Doublet Group distance statistics: 53532

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.013, 0.026, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C5	A	0, -0.001, 0.016, 0.033, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.016 std_dev=0.017
N1	A	0, -0.005, 0.025, 0.054, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.025 std_dev=0.029
N7	A	0, -0.004, 0.027, 0.058, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.027 std_dev=0.031
C4	A	0, -0.007, 0.030, 0.067, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.030 std_dev=0.037
C8	A	0, -0.010, 0.034, 0.077, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.034 std_dev=0.043
N9	A	0, -0.011, 0.035, 0.081, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.035 std_dev=0.046
N6	A	0, -0.011, 0.041, 0.092, 0.113 max_d=0.113 avg_d=0.041 std_dev=0.051
C2	A	0, -0.011, 0.040, 0.092, 0.113 max_d=0.113 avg_d=0.040 std_dev=0.052
N3	A	0, -0.011, 0.049, 0.109, 0.133 max_d=0.133 avg_d=0.049 std_dev=0.060
C1'	A	0, -0.020, 0.052, 0.125, 0.154 max_d=0.154 avg_d=0.052 std_dev=0.072
O4'	A	0, -0.039, 0.107, 0.253, 0.313 max_d=0.313 avg_d=0.107 std_dev=0.146
O2	B	0, -0.010, 0.178, 0.366, 0.438 max_d=0.438 avg_d=0.178 std_dev=0.188
C2'	A	0, -0.059, 0.162, 0.384, 0.475 max_d=0.475 avg_d=0.162 std_dev=0.221
C2	B	0, -0.044, 0.229, 0.502, 0.613 max_d=0.613 avg_d=0.229 std_dev=0.273
N3	B	0, -0.046, 0.238, 0.521, 0.636 max_d=0.636 avg_d=0.238 std_dev=0.284
C4'	A	0, -0.093, 0.248, 0.588, 0.729 max_d=0.729 avg_d=0.248 std_dev=0.341
C3'	A	0, -0.097, 0.255, 0.606, 0.752 max_d=0.752 avg_d=0.255 std_dev=0.352
O2'	B	0, -0.107, 0.301, 0.708, 0.877 max_d=0.877 avg_d=0.301 std_dev=0.408
N1	B	0, -0.101, 0.330, 0.761, 0.938 max_d=0.938 avg_d=0.330 std_dev=0.431
C4	B	0, -0.098, 0.339, 0.775, 0.955 max_d=0.955 avg_d=0.339 std_dev=0.437
O2'	A	0, -0.118, 0.337, 0.792, 0.980 max_d=0.980 avg_d=0.337 std_dev=0.455
O4	B	0, -0.120, 0.401, 0.921, 1.136 max_d=1.136 avg_d=0.401 std_dev=0.520
C5	B	0, -0.136, 0.393, 0.923, 1.142 max_d=1.142 avg_d=0.393 std_dev=0.529
C6	B	0, -0.141, 0.397, 0.935, 1.157 max_d=1.157 avg_d=0.397 std_dev=0.538
O3'	A	0, -0.153, 0.387, 0.927, 1.151 max_d=1.151 avg_d=0.387 std_dev=0.540
C1'	B	0, -0.135, 0.407, 0.949, 1.173 max_d=1.173 avg_d=0.407 std_dev=0.542
C5'	A	0, -0.156, 0.400, 0.956, 1.186 max_d=1.186 avg_d=0.400 std_dev=0.556
C2'	B	0, -0.211, 0.573, 1.357, 1.682 max_d=1.682 avg_d=0.573 std_dev=0.784
O4'	B	0, -0.217, 0.630, 1.477, 1.827 max_d=1.827 avg_d=0.630 std_dev=0.847
O5'	A	0, -0.274, 0.703, 1.680, 2.085 max_d=2.085 avg_d=0.703 std_dev=0.977
OP1	A	0, -0.329, 0.857, 2.043, 2.534 max_d=2.534 avg_d=0.857 std_dev=1.186
C4'	B	0, -0.380, 0.980, 2.339, 2.903 max_d=2.903 avg_d=0.980 std_dev=1.360
C3'	B	0, -0.389, 0.984, 2.356, 2.925 max_d=2.925 avg_d=0.984 std_dev=1.372
P	A	0, -0.404, 1.043, 2.491, 3.091 max_d=3.091 avg_d=1.043 std_dev=1.448
C5'	B	0, -0.486, 1.278, 3.042, 3.772 max_d=3.772 avg_d=1.278 std_dev=1.764
O3'	B	0, -0.526, 1.284, 3.094, 3.844 max_d=3.844 avg_d=1.284 std_dev=1.810
OP2	A	0, -0.543, 1.389, 3.320, 4.120 max_d=4.120 avg_d=1.389 std_dev=1.931
O5'	B	0, -0.746, 1.949, 4.643, 5.759 max_d=5.759 avg_d=1.949 std_dev=2.694
OP1	B	0, -1.027, 2.656, 6.338, 7.863 max_d=7.863 avg_d=2.656 std_dev=3.682
P	B	0, -1.041, 2.674, 6.389, 7.927 max_d=7.927 avg_d=2.674 std_dev=3.715
OP2	B	0, -1.318, 3.357, 8.032, 9.969 max_d=9.969 avg_d=3.357 std_dev=4.675

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.12	0.00	0.02	0.06	0.00	0.03	0.02	0.06	0.03	0.08	0.12	0.04	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.02	0.06	0.16	0.04
C2	0.12	0.00	0.22	0.12	0.01	0.13	0.01	0.06	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.38	0.18	0.10	0.22	0.35	0.09	0.20
C2'	0.00	0.22	0.00	0.00	0.10	0.02	0.07	0.02	0.12	0.06	0.18	0.22	0.10	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.12	0.02	0.12	0.14
C3'	0.02	0.12	0.00	0.00	0.01	0.00	0.09	0.01	0.04	0.21	0.05	0.13	0.09	0.19	0.10	0.01	0.01	0.00	0.27	0.08	0.26	0.30
C4	0.06	0.01	0.10	0.01	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.18	0.00	0.04	0.15	0.33	0.26	0.10
C4'	0.00	0.13	0.02	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.02	0.17	0.06	0.15	0.07	0.15	0.05	0.04	0.04	0.00	0.04	0.14	0.06	0.02
C5	0.03	0.01	0.07	0.09	0.00	0.06	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.16	0.08	0.01	0.12	0.40	0.47	0.06
C5'	0.02	0.06	0.02	0.01	0.05	0.00	0.17	0.00	0.14	0.27	0.04	0.08	0.21	0.28	0.11	0.04	0.03	0.01	0.00	0.09	0.06	0.01
C6	0.06	0.00	0.12	0.04	0.01	0.02	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.24	0.02	0.01	0.16	0.43	0.44	0.10
C8	0.03	0.02	0.06	0.21	0.01	0.17	0.00	0.27	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.22	0.08	0.03	0.37	0.62	0.05
N1	0.08	0.00	0.18	0.05	0.00	0.06	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.32	0.09	0.05	0.20	0.40	0.26	0.16
N3	0.12	0.00	0.22	0.13	0.00	0.15	0.00	0.08	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.34	0.17	0.11	0.21	0.31	0.05	0.19
N6	0.04	0.01	0.10	0.09	0.01	0.07	0.00	0.21	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.22	0.07	0.02	0.13	0.47	0.59	0.07
N7	0.01	0.01	0.01	0.19	0.01	0.15	0.00	0.28	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.20	0.06	0.06	0.44	0.69	0.02
N9	0.00	0.03	0.00	0.10	0.02	0.05	0.01	0.11	0.02	0.00	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.04	0.10	0.01	0.08	0.28	0.33	0.03
O2'	0.01	0.38	0.00	0.01	0.18	0.04	0.16	0.04	0.24	0.02	0.32	0.34	0.22	0.05	0.04	0.00	0.01	0.05	0.09	0.29	0.13	0.05
O3'	0.03	0.18	0.02	0.01	0.00	0.04	0.08	0.03	0.02	0.22	0.09	0.17	0.07	0.20	0.10	0.01	0.00	0.03	0.25	0.09	0.50	0.33
O4'	0.00	0.10	0.01	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.05	0.11	0.02	0.06	0.01	0.05	0.03	0.00	0.12	0.02	0.22	0.13
O5'	0.02	0.22	0.12	0.27	0.15	0.04	0.12	0.00	0.16	0.03	0.20	0.21	0.13	0.06	0.08	0.09	0.25	0.12	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.06	0.35	0.02	0.08	0.33	0.14	0.40	0.09	0.43	0.37	0.40	0.31	0.47	0.44	0.28	0.29	0.09	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01
OP2	0.16	0.09	0.12	0.26	0.26	0.06	0.47	0.06	0.44	0.62	0.26	0.05	0.59	0.69	0.33	0.13	0.50	0.22	0.02	0.00	0.00	0.00
P	0.04	0.20	0.14	0.30	0.10	0.02	0.06	0.01	0.10	0.05	0.16	0.19	0.07	0.02	0.03	0.05	0.33	0.13	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.25	0.18	0.23	0.45	0.26	0.39	0.31	0.41	0.32	0.26	0.19	0.07	0.18	0.69	0.25	0.21	0.56	0.33	0.79	0.71
C2	0.01	0.19	0.27	0.22	0.26	0.05	0.22	0.07	0.17	0.15	0.24	0.12	0.17	0.20	0.28	0.02	0.16	0.36	0.29	0.20
C2'	0.20	0.06	0.24	0.56	0.13	0.53	0.19	0.56	0.22	0.17	0.06	0.05	0.12	0.86	0.11	0.23	0.78	0.62	1.10	0.98
C3'	0.18	0.06	0.23	0.56	0.09	0.54	0.14	0.60	0.17	0.14	0.05	0.01	0.09	0.90	0.08	0.21	0.96	0.83	1.49	1.24
C4	0.22	0.24	0.03	0.15	0.29	0.25	0.30	0.25	0.29	0.27	0.25	0.17	0.06	0.25	0.29	0.21	0.29	0.04	0.35	0.34
C4'	0.16	0.08	0.23	0.54	0.13	0.44	0.18	0.50	0.20	0.15	0.08	0.01	0.10	0.89	0.12	0.14	0.83	0.67	1.34	1.12
C5	0.16	0.20	0.08	0.05	0.22	0.22	0.22	0.22	0.22	0.21	0.19	0.15	0.01	0.13	0.21	0.20	0.26	0.00	0.30	0.30
C5'	0.16	0.10	0.23	0.53	0.14	0.43	0.18	0.50	0.19	0.16	0.10	0.03	0.11	0.88	0.13	0.13	0.89	0.75	1.53	1.24
C6	0.05	0.13	0.23	0.15	0.14	0.08	0.13	0.07	0.12	0.12	0.14	0.11	0.11	0.11	0.15	0.12	0.03	0.22	0.03	0.02
C8	0.28	0.24	0.13	0.32	0.27	0.41	0.31	0.44	0.32	0.30	0.23	0.18	0.15	0.48	0.26	0.30	0.58	0.31	0.80	0.71
N1	0.03	0.11	0.33	0.29	0.15	0.05	0.11	0.07	0.08	0.07	0.14	0.08	0.18	0.27	0.17	0.03	0.17	0.39	0.33	0.23
N3	0.16	0.26	0.03	0.04	0.33	0.12	0.33	0.10	0.30	0.27	0.29	0.16	0.02	0.10	0.34	0.12	0.09	0.13	0.07	0.10
N6	0.01	0.07	0.30	0.23	0.05	0.05	0.04	0.04	0.04	0.06	0.06	0.07	0.14	0.19	0.05	0.10	0.01	0.27	0.10	0.03
N7	0.21	0.21	0.00	0.16	0.22	0.32	0.24	0.34	0.25	0.24	0.20	0.17	0.06	0.28	0.21	0.26	0.44	0.17	0.58	0.53
N9	0.29	0.25	0.17	0.35	0.30	0.39	0.34	0.40	0.35	0.31	0.25	0.16	0.17	0.51	0.30	0.28	0.52	0.26	0.69	0.63
O2'	0.02	0.11	0.15	0.53	0.02	0.39	0.06	0.45	0.08	0.01	0.10	0.23	0.04	0.91	0.02	0.02	0.64	0.52	0.93	0.85
O3'	0.09	0.05	0.19	0.58	0.04	0.56	0.02	0.66	0.05	0.03	0.08	0.11	0.02	0.96	0.06	0.14	1.12	1.07	1.81	1.49
O4'	0.22	0.16	0.25	0.50	0.24	0.41	0.29	0.45	0.29	0.24	0.17	0.05	0.18	0.79	0.23	0.18	0.66	0.44	1.01	0.87
O5'	0.11	0.08	0.28	0.65	0.00	0.48	0.12	0.57	0.16	0.07	0.10	0.22	0.22	1.09	0.03	0.09	0.87	0.82	1.43	1.23
OP1	0.24	0.05	0.40	0.86	0.05	0.74	0.22	0.92	0.28	0.16	0.08	0.21	0.28	1.32	0.01	0.30	1.26	1.32	1.98	1.74
OP2	0.02	0.06	0.15	0.41	0.04	0.19	0.02	0.20	0.01	0.03	0.07	0.11	0.13	0.82	0.05	0.15	0.60	0.51	1.30	0.96
P	0.05	0.15	0.26	0.63	0.07	0.44	0.05	0.53	0.09	0.00	0.17	0.28	0.22	1.10	0.11	0.02	0.85	0.85	1.50	1.25

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.07	0.01	0.04	0.01	0.00	0.22	0.21	0.36	0.24
C2	0.03	0.00	0.12	0.19	0.00	0.03	0.02	0.09	0.03	0.01	0.00	0.00	0.02	0.16	0.01	0.06	0.36	0.30	0.69	0.47
C2'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.00	0.10	0.01	0.09	0.21	0.01	0.00	0.00	0.01	0.33	0.39	0.58	0.36
C3'	0.02	0.19	0.00	0.00	0.22	0.00	0.21	0.01	0.17	0.15	0.23	0.18	0.01	0.00	0.23	0.01	0.40	0.48	0.64	0.42
C4	0.01	0.00	0.00	0.22	0.00	0.11	0.01	0.23	0.00	0.01	0.00	0.01	0.14	0.26	0.01	0.03	0.77	0.62	1.51	1.03
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.11	0.00	0.18	0.01	0.18	0.08	0.06	0.03	0.13	0.03	0.11	0.01	0.04	0.15	0.04	0.03
C5	0.01	0.02	0.07	0.21	0.01	0.18	0.00	0.32	0.00	0.00	0.02	0.02	0.18	0.25	0.01	0.03	0.98	0.78	1.80	1.26
C5'	0.03	0.09	0.00	0.01	0.23	0.01	0.32	0.00	0.31	0.16	0.14	0.01	0.12	0.01	0.24	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00
C6	0.01	0.03	0.10	0.17	0.00	0.18	0.00	0.31	0.00	0.01	0.02	0.03	0.17	0.19	0.01	0.05	0.90	0.68	1.46	1.06
N1	0.00	0.01	0.01	0.15	0.01	0.08	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.02	0.09	0.12	0.01	0.00	0.51	0.41	0.85	0.61
N3	0.02	0.00	0.09	0.23	0.00	0.06	0.02	0.14	0.02	0.01	0.00	0.01	0.07	0.22	0.01	0.05	0.52	0.43	1.04	0.70
O2	0.07	0.00	0.21	0.18	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.10	0.12	0.02	0.07	0.13	0.14	0.30	0.19
O2'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.14	0.13	0.18	0.12	0.17	0.09	0.07	0.10	0.00	0.06	0.16	0.12	0.28	0.45	0.40	0.28
O3'	0.04	0.16	0.00	0.00	0.26	0.03	0.25	0.01	0.19	0.12	0.22	0.12	0.06	0.00	0.28	0.04	0.32	0.64	0.58	0.37
O4	0.01	0.01	0.00	0.23	0.01	0.11	0.01	0.24	0.01	0.01	0.01	0.02	0.16	0.28	0.00	0.04	0.80	0.66	1.66	1.12
O4'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.05	0.07	0.12	0.04	0.04	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02
O5'	0.22	0.36	0.33	0.40	0.77	0.04	0.98	0.01	0.90	0.51	0.52	0.13	0.28	0.32	0.80	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01
OP1	0.21	0.30	0.39	0.48	0.62	0.15	0.78	0.02	0.68	0.41	0.43	0.14	0.45	0.64	0.66	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01
OP2	0.36	0.69	0.58	0.64	1.51	0.04	1.80	0.00	1.46	0.85	1.04	0.30	0.40	0.58	1.66	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.24	0.47	0.36	0.42	1.03	0.03	1.26	0.00	1.06	0.61	0.70	0.19	0.28	0.37	1.12	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00