Doublet Group distance statistics: 53587

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.008, 0.017, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.008 std_dev=0.009
C5	A	0, -0.003, 0.019, 0.041, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.019 std_dev=0.022
N1	A	0, -0.005, 0.020, 0.045, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.020 std_dev=0.025
N7	A	0, -0.003, 0.027, 0.056, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.027 std_dev=0.030
O6	A	0, -0.004, 0.027, 0.057, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.027 std_dev=0.030
C4	A	0, -0.005, 0.027, 0.060, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.027 std_dev=0.033
C2	A	0, -0.008, 0.028, 0.063, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.028 std_dev=0.035
C8	A	0, -0.005, 0.034, 0.073, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.034 std_dev=0.039
N9	A	0, -0.008, 0.032, 0.072, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.032 std_dev=0.040
N3	A	0, -0.009, 0.035, 0.080, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.035 std_dev=0.044
C1'	A	0, -0.011, 0.039, 0.089, 0.109 max_d=0.109 avg_d=0.039 std_dev=0.050
N2	A	0, -0.015, 0.047, 0.110, 0.136 max_d=0.136 avg_d=0.047 std_dev=0.063
N1	B	0, 0.000, 0.138, 0.276, 0.326 max_d=0.326 avg_d=0.138 std_dev=0.138
N3	B	0, -0.012, 0.127, 0.266, 0.321 max_d=0.321 avg_d=0.127 std_dev=0.139
C2	B	0, -0.007, 0.155, 0.317, 0.378 max_d=0.378 avg_d=0.155 std_dev=0.162
O4'	A	0, -0.043, 0.141, 0.324, 0.400 max_d=0.400 avg_d=0.141 std_dev=0.183
C6	B	0, -0.043, 0.191, 0.424, 0.520 max_d=0.520 avg_d=0.191 std_dev=0.234
C4	B	0, -0.054, 0.190, 0.435, 0.535 max_d=0.535 avg_d=0.190 std_dev=0.244
C2'	A	0, -0.068, 0.190, 0.448, 0.555 max_d=0.555 avg_d=0.190 std_dev=0.258
OP1	A	0, -0.070, 0.197, 0.464, 0.574 max_d=0.574 avg_d=0.197 std_dev=0.267
O2'	A	0, -0.063, 0.214, 0.491, 0.606 max_d=0.606 avg_d=0.214 std_dev=0.277
N6	B	0, -0.065, 0.253, 0.572, 0.702 max_d=0.702 avg_d=0.253 std_dev=0.318
C5	B	0, -0.087, 0.257, 0.601, 0.744 max_d=0.744 avg_d=0.257 std_dev=0.344
C3'	A	0, -0.087, 0.262, 0.610, 0.754 max_d=0.754 avg_d=0.262 std_dev=0.348
C4'	A	0, -0.092, 0.262, 0.616, 0.762 max_d=0.762 avg_d=0.262 std_dev=0.354
C1'	B	0, -0.082, 0.273, 0.627, 0.774 max_d=0.774 avg_d=0.273 std_dev=0.355
N9	B	0, -0.095, 0.281, 0.656, 0.812 max_d=0.812 avg_d=0.281 std_dev=0.376
C2'	B	0, -0.103, 0.317, 0.737, 0.911 max_d=0.911 avg_d=0.317 std_dev=0.420
O2'	B	0, -0.114, 0.341, 0.796, 0.984 max_d=0.984 avg_d=0.341 std_dev=0.455
C4'	B	0, -0.112, 0.362, 0.836, 1.032 max_d=1.032 avg_d=0.362 std_dev=0.474
P	A	0, -0.136, 0.353, 0.841, 1.043 max_d=1.043 avg_d=0.353 std_dev=0.488
O4'	B	0, -0.117, 0.372, 0.861, 1.063 max_d=1.063 avg_d=0.372 std_dev=0.489
C3'	B	0, -0.121, 0.377, 0.874, 1.079 max_d=1.079 avg_d=0.377 std_dev=0.497
P	B	0, -0.130, 0.375, 0.879, 1.088 max_d=1.088 avg_d=0.375 std_dev=0.504
O3'	A	0, -0.124, 0.400, 0.924, 1.141 max_d=1.141 avg_d=0.400 std_dev=0.524
N7	B	0, -0.141, 0.412, 0.964, 1.193 max_d=1.193 avg_d=0.412 std_dev=0.553
C5'	A	0, -0.149, 0.406, 0.960, 1.190 max_d=1.190 avg_d=0.406 std_dev=0.555
OP1	B	0, -0.139, 0.419, 0.977, 1.207 max_d=1.207 avg_d=0.419 std_dev=0.558
OP2	B	0, -0.152, 0.406, 0.965, 1.196 max_d=1.196 avg_d=0.406 std_dev=0.558
C8	B	0, -0.144, 0.422, 0.988, 1.222 max_d=1.222 avg_d=0.422 std_dev=0.566
O3'	B	0, -0.167, 0.489, 1.145, 1.416 max_d=1.416 avg_d=0.489 std_dev=0.656
C5'	B	0, -0.173, 0.498, 1.170, 1.448 max_d=1.448 avg_d=0.498 std_dev=0.672
O5'	B	0, -0.185, 0.499, 1.183, 1.466 max_d=1.466 avg_d=0.499 std_dev=0.684
OP2	A	0, -0.192, 0.510, 1.213, 1.504 max_d=1.504 avg_d=0.510 std_dev=0.703
O5'	A	0, -0.195, 0.521, 1.237, 1.533 max_d=1.533 avg_d=0.521 std_dev=0.716

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.07	0.00	0.02	0.04	0.01	0.02	0.02	0.04	0.03	0.06	0.08	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.05	0.03	0.03	0.56	0.19
C2	0.07	0.00	0.23	0.23	0.00	0.12	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.21	0.29	0.02	0.18	0.01	0.04	0.43	0.11
C2'	0.00	0.23	0.00	0.00	0.12	0.02	0.08	0.01	0.13	0.05	0.19	0.27	0.22	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.20	0.12	0.13	0.42	0.04
C3'	0.02	0.23	0.00	0.00	0.13	0.01	0.09	0.00	0.13	0.04	0.19	0.27	0.22	0.00	0.04	0.02	0.01	0.02	0.28	0.11	0.20	0.37	0.03
C4	0.04	0.00	0.12	0.13	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.09	0.16	0.01	0.23	0.02	0.02	0.45	0.10
C4'	0.01	0.12	0.02	0.01	0.04	0.00	0.01	0.01	0.02	0.09	0.08	0.16	0.13	0.08	0.01	0.09	0.00	0.00	0.01	0.00	0.07	0.46	0.11
C5	0.02	0.01	0.08	0.09	0.00	0.01	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.06	0.14	0.04	0.37	0.01	0.03	0.31	0.01
C5'	0.02	0.04	0.01	0.00	0.03	0.01	0.11	0.00	0.09	0.18	0.02	0.09	0.06	0.18	0.07	0.10	0.05	0.01	0.01	0.13	0.09	0.32	0.02
C6	0.04	0.00	0.13	0.13	0.01	0.02	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.21	0.03	0.38	0.00	0.05	0.25	0.04
C8	0.03	0.01	0.05	0.04	0.00	0.09	0.01	0.18	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.39	0.01	0.02	0.41	0.02
N1	0.06	0.00	0.19	0.19	0.01	0.08	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.17	0.27	0.01	0.29	0.01	0.01	0.33	0.03
N2	0.08	0.01	0.27	0.27	0.01	0.16	0.02	0.09	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.26	0.34	0.04	0.11	0.00	0.06	0.46	0.14
N3	0.08	0.00	0.22	0.22	0.00	0.13	0.00	0.06	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.19	0.25	0.04	0.12	0.01	0.07	0.51	0.16
N7	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.08	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.06	0.46	0.01	0.06	0.25	0.07
N9	0.00	0.00	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.02	0.21	0.01	0.03	0.52	0.14
O2'	0.01	0.21	0.00	0.02	0.09	0.09	0.06	0.10	0.12	0.04	0.17	0.26	0.19	0.01	0.00	0.00	0.05	0.04	0.01	0.11	0.07	0.48	0.14
O3'	0.01	0.29	0.01	0.01	0.16	0.00	0.14	0.05	0.21	0.01	0.27	0.34	0.25	0.05	0.05	0.05	0.00	0.00	0.26	0.19	0.27	0.32	0.07
O4'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.01	0.03	0.05	0.01	0.04	0.04	0.06	0.02	0.04	0.00	0.00	0.14	0.04	0.11	0.64	0.29
O5'	0.05	0.18	0.20	0.28	0.23	0.01	0.37	0.01	0.38	0.39	0.29	0.11	0.12	0.46	0.21	0.01	0.26	0.14	0.00	0.45	0.00	0.01	0.01
O6	0.03	0.01	0.12	0.11	0.02	0.00	0.01	0.13	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.19	0.04	0.45	0.00	0.09	0.14	0.12
OP1	0.03	0.04	0.13	0.20	0.02	0.07	0.03	0.09	0.05	0.02	0.01	0.06	0.07	0.06	0.03	0.07	0.27	0.11	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00
OP2	0.56	0.43	0.42	0.37	0.45	0.46	0.31	0.32	0.25	0.41	0.33	0.46	0.51	0.25	0.52	0.48	0.32	0.64	0.01	0.14	0.01	0.00	0.00
P	0.19	0.11	0.04	0.03	0.10	0.11	0.01	0.02	0.04	0.02	0.03	0.14	0.16	0.07	0.14	0.14	0.07	0.29	0.01	0.12	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.23	0.09	0.08	0.03	0.17	0.13	0.12	0.05	0.05	0.21	0.04	0.15	0.03	0.16	0.21	0.07	0.16	0.31	0.11	0.27	0.27	0.01
C2	0.18	0.00	0.00	0.05	0.10	0.13	0.04	0.02	0.05	0.19	0.06	0.07	0.13	0.10	0.17	0.07	0.00	0.33	0.02	0.27	0.17	0.08
C2'	0.36	0.19	0.20	0.15	0.27	0.28	0.21	0.11	0.12	0.31	0.12	0.26	0.02	0.24	0.33	0.17	0.26	0.47	0.06	0.38	0.14	0.16
C3'	0.31	0.10	0.17	0.13	0.21	0.26	0.16	0.11	0.05	0.29	0.03	0.18	0.04	0.21	0.29	0.14	0.24	0.43	0.06	0.40	0.15	0.16
C4	0.21	0.01	0.05	0.01	0.13	0.14	0.11	0.01	0.00	0.25	0.03	0.09	0.06	0.20	0.20	0.01	0.09	0.32	0.05	0.29	0.23	0.06
C4'	0.18	0.02	0.04	0.02	0.09	0.12	0.04	0.04	0.06	0.16	0.08	0.06	0.14	0.10	0.15	0.02	0.15	0.28	0.10	0.31	0.26	0.04
C5	0.24	0.01	0.11	0.06	0.15	0.20	0.15	0.10	0.02	0.34	0.05	0.08	0.02	0.29	0.25	0.05	0.11	0.36	0.06	0.37	0.14	0.15
C5'	0.07	0.16	0.06	0.07	0.03	0.04	0.06	0.10	0.17	0.09	0.21	0.07	0.22	0.03	0.05	0.09	0.06	0.19	0.17	0.26	0.31	0.01
C6	0.27	0.02	0.12	0.09	0.16	0.24	0.15	0.18	0.01	0.38	0.06	0.07	0.03	0.32	0.27	0.04	0.10	0.41	0.16	0.42	0.03	0.24
C8	0.22	0.01	0.10	0.05	0.15	0.15	0.15	0.02	0.05	0.30	0.02	0.09	0.01	0.27	0.23	0.07	0.14	0.32	0.03	0.32	0.23	0.07
N1	0.23	0.02	0.06	0.03	0.12	0.21	0.09	0.15	0.03	0.31	0.07	0.07	0.09	0.22	0.23	0.03	0.04	0.39	0.13	0.39	0.04	0.21
N2	0.13	0.00	0.08	0.12	0.05	0.08	0.03	0.03	0.09	0.07	0.06	0.06	0.17	0.03	0.11	0.15	0.07	0.30	0.09	0.14	0.19	0.02
N3	0.16	0.02	0.01	0.06	0.09	0.08	0.04	0.06	0.04	0.16	0.04	0.08	0.12	0.09	0.15	0.05	0.02	0.29	0.12	0.21	0.28	0.01
N7	0.25	0.01	0.13	0.08	0.16	0.20	0.17	0.09	0.05	0.35	0.04	0.08	0.02	0.32	0.26	0.08	0.15	0.35	0.05	0.37	0.15	0.14
N9	0.21	0.04	0.07	0.02	0.15	0.13	0.13	0.03	0.04	0.25	0.00	0.11	0.02	0.21	0.21	0.05	0.12	0.30	0.08	0.28	0.27	0.03
O2'	0.36	0.26	0.19	0.14	0.30	0.26	0.21	0.07	0.15	0.27	0.19	0.32	0.04	0.19	0.33	0.18	0.26	0.46	0.01	0.31	0.17	0.10
O3'	0.34	0.10	0.20	0.17	0.21	0.29	0.14	0.15	0.03	0.29	0.02	0.19	0.07	0.20	0.30	0.17	0.27	0.46	0.12	0.43	0.12	0.20
O4'	0.10	0.06	0.03	0.06	0.03	0.03	0.00	0.14	0.09	0.10	0.11	0.01	0.15	0.05	0.09	0.03	0.08	0.19	0.21	0.23	0.35	0.06
O5'	0.15	0.09	0.04	0.08	0.14	0.05	0.13	0.14	0.10	0.17	0.08	0.13	0.09	0.16	0.16	0.06	0.07	0.24	0.22	0.13	0.31	0.08
O6	0.30	0.04	0.18	0.15	0.18	0.31	0.19	0.28	0.03	0.45	0.07	0.07	0.01	0.38	0.31	0.08	0.13	0.45	0.28	0.47	0.06	0.32
OP1	0.24	0.07	0.11	0.07	0.19	0.16	0.19	0.01	0.12	0.29	0.06	0.14	0.11	0.27	0.24	0.10	0.20	0.32	0.07	0.31	0.23	0.06
OP2	0.62	0.39	0.46	0.43	0.56	0.57	0.58	0.44	0.47	0.72	0.37	0.47	0.47	0.70	0.64	0.41	0.53	0.74	0.39	0.73	0.25	0.52
P	0.33	0.17	0.19	0.15	0.29	0.26	0.30	0.10	0.23	0.40	0.16	0.24	0.23	0.39	0.35	0.16	0.28	0.43	0.04	0.41	0.09	0.17

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.05	0.01	0.02	0.02	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.17	0.00	0.11	0.27	0.41	0.20
C2	0.03	0.00	0.01	0.08	0.00	0.05	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.05	0.37	0.02	0.25	0.27	0.18	0.08
C2'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.04	0.01	0.01	0.04	0.04	0.02	0.00	0.08	0.02	0.09	0.08	0.25	0.08
C3'	0.02	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.02	0.12	0.03	0.08	0.06	0.11	0.03	0.02	0.01	0.00	0.07	0.08	0.27	0.02
C4	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.16	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.25	0.01	0.28	0.28	0.15	0.07
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.02	0.00	0.08	0.01	0.06	0.16	0.01	0.06	0.09	0.15	0.06	0.01	0.02	0.00	0.01	0.08	0.41	0.14
C5	0.00	0.00	0.03	0.04	0.00	0.08	0.00	0.26	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.18	0.03	0.37	0.23	0.10	0.06
C5'	0.05	0.11	0.02	0.01	0.16	0.01	0.26	0.00	0.25	0.32	0.18	0.08	0.30	0.34	0.18	0.01	0.02	0.02	0.01	0.07	0.17	0.00
C6	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.06	0.00	0.25	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.24	0.02	0.38	0.20	0.13	0.08
C8	0.02	0.01	0.04	0.12	0.00	0.16	0.00	0.32	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.04	0.06	0.40	0.26	0.10	0.06
N1	0.02	0.00	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.32	0.01	0.32	0.23	0.02	0.01
N3	0.03	0.00	0.01	0.08	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.36	0.02	0.21	0.29	0.27	0.13
N6	0.00	0.00	0.04	0.06	0.00	0.09	0.00	0.30	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.19	0.03	0.43	0.15	0.29	0.17
N7	0.01	0.01	0.04	0.11	0.00	0.15	0.00	0.34	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.07	0.05	0.44	0.20	0.30	0.16
N9	0.00	0.00	0.02	0.03	0.00	0.06	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.15	0.02	0.26	0.29	0.21	0.10
O2'	0.01	0.05	0.00	0.02	0.05	0.01	0.06	0.01	0.06	0.05	0.06	0.05	0.06	0.06	0.03	0.00	0.10	0.00	0.09	0.05	0.23	0.06
O3'	0.17	0.37	0.08	0.01	0.25	0.02	0.18	0.02	0.24	0.04	0.32	0.36	0.19	0.07	0.15	0.10	0.00	0.08	0.06	0.09	0.39	0.04
O4'	0.00	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.02	0.02	0.06	0.01	0.02	0.03	0.05	0.02	0.00	0.08	0.00	0.01	0.36	0.59	0.32
O5'	0.11	0.25	0.09	0.07	0.28	0.01	0.37	0.01	0.38	0.40	0.32	0.21	0.43	0.44	0.26	0.09	0.06	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.27	0.27	0.08	0.08	0.28	0.08	0.23	0.07	0.20	0.26	0.23	0.29	0.15	0.20	0.29	0.05	0.09	0.36	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.41	0.18	0.25	0.27	0.15	0.41	0.10	0.17	0.13	0.10	0.02	0.27	0.29	0.30	0.21	0.23	0.39	0.59	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.20	0.08	0.08	0.02	0.07	0.14	0.06	0.00	0.08	0.06	0.01	0.13	0.17	0.16	0.10	0.06	0.04	0.32	0.00	0.00	0.00	0.00