0.774 avg_d=0.418 std_dev=0.270
O4	B	0, 0.177, 0.479, 0.781, 0.772 max_d=0.772 avg_d=0.479 std_dev=0.302
C5	B	0, 0.140, 0.462, 0.784, 0.840 max_d=0.840 avg_d=0.462 std_dev=0.322
C2	B	0, 0.146, 0.474, 0.802, 0.909 max_d=0.909 avg_d=0.474 std_dev=0.328
C3'	B	0, 0.016, 0.354, 0.691, 0.866 max_d=0.866 avg_d=0.354 std_dev=0.338
C6	B	0, 0.088, 0.459, 0.830, 0.907 max_d=0.907 avg_d=0.459 std_dev=0.371
O3'	A	0, 0.028, 0.415, 0.802, 1.092 max_d=1.092 avg_d=0.415 std_dev=0.387
N1	B	0, 0.075, 0.465, 0.856, 0.967 max_d=0.967 avg_d=0.465 std_dev=0.391
C5'	A	0, -0.008, 0.383, 0.774, 1.115 max_d=1.115 avg_d=0.383 std_dev=0.391
O3'	B	0, 0.035, 0.440, 0.844, 1.023 max_d=1.023 avg_d=0.440 std_dev=0.404
O2	B	0, 0.188, 0.602, 1.017, 1.123 max_d=1.123 avg_d=0.602 std_dev=0.415
C2'	B	0, 0.015, 0.500, 0.985, 1.156 max_d=1.156 avg_d=0.500 std_dev=0.485
C4'	B	0, -0.003, 0.514, 1.032, 1.266 max_d=1.266 avg_d=0.514 std_dev=0.518
O5'	B	0, 0.018, 0.542, 1.065, 1.450 max_d=1.450 avg_d=0.542 std_dev=0.523
C1'	B	0, 0.018, 0.562, 1.105, 1.311 max_d=1.311 avg_d=0.562 std_dev=0.543
O4'	B	0, -0.050, 0.643, 1.336, 1.746 max_d=1.746 avg_d=0.643 std_dev=0.693
O5'	A	0, -0.113, 0.667, 1.447, 2.149 max_d=2.149 avg_d=0.667 std_dev=0.780
O2'	B	0, -0.036, 0.759, 1.553, 2.047 max_d=2.047 avg_d=0.759 std_dev=0.795
C5'	B	0, -0.098, 0.732, 1.561, 2.270 max_d=2.270 avg_d=0.732 std_dev=0.829
P	B	0, -0.086, 0.837, 1.761, 2.574 max_d=2.574 avg_d=0.837 std_dev=0.924
P	A	0, -0.136, 0.794, 1.725, 2.457 max_d=2.457 avg_d=0.794 std_dev=0.930
OP1	B	0, -0.079, 0.876, 1.831, 2.681 max_d=2.681 avg_d=0.876 std_dev=0.955
OP2	B	0, -0.138, 0.901, 1.940, 2.891 max_d=2.891 avg_d=0.901 std_dev=1.039
OP2	A	0, -0.083, 1.121, 2.326, 2.689 max_d=2.689 avg_d=1.121 std_dev=1.205
OP1	A	0, -0.047, 1.240, 2.526, 3.243 max_d=3.243 avg_d=1.240 std_dev=1.287

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.08	0.00	0.36	0.70	0.32	0.07
C2	0.02	0.00	0.12	0.06	0.02	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.22	0.17	0.05	0.56	0.76	0.80	0.26
C2'	0.01	0.12	0.00	0.01	0.07	0.01	0.05	0.05	0.07	0.06	0.10	0.12	0.07	0.05	0.03	0.00	0.05	0.02	0.34	0.52	0.28	0.06
C3'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.03	0.01	0.07	0.04	0.05	0.15	0.04	0.06	0.06	0.14	0.06	0.00	0.02	0.01	0.30	0.32	0.29	0.07
C4	0.00	0.02	0.07	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.14	0.07	0.05	0.60	0.71	0.76	0.29
C4'	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.01	0.05	0.03	0.06	0.05	0.01	0.07	0.58	0.06	0.20
C5	0.01	0.02	0.05	0.07	0.01	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.11	0.07	0.04	0.69	0.77	0.94	0.46
C5'	0.03	0.04	0.05	0.04	0.04	0.01	0.06	0.00	0.07	0.07	0.06	0.03	0.09	0.07	0.05	0.05	0.02	0.02	0.01	0.15	0.29	0.05
C6	0.02	0.01	0.07	0.05	0.02	0.02	0.01	0.07	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.15	0.07	0.04	0.69	0.81	1.00	0.48
C8	0.01	0.02	0.06	0.15	0.00	0.04	0.01	0.07	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.00	0.01	0.04	0.15	0.03	0.70	0.66	0.80	0.45
N1	0.02	0.00	0.10	0.04	0.02	0.01	0.02	0.06	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.19	0.11	0.04	0.63	0.79	0.93	0.38
N3	0.01	0.01	0.12	0.06	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.22	0.17	0.06	0.52	0.73	0.69	0.19
N6	0.02	0.00	0.07	0.06	0.02	0.01	0.02	0.09	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.04	0.02	0.14	0.09	0.03	0.72	0.86	1.09	0.57
N7	0.00	0.02	0.05	0.14	0.00	0.05	0.00	0.07	0.02	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.05	0.15	0.04	0.75	0.79	0.99	0.58
N9	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.07	0.04	0.02	0.56	0.65	0.62	0.23
O2'	0.05	0.22	0.00	0.00	0.14	0.06	0.11	0.05	0.15	0.04	0.19	0.22	0.14	0.05	0.07	0.00	0.09	0.04	0.22	0.67	0.12	0.13
O3'	0.08	0.17	0.05	0.02	0.07	0.05	0.07	0.02	0.07	0.15	0.11	0.17	0.09	0.15	0.04	0.09	0.00	0.09	0.15	0.44	0.24	0.03
O4'	0.00	0.05	0.02	0.01	0.05	0.01	0.04	0.02	0.04	0.03	0.04	0.06	0.03	0.04	0.02	0.04	0.09	0.00	0.23	0.76	0.18	0.17
O5'	0.36	0.56	0.34	0.30	0.60	0.07	0.69	0.01	0.69	0.70	0.63	0.52	0.72	0.75	0.56	0.22	0.15	0.23	0.00	0.05	0.02	0.01
OP1	0.70	0.76	0.52	0.32	0.71	0.58	0.77	0.15	0.81	0.66	0.79	0.73	0.86	0.79	0.65	0.67	0.44	0.76	0.05	0.00	0.01	0.00
OP2	0.32	0.80	0.28	0.29	0.76	0.06	0.94	0.29	1.00	0.80	0.93	0.69	1.09	0.99	0.62	0.12	0.24	0.18	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.26	0.06	0.07	0.29	0.20	0.46	0.05	0.48	0.45	0.38	0.19	0.57	0.58	0.23	0.13	0.03	0.17	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.28	0.15	0.13	0.09	0.17	0.45	0.28	0.57	0.32	0.22	0.16	0.26	0.25	0.23	0.16	0.58	0.47	0.48	0.39	0.55
C2	0.35	0.17	0.19	0.17	0.18	0.32	0.21	0.38	0.26	0.24	0.20	0.23	0.17	0.37	0.20	0.57	0.41	0.37	0.34	0.48
C2'	0.18	0.25	0.29	0.15	0.22	0.39	0.28	0.60	0.28	0.20	0.25	0.41	0.51	0.27	0.22	0.46	0.45	0.54	0.45	0.58
C3'	0.18	0.26	0.31	0.18	0.23	0.34	0.28	0.56	0.27	0.20	0.25	0.40	0.50	0.30	0.23	0.40	0.43	0.55	0.47	0.56
C4	0.30	0.17	0.21	0.11	0.18	0.41	0.24	0.53	0.28	0.22	0.20	0.27	0.29	0.33	0.19	0.63	0.47	0.48	0.41	0.57
C4'	0.21	0.16	0.14	0.11	0.17	0.39	0.27	0.54	0.29	0.19	0.16	0.28	0.25	0.18	0.16	0.47	0.41	0.45	0.37	0.50
C5	0.26	0.16	0.24	0.11	0.17	0.39	0.21	0.54	0.25	0.19	0.21	0.27	0.31	0.34	0.20	0.61	0.47	0.52	0.45	0.60
C5'	0.20	0.21	0.19	0.11	0.19	0.37	0.24	0.54	0.26	0.19	0.22	0.34	0.29	0.18	0.19	0.44	0.39	0.46	0.39	0.50
C6	0.26	0.15	0.24	0.14	0.18	0.35	0.18	0.48	0.21	0.18	0.21	0.23	0.28	0.36	0.22	0.57	0.45	0.49	0.44	0.58
C8	0.25	0.16	0.21	0.07	0.17	0.45	0.25	0.62	0.28	0.20	0.20	0.28	0.33	0.28	0.18	0.62	0.50	0.57	0.49	0.64
N1	0.28	0.15	0.22	0.16	0.18	0.31	0.17	0.40	0.21	0.20	0.21	0.20	0.21	0.36	0.22	0.54	0.42	0.42	0.38	0.52
N3	0.36	0.18	0.19	0.15	0.18	0.38	0.24	0.44	0.29	0.25	0.19	0.25	0.22	0.35	0.18	0.62	0.44	0.40	0.35	0.50
N6	0.23	0.13	0.25	0.14	0.17	0.34	0.15	0.48	0.18	0.15	0.21	0.20	0.29	0.35	0.23	0.55	0.44	0.51	0.47	0.60
N7	0.24	0.16	0.23	0.08	0.17	0.43	0.22	0.60	0.25	0.18	0.21	0.28	0.34	0.31	0.20	0.62	0.49	0.58	0.50	0.65
N9	0.29	0.16	0.18	0.08	0.17	0.45	0.26	0.59	0.31	0.23	0.18	0.27	0.30	0.28	0.18	0.63	0.49	0.52	0.44	0.60
O2'	0.22	0.32	0.34	0.22	0.26	0.35	0.29	0.54	0.29	0.24	0.31	0.48	0.52	0.32	0.27	0.38	0.43	0.48	0.40	0.51
O3'	0.31	0.39	0.46	0.34	0.33	0.32	0.34	0.51	0.33	0.31	0.38	0.53	0.64	0.44	0.33	0.32	0.47	0.59	0.54	0.58
O4'	0.29	0.14	0.10	0.09	0.16	0.42	0.27	0.53	0.32	0.23	0.14	0.23	0.16	0.20	0.15	0.55	0.42	0.42	0.33	0.49
O5'	0.56	0.43	0.21	0.26	0.51	0.63	0.62	0.77	0.63	0.55	0.42	0.33	0.19	0.04	0.50	0.82	0.62	0.62	0.60	0.73
OP1	0.82	0.89	0.87	0.91	0.89	0.77	0.86	0.77	0.84	0.85	0.91	0.91	0.83	1.09	0.90	0.84	0.80	0.79	0.88	0.81
OP2	0.54	0.58	0.41	0.21	0.54	0.44	0.53	0.54	0.54	0.54	0.57	0.65	0.50	0.33	0.55	0.68	0.42	0.46	0.34	0.53
P	0.36	0.25	0.17	0.19	0.30	0.40	0.39	0.53	0.41	0.34	0.25	0.24	0.22	0.43	0.30	0.62	0.45	0.48	0.44	0.56

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.06	0.04	0.01	0.08
C2	0.02	0.00	0.14	0.18	0.01	0.08	0.01	0.05	0.02	0.01	0.01	0.01	0.09	0.20	0.00	0.02	0.17	0.14	0.16	0.20
C2'	0.02	0.14	0.00	0.00	0.01	0.01	0.10	0.02	0.12	0.00	0.09	0.30	0.00	0.02	0.03	0.00	0.22	0.18	0.12	0.20
C3'	0.03	0.18	0.00	0.00	0.02	0.01	0.13	0.02	0.16	0.02	0.12	0.32	0.01	0.01	0.03	0.01	0.33	0.26	0.12	0.26
C4	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.31	0.34	0.39	0.37
C4'	0.02	0.08	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.01	0.06	0.02	0.06	0.15	0.03	0.04	0.02	0.01	0.02	0.04	0.14	0.02
C5	0.01	0.01	0.10	0.13	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.16	0.00	0.07	0.34	0.37	0.41	0.39
C5'	0.00	0.05	0.02	0.02	0.04	0.01	0.09	0.00	0.10	0.02	0.03	0.11	0.03	0.03	0.05	0.01	0.00	0.03	0.25	0.01
C6	0.02	0.02	0.12	0.16	0.01	0.06	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.02	0.08	0.17	0.00	0.08	0.29	0.28	0.28	0.31
N1	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.18	0.15	0.14	0.20
N3	0.02	0.01	0.09	0.12	0.00	0.06	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.14	0.02	0.03	0.24	0.24	0.28	0.30
O2	0.05	0.01	0.30	0.32	0.01	0.15	0.01	0.11	0.02	0.02	0.01	0.00	0.21	0.38	0.02	0.02	0.09	0.06	0.08	0.13
O2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.01	0.03	0.08	0.03	0.08	0.01	0.06	0.21	0.00	0.04	0.02	0.02	0.09	0.10	0.06	0.09
O3'	0.05	0.20	0.02	0.01	0.02	0.04	0.16	0.03	0.17	0.03	0.14	0.38	0.04	0.00	0.04	0.04	0.32	0.31	0.14	0.27
O4	0.01	0.00	0.03	0.03	0.01	0.02	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.04	0.00	0.04	0.34	0.39	0.46	0.42
O4'	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.08	0.03	0.03	0.02	0.02	0.04	0.04	0.00	0.12	0.09	0.17	0.07
O5'	0.06	0.17	0.22	0.33	0.31	0.02	0.34	0.00	0.29	0.18	0.24	0.09	0.09	0.32	0.34	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.04	0.14	0.18	0.26	0.34	0.04	0.37	0.03	0.28	0.15	0.24	0.06	0.10	0.31	0.39	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.01	0.16	0.12	0.12	0.39	0.14	0.41	0.25	0.28	0.14	0.28	0.08	0.06	0.14	0.46	0.17	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.20	0.20	0.26	0.37	0.02	0.39	0.01	0.31	0.20	0.30	0.13	0.09	0.27	0.42	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00