Doublet Group distance statistics: 53529

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.007, 0.018, 0.029, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.018 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.009, 0.022, 0.035, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.022 std_dev=0.013
C6	A	0, 0.012, 0.029, 0.046, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.029 std_dev=0.017
N1	A	0, 0.007, 0.027, 0.047, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.027 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.014, 0.036, 0.057, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.036 std_dev=0.021
C4	A	0, 0.015, 0.038, 0.061, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.038 std_dev=0.023
N3	A	0, 0.015, 0.039, 0.064, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.039 std_dev=0.024
C8	A	0, 0.018, 0.044, 0.070, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.044 std_dev=0.026
C1'	A	0, 0.015, 0.043, 0.072, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.043 std_dev=0.028
N6	A	0, 0.023, 0.057, 0.092, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.057 std_dev=0.035
N9	A	0, 0.003, 0.045, 0.086, 0.112 max_d=0.112 avg_d=0.045 std_dev=0.041
O3'	A	0, 0.116, 0.365, 0.614, 0.703 max_d=0.703 avg_d=0.365 std_dev=0.249
C3'	A	0, 0.172, 0.431, 0.690, 0.641 max_d=0.641 avg_d=0.431 std_dev=0.259
C2'	A	0, 0.134, 0.397, 0.660, 0.637 max_d=0.637 avg_d=0.397 std_dev=0.263
O2	B	0, 0.078, 0.350, 0.622, 0.764 max_d=0.764 avg_d=0.350 std_dev=0.272
O4'	A	0, 0.107, 0.408, 0.708, 0.696 max_d=0.696 avg_d=0.408 std_dev=0.300
O2'	B	0, 0.227, 0.537, 0.847, 0.732 max_d=0.732 avg_d=0.537 std_dev=0.310
C2'	B	0, 0.210, 0.523, 0.835, 0.831 max_d=0.831 avg_d=0.523 std_dev=0.313
C1'	B	0, 0.207, 0.522, 0.837, 0.843 max_d=0.843 avg_d=0.522 std_dev=0.315
C2	B	0, 0.172, 0.492, 0.813, 0.899 max_d=0.899 avg_d=0.492 std_dev=0.321
N1	B	0, 0.216, 0.552, 0.888, 0.909 max_d=0.909 avg_d=0.552 std_dev=0.336
O4'	B	0, 0.229, 0.568, 0.907, 0.897 max_d=0.897 avg_d=0.568 std_dev=0.339
C4'	B	0, 0.239, 0.599, 0.959, 0.962 max_d=0.962 avg_d=0.599 std_dev=0.360
C3'	B	0, 0.232, 0.599, 0.966, 1.001 max_d=1.001 avg_d=0.599 std_dev=0.367
N3	B	0, 0.245, 0.623, 1.001, 1.019 max_d=1.019 avg_d=0.623 std_dev=0.378
O3'	B	0, 0.235, 0.616, 0.997, 1.043 max_d=1.043 avg_d=0.616 std_dev=0.381
C6	B	0, 0.302, 0.724, 1.146, 1.062 max_d=1.062 avg_d=0.724 std_dev=0.422
C4'	A	0, 0.179, 0.627, 1.074, 1.051 max_d=1.051 avg_d=0.627 std_dev=0.448
O2'	A	0, 0.178, 0.630, 1.082, 1.069 max_d=1.069 avg_d=0.630 std_dev=0.452
C5'	B	0, 0.294, 0.750, 1.207, 1.235 max_d=1.235 avg_d=0.750 std_dev=0.457
P	A	0, 0.205, 0.665, 1.125, 1.104 max_d=1.104 avg_d=0.665 std_dev=0.460
C4	B	0, 0.334, 0.802, 1.270, 1.178 max_d=1.178 avg_d=0.802 std_dev=0.468
C5	B	0, 0.347, 0.829, 1.310, 1.189 max_d=1.189 avg_d=0.829 std_dev=0.481
O5'	B	0, 0.340, 0.826, 1.312, 1.248 max_d=1.248 avg_d=0.826 std_dev=0.486
O5'	A	0, 0.238, 0.798, 1.358, 1.341 max_d=1.341 avg_d=0.798 std_dev=0.560
O4	B	0, 0.424, 1.004, 1.583, 1.361 max_d=1.361 avg_d=1.004 std_dev=0.580
P	B	0, 0.471, 1.139, 1.807, 1.703 max_d=1.703 avg_d=1.139 std_dev=0.668
OP1	B	0, 0.547, 1.304, 2.061, 1.851 max_d=1.851 avg_d=1.304 std_dev=0.757
OP1	A	0, 0.511, 1.274, 2.036, 1.874 max_d=1.874 avg_d=1.274 std_dev=0.762
OP2	B	0, 0.546, 1.314, 2.081, 1.936 max_d=1.936 avg_d=1.314 std_dev=0.768
C5'	A	0, 0.227, 1.045, 1.864, 1.845 max_d=1.845 avg_d=1.045 std_dev=0.818
OP2	A	0, 0.559, 1.452, 2.346, 2.197 max_d=2.197 avg_d=1.452 std_dev=0.894

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.04	0.02	0.04	0.02	0.05	0.02	0.06	0.04	0.07	0.03	0.01	0.02	0.06	0.01	0.09	0.11	0.14	0.07
C2	0.05	0.00	0.06	0.03	0.02	0.15	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.15	0.08	0.16	0.12	0.28	0.19	0.03
C2'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.06	0.04	0.09	0.05	0.06	0.05	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.21	0.09	0.21	0.13
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.04	0.03	0.03	0.05	0.04	0.00	0.02	0.00	0.00	0.36	0.07	0.34	0.16
C4	0.04	0.02	0.03	0.02	0.00	0.07	0.00	0.02	0.02	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.01	0.05	0.07	0.08	0.21	0.13	0.26	0.11
C4'	0.02	0.15	0.01	0.00	0.07	0.00	0.03	0.01	0.06	0.08	0.12	0.15	0.05	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.11	0.10	0.06
C5	0.04	0.01	0.04	0.03	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.06	0.06	0.05	0.31	0.03	0.38	0.18
C5'	0.02	0.11	0.06	0.01	0.02	0.01	0.08	0.00	0.04	0.21	0.06	0.11	0.07	0.19	0.08	0.06	0.04	0.01	0.01	0.12	0.15	0.02
C6	0.05	0.01	0.04	0.03	0.02	0.06	0.01	0.04	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.05	0.07	0.08	0.29	0.08	0.38	0.16
C8	0.02	0.01	0.09	0.04	0.01	0.08	0.01	0.21	0.02	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.00	0.17	0.05	0.07	0.38	0.13	0.43	0.25
N1	0.06	0.00	0.05	0.03	0.03	0.12	0.01	0.06	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.09	0.07	0.13	0.20	0.20	0.28	0.09
N3	0.04	0.01	0.06	0.03	0.00	0.15	0.02	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.16	0.09	0.15	0.09	0.27	0.16	0.03
N6	0.07	0.02	0.05	0.05	0.03	0.05	0.03	0.07	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.03	0.05	0.07	0.07	0.08	0.34	0.04	0.44	0.19
N7	0.03	0.01	0.07	0.04	0.01	0.05	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.01	0.15	0.06	0.03	0.41	0.13	0.48	0.27
N9	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.08	0.04	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.00	0.02	0.06	0.01	0.24	0.05	0.27	0.14
O2'	0.02	0.15	0.01	0.02	0.05	0.01	0.06	0.06	0.05	0.17	0.09	0.16	0.07	0.15	0.02	0.00	0.02	0.02	0.28	0.11	0.29	0.17
O3'	0.06	0.08	0.01	0.00	0.07	0.01	0.06	0.04	0.07	0.05	0.07	0.09	0.07	0.06	0.06	0.02	0.00	0.06	0.43	0.11	0.45	0.19
O4'	0.01	0.16	0.01	0.00	0.08	0.00	0.05	0.01	0.08	0.07	0.13	0.15	0.08	0.03	0.01	0.02	0.06	0.00	0.25	0.16	0.25	0.15
O5'	0.09	0.12	0.21	0.36	0.21	0.02	0.31	0.01	0.29	0.38	0.20	0.09	0.34	0.41	0.24	0.28	0.43	0.25	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.11	0.28	0.09	0.07	0.13	0.11	0.03	0.12	0.08	0.13	0.20	0.27	0.04	0.13	0.05	0.11	0.11	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.14	0.19	0.21	0.34	0.26	0.10	0.38	0.15	0.38	0.43	0.28	0.16	0.44	0.48	0.27	0.29	0.45	0.25	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.03	0.13	0.16	0.11	0.06	0.18	0.02	0.16	0.25	0.09	0.03	0.19	0.27	0.14	0.17	0.19	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.08	0.15	0.17	0.07	0.12	0.06	0.09	0.12	0.08	0.10	0.15	0.17	0.26	0.09	0.12	0.12	0.06	0.10	0.04	0.06
C2	0.08	0.11	0.06	0.05	0.13	0.09	0.08	0.10	0.03	0.03	0.15	0.14	0.08	0.06	0.14	0.15	0.08	0.09	0.12	0.09
C2'	0.09	0.11	0.07	0.03	0.14	0.13	0.16	0.20	0.16	0.12	0.11	0.09	0.19	0.02	0.12	0.23	0.11	0.13	0.10	0.11
C3'	0.08	0.07	0.19	0.10	0.06	0.02	0.06	0.08	0.05	0.06	0.06	0.09	0.32	0.14	0.05	0.07	0.06	0.06	0.07	0.07
C4	0.02	0.12	0.10	0.04	0.12	0.08	0.08	0.10	0.05	0.05	0.14	0.14	0.10	0.06	0.13	0.15	0.05	0.08	0.06	0.05
C4'	0.33	0.32	0.45	0.38	0.28	0.29	0.26	0.22	0.26	0.30	0.30	0.32	0.55	0.41	0.28	0.20	0.30	0.27	0.30	0.29
C5	0.04	0.09	0.08	0.04	0.11	0.08	0.06	0.10	0.03	0.03	0.13	0.11	0.06	0.06	0.13	0.15	0.05	0.08	0.07	0.05
C5'	0.37	0.31	0.53	0.53	0.29	0.43	0.29	0.41	0.30	0.32	0.30	0.30	0.63	0.61	0.28	0.27	0.46	0.49	0.46	0.48
C6	0.07	0.08	0.06	0.04	0.11	0.09	0.07	0.10	0.02	0.02	0.13	0.09	0.04	0.06	0.14	0.16	0.07	0.08	0.11	0.08
C8	0.02	0.11	0.12	0.06	0.10	0.06	0.06	0.10	0.04	0.06	0.13	0.12	0.16	0.09	0.12	0.13	0.05	0.10	0.02	0.05
N1	0.08	0.08	0.05	0.05	0.12	0.09	0.07	0.10	0.02	0.01	0.14	0.10	0.08	0.06	0.15	0.15	0.09	0.09	0.14	0.10
N3	0.04	0.13	0.09	0.05	0.13	0.08	0.09	0.09	0.05	0.06	0.15	0.16	0.07	0.07	0.14	0.14	0.05	0.07	0.08	0.06
N6	0.08	0.07	0.06	0.05	0.11	0.08	0.07	0.09	0.03	0.03	0.12	0.08	0.04	0.06	0.15	0.16	0.07	0.08	0.12	0.08
N7	0.02	0.09	0.09	0.04	0.10	0.07	0.06	0.10	0.03	0.03	0.12	0.11	0.10	0.07	0.13	0.15	0.05	0.09	0.04	0.04
N9	0.03	0.12	0.14	0.06	0.10	0.07	0.07	0.11	0.05	0.06	0.13	0.14	0.19	0.09	0.11	0.14	0.06	0.10	0.04	0.05
O2'	0.30	0.30	0.17	0.27	0.33	0.36	0.36	0.43	0.37	0.33	0.29	0.27	0.03	0.21	0.30	0.45	0.31	0.31	0.29	0.30
O3'	0.07	0.04	0.12	0.12	0.03	0.16	0.06	0.24	0.06	0.03	0.03	0.06	0.24	0.13	0.01	0.15	0.06	0.12	0.03	0.06
O4'	0.25	0.29	0.38	0.29	0.25	0.16	0.22	0.11	0.21	0.25	0.29	0.31	0.48	0.31	0.25	0.09	0.17	0.15	0.16	0.16
O5'	0.36	0.31	0.36	0.38	0.36	0.41	0.39	0.48	0.39	0.35	0.33	0.25	0.36	0.34	0.36	0.35	0.56	0.63	0.64	0.65
OP1	0.63	0.56	0.83	0.89	0.55	0.77	0.57	0.80	0.58	0.58	0.54	0.53	0.89	1.03	0.54	0.56	0.84	0.96	0.86	0.88
OP2	0.44	0.40	0.40	0.45	0.48	0.53	0.54	0.67	0.52	0.45	0.42	0.31	0.35	0.38	0.48	0.49	0.75	0.89	0.91	0.91
P	0.34	0.31	0.41	0.42	0.32	0.40	0.34	0.45	0.34	0.33	0.31	0.27	0.44	0.44	0.32	0.31	0.52	0.61	0.59	0.60

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.06	0.04
C2	0.01	0.00	0.05	0.06	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.08	0.01	0.02	0.04	0.05	0.14	0.09
C2'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.05	0.00	0.02	0.10	0.00	0.01	0.05	0.00	0.09	0.08	0.16	0.10
C3'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.03	0.10	0.01	0.01	0.05	0.01	0.16	0.12	0.20	0.16
C4	0.01	0.00	0.03	0.02	0.00	0.03	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.06	0.10	0.19	0.14
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.04	0.00	0.00	0.03	0.03	0.01
C5	0.02	0.01	0.05	0.05	0.01	0.04	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.05	0.01	0.03	0.06	0.10	0.18	0.14
C5'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.08	0.00	0.10	0.00	0.10	0.06	0.06	0.04	0.04	0.00	0.10	0.01	0.01	0.06	0.01	0.01
C6	0.02	0.01	0.05	0.06	0.01	0.04	0.00	0.10	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.06	0.01	0.03	0.04	0.07	0.13	0.11
N1	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.04	0.11	0.08
N3	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.06	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.01	0.01	0.05	0.08	0.18	0.12
O2	0.03	0.00	0.10	0.10	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.14	0.01	0.05	0.04	0.04	0.14	0.08
O2'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03	0.04	0.04	0.04	0.03	0.01	0.01	0.06	0.00	0.02	0.06	0.02	0.05	0.04	0.11	0.04
O3'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.00	0.06	0.01	0.06	0.14	0.02	0.00	0.05	0.01	0.21	0.19	0.26	0.21
O4	0.01	0.01	0.05	0.05	0.00	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.05	0.00	0.01	0.09	0.13	0.22	0.17
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.03	0.00	0.01	0.05	0.02	0.01	0.01	0.00	0.14	0.11	0.12	0.12
O5'	0.03	0.04	0.09	0.16	0.06	0.00	0.06	0.01	0.04	0.03	0.05	0.04	0.05	0.21	0.09	0.14	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.02	0.05	0.08	0.12	0.10	0.03	0.10	0.06	0.07	0.04	0.08	0.04	0.04	0.19	0.13	0.11	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.06	0.14	0.16	0.20	0.19	0.03	0.18	0.01	0.13	0.11	0.18	0.14	0.11	0.26	0.22	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.04	0.09	0.10	0.16	0.14	0.01	0.14	0.01	0.11	0.08	0.12	0.08	0.04	0.21	0.17	0.12	0.01	0.00	0.00	0.00