Doublet Group distance statistics: 53569

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 2, 1, 8, 4, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.013, 0.019, 0.025, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.019 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.026, 0.040, 0.054, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.040 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.026, 0.042, 0.057, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.042 std_dev=0.015
C2	A	0, 0.030, 0.047, 0.065, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.047 std_dev=0.018
N3	A	0, 0.036, 0.056, 0.075, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.056 std_dev=0.019
C4	A	0, 0.035, 0.055, 0.075, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.055 std_dev=0.020
N9	A	0, 0.048, 0.069, 0.091, 0.108 max_d=0.108 avg_d=0.069 std_dev=0.021
C1'	A	0, 0.043, 0.067, 0.091, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.067 std_dev=0.024
N7	A	0, 0.042, 0.066, 0.089, 0.117 max_d=0.117 avg_d=0.066 std_dev=0.024
O6	A	0, 0.029, 0.053, 0.076, 0.111 max_d=0.111 avg_d=0.053 std_dev=0.024
C8	A	0, 0.052, 0.081, 0.110, 0.151 max_d=0.151 avg_d=0.081 std_dev=0.029
N2	A	0, 0.058, 0.092, 0.126, 0.126 max_d=0.126 avg_d=0.092 std_dev=0.034
P	B	0, 0.473, 0.702, 0.931, 0.954 max_d=0.954 avg_d=0.702 std_dev=0.229
O5'	B	0, 0.479, 0.716, 0.953, 1.256 max_d=1.256 avg_d=0.716 std_dev=0.237
OP2	B	0, 0.476, 0.727, 0.979, 1.407 max_d=1.407 avg_d=0.727 std_dev=0.251
OP1	B	0, 0.635, 0.888, 1.140, 1.253 max_d=1.253 avg_d=0.888 std_dev=0.253
C2'	A	0, 0.966, 1.356, 1.747, 1.578 max_d=1.578 avg_d=1.356 std_dev=0.391
O4'	A	0, 1.122, 1.569, 2.017, 1.857 max_d=1.857 avg_d=1.569 std_dev=0.448
C5'	B	0, 1.432, 1.925, 2.418, 2.423 max_d=2.423 avg_d=1.925 std_dev=0.493
C4'	B	0, 1.643, 2.183, 2.724, 2.629 max_d=2.629 avg_d=2.183 std_dev=0.540
C3'	A	0, 1.531, 2.133, 2.736, 2.472 max_d=2.472 avg_d=2.133 std_dev=0.603
O3'	B	0, 1.882, 2.509, 3.136, 2.989 max_d=2.989 avg_d=2.509 std_dev=0.627
O2'	A	0, 1.495, 2.160, 2.826, 2.704 max_d=2.704 avg_d=2.160 std_dev=0.665
C3'	B	0, 1.985, 2.658, 3.331, 3.179 max_d=3.179 avg_d=2.658 std_dev=0.673
C4'	A	0, 1.782, 2.484, 3.185, 2.839 max_d=2.839 avg_d=2.484 std_dev=0.702
O3'	A	0, 1.850, 2.579, 3.308, 3.038 max_d=3.038 avg_d=2.579 std_dev=0.729
O4'	B	0, 2.198, 2.948, 3.697, 3.464 max_d=3.464 avg_d=2.948 std_dev=0.749
C8	B	0, 2.372, 3.282, 4.192, 4.196 max_d=4.196 avg_d=3.282 std_dev=0.910
C5'	A	0, 2.634, 3.620, 4.606, 4.169 max_d=4.169 avg_d=3.620 std_dev=0.986
C1'	B	0, 2.713, 3.712, 4.710, 4.468 max_d=4.468 avg_d=3.712 std_dev=0.999
N9	B	0, 2.703, 3.709, 4.715, 4.462 max_d=4.462 avg_d=3.709 std_dev=1.006
N7	B	0, 2.546, 3.578, 4.610, 5.219 max_d=5.219 avg_d=3.578 std_dev=1.032
C2'	B	0, 2.870, 3.919, 4.968, 4.846 max_d=4.846 avg_d=3.919 std_dev=1.049
C4	B	0, 3.107, 4.287, 5.467, 5.450 max_d=5.450 avg_d=4.287 std_dev=1.180
C5	B	0, 3.020, 4.211, 5.401, 5.898 max_d=5.898 avg_d=4.211 std_dev=1.190
O2'	B	0, 3.255, 4.541, 5.827, 6.005 max_d=6.005 avg_d=4.541 std_dev=1.286
N3	B	0, 3.515, 4.866, 6.217, 6.393 max_d=6.393 avg_d=4.866 std_dev=1.351
C6	B	0, 3.400, 4.800, 6.200, 7.301 max_d=7.301 avg_d=4.800 std_dev=1.400
N6	B	0, 3.374, 4.870, 6.367, 8.203 max_d=8.203 avg_d=4.870 std_dev=1.497
O5'	A	0, 3.870, 5.382, 6.893, 6.076 max_d=6.076 avg_d=5.382 std_dev=1.511
C2	B	0, 3.833, 5.354, 6.875, 7.566 max_d=7.566 avg_d=5.354 std_dev=1.521
N1	B	0, 3.803, 5.359, 6.916, 8.036 max_d=8.036 avg_d=5.359 std_dev=1.556
P	A	0, 5.500, 7.758, 10.015, 8.798 max_d=8.798 avg_d=7.758 std_dev=2.258
OP1	A	0, 6.376, 8.942, 11.509, 10.062 max_d=10.062 avg_d=8.942 std_dev=2.566
OP2	A	0, 6.325, 8.983, 11.642, 10.309 max_d=10.309 avg_d=8.983 std_dev=2.658

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.00	0.02	0.18	0.01	0.20	0.01	0.25	0.35	0.13
C2	0.03	0.00	0.13	0.06	0.01	0.15	0.00	0.20	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.09	0.27	0.20	0.25	0.01	0.17	0.51	0.18
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.08	0.01	0.05	0.11	0.07	0.08	0.11	0.16	0.13	0.06	0.03	0.00	0.02	0.01	0.09	0.06	0.28	0.27	0.07
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.09	0.00	0.15	0.02	0.14	0.19	0.09	0.07	0.05	0.20	0.11	0.02	0.01	0.01	0.19	0.17	0.35	0.31	0.15
C4	0.02	0.01	0.08	0.09	0.00	0.06	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.08	0.15	0.11	0.36	0.01	0.25	0.57	0.26
C4'	0.01	0.15	0.01	0.00	0.06	0.00	0.05	0.01	0.06	0.15	0.10	0.21	0.15	0.12	0.04	0.16	0.02	0.00	0.02	0.06	0.25	0.13	0.11
C5	0.01	0.00	0.05	0.15	0.00	0.05	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.16	0.06	0.06	0.50	0.01	0.41	0.76	0.45
C5'	0.06	0.20	0.11	0.02	0.13	0.01	0.13	0.00	0.15	0.18	0.17	0.25	0.19	0.18	0.09	0.06	0.11	0.02	0.01	0.16	0.28	0.20	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.14	0.01	0.06	0.00	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.09	0.10	0.49	0.00	0.37	0.77	0.43
C8	0.01	0.01	0.08	0.19	0.00	0.15	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.23	0.08	0.10	0.61	0.01	0.58	0.83	0.60
N1	0.03	0.00	0.11	0.09	0.01	0.10	0.00	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.18	0.16	0.37	0.01	0.21	0.64	0.27
N2	0.04	0.00	0.16	0.07	0.01	0.21	0.01	0.25	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.14	0.34	0.24	0.19	0.01	0.27	0.46	0.23
N3	0.03	0.01	0.13	0.05	0.00	0.15	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.10	0.27	0.20	0.22	0.01	0.20	0.45	0.16
N7	0.01	0.00	0.06	0.20	0.00	0.12	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.23	0.07	0.06	0.64	0.01	0.62	0.92	0.66
N9	0.00	0.01	0.03	0.11	0.00	0.04	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.11	0.08	0.02	0.39	0.01	0.33	0.57	0.31
O2'	0.02	0.09	0.00	0.02	0.08	0.16	0.16	0.06	0.14	0.23	0.09	0.14	0.10	0.23	0.11	0.00	0.05	0.12	0.15	0.17	0.35	0.29	0.12
O3'	0.18	0.27	0.02	0.01	0.15	0.02	0.06	0.11	0.09	0.08	0.18	0.34	0.27	0.07	0.08	0.05	0.00	0.14	0.22	0.06	0.44	0.35	0.18
O4'	0.01	0.20	0.01	0.01	0.11	0.00	0.06	0.02	0.10	0.10	0.16	0.24	0.20	0.06	0.02	0.12	0.14	0.00	0.26	0.08	0.24	0.32	0.17
O5'	0.20	0.25	0.09	0.19	0.36	0.02	0.50	0.01	0.49	0.61	0.37	0.19	0.22	0.64	0.39	0.15	0.22	0.26	0.00	0.56	0.03	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.06	0.17	0.01	0.06	0.01	0.16	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.17	0.06	0.08	0.56	0.00	0.48	0.88	0.54
OP1	0.25	0.17	0.28	0.35	0.25	0.25	0.41	0.28	0.37	0.58	0.21	0.27	0.20	0.62	0.33	0.35	0.44	0.24	0.03	0.48	0.00	0.01	0.01
OP2	0.35	0.51	0.27	0.31	0.57	0.13	0.76	0.20	0.77	0.83	0.64	0.46	0.45	0.92	0.57	0.29	0.35	0.32	0.02	0.88	0.01	0.00	0.01
P	0.13	0.18	0.07	0.15	0.26	0.11	0.45	0.02	0.43	0.60	0.27	0.23	0.16	0.66	0.31	0.12	0.18	0.17	0.00	0.54	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.42	1.27	0.38	0.22	0.83	0.42	0.91	0.68	1.25	0.36	1.41	1.01	1.41	0.58	0.52	0.42	0.21	0.32	0.51	0.21	0.12	0.18
C2	0.43	1.03	0.35	0.22	0.81	0.43	0.96	0.60	1.16	0.54	1.16	0.86	1.29	0.82	0.57	0.40	0.19	0.37	0.51	0.23	0.12	0.21
C2'	0.60	1.46	0.55	0.39	0.99	0.51	1.02	0.70	1.36	0.48	1.57	1.21	1.44	0.66	0.68	0.60	0.36	0.47	0.55	0.34	0.26	0.33
C3'	0.26	1.08	0.22	0.12	0.62	0.34	0.63	0.66	0.95	0.14	1.17	0.83	1.03	0.31	0.33	0.26	0.14	0.21	0.45	0.23	0.17	0.17
C4	0.44	1.17	0.37	0.23	0.85	0.44	0.99	0.64	1.27	0.50	1.32	0.95	1.45	0.76	0.57	0.41	0.20	0.37	0.51	0.22	0.12	0.21
C4'	0.16	1.02	0.19	0.12	0.55	0.33	0.59	0.70	0.93	0.18	1.14	0.76	1.04	0.31	0.27	0.16	0.16	0.18	0.47	0.17	0.17	0.13
C5	0.43	1.12	0.36	0.23	0.83	0.44	0.99	0.59	1.25	0.54	1.29	0.91	1.44	0.81	0.58	0.41	0.19	0.37	0.49	0.22	0.16	0.21
C5'	0.18	1.00	0.25	0.18	0.55	0.34	0.61	0.70	0.92	0.24	1.11	0.74	1.04	0.37	0.29	0.18	0.21	0.19	0.48	0.18	0.19	0.17
C6	0.42	1.03	0.34	0.22	0.80	0.42	0.97	0.52	1.19	0.58	1.19	0.84	1.37	0.85	0.57	0.40	0.18	0.37	0.46	0.22	0.19	0.20
C8	0.44	1.22	0.37	0.23	0.85	0.44	0.97	0.64	1.28	0.48	1.38	0.98	1.47	0.73	0.57	0.42	0.20	0.37	0.51	0.22	0.14	0.21
N1	0.41	0.98	0.33	0.22	0.78	0.42	0.95	0.52	1.13	0.58	1.12	0.81	1.29	0.85	0.56	0.40	0.18	0.37	0.46	0.22	0.16	0.20
N2	0.42	0.93	0.35	0.22	0.77	0.43	0.91	0.60	1.04	0.55	1.03	0.80	1.12	0.81	0.56	0.40	0.20	0.37	0.51	0.24	0.15	0.22
N3	0.44	1.14	0.37	0.23	0.85	0.44	0.98	0.65	1.25	0.49	1.28	0.94	1.40	0.76	0.57	0.41	0.21	0.37	0.52	0.23	0.13	0.21
N7	0.44	1.17	0.36	0.23	0.84	0.44	0.99	0.60	1.27	0.52	1.33	0.94	1.47	0.79	0.58	0.41	0.20	0.37	0.50	0.22	0.17	0.21
N9	0.44	1.23	0.38	0.23	0.85	0.44	0.97	0.66	1.28	0.45	1.39	0.99	1.46	0.70	0.56	0.42	0.21	0.36	0.52	0.22	0.12	0.21
O2'	0.73	1.68	0.69	0.51	1.14	0.57	1.14	0.68	1.52	0.57	1.79	1.39	1.58	0.74	0.80	0.76	0.48	0.55	0.57	0.33	0.25	0.31
O3'	0.15	0.75	0.18	0.31	0.27	0.43	0.27	0.70	0.57	0.30	0.82	0.50	0.62	0.22	0.12	0.13	0.35	0.32	0.54	0.24	0.30	0.24
O4'	0.23	1.07	0.23	0.13	0.63	0.37	0.70	0.71	1.05	0.23	1.22	0.81	1.20	0.41	0.33	0.21	0.15	0.24	0.51	0.20	0.17	0.18
O5'	0.18	0.91	0.18	0.20	0.52	0.47	0.58	0.91	0.86	0.19	1.02	0.68	0.99	0.35	0.27	0.17	0.27	0.24	0.56	0.46	0.32	0.36
O6	0.41	0.99	0.33	0.23	0.78	0.40	0.95	0.46	1.16	0.59	1.16	0.81	1.35	0.86	0.56	0.40	0.19	0.36	0.42	0.23	0.24	0.19
OP1	0.52	0.85	0.59	0.55	0.65	0.57	0.73	0.90	0.88	0.65	0.95	0.69	0.99	0.71	0.58	0.54	0.59	0.51	0.61	0.32	0.22	0.27
OP2	0.20	0.66	0.25	0.47	0.31	0.73	0.39	1.22	0.65	0.18	0.77	0.45	0.78	0.23	0.15	0.26	0.60	0.44	0.79	0.75	0.58	0.64
P	0.28	0.65	0.37	0.45	0.38	0.59	0.46	1.01	0.66	0.39	0.77	0.46	0.79	0.42	0.30	0.33	0.54	0.40	0.64	0.42	0.26	0.34

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.06	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.14	0.41	0.28	0.25
C2	0.03	0.00	0.17	0.26	0.01	0.08	0.00	0.25	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.23	0.29	0.06	0.26	0.49	0.65	0.46
C2'	0.00	0.17	0.00	0.00	0.09	0.02	0.05	0.03	0.08	0.08	0.13	0.18	0.06	0.05	0.02	0.00	0.03	0.01	0.17	0.40	0.25	0.16
C3'	0.01	0.26	0.00	0.00	0.19	0.00	0.20	0.04	0.23	0.16	0.26	0.23	0.23	0.18	0.12	0.01	0.00	0.03	0.28	0.34	0.27	0.12
C4	0.02	0.01	0.09	0.19	0.00	0.10	0.00	0.29	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.13	0.18	0.03	0.29	0.46	0.61	0.44
C4'	0.02	0.08	0.02	0.00	0.10	0.00	0.16	0.01	0.16	0.19	0.12	0.06	0.20	0.21	0.10	0.06	0.01	0.00	0.02	0.43	0.19	0.22
C5	0.01	0.00	0.05	0.20	0.00	0.16	0.00	0.43	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.11	0.19	0.04	0.38	0.54	0.76	0.54
C5'	0.06	0.25	0.03	0.04	0.29	0.01	0.43	0.00	0.44	0.44	0.36	0.19	0.51	0.50	0.27	0.07	0.03	0.03	0.01	0.20	0.20	0.02
C6	0.01	0.01	0.08	0.23	0.01	0.16	0.01	0.44	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.15	0.24	0.04	0.39	0.58	0.82	0.59
C8	0.02	0.01	0.08	0.16	0.00	0.19	0.00	0.44	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.06	0.17	0.06	0.39	0.48	0.64	0.47
N1	0.02	0.00	0.13	0.26	0.01	0.12	0.01	0.36	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.20	0.28	0.05	0.33	0.54	0.76	0.54
N3	0.03	0.00	0.18	0.23	0.00	0.06	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.21	0.25	0.06	0.23	0.45	0.55	0.39
N6	0.01	0.01	0.06	0.23	0.01	0.20	0.01	0.51	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.13	0.24	0.05	0.44	0.65	0.91	0.66
N7	0.01	0.01	0.05	0.18	0.00	0.21	0.00	0.50	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.07	0.19	0.06	0.43	0.57	0.80	0.58
N9	0.00	0.01	0.02	0.12	0.00	0.10	0.00	0.27	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.10	0.02	0.27	0.42	0.50	0.37
O2'	0.02	0.23	0.00	0.01	0.13	0.06	0.11	0.07	0.15	0.06	0.20	0.21	0.13	0.07	0.05	0.00	0.05	0.06	0.09	0.58	0.23	0.32
O3'	0.02	0.29	0.03	0.00	0.18	0.01	0.19	0.03	0.24	0.17	0.28	0.25	0.24	0.19	0.10	0.05	0.00	0.01	0.25	0.40	0.17	0.10
O4'	0.00	0.06	0.01	0.03	0.03	0.00	0.04	0.03	0.04	0.06	0.05	0.06	0.05	0.06	0.02	0.06	0.01	0.00	0.11	0.40	0.21	0.24
O5'	0.14	0.26	0.17	0.28	0.29	0.02	0.38	0.01	0.39	0.39	0.33	0.23	0.44	0.43	0.27	0.09	0.25	0.11	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.41	0.49	0.40	0.34	0.46	0.43	0.54	0.20	0.58	0.48	0.54	0.45	0.65	0.57	0.42	0.58	0.40	0.40	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.28	0.65	0.25	0.27	0.61	0.19	0.76	0.20	0.82	0.64	0.76	0.55	0.91	0.80	0.50	0.23	0.17	0.21	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.25	0.46	0.16	0.12	0.44	0.22	0.54	0.02	0.59	0.47	0.54	0.39	0.66	0.58	0.37	0.32	0.10	0.24	0.00	0.00	0.01	0.00