Doublet Group distance statistics: 53576

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 2, 2, 2, 3, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.020, 0.031, 0.042, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.031 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.015, 0.027, 0.038, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.027 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.029, 0.043, 0.057, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.043 std_dev=0.014
N7	A	0, 0.025, 0.040, 0.054, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.040 std_dev=0.014
C2	A	0, 0.031, 0.047, 0.063, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.047 std_dev=0.016
N9	A	0, 0.026, 0.042, 0.059, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.042 std_dev=0.016
C8	A	0, 0.030, 0.046, 0.063, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.046 std_dev=0.017
C4	A	0, 0.036, 0.055, 0.073, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.055 std_dev=0.019
C1'	A	0, 0.039, 0.058, 0.077, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.058 std_dev=0.019
N3	A	0, 0.042, 0.061, 0.081, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.061 std_dev=0.019
N2	A	0, 0.050, 0.082, 0.113, 0.125 max_d=0.125 avg_d=0.082 std_dev=0.031
O6	A	0, 0.098, 0.147, 0.196, 0.222 max_d=0.222 avg_d=0.147 std_dev=0.049
C2'	A	0, 0.020, 0.074, 0.129, 0.203 max_d=0.203 avg_d=0.074 std_dev=0.054
O4'	A	0, 0.095, 0.154, 0.212, 0.236 max_d=0.236 avg_d=0.154 std_dev=0.058
C3'	A	0, 0.217, 0.328, 0.439, 0.437 max_d=0.437 avg_d=0.328 std_dev=0.111
O2'	A	0, 0.203, 0.315, 0.427, 0.444 max_d=0.444 avg_d=0.315 std_dev=0.112
C4'	A	0, 0.258, 0.379, 0.501, 0.481 max_d=0.481 avg_d=0.379 std_dev=0.122
O3'	A	0, 0.288, 0.457, 0.626, 0.649 max_d=0.649 avg_d=0.457 std_dev=0.169
C1'	B	0, 0.227, 0.402, 0.576, 0.720 max_d=0.720 avg_d=0.402 std_dev=0.175
C5'	A	0, 0.372, 0.561, 0.750, 0.762 max_d=0.762 avg_d=0.561 std_dev=0.189
N9	B	0, 0.207, 0.397, 0.587, 0.739 max_d=0.739 avg_d=0.397 std_dev=0.190
O5'	B	0, 0.357, 0.550, 0.742, 0.776 max_d=0.776 avg_d=0.550 std_dev=0.193
C2'	B	0, 0.219, 0.415, 0.611, 0.755 max_d=0.755 avg_d=0.415 std_dev=0.196
P	B	0, 0.278, 0.483, 0.687, 0.715 max_d=0.715 avg_d=0.483 std_dev=0.204
O5'	A	0, 0.427, 0.638, 0.848, 0.842 max_d=0.842 avg_d=0.638 std_dev=0.210
C4	B	0, 0.220, 0.439, 0.657, 0.799 max_d=0.799 avg_d=0.439 std_dev=0.219
C8	B	0, 0.160, 0.380, 0.599, 0.827 max_d=0.827 avg_d=0.380 std_dev=0.220
OP2	B	0, 0.126, 0.350, 0.574, 0.680 max_d=0.680 avg_d=0.350 std_dev=0.224
OP1	B	0, 0.387, 0.617, 0.847, 0.972 max_d=0.972 avg_d=0.617 std_dev=0.230
N3	B	0, 0.247, 0.495, 0.743, 0.899 max_d=0.899 avg_d=0.495 std_dev=0.248
C5	B	0, 0.199, 0.447, 0.695, 0.891 max_d=0.891 avg_d=0.447 std_dev=0.248
N7	B	0, 0.166, 0.417, 0.668, 0.814 max_d=0.814 avg_d=0.417 std_dev=0.251
C3'	B	0, 0.186, 0.438, 0.689, 0.865 max_d=0.865 avg_d=0.438 std_dev=0.251
C4'	B	0, 0.269, 0.529, 0.788, 0.866 max_d=0.866 avg_d=0.529 std_dev=0.260
O4'	B	0, 0.287, 0.557, 0.828, 1.077 max_d=1.077 avg_d=0.557 std_dev=0.271
P	A	0, 0.510, 0.794, 1.079, 1.140 max_d=1.140 avg_d=0.794 std_dev=0.284
C6	B	0, 0.234, 0.521, 0.809, 1.072 max_d=1.072 avg_d=0.521 std_dev=0.288
C2	B	0, 0.257, 0.552, 0.847, 1.076 max_d=1.076 avg_d=0.552 std_dev=0.295
N6	B	0, 0.259, 0.574, 0.889, 1.191 max_d=1.191 avg_d=0.574 std_dev=0.315
N1	B	0, 0.245, 0.563, 0.882, 1.149 max_d=1.149 avg_d=0.563 std_dev=0.319
O2'	B	0, 0.319, 0.638, 0.958, 1.044 max_d=1.044 avg_d=0.638 std_dev=0.319
OP2	A	0, 0.617, 1.000, 1.383, 1.500 max_d=1.500 avg_d=1.000 std_dev=0.383
OP1	A	0, 0.598, 1.053, 1.507, 1.730 max_d=1.730 avg_d=1.053 std_dev=0.454
C5'	B	0, 0.569, 1.036, 1.502, 1.542 max_d=1.542 avg_d=1.036 std_dev=0.466
O3'	B	0, 0.256, 0.745, 1.235, 1.649 max_d=1.649 avg_d=0.745 std_dev=0.490

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.04	0.14	0.07
C2	0.02	0.00	0.05	0.06	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.07	0.03	0.06	0.02	0.09	0.26	0.13
C2'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.03	0.02	0.03	0.01	0.03	0.03	0.04	0.06	0.05	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.09	0.06	0.03
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.06	0.06	0.06	0.06	0.05	0.06	0.05	0.01	0.01	0.01	0.04	0.06	0.12	0.08	0.05
C4	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.05	0.02	0.07	0.01	0.10	0.24	0.13
C4'	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.04	0.02	0.05	0.01	0.00	0.01	0.03	0.09	0.03	0.01
C5	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.07	0.03	0.09	0.01	0.15	0.28	0.16
C5'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.00	0.05	0.06	0.03	0.03	0.02	0.07	0.04	0.05	0.02	0.01	0.01	0.06	0.09	0.01	0.01
C6	0.02	0.01	0.03	0.06	0.01	0.02	0.01	0.05	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.05	0.07	0.03	0.09	0.01	0.16	0.30	0.16
C8	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.07	0.03	0.10	0.03	0.14	0.25	0.15
N1	0.02	0.01	0.04	0.06	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.06	0.07	0.03	0.08	0.02	0.13	0.29	0.15
N2	0.03	0.01	0.06	0.06	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.08	0.04	0.06	0.03	0.08	0.26	0.13
N3	0.02	0.01	0.05	0.05	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.06	0.03	0.06	0.02	0.07	0.23	0.11
N7	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.04	0.01	0.07	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.08	0.03	0.11	0.03	0.18	0.30	0.17
N9	0.00	0.01	0.02	0.05	0.01	0.02	0.01	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.07	0.02	0.09	0.21	0.12
O2'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.04	0.05	0.04	0.05	0.05	0.03	0.06	0.07	0.05	0.03	0.02	0.00	0.03	0.03	0.03	0.05	0.12	0.04	0.02
O3'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.05	0.01	0.07	0.02	0.07	0.07	0.07	0.08	0.06	0.08	0.04	0.03	0.00	0.01	0.05	0.08	0.19	0.17	0.11
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.03	0.03	0.04	0.03	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.04	0.04	0.05	0.15	0.09
O5'	0.03	0.06	0.03	0.04	0.07	0.01	0.09	0.01	0.09	0.10	0.08	0.06	0.06	0.11	0.07	0.03	0.05	0.04	0.00	0.10	0.02	0.02	0.00
O6	0.02	0.02	0.03	0.06	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.05	0.08	0.04	0.10	0.00	0.18	0.31	0.17
OP1	0.04	0.09	0.09	0.12	0.10	0.09	0.15	0.09	0.16	0.14	0.13	0.08	0.07	0.18	0.09	0.12	0.19	0.05	0.02	0.18	0.00	0.01	0.01
OP2	0.14	0.26	0.06	0.08	0.24	0.03	0.28	0.01	0.30	0.25	0.29	0.26	0.23	0.30	0.21	0.04	0.17	0.15	0.02	0.31	0.01	0.00	0.00
P	0.07	0.13	0.03	0.05	0.13	0.01	0.16	0.01	0.16	0.15	0.15	0.13	0.11	0.17	0.12	0.02	0.11	0.09	0.00	0.17	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.36	0.18	0.12	0.26	0.10	0.29	0.11	0.35	0.23	0.37	0.31	0.38	0.28	0.20	0.26	0.19	0.19	0.13	0.08	0.12	0.07
C2	0.13	0.20	0.22	0.17	0.17	0.11	0.18	0.13	0.19	0.21	0.19	0.19	0.20	0.23	0.15	0.28	0.12	0.22	0.13	0.08	0.16	0.07
C2'	0.14	0.34	0.21	0.15	0.24	0.07	0.27	0.13	0.33	0.23	0.36	0.28	0.38	0.29	0.18	0.27	0.14	0.15	0.11	0.10	0.13	0.07
C3'	0.15	0.37	0.21	0.17	0.26	0.08	0.29	0.12	0.36	0.23	0.40	0.30	0.41	0.28	0.19	0.28	0.15	0.17	0.12	0.09	0.11	0.06
C4	0.15	0.28	0.22	0.17	0.22	0.12	0.24	0.15	0.27	0.20	0.29	0.25	0.29	0.24	0.18	0.30	0.15	0.22	0.13	0.06	0.10	0.05
C4'	0.19	0.42	0.17	0.12	0.29	0.11	0.31	0.11	0.39	0.23	0.44	0.35	0.44	0.28	0.22	0.26	0.21	0.20	0.13	0.08	0.10	0.06
C5	0.15	0.25	0.25	0.23	0.20	0.14	0.21	0.20	0.25	0.16	0.26	0.22	0.26	0.19	0.16	0.36	0.19	0.23	0.15	0.05	0.06	0.04
C5'	0.20	0.44	0.17	0.12	0.31	0.13	0.33	0.13	0.42	0.23	0.47	0.37	0.46	0.28	0.23	0.27	0.21	0.22	0.12	0.08	0.10	0.05
C6	0.15	0.20	0.29	0.27	0.16	0.15	0.16	0.24	0.19	0.13	0.20	0.18	0.20	0.15	0.14	0.40	0.25	0.24	0.17	0.06	0.07	0.07
C8	0.16	0.32	0.22	0.19	0.24	0.13	0.25	0.17	0.31	0.19	0.33	0.27	0.34	0.23	0.18	0.33	0.16	0.23	0.13	0.05	0.06	0.04
N1	0.13	0.17	0.27	0.25	0.14	0.14	0.14	0.21	0.16	0.13	0.17	0.16	0.17	0.15	0.12	0.35	0.20	0.24	0.16	0.06	0.10	0.05
N2	0.14	0.16	0.20	0.13	0.15	0.10	0.18	0.11	0.16	0.25	0.15	0.16	0.18	0.26	0.16	0.23	0.13	0.21	0.14	0.12	0.21	0.13
N3	0.16	0.27	0.20	0.14	0.22	0.11	0.24	0.12	0.26	0.24	0.27	0.25	0.27	0.29	0.19	0.27	0.15	0.21	0.13	0.08	0.15	0.08
N7	0.15	0.28	0.25	0.23	0.22	0.14	0.23	0.21	0.28	0.17	0.29	0.24	0.30	0.20	0.17	0.37	0.20	0.24	0.15	0.05	0.05	0.05
N9	0.16	0.32	0.20	0.16	0.24	0.11	0.26	0.14	0.31	0.20	0.34	0.28	0.34	0.25	0.19	0.30	0.16	0.21	0.13	0.07	0.10	0.05
O2'	0.15	0.35	0.18	0.12	0.25	0.08	0.29	0.17	0.35	0.26	0.37	0.29	0.40	0.31	0.20	0.24	0.19	0.13	0.14	0.14	0.17	0.12
O3'	0.15	0.38	0.21	0.17	0.25	0.07	0.29	0.15	0.36	0.23	0.40	0.31	0.41	0.29	0.19	0.27	0.14	0.15	0.11	0.12	0.13	0.07
O4'	0.20	0.41	0.17	0.12	0.30	0.13	0.31	0.13	0.39	0.23	0.43	0.35	0.43	0.28	0.23	0.26	0.22	0.22	0.14	0.08	0.12	0.07
O5'	0.18	0.39	0.21	0.17	0.27	0.12	0.29	0.15	0.37	0.21	0.41	0.32	0.42	0.25	0.21	0.30	0.17	0.21	0.14	0.10	0.11	0.08
O6	0.17	0.18	0.33	0.33	0.15	0.18	0.16	0.29	0.18	0.13	0.19	0.17	0.19	0.14	0.14	0.46	0.34	0.25	0.22	0.11	0.13	0.13
OP1	0.14	0.39	0.22	0.20	0.23	0.12	0.24	0.16	0.34	0.16	0.42	0.31	0.39	0.18	0.16	0.32	0.16	0.19	0.17	0.16	0.16	0.13
OP2	0.30	0.14	0.49	0.47	0.19	0.29	0.20	0.29	0.15	0.33	0.15	0.15	0.17	0.28	0.26	0.59	0.42	0.26	0.35	0.28	0.28	0.27
P	0.14	0.25	0.29	0.27	0.16	0.14	0.17	0.18	0.23	0.18	0.28	0.19	0.28	0.17	0.14	0.38	0.21	0.17	0.20	0.16	0.16	0.14

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.05	0.02	0.02	0.03	0.04	0.01	0.01	0.00	0.02	0.14	0.00	0.12	0.16	0.10	0.09
C2	0.04	0.00	0.10	0.09	0.01	0.09	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.22	0.32	0.11	0.11	0.12	0.23	0.13
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.05	0.02	0.04	0.09	0.05	0.09	0.08	0.10	0.05	0.07	0.02	0.00	0.04	0.02	0.34	0.35	0.26	0.31
C3'	0.02	0.09	0.00	0.00	0.03	0.01	0.02	0.03	0.02	0.08	0.06	0.09	0.03	0.06	0.01	0.02	0.01	0.01	0.31	0.38	0.27	0.32
C4	0.02	0.01	0.05	0.03	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.10	0.22	0.06	0.10	0.11	0.20	0.12
C4'	0.01	0.09	0.02	0.01	0.04	0.00	0.02	0.01	0.03	0.08	0.07	0.09	0.03	0.06	0.02	0.03	0.03	0.00	0.02	0.12	0.10	0.04
C5	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.00	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.18	0.03	0.10	0.11	0.23	0.15
C5'	0.05	0.11	0.09	0.03	0.05	0.01	0.07	0.00	0.06	0.18	0.09	0.11	0.08	0.15	0.08	0.07	0.07	0.02	0.01	0.10	0.16	0.01
C6	0.02	0.01	0.05	0.02	0.01	0.03	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.22	0.05	0.09	0.11	0.25	0.15
C8	0.02	0.01	0.09	0.08	0.00	0.08	0.01	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.14	0.08	0.06	0.15	0.12	0.20	0.16
N1	0.03	0.01	0.08	0.06	0.01	0.07	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.18	0.28	0.08	0.10	0.11	0.25	0.14
N3	0.04	0.01	0.10	0.09	0.01	0.09	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.21	0.31	0.11	0.11	0.12	0.21	0.11
N6	0.01	0.01	0.05	0.03	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.08	0.19	0.04	0.09	0.12	0.26	0.17
N7	0.01	0.01	0.07	0.06	0.01	0.06	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.10	0.11	0.04	0.13	0.13	0.24	0.17
N9	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.14	0.00	0.11	0.11	0.16	0.11
O2'	0.02	0.22	0.00	0.02	0.10	0.03	0.06	0.07	0.11	0.14	0.18	0.21	0.08	0.10	0.03	0.00	0.06	0.02	0.37	0.42	0.34	0.36
O3'	0.14	0.32	0.04	0.01	0.22	0.03	0.18	0.07	0.22	0.08	0.28	0.31	0.19	0.11	0.14	0.06	0.00	0.10	0.22	0.43	0.26	0.29
O4'	0.00	0.11	0.02	0.01	0.06	0.00	0.03	0.02	0.05	0.06	0.08	0.11	0.04	0.04	0.00	0.02	0.10	0.00	0.14	0.15	0.20	0.12
O5'	0.12	0.11	0.34	0.31	0.10	0.02	0.10	0.01	0.09	0.15	0.10	0.11	0.09	0.13	0.11	0.37	0.22	0.14	0.00	0.03	0.02	0.01
OP1	0.16	0.12	0.35	0.38	0.11	0.12	0.11	0.10	0.11	0.12	0.11	0.12	0.12	0.13	0.11	0.42	0.43	0.15	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.10	0.23	0.26	0.27	0.20	0.10	0.23	0.16	0.25	0.20	0.25	0.21	0.26	0.24	0.16	0.34	0.26	0.20	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.13	0.31	0.32	0.12	0.04	0.15	0.01	0.15	0.16	0.14	0.11	0.17	0.17	0.11	0.36	0.29	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00