Doublet Group distance statistics: 53602

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 6, 18, 8, 14, 13, 3, 3, 3, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.009, 0.014, 0.020, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.014 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.005, 0.015, 0.025, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.015 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.008, 0.019, 0.030, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.019 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.009, 0.020, 0.031, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.020 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.008, 0.019, 0.030, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.019 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.005, 0.017, 0.028, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.017 std_dev=0.012
N9	A	0, 0.012, 0.024, 0.036, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.024 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.016, 0.029, 0.042, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.029 std_dev=0.013
N7	A	0, 0.011, 0.032, 0.053, 0.101 max_d=0.101 avg_d=0.032 std_dev=0.021
O6	A	0, 0.018, 0.040, 0.062, 0.158 max_d=0.158 avg_d=0.040 std_dev=0.022
N2	A	0, 0.019, 0.041, 0.063, 0.125 max_d=0.125 avg_d=0.041 std_dev=0.022
C8	A	0, 0.013, 0.035, 0.057, 0.129 max_d=0.129 avg_d=0.035 std_dev=0.022
OP1	B	0, 0.162, 0.338, 0.515, 0.866 max_d=0.866 avg_d=0.338 std_dev=0.176
P	B	0, 0.228, 0.405, 0.582, 0.838 max_d=0.838 avg_d=0.405 std_dev=0.177
O4'	A	0, 0.001, 0.221, 0.440, 1.251 max_d=1.251 avg_d=0.221 std_dev=0.220
C2'	A	0, 0.050, 0.271, 0.492, 1.318 max_d=1.318 avg_d=0.271 std_dev=0.221
C4'	A	0, 0.221, 0.514, 0.807, 1.804 max_d=1.804 avg_d=0.514 std_dev=0.293
C3'	A	0, 0.196, 0.514, 0.833, 2.032 max_d=2.032 avg_d=0.514 std_dev=0.318
O3'	A	0, 0.805, 1.123, 1.442, 2.415 max_d=2.415 avg_d=1.123 std_dev=0.319
OP2	B	0, 0.203, 0.552, 0.900, 1.614 max_d=1.614 avg_d=0.552 std_dev=0.348
O2'	A	0, 0.040, 0.417, 0.795, 2.069 max_d=2.069 avg_d=0.417 std_dev=0.377
O5'	B	0, 0.025, 0.565, 1.105, 2.574 max_d=2.574 avg_d=0.565 std_dev=0.540
C5'	B	0, 0.030, 0.659, 1.287, 3.277 max_d=3.277 avg_d=0.659 std_dev=0.629
C4'	B	0, 0.070, 0.714, 1.359, 3.435 max_d=3.435 avg_d=0.714 std_dev=0.644
C5'	A	0, 0.076, 0.741, 1.405, 3.855 max_d=3.855 avg_d=0.741 std_dev=0.665
O4'	B	0, 0.033, 0.702, 1.372, 3.574 max_d=3.574 avg_d=0.702 std_dev=0.669
O5'	A	0, 0.072, 0.918, 1.764, 4.967 max_d=4.967 avg_d=0.918 std_dev=0.846
C1'	B	0, -0.116, 0.812, 1.740, 5.109 max_d=5.109 avg_d=0.812 std_dev=0.928
O2'	B	0, -0.096, 0.928, 1.952, 5.690 max_d=5.690 avg_d=0.928 std_dev=1.024
C2'	B	0, -0.144, 0.890, 1.924, 5.667 max_d=5.667 avg_d=0.890 std_dev=1.034
C3'	B	0, -0.181, 0.865, 1.911, 5.694 max_d=5.694 avg_d=0.865 std_dev=1.046
P	A	0, -0.151, 0.910, 1.970, 5.993 max_d=5.993 avg_d=0.910 std_dev=1.060
OP1	A	0, 0.346, 1.550, 2.753, 7.241 max_d=7.241 avg_d=1.550 std_dev=1.203
O3'	B	0, -0.261, 0.947, 2.155, 6.647 max_d=6.647 avg_d=0.947 std_dev=1.208
N9	B	0, -0.354, 0.905, 2.165, 6.903 max_d=6.903 avg_d=0.905 std_dev=1.260
OP2	A	0, -0.419, 0.969, 2.358, 7.674 max_d=7.674 avg_d=0.969 std_dev=1.388
C8	B	0, -0.476, 0.937, 2.349, 7.663 max_d=7.663 avg_d=0.937 std_dev=1.412
N3	B	0, -0.421, 1.058, 2.536, 8.198 max_d=8.198 avg_d=1.058 std_dev=1.479
C4	B	0, -0.499, 1.018, 2.534, 8.336 max_d=8.336 avg_d=1.018 std_dev=1.517
N7	B	0, -0.692, 1.063, 2.819, 9.514 max_d=9.514 avg_d=1.063 std_dev=1.755
C2	B	0, -0.597, 1.181, 2.959, 9.822 max_d=9.822 avg_d=1.181 std_dev=1.778
N2	B	0, -0.529, 1.255, 3.040, 9.901 max_d=9.901 avg_d=1.255 std_dev=1.784
C5	B	0, -0.717, 1.107, 2.932, 9.951 max_d=9.951 avg_d=1.107 std_dev=1.825
N1	B	0, -0.836, 1.265, 3.367, 11.516 max_d=11.516 avg_d=1.265 std_dev=2.101
C6	B	0, -0.910, 1.246, 3.402, 11.751 max_d=11.751 avg_d=1.246 std_dev=2.156
O6	B	0, -1.113, 1.359, 3.830, 13.416 max_d=13.416 avg_d=1.359 std_dev=2.472

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.16	0.00	0.05	0.01	0.19	0.12	0.08
C2	0.03	0.00	0.15	0.24	0.01	0.12	0.01	0.29	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.13	0.25	0.15	0.52	0.02	0.68	0.91	0.67
C2'	0.00	0.15	0.00	0.01	0.07	0.01	0.05	0.13	0.07	0.07	0.11	0.18	0.15	0.05	0.02	0.00	0.03	0.01	0.10	0.06	0.32	0.12	0.13
C3'	0.02	0.24	0.01	0.00	0.14	0.00	0.11	0.02	0.15	0.03	0.21	0.29	0.23	0.05	0.05	0.02	0.01	0.02	0.02	0.14	0.14	0.07	0.05
C4	0.01	0.01	0.07	0.14	0.00	0.06	0.00	0.17	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.08	0.07	0.26	0.01	0.39	0.46	0.33
C4'	0.01	0.12	0.01	0.00	0.06	0.00	0.05	0.01	0.07	0.04	0.10	0.14	0.11	0.04	0.03	0.12	0.02	0.01	0.01	0.07	0.08	0.08	0.06
C5	0.01	0.01	0.05	0.11	0.00	0.05	0.00	0.15	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.14	0.07	0.03	0.21	0.01	0.36	0.43	0.29
C5'	0.05	0.29	0.13	0.02	0.17	0.01	0.15	0.00	0.19	0.06	0.25	0.34	0.26	0.09	0.09	0.05	0.12	0.02	0.01	0.18	0.10	0.02	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.15	0.01	0.07	0.01	0.19	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.14	0.10	0.06	0.30	0.00	0.46	0.61	0.42
C8	0.01	0.01	0.07	0.03	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.20	0.20	0.06	0.07	0.02	0.20	0.15	0.09
N1	0.03	0.01	0.11	0.21	0.02	0.10	0.02	0.25	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.13	0.19	0.11	0.44	0.01	0.60	0.83	0.59
N2	0.04	0.01	0.18	0.29	0.01	0.14	0.01	0.34	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.17	0.35	0.18	0.66	0.02	0.86	1.17	0.87
N3	0.03	0.01	0.15	0.23	0.00	0.11	0.01	0.26	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.20	0.15	0.45	0.02	0.57	0.71	0.55
N7	0.01	0.01	0.05	0.05	0.01	0.04	0.00	0.09	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.20	0.15	0.04	0.09	0.02	0.24	0.23	0.14
N9	0.00	0.02	0.02	0.05	0.01	0.03	0.01	0.09	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.10	0.11	0.01	0.10	0.01	0.25	0.21	0.14
O2'	0.01	0.13	0.00	0.02	0.09	0.12	0.14	0.05	0.14	0.20	0.13	0.17	0.12	0.20	0.10	0.00	0.04	0.07	0.09	0.17	0.23	0.20	0.11
O3'	0.16	0.25	0.03	0.01	0.08	0.02	0.07	0.12	0.10	0.20	0.19	0.35	0.20	0.15	0.11	0.04	0.00	0.10	0.09	0.09	0.12	0.21	0.20
O4'	0.00	0.15	0.01	0.02	0.07	0.01	0.03	0.02	0.06	0.06	0.11	0.18	0.15	0.04	0.01	0.07	0.10	0.00	0.05	0.05	0.11	0.12	0.08
O5'	0.05	0.52	0.10	0.02	0.26	0.01	0.21	0.01	0.30	0.07	0.44	0.66	0.45	0.09	0.10	0.09	0.09	0.05	0.00	0.28	0.02	0.01	0.01
O6	0.01	0.02	0.06	0.14	0.01	0.07	0.01	0.18	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.17	0.09	0.05	0.28	0.00	0.43	0.60	0.40
OP1	0.19	0.68	0.32	0.14	0.39	0.08	0.36	0.10	0.46	0.20	0.60	0.86	0.57	0.24	0.25	0.23	0.12	0.11	0.02	0.43	0.00	0.01	0.01
OP2	0.12	0.91	0.12	0.07	0.46	0.08	0.43	0.02	0.61	0.15	0.83	1.17	0.71	0.23	0.21	0.20	0.21	0.12	0.01	0.60	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.67	0.13	0.05	0.33	0.06	0.29	0.02	0.42	0.09	0.59	0.87	0.55	0.14	0.14	0.11	0.20	0.08	0.01	0.40	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.32	0.44	0.66	0.61	0.43	0.25	0.50	0.28	0.55	0.45	0.51	0.42	0.40	0.52	0.39	0.56	0.47	0.13	0.13	0.61	0.10	0.27	0.11
C2	0.27	0.35	0.58	0.55	0.36	0.24	0.43	0.30	0.46	0.42	0.41	0.32	0.32	0.47	0.34	0.44	0.41	0.12	0.14	0.51	0.11	0.20	0.12
C2'	0.47	0.63	0.78	0.67	0.62	0.35	0.73	0.38	0.78	0.66	0.72	0.60	0.58	0.76	0.58	0.66	0.48	0.26	0.27	0.86	0.22	0.41	0.24
C3'	0.51	0.65	0.80	0.69	0.65	0.40	0.75	0.43	0.79	0.70	0.74	0.61	0.60	0.78	0.61	0.67	0.48	0.32	0.32	0.87	0.33	0.54	0.33
C4	0.33	0.42	0.68	0.66	0.42	0.30	0.49	0.34	0.52	0.46	0.48	0.40	0.39	0.51	0.40	0.55	0.54	0.16	0.17	0.57	0.11	0.22	0.13
C4'	0.16	0.26	0.44	0.36	0.26	0.11	0.34	0.12	0.38	0.31	0.33	0.22	0.22	0.38	0.24	0.34	0.20	0.15	0.12	0.44	0.16	0.32	0.16
C5	0.38	0.46	0.73	0.77	0.45	0.37	0.51	0.42	0.53	0.48	0.50	0.44	0.43	0.53	0.43	0.60	0.68	0.20	0.23	0.58	0.15	0.20	0.16
C5'	0.23	0.22	0.20	0.16	0.24	0.26	0.28	0.23	0.30	0.28	0.26	0.21	0.21	0.32	0.24	0.19	0.19	0.36	0.37	0.34	0.35	0.43	0.39
C6	0.38	0.44	0.73	0.79	0.44	0.40	0.49	0.46	0.51	0.48	0.48	0.42	0.42	0.52	0.43	0.58	0.71	0.22	0.26	0.55	0.18	0.20	0.18
C8	0.39	0.49	0.75	0.77	0.48	0.37	0.53	0.39	0.57	0.49	0.54	0.48	0.46	0.54	0.44	0.64	0.68	0.20	0.21	0.62	0.13	0.22	0.15
N1	0.32	0.38	0.65	0.68	0.39	0.33	0.46	0.40	0.47	0.45	0.43	0.35	0.36	0.49	0.38	0.49	0.56	0.17	0.21	0.52	0.16	0.18	0.17
N2	0.22	0.29	0.48	0.41	0.31	0.17	0.39	0.21	0.42	0.38	0.36	0.26	0.26	0.44	0.29	0.34	0.26	0.11	0.11	0.47	0.11	0.22	0.10
N3	0.28	0.37	0.60	0.56	0.38	0.23	0.45	0.27	0.48	0.42	0.43	0.34	0.34	0.49	0.35	0.47	0.41	0.12	0.13	0.54	0.10	0.23	0.11
N7	0.41	0.50	0.78	0.82	0.49	0.41	0.53	0.44	0.56	0.50	0.54	0.49	0.47	0.55	0.46	0.66	0.75	0.23	0.24	0.61	0.16	0.21	0.17
N9	0.34	0.45	0.70	0.68	0.44	0.30	0.51	0.34	0.54	0.47	0.51	0.44	0.42	0.53	0.41	0.58	0.56	0.16	0.17	0.60	0.11	0.24	0.13
O2'	0.48	0.68	0.79	0.68	0.67	0.35	0.79	0.37	0.85	0.71	0.79	0.64	0.61	0.82	0.61	0.68	0.49	0.27	0.28	0.95	0.22	0.41	0.25
O3'	0.59	0.76	0.88	0.76	0.76	0.47	0.88	0.52	0.93	0.82	0.87	0.72	0.70	0.91	0.72	0.75	0.54	0.40	0.42	1.03	0.42	0.69	0.46
O4'	0.13	0.21	0.45	0.41	0.21	0.10	0.27	0.12	0.31	0.25	0.27	0.19	0.18	0.31	0.18	0.35	0.28	0.14	0.13	0.36	0.15	0.22	0.15
O5'	0.54	0.51	0.25	0.30	0.53	0.55	0.54	0.54	0.54	0.56	0.52	0.51	0.52	0.56	0.54	0.35	0.42	0.70	0.73	0.55	0.66	0.64	0.71
O6	0.42	0.46	0.77	0.89	0.47	0.48	0.51	0.53	0.52	0.50	0.50	0.45	0.45	0.53	0.46	0.63	0.85	0.27	0.31	0.56	0.22	0.23	0.22
OP1	0.86	0.86	0.63	0.70	0.86	0.88	0.86	0.89	0.86	0.86	0.86	0.87	0.86	0.86	0.86	0.76	0.86	0.98	1.07	0.85	0.92	1.03	1.06
OP2	1.33	1.34	1.01	1.06	1.36	1.31	1.38	1.33	1.37	1.39	1.36	1.32	1.33	1.40	1.36	1.07	1.15	1.48	1.52	1.38	1.31	1.24	1.41
P	0.89	0.89	0.61	0.68	0.90	0.91	0.90	0.91	0.90	0.91	0.89	0.88	0.89	0.91	0.90	0.70	0.81	1.04	1.09	0.90	0.93	0.92	1.03

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.13	0.01	0.17	0.01	0.14	0.21	0.14
C2	0.02	0.00	0.17	0.18	0.01	0.06	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.10	0.08	0.05	0.23	0.01	0.19	0.31	0.23
C2'	0.00	0.17	0.00	0.00	0.08	0.02	0.03	0.09	0.06	0.09	0.12	0.21	0.17	0.06	0.01	0.00	0.02	0.01	0.32	0.04	0.33	0.27	0.26
C3'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.16	0.00	0.18	0.01	0.20	0.12	0.20	0.18	0.16	0.16	0.11	0.02	0.01	0.01	0.16	0.20	0.26	0.26	0.11
C4	0.01	0.01	0.08	0.16	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.11	0.05	0.03	0.25	0.01	0.23	0.34	0.28
C4'	0.01	0.06	0.02	0.00	0.06	0.00	0.08	0.00	0.08	0.08	0.07	0.06	0.05	0.10	0.05	0.14	0.02	0.00	0.02	0.10	0.09	0.35	0.11
C5	0.01	0.01	0.03	0.18	0.00	0.08	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.17	0.08	0.02	0.30	0.01	0.32	0.50	0.39
C5'	0.04	0.08	0.09	0.01	0.08	0.00	0.12	0.00	0.13	0.12	0.11	0.07	0.06	0.14	0.07	0.06	0.11	0.01	0.01	0.15	0.16	0.18	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.20	0.01	0.08	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.17	0.09	0.02	0.31	0.00	0.33	0.53	0.40
C8	0.01	0.01	0.09	0.12	0.01	0.08	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.17	0.07	0.04	0.32	0.02	0.34	0.52	0.42
N1	0.02	0.00	0.12	0.20	0.01	0.07	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.08	0.04	0.27	0.01	0.26	0.41	0.32
N2	0.03	0.00	0.21	0.18	0.01	0.06	0.01	0.07	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.11	0.09	0.06	0.20	0.02	0.16	0.28	0.19
N3	0.02	0.00	0.17	0.16	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.07	0.05	0.21	0.01	0.17	0.27	0.20
N7	0.01	0.01	0.06	0.16	0.01	0.10	0.01	0.14	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.20	0.10	0.03	0.34	0.02	0.39	0.63	0.48
N9	0.00	0.01	0.01	0.11	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.11	0.04	0.01	0.25	0.01	0.22	0.32	0.27
O2'	0.02	0.10	0.00	0.02	0.11	0.14	0.17	0.06	0.17	0.17	0.13	0.11	0.08	0.20	0.11	0.00	0.04	0.10	0.17	0.20	0.21	0.32	0.16
O3'	0.13	0.08	0.02	0.01	0.05	0.02	0.08	0.11	0.09	0.07	0.08	0.09	0.07	0.10	0.04	0.04	0.00	0.09	0.07	0.12	0.15	0.54	0.23
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.04	0.06	0.05	0.03	0.01	0.10	0.09	0.00	0.05	0.02	0.10	0.20	0.07
O5'	0.17	0.23	0.32	0.16	0.25	0.02	0.30	0.01	0.31	0.32	0.27	0.20	0.21	0.34	0.25	0.17	0.07	0.05	0.00	0.33	0.02	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.04	0.20	0.01	0.10	0.01	0.15	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.20	0.12	0.02	0.33	0.00	0.39	0.63	0.47
OP1	0.14	0.19	0.33	0.26	0.23	0.09	0.32	0.16	0.33	0.34	0.26	0.16	0.17	0.39	0.22	0.21	0.15	0.10	0.02	0.39	0.00	0.01	0.01
OP2	0.21	0.31	0.27	0.26	0.34	0.35	0.50	0.18	0.53	0.52	0.41	0.28	0.27	0.63	0.32	0.32	0.54	0.20	0.02	0.63	0.01	0.00	0.01
P	0.14	0.23	0.26	0.11	0.28	0.11	0.39	0.01	0.40	0.42	0.32	0.19	0.20	0.48	0.27	0.16	0.23	0.07	0.00	0.47	0.01	0.01	0.00