Doublet Group distance statistics: 53592

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.012, 0.025, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.012 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.000, 0.013, 0.025, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.000, 0.018, 0.035, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.018 std_dev=0.018
C1'	A	0, 0.000, 0.022, 0.043, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.022 std_dev=0.022
C5	A	0, 0.000, 0.023, 0.047, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.023 std_dev=0.023
C4	A	0, 0.000, 0.025, 0.049, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.025 std_dev=0.025
C8	A	0, 0.000, 0.026, 0.051, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.026 std_dev=0.026
N7	A	0, 0.000, 0.026, 0.052, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.026 std_dev=0.026
N3	A	0, 0.000, 0.026, 0.053, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.026 std_dev=0.026
N9	A	0, 0.000, 0.040, 0.081, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.040 std_dev=0.040
O6	A	0, 0.000, 0.052, 0.103, 0.103 max_d=0.103 avg_d=0.052 std_dev=0.052
N2	A	0, 0.000, 0.055, 0.111, 0.111 max_d=0.111 avg_d=0.055 std_dev=0.055
C3'	A	0, 0.000, 0.162, 0.324, 0.324 max_d=0.324 avg_d=0.162 std_dev=0.162
O3'	A	0, 0.000, 0.242, 0.484, 0.484 max_d=0.484 avg_d=0.242 std_dev=0.242
C2'	A	0, 0.000, 0.269, 0.538, 0.538 max_d=0.538 avg_d=0.269 std_dev=0.269
C2'	B	0, 0.000, 0.322, 0.643, 0.643 max_d=0.643 avg_d=0.322 std_dev=0.322
O4'	A	0, 0.000, 0.340, 0.681, 0.681 max_d=0.681 avg_d=0.340 std_dev=0.340
C4'	A	0, 0.000, 0.489, 0.978, 0.978 max_d=0.978 avg_d=0.489 std_dev=0.489
OP1	B	0, 0.000, 0.509, 1.018, 1.018 max_d=1.018 avg_d=0.509 std_dev=0.509
O5'	A	0, 0.000, 0.539, 1.077, 1.077 max_d=1.077 avg_d=0.539 std_dev=0.539
O2'	A	0, 0.000, 0.543, 1.085, 1.085 max_d=1.085 avg_d=0.543 std_dev=0.543
OP1	A	0, 0.000, 0.666, 1.333, 1.333 max_d=1.333 avg_d=0.666 std_dev=0.666
P	B	0, 0.000, 0.674, 1.348, 1.348 max_d=1.348 avg_d=0.674 std_dev=0.674
OP2	B	0, 0.000, 0.677, 1.354, 1.354 max_d=1.354 avg_d=0.677 std_dev=0.677
P	A	0, 0.000, 0.782, 1.564, 1.564 max_d=1.564 avg_d=0.782 std_dev=0.782
C5'	A	0, 0.000, 0.854, 1.708, 1.708 max_d=1.708 avg_d=0.854 std_dev=0.854
O2'	B	0, 0.000, 0.877, 1.755, 1.755 max_d=1.755 avg_d=0.877 std_dev=0.877
O5'	B	0, 0.000, 1.065, 2.130, 2.130 max_d=2.130 avg_d=1.065 std_dev=1.065
C3'	B	0, 0.000, 1.271, 2.543, 2.543 max_d=2.543 avg_d=1.271 std_dev=1.271
C5'	B	0, 0.000, 1.472, 2.944, 2.944 max_d=2.944 avg_d=1.472 std_dev=1.472
C1'	B	0, 0.000, 1.587, 3.173, 3.173 max_d=3.173 avg_d=1.587 std_dev=1.587
C4'	B	0, 0.000, 1.774, 3.547, 3.547 max_d=3.547 avg_d=1.774 std_dev=1.774
OP2	A	0, 0.000, 1.960, 3.921, 3.921 max_d=3.921 avg_d=1.960 std_dev=1.960
O4'	B	0, 0.000, 2.114, 4.229, 4.229 max_d=4.229 avg_d=2.114 std_dev=2.114
N9	B	0, 0.000, 2.324, 4.647, 4.647 max_d=4.647 avg_d=2.324 std_dev=2.324
O3'	B	0, 0.000, 2.438, 4.876, 4.876 max_d=4.876 avg_d=2.438 std_dev=2.438
C8	B	0, 0.000, 2.789, 5.578, 5.578 max_d=5.578 avg_d=2.789 std_dev=2.789
C4	B	0, 0.000, 3.193, 6.385, 6.385 max_d=6.385 avg_d=3.193 std_dev=3.193
N3	B	0, 0.000, 3.237, 6.473, 6.473 max_d=6.473 avg_d=3.237 std_dev=3.237
N7	B	0, 0.000, 3.975, 7.949, 7.949 max_d=7.949 avg_d=3.975 std_dev=3.975
C5	B	0, 0.000, 4.184, 8.368, 8.368 max_d=8.368 avg_d=4.184 std_dev=4.184
C2	B	0, 0.000, 4.213, 8.425, 8.425 max_d=8.425 avg_d=4.213 std_dev=4.213
N1	B	0, 0.000, 5.208, 10.416, 10.416 max_d=10.416 avg_d=5.208 std_dev=5.208
C6	B	0, 0.000, 5.277, 10.555, 10.555 max_d=10.555 avg_d=5.277 std_dev=5.277
N6	B	0, 0.000, 6.423, 12.846, 12.846 max_d=12.846 avg_d=6.423 std_dev=6.423

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.36	0.02	0.22	0.64	0.37
C2	0.02	0.00	0.06	0.01	0.01	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.15	0.07	0.11	0.38	0.00	0.13	0.88	0.50
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.01	0.04	0.02	0.07	0.05	0.07	0.07	0.05	0.01	0.00	0.02	0.00	0.51	0.02	0.40	0.89	0.52
C3'	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.29	0.03	0.34	0.40	0.22
C4	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.04	0.04	0.39	0.01	0.13	0.92	0.51
C4'	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.00	0.04	0.14	0.02	0.13	0.08	0.12	0.04	0.01	0.00	0.00	0.02	0.08	0.09	0.01	0.04
C5	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.35	0.01	0.04	1.04	0.54
C5'	0.03	0.00	0.04	0.01	0.07	0.00	0.15	0.00	0.14	0.23	0.07	0.05	0.01	0.23	0.10	0.03	0.01	0.00	0.00	0.20	0.05	0.00	0.02
C6	0.00	0.00	0.02	0.02	0.00	0.04	0.01	0.14	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.04	0.00	0.33	0.00	0.00	1.04	0.53
C8	0.01	0.00	0.07	0.01	0.00	0.14	0.01	0.23	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.15	0.01	0.12	0.35	0.03	0.06	1.06	0.54
N1	0.01	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.09	0.05	0.06	0.36	0.01	0.06	0.97	0.52
N2	0.04	0.00	0.07	0.03	0.00	0.13	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.19	0.09	0.16	0.39	0.01	0.16	0.83	0.49
N3	0.02	0.00	0.07	0.01	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.16	0.05	0.12	0.39	0.00	0.17	0.83	0.48
N7	0.01	0.01	0.05	0.01	0.00	0.12	0.01	0.23	0.02	0.00	0.02	0.02	0.00	0.00	0.00	0.13	0.02	0.09	0.32	0.04	0.00	1.13	0.56
N9	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.02	0.02	0.40	0.02	0.15	0.89	0.49
O2'	0.01	0.15	0.00	0.01	0.05	0.01	0.02	0.03	0.01	0.15	0.09	0.19	0.16	0.13	0.02	0.00	0.04	0.01	0.54	0.01	0.49	1.06	0.59
O3'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.04	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.05	0.09	0.05	0.02	0.02	0.04	0.00	0.03	0.16	0.02	0.28	0.19	0.07
O4'	0.00	0.11	0.00	0.01	0.04	0.00	0.03	0.00	0.00	0.12	0.06	0.16	0.12	0.09	0.02	0.01	0.03	0.00	0.12	0.04	0.07	0.19	0.12
O5'	0.36	0.38	0.51	0.29	0.39	0.02	0.35	0.00	0.33	0.35	0.36	0.39	0.39	0.32	0.40	0.54	0.16	0.12	0.00	0.28	0.01	0.02	0.00
O6	0.02	0.00	0.02	0.03	0.01	0.08	0.01	0.20	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.04	0.02	0.01	0.02	0.04	0.28	0.00	0.08	1.06	0.52
OP1	0.22	0.13	0.40	0.34	0.13	0.09	0.04	0.05	0.00	0.06	0.06	0.16	0.17	0.00	0.15	0.49	0.28	0.07	0.01	0.08	0.00	0.00	0.00
OP2	0.64	0.88	0.89	0.40	0.92	0.01	1.04	0.00	1.04	1.06	0.97	0.83	0.83	1.13	0.89	1.06	0.19	0.19	0.02	1.06	0.00	0.00	0.01
P	0.37	0.50	0.52	0.22	0.51	0.04	0.54	0.02	0.53	0.54	0.52	0.49	0.48	0.56	0.49	0.59	0.07	0.12	0.00	0.52	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.41	2.67	0.15	0.83	2.10	0.78	2.93	0.69	3.70	1.84	3.49	1.95	4.54	2.75	1.42	0.49	1.55	0.02	0.63	0.22	0.32	0.39
C2	0.37	1.94	0.12	0.60	1.73	0.70	2.49	0.67	2.89	1.81	2.56	1.48	3.51	2.61	1.28	0.31	1.04	0.03	0.64	0.31	0.33	0.43
C2'	0.37	2.70	0.28	0.96	2.05	0.81	2.83	0.75	3.61	1.73	3.49	1.96	4.39	2.62	1.35	0.63	1.69	0.04	0.72	0.35	0.44	0.50
C3'	0.47	2.91	0.13	0.84	2.17	0.70	2.93	0.63	3.76	1.78	3.72	2.12	4.51	2.65	1.44	0.52	1.62	0.12	0.58	0.21	0.34	0.37
C4	0.35	2.28	0.16	0.74	1.90	0.79	2.74	0.72	3.34	1.84	3.03	1.67	4.13	2.73	1.33	0.42	1.32	0.03	0.67	0.31	0.33	0.44
C4'	0.56	3.04	0.09	0.63	2.30	0.62	3.09	0.54	3.95	1.93	3.89	2.22	4.76	2.82	1.56	0.28	1.40	0.14	0.46	0.10	0.22	0.26
C5	0.32	2.15	0.15	0.69	1.81	0.78	2.63	0.71	3.20	1.81	2.89	1.57	3.98	2.66	1.28	0.39	1.22	0.06	0.66	0.34	0.30	0.43
C5'	0.54	3.04	0.09	0.62	2.29	0.66	3.09	0.59	3.95	1.93	3.89	2.21	4.78	2.83	1.55	0.27	1.36	0.09	0.53	0.21	0.31	0.34
C6	0.32	1.93	0.12	0.58	1.67	0.72	2.45	0.65	2.93	1.75	2.60	1.42	3.63	2.55	1.22	0.32	1.02	0.04	0.61	0.34	0.25	0.40
C8	0.34	2.42	0.17	0.78	1.95	0.83	2.80	0.73	3.50	1.84	3.24	1.75	4.35	2.74	1.34	0.46	1.42	0.06	0.68	0.32	0.31	0.43
N1	0.33	1.82	0.10	0.53	1.62	0.67	2.35	0.63	2.76	1.74	2.43	1.36	3.38	2.49	1.20	0.28	0.93	0.01	0.60	0.34	0.27	0.40
N2	0.40	1.76	0.08	0.51	1.64	0.61	2.31	0.62	2.59	1.78	2.28	1.38	3.05	2.50	1.25	0.24	0.86	0.09	0.62	0.29	0.35	0.44
N3	0.38	2.21	0.15	0.72	1.90	0.76	2.71	0.71	3.24	1.85	2.90	1.66	3.95	2.73	1.35	0.40	1.27	0.01	0.67	0.28	0.35	0.44
N7	0.31	2.26	0.16	0.73	1.86	0.81	2.70	0.72	3.33	1.82	3.04	1.63	4.16	2.69	1.29	0.42	1.30	0.08	0.67	0.35	0.30	0.43
N9	0.36	2.47	0.16	0.80	1.99	0.81	2.84	0.72	3.54	1.85	3.28	1.80	4.39	2.76	1.37	0.47	1.45	0.03	0.67	0.29	0.34	0.43
O2'	0.26	2.49	0.49	1.15	1.87	0.89	2.60	0.84	3.32	1.55	3.21	1.80	4.01	2.39	1.20	0.84	1.85	0.00	0.84	0.47	0.56	0.62
O3'	0.49	2.90	0.13	0.84	2.16	0.64	2.86	0.56	3.67	1.73	3.66	2.13	4.32	2.55	1.43	0.53	1.66	0.17	0.50	0.10	0.25	0.28
O4'	0.49	2.84	0.05	0.65	2.21	0.68	3.05	0.58	3.88	1.93	3.71	2.07	4.74	2.84	1.51	0.31	1.39	0.05	0.49	0.09	0.21	0.26
O5'	0.56	2.86	0.14	0.53	2.25	0.58	3.11	0.44	3.92	2.06	3.74	2.08	4.79	2.96	1.59	0.24	1.31	0.14	0.32	0.11	0.03	0.06
O6	0.30	1.82	0.10	0.52	1.60	0.68	2.35	0.61	2.81	1.71	2.49	1.33	3.50	2.47	1.17	0.28	0.92	0.05	0.56	0.33	0.19	0.36
OP1	0.57	2.98	0.13	0.57	2.29	0.63	3.11	0.54	3.95	2.02	3.85	2.17	4.80	2.92	1.59	0.22	1.32	0.12	0.47	0.14	0.16	0.26
OP2	0.57	2.61	0.16	0.44	2.17	0.46	3.08	0.21	3.80	2.17	3.52	1.90	4.71	3.06	1.60	0.26	1.26	0.21	0.04	0.55	0.48	0.34
P	0.55	2.80	0.12	0.53	2.22	0.56	3.09	0.39	3.88	2.07	3.69	2.03	4.77	2.97	1.57	0.28	1.31	0.14	0.27	0.20	0.11	0.02

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.02	0.21	0.00	0.32	0.61	0.19	0.31
C2	0.03	0.00	0.35	0.31	0.01	0.01	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.07	0.19	0.55	1.19	0.34	0.58
C2'	0.00	0.35	0.00	0.00	0.17	0.00	0.06	0.16	0.14	0.19	0.27	0.35	0.07	0.11	0.00	0.00	0.01	0.00	0.05	0.21	0.29	0.03
C3'	0.01	0.31	0.00	0.00	0.26	0.00	0.28	0.01	0.32	0.18	0.34	0.27	0.32	0.24	0.19	0.02	0.00	0.01	0.05	0.10	0.17	0.01
C4	0.00	0.01	0.17	0.26	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.04	0.11	0.61	1.21	0.35	0.63
C4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.03	0.12	0.01	0.02	0.04	0.10	0.06	0.26	0.02	0.00	0.01	0.05	0.07	0.02
C5	0.01	0.01	0.06	0.28	0.00	0.05	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.20	0.12	0.06	0.76	1.54	0.43	0.80
C5'	0.06	0.09	0.16	0.01	0.05	0.00	0.02	0.00	0.04	0.07	0.06	0.09	0.03	0.05	0.01	0.08	0.15	0.00	0.00	0.00	0.05	0.01
C6	0.01	0.00	0.14	0.32	0.01	0.03	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.15	0.15	0.11	0.75	1.60	0.43	0.82
C8	0.02	0.01	0.19	0.18	0.00	0.12	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.36	0.08	0.11	0.83	1.47	0.44	0.84
N1	0.02	0.00	0.27	0.34	0.01	0.01	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.15	0.66	1.43	0.40	0.72
N3	0.03	0.00	0.35	0.27	0.00	0.02	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.17	0.01	0.18	0.49	1.03	0.30	0.51
N6	0.02	0.01	0.07	0.32	0.01	0.04	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.23	0.19	0.09	0.81	1.78	0.47	0.91
N7	0.02	0.01	0.11	0.24	0.00	0.10	0.00	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.35	0.15	0.05	0.87	1.73	0.49	0.94
N9	0.01	0.01	0.00	0.19	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.15	0.00	0.00	0.61	1.10	0.33	0.59
O2'	0.02	0.15	0.00	0.02	0.05	0.26	0.20	0.08	0.15	0.36	0.01	0.17	0.23	0.35	0.15	0.00	0.01	0.19	0.13	0.19	0.18	0.04
O3'	0.21	0.07	0.01	0.00	0.04	0.02	0.12	0.15	0.15	0.08	0.13	0.01	0.19	0.15	0.00	0.01	0.00	0.17	0.04	0.02	0.06	0.06
O4'	0.00	0.19	0.00	0.01	0.11	0.00	0.06	0.00	0.11	0.11	0.15	0.18	0.09	0.05	0.00	0.19	0.17	0.00	0.31	0.51	0.38	0.32
O5'	0.32	0.55	0.05	0.05	0.61	0.01	0.76	0.00	0.75	0.83	0.66	0.49	0.81	0.87	0.61	0.13	0.04	0.31	0.00	0.02	0.00	0.00
OP1	0.61	1.19	0.21	0.10	1.21	0.05	1.54	0.00	1.60	1.47	1.43	1.03	1.78	1.73	1.10	0.19	0.02	0.51	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.19	0.34	0.29	0.17	0.35	0.07	0.43	0.05	0.43	0.44	0.40	0.30	0.47	0.49	0.33	0.18	0.06	0.38	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.31	0.58	0.03	0.01	0.63	0.02	0.80	0.01	0.82	0.84	0.72	0.51	0.91	0.94	0.59	0.04	0.06	0.32	0.00	0.00	0.00	0.00