Doublet Group distance statistics: 53549

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, -0.002, 0.018, 0.039, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.018 std_dev=0.020
C1'	A	0, 0.001, 0.024, 0.047, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.024 std_dev=0.023
C6	A	0, -0.006, 0.017, 0.040, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.017 std_dev=0.023
C2	A	0, 0.000, 0.024, 0.049, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.024 std_dev=0.024
C5	A	0, -0.003, 0.023, 0.050, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.023 std_dev=0.026
C4	A	0, -0.002, 0.025, 0.053, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.025 std_dev=0.028
N3	A	0, -0.001, 0.029, 0.059, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.029 std_dev=0.030
N7	A	0, -0.002, 0.036, 0.074, 0.120 max_d=0.120 avg_d=0.036 std_dev=0.038
O6	A	0, -0.002, 0.043, 0.088, 0.143 max_d=0.143 avg_d=0.043 std_dev=0.045
C8	A	0, -0.003, 0.045, 0.092, 0.151 max_d=0.151 avg_d=0.045 std_dev=0.047
N9	A	0, -0.013, 0.036, 0.085, 0.158 max_d=0.158 avg_d=0.036 std_dev=0.049
N2	A	0, -0.023, 0.061, 0.146, 0.276 max_d=0.276 avg_d=0.061 std_dev=0.085
O5'	B	0, 0.116, 0.288, 0.460, 0.533 max_d=0.533 avg_d=0.288 std_dev=0.172
O4'	A	0, -0.049, 0.213, 0.476, 0.875 max_d=0.875 avg_d=0.213 std_dev=0.262
C2'	A	0, -0.029, 0.253, 0.536, 0.919 max_d=0.919 avg_d=0.253 std_dev=0.282
C5'	B	0, 0.198, 0.486, 0.774, 0.859 max_d=0.859 avg_d=0.486 std_dev=0.288
O5'	A	0, 0.094, 0.435, 0.777, 0.932 max_d=0.932 avg_d=0.435 std_dev=0.342
C4'	A	0, 0.009, 0.358, 0.707, 0.953 max_d=0.953 avg_d=0.358 std_dev=0.349
P	B	0, 0.059, 0.416, 0.774, 1.087 max_d=1.087 avg_d=0.416 std_dev=0.358
C6	B	0, 0.169, 0.542, 0.914, 1.031 max_d=1.031 avg_d=0.542 std_dev=0.372
C4'	B	0, 0.200, 0.573, 0.946, 1.051 max_d=1.051 avg_d=0.573 std_dev=0.373
C5	B	0, 0.182, 0.556, 0.930, 1.027 max_d=1.027 avg_d=0.556 std_dev=0.374
OP2	A	0, 0.197, 0.571, 0.946, 1.088 max_d=1.088 avg_d=0.571 std_dev=0.375
O4'	B	0, 0.213, 0.595, 0.976, 1.121 max_d=1.121 avg_d=0.595 std_dev=0.381
OP2	B	0, 0.140, 0.547, 0.955, 1.059 max_d=1.059 avg_d=0.547 std_dev=0.407
C5'	A	0, 0.022, 0.433, 0.843, 1.143 max_d=1.143 avg_d=0.433 std_dev=0.410
P	A	0, 0.145, 0.568, 0.991, 1.132 max_d=1.132 avg_d=0.568 std_dev=0.423
C3'	B	0, 0.130, 0.585, 1.041, 1.248 max_d=1.248 avg_d=0.585 std_dev=0.456
N1	B	0, 0.158, 0.620, 1.081, 1.189 max_d=1.189 avg_d=0.620 std_dev=0.462
C4	B	0, 0.191, 0.660, 1.129, 1.185 max_d=1.185 avg_d=0.660 std_dev=0.469
C1'	B	0, 0.168, 0.647, 1.125, 1.246 max_d=1.246 avg_d=0.647 std_dev=0.478
N4	B	0, 0.240, 0.723, 1.206, 1.232 max_d=1.232 avg_d=0.723 std_dev=0.483
C3'	A	0, 0.044, 0.533, 1.021, 1.252 max_d=1.252 avg_d=0.533 std_dev=0.488
OP1	B	0, 0.089, 0.634, 1.179, 1.364 max_d=1.364 avg_d=0.634 std_dev=0.545
C2'	B	0, 0.120, 0.671, 1.221, 1.437 max_d=1.437 avg_d=0.671 std_dev=0.551
OP1	A	0, 0.159, 0.714, 1.269, 1.456 max_d=1.456 avg_d=0.714 std_dev=0.555
C2	B	0, 0.150, 0.715, 1.280, 1.450 max_d=1.450 avg_d=0.715 std_dev=0.565
N3	B	0, 0.164, 0.736, 1.308, 1.448 max_d=1.448 avg_d=0.736 std_dev=0.572
O3'	B	0, 0.094, 0.710, 1.326, 1.640 max_d=1.640 avg_d=0.710 std_dev=0.616
O2	B	0, 0.152, 0.807, 1.462, 1.718 max_d=1.718 avg_d=0.807 std_dev=0.655
O2'	B	0, 0.110, 0.810, 1.510, 1.800 max_d=1.800 avg_d=0.810 std_dev=0.700
O2'	A	0, -0.025, 0.859, 1.743, 2.278 max_d=2.278 avg_d=0.859 std_dev=0.884
O3'	A	0, 0.034, 1.075, 2.117, 2.650 max_d=2.650 avg_d=1.075 std_dev=1.041

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.06	0.03	0.02	0.01	0.07	0.03	0.02	0.01	0.01	0.33	0.00	0.14	0.05	0.17	0.29	0.27
C2	0.03	0.00	0.25	0.31	0.01	0.21	0.01	0.23	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.50	0.21	0.21	0.21	0.03	0.14	0.20	0.14
C2'	0.01	0.25	0.00	0.00	0.18	0.02	0.14	0.18	0.19	0.05	0.23	0.24	0.25	0.04	0.05	0.01	0.02	0.05	0.36	0.19	0.29	0.50	0.42
C3'	0.04	0.31	0.00	0.00	0.19	0.00	0.16	0.02	0.21	0.06	0.28	0.36	0.28	0.09	0.08	0.02	0.01	0.04	0.14	0.19	0.21	0.16	0.12
C4	0.01	0.01	0.18	0.19	0.00	0.10	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.43	0.09	0.10	0.11	0.03	0.14	0.27	0.20
C4'	0.02	0.21	0.02	0.00	0.10	0.00	0.08	0.01	0.11	0.03	0.17	0.28	0.19	0.03	0.03	0.28	0.01	0.00	0.01	0.10	0.05	0.09	0.11
C5	0.02	0.01	0.14	0.16	0.00	0.08	0.00	0.14	0.02	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.50	0.15	0.06	0.12	0.03	0.14	0.25	0.19
C5'	0.06	0.23	0.18	0.02	0.13	0.01	0.14	0.00	0.17	0.10	0.21	0.31	0.19	0.11	0.09	0.12	0.20	0.01	0.01	0.18	0.05	0.02	0.02
C6	0.03	0.01	0.19	0.21	0.01	0.11	0.02	0.17	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.03	0.03	0.58	0.09	0.08	0.15	0.02	0.14	0.22	0.16
C8	0.02	0.01	0.05	0.06	0.00	0.03	0.02	0.10	0.04	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.33	0.38	0.06	0.11	0.06	0.16	0.28	0.25
N1	0.01	0.00	0.23	0.28	0.01	0.17	0.02	0.21	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.02	0.56	0.13	0.16	0.20	0.03	0.15	0.20	0.14
N2	0.07	0.00	0.24	0.36	0.01	0.28	0.02	0.31	0.03	0.01	0.03	0.00	0.02	0.02	0.03	0.46	0.35	0.28	0.30	0.06	0.19	0.19	0.20
N3	0.03	0.01	0.25	0.28	0.01	0.19	0.00	0.19	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.42	0.16	0.21	0.15	0.02	0.13	0.26	0.17
N7	0.02	0.01	0.04	0.09	0.00	0.03	0.01	0.11	0.03	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.44	0.30	0.04	0.10	0.05	0.14	0.26	0.22
N9	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.03	0.02	0.09	0.03	0.00	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.28	0.25	0.02	0.11	0.05	0.16	0.29	0.25
O2'	0.01	0.50	0.01	0.02	0.43	0.28	0.50	0.12	0.58	0.33	0.56	0.46	0.42	0.44	0.28	0.00	0.07	0.13	0.25	0.61	0.21	0.51	0.32
O3'	0.33	0.21	0.02	0.01	0.09	0.01	0.15	0.20	0.09	0.38	0.13	0.35	0.16	0.30	0.25	0.07	0.00	0.16	0.28	0.12	0.53	0.30	0.30
O4'	0.00	0.21	0.05	0.04	0.10	0.00	0.06	0.01	0.08	0.06	0.16	0.28	0.21	0.04	0.02	0.13	0.16	0.00	0.11	0.06	0.22	0.28	0.28
O5'	0.14	0.21	0.36	0.14	0.11	0.01	0.12	0.01	0.15	0.11	0.20	0.30	0.15	0.10	0.11	0.25	0.28	0.11	0.00	0.16	0.01	0.02	0.01
O6	0.05	0.03	0.19	0.19	0.03	0.10	0.03	0.18	0.02	0.06	0.03	0.06	0.02	0.05	0.05	0.61	0.12	0.06	0.16	0.00	0.15	0.21	0.16
OP1	0.17	0.14	0.29	0.21	0.14	0.05	0.14	0.05	0.14	0.16	0.15	0.19	0.13	0.14	0.16	0.21	0.53	0.22	0.01	0.15	0.00	0.01	0.01
OP2	0.29	0.20	0.50	0.16	0.27	0.09	0.25	0.02	0.22	0.28	0.20	0.19	0.26	0.26	0.29	0.51	0.30	0.28	0.02	0.21	0.01	0.00	0.01
P	0.27	0.14	0.42	0.12	0.20	0.11	0.19	0.02	0.16	0.25	0.14	0.20	0.17	0.22	0.25	0.32	0.30	0.28	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.34	0.18	0.36	0.35	0.31	0.21	0.32	0.14	0.18	0.43	0.41	0.39	0.15	0.48	0.20	0.14	0.27	0.07	0.10
C2	0.11	0.13	0.14	0.18	0.21	0.22	0.10	0.24	0.05	0.05	0.22	0.27	0.14	0.14	0.17	0.21	0.12	0.19	0.09	0.11
C2'	0.14	0.28	0.18	0.40	0.27	0.38	0.20	0.46	0.20	0.15	0.36	0.32	0.37	0.13	0.51	0.25	0.35	0.44	0.27	0.34
C3'	0.19	0.37	0.14	0.06	0.42	0.06	0.35	0.07	0.29	0.28	0.44	0.46	0.38	0.13	0.16	0.11	0.20	0.21	0.25	0.17
C4	0.20	0.15	0.26	0.36	0.22	0.34	0.12	0.32	0.15	0.13	0.24	0.32	0.17	0.24	0.38	0.29	0.16	0.20	0.06	0.09
C4'	0.21	0.41	0.14	0.12	0.42	0.12	0.34	0.16	0.29	0.31	0.46	0.45	0.41	0.13	0.30	0.11	0.11	0.25	0.17	0.10
C5	0.32	0.22	0.35	0.38	0.16	0.38	0.22	0.32	0.29	0.28	0.19	0.22	0.23	0.33	0.37	0.37	0.18	0.17	0.10	0.08
C5'	0.45	0.52	0.46	0.19	0.51	0.15	0.47	0.04	0.46	0.49	0.53	0.51	0.52	0.49	0.06	0.30	0.23	0.23	0.19	0.14
C6	0.33	0.24	0.32	0.32	0.18	0.34	0.26	0.28	0.33	0.30	0.19	0.15	0.24	0.31	0.28	0.37	0.17	0.16	0.14	0.09
C8	0.32	0.25	0.40	0.45	0.21	0.41	0.21	0.36	0.26	0.27	0.24	0.27	0.28	0.38	0.49	0.36	0.19	0.20	0.08	0.09
N1	0.22	0.11	0.21	0.23	0.08	0.26	0.11	0.24	0.21	0.18	0.10	0.15	0.13	0.20	0.19	0.30	0.14	0.18	0.12	0.10
N2	0.13	0.22	0.20	0.15	0.25	0.14	0.18	0.18	0.14	0.16	0.26	0.27	0.21	0.20	0.18	0.12	0.08	0.21	0.14	0.15
N3	0.07	0.21	0.12	0.25	0.29	0.26	0.15	0.29	0.04	0.06	0.31	0.35	0.21	0.13	0.27	0.20	0.14	0.23	0.07	0.12
N7	0.38	0.31	0.42	0.44	0.24	0.42	0.28	0.35	0.34	0.35	0.27	0.24	0.32	0.41	0.44	0.41	0.19	0.17	0.11	0.08
N9	0.21	0.19	0.30	0.41	0.25	0.37	0.16	0.34	0.17	0.15	0.28	0.34	0.23	0.28	0.47	0.29	0.17	0.23	0.05	0.10
O2'	0.21	0.42	0.16	0.26	0.29	0.24	0.28	0.37	0.25	0.23	0.43	0.31	0.61	0.29	0.31	0.18	0.37	0.48	0.43	0.42
O3'	0.15	0.31	0.13	0.14	0.27	0.14	0.19	0.13	0.15	0.19	0.34	0.30	0.39	0.10	0.14	0.14	0.19	0.27	0.23	0.19
O4'	0.13	0.38	0.09	0.32	0.42	0.28	0.32	0.32	0.23	0.25	0.45	0.46	0.36	0.08	0.48	0.16	0.18	0.34	0.23	0.20
O5'	0.32	0.40	0.35	0.15	0.42	0.07	0.39	0.06	0.37	0.38	0.43	0.43	0.38	0.35	0.01	0.18	0.18	0.27	0.17	0.13
O6	0.39	0.34	0.36	0.33	0.32	0.35	0.39	0.26	0.40	0.39	0.31	0.25	0.33	0.36	0.28	0.41	0.17	0.17	0.18	0.10
OP1	0.04	0.15	0.12	0.01	0.18	0.18	0.14	0.31	0.10	0.10	0.19	0.21	0.16	0.14	0.01	0.12	0.13	0.45	0.23	0.27
OP2	0.07	0.09	0.04	0.07	0.12	0.21	0.11	0.30	0.07	0.05	0.12	0.14	0.09	0.05	0.01	0.19	0.11	0.34	0.21	0.21
P	0.07	0.15	0.13	0.02	0.18	0.10	0.17	0.19	0.14	0.12	0.18	0.20	0.13	0.13	0.00	0.05	0.06	0.31	0.14	0.15

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.04	0.06	0.12	0.07
C2	0.01	0.00	0.07	0.07	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.08	0.03	0.12	0.14	0.26	0.17
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.05	0.01	0.06	0.02	0.11	0.00	0.01	0.01	0.10	0.12	0.16	0.11
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.06	0.00	0.07	0.02	0.07	0.03	0.08	0.06	0.10	0.02	0.01	0.00	0.14	0.14	0.13	0.12
C4	0.01	0.01	0.02	0.06	0.00	0.05	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01	0.21	0.27	0.39	0.28
C4'	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.07	0.02	0.03	0.05	0.05	0.02	0.01	0.00	0.03	0.09	0.06	0.04
C5	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.07	0.00	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.08	0.03	0.22	0.29	0.38	0.30
C5'	0.02	0.05	0.02	0.02	0.13	0.01	0.15	0.00	0.13	0.07	0.09	0.14	0.03	0.03	0.03	0.01	0.02	0.11	0.04	0.03
C6	0.01	0.01	0.05	0.07	0.00	0.07	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.08	0.04	0.19	0.21	0.28	0.22
N1	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.12	0.13	0.22	0.15
N3	0.01	0.01	0.06	0.08	0.00	0.03	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.09	0.02	0.17	0.21	0.34	0.23
N4	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.05	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.07	0.01	0.22	0.32	0.43	0.32
O2	0.04	0.00	0.11	0.10	0.01	0.05	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.12	0.13	0.07	0.08	0.08	0.22	0.13
O2'	0.01	0.07	0.00	0.02	0.03	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.06	0.03	0.12	0.00	0.03	0.02	0.07	0.12	0.12	0.07
O3'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.07	0.01	0.08	0.03	0.08	0.03	0.09	0.07	0.13	0.03	0.00	0.01	0.17	0.19	0.14	0.14
O4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.07	0.02	0.01	0.00	0.06	0.09	0.06	0.07
O5'	0.04	0.12	0.10	0.14	0.21	0.03	0.22	0.02	0.19	0.12	0.17	0.22	0.08	0.07	0.17	0.06	0.00	0.01	0.03	0.01
OP1	0.06	0.14	0.12	0.14	0.27	0.09	0.29	0.11	0.21	0.13	0.21	0.32	0.08	0.12	0.19	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.12	0.26	0.16	0.13	0.39	0.06	0.38	0.04	0.28	0.22	0.34	0.43	0.22	0.12	0.14	0.06	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.17	0.11	0.12	0.28	0.04	0.30	0.03	0.22	0.15	0.23	0.32	0.13	0.07	0.14	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00