Doublet Group distance statistics: 53580

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 2, 1, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.010, 0.018, 0.026, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.018 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.014, 0.026, 0.039, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.026 std_dev=0.013
C6	A	0, 0.001, 0.016, 0.030, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.016 std_dev=0.015
N2	A	0, 0.020, 0.039, 0.058, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.039 std_dev=0.019
N3	A	0, 0.011, 0.032, 0.053, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.032 std_dev=0.021
C5	A	0, 0.007, 0.029, 0.051, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.029 std_dev=0.022
N1	A	0, 0.007, 0.030, 0.052, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.030 std_dev=0.022
C4	A	0, 0.003, 0.038, 0.073, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.038 std_dev=0.035
N9	A	0, 0.007, 0.042, 0.078, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.042 std_dev=0.036
O6	A	0, 0.004, 0.048, 0.092, 0.113 max_d=0.113 avg_d=0.048 std_dev=0.044
N7	A	0, 0.008, 0.055, 0.103, 0.133 max_d=0.133 avg_d=0.055 std_dev=0.048
C8	A	0, 0.006, 0.069, 0.133, 0.165 max_d=0.165 avg_d=0.069 std_dev=0.063
O4'	A	0, 0.133, 0.293, 0.453, 0.596 max_d=0.596 avg_d=0.293 std_dev=0.160
C2'	A	0, 0.192, 0.363, 0.535, 0.579 max_d=0.579 avg_d=0.363 std_dev=0.171
C4'	A	0, 0.165, 0.401, 0.636, 0.856 max_d=0.856 avg_d=0.401 std_dev=0.235
OP2	B	0, 0.221, 0.458, 0.695, 0.832 max_d=0.832 avg_d=0.458 std_dev=0.237
P	B	0, 0.255, 0.494, 0.734, 0.845 max_d=0.845 avg_d=0.494 std_dev=0.239
C3'	A	0, 0.270, 0.523, 0.777, 0.929 max_d=0.929 avg_d=0.523 std_dev=0.254
O2'	A	0, 0.242, 0.501, 0.760, 0.828 max_d=0.828 avg_d=0.501 std_dev=0.259
O3'	A	0, 0.435, 0.823, 1.210, 1.386 max_d=1.386 avg_d=0.823 std_dev=0.388
C5'	A	0, 0.378, 0.773, 1.168, 1.464 max_d=1.464 avg_d=0.773 std_dev=0.395
C5'	B	0, 0.436, 0.895, 1.353, 1.280 max_d=1.280 avg_d=0.895 std_dev=0.459
OP1	B	0, 0.326, 0.789, 1.251, 1.700 max_d=1.700 avg_d=0.789 std_dev=0.463
O5'	B	0, 0.217, 0.712, 1.207, 1.792 max_d=1.792 avg_d=0.712 std_dev=0.495
O5'	A	0, 0.462, 1.010, 1.558, 1.896 max_d=1.896 avg_d=1.010 std_dev=0.548
OP2	A	0, 0.760, 1.377, 1.994, 1.957 max_d=1.957 avg_d=1.377 std_dev=0.617
P	A	0, 0.621, 1.257, 1.893, 2.173 max_d=2.173 avg_d=1.257 std_dev=0.636
C4'	B	0, 0.566, 1.246, 1.926, 2.279 max_d=2.279 avg_d=1.246 std_dev=0.680
N7	B	0, 0.247, 0.949, 1.651, 2.393 max_d=2.393 avg_d=0.949 std_dev=0.702
C8	B	0, 0.194, 0.899, 1.604, 2.435 max_d=2.435 avg_d=0.899 std_dev=0.705
C3'	B	0, 0.516, 1.271, 2.027, 2.691 max_d=2.691 avg_d=1.271 std_dev=0.756
O4'	B	0, 0.581, 1.389, 2.196, 2.839 max_d=2.839 avg_d=1.389 std_dev=0.807
OP1	A	0, 0.625, 1.436, 2.248, 2.603 max_d=2.603 avg_d=1.436 std_dev=0.812
O3'	B	0, 0.624, 1.479, 2.335, 3.005 max_d=3.005 avg_d=1.479 std_dev=0.855
N9	B	0, 0.402, 1.286, 2.171, 3.117 max_d=3.117 avg_d=1.286 std_dev=0.884
C1'	B	0, 0.571, 1.514, 2.458, 3.418 max_d=3.418 avg_d=1.514 std_dev=0.944
C2'	B	0, 0.600, 1.577, 2.554, 3.580 max_d=3.580 avg_d=1.577 std_dev=0.977
C5	B	0, 0.327, 1.317, 2.307, 3.055 max_d=3.055 avg_d=1.317 std_dev=0.990
C4	B	0, 0.563, 1.604, 2.644, 3.557 max_d=3.557 avg_d=1.604 std_dev=1.041
O2'	B	0, 0.797, 1.978, 3.158, 4.320 max_d=4.320 avg_d=1.978 std_dev=1.180
N6	B	0, 0.308, 1.526, 2.745, 3.786 max_d=3.786 avg_d=1.526 std_dev=1.218
C6	B	0, 0.394, 1.616, 2.838, 3.489 max_d=3.489 avg_d=1.616 std_dev=1.222
N3	B	0, 0.871, 2.149, 3.427, 4.349 max_d=4.349 avg_d=2.149 std_dev=1.278
N1	B	0, 0.715, 2.155, 3.595, 4.235 max_d=4.235 avg_d=2.155 std_dev=1.440
C2	B	0, 0.928, 2.378, 3.828, 4.587 max_d=4.587 avg_d=2.378 std_dev=1.450

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.03	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.09	0.02	0.10	0.52	0.19
C2	0.03	0.00	0.14	0.15	0.01	0.02	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.12	0.22	0.08	0.27	0.01	0.16	0.45	0.20
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.08	0.03	0.06	0.01	0.09	0.08	0.11	0.16	0.14	0.08	0.02	0.00	0.03	0.01	0.16	0.09	0.12	0.40	0.07
C3'	0.02	0.15	0.00	0.00	0.09	0.00	0.07	0.02	0.09	0.09	0.13	0.18	0.15	0.07	0.03	0.02	0.01	0.02	0.24	0.09	0.17	0.34	0.06
C4	0.01	0.01	0.08	0.09	0.00	0.01	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.12	0.05	0.28	0.01	0.16	0.46	0.20
C4'	0.01	0.02	0.03	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.02	0.08	0.01	0.03	0.02	0.07	0.03	0.08	0.01	0.00	0.02	0.03	0.08	0.40	0.09
C5	0.01	0.01	0.06	0.07	0.00	0.03	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.10	0.03	0.36	0.01	0.20	0.40	0.22
C5'	0.03	0.07	0.01	0.02	0.09	0.01	0.13	0.00	0.12	0.16	0.10	0.05	0.06	0.17	0.10	0.09	0.06	0.02	0.01	0.13	0.09	0.26	0.02
C6	0.02	0.01	0.09	0.09	0.01	0.02	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.14	0.04	0.37	0.00	0.20	0.38	0.23
C8	0.01	0.01	0.08	0.09	0.00	0.08	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.09	0.04	0.37	0.02	0.19	0.42	0.19
N1	0.03	0.00	0.11	0.13	0.01	0.01	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.11	0.19	0.07	0.33	0.01	0.18	0.41	0.22
N2	0.03	0.00	0.16	0.18	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.15	0.27	0.10	0.24	0.02	0.15	0.46	0.20
N3	0.03	0.00	0.14	0.15	0.00	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.19	0.08	0.23	0.01	0.15	0.47	0.19
N7	0.02	0.01	0.08	0.07	0.01	0.07	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.08	0.02	0.41	0.02	0.21	0.37	0.22
N9	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.03	0.01	0.10	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.25	0.02	0.15	0.48	0.18
O2'	0.02	0.12	0.00	0.02	0.07	0.08	0.07	0.09	0.10	0.05	0.11	0.15	0.11	0.07	0.02	0.00	0.07	0.06	0.04	0.11	0.08	0.44	0.13
O3'	0.02	0.22	0.03	0.01	0.12	0.01	0.10	0.06	0.14	0.09	0.19	0.27	0.19	0.08	0.03	0.07	0.00	0.02	0.26	0.14	0.28	0.28	0.14
O4'	0.00	0.08	0.01	0.02	0.05	0.00	0.03	0.02	0.04	0.04	0.07	0.10	0.08	0.02	0.02	0.06	0.02	0.00	0.10	0.04	0.13	0.57	0.26
O5'	0.09	0.27	0.16	0.24	0.28	0.02	0.36	0.01	0.37	0.37	0.33	0.24	0.23	0.41	0.25	0.04	0.26	0.10	0.00	0.41	0.02	0.02	0.00
O6	0.02	0.01	0.09	0.09	0.01	0.03	0.01	0.13	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.11	0.14	0.04	0.41	0.00	0.22	0.35	0.24
OP1	0.10	0.16	0.12	0.17	0.16	0.08	0.20	0.09	0.20	0.19	0.18	0.15	0.15	0.21	0.15	0.08	0.28	0.13	0.02	0.22	0.00	0.01	0.01
OP2	0.52	0.45	0.40	0.34	0.46	0.40	0.40	0.26	0.38	0.42	0.41	0.46	0.47	0.37	0.48	0.44	0.28	0.57	0.02	0.35	0.01	0.00	0.01
P	0.19	0.20	0.07	0.06	0.20	0.09	0.22	0.02	0.23	0.19	0.22	0.20	0.19	0.22	0.18	0.13	0.14	0.26	0.00	0.24	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.50	0.89	0.30	0.21	0.65	0.36	0.66	0.34	0.84	0.44	0.95	0.76	0.91	0.49	0.52	0.33	0.17	0.58	0.48	0.28	0.21	0.21
C2	0.30	0.58	0.23	0.26	0.46	0.26	0.54	0.28	0.66	0.36	0.66	0.49	0.76	0.47	0.36	0.23	0.33	0.40	0.37	0.29	0.21	0.21
C2'	0.36	0.70	0.18	0.16	0.45	0.28	0.43	0.31	0.61	0.29	0.75	0.58	0.68	0.30	0.35	0.23	0.20	0.46	0.40	0.43	0.25	0.26
C3'	0.33	0.71	0.17	0.18	0.43	0.25	0.40	0.31	0.59	0.27	0.75	0.57	0.64	0.28	0.32	0.22	0.24	0.42	0.36	0.54	0.28	0.32
C4	0.37	0.74	0.22	0.22	0.56	0.27	0.62	0.28	0.79	0.39	0.83	0.62	0.92	0.50	0.43	0.22	0.29	0.46	0.39	0.31	0.23	0.20
C4'	0.46	0.84	0.29	0.20	0.58	0.32	0.54	0.30	0.70	0.38	0.87	0.72	0.72	0.39	0.46	0.34	0.18	0.52	0.41	0.39	0.21	0.22
C5	0.31	0.71	0.22	0.26	0.52	0.23	0.61	0.26	0.78	0.37	0.81	0.58	0.91	0.50	0.39	0.22	0.38	0.40	0.33	0.33	0.25	0.21
C5'	0.48	0.86	0.32	0.21	0.60	0.32	0.57	0.29	0.73	0.39	0.89	0.74	0.74	0.41	0.48	0.37	0.17	0.52	0.42	0.39	0.22	0.22
C6	0.25	0.62	0.25	0.32	0.46	0.21	0.56	0.24	0.72	0.33	0.72	0.50	0.85	0.48	0.33	0.25	0.47	0.34	0.29	0.33	0.27	0.22
C8	0.39	0.82	0.22	0.21	0.60	0.27	0.65	0.28	0.84	0.40	0.91	0.68	0.95	0.50	0.45	0.22	0.30	0.47	0.38	0.33	0.24	0.20
N1	0.24	0.56	0.26	0.32	0.42	0.23	0.52	0.25	0.66	0.32	0.65	0.45	0.78	0.46	0.31	0.26	0.45	0.34	0.30	0.31	0.26	0.21
N2	0.30	0.48	0.24	0.26	0.39	0.28	0.46	0.29	0.54	0.34	0.54	0.41	0.61	0.42	0.33	0.24	0.31	0.40	0.40	0.25	0.18	0.20
N3	0.38	0.69	0.23	0.22	0.54	0.29	0.60	0.30	0.75	0.40	0.77	0.59	0.86	0.49	0.42	0.23	0.25	0.47	0.42	0.29	0.20	0.20
N7	0.33	0.77	0.22	0.25	0.56	0.23	0.63	0.26	0.81	0.38	0.86	0.63	0.94	0.50	0.41	0.21	0.38	0.42	0.33	0.34	0.26	0.21
N9	0.42	0.82	0.24	0.20	0.61	0.30	0.65	0.30	0.83	0.41	0.90	0.69	0.94	0.50	0.47	0.25	0.24	0.51	0.42	0.30	0.22	0.21
O2'	0.46	0.74	0.28	0.19	0.49	0.36	0.41	0.35	0.57	0.35	0.75	0.63	0.58	0.31	0.42	0.35	0.16	0.55	0.48	0.33	0.22	0.24
O3'	0.28	0.63	0.16	0.20	0.34	0.26	0.30	0.37	0.48	0.26	0.66	0.49	0.54	0.25	0.25	0.21	0.26	0.38	0.36	0.66	0.36	0.41
O4'	0.55	0.98	0.36	0.25	0.72	0.39	0.71	0.34	0.89	0.48	1.03	0.84	0.94	0.53	0.58	0.40	0.18	0.61	0.49	0.27	0.21	0.20
O5'	0.53	0.87	0.33	0.23	0.65	0.42	0.63	0.41	0.78	0.47	0.90	0.75	0.81	0.49	0.54	0.36	0.14	0.63	0.58	0.24	0.37	0.33
O6	0.21	0.60	0.28	0.36	0.44	0.21	0.55	0.23	0.70	0.32	0.71	0.47	0.84	0.47	0.30	0.30	0.55	0.30	0.26	0.34	0.30	0.22
OP1	0.45	0.93	0.26	0.15	0.62	0.27	0.60	0.25	0.78	0.36	0.95	0.78	0.80	0.41	0.47	0.30	0.20	0.51	0.35	0.45	0.22	0.21
OP2	0.18	0.58	0.36	0.47	0.31	0.31	0.33	0.36	0.52	0.18	0.65	0.43	0.60	0.20	0.19	0.35	0.61	0.19	0.26	0.75	0.36	0.44
P	0.33	0.78	0.17	0.17	0.50	0.22	0.49	0.24	0.68	0.27	0.83	0.63	0.73	0.32	0.35	0.19	0.27	0.41	0.32	0.47	0.24	0.24

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.18	0.14	0.25	0.14
C2	0.03	0.00	0.24	0.19	0.00	0.05	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.26	0.27	0.15	0.26	0.22	0.32	0.27
C2'	0.00	0.24	0.00	0.00	0.13	0.01	0.07	0.01	0.12	0.11	0.19	0.24	0.09	0.05	0.01	0.00	0.02	0.01	0.06	0.10	0.43	0.19
C3'	0.01	0.19	0.00	0.00	0.11	0.00	0.08	0.01	0.12	0.13	0.17	0.18	0.10	0.09	0.04	0.01	0.01	0.01	0.10	0.15	0.47	0.24
C4	0.01	0.00	0.13	0.11	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.13	0.14	0.08	0.27	0.22	0.31	0.27
C4'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.07	0.08	0.06	0.04	0.08	0.09	0.04	0.04	0.02	0.00	0.01	0.15	0.23	0.08
C5	0.01	0.01	0.07	0.08	0.00	0.07	0.00	0.16	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.10	0.04	0.32	0.30	0.36	0.33
C5'	0.03	0.15	0.01	0.01	0.12	0.00	0.16	0.00	0.17	0.15	0.17	0.12	0.19	0.18	0.09	0.04	0.02	0.01	0.01	0.19	0.10	0.01
C6	0.02	0.01	0.12	0.12	0.01	0.07	0.01	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.16	0.07	0.32	0.33	0.38	0.35
C8	0.02	0.01	0.11	0.13	0.00	0.08	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.14	0.10	0.33	0.28	0.32	0.32
N1	0.02	0.00	0.19	0.17	0.01	0.06	0.00	0.17	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.21	0.24	0.12	0.29	0.29	0.35	0.32
N3	0.02	0.00	0.24	0.18	0.00	0.04	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.25	0.24	0.14	0.24	0.17	0.29	0.24
N6	0.02	0.01	0.09	0.10	0.01	0.08	0.01	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.11	0.13	0.05	0.33	0.39	0.41	0.39
N7	0.02	0.01	0.05	0.09	0.01	0.09	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.09	0.06	0.35	0.35	0.38	0.38
N9	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.26	0.19	0.28	0.23
O2'	0.01	0.26	0.00	0.01	0.13	0.04	0.08	0.04	0.14	0.09	0.21	0.25	0.11	0.04	0.02	0.00	0.02	0.05	0.06	0.10	0.43	0.18
O3'	0.02	0.27	0.02	0.01	0.14	0.02	0.10	0.02	0.16	0.14	0.24	0.24	0.13	0.09	0.04	0.02	0.00	0.02	0.26	0.24	0.55	0.31
O4'	0.00	0.15	0.01	0.01	0.08	0.00	0.04	0.01	0.07	0.10	0.12	0.14	0.05	0.06	0.01	0.05	0.02	0.00	0.22	0.23	0.10	0.13
O5'	0.18	0.26	0.06	0.10	0.27	0.01	0.32	0.01	0.32	0.33	0.29	0.24	0.33	0.35	0.26	0.06	0.26	0.22	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.14	0.22	0.10	0.15	0.22	0.15	0.30	0.19	0.33	0.28	0.29	0.17	0.39	0.35	0.19	0.10	0.24	0.23	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.25	0.32	0.43	0.47	0.31	0.23	0.36	0.10	0.38	0.32	0.35	0.29	0.41	0.38	0.28	0.43	0.55	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.14	0.27	0.19	0.24	0.27	0.08	0.33	0.01	0.35	0.32	0.32	0.24	0.39	0.38	0.23	0.18	0.31	0.13	0.00	0.01	0.00	0.00