Doublet Group distance statistics: 53612

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 6, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.004, 0.009, 0.014, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.007, 0.012, 0.017, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.012 std_dev=0.005
C1'	A	0, 0.009, 0.016, 0.022, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.016 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.010, 0.017, 0.024, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.017 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.009, 0.019, 0.028, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.019 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.012, 0.022, 0.032, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.022 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.014, 0.026, 0.039, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.026 std_dev=0.013
N2	A	0, 0.008, 0.021, 0.034, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.021 std_dev=0.013
O6	A	0, 0.020, 0.036, 0.052, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.036 std_dev=0.016
N9	A	0, 0.017, 0.034, 0.051, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.034 std_dev=0.017
N7	A	0, 0.028, 0.051, 0.073, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.051 std_dev=0.022
C8	A	0, 0.036, 0.064, 0.092, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.064 std_dev=0.028
O4'	A	0, 0.076, 0.133, 0.190, 0.205 max_d=0.205 avg_d=0.133 std_dev=0.057
C2'	A	0, 0.147, 0.226, 0.306, 0.338 max_d=0.338 avg_d=0.226 std_dev=0.080
C4'	A	0, 0.129, 0.211, 0.294, 0.334 max_d=0.334 avg_d=0.211 std_dev=0.082
O2'	A	0, 0.226, 0.362, 0.499, 0.512 max_d=0.512 avg_d=0.362 std_dev=0.137
C3'	A	0, 0.144, 0.289, 0.434, 0.467 max_d=0.467 avg_d=0.289 std_dev=0.145
C5'	A	0, 0.257, 0.408, 0.559, 0.587 max_d=0.587 avg_d=0.408 std_dev=0.151
O3'	A	0, 0.237, 0.447, 0.657, 0.702 max_d=0.702 avg_d=0.447 std_dev=0.210
O5'	A	0, 0.346, 0.573, 0.801, 0.838 max_d=0.838 avg_d=0.573 std_dev=0.228
P	B	0, 0.292, 0.534, 0.776, 0.834 max_d=0.834 avg_d=0.534 std_dev=0.242
OP1	B	0, 0.321, 0.582, 0.844, 0.905 max_d=0.905 avg_d=0.582 std_dev=0.262
P	A	0, 0.498, 0.793, 1.089, 1.138 max_d=1.138 avg_d=0.793 std_dev=0.295
OP1	A	0, 0.571, 0.959, 1.347, 1.425 max_d=1.425 avg_d=0.959 std_dev=0.388
OP2	B	0, 0.393, 0.843, 1.293, 1.443 max_d=1.443 avg_d=0.843 std_dev=0.450
OP2	A	0, 0.408, 0.875, 1.341, 1.569 max_d=1.569 avg_d=0.875 std_dev=0.467
O5'	B	0, 0.362, 1.139, 1.915, 2.596 max_d=2.596 avg_d=1.139 std_dev=0.776
C5'	B	0, 0.875, 1.999, 3.123, 3.313 max_d=3.313 avg_d=1.999 std_dev=1.124
C4'	B	0, 0.600, 1.889, 3.179, 4.348 max_d=4.348 avg_d=1.889 std_dev=1.290
C3'	B	0, 0.530, 1.830, 3.131, 4.209 max_d=4.209 avg_d=1.830 std_dev=1.300
O3'	B	0, 0.195, 1.822, 3.449, 5.096 max_d=5.096 avg_d=1.822 std_dev=1.627
C2'	B	0, 0.657, 2.369, 4.080, 5.072 max_d=5.072 avg_d=2.369 std_dev=1.712
O4'	B	0, 0.313, 2.159, 4.006, 5.729 max_d=5.729 avg_d=2.159 std_dev=1.847
C8	B	0, 0.351, 2.544, 4.737, 6.652 max_d=6.652 avg_d=2.544 std_dev=2.193
C1'	B	0, -0.085, 2.123, 4.331, 6.209 max_d=6.209 avg_d=2.123 std_dev=2.208
O2'	B	0, 0.953, 3.209, 5.466, 6.697 max_d=6.697 avg_d=3.209 std_dev=2.256
N9	B	0, -0.056, 2.300, 4.656, 6.780 max_d=6.780 avg_d=2.300 std_dev=2.356
N7	B	0, 0.470, 2.840, 5.209, 7.336 max_d=7.336 avg_d=2.840 std_dev=2.369
C4	B	0, -0.045, 2.544, 5.134, 7.605 max_d=7.605 avg_d=2.544 std_dev=2.589
C5	B	0, 0.180, 2.800, 5.420, 7.932 max_d=7.932 avg_d=2.800 std_dev=2.620
N3	B	0, 0.126, 2.791, 5.455, 8.058 max_d=8.058 avg_d=2.791 std_dev=2.664
C6	B	0, 0.252, 3.131, 6.010, 8.835 max_d=8.835 avg_d=3.131 std_dev=2.879
C2	B	0, 0.222, 3.122, 6.022, 8.907 max_d=8.907 avg_d=3.122 std_dev=2.900
O6	B	0, 0.494, 3.459, 6.423, 9.277 max_d=9.277 avg_d=3.459 std_dev=2.964
N1	B	0, 0.200, 3.225, 6.249, 9.281 max_d=9.281 avg_d=3.225 std_dev=3.025
N2	B	0, 0.467, 3.508, 6.549, 9.514 max_d=9.514 avg_d=3.508 std_dev=3.041

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.05	0.01	0.05	0.19	0.12
C2	0.01	0.00	0.09	0.05	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.16	0.08	0.03	0.12	0.01	0.19	0.38	0.25
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.06	0.01	0.05	0.02	0.06	0.02	0.08	0.09	0.08	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.04	0.06	0.10	0.06	0.04
C3'	0.02	0.05	0.00	0.00	0.05	0.00	0.07	0.02	0.07	0.11	0.06	0.06	0.04	0.10	0.06	0.01	0.00	0.01	0.05	0.08	0.14	0.04	0.05
C4	0.01	0.00	0.06	0.05	0.00	0.02	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.09	0.05	0.02	0.13	0.01	0.19	0.36	0.24
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.04	0.06	0.02	0.02	0.02	0.06	0.03	0.07	0.01	0.00	0.01	0.05	0.08	0.05	0.03
C5	0.01	0.00	0.05	0.07	0.00	0.04	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.08	0.08	0.01	0.16	0.01	0.27	0.43	0.29
C5'	0.02	0.06	0.02	0.02	0.07	0.01	0.10	0.00	0.10	0.11	0.08	0.05	0.05	0.12	0.07	0.07	0.03	0.01	0.01	0.12	0.07	0.02	0.02
C6	0.01	0.01	0.06	0.07	0.00	0.04	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.11	0.08	0.02	0.16	0.00	0.29	0.45	0.31
C8	0.01	0.01	0.02	0.11	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.12	0.02	0.16	0.01	0.24	0.36	0.25
N1	0.01	0.00	0.08	0.06	0.00	0.02	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.14	0.08	0.03	0.14	0.01	0.25	0.43	0.29
N2	0.02	0.00	0.09	0.06	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.18	0.11	0.04	0.11	0.02	0.17	0.38	0.24
N3	0.01	0.00	0.08	0.04	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.07	0.03	0.11	0.01	0.15	0.34	0.22
N7	0.01	0.01	0.03	0.10	0.00	0.06	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.12	0.02	0.18	0.01	0.31	0.44	0.30
N9	0.00	0.01	0.02	0.06	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.12	0.01	0.15	0.30	0.21
O2'	0.01	0.16	0.01	0.01	0.09	0.07	0.08	0.07	0.11	0.02	0.14	0.18	0.14	0.04	0.03	0.00	0.05	0.07	0.07	0.10	0.10	0.08	0.08
O3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.05	0.01	0.08	0.03	0.08	0.12	0.08	0.11	0.07	0.12	0.05	0.05	0.00	0.01	0.08	0.10	0.21	0.10	0.11
O4'	0.00	0.03	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.04	0.03	0.02	0.00	0.07	0.01	0.00	0.03	0.02	0.04	0.16	0.10
O5'	0.05	0.12	0.04	0.05	0.13	0.01	0.16	0.01	0.16	0.16	0.14	0.11	0.11	0.18	0.12	0.07	0.08	0.03	0.00	0.18	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.06	0.08	0.01	0.05	0.01	0.12	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.10	0.10	0.02	0.18	0.00	0.35	0.48	0.33
OP1	0.05	0.19	0.10	0.14	0.19	0.08	0.27	0.07	0.29	0.24	0.25	0.17	0.15	0.31	0.15	0.10	0.21	0.04	0.01	0.35	0.00	0.01	0.00
OP2	0.19	0.38	0.06	0.04	0.36	0.05	0.43	0.02	0.45	0.36	0.43	0.38	0.34	0.44	0.30	0.08	0.10	0.16	0.01	0.48	0.01	0.00	0.00
P	0.12	0.25	0.04	0.05	0.24	0.03	0.29	0.02	0.31	0.25	0.29	0.24	0.22	0.30	0.21	0.08	0.11	0.10	0.00	0.33	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.45	0.95	0.83	0.28	0.69	0.47	0.95	0.54	1.16	0.79	1.06	1.10	0.78	1.08	0.55	1.20	0.38	0.59	0.40	1.50	0.22	0.33	0.22
C2	0.49	0.70	0.85	0.28	0.54	0.66	0.69	0.74	0.78	0.65	0.70	0.80	0.65	0.88	0.45	1.11	0.22	0.84	0.58	0.97	0.22	0.41	0.25
C2'	0.62	1.31	0.97	0.43	1.10	0.34	1.48	0.40	1.78	1.17	1.57	1.39	1.09	1.58	0.89	1.26	0.53	0.41	0.32	2.21	0.29	0.34	0.28
C3'	0.62	1.30	0.98	0.43	1.07	0.36	1.43	0.38	1.72	1.15	1.54	1.39	1.07	1.53	0.88	1.26	0.52	0.43	0.32	2.14	0.28	0.34	0.25
C4	0.51	0.79	0.86	0.29	0.59	0.62	0.76	0.69	0.89	0.70	0.82	0.92	0.69	0.93	0.50	1.18	0.24	0.77	0.52	1.14	0.22	0.34	0.22
C4'	0.46	1.03	0.83	0.30	0.75	0.42	1.01	0.49	1.25	0.83	1.17	1.20	0.83	1.12	0.59	1.19	0.41	0.51	0.37	1.61	0.24	0.32	0.24
C5	0.61	0.75	0.93	0.39	0.58	0.72	0.67	0.80	0.77	0.68	0.74	0.86	0.69	0.82	0.55	1.24	0.30	0.85	0.58	0.96	0.23	0.32	0.21
C5'	0.46	0.95	0.83	0.28	0.67	0.46	0.89	0.51	1.10	0.76	1.05	1.14	0.78	1.01	0.55	1.21	0.37	0.55	0.38	1.41	0.22	0.30	0.20
C6	0.68	0.70	0.98	0.48	0.59	0.81	0.61	0.90	0.67	0.66	0.67	0.80	0.68	0.73	0.59	1.28	0.41	0.93	0.66	0.80	0.24	0.33	0.21
C8	0.56	0.81	0.89	0.33	0.60	0.64	0.74	0.70	0.89	0.71	0.85	0.96	0.71	0.89	0.54	1.24	0.26	0.76	0.51	1.14	0.22	0.30	0.20
N1	0.62	0.67	0.93	0.41	0.55	0.79	0.59	0.89	0.65	0.61	0.63	0.76	0.65	0.72	0.53	1.17	0.32	0.94	0.67	0.79	0.23	0.36	0.22
N2	0.42	0.65	0.83	0.27	0.51	0.63	0.71	0.72	0.78	0.68	0.66	0.74	0.61	0.94	0.41	1.10	0.27	0.83	0.59	0.97	0.22	0.52	0.29
N3	0.45	0.79	0.84	0.26	0.59	0.57	0.82	0.64	0.95	0.73	0.84	0.91	0.70	1.01	0.48	1.16	0.28	0.73	0.49	1.19	0.22	0.39	0.24
N7	0.63	0.77	0.94	0.41	0.60	0.72	0.68	0.79	0.79	0.70	0.77	0.89	0.70	0.82	0.58	1.29	0.33	0.84	0.57	0.98	0.23	0.31	0.20
N9	0.49	0.85	0.85	0.27	0.62	0.57	0.82	0.64	0.99	0.73	0.91	1.00	0.72	0.97	0.52	1.19	0.27	0.70	0.47	1.27	0.22	0.32	0.21
O2'	0.62	1.43	0.92	0.43	1.16	0.29	1.57	0.42	1.93	1.18	1.74	1.50	1.16	1.60	0.91	1.26	0.60	0.35	0.31	2.40	0.33	0.35	0.35
O3'	0.75	1.53	1.03	0.51	1.29	0.33	1.69	0.33	2.03	1.35	1.84	1.60	1.27	1.76	1.06	1.28	0.61	0.42	0.28	2.50	0.32	0.37	0.29
O4'	0.44	0.87	0.77	0.24	0.58	0.52	0.76	0.60	0.96	0.66	0.93	1.08	0.72	0.89	0.46	1.18	0.34	0.66	0.43	1.26	0.20	0.32	0.21
O5'	0.50	0.94	0.90	0.31	0.69	0.46	0.91	0.51	1.09	0.80	1.03	1.10	0.78	1.03	0.59	1.27	0.34	0.56	0.38	1.39	0.20	0.27	0.16
O6	0.77	0.70	1.07	0.61	0.63	0.88	0.60	1.00	0.62	0.69	0.65	0.78	0.71	0.68	0.67	1.40	0.58	0.97	0.69	0.70	0.25	0.34	0.21
OP1	0.47	0.89	0.91	0.32	0.66	0.43	0.86	0.45	1.03	0.80	0.97	1.08	0.74	1.01	0.57	1.29	0.34	0.51	0.35	1.31	0.22	0.25	0.15
OP2	0.64	0.95	1.12	0.46	0.79	0.48	0.97	0.51	1.10	0.93	1.04	1.07	0.82	1.10	0.73	1.52	0.43	0.57	0.43	1.34	0.30	0.28	0.29
P	0.56	0.90	0.99	0.38	0.69	0.48	0.87	0.52	1.01	0.82	0.97	1.06	0.76	1.00	0.63	1.40	0.38	0.58	0.39	1.27	0.23	0.27	0.20

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.08	0.01	0.01	0.03	0.05	0.03	0.01	0.00	0.01	0.32	0.00	0.32	0.01	0.35	0.70	0.37
C2	0.04	0.00	0.29	0.18	0.01	0.31	0.01	0.39	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.40	0.47	0.39	0.39	0.00	0.35	0.79	0.44
C2'	0.00	0.29	0.00	0.00	0.16	0.02	0.10	0.21	0.15	0.15	0.23	0.35	0.28	0.10	0.05	0.00	0.04	0.02	0.73	0.12	0.83	1.31	0.90
C3'	0.02	0.18	0.00	0.00	0.20	0.00	0.29	0.02	0.28	0.37	0.22	0.20	0.16	0.38	0.21	0.02	0.01	0.02	0.41	0.32	0.59	0.77	0.54
C4	0.02	0.01	0.16	0.20	0.00	0.11	0.00	0.15	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.23	0.28	0.20	0.44	0.01	0.43	0.92	0.56
C4'	0.01	0.31	0.02	0.00	0.11	0.00	0.08	0.01	0.10	0.29	0.22	0.41	0.30	0.23	0.08	0.29	0.03	0.00	0.01	0.09	0.24	0.19	0.13
C5	0.01	0.01	0.10	0.29	0.00	0.08	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.30	0.18	0.10	0.57	0.01	0.60	1.17	0.78
C5'	0.08	0.39	0.21	0.02	0.15	0.01	0.13	0.00	0.15	0.40	0.28	0.52	0.36	0.33	0.13	0.10	0.21	0.02	0.01	0.15	0.11	0.18	0.02
C6	0.01	0.00	0.15	0.28	0.00	0.10	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.29	0.24	0.17	0.55	0.00	0.60	1.17	0.77
C8	0.01	0.01	0.15	0.37	0.00	0.29	0.00	0.40	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.49	0.17	0.20	0.77	0.02	0.72	1.29	0.96
N1	0.03	0.00	0.23	0.22	0.01	0.22	0.01	0.28	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.31	0.36	0.30	0.46	0.01	0.46	0.97	0.59
N2	0.05	0.00	0.35	0.20	0.01	0.41	0.01	0.52	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.53	0.58	0.46	0.39	0.01	0.33	0.68	0.40
N3	0.03	0.01	0.28	0.16	0.00	0.30	0.00	0.36	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.38	0.47	0.39	0.36	0.00	0.33	0.73	0.40
N7	0.01	0.01	0.10	0.38	0.00	0.23	0.00	0.33	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.46	0.18	0.10	0.75	0.03	0.79	1.40	1.02
N9	0.00	0.01	0.05	0.21	0.00	0.08	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.22	0.16	0.02	0.50	0.02	0.47	0.95	0.61
O2'	0.01	0.40	0.00	0.02	0.23	0.29	0.30	0.10	0.29	0.49	0.31	0.53	0.38	0.46	0.22	0.00	0.05	0.20	0.44	0.34	0.67	1.26	0.69
O3'	0.32	0.47	0.04	0.01	0.28	0.03	0.18	0.21	0.24	0.17	0.36	0.58	0.47	0.18	0.16	0.05	0.00	0.21	0.15	0.21	0.34	0.49	0.23
O4'	0.00	0.39	0.02	0.02	0.20	0.00	0.10	0.02	0.17	0.20	0.30	0.46	0.39	0.10	0.02	0.20	0.21	0.00	0.10	0.13	0.18	0.22	0.17
O5'	0.32	0.39	0.73	0.41	0.44	0.01	0.57	0.01	0.55	0.77	0.46	0.39	0.36	0.75	0.50	0.44	0.15	0.10	0.00	0.62	0.02	0.01	0.01
O6	0.01	0.00	0.12	0.32	0.01	0.09	0.01	0.15	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.34	0.21	0.13	0.62	0.00	0.72	1.31	0.90
OP1	0.35	0.35	0.83	0.59	0.43	0.24	0.60	0.11	0.60	0.72	0.46	0.33	0.33	0.79	0.47	0.67	0.34	0.18	0.02	0.72	0.00	0.01	0.01
OP2	0.70	0.79	1.31	0.77	0.92	0.19	1.17	0.18	1.17	1.29	0.97	0.68	0.73	1.40	0.95	1.26	0.49	0.22	0.01	1.31	0.01	0.00	0.00
P	0.37	0.44	0.90	0.54	0.56	0.13	0.78	0.02	0.77	0.96	0.59	0.40	0.40	1.02	0.61	0.69	0.23	0.17	0.01	0.90	0.01	0.00	0.00