Doublet Group distance statistics: 53603

back

Distances from reference structure (by RMSD)

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	max_d=0.027 avg_d=0.012 std_dev=0.004
N3	A	max_d=0.040 avg_d=0.022 std_dev=0.007
N1	A	max_d=0.043 avg_d=0.021 std_dev=0.008
C5	A	max_d=0.050 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C4	A	max_d=0.057 avg_d=0.023 std_dev=0.009
C2	A	max_d=0.051 avg_d=0.019 std_dev=0.009
C1'	A	max_d=0.062 avg_d=0.024 std_dev=0.011
N9	A	max_d=0.063 avg_d=0.027 std_dev=0.012
O6	A	max_d=0.085 avg_d=0.034 std_dev=0.013
N2	A	max_d=0.100 avg_d=0.040 std_dev=0.016
N7	A	max_d=0.104 avg_d=0.028 std_dev=0.017
C8	A	max_d=0.115 avg_d=0.034 std_dev=0.019
P	B	max_d=0.986 avg_d=0.424 std_dev=0.191
O5'	B	max_d=1.625 avg_d=1.142 std_dev=0.209
C3'	A	max_d=1.736 avg_d=1.480 std_dev=0.240
O4'	A	max_d=1.299 avg_d=1.136 std_dev=0.249
O3'	A	max_d=2.706 avg_d=1.127 std_dev=0.255
OP1	B	max_d=1.335 avg_d=0.943 std_dev=0.256
OP2	B	max_d=1.870 avg_d=1.192 std_dev=0.271
C4'	A	max_d=1.644 avg_d=1.405 std_dev=0.275
C2'	A	max_d=1.730 avg_d=1.527 std_dev=0.278
C5'	B	max_d=2.002 avg_d=1.403 std_dev=0.289
C3'	B	max_d=2.766 avg_d=2.180 std_dev=0.298
OP2	A	max_d=2.706 avg_d=2.190 std_dev=0.305
C4'	B	max_d=2.618 avg_d=2.007 std_dev=0.305
O5'	A	max_d=2.669 avg_d=2.226 std_dev=0.314
O4'	B	max_d=2.796 avg_d=2.255 std_dev=0.319
P	A	max_d=2.931 avg_d=2.360 std_dev=0.319
O3'	B	max_d=3.154 avg_d=2.487 std_dev=0.336
C8	B	max_d=2.917 avg_d=2.460 std_dev=0.352
C2'	B	max_d=3.357 avg_d=2.754 std_dev=0.369
C1'	B	max_d=3.299 avg_d=2.723 std_dev=0.372
N9	B	max_d=3.121 avg_d=2.669 std_dev=0.376
OP1	A	max_d=3.727 avg_d=2.914 std_dev=0.395
N7	B	max_d=3.399 avg_d=2.753 std_dev=0.405
O2'	A	max_d=2.873 avg_d=2.532 std_dev=0.432
C4	B	max_d=3.663 avg_d=3.094 std_dev=0.447
O2'	B	max_d=4.068 avg_d=3.360 std_dev=0.450
C5	B	max_d=3.819 avg_d=3.118 std_dev=0.460
N3	B	max_d=4.248 avg_d=3.586 std_dev=0.513
C5'	A	max_d=3.282 avg_d=2.908 std_dev=0.520
C6	B	max_d=4.530 avg_d=3.688 std_dev=0.544
C2	B	max_d=4.794 avg_d=4.040 std_dev=0.583
O6	B	max_d=4.928 avg_d=3.984 std_dev=0.589
N1	B	max_d=4.932 avg_d=4.086 std_dev=0.596
N2	B	max_d=5.549 avg_d=4.646 std_dev=0.665

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.09	0.00	0.13	0.01	0.14	0.14	0.09
C2	0.02	0.00	0.15	0.08	0.01	0.09	0.01	0.21	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.21	0.08	0.16	0.23	0.01	0.13	0.15	0.13
C2'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.08	0.01	0.04	0.09	0.07	0.06	0.11	0.17	0.15	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.14	0.06	0.16	0.32	0.21
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.05	0.00	0.05	0.02	0.06	0.05	0.07	0.10	0.08	0.05	0.03	0.01	0.00	0.01	0.19	0.06	0.10	0.21	0.17
C4	0.01	0.01	0.08	0.05	0.00	0.06	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.12	0.05	0.08	0.19	0.01	0.12	0.15	0.10
C4'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.06	0.00	0.06	0.00	0.07	0.04	0.08	0.11	0.08	0.05	0.03	0.04	0.02	0.00	0.02	0.07	0.16	0.06	0.03
C5	0.01	0.01	0.04	0.05	0.00	0.06	0.00	0.20	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.10	0.04	0.04	0.20	0.01	0.12	0.15	0.11
C5'	0.06	0.21	0.09	0.02	0.18	0.00	0.20	0.00	0.22	0.15	0.22	0.20	0.19	0.19	0.14	0.05	0.08	0.02	0.01	0.23	0.22	0.06	0.03
C6	0.01	0.01	0.07	0.06	0.01	0.07	0.01	0.22	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.04	0.07	0.22	0.00	0.13	0.15	0.12
C8	0.01	0.01	0.06	0.05	0.00	0.04	0.01	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.10	0.06	0.06	0.16	0.02	0.13	0.15	0.09
N1	0.02	0.01	0.11	0.07	0.01	0.08	0.01	0.22	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.18	0.06	0.12	0.23	0.01	0.13	0.15	0.14
N2	0.03	0.00	0.17	0.10	0.01	0.11	0.01	0.20	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.24	0.09	0.19	0.24	0.02	0.14	0.15	0.15
N3	0.02	0.00	0.15	0.08	0.00	0.08	0.01	0.19	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.19	0.07	0.16	0.21	0.01	0.12	0.15	0.11
N7	0.01	0.01	0.04	0.05	0.00	0.05	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.09	0.04	0.03	0.18	0.02	0.12	0.15	0.10
N9	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.05	0.05	0.01	0.16	0.01	0.13	0.15	0.09
O2'	0.01	0.21	0.00	0.01	0.12	0.04	0.10	0.05	0.14	0.10	0.18	0.24	0.19	0.09	0.05	0.00	0.04	0.03	0.15	0.13	0.19	0.36	0.23
O3'	0.09	0.08	0.02	0.00	0.05	0.02	0.04	0.08	0.04	0.06	0.06	0.09	0.07	0.04	0.05	0.04	0.00	0.10	0.16	0.04	0.08	0.17	0.12
O4'	0.00	0.16	0.01	0.01	0.08	0.00	0.04	0.02	0.07	0.06	0.12	0.19	0.16	0.03	0.01	0.03	0.10	0.00	0.27	0.06	0.29	0.16	0.21
O5'	0.13	0.23	0.14	0.19	0.19	0.02	0.20	0.01	0.22	0.16	0.23	0.24	0.21	0.18	0.16	0.15	0.16	0.27	0.00	0.22	0.02	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.06	0.06	0.01	0.07	0.01	0.23	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.13	0.04	0.06	0.22	0.00	0.13	0.15	0.13
OP1	0.14	0.13	0.16	0.10	0.12	0.16	0.12	0.22	0.13	0.13	0.13	0.14	0.12	0.12	0.13	0.19	0.08	0.29	0.02	0.13	0.00	0.01	0.01
OP2	0.14	0.15	0.32	0.21	0.15	0.06	0.15	0.06	0.15	0.15	0.15	0.15	0.15	0.15	0.15	0.36	0.17	0.16	0.02	0.15	0.01	0.00	0.00
P	0.09	0.13	0.21	0.17	0.10	0.03	0.11	0.03	0.12	0.09	0.14	0.15	0.11	0.10	0.09	0.23	0.12	0.21	0.00	0.13	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.19	0.10	0.07	0.15	0.08	0.16	0.12	0.18	0.13	0.19	0.21	0.17	0.15	0.12	0.11	0.10	0.07	0.12	0.19	0.15	0.13	0.11
C2	0.11	0.11	0.12	0.13	0.10	0.13	0.11	0.14	0.11	0.12	0.11	0.11	0.10	0.12	0.10	0.13	0.13	0.11	0.12	0.12	0.15	0.14	0.11
C2'	0.25	0.26	0.25	0.22	0.25	0.22	0.24	0.23	0.24	0.24	0.25	0.26	0.26	0.23	0.24	0.24	0.22	0.23	0.19	0.23	0.22	0.26	0.21
C3'	0.26	0.31	0.27	0.21	0.27	0.19	0.25	0.18	0.26	0.22	0.29	0.33	0.31	0.22	0.25	0.29	0.21	0.21	0.14	0.24	0.14	0.17	0.13
C4	0.10	0.15	0.10	0.09	0.12	0.09	0.13	0.12	0.15	0.12	0.15	0.16	0.14	0.14	0.11	0.11	0.11	0.08	0.11	0.16	0.15	0.13	0.11
C4'	0.23	0.35	0.24	0.13	0.29	0.10	0.28	0.09	0.30	0.21	0.33	0.37	0.33	0.23	0.25	0.25	0.10	0.16	0.13	0.29	0.12	0.11	0.08
C5	0.12	0.17	0.12	0.11	0.14	0.11	0.15	0.12	0.17	0.13	0.17	0.19	0.16	0.15	0.12	0.13	0.12	0.10	0.12	0.18	0.16	0.14	0.12
C5'	0.39	0.51	0.40	0.27	0.46	0.20	0.44	0.12	0.46	0.37	0.50	0.52	0.50	0.39	0.41	0.38	0.19	0.29	0.18	0.45	0.13	0.18	0.13
C6	0.13	0.16	0.14	0.13	0.14	0.13	0.14	0.13	0.15	0.14	0.16	0.17	0.15	0.15	0.13	0.14	0.13	0.13	0.14	0.16	0.17	0.15	0.14
C8	0.12	0.21	0.11	0.09	0.16	0.09	0.17	0.11	0.20	0.14	0.22	0.24	0.19	0.16	0.13	0.12	0.11	0.09	0.12	0.21	0.15	0.13	0.11
N1	0.13	0.14	0.14	0.14	0.13	0.14	0.12	0.14	0.13	0.14	0.14	0.15	0.13	0.13	0.13	0.14	0.14	0.13	0.14	0.14	0.17	0.14	0.13
N2	0.13	0.11	0.14	0.15	0.11	0.15	0.12	0.16	0.13	0.13	0.12	0.12	0.11	0.14	0.12	0.14	0.15	0.14	0.13	0.13	0.15	0.15	0.11
N3	0.09	0.11	0.10	0.10	0.10	0.10	0.11	0.13	0.12	0.12	0.12	0.12	0.10	0.12	0.09	0.11	0.11	0.09	0.11	0.13	0.14	0.14	0.10
N7	0.12	0.21	0.12	0.10	0.16	0.10	0.17	0.12	0.20	0.14	0.21	0.23	0.19	0.16	0.13	0.13	0.12	0.10	0.12	0.21	0.16	0.14	0.12
N9	0.10	0.18	0.10	0.08	0.14	0.08	0.15	0.12	0.18	0.13	0.19	0.20	0.16	0.15	0.12	0.11	0.10	0.08	0.11	0.19	0.15	0.13	0.11
O2'	0.21	0.20	0.20	0.21	0.20	0.22	0.21	0.26	0.20	0.23	0.19	0.20	0.20	0.23	0.21	0.19	0.21	0.22	0.23	0.20	0.31	0.35	0.29
O3'	0.23	0.32	0.24	0.16	0.27	0.14	0.25	0.15	0.27	0.20	0.31	0.35	0.31	0.21	0.23	0.25	0.16	0.17	0.14	0.26	0.15	0.16	0.12
O4'	0.12	0.24	0.11	0.13	0.17	0.15	0.17	0.21	0.21	0.14	0.24	0.27	0.20	0.16	0.13	0.12	0.18	0.11	0.22	0.21	0.25	0.18	0.21
O5'	0.10	0.13	0.11	0.06	0.12	0.06	0.13	0.10	0.14	0.13	0.14	0.14	0.13	0.14	0.11	0.13	0.02	0.07	0.16	0.15	0.12	0.13	0.12
O6	0.15	0.19	0.15	0.14	0.16	0.14	0.17	0.14	0.18	0.16	0.19	0.20	0.17	0.17	0.15	0.15	0.14	0.15	0.15	0.18	0.18	0.16	0.15
OP1	0.04	0.07	0.03	0.03	0.05	0.10	0.06	0.14	0.07	0.07	0.06	0.08	0.06	0.07	0.04	0.08	0.01	0.09	0.12	0.07	0.20	0.18	0.15
OP2	0.05	0.13	0.06	0.04	0.11	0.10	0.12	0.16	0.14	0.09	0.14	0.13	0.11	0.11	0.08	0.04	0.02	0.08	0.14	0.15	0.12	0.13	0.10
P	0.02	0.07	0.05	0.01	0.05	0.06	0.06	0.09	0.07	0.05	0.07	0.08	0.06	0.06	0.04	0.07	0.01	0.04	0.12	0.08	0.12	0.12	0.09

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.01	0.06	0.09	0.05
C2	0.02	0.00	0.04	0.05	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.06	0.03	0.08	0.01	0.09	0.16	0.10
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.04	0.05	0.04	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.03	0.08	0.08	0.04
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.05	0.04	0.05	0.06	0.05	0.04	0.03	0.02	0.01	0.01	0.08	0.05	0.10	0.07	0.06
C4	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.04	0.01	0.08	0.01	0.09	0.15	0.10
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.04	0.02	0.03	0.02	0.04	0.02	0.04	0.02	0.00	0.01	0.04	0.06	0.05	0.02
C5	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.05	0.02	0.09	0.01	0.12	0.17	0.13
C5'	0.02	0.03	0.01	0.01	0.04	0.01	0.06	0.00	0.06	0.07	0.05	0.03	0.03	0.07	0.04	0.04	0.02	0.01	0.01	0.07	0.05	0.04	0.01
C6	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.06	0.02	0.10	0.00	0.13	0.19	0.14
C8	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.04	0.03	0.09	0.01	0.11	0.14	0.11
N1	0.02	0.00	0.04	0.05	0.01	0.02	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.06	0.02	0.09	0.01	0.11	0.18	0.12
N2	0.02	0.00	0.05	0.06	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.07	0.04	0.07	0.02	0.09	0.16	0.10
N3	0.02	0.00	0.04	0.05	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.05	0.03	0.07	0.01	0.08	0.14	0.09
N7	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.05	0.02	0.10	0.01	0.13	0.18	0.14
N9	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.08	0.12	0.09
O2'	0.01	0.04	0.00	0.02	0.02	0.04	0.02	0.04	0.03	0.02	0.04	0.05	0.04	0.02	0.01	0.00	0.05	0.02	0.05	0.03	0.10	0.07	0.05
O3'	0.02	0.06	0.02	0.01	0.04	0.02	0.05	0.02	0.06	0.04	0.06	0.07	0.05	0.05	0.03	0.05	0.00	0.02	0.10	0.06	0.14	0.09	0.09
O4'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.04	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.07	0.02	0.06	0.08	0.06
O5'	0.05	0.08	0.04	0.08	0.08	0.01	0.09	0.01	0.10	0.09	0.09	0.07	0.07	0.10	0.07	0.05	0.10	0.07	0.00	0.10	0.03	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.06	0.02	0.10	0.00	0.15	0.20	0.15
OP1	0.06	0.09	0.08	0.10	0.09	0.06	0.12	0.05	0.13	0.11	0.11	0.09	0.08	0.13	0.08	0.10	0.14	0.06	0.03	0.15	0.00	0.01	0.00
OP2	0.09	0.16	0.08	0.07	0.15	0.05	0.17	0.04	0.19	0.14	0.18	0.16	0.14	0.18	0.12	0.07	0.09	0.08	0.01	0.20	0.01	0.00	0.00
P	0.05	0.10	0.04	0.06	0.10	0.02	0.13	0.01	0.14	0.11	0.12	0.10	0.09	0.14	0.09	0.05	0.09	0.06	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00