Doublet Group distance statistics: 53564

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 7, 10, 8, 9, 3, 6, 2, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.003, 0.014, 0.024, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.014 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.000, 0.013, 0.026, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.013 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.006, 0.021, 0.036, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.021 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.006, 0.021, 0.035, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.021 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.001, 0.018, 0.035, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.018 std_dev=0.017
N2	A	0, 0.016, 0.035, 0.054, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.035 std_dev=0.019
C5	A	0, 0.000, 0.020, 0.040, 0.111 max_d=0.111 avg_d=0.020 std_dev=0.020
C4	A	0, -0.001, 0.023, 0.048, 0.128 max_d=0.128 avg_d=0.023 std_dev=0.024
N9	A	0, 0.001, 0.028, 0.056, 0.150 max_d=0.150 avg_d=0.028 std_dev=0.028
O6	A	0, 0.002, 0.043, 0.085, 0.186 max_d=0.186 avg_d=0.043 std_dev=0.041
N7	A	0, 0.000, 0.042, 0.085, 0.238 max_d=0.238 avg_d=0.042 std_dev=0.042
C8	A	0, -0.002, 0.049, 0.100, 0.286 max_d=0.286 avg_d=0.049 std_dev=0.051
O4'	A	0, 0.025, 0.184, 0.343, 0.858 max_d=0.858 avg_d=0.184 std_dev=0.159
C2'	A	0, 0.071, 0.245, 0.419, 0.799 max_d=0.799 avg_d=0.245 std_dev=0.174
O2'	A	0, 0.123, 0.329, 0.534, 0.837 max_d=0.837 avg_d=0.329 std_dev=0.205
O5'	B	0, 0.217, 0.427, 0.638, 0.891 max_d=0.891 avg_d=0.427 std_dev=0.211
P	B	0, 0.122, 0.340, 0.557, 1.021 max_d=1.021 avg_d=0.340 std_dev=0.218
OP2	B	0, 0.095, 0.315, 0.534, 1.094 max_d=1.094 avg_d=0.315 std_dev=0.219
C5'	B	0, 0.292, 0.544, 0.796, 1.063 max_d=1.063 avg_d=0.544 std_dev=0.252
C4'	A	0, 0.042, 0.295, 0.549, 1.372 max_d=1.372 avg_d=0.295 std_dev=0.253
C3'	A	0, 0.091, 0.363, 0.636, 1.375 max_d=1.375 avg_d=0.363 std_dev=0.273
N7	B	0, 0.275, 0.566, 0.857, 1.411 max_d=1.411 avg_d=0.566 std_dev=0.291
OP1	B	0, 0.243, 0.536, 0.828, 1.483 max_d=1.483 avg_d=0.536 std_dev=0.292
C4'	B	0, 0.346, 0.665, 0.984, 1.326 max_d=1.326 avg_d=0.665 std_dev=0.319
O4'	B	0, 0.364, 0.693, 1.022, 1.295 max_d=1.295 avg_d=0.693 std_dev=0.329
C8	B	0, 0.295, 0.633, 0.971, 1.266 max_d=1.266 avg_d=0.633 std_dev=0.338
N9	B	0, 0.300, 0.641, 0.983, 1.225 max_d=1.225 avg_d=0.641 std_dev=0.342
C5	B	0, 0.209, 0.555, 0.900, 1.876 max_d=1.876 avg_d=0.555 std_dev=0.346
C4	B	0, 0.254, 0.623, 0.991, 1.723 max_d=1.723 avg_d=0.623 std_dev=0.369
C3'	B	0, 0.333, 0.704, 1.075, 1.399 max_d=1.399 avg_d=0.704 std_dev=0.371
O3'	A	0, 0.152, 0.538, 0.924, 2.054 max_d=2.054 avg_d=0.538 std_dev=0.386
C1'	B	0, 0.357, 0.750, 1.142, 1.414 max_d=1.414 avg_d=0.750 std_dev=0.393
C5'	A	0, 0.115, 0.529, 0.943, 2.093 max_d=2.093 avg_d=0.529 std_dev=0.414
O3'	B	0, 0.379, 0.810, 1.240, 1.559 max_d=1.559 avg_d=0.810 std_dev=0.430
C2'	B	0, 0.360, 0.804, 1.249, 1.545 max_d=1.545 avg_d=0.804 std_dev=0.445
C6	B	0, 0.165, 0.621, 1.077, 2.500 max_d=2.500 avg_d=0.621 std_dev=0.456
N6	B	0, 0.176, 0.644, 1.113, 2.812 max_d=2.812 avg_d=0.644 std_dev=0.469
O5'	A	0, 0.147, 0.620, 1.094, 2.245 max_d=2.245 avg_d=0.620 std_dev=0.473
N3	B	0, 0.250, 0.743, 1.236, 2.066 max_d=2.066 avg_d=0.743 std_dev=0.493
O2'	B	0, 0.421, 0.970, 1.520, 1.895 max_d=1.895 avg_d=0.970 std_dev=0.549
N1	B	0, 0.213, 0.783, 1.354, 2.842 max_d=2.842 avg_d=0.783 std_dev=0.570
P	A	0, 0.167, 0.739, 1.312, 2.509 max_d=2.509 avg_d=0.739 std_dev=0.573
C2	B	0, 0.228, 0.817, 1.407, 2.605 max_d=2.605 avg_d=0.817 std_dev=0.589
OP1	A	0, 0.180, 0.803, 1.426, 2.606 max_d=2.606 avg_d=0.803 std_dev=0.623
OP2	A	0, 0.222, 0.860, 1.498, 2.637 max_d=2.637 avg_d=0.860 std_dev=0.638

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.09	0.04	0.10	0.15	0.10
C2	0.03	0.00	0.13	0.15	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.13	0.19	0.05	0.20	0.02	0.21	0.29	0.22
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.08	0.02	0.07	0.02	0.09	0.07	0.12	0.16	0.13	0.06	0.03	0.00	0.01	0.01	0.09	0.10	0.17	0.13	0.10
C3'	0.02	0.15	0.00	0.00	0.10	0.00	0.11	0.02	0.13	0.08	0.15	0.17	0.14	0.09	0.06	0.02	0.01	0.01	0.13	0.14	0.22	0.13	0.13
C4	0.02	0.01	0.08	0.10	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.11	0.03	0.20	0.02	0.20	0.27	0.22
C4'	0.01	0.05	0.02	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.06	0.05	0.06	0.06	0.05	0.05	0.03	0.05	0.02	0.00	0.02	0.07	0.11	0.10	0.03
C5	0.02	0.01	0.07	0.11	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.13	0.03	0.24	0.02	0.25	0.33	0.27
C5'	0.02	0.08	0.02	0.02	0.08	0.01	0.10	0.00	0.11	0.10	0.10	0.08	0.07	0.11	0.07	0.05	0.03	0.02	0.01	0.12	0.11	0.13	0.02
C6	0.03	0.01	0.09	0.13	0.01	0.06	0.01	0.11	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.09	0.17	0.04	0.25	0.01	0.28	0.36	0.29
C8	0.01	0.01	0.07	0.08	0.01	0.05	0.01	0.10	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.05	0.10	0.03	0.22	0.04	0.22	0.27	0.24
N1	0.03	0.00	0.12	0.15	0.01	0.06	0.01	0.10	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.11	0.18	0.05	0.23	0.01	0.25	0.34	0.26
N2	0.04	0.00	0.16	0.17	0.01	0.06	0.01	0.08	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.16	0.22	0.06	0.19	0.02	0.20	0.29	0.21
N3	0.03	0.00	0.13	0.14	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.16	0.05	0.18	0.02	0.18	0.26	0.19
N7	0.01	0.01	0.06	0.09	0.01	0.05	0.00	0.11	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.12	0.02	0.25	0.04	0.28	0.34	0.29
N9	0.01	0.02	0.03	0.06	0.01	0.03	0.01	0.07	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.06	0.01	0.17	0.03	0.17	0.22	0.18
O2'	0.02	0.13	0.00	0.02	0.07	0.05	0.06	0.05	0.09	0.05	0.11	0.16	0.12	0.05	0.03	0.00	0.04	0.05	0.04	0.10	0.16	0.12	0.06
O3'	0.01	0.19	0.01	0.01	0.11	0.02	0.13	0.03	0.17	0.10	0.18	0.22	0.16	0.12	0.06	0.04	0.00	0.02	0.13	0.19	0.29	0.17	0.17
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.02	0.04	0.03	0.05	0.06	0.05	0.02	0.01	0.05	0.02	0.00	0.08	0.05	0.10	0.15	0.10
O5'	0.09	0.20	0.09	0.13	0.20	0.02	0.24	0.01	0.25	0.22	0.23	0.19	0.18	0.25	0.17	0.04	0.13	0.08	0.00	0.27	0.02	0.02	0.01
O6	0.04	0.02	0.10	0.14	0.02	0.07	0.02	0.12	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.04	0.03	0.10	0.19	0.05	0.27	0.00	0.31	0.38	0.32
OP1	0.10	0.21	0.17	0.22	0.20	0.11	0.25	0.11	0.28	0.22	0.25	0.20	0.18	0.28	0.17	0.16	0.29	0.10	0.02	0.31	0.00	0.01	0.01
OP2	0.15	0.29	0.13	0.13	0.27	0.10	0.33	0.13	0.36	0.27	0.34	0.29	0.26	0.34	0.22	0.12	0.17	0.15	0.02	0.38	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.22	0.10	0.13	0.22	0.03	0.27	0.02	0.29	0.24	0.26	0.21	0.19	0.29	0.18	0.06	0.17	0.10	0.01	0.32	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.25	0.31	0.22	0.20	0.26	0.21	0.24	0.17	0.27	0.24	0.31	0.29	0.26	0.23	0.25	0.24	0.20	0.25	0.15	0.16	0.19	0.14
C2	0.15	0.21	0.15	0.15	0.18	0.14	0.20	0.14	0.24	0.18	0.24	0.19	0.28	0.20	0.16	0.15	0.17	0.17	0.14	0.21	0.21	0.17
C2'	0.30	0.28	0.27	0.26	0.26	0.28	0.23	0.25	0.21	0.30	0.27	0.28	0.22	0.27	0.28	0.28	0.25	0.31	0.23	0.24	0.27	0.23
C3'	0.32	0.29	0.27	0.26	0.26	0.29	0.23	0.27	0.21	0.30	0.27	0.28	0.21	0.27	0.29	0.30	0.25	0.33	0.25	0.28	0.30	0.26
C4	0.18	0.26	0.16	0.15	0.21	0.15	0.22	0.13	0.26	0.19	0.28	0.23	0.30	0.20	0.18	0.17	0.17	0.19	0.14	0.20	0.20	0.16
C4'	0.29	0.33	0.26	0.22	0.27	0.24	0.25	0.20	0.25	0.27	0.31	0.31	0.23	0.25	0.27	0.29	0.22	0.29	0.17	0.18	0.21	0.16
C5	0.16	0.26	0.16	0.15	0.20	0.14	0.22	0.13	0.27	0.18	0.29	0.22	0.31	0.19	0.17	0.16	0.19	0.17	0.14	0.24	0.21	0.18
C5'	0.29	0.35	0.26	0.22	0.28	0.23	0.25	0.19	0.27	0.26	0.33	0.32	0.26	0.24	0.27	0.29	0.22	0.28	0.17	0.20	0.22	0.17
C6	0.15	0.24	0.17	0.17	0.19	0.14	0.22	0.15	0.27	0.18	0.27	0.21	0.31	0.20	0.17	0.17	0.22	0.16	0.15	0.27	0.22	0.19
C8	0.19	0.30	0.17	0.16	0.23	0.15	0.23	0.13	0.28	0.19	0.32	0.26	0.31	0.20	0.20	0.18	0.18	0.19	0.13	0.21	0.20	0.16
N1	0.15	0.22	0.17	0.17	0.19	0.15	0.21	0.15	0.25	0.18	0.25	0.19	0.29	0.21	0.17	0.16	0.21	0.16	0.16	0.25	0.22	0.19
N2	0.15	0.20	0.14	0.14	0.18	0.15	0.20	0.15	0.23	0.18	0.22	0.18	0.26	0.21	0.16	0.14	0.16	0.17	0.15	0.19	0.20	0.17
N3	0.18	0.24	0.16	0.15	0.20	0.16	0.21	0.14	0.25	0.19	0.26	0.21	0.28	0.19	0.18	0.16	0.16	0.19	0.14	0.18	0.20	0.16
N7	0.17	0.28	0.16	0.16	0.21	0.14	0.23	0.13	0.28	0.18	0.31	0.24	0.32	0.20	0.18	0.17	0.19	0.17	0.14	0.24	0.21	0.17
N9	0.21	0.29	0.18	0.17	0.23	0.17	0.23	0.14	0.27	0.20	0.30	0.26	0.29	0.21	0.21	0.19	0.18	0.21	0.14	0.19	0.20	0.15
O2'	0.35	0.30	0.32	0.30	0.28	0.32	0.24	0.28	0.21	0.34	0.27	0.30	0.23	0.30	0.32	0.34	0.29	0.35	0.26	0.23	0.25	0.23
O3'	0.37	0.31	0.33	0.31	0.29	0.36	0.24	0.34	0.21	0.35	0.28	0.31	0.22	0.30	0.34	0.36	0.30	0.40	0.30	0.34	0.35	0.32
O4'	0.27	0.36	0.26	0.22	0.29	0.22	0.27	0.17	0.30	0.25	0.35	0.33	0.29	0.24	0.27	0.28	0.22	0.26	0.15	0.15	0.18	0.13
O5'	0.29	0.34	0.25	0.23	0.28	0.25	0.26	0.24	0.28	0.27	0.33	0.31	0.27	0.26	0.27	0.27	0.23	0.30	0.24	0.30	0.30	0.26
O6	0.16	0.25	0.19	0.20	0.20	0.16	0.23	0.18	0.27	0.19	0.28	0.21	0.32	0.22	0.18	0.19	0.25	0.16	0.17	0.30	0.22	0.21
OP1	0.27	0.36	0.25	0.22	0.27	0.23	0.25	0.24	0.28	0.26	0.35	0.32	0.26	0.24	0.26	0.27	0.22	0.27	0.23	0.34	0.33	0.29
OP2	0.31	0.35	0.29	0.29	0.31	0.31	0.30	0.33	0.32	0.32	0.36	0.33	0.32	0.31	0.31	0.30	0.29	0.33	0.32	0.41	0.39	0.36
P	0.29	0.36	0.26	0.24	0.29	0.26	0.28	0.26	0.30	0.29	0.36	0.33	0.30	0.27	0.29	0.28	0.24	0.30	0.25	0.32	0.32	0.28

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.06	0.06	0.09	0.07
C2	0.02	0.00	0.16	0.14	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.19	0.09	0.11	0.14	0.19	0.17
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.09	0.01	0.05	0.02	0.08	0.09	0.13	0.16	0.07	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.06	0.10	0.10	0.07
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.08	0.00	0.07	0.02	0.09	0.11	0.12	0.13	0.08	0.09	0.04	0.02	0.01	0.01	0.07	0.12	0.10	0.08
C4	0.01	0.01	0.09	0.08	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.08	0.10	0.05	0.10	0.12	0.17	0.14
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.04	0.03	0.03	0.04	0.04	0.02	0.05	0.02	0.00	0.02	0.06	0.03	0.02
C5	0.01	0.01	0.05	0.07	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.09	0.03	0.11	0.15	0.20	0.16
C5'	0.02	0.07	0.02	0.02	0.06	0.01	0.07	0.00	0.08	0.07	0.08	0.06	0.09	0.08	0.05	0.05	0.04	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.08	0.09	0.01	0.03	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.12	0.06	0.12	0.17	0.22	0.18
C8	0.01	0.01	0.09	0.11	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.07	0.13	0.06	0.10	0.13	0.17	0.13
N1	0.02	0.00	0.13	0.12	0.01	0.03	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.17	0.08	0.11	0.16	0.21	0.18
N3	0.02	0.00	0.16	0.13	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.17	0.09	0.10	0.12	0.17	0.14
N6	0.02	0.01	0.07	0.08	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.07	0.12	0.05	0.12	0.19	0.24	0.20
N7	0.01	0.01	0.06	0.09	0.01	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.12	0.04	0.11	0.16	0.21	0.16
N9	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.08	0.10	0.14	0.11
O2'	0.01	0.16	0.00	0.02	0.08	0.05	0.05	0.05	0.08	0.07	0.13	0.16	0.07	0.05	0.02	0.00	0.05	0.05	0.06	0.10	0.09	0.06
O3'	0.02	0.19	0.02	0.01	0.10	0.02	0.09	0.04	0.12	0.13	0.17	0.17	0.12	0.12	0.05	0.05	0.00	0.02	0.11	0.18	0.15	0.12
O4'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.05	0.00	0.03	0.01	0.06	0.06	0.08	0.09	0.05	0.04	0.01	0.05	0.02	0.00	0.05	0.06	0.08	0.08
O5'	0.06	0.11	0.06	0.07	0.10	0.02	0.11	0.01	0.12	0.10	0.11	0.10	0.12	0.11	0.08	0.06	0.11	0.05	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.06	0.14	0.10	0.12	0.12	0.06	0.15	0.05	0.17	0.13	0.16	0.12	0.19	0.16	0.10	0.10	0.18	0.06	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.09	0.19	0.10	0.10	0.17	0.03	0.20	0.02	0.22	0.17	0.21	0.17	0.24	0.21	0.14	0.09	0.15	0.08	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.17	0.07	0.08	0.14	0.02	0.16	0.01	0.18	0.13	0.18	0.14	0.20	0.16	0.11	0.06	0.12	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00