Doublet Group distance statistics: 53591

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.021, 0.043, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.021 std_dev=0.021
C2	A	0, 0.000, 0.022, 0.044, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.022 std_dev=0.022
C1'	A	0, 0.000, 0.022, 0.045, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.022 std_dev=0.022
C5	A	0, 0.000, 0.026, 0.051, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.026 std_dev=0.026
N3	A	0, 0.000, 0.028, 0.057, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.028 std_dev=0.028
N1	A	0, 0.000, 0.029, 0.058, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.029 std_dev=0.029
C4	A	0, 0.000, 0.034, 0.069, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.034 std_dev=0.034
N2	A	0, 0.000, 0.045, 0.090, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.045 std_dev=0.045
N9	A	0, 0.000, 0.048, 0.095, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.048 std_dev=0.048
O6	A	0, 0.000, 0.055, 0.109, 0.109 max_d=0.109 avg_d=0.055 std_dev=0.055
N7	A	0, 0.000, 0.057, 0.114, 0.114 max_d=0.114 avg_d=0.057 std_dev=0.057
C8	A	0, 0.000, 0.075, 0.151, 0.151 max_d=0.151 avg_d=0.075 std_dev=0.075
P	B	0, 0.000, 0.239, 0.478, 0.478 max_d=0.478 avg_d=0.239 std_dev=0.239
C2'	A	0, 0.000, 0.536, 1.072, 1.072 max_d=1.072 avg_d=0.536 std_dev=0.536
O4'	A	0, 0.000, 0.571, 1.141, 1.141 max_d=1.141 avg_d=0.571 std_dev=0.571
OP1	B	0, 0.000, 0.735, 1.470, 1.470 max_d=1.470 avg_d=0.735 std_dev=0.735
OP2	B	0, 0.000, 0.749, 1.497, 1.497 max_d=1.497 avg_d=0.749 std_dev=0.749
O2'	A	0, 0.000, 0.756, 1.512, 1.512 max_d=1.512 avg_d=0.756 std_dev=0.756
P	A	0, 0.000, 0.867, 1.734, 1.734 max_d=1.734 avg_d=0.867 std_dev=0.867
O5'	B	0, 0.000, 0.965, 1.929, 1.929 max_d=1.929 avg_d=0.965 std_dev=0.965
OP1	A	0, 0.000, 1.000, 2.000, 2.000 max_d=2.000 avg_d=1.000 std_dev=1.000
C4'	A	0, 0.000, 1.090, 2.180, 2.180 max_d=2.180 avg_d=1.090 std_dev=1.090
O5'	A	0, 0.000, 1.099, 2.199, 2.199 max_d=2.199 avg_d=1.099 std_dev=1.099
C3'	A	0, 0.000, 1.153, 2.306, 2.306 max_d=2.306 avg_d=1.153 std_dev=1.153
C5'	B	0, 0.000, 1.187, 2.373, 2.373 max_d=2.373 avg_d=1.187 std_dev=1.187
OP2	A	0, 0.000, 1.266, 2.532, 2.532 max_d=2.532 avg_d=1.266 std_dev=1.266
C5'	A	0, 0.000, 1.348, 2.695, 2.695 max_d=2.695 avg_d=1.348 std_dev=1.348
O3'	A	0, 0.000, 1.785, 3.571, 3.571 max_d=3.571 avg_d=1.785 std_dev=1.785
C4'	B	0, 0.000, 2.197, 4.394, 4.394 max_d=4.394 avg_d=2.197 std_dev=2.197
O4'	B	0, 0.000, 2.560, 5.120, 5.120 max_d=5.120 avg_d=2.560 std_dev=2.560
C3'	B	0, 0.000, 2.608, 5.216, 5.216 max_d=5.216 avg_d=2.608 std_dev=2.608
C8	B	0, 0.000, 3.137, 6.273, 6.273 max_d=6.273 avg_d=3.137 std_dev=3.137
C1'	B	0, 0.000, 3.320, 6.639, 6.639 max_d=6.639 avg_d=3.320 std_dev=3.320
C2'	B	0, 0.000, 3.403, 6.806, 6.806 max_d=6.806 avg_d=3.403 std_dev=3.403
N9	B	0, 0.000, 3.510, 7.021, 7.021 max_d=7.021 avg_d=3.510 std_dev=3.510
O3'	B	0, 0.000, 3.603, 7.206, 7.206 max_d=7.206 avg_d=3.603 std_dev=3.603
N7	B	0, 0.000, 3.812, 7.625, 7.625 max_d=7.625 avg_d=3.812 std_dev=3.812
C4	B	0, 0.000, 4.371, 8.741, 8.741 max_d=8.741 avg_d=4.371 std_dev=4.371
C5	B	0, 0.000, 4.511, 9.023, 9.023 max_d=9.023 avg_d=4.511 std_dev=4.511
O2'	B	0, 0.000, 4.520, 9.039, 9.039 max_d=9.039 avg_d=4.520 std_dev=4.520
N3	B	0, 0.000, 5.075, 10.149, 10.149 max_d=10.149 avg_d=5.075 std_dev=5.075
C6	B	0, 0.000, 5.405, 10.810, 10.810 max_d=10.810 avg_d=5.405 std_dev=5.405
C2	B	0, 0.000, 5.797, 11.593, 11.593 max_d=11.593 avg_d=5.797 std_dev=5.797
N6	B	0, 0.000, 5.805, 11.609, 11.609 max_d=11.609 avg_d=5.805 std_dev=5.805
N1	B	0, 0.000, 5.989, 11.977, 11.977 max_d=11.977 avg_d=5.989 std_dev=5.989

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.04	0.02	0.00	0.00	0.01	0.28	0.01	0.09	0.02	0.29	0.01	0.06
C2	0.02	0.00	0.29	0.29	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.06	0.12	0.11	0.01	0.28	0.12	0.24
C2'	0.00	0.29	0.00	0.00	0.18	0.01	0.14	0.15	0.21	0.07	0.27	0.31	0.27	0.01	0.04	0.01	0.04	0.02	0.27	0.20	0.22	0.24	0.32
C3'	0.01	0.29	0.00	0.00	0.30	0.00	0.41	0.00	0.45	0.30	0.39	0.22	0.22	0.40	0.23	0.01	0.01	0.01	0.05	0.51	0.07	0.03	0.05
C4	0.01	0.00	0.18	0.30	0.00	0.09	0.00	0.09	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.14	0.01	0.06	0.12	0.02	0.29	0.13	0.25
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.09	0.00	0.17	0.00	0.18	0.18	0.11	0.02	0.01	0.20	0.10	0.23	0.03	0.00	0.01	0.22	0.33	0.06	0.06
C5	0.00	0.00	0.14	0.41	0.00	0.17	0.00	0.19	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.21	0.18	0.02	0.23	0.02	0.28	0.23	0.37
C5'	0.05	0.06	0.15	0.00	0.09	0.00	0.19	0.00	0.22	0.18	0.15	0.01	0.02	0.23	0.08	0.07	0.16	0.01	0.00	0.28	0.23	0.05	0.01
C6	0.01	0.01	0.21	0.45	0.01	0.18	0.01	0.22	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.18	0.22	0.04	0.27	0.01	0.28	0.26	0.41
C8	0.00	0.00	0.07	0.30	0.00	0.18	0.01	0.18	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.25	0.15	0.06	0.17	0.03	0.28	0.19	0.33
N1	0.01	0.00	0.27	0.39	0.00	0.11	0.00	0.15	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.12	0.10	0.09	0.20	0.01	0.28	0.20	0.34
N2	0.04	0.00	0.31	0.22	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.16	0.16	0.07	0.01	0.28	0.08	0.20
N3	0.02	0.00	0.27	0.22	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.14	0.12	0.05	0.02	0.29	0.08	0.19
N7	0.00	0.00	0.01	0.40	0.00	0.20	0.00	0.23	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.27	0.24	0.03	0.27	0.03	0.26	0.26	0.42
N9	0.00	0.01	0.04	0.23	0.00	0.10	0.01	0.08	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.16	0.02	0.01	0.06	0.03	0.29	0.10	0.21
O2'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.14	0.23	0.21	0.07	0.18	0.25	0.12	0.01	0.03	0.27	0.16	0.00	0.08	0.16	0.16	0.20	0.15	0.09	0.24
O3'	0.28	0.06	0.04	0.01	0.01	0.03	0.18	0.16	0.22	0.15	0.10	0.16	0.14	0.24	0.02	0.08	0.00	0.18	0.21	0.32	0.18	0.25	0.11
O4'	0.01	0.12	0.02	0.01	0.06	0.00	0.02	0.01	0.04	0.06	0.09	0.16	0.12	0.03	0.01	0.16	0.18	0.00	0.03	0.01	0.53	0.09	0.19
O5'	0.09	0.11	0.27	0.05	0.12	0.01	0.23	0.00	0.27	0.17	0.20	0.07	0.05	0.27	0.06	0.16	0.21	0.03	0.00	0.34	0.01	0.02	0.00
O6	0.02	0.01	0.20	0.51	0.02	0.22	0.02	0.28	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.20	0.32	0.01	0.34	0.00	0.27	0.33	0.48
OP1	0.29	0.28	0.22	0.07	0.29	0.33	0.28	0.23	0.28	0.28	0.28	0.28	0.29	0.26	0.29	0.15	0.18	0.53	0.01	0.27	0.00	0.00	0.00
OP2	0.01	0.12	0.24	0.03	0.13	0.06	0.23	0.05	0.26	0.19	0.20	0.08	0.08	0.26	0.10	0.09	0.25	0.09	0.02	0.33	0.00	0.00	0.00
P	0.06	0.24	0.32	0.05	0.25	0.06	0.37	0.01	0.41	0.33	0.34	0.20	0.19	0.42	0.21	0.24	0.11	0.19	0.00	0.48	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	1.09	2.15	1.19	0.52	1.87	0.30	2.22	0.21	2.54	1.70	2.47	1.84	2.88	2.15	1.53	1.24	0.21	0.70	0.23	0.06	0.37	0.07
C2	0.79	1.45	0.96	0.33	1.34	0.11	1.61	0.06	1.76	1.35	1.66	1.26	1.97	1.65	1.14	0.97	0.02	0.45	0.12	0.12	0.42	0.10
C2'	0.71	1.79	0.80	0.18	1.48	0.02	1.83	0.10	2.16	1.28	2.10	1.47	2.50	1.73	1.13	0.82	0.08	0.35	0.13	0.40	0.66	0.45
C3'	0.78	2.08	0.86	0.21	1.69	0.02	2.09	0.10	2.50	1.43	2.45	1.69	2.92	1.96	1.27	0.89	0.05	0.37	0.14	0.38	0.71	0.43
C4	0.79	1.62	0.93	0.28	1.45	0.08	1.79	0.07	2.01	1.42	1.90	1.38	2.31	1.81	1.20	0.92	0.09	0.44	0.11	0.10	0.41	0.10
C4'	1.04	2.33	1.15	0.46	1.94	0.20	2.34	0.11	2.76	1.69	2.70	1.94	3.17	2.22	1.53	1.22	0.17	0.59	0.11	0.06	0.47	0.16
C5	0.55	1.30	0.68	0.07	1.18	0.12	1.52	0.04	1.72	1.21	1.59	1.07	2.02	1.58	0.96	0.63	0.37	0.22	0.00	0.12	0.42	0.11
C5'	0.88	2.21	1.00	0.31	1.82	0.05	2.24	0.01	2.67	1.59	2.61	1.81	3.11	2.13	1.40	1.04	0.01	0.45	0.01	0.10	0.53	0.22
C6	0.36	0.99	0.52	0.06	0.92	0.26	1.24	0.12	1.39	1.01	1.25	0.79	1.66	1.33	0.74	0.44	0.53	0.06	0.08	0.15	0.42	0.12
C8	0.69	1.62	0.81	0.17	1.42	0.02	1.80	0.03	2.07	1.39	1.95	1.34	2.41	1.81	1.15	0.77	0.25	0.35	0.05	0.09	0.42	0.11
N1	0.49	1.07	0.66	0.07	1.00	0.14	1.28	0.07	1.41	1.07	1.29	0.89	1.63	1.36	0.84	0.62	0.35	0.17	0.02	0.16	0.43	0.11
N2	0.94	1.51	1.11	0.48	1.42	0.25	1.63	0.12	1.75	1.42	1.67	1.36	1.89	1.67	1.25	1.16	0.19	0.59	0.20	0.13	0.40	0.09
N3	0.94	1.74	1.08	0.43	1.57	0.21	1.88	0.13	2.08	1.52	1.99	1.52	2.34	1.89	1.33	1.11	0.10	0.57	0.18	0.09	0.40	0.09
N7	0.51	1.33	0.63	0.02	1.19	0.17	1.56	0.05	1.79	1.22	1.65	1.07	2.12	1.61	0.95	0.56	0.45	0.18	0.02	0.11	0.42	0.12
N9	0.87	1.81	0.98	0.33	1.59	0.12	1.95	0.10	2.22	1.51	2.12	1.53	2.55	1.94	1.30	0.99	0.04	0.50	0.13	0.08	0.40	0.10
O2'	1.14	2.11	1.22	0.64	1.82	0.48	2.10	0.37	2.39	1.60	2.36	1.83	2.66	1.99	1.50	1.24	0.45	0.83	0.32	0.08	0.23	0.07
O3'	1.15	2.52	1.25	0.60	2.10	0.34	2.50	0.23	2.94	1.79	2.90	2.12	3.37	2.34	1.65	1.29	0.39	0.71	0.19	0.10	0.38	0.11
O4'	1.18	2.34	1.30	0.60	2.01	0.35	2.39	0.26	2.75	1.82	2.69	2.00	3.13	2.31	1.65	1.37	0.28	0.75	0.29	0.17	0.30	0.03
O5'	0.67	1.90	0.77	0.10	1.57	0.13	2.01	0.11	2.40	1.42	2.31	1.52	2.84	1.94	1.19	0.76	0.28	0.26	0.11	0.14	0.60	0.29
O6	0.12	0.68	0.28	0.27	0.65	0.44	0.97	0.22	1.11	0.80	0.95	0.50	1.38	1.09	0.50	0.15	0.80	0.16	0.18	0.17	0.40	0.12
OP1	0.58	1.69	0.64	0.02	1.40	0.17	1.80	0.13	2.15	1.29	2.06	1.34	2.55	1.76	1.06	0.59	0.43	0.24	0.12	0.18	0.65	0.36
OP2	0.61	1.91	0.72	0.03	1.56	0.19	2.01	0.15	2.43	1.40	2.34	1.51	2.90	1.94	1.16	0.69	0.38	0.20	0.14	0.13	0.62	0.30
P	0.56	1.82	0.63	0.05	1.48	0.24	1.93	0.20	2.32	1.33	2.23	1.43	2.77	1.86	1.10	0.59	0.46	0.18	0.19	0.22	0.72	0.39

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.22	0.00	0.25	0.43	0.22	0.36
C2	0.02	0.00	0.27	0.20	0.01	0.05	0.00	0.21	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.08	0.13	0.07	0.23	0.56	0.17	0.32
C2'	0.00	0.27	0.00	0.00	0.14	0.03	0.06	0.08	0.12	0.13	0.21	0.27	0.08	0.07	0.00	0.00	0.01	0.03	0.47	0.79	0.47	0.69
C3'	0.02	0.20	0.00	0.00	0.17	0.00	0.19	0.04	0.22	0.11	0.22	0.18	0.23	0.16	0.11	0.00	0.00	0.00	0.17	0.34	0.15	0.31
C4	0.01	0.01	0.14	0.17	0.00	0.07	0.00	0.21	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.11	0.04	0.24	0.56	0.20	0.33
C4'	0.00	0.05	0.03	0.00	0.07	0.00	0.11	0.00	0.10	0.12	0.08	0.04	0.12	0.13	0.08	0.09	0.00	0.00	0.00	0.03	0.03	0.05
C5	0.01	0.00	0.06	0.19	0.00	0.11	0.00	0.27	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.18	0.06	0.02	0.22	0.60	0.21	0.31
C5'	0.04	0.21	0.08	0.04	0.21	0.00	0.27	0.00	0.29	0.25	0.26	0.18	0.32	0.29	0.18	0.01	0.11	0.01	0.00	0.03	0.06	0.01
C6	0.01	0.00	0.12	0.22	0.00	0.10	0.00	0.29	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.14	0.06	0.04	0.22	0.61	0.19	0.30
C8	0.01	0.01	0.13	0.11	0.00	0.12	0.00	0.25	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.27	0.05	0.05	0.23	0.57	0.25	0.33
N1	0.02	0.00	0.21	0.22	0.01	0.08	0.00	0.26	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.09	0.06	0.22	0.60	0.18	0.31
N3	0.02	0.00	0.27	0.18	0.00	0.04	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.15	0.07	0.23	0.53	0.17	0.33
N6	0.01	0.00	0.08	0.23	0.00	0.12	0.00	0.32	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.19	0.03	0.03	0.21	0.62	0.20	0.28
N7	0.00	0.00	0.07	0.16	0.00	0.13	0.00	0.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.28	0.03	0.02	0.21	0.61	0.23	0.30
N9	0.00	0.01	0.00	0.11	0.00	0.08	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.14	0.12	0.00	0.25	0.52	0.22	0.34
O2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.07	0.09	0.18	0.01	0.14	0.27	0.02	0.11	0.19	0.28	0.14	0.00	0.04	0.09	0.38	0.81	0.42	0.68
O3'	0.22	0.13	0.01	0.00	0.11	0.00	0.06	0.11	0.06	0.05	0.09	0.15	0.03	0.03	0.12	0.04	0.00	0.12	0.01	0.12	0.18	0.07
O4'	0.00	0.07	0.03	0.00	0.04	0.00	0.02	0.01	0.04	0.05	0.06	0.07	0.03	0.02	0.00	0.09	0.12	0.00	0.09	0.12	0.06	0.13
O5'	0.25	0.23	0.47	0.17	0.24	0.00	0.22	0.00	0.22	0.23	0.22	0.23	0.21	0.21	0.25	0.38	0.01	0.09	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.43	0.56	0.79	0.34	0.56	0.03	0.60	0.03	0.61	0.57	0.60	0.53	0.62	0.61	0.52	0.81	0.12	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.22	0.17	0.47	0.15	0.20	0.03	0.21	0.06	0.19	0.25	0.18	0.17	0.20	0.23	0.22	0.42	0.18	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.36	0.32	0.69	0.31	0.33	0.05	0.31	0.01	0.30	0.33	0.31	0.33	0.28	0.30	0.34	0.68	0.07	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00