Doublet Group distance statistics: 53542

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 18, 20, 9, 3, 2, 0, 3, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.007, 0.010, 0.014, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.010 std_dev=0.004
C2	A	0, 0.007, 0.015, 0.023, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.015 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.011, 0.019, 0.027, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.019 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.015, 0.023, 0.031, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.023 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.008, 0.017, 0.025, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.017 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.013, 0.021, 0.029, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.021 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.012, 0.021, 0.030, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.021 std_dev=0.009
N9	A	0, 0.015, 0.026, 0.037, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.026 std_dev=0.011
N2	A	0, 0.023, 0.037, 0.050, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.037 std_dev=0.014
O6	A	0, 0.013, 0.028, 0.044, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.028 std_dev=0.015
N7	A	0, 0.013, 0.032, 0.050, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.032 std_dev=0.019
C8	A	0, 0.020, 0.040, 0.061, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.040 std_dev=0.021
OP2	B	0, 0.109, 0.268, 0.427, 0.978 max_d=0.978 avg_d=0.268 std_dev=0.159
P	B	0, 0.072, 0.259, 0.446, 0.933 max_d=0.933 avg_d=0.259 std_dev=0.187
C3'	A	0, 0.241, 0.457, 0.673, 1.546 max_d=1.546 avg_d=0.457 std_dev=0.216
C2'	A	0, -0.091, 0.139, 0.369, 1.368 max_d=1.368 avg_d=0.139 std_dev=0.230
O3'	A	0, 1.456, 1.689, 1.922, 1.815 max_d=1.815 avg_d=1.689 std_dev=0.233
O4'	A	0, -0.112, 0.132, 0.375, 1.464 max_d=1.464 avg_d=0.132 std_dev=0.244
OP1	B	0, 0.100, 0.368, 0.637, 1.381 max_d=1.381 avg_d=0.368 std_dev=0.269
O5'	B	0, 0.050, 0.346, 0.641, 1.741 max_d=1.741 avg_d=0.346 std_dev=0.295
O3'	B	0, 0.121, 0.422, 0.723, 1.602 max_d=1.602 avg_d=0.422 std_dev=0.301
C4'	A	0, -0.031, 0.277, 0.584, 1.928 max_d=1.928 avg_d=0.277 std_dev=0.307
O2'	A	0, -0.055, 0.296, 0.647, 2.139 max_d=2.139 avg_d=0.296 std_dev=0.351
C5'	B	0, -0.041, 0.343, 0.727, 2.268 max_d=2.268 avg_d=0.343 std_dev=0.384
C3'	B	0, -0.010, 0.422, 0.853, 2.624 max_d=2.624 avg_d=0.422 std_dev=0.431
C5'	A	0, -0.152, 0.403, 0.959, 3.398 max_d=3.398 avg_d=0.403 std_dev=0.555
C4'	B	0, -0.201, 0.415, 1.030, 3.634 max_d=3.634 avg_d=0.415 std_dev=0.615
C2'	B	0, -0.288, 0.522, 1.331, 4.839 max_d=4.839 avg_d=0.522 std_dev=0.810
O5'	A	0, -0.308, 0.522, 1.353, 4.929 max_d=4.929 avg_d=0.522 std_dev=0.830
O2'	B	0, -0.310, 0.567, 1.444, 5.101 max_d=5.101 avg_d=0.567 std_dev=0.877
OP1	A	0, -0.277, 0.635, 1.547, 5.518 max_d=5.518 avg_d=0.635 std_dev=0.912
P	A	0, -0.316, 0.598, 1.513, 5.462 max_d=5.462 avg_d=0.598 std_dev=0.914
OP2	A	0, -0.324, 0.692, 1.707, 6.017 max_d=6.017 avg_d=0.692 std_dev=1.016
O4'	B	0, -0.534, 0.518, 1.570, 6.152 max_d=6.152 avg_d=0.518 std_dev=1.052
C1'	B	0, -0.655, 0.572, 1.798, 7.148 max_d=7.148 avg_d=0.572 std_dev=1.227
N1	B	0, -0.917, 0.660, 2.236, 9.175 max_d=9.175 avg_d=0.660 std_dev=1.577
C6	B	0, -0.918, 0.694, 2.306, 9.435 max_d=9.435 avg_d=0.694 std_dev=1.612
C2	B	0, -1.221, 0.748, 2.716, 11.358 max_d=11.358 avg_d=0.748 std_dev=1.969
O2	B	0, -1.251, 0.762, 2.776, 11.552 max_d=11.552 avg_d=0.762 std_dev=2.013
C5	B	0, -1.234, 0.813, 2.860, 11.891 max_d=11.891 avg_d=0.813 std_dev=2.047
N3	B	0, -1.496, 0.848, 3.193, 13.500 max_d=13.500 avg_d=0.848 std_dev=2.345
C4	B	0, -1.510, 0.883, 3.277, 13.806 max_d=13.806 avg_d=0.883 std_dev=2.393
N4	B	0, -1.811, 1.018, 3.848, 16.266 max_d=16.266 avg_d=1.018 std_dev=2.830

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.05	0.00	0.20	0.01	0.22	0.15	0.13
C2	0.03	0.00	0.09	0.03	0.01	0.15	0.01	0.18	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.22	0.07	0.18	0.14	0.01	0.30	0.16	0.18
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.06	0.01	0.04	0.03	0.06	0.04	0.08	0.11	0.09	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.18	0.06	0.13	0.06	0.06
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.04	0.03	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.03	0.09	0.08	0.10
C4	0.01	0.01	0.06	0.02	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.11	0.05	0.09	0.24	0.01	0.37	0.25	0.26
C4'	0.01	0.15	0.01	0.00	0.06	0.00	0.03	0.01	0.06	0.09	0.11	0.18	0.14	0.06	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.04	0.05	0.07	0.03
C5	0.01	0.01	0.04	0.02	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.05	0.04	0.33	0.01	0.50	0.37	0.38
C5'	0.02	0.18	0.03	0.01	0.08	0.01	0.06	0.00	0.08	0.12	0.14	0.22	0.16	0.10	0.04	0.03	0.02	0.01	0.00	0.07	0.07	0.16	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.02	0.01	0.06	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.05	0.08	0.30	0.00	0.50	0.36	0.37
C8	0.01	0.01	0.04	0.03	0.00	0.09	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.11	0.04	0.09	0.45	0.01	0.56	0.45	0.45
N1	0.02	0.00	0.08	0.02	0.01	0.11	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.18	0.06	0.14	0.21	0.01	0.40	0.25	0.27
N2	0.03	0.01	0.11	0.04	0.01	0.18	0.01	0.22	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.28	0.08	0.21	0.09	0.02	0.24	0.10	0.12
N3	0.02	0.00	0.09	0.03	0.00	0.14	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.21	0.07	0.18	0.13	0.01	0.27	0.14	0.15
N7	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.04	0.05	0.45	0.01	0.62	0.49	0.49
N9	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.30	0.01	0.38	0.28	0.28
O2'	0.02	0.22	0.00	0.02	0.11	0.02	0.06	0.03	0.11	0.11	0.18	0.28	0.21	0.07	0.02	0.00	0.06	0.02	0.15	0.09	0.13	0.06	0.06
O3'	0.05	0.07	0.02	0.01	0.05	0.02	0.05	0.02	0.05	0.04	0.06	0.08	0.07	0.04	0.05	0.06	0.00	0.04	0.05	0.05	0.09	0.16	0.15
O4'	0.00	0.18	0.01	0.01	0.09	0.00	0.04	0.01	0.08	0.09	0.14	0.21	0.18	0.05	0.01	0.02	0.04	0.00	0.14	0.06	0.20	0.18	0.13
O5'	0.20	0.14	0.18	0.04	0.24	0.01	0.33	0.00	0.30	0.45	0.21	0.09	0.13	0.45	0.30	0.15	0.05	0.14	0.00	0.35	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.06	0.03	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.09	0.05	0.06	0.35	0.00	0.57	0.44	0.44
OP1	0.22	0.30	0.13	0.09	0.37	0.05	0.50	0.07	0.50	0.56	0.40	0.24	0.27	0.62	0.38	0.13	0.09	0.20	0.01	0.57	0.00	0.01	0.00
OP2	0.15	0.16	0.06	0.08	0.25	0.07	0.37	0.16	0.36	0.45	0.25	0.10	0.14	0.49	0.28	0.06	0.16	0.18	0.01	0.44	0.01	0.00	0.01
P	0.13	0.18	0.06	0.10	0.26	0.03	0.38	0.01	0.37	0.45	0.27	0.12	0.15	0.49	0.28	0.06	0.15	0.13	0.00	0.44	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.21	0.17	0.14	0.75	0.30	0.86	0.24	0.59	0.25	0.44	0.98	0.20	0.41	0.28	0.19	0.15	0.15	0.08	0.09
C2	0.14	0.32	0.15	0.16	0.72	0.21	0.82	0.19	0.63	0.35	0.49	0.85	0.18	0.26	0.28	0.12	0.11	0.13	0.09	0.08
C2'	0.10	0.30	0.13	0.15	0.87	0.17	0.98	0.10	0.71	0.36	0.55	1.10	0.15	0.30	0.16	0.10	0.06	0.15	0.16	0.13
C3'	0.17	0.16	0.14	0.12	0.69	0.28	0.81	0.22	0.55	0.20	0.38	0.92	0.24	0.39	0.20	0.21	0.13	0.15	0.08	0.08
C4	0.16	0.42	0.15	0.14	0.95	0.21	1.04	0.18	0.77	0.44	0.66	1.16	0.22	0.30	0.29	0.12	0.11	0.13	0.09	0.08
C4'	0.21	0.15	0.20	0.19	0.68	0.38	0.77	0.35	0.49	0.17	0.37	0.92	0.25	0.44	0.31	0.28	0.28	0.31	0.18	0.23
C5	0.30	0.67	0.21	0.17	1.24	0.16	1.30	0.14	0.99	0.66	0.94	1.47	0.43	0.25	0.29	0.23	0.10	0.13	0.10	0.09
C5'	0.13	0.30	0.15	0.15	0.88	0.33	0.94	0.33	0.64	0.31	0.58	1.15	0.16	0.35	0.28	0.20	0.28	0.35	0.22	0.26
C6	0.41	0.79	0.27	0.20	1.32	0.16	1.38	0.13	1.08	0.77	1.05	1.52	0.56	0.21	0.30	0.34	0.11	0.13	0.12	0.10
C8	0.22	0.59	0.18	0.15	1.22	0.19	1.27	0.16	0.93	0.58	0.90	1.50	0.33	0.30	0.29	0.16	0.10	0.13	0.10	0.08
N1	0.31	0.59	0.21	0.17	1.02	0.15	1.11	0.14	0.88	0.60	0.79	1.16	0.40	0.21	0.29	0.26	0.11	0.13	0.11	0.10
N2	0.14	0.15	0.18	0.19	0.43	0.25	0.53	0.23	0.40	0.18	0.25	0.52	0.17	0.27	0.28	0.15	0.14	0.14	0.10	0.09
N3	0.12	0.25	0.15	0.15	0.70	0.25	0.81	0.21	0.59	0.29	0.44	0.86	0.15	0.32	0.28	0.12	0.12	0.14	0.09	0.08
N7	0.33	0.76	0.24	0.18	1.40	0.16	1.43	0.14	1.07	0.73	1.08	1.68	0.50	0.26	0.29	0.25	0.10	0.13	0.11	0.09
N9	0.13	0.39	0.14	0.14	0.97	0.24	1.06	0.20	0.76	0.42	0.66	1.20	0.19	0.34	0.28	0.12	0.11	0.14	0.09	0.08
O2'	0.11	0.27	0.15	0.21	0.81	0.12	0.95	0.10	0.71	0.35	0.49	1.01	0.18	0.28	0.16	0.11	0.18	0.32	0.33	0.29
O3'	0.36	0.22	0.28	0.20	0.39	0.42	0.53	0.32	0.31	0.12	0.15	0.59	0.50	0.54	0.27	0.39	0.21	0.17	0.09	0.11
O4'	0.21	0.18	0.23	0.23	0.70	0.41	0.79	0.38	0.51	0.19	0.40	0.94	0.23	0.46	0.37	0.27	0.30	0.33	0.20	0.25
O5'	0.30	0.63	0.34	0.32	1.23	0.12	1.28	0.09	0.97	0.64	0.92	1.51	0.37	0.18	0.23	0.19	0.07	0.14	0.09	0.06
O6	0.58	1.03	0.38	0.26	1.59	0.20	1.63	0.15	1.29	0.98	1.32	1.80	0.80	0.24	0.31	0.49	0.14	0.14	0.14	0.12
OP1	0.68	1.11	0.66	0.58	1.77	0.35	1.77	0.29	1.40	1.08	1.45	2.10	0.84	0.41	0.42	0.54	0.29	0.17	0.27	0.24
OP2	0.38	0.74	0.40	0.37	1.39	0.13	1.42	0.09	1.08	0.74	1.06	1.70	0.46	0.21	0.25	0.24	0.09	0.14	0.11	0.07
P	0.45	0.84	0.47	0.43	1.49	0.18	1.51	0.14	1.16	0.83	1.16	1.80	0.56	0.25	0.29	0.32	0.14	0.11	0.15	0.11

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.03	0.00	0.06	0.20	0.11	0.05
C2	0.02	0.00	0.10	0.11	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.10	0.05	0.12	0.34	0.15	0.11
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.06	0.01	0.03	0.01	0.05	0.02	0.09	0.06	0.16	0.00	0.03	0.01	0.10	0.14	0.06	0.09
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.11	0.00	0.08	0.01	0.06	0.06	0.12	0.12	0.12	0.02	0.01	0.01	0.15	0.11	0.09	0.13
C4	0.02	0.01	0.06	0.11	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.12	0.03	0.15	0.42	0.25	0.14
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.08	0.03	0.04	0.07	0.04	0.06	0.02	0.00	0.02	0.07	0.05	0.03
C5	0.01	0.01	0.03	0.08	0.00	0.08	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.09	0.05	0.15	0.38	0.30	0.14
C5'	0.02	0.04	0.01	0.01	0.10	0.01	0.14	0.00	0.13	0.06	0.06	0.12	0.05	0.06	0.03	0.02	0.01	0.05	0.04	0.02
C6	0.01	0.01	0.05	0.06	0.01	0.08	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.06	0.07	0.14	0.32	0.27	0.11
N1	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.11	0.30	0.18	0.09
N3	0.02	0.00	0.09	0.12	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.13	0.04	0.14	0.40	0.19	0.14
N4	0.02	0.01	0.06	0.12	0.00	0.07	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.14	0.04	0.16	0.45	0.28	0.16
O2	0.03	0.00	0.16	0.12	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.12	0.13	0.08	0.10	0.31	0.11	0.10
O2'	0.01	0.06	0.00	0.02	0.04	0.06	0.05	0.06	0.06	0.03	0.05	0.04	0.12	0.00	0.05	0.04	0.05	0.09	0.08	0.06
O3'	0.03	0.10	0.03	0.01	0.12	0.02	0.09	0.03	0.06	0.05	0.13	0.14	0.13	0.05	0.00	0.02	0.12	0.10	0.16	0.10
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.02	0.07	0.01	0.04	0.04	0.08	0.04	0.02	0.00	0.06	0.19	0.14	0.06
O5'	0.06	0.12	0.10	0.15	0.15	0.02	0.15	0.01	0.14	0.11	0.14	0.16	0.10	0.05	0.12	0.06	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.20	0.34	0.14	0.11	0.42	0.07	0.38	0.05	0.32	0.30	0.40	0.45	0.31	0.09	0.10	0.19	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.11	0.15	0.06	0.09	0.25	0.05	0.30	0.04	0.27	0.18	0.19	0.28	0.11	0.08	0.16	0.14	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.11	0.09	0.13	0.14	0.03	0.14	0.02	0.11	0.09	0.14	0.16	0.10	0.06	0.10	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00