Doublet Group distance statistics: 53563

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 4, 8, 7, 15, 11, 3, 6, 3, 4, 4, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.017, 0.028, 0.039, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.028 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.004, 0.018, 0.032, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.018 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.032, 0.052, 0.072, 0.121 max_d=0.121 avg_d=0.052 std_dev=0.020
N1	A	0, 0.018, 0.038, 0.058, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.038 std_dev=0.020
C5	A	0, 0.018, 0.039, 0.059, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.039 std_dev=0.021
C1'	A	0, 0.016, 0.037, 0.058, 0.145 max_d=0.145 avg_d=0.037 std_dev=0.021
N2	A	0, 0.047, 0.072, 0.097, 0.202 max_d=0.202 avg_d=0.072 std_dev=0.025
C4	A	0, 0.035, 0.062, 0.089, 0.127 max_d=0.127 avg_d=0.062 std_dev=0.027
N9	A	0, 0.025, 0.052, 0.080, 0.135 max_d=0.135 avg_d=0.052 std_dev=0.027
O6	A	0, 0.049, 0.086, 0.124, 0.153 max_d=0.153 avg_d=0.086 std_dev=0.038
N7	A	0, 0.027, 0.067, 0.107, 0.144 max_d=0.144 avg_d=0.067 std_dev=0.040
C8	A	0, 0.038, 0.088, 0.138, 0.189 max_d=0.189 avg_d=0.088 std_dev=0.050
O4'	A	0, 0.042, 0.128, 0.215, 0.553 max_d=0.553 avg_d=0.128 std_dev=0.086
C2'	A	0, 0.095, 0.188, 0.281, 0.648 max_d=0.648 avg_d=0.188 std_dev=0.093
C3'	A	0, 0.127, 0.258, 0.389, 0.829 max_d=0.829 avg_d=0.258 std_dev=0.131
C4'	A	0, 0.092, 0.242, 0.392, 0.858 max_d=0.858 avg_d=0.242 std_dev=0.150
O2'	A	0, 0.099, 0.261, 0.422, 0.931 max_d=0.931 avg_d=0.261 std_dev=0.161
O3'	A	0, 0.192, 0.387, 0.581, 1.105 max_d=1.105 avg_d=0.387 std_dev=0.194
OP2	B	0, 0.214, 0.437, 0.659, 1.057 max_d=1.057 avg_d=0.437 std_dev=0.222
O5'	B	0, 0.289, 0.532, 0.775, 1.059 max_d=1.059 avg_d=0.532 std_dev=0.243
P	B	0, 0.252, 0.514, 0.776, 1.147 max_d=1.147 avg_d=0.514 std_dev=0.262
O5'	A	0, 0.168, 0.431, 0.694, 1.463 max_d=1.463 avg_d=0.431 std_dev=0.263
C5'	A	0, 0.085, 0.395, 0.704, 1.902 max_d=1.902 avg_d=0.395 std_dev=0.309
N7	B	0, 0.156, 0.466, 0.777, 1.599 max_d=1.599 avg_d=0.466 std_dev=0.311
C5'	B	0, 0.345, 0.670, 0.995, 1.455 max_d=1.455 avg_d=0.670 std_dev=0.325
C8	B	0, 0.168, 0.496, 0.823, 1.667 max_d=1.667 avg_d=0.496 std_dev=0.328
C5	B	0, 0.196, 0.530, 0.864, 1.745 max_d=1.745 avg_d=0.530 std_dev=0.334
OP1	B	0, 0.312, 0.647, 0.981, 1.466 max_d=1.466 avg_d=0.647 std_dev=0.335
C3'	B	0, 0.301, 0.642, 0.984, 1.664 max_d=1.664 avg_d=0.642 std_dev=0.341
C4'	B	0, 0.342, 0.699, 1.055, 1.513 max_d=1.513 avg_d=0.699 std_dev=0.357
O4'	B	0, 0.337, 0.704, 1.070, 1.729 max_d=1.729 avg_d=0.704 std_dev=0.366
N9	B	0, 0.193, 0.560, 0.926, 1.865 max_d=1.865 avg_d=0.560 std_dev=0.366
C6	B	0, 0.274, 0.650, 1.026, 1.998 max_d=1.998 avg_d=0.650 std_dev=0.376
O3'	B	0, 0.371, 0.752, 1.132, 1.851 max_d=1.851 avg_d=0.752 std_dev=0.380
C4	B	0, 0.197, 0.579, 0.962, 1.905 max_d=1.905 avg_d=0.579 std_dev=0.382
P	A	0, 0.315, 0.704, 1.093, 2.402 max_d=2.402 avg_d=0.704 std_dev=0.389
N6	B	0, 0.282, 0.695, 1.109, 2.110 max_d=2.110 avg_d=0.695 std_dev=0.413
C1'	B	0, 0.293, 0.707, 1.120, 2.016 max_d=2.016 avg_d=0.707 std_dev=0.414
C2'	B	0, 0.340, 0.757, 1.174, 2.090 max_d=2.090 avg_d=0.757 std_dev=0.417
N1	B	0, 0.346, 0.790, 1.233, 2.332 max_d=2.332 avg_d=0.790 std_dev=0.444
OP2	A	0, 0.285, 0.745, 1.205, 2.758 max_d=2.758 avg_d=0.745 std_dev=0.460
N3	B	0, 0.253, 0.716, 1.180, 2.140 max_d=2.140 avg_d=0.716 std_dev=0.464
C2	B	0, 0.319, 0.803, 1.286, 2.425 max_d=2.425 avg_d=0.803 std_dev=0.483
O2'	B	0, 0.444, 0.962, 1.479, 2.388 max_d=2.388 avg_d=0.962 std_dev=0.517
OP1	A	0, 0.410, 0.934, 1.459, 2.896 max_d=2.896 avg_d=0.934 std_dev=0.524

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.04	0.05	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.15	0.02	0.19	0.11	0.13
C2	0.04	0.00	0.08	0.09	0.01	0.05	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.13	0.11	0.04	0.23	0.01	0.24	0.33	0.23
C2'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.05	0.02	0.05	0.02	0.07	0.05	0.07	0.09	0.08	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.14	0.07	0.20	0.14	0.10
C3'	0.02	0.09	0.00	0.00	0.07	0.00	0.09	0.02	0.10	0.09	0.10	0.11	0.09	0.10	0.06	0.02	0.01	0.01	0.16	0.11	0.22	0.17	0.13
C4	0.02	0.01	0.05	0.07	0.00	0.05	0.00	0.17	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.07	0.02	0.24	0.01	0.24	0.30	0.23
C4'	0.01	0.05	0.02	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.09	0.11	0.07	0.05	0.04	0.11	0.06	0.06	0.02	0.00	0.01	0.11	0.17	0.09	0.08
C5	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.09	0.00	0.23	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.09	0.02	0.28	0.01	0.29	0.39	0.30
C5'	0.05	0.16	0.02	0.02	0.17	0.01	0.23	0.00	0.24	0.23	0.21	0.13	0.13	0.27	0.15	0.06	0.06	0.02	0.01	0.28	0.16	0.17	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.10	0.01	0.09	0.01	0.24	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.11	0.02	0.29	0.01	0.32	0.43	0.33
C8	0.01	0.01	0.05	0.09	0.01	0.11	0.01	0.23	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.04	0.11	0.04	0.29	0.02	0.27	0.31	0.28
N1	0.04	0.00	0.07	0.10	0.01	0.07	0.01	0.21	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.13	0.11	0.03	0.27	0.01	0.28	0.39	0.29
N2	0.05	0.00	0.09	0.11	0.01	0.05	0.01	0.13	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.16	0.14	0.06	0.22	0.01	0.22	0.31	0.21
N3	0.04	0.01	0.08	0.09	0.00	0.04	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.10	0.05	0.22	0.01	0.21	0.27	0.20
N7	0.01	0.01	0.06	0.10	0.01	0.11	0.00	0.27	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.12	0.04	0.31	0.02	0.33	0.41	0.34
N9	0.01	0.02	0.02	0.06	0.01	0.06	0.01	0.15	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.23	0.01	0.22	0.24	0.20
O2'	0.02	0.13	0.00	0.02	0.08	0.06	0.07	0.06	0.10	0.04	0.13	0.16	0.12	0.05	0.03	0.00	0.04	0.05	0.06	0.10	0.21	0.06	0.10
O3'	0.02	0.11	0.02	0.01	0.07	0.02	0.09	0.06	0.11	0.11	0.11	0.14	0.10	0.12	0.05	0.04	0.00	0.01	0.15	0.13	0.26	0.20	0.15
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.04	0.03	0.06	0.05	0.04	0.01	0.05	0.01	0.00	0.14	0.03	0.20	0.12	0.15
O5'	0.15	0.23	0.14	0.16	0.24	0.01	0.28	0.01	0.29	0.29	0.27	0.22	0.22	0.31	0.23	0.06	0.15	0.14	0.00	0.31	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.07	0.11	0.01	0.11	0.01	0.28	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.10	0.13	0.03	0.31	0.00	0.36	0.48	0.37
OP1	0.19	0.24	0.20	0.22	0.24	0.17	0.29	0.16	0.32	0.27	0.28	0.22	0.21	0.33	0.22	0.21	0.26	0.20	0.02	0.36	0.00	0.02	0.01
OP2	0.11	0.33	0.14	0.17	0.30	0.09	0.39	0.17	0.43	0.31	0.39	0.31	0.27	0.41	0.24	0.06	0.20	0.12	0.02	0.48	0.02	0.00	0.01
P	0.13	0.23	0.10	0.13	0.23	0.08	0.30	0.02	0.33	0.28	0.29	0.21	0.20	0.34	0.20	0.10	0.15	0.15	0.01	0.37	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.27	0.44	0.26	0.22	0.33	0.20	0.34	0.18	0.42	0.24	0.47	0.38	0.47	0.26	0.27	0.27	0.24	0.24	0.17	0.17	0.18	0.16
C2	0.19	0.28	0.18	0.17	0.24	0.16	0.27	0.17	0.33	0.20	0.32	0.24	0.38	0.25	0.20	0.18	0.19	0.19	0.17	0.17	0.17	0.16
C2'	0.27	0.42	0.27	0.23	0.33	0.20	0.35	0.17	0.43	0.26	0.46	0.37	0.49	0.30	0.28	0.28	0.24	0.23	0.16	0.13	0.14	0.13
C3'	0.29	0.44	0.28	0.24	0.34	0.22	0.35	0.20	0.42	0.28	0.46	0.39	0.47	0.31	0.30	0.29	0.25	0.25	0.18	0.14	0.14	0.14
C4	0.21	0.37	0.20	0.18	0.28	0.17	0.32	0.17	0.40	0.22	0.41	0.31	0.46	0.27	0.23	0.20	0.20	0.20	0.17	0.18	0.18	0.17
C4'	0.29	0.48	0.29	0.24	0.35	0.22	0.34	0.19	0.42	0.25	0.50	0.42	0.44	0.26	0.29	0.30	0.26	0.25	0.16	0.14	0.15	0.14
C5	0.19	0.35	0.19	0.17	0.27	0.16	0.31	0.17	0.39	0.21	0.40	0.29	0.46	0.26	0.22	0.19	0.20	0.19	0.18	0.22	0.20	0.19
C5'	0.30	0.50	0.29	0.25	0.36	0.23	0.34	0.22	0.43	0.26	0.51	0.43	0.44	0.27	0.30	0.31	0.26	0.27	0.22	0.21	0.21	0.20
C6	0.18	0.31	0.18	0.18	0.24	0.17	0.28	0.19	0.36	0.20	0.36	0.25	0.43	0.25	0.20	0.18	0.21	0.19	0.19	0.24	0.21	0.21
C8	0.22	0.41	0.21	0.19	0.31	0.17	0.33	0.17	0.42	0.22	0.46	0.35	0.48	0.27	0.24	0.22	0.21	0.21	0.17	0.20	0.19	0.18
N1	0.18	0.28	0.18	0.17	0.22	0.17	0.27	0.19	0.33	0.19	0.32	0.23	0.39	0.24	0.19	0.17	0.20	0.19	0.19	0.22	0.20	0.20
N2	0.18	0.24	0.17	0.16	0.21	0.16	0.24	0.17	0.28	0.20	0.26	0.21	0.31	0.23	0.19	0.17	0.17	0.20	0.17	0.15	0.16	0.15
N3	0.21	0.33	0.20	0.18	0.27	0.17	0.31	0.17	0.37	0.22	0.37	0.29	0.43	0.27	0.23	0.20	0.20	0.21	0.17	0.16	0.17	0.15
N7	0.20	0.39	0.20	0.18	0.29	0.16	0.32	0.17	0.41	0.21	0.43	0.32	0.48	0.26	0.22	0.20	0.21	0.20	0.18	0.23	0.20	0.19
N9	0.23	0.41	0.22	0.19	0.31	0.18	0.33	0.17	0.42	0.23	0.45	0.35	0.48	0.27	0.25	0.23	0.21	0.21	0.17	0.18	0.18	0.16
O2'	0.31	0.43	0.31	0.28	0.34	0.26	0.34	0.23	0.42	0.28	0.46	0.38	0.49	0.29	0.30	0.32	0.29	0.28	0.22	0.21	0.22	0.21
O3'	0.32	0.46	0.32	0.27	0.36	0.25	0.37	0.22	0.44	0.32	0.48	0.41	0.48	0.34	0.33	0.33	0.28	0.28	0.19	0.14	0.14	0.14
O4'	0.29	0.48	0.28	0.24	0.36	0.22	0.34	0.19	0.43	0.25	0.50	0.42	0.45	0.26	0.29	0.29	0.25	0.26	0.18	0.18	0.19	0.17
O5'	0.26	0.47	0.25	0.23	0.33	0.20	0.33	0.21	0.42	0.24	0.49	0.40	0.45	0.26	0.27	0.26	0.24	0.23	0.21	0.29	0.29	0.25
O6	0.18	0.30	0.19	0.19	0.23	0.18	0.28	0.21	0.35	0.19	0.36	0.24	0.42	0.24	0.19	0.18	0.23	0.20	0.21	0.28	0.23	0.24
OP1	0.31	0.55	0.30	0.26	0.39	0.24	0.38	0.23	0.47	0.28	0.57	0.48	0.48	0.30	0.32	0.31	0.26	0.27	0.23	0.30	0.29	0.26
OP2	0.28	0.45	0.28	0.29	0.33	0.28	0.35	0.32	0.43	0.30	0.49	0.38	0.47	0.31	0.29	0.28	0.30	0.28	0.33	0.46	0.43	0.40
P	0.25	0.49	0.24	0.21	0.34	0.19	0.33	0.21	0.43	0.23	0.52	0.41	0.46	0.26	0.26	0.25	0.22	0.22	0.22	0.33	0.31	0.27

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.06	0.07	0.10	0.07
C2	0.02	0.00	0.15	0.16	0.00	0.05	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.14	0.20	0.08	0.09	0.11	0.18	0.12
C2'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.08	0.01	0.06	0.02	0.09	0.06	0.12	0.14	0.08	0.05	0.03	0.00	0.02	0.01	0.08	0.10	0.12	0.08
C3'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.11	0.00	0.12	0.02	0.14	0.10	0.16	0.14	0.14	0.11	0.07	0.02	0.01	0.01	0.12	0.14	0.12	0.11
C4	0.01	0.00	0.08	0.11	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.07	0.12	0.04	0.09	0.10	0.16	0.11
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.07	0.09	0.06	0.04	0.09	0.10	0.05	0.04	0.02	0.00	0.02	0.06	0.07	0.02
C5	0.01	0.01	0.06	0.12	0.00	0.07	0.00	0.14	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.14	0.03	0.12	0.15	0.20	0.15
C5'	0.03	0.10	0.02	0.02	0.11	0.01	0.14	0.00	0.15	0.15	0.13	0.09	0.17	0.17	0.09	0.04	0.03	0.02	0.01	0.07	0.09	0.01
C6	0.02	0.00	0.09	0.14	0.01	0.07	0.00	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.17	0.04	0.12	0.16	0.22	0.17
C8	0.01	0.01	0.06	0.10	0.00	0.09	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.12	0.05	0.12	0.13	0.16	0.14
N1	0.02	0.00	0.12	0.16	0.01	0.06	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.20	0.06	0.11	0.14	0.20	0.15
N3	0.03	0.00	0.14	0.14	0.00	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.17	0.07	0.08	0.09	0.15	0.10
N6	0.02	0.01	0.08	0.14	0.01	0.09	0.01	0.17	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.18	0.04	0.14	0.19	0.24	0.20
N7	0.01	0.01	0.05	0.11	0.00	0.10	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.13	0.03	0.14	0.17	0.21	0.18
N9	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.07	0.01	0.08	0.09	0.14	0.10
O2'	0.02	0.14	0.00	0.02	0.07	0.04	0.05	0.04	0.08	0.05	0.12	0.13	0.07	0.04	0.02	0.00	0.05	0.04	0.06	0.09	0.10	0.06
O3'	0.02	0.20	0.02	0.01	0.12	0.02	0.14	0.03	0.17	0.12	0.20	0.17	0.18	0.13	0.07	0.05	0.00	0.02	0.14	0.19	0.16	0.15
O4'	0.00	0.08	0.01	0.01	0.04	0.00	0.03	0.02	0.04	0.05	0.06	0.07	0.04	0.03	0.01	0.04	0.02	0.00	0.08	0.09	0.11	0.10
O5'	0.06	0.09	0.08	0.12	0.09	0.02	0.12	0.01	0.12	0.12	0.11	0.08	0.14	0.14	0.08	0.06	0.14	0.08	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.07	0.11	0.10	0.14	0.10	0.06	0.15	0.07	0.16	0.13	0.14	0.09	0.19	0.17	0.09	0.09	0.19	0.09	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.10	0.18	0.12	0.12	0.16	0.07	0.20	0.09	0.22	0.16	0.20	0.15	0.24	0.21	0.14	0.10	0.16	0.11	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.12	0.08	0.11	0.11	0.02	0.15	0.01	0.17	0.14	0.15	0.10	0.20	0.18	0.10	0.06	0.15	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00