Doublet Group distance statistics: 53566

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 0, 8, 15, 15, 3, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.008, 0.015, 0.023, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.015 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.025, 0.037, 0.049, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.037 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.034, 0.051, 0.068, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.051 std_dev=0.017
N1	A	0, 0.040, 0.058, 0.075, 0.108 max_d=0.108 avg_d=0.058 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.032, 0.051, 0.070, 0.118 max_d=0.118 avg_d=0.051 std_dev=0.019
N3	A	0, 0.041, 0.062, 0.083, 0.118 max_d=0.118 avg_d=0.062 std_dev=0.021
C2	A	0, 0.046, 0.067, 0.088, 0.126 max_d=0.126 avg_d=0.067 std_dev=0.021
N7	A	0, 0.045, 0.066, 0.087, 0.112 max_d=0.112 avg_d=0.066 std_dev=0.021
C1'	A	0, 0.049, 0.073, 0.097, 0.136 max_d=0.136 avg_d=0.073 std_dev=0.024
O6	A	0, 0.039, 0.065, 0.090, 0.146 max_d=0.146 avg_d=0.065 std_dev=0.026
C8	A	0, 0.051, 0.078, 0.104, 0.132 max_d=0.132 avg_d=0.078 std_dev=0.026
N2	A	0, 0.083, 0.124, 0.164, 0.221 max_d=0.221 avg_d=0.124 std_dev=0.041
P	B	0, 0.419, 0.624, 0.830, 1.237 max_d=1.237 avg_d=0.624 std_dev=0.206
O4'	A	0, 0.318, 0.544, 0.769, 0.847 max_d=0.847 avg_d=0.544 std_dev=0.226
OP2	B	0, 0.406, 0.637, 0.868, 1.105 max_d=1.105 avg_d=0.637 std_dev=0.231
C2'	A	0, 0.505, 0.743, 0.982, 1.088 max_d=1.088 avg_d=0.743 std_dev=0.239
O5'	B	0, 0.552, 0.824, 1.096, 1.604 max_d=1.604 avg_d=0.824 std_dev=0.272
OP1	B	0, 0.439, 0.717, 0.995, 1.162 max_d=1.162 avg_d=0.717 std_dev=0.278
O2'	A	0, 0.706, 1.007, 1.307, 1.650 max_d=1.650 avg_d=1.007 std_dev=0.301
C4'	A	0, 0.636, 0.950, 1.265, 1.453 max_d=1.453 avg_d=0.950 std_dev=0.314
C3'	A	0, 0.798, 1.137, 1.476, 1.596 max_d=1.596 avg_d=1.137 std_dev=0.339
C5'	B	0, 0.515, 0.932, 1.349, 2.071 max_d=2.071 avg_d=0.932 std_dev=0.417
C4'	B	0, 0.622, 1.080, 1.538, 2.769 max_d=2.769 avg_d=1.080 std_dev=0.458
C8	B	0, 0.592, 1.062, 1.532, 2.975 max_d=2.975 avg_d=1.062 std_dev=0.470
O3'	A	0, 1.252, 1.751, 2.249, 2.497 max_d=2.497 avg_d=1.751 std_dev=0.498
C3'	B	0, 0.584, 1.089, 1.595, 2.920 max_d=2.920 avg_d=1.089 std_dev=0.505
N7	B	0, 0.673, 1.188, 1.703, 3.168 max_d=3.168 avg_d=1.188 std_dev=0.515
O4'	B	0, 0.769, 1.284, 1.800, 3.420 max_d=3.420 avg_d=1.284 std_dev=0.516
C5'	A	0, 1.056, 1.575, 2.095, 2.363 max_d=2.363 avg_d=1.575 std_dev=0.520
C2'	B	0, 0.756, 1.374, 1.993, 3.818 max_d=3.818 avg_d=1.374 std_dev=0.618
O3'	B	0, 0.484, 1.103, 1.721, 2.757 max_d=2.757 avg_d=1.103 std_dev=0.619
C1'	B	0, 0.774, 1.407, 2.041, 3.926 max_d=3.926 avg_d=1.407 std_dev=0.634
N9	B	0, 0.715, 1.367, 2.019, 3.864 max_d=3.864 avg_d=1.367 std_dev=0.652
O5'	A	0, 0.838, 1.502, 2.166, 3.242 max_d=3.242 avg_d=1.502 std_dev=0.664
O2'	B	0, 0.883, 1.605, 2.326, 4.265 max_d=4.265 avg_d=1.605 std_dev=0.722
C5	B	0, 0.945, 1.695, 2.444, 4.286 max_d=4.286 avg_d=1.695 std_dev=0.750
P	A	0, 1.431, 2.211, 2.991, 3.493 max_d=3.493 avg_d=2.211 std_dev=0.780
OP2	A	0, 1.661, 2.457, 3.254, 3.688 max_d=3.688 avg_d=2.457 std_dev=0.797
N6	B	0, 1.319, 2.124, 2.930, 4.686 max_d=4.686 avg_d=2.124 std_dev=0.806
C4	B	0, 0.950, 1.828, 2.705, 4.734 max_d=4.734 avg_d=1.828 std_dev=0.878
C6	B	0, 1.255, 2.155, 3.055, 5.005 max_d=5.005 avg_d=2.155 std_dev=0.900
OP1	A	0, 2.077, 3.105, 4.133, 5.324 max_d=5.324 avg_d=3.105 std_dev=1.028
N3	B	0, 1.236, 2.371, 3.506, 5.798 max_d=5.798 avg_d=2.371 std_dev=1.135
N1	B	0, 1.554, 2.704, 3.853, 6.067 max_d=6.067 avg_d=2.704 std_dev=1.150
C2	B	0, 1.519, 2.773, 4.028, 6.383 max_d=6.383 avg_d=2.773 std_dev=1.254

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.05	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.13	0.02	0.10	0.12	0.11
C2	0.04	0.00	0.20	0.21	0.01	0.07	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.21	0.25	0.06	0.25	0.02	0.21	0.32	0.23
C2'	0.01	0.20	0.00	0.00	0.11	0.01	0.08	0.02	0.12	0.06	0.17	0.23	0.18	0.04	0.03	0.00	0.02	0.01	0.17	0.11	0.21	0.10	0.09
C3'	0.01	0.21	0.00	0.00	0.15	0.01	0.17	0.02	0.19	0.14	0.21	0.24	0.18	0.16	0.10	0.03	0.01	0.02	0.23	0.20	0.34	0.11	0.16
C4	0.02	0.01	0.11	0.15	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.16	0.03	0.31	0.01	0.21	0.30	0.22
C4'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.05	0.00	0.09	0.01	0.08	0.13	0.07	0.09	0.06	0.13	0.06	0.05	0.03	0.01	0.02	0.11	0.14	0.17	0.05
C5	0.01	0.01	0.08	0.17	0.00	0.09	0.00	0.17	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.19	0.04	0.44	0.01	0.31	0.45	0.33
C5'	0.03	0.09	0.02	0.02	0.11	0.01	0.17	0.00	0.17	0.20	0.13	0.09	0.07	0.22	0.11	0.06	0.04	0.02	0.01	0.21	0.22	0.23	0.02
C6	0.02	0.01	0.12	0.19	0.01	0.08	0.01	0.17	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.12	0.24	0.04	0.44	0.01	0.32	0.51	0.35
C8	0.02	0.01	0.06	0.14	0.01	0.13	0.01	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.15	0.04	0.51	0.02	0.37	0.38	0.36
N1	0.03	0.01	0.17	0.21	0.01	0.07	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.18	0.26	0.05	0.35	0.01	0.26	0.43	0.29
N2	0.05	0.00	0.23	0.24	0.01	0.09	0.01	0.09	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.26	0.30	0.06	0.21	0.02	0.23	0.30	0.23
N3	0.04	0.01	0.18	0.18	0.01	0.06	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.19	0.21	0.05	0.22	0.02	0.18	0.25	0.19
N7	0.01	0.01	0.04	0.16	0.01	0.13	0.00	0.22	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.19	0.04	0.55	0.02	0.42	0.52	0.43
N9	0.01	0.02	0.03	0.10	0.01	0.06	0.01	0.11	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.09	0.01	0.32	0.02	0.20	0.23	0.19
O2'	0.01	0.21	0.00	0.03	0.10	0.05	0.08	0.06	0.12	0.05	0.18	0.26	0.19	0.04	0.03	0.00	0.07	0.06	0.07	0.11	0.16	0.10	0.06
O3'	0.02	0.25	0.02	0.01	0.16	0.03	0.19	0.04	0.24	0.15	0.26	0.30	0.21	0.19	0.09	0.07	0.00	0.03	0.20	0.26	0.44	0.17	0.22
O4'	0.01	0.06	0.01	0.02	0.03	0.01	0.04	0.02	0.04	0.04	0.05	0.06	0.05	0.04	0.01	0.06	0.03	0.00	0.10	0.05	0.13	0.22	0.18
O5'	0.13	0.25	0.17	0.23	0.31	0.02	0.44	0.01	0.44	0.51	0.35	0.21	0.22	0.55	0.32	0.07	0.20	0.10	0.00	0.50	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.11	0.20	0.01	0.11	0.01	0.21	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.11	0.26	0.05	0.50	0.00	0.40	0.60	0.43
OP1	0.10	0.21	0.21	0.34	0.21	0.14	0.31	0.22	0.32	0.37	0.26	0.23	0.18	0.42	0.20	0.16	0.44	0.13	0.02	0.40	0.00	0.01	0.01
OP2	0.12	0.32	0.10	0.11	0.30	0.17	0.45	0.23	0.51	0.38	0.43	0.30	0.25	0.52	0.23	0.10	0.17	0.22	0.02	0.60	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.23	0.09	0.16	0.22	0.05	0.33	0.02	0.35	0.36	0.29	0.23	0.19	0.43	0.19	0.06	0.22	0.18	0.01	0.43	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.28	0.42	0.25	0.23	0.31	0.24	0.29	0.26	0.37	0.27	0.44	0.37	0.38	0.26	0.28	0.27	0.24	0.31	0.42	0.27	0.27	0.31
C2	0.21	0.31	0.19	0.22	0.24	0.20	0.26	0.22	0.33	0.22	0.35	0.27	0.38	0.23	0.21	0.19	0.25	0.23	0.38	0.25	0.29	0.28
C2'	0.35	0.54	0.30	0.31	0.35	0.37	0.34	0.42	0.46	0.35	0.58	0.43	0.52	0.33	0.33	0.32	0.30	0.42	0.59	0.46	0.45	0.49
C3'	0.34	0.54	0.29	0.30	0.34	0.36	0.31	0.43	0.43	0.34	0.58	0.43	0.47	0.31	0.32	0.31	0.29	0.42	0.61	0.49	0.48	0.53
C4	0.24	0.37	0.21	0.21	0.27	0.21	0.28	0.22	0.35	0.24	0.40	0.31	0.40	0.25	0.24	0.22	0.24	0.25	0.39	0.25	0.29	0.28
C4'	0.30	0.47	0.29	0.28	0.32	0.28	0.29	0.31	0.36	0.26	0.48	0.40	0.36	0.25	0.28	0.32	0.32	0.34	0.44	0.32	0.30	0.35
C5	0.22	0.35	0.20	0.22	0.26	0.19	0.27	0.21	0.34	0.23	0.38	0.29	0.38	0.23	0.22	0.20	0.27	0.23	0.37	0.26	0.31	0.28
C5'	0.29	0.48	0.30	0.29	0.32	0.26	0.29	0.29	0.36	0.25	0.48	0.41	0.35	0.24	0.28	0.33	0.34	0.32	0.42	0.31	0.30	0.34
C6	0.20	0.32	0.19	0.24	0.23	0.19	0.25	0.22	0.32	0.21	0.36	0.27	0.37	0.22	0.20	0.19	0.30	0.21	0.36	0.27	0.33	0.28
C8	0.25	0.40	0.22	0.22	0.29	0.20	0.28	0.22	0.36	0.25	0.42	0.34	0.39	0.25	0.25	0.23	0.25	0.26	0.39	0.25	0.29	0.28
N1	0.19	0.30	0.19	0.24	0.23	0.20	0.25	0.22	0.32	0.21	0.34	0.25	0.37	0.22	0.20	0.19	0.29	0.21	0.36	0.26	0.33	0.28
N2	0.21	0.29	0.19	0.22	0.24	0.21	0.27	0.22	0.32	0.22	0.32	0.25	0.36	0.24	0.21	0.19	0.24	0.23	0.39	0.23	0.26	0.27
N3	0.24	0.35	0.21	0.21	0.27	0.21	0.28	0.23	0.36	0.25	0.38	0.30	0.41	0.25	0.24	0.22	0.23	0.26	0.40	0.25	0.27	0.28
N7	0.22	0.37	0.20	0.22	0.27	0.19	0.27	0.21	0.35	0.23	0.40	0.31	0.38	0.24	0.23	0.20	0.27	0.24	0.37	0.26	0.31	0.28
N9	0.26	0.40	0.23	0.22	0.29	0.22	0.29	0.23	0.36	0.25	0.42	0.34	0.39	0.26	0.26	0.24	0.24	0.28	0.40	0.25	0.28	0.29
O2'	0.36	0.58	0.33	0.32	0.38	0.38	0.36	0.45	0.50	0.36	0.64	0.46	0.60	0.34	0.35	0.34	0.32	0.44	0.57	0.46	0.42	0.48
O3'	0.37	0.67	0.34	0.34	0.39	0.43	0.36	0.52	0.52	0.37	0.71	0.51	0.57	0.33	0.35	0.37	0.34	0.48	0.67	0.59	0.55	0.61
O4'	0.29	0.43	0.27	0.25	0.32	0.24	0.29	0.24	0.36	0.25	0.43	0.38	0.35	0.25	0.28	0.29	0.29	0.30	0.36	0.22	0.21	0.25
O5'	0.30	0.49	0.39	0.37	0.33	0.29	0.29	0.31	0.36	0.27	0.48	0.41	0.35	0.26	0.29	0.42	0.46	0.31	0.46	0.41	0.40	0.43
O6	0.19	0.32	0.20	0.26	0.23	0.20	0.25	0.22	0.32	0.20	0.35	0.26	0.37	0.22	0.20	0.19	0.34	0.20	0.34	0.29	0.34	0.28
OP1	0.44	0.55	0.64	0.66	0.42	0.48	0.37	0.48	0.41	0.39	0.53	0.50	0.37	0.34	0.41	0.66	0.81	0.38	0.36	0.40	0.38	0.38
OP2	0.32	0.48	0.38	0.37	0.33	0.32	0.30	0.36	0.37	0.31	0.48	0.40	0.36	0.29	0.30	0.40	0.45	0.35	0.51	0.52	0.50	0.51
P	0.37	0.51	0.51	0.52	0.38	0.38	0.34	0.39	0.39	0.33	0.50	0.45	0.36	0.30	0.35	0.53	0.63	0.33	0.35	0.38	0.36	0.37

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.06	0.07	0.26	0.13
C2	0.03	0.00	0.17	0.14	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.19	0.20	0.08	0.12	0.15	0.28	0.21
C2'	0.00	0.17	0.00	0.00	0.09	0.01	0.05	0.01	0.08	0.09	0.13	0.16	0.07	0.07	0.02	0.00	0.03	0.01	0.13	0.16	0.21	0.07
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.08	0.00	0.07	0.01	0.09	0.13	0.12	0.14	0.09	0.10	0.05	0.02	0.01	0.01	0.20	0.25	0.17	0.10
C4	0.02	0.01	0.09	0.08	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.09	0.10	0.04	0.13	0.12	0.27	0.18
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.04	0.08	0.04	0.05	0.06	0.08	0.03	0.05	0.02	0.00	0.01	0.12	0.23	0.05
C5	0.01	0.01	0.05	0.07	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.09	0.03	0.19	0.16	0.27	0.19
C5'	0.02	0.08	0.01	0.01	0.08	0.00	0.11	0.00	0.12	0.14	0.10	0.07	0.14	0.15	0.08	0.05	0.03	0.01	0.01	0.15	0.24	0.01
C6	0.02	0.01	0.08	0.09	0.01	0.04	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.12	0.05	0.18	0.19	0.27	0.21
C8	0.01	0.01	0.09	0.13	0.00	0.08	0.01	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.07	0.14	0.05	0.23	0.14	0.26	0.16
N1	0.03	0.01	0.13	0.12	0.01	0.04	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.15	0.17	0.07	0.15	0.18	0.28	0.22
N3	0.03	0.00	0.16	0.14	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.18	0.18	0.08	0.10	0.12	0.28	0.19
N6	0.02	0.01	0.07	0.09	0.01	0.06	0.01	0.14	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.08	0.12	0.04	0.21	0.22	0.27	0.23
N7	0.01	0.01	0.07	0.10	0.01	0.08	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.13	0.03	0.24	0.18	0.26	0.19
N9	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.03	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.14	0.09	0.26	0.15
O2'	0.01	0.19	0.00	0.02	0.09	0.05	0.06	0.05	0.10	0.07	0.15	0.18	0.08	0.05	0.02	0.00	0.05	0.04	0.06	0.16	0.21	0.05
O3'	0.03	0.20	0.03	0.01	0.10	0.02	0.09	0.03	0.12	0.14	0.17	0.18	0.12	0.13	0.05	0.05	0.00	0.02	0.20	0.35	0.16	0.15
O4'	0.00	0.08	0.01	0.01	0.04	0.00	0.03	0.01	0.05	0.05	0.07	0.08	0.04	0.03	0.01	0.04	0.02	0.00	0.10	0.11	0.28	0.17
O5'	0.06	0.12	0.13	0.20	0.13	0.01	0.19	0.01	0.18	0.23	0.15	0.10	0.21	0.24	0.14	0.06	0.20	0.10	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.07	0.15	0.16	0.25	0.12	0.12	0.16	0.15	0.19	0.14	0.18	0.12	0.22	0.18	0.09	0.16	0.35	0.11	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.26	0.28	0.21	0.17	0.27	0.23	0.27	0.24	0.27	0.26	0.28	0.28	0.27	0.26	0.26	0.21	0.16	0.28	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.13	0.21	0.07	0.10	0.18	0.05	0.19	0.01	0.21	0.16	0.22	0.19	0.23	0.19	0.15	0.05	0.15	0.17	0.01	0.01	0.01	0.00