Doublet Group distance statistics: 53593

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.007, 0.014, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.007 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.000, 0.009, 0.019, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.009 std_dev=0.009
N7	A	0, 0.000, 0.010, 0.019, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.010 std_dev=0.010
C8	A	0, 0.000, 0.014, 0.029, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.014 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.000, 0.015, 0.029, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.015 std_dev=0.015
O6	A	0, 0.000, 0.016, 0.032, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.016 std_dev=0.016
N9	A	0, 0.000, 0.016, 0.033, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.016 std_dev=0.016
N1	A	0, 0.000, 0.021, 0.042, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.021 std_dev=0.021
N3	A	0, 0.000, 0.024, 0.048, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.024 std_dev=0.024
C2	A	0, 0.000, 0.028, 0.056, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.028 std_dev=0.028
C1'	A	0, 0.000, 0.040, 0.079, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.040 std_dev=0.040
N2	A	0, 0.000, 0.045, 0.091, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.045 std_dev=0.045
OP1	B	0, 0.000, 0.191, 0.381, 0.381 max_d=0.381 avg_d=0.191 std_dev=0.191
OP2	B	0, 0.000, 0.202, 0.405, 0.405 max_d=0.405 avg_d=0.202 std_dev=0.202
C2'	A	0, 0.000, 0.509, 1.017, 1.017 max_d=1.017 avg_d=0.509 std_dev=0.509
O4'	A	0, 0.000, 0.578, 1.157, 1.157 max_d=1.157 avg_d=0.578 std_dev=0.578
P	B	0, 0.000, 0.614, 1.228, 1.228 max_d=1.228 avg_d=0.614 std_dev=0.614
O2'	A	0, 0.000, 0.869, 1.737, 1.737 max_d=1.737 avg_d=0.869 std_dev=0.869
C4'	A	0, 0.000, 0.994, 1.988, 1.988 max_d=1.988 avg_d=0.994 std_dev=0.994
C3'	A	0, 0.000, 0.998, 1.995, 1.995 max_d=1.995 avg_d=0.998 std_dev=0.998
O5'	A	0, 0.000, 1.116, 2.233, 2.233 max_d=2.233 avg_d=1.116 std_dev=1.116
C5'	A	0, 0.000, 1.241, 2.482, 2.482 max_d=2.482 avg_d=1.241 std_dev=1.241
OP2	A	0, 0.000, 1.275, 2.549, 2.549 max_d=2.549 avg_d=1.275 std_dev=1.275
O5'	B	0, 0.000, 1.471, 2.942, 2.942 max_d=2.942 avg_d=1.471 std_dev=1.471
P	A	0, 0.000, 1.476, 2.952, 2.952 max_d=2.952 avg_d=1.476 std_dev=1.476
O3'	B	0, 0.000, 1.579, 3.158, 3.158 max_d=3.158 avg_d=1.579 std_dev=1.579
O3'	A	0, 0.000, 1.583, 3.166, 3.166 max_d=3.166 avg_d=1.583 std_dev=1.583
C4'	B	0, 0.000, 1.645, 3.291, 3.291 max_d=3.291 avg_d=1.645 std_dev=1.645
C3'	B	0, 0.000, 1.763, 3.527, 3.527 max_d=3.527 avg_d=1.763 std_dev=1.763
C5'	B	0, 0.000, 1.823, 3.645, 3.645 max_d=3.645 avg_d=1.823 std_dev=1.823
O4'	B	0, 0.000, 1.980, 3.959, 3.959 max_d=3.959 avg_d=1.980 std_dev=1.980
OP1	A	0, 0.000, 2.047, 4.094, 4.094 max_d=4.094 avg_d=2.047 std_dev=2.047
O2'	B	0, 0.000, 2.068, 4.136, 4.136 max_d=4.136 avg_d=2.068 std_dev=2.068
C2'	B	0, 0.000, 2.132, 4.265, 4.265 max_d=4.265 avg_d=2.132 std_dev=2.132
C1'	B	0, 0.000, 2.270, 4.540, 4.540 max_d=4.540 avg_d=2.270 std_dev=2.270
N9	B	0, 0.000, 2.754, 5.507, 5.507 max_d=5.507 avg_d=2.754 std_dev=2.754
C8	B	0, 0.000, 2.784, 5.568, 5.568 max_d=5.568 avg_d=2.784 std_dev=2.784
N7	B	0, 0.000, 3.354, 6.708, 6.708 max_d=6.708 avg_d=3.354 std_dev=3.354
C4	B	0, 0.000, 3.402, 6.805, 6.805 max_d=6.805 avg_d=3.402 std_dev=3.402
C5	B	0, 0.000, 3.711, 7.423, 7.423 max_d=7.423 avg_d=3.711 std_dev=3.711
N3	B	0, 0.000, 3.774, 7.548, 7.548 max_d=7.548 avg_d=3.774 std_dev=3.774
C6	B	0, 0.000, 4.397, 8.793, 8.793 max_d=8.793 avg_d=4.397 std_dev=4.397
C2	B	0, 0.000, 4.431, 8.862, 8.862 max_d=8.862 avg_d=4.431 std_dev=4.431
N1	B	0, 0.000, 4.734, 9.469, 9.469 max_d=9.469 avg_d=4.734 std_dev=4.734
N6	B	0, 0.000, 4.794, 9.588, 9.588 max_d=9.588 avg_d=4.794 std_dev=4.794

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.00	0.02	0.05	0.03	0.00	0.04	0.06	0.04	0.01	0.01	0.00	0.27	0.00	0.14	0.03	0.21	0.46	0.35
C2	0.05	0.00	0.17	0.06	0.01	0.17	0.00	0.16	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.36	0.25	0.07	0.00	0.36	0.39	0.40
C2'	0.00	0.17	0.00	0.00	0.10	0.00	0.05	0.16	0.09	0.08	0.14	0.19	0.16	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.34	0.07	0.26	0.59	0.45
C3'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.16	0.00	0.26	0.00	0.25	0.33	0.16	0.01	0.03	0.35	0.19	0.01	0.00	0.01	0.03	0.30	0.18	0.01	0.04
C4	0.03	0.01	0.10	0.16	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.13	0.17	0.13	0.00	0.01	0.27	0.38	0.34
C4'	0.00	0.17	0.00	0.00	0.02	0.00	0.07	0.00	0.02	0.24	0.09	0.25	0.16	0.20	0.07	0.24	0.04	0.00	0.00	0.06	0.06	0.10	0.07
C5	0.02	0.00	0.05	0.26	0.00	0.07	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.24	0.00	0.06	0.13	0.00	0.21	0.29	0.24
C5'	0.05	0.16	0.16	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.04	0.24	0.07	0.24	0.16	0.22	0.04	0.07	0.15	0.01	0.01	0.09	0.05	0.01	0.01
C6	0.03	0.00	0.09	0.25	0.01	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.22	0.05	0.11	0.13	0.00	0.24	0.25	0.24
C8	0.00	0.01	0.08	0.33	0.00	0.24	0.00	0.24	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.32	0.17	0.13	0.21	0.00	0.10	0.33	0.16
N1	0.04	0.00	0.14	0.16	0.01	0.09	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.12	0.21	0.19	0.03	0.00	0.31	0.31	0.33
N2	0.06	0.00	0.19	0.01	0.01	0.25	0.01	0.24	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.06	0.48	0.30	0.13	0.00	0.41	0.41	0.45
N3	0.04	0.00	0.16	0.03	0.00	0.16	0.00	0.16	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.38	0.24	0.10	0.01	0.34	0.43	0.42
N7	0.01	0.01	0.03	0.35	0.00	0.20	0.00	0.22	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.33	0.18	0.06	0.25	0.00	0.10	0.22	0.12
N9	0.01	0.02	0.01	0.19	0.01	0.07	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.18	0.07	0.01	0.01	0.01	0.21	0.41	0.31
O2'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.13	0.24	0.24	0.07	0.22	0.32	0.12	0.06	0.01	0.33	0.18	0.00	0.01	0.17	0.24	0.26	0.10	0.64	0.36
O3'	0.27	0.36	0.02	0.00	0.17	0.04	0.00	0.15	0.05	0.17	0.21	0.48	0.38	0.18	0.07	0.01	0.00	0.20	0.23	0.04	0.58	0.27	0.30
O4'	0.00	0.25	0.01	0.01	0.13	0.00	0.06	0.01	0.11	0.13	0.19	0.30	0.24	0.06	0.01	0.17	0.20	0.00	0.05	0.08	0.15	0.31	0.26
O5'	0.14	0.07	0.34	0.03	0.00	0.00	0.13	0.01	0.13	0.21	0.03	0.13	0.10	0.25	0.01	0.24	0.23	0.05	0.00	0.19	0.02	0.01	0.00
O6	0.03	0.00	0.07	0.30	0.01	0.06	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.26	0.04	0.08	0.19	0.00	0.20	0.16	0.17
OP1	0.21	0.36	0.26	0.18	0.27	0.06	0.21	0.05	0.24	0.10	0.31	0.41	0.34	0.10	0.21	0.10	0.58	0.15	0.02	0.20	0.00	0.00	0.00
OP2	0.46	0.39	0.59	0.01	0.38	0.10	0.29	0.01	0.25	0.33	0.31	0.41	0.43	0.22	0.41	0.64	0.27	0.31	0.01	0.16	0.00	0.00	0.00
P	0.35	0.40	0.45	0.04	0.34	0.07	0.24	0.01	0.24	0.16	0.33	0.45	0.42	0.12	0.31	0.36	0.30	0.26	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.36	1.78	0.58	0.26	1.10	0.27	1.23	0.72	1.77	0.36	2.00	1.38	2.00	0.73	0.60	0.52	0.31	0.19	0.13	0.13	0.13	0.14
C2	0.41	1.50	0.57	0.34	1.15	0.20	1.42	0.61	1.73	0.75	1.72	1.22	1.94	1.21	0.76	0.40	0.32	0.09	0.11	0.08	0.08	0.10
C2'	0.82	2.36	1.01	0.65	1.60	0.14	1.71	0.34	2.30	0.78	2.59	1.91	2.54	1.15	1.06	0.96	0.67	0.25	0.26	0.14	0.12	0.16
C3'	0.37	1.77	0.55	0.23	1.05	0.22	1.12	0.64	1.66	0.29	1.96	1.36	1.86	0.60	0.56	0.52	0.27	0.13	0.03	0.02	0.02	0.02
C4	0.45	1.74	0.60	0.32	1.24	0.19	1.48	0.60	1.93	0.69	2.00	1.38	2.23	1.15	0.78	0.46	0.30	0.06	0.08	0.08	0.08	0.07
C4'	0.02	1.32	0.18	0.15	0.61	0.59	0.66	1.02	1.17	0.12	1.49	0.93	1.34	0.15	0.15	0.17	0.09	0.51	0.37	0.26	0.25	0.29
C5	0.49	1.73	0.57	0.31	1.29	0.15	1.57	0.51	1.98	0.84	2.01	1.38	2.31	1.32	0.86	0.41	0.24	0.02	0.06	0.07	0.05	0.01
C5'	0.05	1.23	0.11	0.21	0.56	0.62	0.62	1.03	1.10	0.12	1.39	0.86	1.27	0.15	0.12	0.10	0.17	0.51	0.39	0.24	0.23	0.26
C6	0.49	1.61	0.53	0.31	1.26	0.13	1.57	0.44	1.92	0.95	1.88	1.30	2.22	1.42	0.88	0.33	0.20	0.05	0.06	0.06	0.03	0.02
C8	0.49	1.86	0.60	0.30	1.29	0.17	1.52	0.57	2.01	0.71	2.13	1.46	2.33	1.15	0.81	0.48	0.26	0.02	0.06	0.07	0.06	0.02
N1	0.45	1.49	0.53	0.32	1.19	0.15	1.49	0.49	1.78	0.91	1.73	1.21	2.04	1.38	0.84	0.33	0.24	0.00	0.09	0.07	0.05	0.03
N2	0.34	1.30	0.56	0.36	1.03	0.23	1.25	0.67	1.47	0.66	1.47	1.08	1.59	1.07	0.67	0.39	0.37	0.18	0.15	0.08	0.10	0.16
N3	0.40	1.64	0.60	0.33	1.17	0.22	1.40	0.65	1.80	0.61	1.86	1.31	2.04	1.05	0.72	0.47	0.34	0.13	0.11	0.08	0.09	0.11
N7	0.51	1.81	0.58	0.30	1.32	0.14	1.59	0.50	2.04	0.84	2.10	1.44	2.38	1.30	0.87	0.42	0.23	0.04	0.04	0.06	0.05	0.01
N9	0.44	1.82	0.61	0.30	1.23	0.21	1.43	0.63	1.93	0.60	2.07	1.43	2.23	1.02	0.74	0.50	0.30	0.08	0.08	0.09	0.09	0.07
O2'	0.83	2.57	1.09	0.70	1.68	0.10	1.76	0.42	2.41	0.74	2.80	2.06	2.60	1.11	1.08	1.04	0.75	0.19	0.14	0.10	0.12	0.08
O3'	0.13	1.33	0.06	0.26	0.54	0.70	0.58	1.11	1.15	0.26	1.52	0.90	1.33	0.02	0.04	0.05	0.21	0.62	0.41	0.43	0.42	0.43
O4'	0.06	1.28	0.16	0.16	0.61	0.65	0.69	1.08	1.20	0.11	1.47	0.90	1.40	0.21	0.14	0.12	0.10	0.56	0.47	0.35	0.34	0.38
O5'	0.20	1.50	0.32	0.01	0.86	0.40	0.97	0.79	1.45	0.22	1.69	1.12	1.68	0.54	0.41	0.27	0.01	0.26	0.18	0.07	0.07	0.06
O6	0.50	1.57	0.49	0.29	1.26	0.10	1.59	0.34	1.91	1.03	1.86	1.27	2.23	1.49	0.91	0.27	0.14	0.12	0.04	0.05	0.01	0.07
OP1	0.05	1.31	0.00	0.36	0.63	0.71	0.73	1.11	1.23	0.03	1.50	0.91	1.45	0.29	0.17	0.03	0.42	0.50	0.53	0.42	0.40	0.38
OP2	0.09	1.44	0.13	0.19	0.82	0.56	1.00	0.92	1.50	0.24	1.69	1.04	1.78	0.62	0.37	0.04	0.27	0.36	0.39	0.32	0.33	0.26
P	0.08	1.25	0.02	0.35	0.61	0.72	0.75	1.10	1.24	0.01	1.47	0.86	1.49	0.33	0.16	0.07	0.39	0.53	0.53	0.41	0.41	0.38

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.37	0.22	0.36	0.20
C2	0.01	0.00	0.09	0.08	0.00	0.04	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.11	0.00	0.60	0.53	0.94	0.62
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.04	0.00	0.02	0.00	0.04	0.04	0.06	0.09	0.02	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.19	0.16	0.40	0.15
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.08	0.05	0.08	0.01	0.06	0.02	0.00	0.00	0.00	0.10	0.25	0.37	0.17
C4	0.01	0.00	0.04	0.03	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.06	0.03	0.00	0.65	0.58	0.89	0.63
C4'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.04	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.07	0.04	0.10
C5	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.02	0.01	0.79	0.82	1.14	0.87
C5'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.33	0.17	0.00
C6	0.01	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.01	0.01	0.79	0.86	1.23	0.92
C8	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.10	0.03	0.83	0.81	0.97	0.83
N1	0.01	0.00	0.06	0.05	0.00	0.03	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.06	0.00	0.71	0.71	1.13	0.80
N3	0.01	0.00	0.09	0.08	0.00	0.04	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.11	0.11	0.01	0.54	0.43	0.79	0.50
N6	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.03	0.02	0.86	1.01	1.38	1.07
N7	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.09	0.03	0.88	0.97	1.22	1.01
N9	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.62	0.53	0.73	0.55
O2'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.06	0.02	0.03	0.02	0.06	0.02	0.08	0.11	0.04	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.13	0.14	0.13
O3'	0.01	0.11	0.01	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.10	0.06	0.11	0.03	0.09	0.02	0.02	0.00	0.01	0.17	0.08	0.24	0.01
O4'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.28	0.13	0.06	0.03
O5'	0.37	0.60	0.19	0.10	0.65	0.00	0.79	0.00	0.79	0.83	0.71	0.54	0.86	0.88	0.62	0.00	0.17	0.28	0.00	0.01	0.00	0.00
OP1	0.22	0.53	0.16	0.25	0.58	0.07	0.82	0.33	0.86	0.81	0.71	0.43	1.01	0.97	0.53	0.13	0.08	0.13	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.36	0.94	0.40	0.37	0.89	0.04	1.14	0.17	1.23	0.97	1.13	0.79	1.38	1.22	0.73	0.14	0.24	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.20	0.62	0.15	0.17	0.63	0.10	0.87	0.00	0.92	0.83	0.80	0.50	1.07	1.01	0.55	0.13	0.01	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00