Doublet Group distance statistics: 53559

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.008, 0.016, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.008 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.000, 0.008, 0.016, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.008 std_dev=0.008
N7	A	0, 0.000, 0.011, 0.022, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.000, 0.014, 0.028, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.000, 0.015, 0.030, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.015 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.000, 0.015, 0.030, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.015 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.000, 0.016, 0.033, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.016 std_dev=0.016
C8	A	0, 0.000, 0.017, 0.033, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.017 std_dev=0.017
O6	A	0, 0.000, 0.017, 0.033, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.017 std_dev=0.017
N3	A	0, 0.000, 0.017, 0.034, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.017 std_dev=0.017
C1'	A	0, 0.000, 0.021, 0.041, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.021 std_dev=0.021
N2	A	0, 0.000, 0.029, 0.057, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.029 std_dev=0.029
OP1	B	0, 0.000, 0.345, 0.689, 0.689 max_d=0.689 avg_d=0.345 std_dev=0.345
P	B	0, 0.000, 0.350, 0.700, 0.700 max_d=0.700 avg_d=0.350 std_dev=0.350
O5'	B	0, 0.000, 0.428, 0.856, 0.856 max_d=0.856 avg_d=0.428 std_dev=0.428
O4'	A	0, 0.000, 0.487, 0.974, 0.974 max_d=0.974 avg_d=0.487 std_dev=0.487
C2'	A	0, 0.000, 0.572, 1.144, 1.144 max_d=1.144 avg_d=0.572 std_dev=0.572
OP2	B	0, 0.000, 0.743, 1.487, 1.487 max_d=1.487 avg_d=0.743 std_dev=0.743
C4'	A	0, 0.000, 0.790, 1.579, 1.579 max_d=1.579 avg_d=0.790 std_dev=0.790
O5'	A	0, 0.000, 0.865, 1.730, 1.730 max_d=1.730 avg_d=0.865 std_dev=0.865
C3'	A	0, 0.000, 0.871, 1.742, 1.742 max_d=1.742 avg_d=0.871 std_dev=0.871
O2'	A	0, 0.000, 0.918, 1.836, 1.836 max_d=1.836 avg_d=0.918 std_dev=0.918
OP2	A	0, 0.000, 0.922, 1.844, 1.844 max_d=1.844 avg_d=0.922 std_dev=0.922
C5'	A	0, 0.000, 0.993, 1.986, 1.986 max_d=1.986 avg_d=0.993 std_dev=0.993
P	A	0, 0.000, 1.054, 2.107, 2.107 max_d=2.107 avg_d=1.054 std_dev=1.054
OP1	A	0, 0.000, 1.303, 2.606, 2.606 max_d=2.606 avg_d=1.303 std_dev=1.303
O3'	A	0, 0.000, 1.350, 2.700, 2.700 max_d=2.700 avg_d=1.350 std_dev=1.350
C3'	B	0, 0.000, 1.496, 2.992, 2.992 max_d=2.992 avg_d=1.496 std_dev=1.496
C2'	B	0, 0.000, 1.648, 3.296, 3.296 max_d=3.296 avg_d=1.648 std_dev=1.648
C5'	B	0, 0.000, 1.748, 3.496, 3.496 max_d=3.496 avg_d=1.748 std_dev=1.748
C4'	B	0, 0.000, 2.111, 4.222, 4.222 max_d=4.222 avg_d=2.111 std_dev=2.111
N1	B	0, 0.000, 2.218, 4.436, 4.436 max_d=4.436 avg_d=2.218 std_dev=2.218
C1'	B	0, 0.000, 2.235, 4.469, 4.469 max_d=4.469 avg_d=2.235 std_dev=2.235
C6	B	0, 0.000, 2.246, 4.491, 4.491 max_d=4.491 avg_d=2.246 std_dev=2.246
O4'	B	0, 0.000, 2.306, 4.612, 4.612 max_d=4.612 avg_d=2.306 std_dev=2.306
O3'	B	0, 0.000, 2.610, 5.220, 5.220 max_d=5.220 avg_d=2.610 std_dev=2.610
C2	B	0, 0.000, 2.804, 5.607, 5.607 max_d=5.607 avg_d=2.804 std_dev=2.804
O2'	B	0, 0.000, 2.855, 5.710, 5.710 max_d=5.710 avg_d=2.855 std_dev=2.855
O2	B	0, 0.000, 2.973, 5.947, 5.947 max_d=5.947 avg_d=2.973 std_dev=2.973
C5	B	0, 0.000, 3.225, 6.451, 6.451 max_d=6.451 avg_d=3.225 std_dev=3.225
N3	B	0, 0.000, 3.529, 7.058, 7.058 max_d=7.058 avg_d=3.529 std_dev=3.529
C4	B	0, 0.000, 3.868, 7.737, 7.737 max_d=7.737 avg_d=3.868 std_dev=3.868
N4	B	0, 0.000, 4.982, 9.963, 9.963 max_d=9.963 avg_d=4.982 std_dev=4.982

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.07	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.00	0.00	0.01	0.23	0.00	0.15	0.02	0.13	0.22	0.16
C2	0.02	0.00	0.25	0.21	0.00	0.01	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.10	0.13	0.09	0.00	0.10	0.18	0.15
C2'	0.00	0.25	0.00	0.00	0.12	0.00	0.05	0.16	0.11	0.14	0.19	0.31	0.25	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.32	0.08	0.32	0.41	0.34
C3'	0.00	0.21	0.00	0.00	0.20	0.00	0.24	0.02	0.26	0.20	0.25	0.19	0.18	0.24	0.16	0.03	0.00	0.01	0.08	0.28	0.05	0.11	0.08
C4	0.01	0.00	0.12	0.20	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.11	0.05	0.07	0.10	0.01	0.11	0.20	0.15
C4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.02	0.08	0.00	0.02	0.00	0.06	0.04	0.25	0.01	0.00	0.01	0.03	0.03	0.01	0.01
C5	0.01	0.00	0.05	0.24	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.21	0.04	0.04	0.08	0.01	0.13	0.21	0.16
C5'	0.07	0.09	0.16	0.02	0.06	0.00	0.06	0.00	0.07	0.02	0.09	0.09	0.08	0.03	0.05	0.08	0.19	0.01	0.00	0.07	0.03	0.00	0.00
C6	0.02	0.00	0.11	0.26	0.01	0.02	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.17	0.04	0.07	0.08	0.00	0.12	0.19	0.16
C8	0.00	0.01	0.14	0.20	0.00	0.08	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.30	0.07	0.08	0.09	0.01	0.14	0.24	0.16
N1	0.02	0.00	0.19	0.25	0.01	0.00	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.02	0.11	0.08	0.00	0.11	0.18	0.16
N2	0.03	0.00	0.31	0.19	0.00	0.02	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.13	0.15	0.15	0.09	0.00	0.09	0.17	0.15
N3	0.02	0.00	0.25	0.18	0.00	0.00	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.14	0.11	0.10	0.01	0.09	0.18	0.14
N7	0.00	0.00	0.08	0.24	0.00	0.06	0.00	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.30	0.11	0.03	0.07	0.01	0.14	0.23	0.16
N9	0.00	0.01	0.01	0.16	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.17	0.05	0.00	0.12	0.01	0.12	0.22	0.16
O2'	0.01	0.03	0.00	0.03	0.11	0.25	0.21	0.08	0.17	0.30	0.07	0.13	0.04	0.30	0.17	0.00	0.05	0.17	0.21	0.21	0.20	0.46	0.27
O3'	0.23	0.10	0.01	0.00	0.05	0.01	0.04	0.19	0.04	0.07	0.02	0.15	0.14	0.11	0.05	0.05	0.00	0.19	0.27	0.09	0.42	0.35	0.33
O4'	0.00	0.13	0.01	0.01	0.07	0.00	0.04	0.01	0.07	0.08	0.11	0.15	0.11	0.03	0.00	0.17	0.19	0.00	0.04	0.06	0.00	0.06	0.03
O5'	0.15	0.09	0.32	0.08	0.10	0.01	0.08	0.00	0.08	0.09	0.08	0.09	0.10	0.07	0.12	0.21	0.27	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.00
O6	0.02	0.00	0.08	0.28	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.21	0.09	0.06	0.07	0.00	0.13	0.18	0.16
OP1	0.13	0.10	0.32	0.05	0.11	0.03	0.13	0.03	0.12	0.14	0.11	0.09	0.09	0.14	0.12	0.20	0.42	0.00	0.01	0.13	0.00	0.00	0.00
OP2	0.22	0.18	0.41	0.11	0.20	0.01	0.21	0.00	0.19	0.24	0.18	0.17	0.18	0.23	0.22	0.46	0.35	0.06	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00
P	0.16	0.15	0.34	0.08	0.15	0.01	0.16	0.00	0.16	0.16	0.16	0.15	0.14	0.16	0.16	0.27	0.33	0.03	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.31	0.98	0.25	0.60	1.60	0.48	1.47	0.62	1.05	0.80	1.36	1.94	0.77	0.49	1.22	0.20	0.21	0.04	0.11	0.04
C2	0.18	0.65	0.24	0.52	1.11	0.44	1.08	0.59	0.78	0.55	0.91	1.31	0.49	0.40	0.98	0.11	0.23	0.04	0.10	0.06
C2'	0.82	1.50	0.19	0.24	2.05	0.05	1.88	0.24	1.48	1.29	1.86	2.37	1.32	0.02	0.92	0.70	0.11	0.21	0.28	0.21
C3'	0.68	1.34	0.05	0.36	1.92	0.17	1.76	0.32	1.36	1.14	1.71	2.25	1.15	0.18	1.04	0.57	0.04	0.20	0.31	0.18
C4	0.26	0.74	0.20	0.50	1.20	0.38	1.13	0.52	0.82	0.62	1.01	1.43	0.58	0.35	1.00	0.19	0.21	0.08	0.09	0.08
C4'	0.31	1.01	0.26	0.62	1.66	0.51	1.50	0.65	1.06	0.81	1.41	2.03	0.79	0.52	1.26	0.18	0.23	0.04	0.10	0.07
C5	0.25	0.59	0.13	0.39	0.91	0.24	0.86	0.37	0.65	0.50	0.78	1.07	0.48	0.21	0.78	0.21	0.18	0.12	0.10	0.11
C5'	0.25	0.89	0.28	0.63	1.48	0.51	1.33	0.66	0.93	0.71	1.27	1.83	0.70	0.49	1.22	0.13	0.30	0.13	0.02	0.16
C6	0.20	0.43	0.10	0.30	0.65	0.16	0.63	0.27	0.48	0.38	0.56	0.76	0.35	0.13	0.60	0.19	0.17	0.14	0.10	0.13
C8	0.31	0.74	0.14	0.45	1.14	0.29	1.06	0.42	0.78	0.62	0.99	1.36	0.60	0.26	0.92	0.25	0.19	0.11	0.09	0.10
N1	0.17	0.46	0.15	0.37	0.75	0.26	0.73	0.38	0.54	0.40	0.62	0.87	0.36	0.22	0.69	0.14	0.19	0.10	0.11	0.10
N2	0.13	0.68	0.31	0.61	1.21	0.58	1.20	0.74	0.85	0.56	0.97	1.42	0.48	0.51	1.08	0.03	0.26	0.04	0.09	0.02
N3	0.23	0.80	0.26	0.58	1.33	0.49	1.27	0.64	0.91	0.66	1.11	1.59	0.60	0.46	1.12	0.14	0.24	0.04	0.09	0.05
N7	0.28	0.61	0.10	0.36	0.90	0.20	0.85	0.33	0.64	0.52	0.79	1.06	0.50	0.16	0.76	0.25	0.17	0.13	0.09	0.12
N9	0.30	0.83	0.20	0.53	1.33	0.39	1.24	0.53	0.90	0.69	1.13	1.60	0.66	0.37	1.07	0.22	0.21	0.08	0.10	0.07
O2'	0.67	1.44	0.03	0.51	2.05	0.30	1.84	0.51	1.38	1.18	1.85	2.42	1.26	0.26	1.25	0.52	0.14	0.06	0.02	0.03
O3'	0.39	1.11	0.29	0.71	1.73	0.52	1.55	0.67	1.11	0.89	1.51	2.09	0.91	0.54	1.44	0.27	0.28	0.07	0.01	0.12
O4'	0.07	0.75	0.45	0.78	1.41	0.71	1.28	0.82	0.83	0.56	1.15	1.78	0.52	0.72	1.37	0.06	0.38	0.17	0.00	0.19
O5'	0.34	0.87	0.18	0.53	1.34	0.37	1.21	0.52	0.88	0.71	1.17	1.62	0.72	0.32	1.08	0.24	0.25	0.15	0.02	0.17
O6	0.18	0.28	0.03	0.18	0.37	0.03	0.36	0.11	0.30	0.25	0.33	0.41	0.24	0.00	0.38	0.19	0.12	0.15	0.11	0.14
OP1	0.42	0.93	0.09	0.46	1.35	0.28	1.20	0.45	0.89	0.76	1.21	1.62	0.80	0.21	1.00	0.32	0.23	0.16	0.01	0.18
OP2	0.34	0.69	0.12	0.45	0.98	0.24	0.87	0.40	0.66	0.57	0.89	1.16	0.61	0.15	0.90	0.28	0.29	0.27	0.09	0.28
P	0.29	0.76	0.18	0.52	1.16	0.35	1.03	0.51	0.75	0.61	1.02	1.41	0.63	0.29	1.03	0.21	0.30	0.23	0.05	0.25

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.35	0.17	0.05
C2	0.01	0.00	0.08	0.11	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.13	0.01	0.09	0.50	0.34	0.11
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.02	0.00	0.07	0.00	0.08	0.00	0.04	0.03	0.18	0.00	0.02	0.00	0.01	0.08	0.12	0.01
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.01	0.00	0.05	0.01	0.07	0.02	0.08	0.00	0.19	0.01	0.00	0.00	0.02	0.10	0.03	0.03
C4	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.02	0.01	0.08	0.60	0.55	0.13
C4'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.04	0.02	0.06	0.02	0.01	0.00	0.00	0.06	0.11	0.01
C5	0.00	0.00	0.07	0.05	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.06	0.03	0.05	0.60	0.58	0.12
C5'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.05	0.00	0.03	0.00	0.03	0.03	0.06	0.05	0.07	0.02	0.03	0.01	0.00	0.06	0.26	0.00
C6	0.00	0.01	0.08	0.07	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.06	0.07	0.03	0.03	0.54	0.45	0.10
N1	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.01	0.05	0.47	0.32	0.09
N3	0.01	0.00	0.04	0.08	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.10	0.00	0.09	0.56	0.45	0.13
N4	0.00	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.01	0.02	0.07	0.62	0.62	0.13
O2	0.02	0.00	0.18	0.19	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.10	0.23	0.02	0.10	0.46	0.26	0.11
O2'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.04	0.02	0.06	0.02	0.06	0.02	0.00	0.05	0.10	0.00	0.02	0.02	0.01	0.07	0.01	0.01
O3'	0.01	0.13	0.02	0.00	0.02	0.01	0.06	0.03	0.07	0.03	0.10	0.01	0.23	0.02	0.00	0.00	0.05	0.35	0.10	0.08
O4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.00	0.02	0.37	0.06	0.05
O5'	0.02	0.09	0.01	0.02	0.08	0.00	0.05	0.00	0.03	0.05	0.09	0.07	0.10	0.01	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.35	0.50	0.08	0.10	0.60	0.06	0.60	0.06	0.54	0.47	0.56	0.62	0.46	0.07	0.35	0.37	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.17	0.34	0.12	0.03	0.55	0.11	0.58	0.26	0.45	0.32	0.45	0.62	0.26	0.01	0.10	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.05	0.11	0.01	0.03	0.13	0.01	0.12	0.00	0.10	0.09	0.13	0.13	0.11	0.01	0.08	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00