Doublet Group distance statistics: 53606

back

Distances from reference structure (by RMSD)

4, 10, 5, 5, 3, 3, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.008, 0.015, 0.021, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.015 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.010, 0.017, 0.024, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.017 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.010, 0.019, 0.027, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.019 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.001, 0.009, 0.017, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.009 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.005, 0.016, 0.027, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.016 std_dev=0.011
N9	A	0, 0.007, 0.019, 0.031, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.019 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.004, 0.016, 0.028, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.016 std_dev=0.012
N2	A	0, 0.016, 0.030, 0.045, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.030 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.004, 0.018, 0.033, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.018 std_dev=0.015
N7	A	0, 0.006, 0.030, 0.053, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.030 std_dev=0.024
C8	A	0, 0.005, 0.034, 0.063, 0.117 max_d=0.117 avg_d=0.034 std_dev=0.029
O6	A	0, -0.002, 0.030, 0.062, 0.155 max_d=0.155 avg_d=0.030 std_dev=0.032
C2'	A	0, -0.013, 0.111, 0.236, 0.593 max_d=0.593 avg_d=0.111 std_dev=0.125
O4'	A	0, -0.028, 0.099, 0.226, 0.622 max_d=0.622 avg_d=0.099 std_dev=0.127
OP2	B	0, 0.075, 0.251, 0.426, 0.776 max_d=0.776 avg_d=0.251 std_dev=0.176
O2'	A	0, -0.020, 0.163, 0.345, 0.925 max_d=0.925 avg_d=0.163 std_dev=0.182
C3'	A	0, -0.004, 0.185, 0.374, 0.943 max_d=0.943 avg_d=0.185 std_dev=0.189
P	B	0, 0.073, 0.272, 0.471, 0.929 max_d=0.929 avg_d=0.272 std_dev=0.199
C4'	A	0, -0.037, 0.182, 0.402, 1.229 max_d=1.229 avg_d=0.182 std_dev=0.219
O3'	A	0, 0.006, 0.252, 0.499, 1.158 max_d=1.158 avg_d=0.252 std_dev=0.247
O5'	B	0, 0.087, 0.334, 0.581, 1.003 max_d=1.003 avg_d=0.334 std_dev=0.247
O4'	B	0, 0.095, 0.354, 0.613, 1.090 max_d=1.090 avg_d=0.354 std_dev=0.259
O5'	A	0, 0.062, 0.323, 0.585, 1.257 max_d=1.257 avg_d=0.323 std_dev=0.261
OP1	B	0, 0.033, 0.298, 0.563, 1.471 max_d=1.471 avg_d=0.298 std_dev=0.265
C4'	B	0, 0.095, 0.410, 0.725, 1.471 max_d=1.471 avg_d=0.410 std_dev=0.315
C1'	B	0, 0.089, 0.410, 0.731, 1.431 max_d=1.431 avg_d=0.410 std_dev=0.321
P	A	0, 0.121, 0.444, 0.767, 1.653 max_d=1.653 avg_d=0.444 std_dev=0.323
C5'	B	0, 0.079, 0.418, 0.757, 1.726 max_d=1.726 avg_d=0.418 std_dev=0.339
OP2	A	0, 0.116, 0.499, 0.881, 1.708 max_d=1.708 avg_d=0.499 std_dev=0.382
C2'	B	0, 0.128, 0.515, 0.902, 1.684 max_d=1.684 avg_d=0.515 std_dev=0.387
C3'	B	0, 0.094, 0.506, 0.917, 1.832 max_d=1.832 avg_d=0.506 std_dev=0.411
OP1	A	0, 0.099, 0.556, 1.013, 2.006 max_d=2.006 avg_d=0.556 std_dev=0.457
C5'	A	0, -0.140, 0.347, 0.834, 2.754 max_d=2.754 avg_d=0.347 std_dev=0.487
O2'	B	0, 0.088, 0.634, 1.181, 2.894 max_d=2.894 avg_d=0.634 std_dev=0.547
N9	B	0, -0.167, 0.474, 1.116, 3.257 max_d=3.257 avg_d=0.474 std_dev=0.642
O3'	B	0, 0.020, 0.678, 1.336, 2.999 max_d=2.999 avg_d=0.678 std_dev=0.658
C8	B	0, -0.328, 0.572, 1.473, 4.585 max_d=4.585 avg_d=0.572 std_dev=0.901
C4	B	0, -0.422, 0.509, 1.441, 4.571 max_d=4.571 avg_d=0.509 std_dev=0.932
N3	B	0, -0.495, 0.528, 1.552, 4.915 max_d=4.915 avg_d=0.528 std_dev=1.024
N7	B	0, -0.605, 0.631, 1.867, 6.125 max_d=6.125 avg_d=0.631 std_dev=1.236
C5	B	0, -0.659, 0.591, 1.841, 6.107 max_d=6.107 avg_d=0.591 std_dev=1.250
C2	B	0, -0.776, 0.623, 2.021, 6.680 max_d=6.680 avg_d=0.623 std_dev=1.399
C6	B	0, -0.919, 0.689, 2.298, 7.766 max_d=7.766 avg_d=0.689 std_dev=1.609
N2	B	0, -0.922, 0.709, 2.340, 7.733 max_d=7.733 avg_d=0.709 std_dev=1.631
N1	B	0, -0.952, 0.688, 2.327, 7.858 max_d=7.858 avg_d=0.688 std_dev=1.640
O6	B	0, -1.099, 0.822, 2.744, 9.285 max_d=9.285 avg_d=0.822 std_dev=1.922

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.02	0.27	0.11	0.11
C2	0.01	0.00	0.11	0.08	0.01	0.04	0.01	0.18	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.16	0.10	0.05	0.10	0.01	0.23	0.23	0.12
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.07	0.02	0.05	0.07	0.07	0.04	0.10	0.12	0.11	0.03	0.02	0.00	0.03	0.01	0.08	0.07	0.22	0.12	0.07
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.04	0.00	0.04	0.02	0.05	0.09	0.07	0.10	0.07	0.07	0.03	0.02	0.01	0.01	0.15	0.06	0.19	0.13	0.05
C4	0.01	0.01	0.07	0.04	0.00	0.05	0.00	0.19	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.09	0.05	0.02	0.11	0.01	0.22	0.22	0.12
C4'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.08	0.09	0.06	0.03	0.03	0.10	0.05	0.12	0.02	0.00	0.02	0.10	0.31	0.09	0.15
C5	0.01	0.01	0.05	0.04	0.00	0.08	0.00	0.26	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.05	0.02	0.14	0.01	0.20	0.27	0.14
C5'	0.07	0.18	0.07	0.02	0.19	0.01	0.26	0.00	0.27	0.25	0.23	0.16	0.15	0.29	0.17	0.07	0.05	0.01	0.01	0.30	0.07	0.06	0.02
C6	0.01	0.01	0.07	0.05	0.00	0.08	0.00	0.27	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.06	0.02	0.15	0.00	0.20	0.28	0.15
C8	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.09	0.00	0.25	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.09	0.05	0.14	0.02	0.19	0.23	0.14
N1	0.01	0.00	0.10	0.07	0.01	0.06	0.00	0.23	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.14	0.08	0.03	0.13	0.01	0.21	0.26	0.13
N2	0.02	0.00	0.12	0.10	0.01	0.03	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.18	0.13	0.06	0.09	0.02	0.24	0.22	0.12
N3	0.01	0.00	0.11	0.07	0.00	0.03	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.15	0.09	0.05	0.09	0.01	0.24	0.20	0.11
N7	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.10	0.00	0.29	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.08	0.04	0.16	0.02	0.19	0.28	0.16
N9	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.05	0.01	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.03	0.01	0.10	0.02	0.22	0.19	0.12
O2'	0.01	0.16	0.00	0.02	0.09	0.12	0.08	0.07	0.10	0.03	0.14	0.18	0.15	0.04	0.03	0.00	0.03	0.06	0.12	0.10	0.21	0.11	0.05
O3'	0.01	0.10	0.03	0.01	0.05	0.02	0.05	0.05	0.06	0.09	0.08	0.13	0.09	0.08	0.03	0.03	0.00	0.01	0.18	0.07	0.19	0.11	0.05
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.05	0.03	0.06	0.05	0.04	0.01	0.06	0.01	0.00	0.06	0.03	0.31	0.09	0.15
O5'	0.05	0.10	0.08	0.15	0.11	0.02	0.14	0.01	0.15	0.14	0.13	0.09	0.09	0.16	0.10	0.12	0.18	0.06	0.00	0.17	0.01	0.01	0.00
O6	0.02	0.01	0.07	0.06	0.01	0.10	0.01	0.30	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.10	0.07	0.03	0.17	0.00	0.20	0.31	0.16
OP1	0.27	0.23	0.22	0.19	0.22	0.31	0.20	0.07	0.20	0.19	0.21	0.24	0.24	0.19	0.22	0.21	0.19	0.31	0.01	0.20	0.00	0.01	0.00
OP2	0.11	0.23	0.12	0.13	0.22	0.09	0.27	0.06	0.28	0.23	0.26	0.22	0.20	0.28	0.19	0.11	0.11	0.09	0.01	0.31	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.12	0.07	0.05	0.12	0.15	0.14	0.02	0.15	0.14	0.13	0.12	0.11	0.16	0.12	0.05	0.05	0.15	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.56	0.28	0.12	0.14	0.18	0.42	0.25	0.36	0.66	0.32	0.98	0.42	0.78	0.27	0.28	0.12	0.17	0.17	0.61	0.08	0.10	0.08
C2	0.11	0.72	0.24	0.13	0.23	0.18	0.18	0.21	0.27	0.46	0.55	0.95	0.58	0.46	0.12	0.24	0.13	0.19	0.15	0.26	0.08	0.15	0.08
C2'	0.20	0.41	0.33	0.16	0.20	0.12	0.46	0.18	0.39	0.69	0.23	0.78	0.29	0.79	0.34	0.29	0.14	0.13	0.12	0.60	0.11	0.17	0.09
C3'	0.16	0.52	0.31	0.15	0.14	0.13	0.36	0.18	0.28	0.63	0.32	0.90	0.37	0.71	0.28	0.29	0.14	0.13	0.12	0.48	0.11	0.15	0.09
C4	0.13	0.86	0.28	0.15	0.24	0.17	0.20	0.21	0.30	0.52	0.67	1.21	0.63	0.55	0.16	0.30	0.15	0.20	0.16	0.31	0.09	0.12	0.09
C4'	0.13	0.58	0.27	0.13	0.13	0.17	0.39	0.21	0.32	0.66	0.32	1.02	0.43	0.77	0.26	0.27	0.12	0.17	0.15	0.58	0.14	0.18	0.12
C5	0.15	1.08	0.29	0.19	0.43	0.16	0.32	0.18	0.61	0.38	1.02	1.38	0.79	0.35	0.15	0.34	0.19	0.22	0.16	0.53	0.13	0.14	0.12
C5'	0.17	0.68	0.33	0.27	0.18	0.16	0.39	0.20	0.30	0.70	0.44	1.15	0.49	0.79	0.30	0.29	0.26	0.15	0.22	0.51	0.36	0.39	0.32
C6	0.18	1.16	0.28	0.20	0.57	0.17	0.52	0.18	0.86	0.25	1.18	1.34	0.87	0.24	0.22	0.34	0.22	0.23	0.17	0.81	0.15	0.16	0.14
C8	0.15	0.97	0.30	0.18	0.31	0.16	0.22	0.20	0.41	0.49	0.84	1.36	0.70	0.50	0.17	0.35	0.18	0.21	0.16	0.36	0.12	0.13	0.12
N1	0.16	0.99	0.26	0.17	0.49	0.17	0.40	0.18	0.65	0.27	0.93	1.14	0.78	0.23	0.17	0.29	0.18	0.23	0.16	0.57	0.11	0.14	0.10
N2	0.09	0.45	0.20	0.11	0.14	0.19	0.25	0.24	0.23	0.46	0.31	0.63	0.39	0.48	0.17	0.17	0.13	0.17	0.16	0.29	0.12	0.18	0.12
N3	0.12	0.64	0.25	0.12	0.14	0.18	0.29	0.23	0.24	0.57	0.42	0.97	0.50	0.64	0.20	0.24	0.12	0.18	0.16	0.38	0.08	0.13	0.08
N7	0.17	1.12	0.30	0.20	0.44	0.16	0.34	0.18	0.65	0.38	1.08	1.46	0.81	0.34	0.17	0.37	0.22	0.22	0.17	0.59	0.15	0.15	0.14
N9	0.14	0.79	0.29	0.15	0.19	0.17	0.25	0.22	0.26	0.57	0.59	1.20	0.58	0.63	0.20	0.31	0.15	0.19	0.16	0.37	0.09	0.12	0.09
O2'	0.28	0.22	0.36	0.19	0.37	0.12	0.67	0.16	0.65	0.80	0.32	0.50	0.17	0.95	0.47	0.29	0.15	0.15	0.12	0.89	0.14	0.21	0.13
O3'	0.19	0.40	0.32	0.15	0.18	0.12	0.41	0.17	0.34	0.65	0.23	0.75	0.28	0.73	0.32	0.29	0.14	0.12	0.11	0.54	0.12	0.17	0.10
O4'	0.13	0.66	0.25	0.12	0.13	0.22	0.37	0.26	0.31	0.63	0.38	1.12	0.50	0.76	0.23	0.28	0.12	0.22	0.19	0.58	0.09	0.12	0.10
O5'	0.19	0.83	0.34	0.23	0.24	0.16	0.30	0.18	0.30	0.61	0.64	1.28	0.60	0.66	0.25	0.36	0.23	0.20	0.14	0.39	0.21	0.22	0.17
O6	0.21	1.26	0.28	0.23	0.72	0.18	0.77	0.18	1.16	0.22	1.38	1.39	0.95	0.38	0.33	0.37	0.27	0.25	0.18	1.20	0.20	0.19	0.18
OP1	0.23	0.74	0.39	0.31	0.28	0.19	0.41	0.21	0.41	0.67	0.61	1.16	0.53	0.73	0.33	0.39	0.30	0.19	0.21	0.53	0.29	0.30	0.26
OP2	0.26	1.07	0.34	0.20	0.41	0.26	0.25	0.27	0.50	0.38	0.95	1.49	0.80	0.35	0.21	0.45	0.19	0.31	0.23	0.42	0.18	0.18	0.18
P	0.14	0.87	0.31	0.19	0.24	0.13	0.24	0.15	0.33	0.54	0.71	1.31	0.63	0.57	0.19	0.36	0.19	0.17	0.11	0.37	0.17	0.18	0.13

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.12	0.00	0.05	0.02	0.28	0.19	0.15
C2	0.03	0.00	0.06	0.05	0.01	0.10	0.00	0.23	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.14	0.23	0.09	0.44	0.01	0.61	0.78	0.57
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.05	0.04	0.05	0.05	0.08	0.06	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.13	0.04	0.25	0.19	0.14
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.08	0.00	0.15	0.01	0.14	0.21	0.08	0.08	0.04	0.21	0.11	0.02	0.01	0.01	0.06	0.17	0.27	0.14	0.12
C4	0.02	0.01	0.03	0.08	0.00	0.07	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.11	0.05	0.33	0.01	0.58	0.58	0.46
C4'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.07	0.00	0.10	0.00	0.10	0.12	0.09	0.13	0.10	0.12	0.06	0.12	0.02	0.00	0.01	0.11	0.16	0.08	0.07
C5	0.01	0.00	0.03	0.15	0.00	0.10	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.14	0.07	0.02	0.36	0.01	0.70	0.67	0.54
C5'	0.01	0.23	0.05	0.01	0.17	0.00	0.20	0.00	0.23	0.16	0.24	0.25	0.20	0.19	0.11	0.05	0.08	0.02	0.01	0.24	0.07	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.04	0.14	0.01	0.10	0.01	0.23	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.15	0.09	0.04	0.42	0.00	0.77	0.81	0.63
C8	0.01	0.01	0.05	0.21	0.00	0.12	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.14	0.15	0.06	0.20	0.02	0.57	0.35	0.34
N1	0.03	0.00	0.05	0.08	0.01	0.09	0.01	0.24	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.15	0.16	0.07	0.46	0.01	0.72	0.85	0.64
N2	0.04	0.00	0.08	0.08	0.01	0.13	0.01	0.25	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.31	0.12	0.46	0.01	0.57	0.80	0.57
N3	0.03	0.00	0.06	0.04	0.00	0.10	0.01	0.20	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.23	0.10	0.38	0.01	0.53	0.63	0.48
N7	0.01	0.01	0.04	0.21	0.01	0.12	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.16	0.14	0.04	0.28	0.02	0.70	0.52	0.47
N9	0.00	0.01	0.02	0.11	0.01	0.06	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.10	0.05	0.01	0.19	0.02	0.47	0.36	0.31
O2'	0.01	0.14	0.00	0.02	0.12	0.12	0.14	0.05	0.15	0.14	0.15	0.16	0.13	0.16	0.10	0.00	0.05	0.10	0.09	0.16	0.23	0.20	0.13
O3'	0.12	0.23	0.02	0.01	0.11	0.02	0.07	0.08	0.09	0.15	0.16	0.31	0.23	0.14	0.05	0.05	0.00	0.07	0.05	0.09	0.33	0.16	0.17
O4'	0.00	0.09	0.01	0.01	0.05	0.00	0.02	0.02	0.04	0.06	0.07	0.12	0.10	0.04	0.01	0.10	0.07	0.00	0.07	0.04	0.19	0.15	0.10
O5'	0.05	0.44	0.13	0.06	0.33	0.01	0.36	0.01	0.42	0.20	0.46	0.46	0.38	0.28	0.19	0.09	0.05	0.07	0.00	0.42	0.02	0.01	0.00
O6	0.02	0.01	0.04	0.17	0.01	0.11	0.01	0.24	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.16	0.09	0.04	0.42	0.00	0.83	0.84	0.67
OP1	0.28	0.61	0.25	0.27	0.58	0.16	0.70	0.07	0.77	0.57	0.72	0.57	0.53	0.70	0.47	0.23	0.33	0.19	0.02	0.83	0.00	0.01	0.01
OP2	0.19	0.78	0.19	0.14	0.58	0.08	0.67	0.02	0.81	0.35	0.85	0.80	0.63	0.52	0.36	0.20	0.16	0.15	0.01	0.84	0.01	0.00	0.00
P	0.15	0.57	0.14	0.12	0.46	0.07	0.54	0.01	0.63	0.34	0.64	0.57	0.48	0.47	0.31	0.13	0.17	0.10	0.00	0.67	0.01	0.00	0.00