Doublet Group distance statistics: 53546

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 1, 0, 5, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.006, 0.014, 0.021, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.014 std_dev=0.008
C8	A	0, 0.011, 0.021, 0.032, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.021 std_dev=0.010
N9	A	0, 0.007, 0.018, 0.030, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.018 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.008, 0.020, 0.032, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.020 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.000, 0.013, 0.026, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.013 std_dev=0.013
N7	A	0, 0.010, 0.024, 0.038, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.024 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.004, 0.019, 0.034, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.019 std_dev=0.015
C2	A	0, 0.003, 0.024, 0.045, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.024 std_dev=0.021
N3	A	0, 0.009, 0.031, 0.053, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.031 std_dev=0.022
C1'	A	0, 0.006, 0.029, 0.052, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.029 std_dev=0.023
O6	A	0, 0.003, 0.034, 0.066, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.034 std_dev=0.031
N2	A	0, 0.017, 0.062, 0.108, 0.182 max_d=0.182 avg_d=0.062 std_dev=0.046
O4'	A	0, 0.041, 0.134, 0.228, 0.266 max_d=0.266 avg_d=0.134 std_dev=0.093
C2'	A	0, 0.049, 0.201, 0.353, 0.463 max_d=0.463 avg_d=0.201 std_dev=0.152
C4'	A	0, 0.024, 0.202, 0.380, 0.539 max_d=0.539 avg_d=0.202 std_dev=0.178
C2'	B	0, 0.216, 0.395, 0.573, 0.567 max_d=0.567 avg_d=0.395 std_dev=0.178
C1'	B	0, 0.197, 0.390, 0.583, 0.684 max_d=0.684 avg_d=0.390 std_dev=0.193
C4'	B	0, 0.183, 0.380, 0.577, 0.648 max_d=0.648 avg_d=0.380 std_dev=0.197
C3'	A	0, 0.057, 0.259, 0.461, 0.635 max_d=0.635 avg_d=0.259 std_dev=0.202
O4'	B	0, 0.234, 0.438, 0.642, 0.618 max_d=0.618 avg_d=0.438 std_dev=0.204
C3'	B	0, 0.222, 0.427, 0.632, 0.616 max_d=0.616 avg_d=0.427 std_dev=0.205
N1	B	0, 0.227, 0.444, 0.660, 0.771 max_d=0.771 avg_d=0.444 std_dev=0.217
O3'	A	0, 0.078, 0.295, 0.513, 0.669 max_d=0.669 avg_d=0.295 std_dev=0.217
OP2	B	0, 0.225, 0.446, 0.668, 0.656 max_d=0.656 avg_d=0.446 std_dev=0.222
C6	B	0, 0.240, 0.470, 0.701, 0.775 max_d=0.775 avg_d=0.470 std_dev=0.230
C5'	B	0, 0.273, 0.523, 0.773, 0.769 max_d=0.769 avg_d=0.523 std_dev=0.250
O2'	A	0, 0.114, 0.365, 0.616, 0.772 max_d=0.772 avg_d=0.365 std_dev=0.251
P	B	0, 0.228, 0.482, 0.736, 0.800 max_d=0.800 avg_d=0.482 std_dev=0.254
C2	B	0, 0.275, 0.540, 0.804, 0.902 max_d=0.902 avg_d=0.540 std_dev=0.264
O3'	B	0, 0.302, 0.575, 0.848, 0.817 max_d=0.817 avg_d=0.575 std_dev=0.273
O2	B	0, 0.238, 0.518, 0.797, 0.926 max_d=0.926 avg_d=0.518 std_dev=0.280
O2'	B	0, 0.276, 0.557, 0.838, 1.003 max_d=1.003 avg_d=0.557 std_dev=0.281
O5'	A	0, 0.104, 0.385, 0.667, 0.940 max_d=0.940 avg_d=0.385 std_dev=0.281
C5	B	0, 0.325, 0.622, 0.920, 0.923 max_d=0.923 avg_d=0.622 std_dev=0.297
O5'	B	0, 0.220, 0.521, 0.821, 0.932 max_d=0.932 avg_d=0.521 std_dev=0.301
C5'	A	0, 0.073, 0.378, 0.683, 0.936 max_d=0.936 avg_d=0.378 std_dev=0.305
N3	B	0, 0.359, 0.677, 0.995, 1.010 max_d=1.010 avg_d=0.677 std_dev=0.318
P	A	0, 0.072, 0.392, 0.712, 1.181 max_d=1.181 avg_d=0.392 std_dev=0.320
OP1	B	0, 0.174, 0.497, 0.819, 1.017 max_d=1.017 avg_d=0.497 std_dev=0.322
OP2	A	0, 0.209, 0.532, 0.855, 1.245 max_d=1.245 avg_d=0.532 std_dev=0.323
C4	B	0, 0.395, 0.737, 1.080, 1.058 max_d=1.058 avg_d=0.737 std_dev=0.342
OP1	A	0, 0.018, 0.404, 0.791, 1.475 max_d=1.475 avg_d=0.404 std_dev=0.387
N4	B	0, 0.499, 0.933, 1.368, 1.294 max_d=1.294 avg_d=0.933 std_dev=0.434

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.04	0.03	0.02	0.05	0.09	0.06	0.02	0.01	0.01	0.04	0.01	0.12	0.04	0.14	0.21	0.14
C2	0.06	0.00	0.11	0.08	0.02	0.07	0.02	0.12	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.22	0.09	0.09	0.18	0.01	0.18	0.23	0.19
C2'	0.01	0.11	0.00	0.01	0.06	0.01	0.05	0.04	0.06	0.08	0.09	0.14	0.11	0.06	0.03	0.00	0.01	0.01	0.07	0.07	0.12	0.13	0.09
C3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.03	0.01	0.03	0.04	0.04	0.07	0.06	0.13	0.08	0.06	0.03	0.04	0.01	0.02	0.07	0.05	0.09	0.08	0.06
C4	0.03	0.02	0.06	0.03	0.00	0.04	0.01	0.11	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.14	0.02	0.06	0.17	0.02	0.17	0.23	0.18
C4'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.04	0.00	0.06	0.02	0.07	0.06	0.05	0.10	0.06	0.07	0.04	0.02	0.02	0.01	0.05	0.08	0.05	0.10	0.05
C5	0.02	0.02	0.05	0.03	0.01	0.06	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.14	0.02	0.04	0.19	0.03	0.17	0.22	0.18
C5'	0.04	0.12	0.04	0.04	0.11	0.02	0.14	0.00	0.16	0.13	0.14	0.13	0.10	0.16	0.09	0.03	0.05	0.04	0.01	0.19	0.02	0.08	0.03
C6	0.03	0.01	0.06	0.04	0.01	0.07	0.01	0.16	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.17	0.03	0.06	0.20	0.01	0.17	0.21	0.18
C8	0.02	0.02	0.08	0.07	0.02	0.06	0.01	0.13	0.02	0.00	0.01	0.04	0.03	0.00	0.01	0.09	0.07	0.03	0.19	0.04	0.18	0.23	0.18
N1	0.05	0.00	0.09	0.06	0.01	0.05	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.21	0.06	0.07	0.19	0.01	0.17	0.22	0.19
N2	0.09	0.01	0.14	0.13	0.02	0.10	0.02	0.13	0.01	0.04	0.02	0.00	0.03	0.03	0.04	0.26	0.14	0.12	0.19	0.02	0.19	0.24	0.20
N3	0.06	0.01	0.11	0.08	0.01	0.06	0.02	0.10	0.02	0.03	0.01	0.03	0.00	0.03	0.03	0.20	0.07	0.09	0.18	0.02	0.18	0.24	0.19
N7	0.02	0.03	0.06	0.06	0.02	0.07	0.01	0.16	0.02	0.00	0.02	0.03	0.03	0.00	0.02	0.11	0.05	0.02	0.20	0.05	0.18	0.22	0.18
N9	0.01	0.03	0.03	0.03	0.01	0.04	0.01	0.09	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.02	0.00	0.07	0.03	0.02	0.16	0.03	0.17	0.23	0.17
O2'	0.01	0.22	0.00	0.04	0.14	0.02	0.14	0.03	0.17	0.09	0.21	0.26	0.20	0.11	0.07	0.00	0.05	0.02	0.08	0.17	0.16	0.12	0.11
O3'	0.04	0.09	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.05	0.03	0.07	0.06	0.14	0.07	0.05	0.03	0.05	0.00	0.07	0.07	0.04	0.10	0.07	0.06
O4'	0.01	0.09	0.01	0.02	0.06	0.01	0.04	0.04	0.06	0.03	0.07	0.12	0.09	0.02	0.02	0.02	0.07	0.00	0.15	0.06	0.17	0.25	0.17
O5'	0.12	0.18	0.07	0.07	0.17	0.05	0.19	0.01	0.20	0.19	0.19	0.19	0.18	0.20	0.16	0.08	0.07	0.15	0.00	0.21	0.01	0.05	0.02
O6	0.04	0.01	0.07	0.05	0.02	0.08	0.03	0.19	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.05	0.03	0.17	0.04	0.06	0.21	0.00	0.18	0.20	0.19
OP1	0.14	0.18	0.12	0.09	0.17	0.05	0.17	0.02	0.17	0.18	0.17	0.19	0.18	0.18	0.17	0.16	0.10	0.17	0.01	0.18	0.00	0.02	0.00
OP2	0.21	0.23	0.13	0.08	0.23	0.10	0.22	0.08	0.21	0.23	0.22	0.24	0.24	0.22	0.23	0.12	0.07	0.25	0.05	0.20	0.02	0.00	0.01
P	0.14	0.19	0.09	0.06	0.18	0.05	0.18	0.03	0.18	0.18	0.19	0.20	0.19	0.18	0.17	0.11	0.06	0.17	0.02	0.19	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.07	0.13	0.17	0.07	0.25	0.06	0.19	0.18	0.10	0.07	0.21	0.33	0.10	0.27	0.10	0.07	0.21	0.17	0.12	0.13
C2	0.07	0.10	0.17	0.11	0.18	0.05	0.15	0.16	0.09	0.06	0.15	0.23	0.08	0.20	0.17	0.08	0.19	0.17	0.11	0.12
C2'	0.11	0.12	0.21	0.11	0.22	0.05	0.16	0.14	0.10	0.08	0.19	0.30	0.10	0.29	0.13	0.07	0.15	0.11	0.16	0.06
C3'	0.08	0.12	0.17	0.05	0.23	0.05	0.16	0.17	0.08	0.06	0.21	0.32	0.11	0.27	0.06	0.06	0.19	0.14	0.14	0.09
C4	0.08	0.09	0.17	0.10	0.19	0.05	0.15	0.16	0.08	0.04	0.16	0.26	0.07	0.24	0.14	0.07	0.20	0.15	0.10	0.11
C4'	0.04	0.17	0.10	0.05	0.28	0.11	0.21	0.24	0.12	0.10	0.26	0.37	0.15	0.22	0.05	0.10	0.26	0.19	0.13	0.16
C5	0.10	0.08	0.18	0.13	0.17	0.06	0.14	0.14	0.08	0.05	0.13	0.23	0.06	0.22	0.17	0.08	0.17	0.12	0.12	0.09
C5'	0.09	0.22	0.09	0.13	0.31	0.20	0.25	0.31	0.17	0.15	0.29	0.39	0.20	0.17	0.13	0.17	0.32	0.25	0.14	0.22
C6	0.11	0.08	0.18	0.15	0.15	0.07	0.14	0.13	0.09	0.07	0.12	0.20	0.07	0.20	0.19	0.09	0.15	0.11	0.16	0.10
C8	0.10	0.08	0.18	0.11	0.19	0.06	0.15	0.16	0.07	0.04	0.16	0.27	0.06	0.25	0.14	0.08	0.20	0.14	0.10	0.10
N1	0.09	0.09	0.17	0.14	0.16	0.04	0.14	0.13	0.09	0.07	0.13	0.20	0.08	0.18	0.19	0.08	0.15	0.11	0.16	0.10
N2	0.05	0.12	0.16	0.11	0.19	0.08	0.16	0.19	0.10	0.07	0.17	0.23	0.11	0.19	0.18	0.09	0.21	0.22	0.11	0.15
N3	0.07	0.11	0.17	0.10	0.20	0.06	0.16	0.18	0.09	0.05	0.18	0.27	0.09	0.23	0.14	0.08	0.22	0.20	0.09	0.14
N7	0.11	0.08	0.18	0.13	0.17	0.07	0.14	0.14	0.08	0.06	0.14	0.24	0.06	0.24	0.16	0.09	0.17	0.12	0.12	0.09
N9	0.09	0.09	0.18	0.10	0.21	0.05	0.16	0.16	0.08	0.04	0.17	0.28	0.07	0.26	0.13	0.07	0.21	0.16	0.10	0.12
O2'	0.22	0.14	0.31	0.22	0.20	0.14	0.17	0.12	0.16	0.16	0.18	0.27	0.14	0.39	0.24	0.15	0.10	0.07	0.25	0.10
O3'	0.12	0.11	0.21	0.08	0.22	0.03	0.14	0.14	0.05	0.05	0.20	0.31	0.10	0.32	0.08	0.07	0.18	0.15	0.13	0.08
O4'	0.08	0.21	0.09	0.10	0.32	0.15	0.27	0.28	0.18	0.15	0.30	0.41	0.18	0.19	0.07	0.15	0.31	0.25	0.14	0.23
O5'	0.11	0.25	0.11	0.12	0.33	0.19	0.28	0.29	0.21	0.19	0.32	0.40	0.24	0.18	0.12	0.17	0.25	0.20	0.21	0.19
O6	0.12	0.10	0.18	0.16	0.15	0.10	0.15	0.13	0.11	0.10	0.12	0.19	0.09	0.18	0.21	0.11	0.14	0.14	0.19	0.13
OP1	0.13	0.22	0.16	0.11	0.30	0.15	0.26	0.23	0.20	0.18	0.28	0.37	0.21	0.23	0.12	0.15	0.17	0.13	0.23	0.13
OP2	0.18	0.22	0.20	0.15	0.28	0.16	0.25	0.22	0.21	0.20	0.27	0.33	0.21	0.27	0.15	0.16	0.14	0.14	0.27	0.14
P	0.13	0.24	0.13	0.12	0.33	0.17	0.28	0.26	0.21	0.19	0.31	0.40	0.23	0.20	0.12	0.16	0.21	0.15	0.23	0.16

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.04	0.03	0.07	0.03	0.01	0.01	0.05	0.11	0.09	0.06
C2	0.04	0.00	0.09	0.13	0.01	0.07	0.03	0.09	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.14	0.05	0.15	0.17	0.15	0.17
C2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.06	0.02	0.06	0.02	0.06	0.03	0.08	0.07	0.14	0.01	0.01	0.02	0.04	0.16	0.14	0.07
C3'	0.02	0.13	0.01	0.00	0.13	0.01	0.11	0.02	0.09	0.08	0.15	0.14	0.15	0.02	0.01	0.02	0.07	0.17	0.14	0.09
C4	0.03	0.01	0.06	0.13	0.00	0.10	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.16	0.04	0.21	0.24	0.24	0.24
C4'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.10	0.00	0.12	0.01	0.11	0.06	0.08	0.10	0.07	0.05	0.03	0.01	0.03	0.13	0.07	0.03
C5	0.03	0.03	0.06	0.11	0.01	0.12	0.00	0.17	0.01	0.02	0.03	0.01	0.04	0.05	0.13	0.06	0.23	0.24	0.21	0.25
C5'	0.02	0.09	0.02	0.02	0.15	0.01	0.17	0.00	0.16	0.09	0.12	0.16	0.09	0.05	0.04	0.02	0.01	0.12	0.04	0.02
C6	0.03	0.04	0.06	0.09	0.01	0.11	0.01	0.16	0.00	0.02	0.04	0.02	0.04	0.05	0.10	0.06	0.19	0.19	0.13	0.18
N1	0.02	0.02	0.03	0.08	0.01	0.06	0.02	0.09	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.03	0.08	0.03	0.13	0.15	0.10	0.13
N3	0.04	0.01	0.08	0.15	0.01	0.08	0.03	0.12	0.04	0.02	0.00	0.01	0.02	0.04	0.16	0.05	0.18	0.21	0.20	0.21
N4	0.03	0.01	0.07	0.14	0.01	0.10	0.01	0.16	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.04	0.18	0.04	0.23	0.28	0.29	0.28
O2	0.07	0.01	0.14	0.15	0.02	0.07	0.04	0.09	0.04	0.03	0.02	0.02	0.00	0.07	0.15	0.07	0.13	0.16	0.13	0.15
O2'	0.03	0.03	0.01	0.02	0.04	0.05	0.05	0.05	0.05	0.03	0.04	0.04	0.07	0.00	0.04	0.06	0.03	0.17	0.13	0.06
O3'	0.01	0.14	0.01	0.01	0.16	0.03	0.13	0.04	0.10	0.08	0.16	0.18	0.15	0.04	0.00	0.02	0.10	0.23	0.19	0.13
O4'	0.01	0.05	0.02	0.02	0.04	0.01	0.06	0.02	0.06	0.03	0.05	0.04	0.07	0.06	0.02	0.00	0.09	0.11	0.16	0.11
O5'	0.05	0.15	0.04	0.07	0.21	0.03	0.23	0.01	0.19	0.13	0.18	0.23	0.13	0.03	0.10	0.09	0.00	0.04	0.04	0.01
OP1	0.11	0.17	0.16	0.17	0.24	0.13	0.24	0.12	0.19	0.15	0.21	0.28	0.16	0.17	0.23	0.11	0.04	0.00	0.02	0.01
OP2	0.09	0.15	0.14	0.14	0.24	0.07	0.21	0.04	0.13	0.10	0.20	0.29	0.13	0.13	0.19	0.16	0.04	0.02	0.00	0.02
P	0.06	0.17	0.07	0.09	0.24	0.03	0.25	0.02	0.18	0.13	0.21	0.28	0.15	0.06	0.13	0.11	0.01	0.01	0.02	0.00