Doublet Group distance statistics: 53528

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.004, 0.013, 0.022, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.013 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.006, 0.017, 0.029, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.017 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.008, 0.019, 0.031, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.019 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.006, 0.019, 0.032, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.019 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.011, 0.025, 0.040, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.025 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.010, 0.029, 0.049, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.029 std_dev=0.019
N6	A	0, 0.004, 0.027, 0.051, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.027 std_dev=0.024
N7	A	0, 0.013, 0.037, 0.061, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.037 std_dev=0.024
N9	A	0, 0.010, 0.041, 0.072, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.041 std_dev=0.031
C8	A	0, 0.016, 0.048, 0.081, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.048 std_dev=0.033
C4'	A	0, 0.017, 0.166, 0.315, 0.344 max_d=0.344 avg_d=0.166 std_dev=0.149
O4'	A	0, 0.030, 0.222, 0.415, 0.447 max_d=0.447 avg_d=0.222 std_dev=0.193
C2'	A	0, 0.059, 0.279, 0.500, 0.487 max_d=0.487 avg_d=0.279 std_dev=0.221
C5'	A	0, 0.082, 0.449, 0.816, 0.851 max_d=0.851 avg_d=0.449 std_dev=0.367
O2'	B	0, 0.109, 0.482, 0.855, 0.821 max_d=0.821 avg_d=0.482 std_dev=0.373
O2'	A	0, 0.087, 0.502, 0.916, 0.924 max_d=0.924 avg_d=0.502 std_dev=0.414
C3'	A	0, 0.092, 0.512, 0.933, 0.952 max_d=0.952 avg_d=0.512 std_dev=0.420
O2	B	0, 0.023, 0.449, 0.876, 0.957 max_d=0.957 avg_d=0.449 std_dev=0.426
C1'	B	0, 0.073, 0.513, 0.952, 0.997 max_d=0.997 avg_d=0.513 std_dev=0.439
N1	B	0, 0.078, 0.524, 0.971, 1.006 max_d=1.006 avg_d=0.524 std_dev=0.446
C2	B	0, 0.053, 0.502, 0.951, 1.012 max_d=1.012 avg_d=0.502 std_dev=0.449
C2'	B	0, 0.117, 0.587, 1.057, 0.994 max_d=0.994 avg_d=0.587 std_dev=0.470
C6	B	0, 0.121, 0.606, 1.091, 1.087 max_d=1.087 avg_d=0.606 std_dev=0.485
N3	B	0, 0.070, 0.575, 1.080, 1.142 max_d=1.142 avg_d=0.575 std_dev=0.505
O5'	A	0, 0.141, 0.655, 1.169, 1.189 max_d=1.189 avg_d=0.655 std_dev=0.514
C5	B	0, 0.133, 0.657, 1.181, 1.174 max_d=1.174 avg_d=0.657 std_dev=0.524
C4	B	0, 0.113, 0.654, 1.194, 1.229 max_d=1.229 avg_d=0.654 std_dev=0.541
O4	B	0, 0.126, 0.724, 1.321, 1.368 max_d=1.368 avg_d=0.724 std_dev=0.598
P	A	0, 0.193, 0.877, 1.560, 1.517 max_d=1.517 avg_d=0.877 std_dev=0.683
O4'	B	0, 0.113, 0.853, 1.592, 1.679 max_d=1.679 avg_d=0.853 std_dev=0.740
O3'	A	0, 0.168, 0.966, 1.764, 1.782 max_d=1.782 avg_d=0.966 std_dev=0.798
C3'	B	0, 0.180, 0.980, 1.779, 1.730 max_d=1.730 avg_d=0.980 std_dev=0.800
OP2	A	0, 0.128, 0.957, 1.786, 1.896 max_d=1.896 avg_d=0.957 std_dev=0.829
O3'	B	0, 0.204, 1.049, 1.894, 1.744 max_d=1.744 avg_d=1.049 std_dev=0.845
C4'	B	0, 0.175, 1.108, 2.041, 2.073 max_d=2.073 avg_d=1.108 std_dev=0.933
C5'	B	0, 0.277, 1.720, 3.162, 3.182 max_d=3.182 avg_d=1.720 std_dev=1.442
OP1	A	0, 0.339, 1.986, 3.633, 4.047 max_d=4.047 avg_d=1.986 std_dev=1.647
O5'	B	0, 0.582, 3.210, 5.838, 5.689 max_d=5.689 avg_d=3.210 std_dev=2.628
OP1	B	0, 0.732, 3.942, 7.151, 6.979 max_d=6.979 avg_d=3.942 std_dev=3.209
P	B	0, 0.805, 4.341, 7.878, 7.616 max_d=7.616 avg_d=4.341 std_dev=3.536
OP2	B	0, 1.084, 5.768, 10.453, 9.958 max_d=9.958 avg_d=5.768 std_dev=4.684

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.12	0.72	0.08	0.26
C2	0.02	0.00	0.07	0.02	0.00	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.20	0.05	0.01	0.18	1.02	0.17	0.39
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.03	0.03	0.04	0.01	0.05	0.07	0.05	0.07	0.06	0.07	0.02	0.00	0.01	0.01	0.07	0.36	0.03	0.13
C3'	0.03	0.02	0.00	0.00	0.08	0.00	0.15	0.01	0.13	0.22	0.07	0.02	0.17	0.22	0.12	0.01	0.01	0.02	0.03	0.04	0.09	0.03
C4	0.01	0.00	0.03	0.08	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.12	0.07	0.01	0.16	1.03	0.19	0.38
C4'	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.04	0.06	0.02	0.01	0.05	0.06	0.04	0.14	0.02	0.00	0.01	0.16	0.15	0.04
C5	0.00	0.01	0.04	0.15	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.09	0.17	0.03	0.16	1.19	0.29	0.43
C5'	0.02	0.04	0.01	0.01	0.04	0.01	0.06	0.00	0.05	0.09	0.04	0.03	0.06	0.09	0.05	0.14	0.06	0.02	0.01	0.10	0.30	0.03
C6	0.01	0.01	0.05	0.13	0.01	0.04	0.01	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.16	0.02	0.16	1.21	0.31	0.44
C8	0.02	0.01	0.07	0.22	0.00	0.06	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.24	0.06	0.16	1.18	0.30	0.41
N1	0.02	0.00	0.05	0.07	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.17	0.07	0.01	0.17	1.13	0.25	0.43
N3	0.02	0.00	0.07	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.20	0.07	0.02	0.17	0.94	0.13	0.36
N6	0.01	0.01	0.06	0.17	0.01	0.05	0.01	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.22	0.02	0.16	1.28	0.38	0.46
N7	0.01	0.00	0.07	0.22	0.01	0.06	0.00	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.04	0.27	0.05	0.17	1.28	0.37	0.45
N9	0.01	0.00	0.02	0.12	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.10	0.02	0.14	0.98	0.18	0.35
O2'	0.01	0.20	0.00	0.01	0.12	0.14	0.09	0.14	0.12	0.03	0.17	0.20	0.11	0.04	0.05	0.00	0.08	0.10	0.06	0.14	0.06	0.04
O3'	0.03	0.05	0.01	0.01	0.07	0.02	0.17	0.06	0.16	0.24	0.07	0.07	0.22	0.27	0.10	0.08	0.00	0.03	0.20	0.43	0.22	0.27
O4'	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.02	0.02	0.06	0.01	0.02	0.02	0.05	0.02	0.10	0.03	0.00	0.11	0.69	0.17	0.25
O5'	0.12	0.18	0.07	0.03	0.16	0.01	0.16	0.01	0.16	0.16	0.17	0.17	0.16	0.17	0.14	0.06	0.20	0.11	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.72	1.02	0.36	0.04	1.03	0.16	1.19	0.10	1.21	1.18	1.13	0.94	1.28	1.28	0.98	0.14	0.43	0.69	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.08	0.17	0.03	0.09	0.19	0.15	0.29	0.30	0.31	0.30	0.25	0.13	0.38	0.37	0.18	0.06	0.22	0.17	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.26	0.39	0.13	0.03	0.38	0.04	0.43	0.03	0.44	0.41	0.43	0.36	0.46	0.45	0.35	0.04	0.27	0.25	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.31	0.23	0.13	0.14	0.25	0.34	0.29	0.37	0.30	0.28	0.22	0.19	0.12	0.05	0.24	0.36	0.52	0.34	0.65	0.64
C2	0.09	0.08	0.25	0.22	0.14	0.10	0.15	0.10	0.13	0.10	0.10	0.02	0.26	0.32	0.14	0.18	0.08	0.09	0.08	0.08
C2'	0.19	0.14	0.06	0.11	0.15	0.33	0.16	0.42	0.16	0.16	0.14	0.14	0.13	0.03	0.15	0.31	0.74	0.56	1.03	0.91
C3'	0.13	0.12	0.02	0.08	0.12	0.26	0.12	0.37	0.11	0.12	0.12	0.13	0.09	0.04	0.13	0.22	0.79	0.59	1.22	1.03
C4	0.20	0.13	0.13	0.12	0.16	0.20	0.20	0.21	0.20	0.17	0.13	0.10	0.15	0.24	0.15	0.27	0.28	0.16	0.31	0.34
C4'	0.28	0.21	0.17	0.24	0.23	0.38	0.27	0.46	0.28	0.25	0.20	0.18	0.14	0.17	0.22	0.34	0.78	0.58	1.10	1.00
C5	0.18	0.10	0.15	0.15	0.12	0.18	0.16	0.20	0.16	0.14	0.10	0.07	0.15	0.27	0.11	0.26	0.25	0.13	0.28	0.31
C5'	0.28	0.19	0.21	0.29	0.23	0.41	0.28	0.51	0.29	0.25	0.19	0.15	0.18	0.26	0.22	0.34	0.85	0.67	1.23	1.11
C6	0.12	0.05	0.21	0.21	0.08	0.14	0.12	0.14	0.12	0.09	0.05	0.01	0.20	0.33	0.08	0.22	0.14	0.08	0.11	0.17
C8	0.23	0.14	0.06	0.06	0.16	0.26	0.20	0.28	0.21	0.19	0.13	0.12	0.07	0.17	0.14	0.31	0.41	0.23	0.53	0.53
N1	0.08	0.03	0.26	0.24	0.08	0.09	0.11	0.09	0.09	0.06	0.05	0.02	0.24	0.35	0.09	0.17	0.06	0.09	0.07	0.06
N3	0.17	0.14	0.17	0.15	0.18	0.16	0.20	0.17	0.19	0.17	0.15	0.10	0.23	0.26	0.18	0.24	0.19	0.13	0.19	0.22
N6	0.11	0.02	0.22	0.23	0.05	0.13	0.09	0.13	0.09	0.07	0.02	0.01	0.19	0.34	0.04	0.21	0.12	0.07	0.08	0.15
N7	0.21	0.11	0.11	0.11	0.13	0.22	0.17	0.24	0.18	0.16	0.10	0.09	0.10	0.23	0.11	0.29	0.34	0.17	0.42	0.43
N9	0.25	0.16	0.06	0.07	0.18	0.26	0.22	0.28	0.23	0.21	0.16	0.13	0.08	0.16	0.17	0.31	0.40	0.23	0.49	0.50
O2'	0.05	0.01	0.09	0.07	0.01	0.29	0.02	0.40	0.03	0.02	0.01	0.02	0.24	0.01	0.00	0.20	0.72	0.56	0.97	0.88
O3'	0.07	0.05	0.19	0.10	0.06	0.08	0.09	0.22	0.10	0.07	0.05	0.08	0.27	0.19	0.06	0.07	0.80	0.59	1.41	1.10
O4'	0.36	0.25	0.24	0.26	0.29	0.41	0.35	0.45	0.36	0.32	0.24	0.20	0.24	0.16	0.28	0.40	0.62	0.44	0.78	0.77
O5'	0.17	0.11	0.08	0.17	0.12	0.34	0.15	0.46	0.17	0.14	0.11	0.12	0.07	0.13	0.12	0.27	0.82	0.66	1.26	1.10
OP1	0.36	0.59	0.47	0.27	0.58	0.26	0.45	0.39	0.38	0.44	0.64	0.65	0.51	0.23	0.65	0.26	0.69	0.64	1.17	1.07
OP2	0.24	0.24	0.12	0.13	0.26	0.29	0.25	0.36	0.24	0.24	0.25	0.24	0.12	0.09	0.27	0.29	0.77	0.53	1.26	1.04
P	0.16	0.20	0.14	0.15	0.17	0.32	0.14	0.45	0.14	0.15	0.21	0.25	0.15	0.10	0.20	0.25	0.79	0.66	1.24	1.10

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.17	0.09	0.29	0.18
C2	0.02	0.00	0.12	0.08	0.01	0.05	0.01	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.10	0.10	0.01	0.12	0.19	0.06	0.45	0.27
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.03	0.01	0.07	0.01	0.11	0.02	0.10	0.18	0.00	0.01	0.04	0.00	0.29	0.22	0.50	0.27
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.09	0.00	0.06	0.01	0.04	0.04	0.10	0.08	0.01	0.01	0.11	0.01	0.35	0.26	0.53	0.30
C4	0.01	0.01	0.03	0.09	0.00	0.08	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.00	0.02	0.68	0.46	1.29	0.89
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.08	0.00	0.15	0.01	0.15	0.03	0.02	0.13	0.04	0.01	0.08	0.00	0.01	0.05	0.04	0.03
C5	0.01	0.01	0.07	0.06	0.00	0.15	0.00	0.29	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.04	0.00	0.11	0.94	0.66	1.64	1.16
C5'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.17	0.01	0.29	0.00	0.28	0.07	0.05	0.17	0.05	0.04	0.18	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01
C6	0.02	0.00	0.11	0.04	0.01	0.15	0.00	0.28	0.00	0.00	0.01	0.00	0.12	0.04	0.01	0.15	0.87	0.57	1.36	1.00
N1	0.01	0.00	0.02	0.04	0.00	0.03	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.41	0.22	0.70	0.48
N3	0.01	0.00	0.10	0.10	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.12	0.01	0.08	0.37	0.20	0.78	0.51
O2	0.04	0.00	0.18	0.08	0.01	0.13	0.01	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.20	0.13	0.01	0.22	0.10	0.17	0.04	0.07
O2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.01	0.04	0.10	0.05	0.12	0.01	0.08	0.20	0.00	0.02	0.01	0.03	0.09	0.14	0.20	0.06
O3'	0.01	0.10	0.01	0.01	0.09	0.01	0.04	0.04	0.04	0.03	0.12	0.13	0.02	0.00	0.11	0.01	0.22	0.26	0.41	0.17
O4	0.01	0.01	0.04	0.11	0.00	0.08	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.00	0.03	0.71	0.51	1.42	0.97
O4'	0.00	0.12	0.00	0.01	0.02	0.00	0.11	0.01	0.15	0.01	0.08	0.22	0.03	0.01	0.03	0.00	0.02	0.05	0.02	0.02
O5'	0.17	0.19	0.29	0.35	0.68	0.01	0.94	0.00	0.87	0.41	0.37	0.10	0.09	0.22	0.71	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.09	0.06	0.22	0.26	0.46	0.05	0.66	0.03	0.57	0.22	0.20	0.17	0.14	0.26	0.51	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.29	0.45	0.50	0.53	1.29	0.04	1.64	0.01	1.36	0.70	0.78	0.04	0.20	0.41	1.42	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.18	0.27	0.27	0.30	0.89	0.03	1.16	0.01	1.00	0.48	0.51	0.07	0.06	0.17	0.97	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00